BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg313056 Length=4740 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G21650.3 | Symbols: SECA2 | Preprotein translocase SecA fami... 4294 0.0 AT1G21651.1 | Symbols: | zinc ion binding | chr1:7600805-76042... 2416 0.0 > AT1G21650.3 | Symbols: SECA2 | Preprotein translocase SecA family protein | chr1:7592854-7604229 REVERSE LENGTH=5532 Length=5532 Score = 4294 bits (2325), Expect = 0.0 Identities = 2543/2643 (96%), Gaps = 35/2643 (1%) Strand=Plus/Plus Query 2129 AGGGGAATTTGGGTCGTTTAAAGAGGAATATACAGGATTTTACGAGCATGAATTATTGGG 2188 ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2491 AGGGGAATTTGGGTCGTTTGAAGAGGAATGTACAAGATTTTACGAGCATGAATTATTGGG 2550 Query 2189 TTGTGCGGGACTACTATCGTCTTGTGGAATCCGTCAATTCCCTTGAGCCACAGATGCAAA 2248 |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct 2551 TTGTCCGGGACTACTACCGTCTGGTGGAATCTGTCAATTCCCTTGAACCACAGATTCAAA 2610 Query 2249 GCCTTTCCGATG---A-G-----C--AG-CTGAAAGCTAAAACTGCAGAATTTCGAGAAA 2296 |||||||||||| | | | || ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2611 GCCTTTCCGATGAACAGGTTAAACTTAGTCTGAAAGCTAAAACTGCTGAATTTCGAGAAA 2670 Query 2297 GATTAGCACGAGGGGAGTCCCTAGCAGATATGCAAGCTGAGGCATTTGCTGTTGTCCGTG 2356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2671 GATTAGCACGAGGGGAGTCCCTAGCAGATATGCAAGCTGAGGCATTTGCTGTTGTCCGTG 2730 Query 2357 AAGCTGCTAAGAGAACAATTGGAATGCGTCATTTTGACGTGCAGATAATTGGTGGAGGAG 2416 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2731 AAGCTGCAAAGAGAACAATTGGAATGCGTCATTTTGACGTGCAGATAATTGGTGGAGGAG 2790 Query 2417 TGCTTCACGATGGATCCATTGCGGAGATGAAGACTGGTGAAGGGAAGACGCTAGTCTCCA 2476 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | Sbjct 2791 TGCTTCATGATGGATCCATTGCGGAGATGAAGACAGGTGAAGGGAAAACACTAGTTTCTA 2850 Query 2477 CCTTAGCTGCATATCTTAATGCATTAACTGGTGAAGGCGTTCATGTGGTTACCGTGAATG 2536 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2851 CCTTAGCTGCATATCTTAATGCATTAACTGGTGAGGGCGTTCATGTGGTTACTGTGAATG 2910 Query 2537 ATTACCTGGCCCAGCGTGATGCTGAATGGATGGGTCGTGTTCACCGCTTCTTAGGCCTTT 2596 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2911 ATTACCTGGCACAGCGTGATGCTGAATGGATGGGTCGTGTTCACCGCTTCTTAGGCCTTT 2970 Query 2597 CAGTTGGTCTCATTCAGAGAGGGATGAAAGCTGAAGAGAGAAAATTCAACTATAGCTCTG 2656 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2971 CAGTTGGTCTCATTCAGAGAGGGATGAAAGCTGAAGAGAGAAAATTCAACTATAGCTGTG 3030 Query 2657 ATATAACATACACCAATAACTCGGAGCTTGGATTTGATTATCTACGAGATAACCTTACTT 2716 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3031 ATATAACATACACCAATAACTCGGAGCTTGGATTTGATTATCTACGAGATAACCTTACTT 3090 Query 2717 CAAACCGTGAACAACTTGTTATGAGATGGCCAAAACCATTTCACTTTGCAATAGTTGATG 2776 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3091 CAAACCGTGAACAACTTGTTATGAGATGGCCAAAACCATTTCACTTTGCAATAGTTGATG 3150 Query 2777 AAGTGGATTCAGTCCTCATTGATGAAGGCAGAAATCCTTTGCTAATAAGTGGTGAGGCTA 2836 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3151 AAGTGGACTCAGTCCTCATTGATGAAGGCAGAAATCCTTTGCTAATTAGTGGTGAGGCTA 3210 Query 2837 ACGAAAATGCCGCACGATATCCAGTTGCTGCTAAAGTGGCGGAACTTCTCGTAAAGGATA 2896 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3211 ACGAAAATGCCGCACGATATCCAGTTGCTGCTAAAGTGGCTGAACTTCTCGTAAAGGATA 3270 Query 2897 GTCATTACAAAGTTGAACTGAAAGAAAACTCAGTGGAACTCACAGAAGAAGGCATATCTC 2956 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3271 GTCATTACAAAGTTGAACTGAAAGAAAACTCAGTGGAACTCACAGAAGAAGGCATATCTC 3330 Query 2957 TTGCTGAAATGGCTCTTGAGACGAGTGATTTATGGGATGAAAATGATCCATGGACAAGGT 3016 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct 3331 TTGCTGAAATGGCTCTTGAGACGGGTGATTTATGGGACGAAAATGATCCATGGGCAAGGT 3390 Query 3017 TTGTTATGAATGCTTTAAAAGCTAAAGAATTTTACAAGCGGGATGTCCAATATATTGTGA 3076 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3391 TTGTTATGAATGCTTTGAAAGCTAAAGAATTTTACAAGCGGGATGTCCAATATATTGTGA 3450 Query 3077 GAGATGGGAAAGCACTTATAATCAATGAGTTGACTGGAAGAGTTGAAGACAAAAGGAGAT 3136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3451 GAGATGGGAAAGCACTTATAATCAATGAGTTGACTGGAAGAGTTGAAGACAAAAGGAGAT 3510 Query 3137 GGTCTGAAGGAGTTCACCAGGCTGTGGAGGCTAAAGAAGGTCTAGAAATTCAGGCTGATT 3196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3511 GGTCTGAAGGAGTTCACCAGGCTGTGGAGGCTAAAGAAGGTCTAGAAATTCAGGCTGATT 3570 Query 3197 CAATTGTTGTGGCTCAAATCACCTATCAATCACTCTTTAAACTCTACCCAAAGCTCTCCG 3256 |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3571 CAATTGTTGTGGCTCAAATCACCTATCAGTCGCTCTTTAAACTCTATCCAAAGCTCTCCG 3630 Query 3257 GGATGACTGGGACAGCCAAAACAGAAGAAAAAGAATTTTTGAAGATGTTTCAGATACCTG 3316 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3631 GGATGACTGGGACAGCAAAAACAGAAGAAAAAGAATTTTTGAAAATGTTTCAGATACCTG 3690 Query 3317 TTATTGAAGTTCCTACAAATTTGTCAAATATTCGAATCGATCTACCAATACAAGCTTTCG 3376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3691 TTATTGAAGTTCCTACAAATTTGTCAAATATTCGAATCGATCTACCAATACAAGCTTTCG 3750 Query 3377 CTACTGCTCGGGGTAAATGGGAACATGTTCGTCGAGAAGTTGAAGATATGTTTGGACAAG 3436 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3751 CGACTGCTCGGGGTAAATGGGAACATGTTCGTCGAGAAGTTGAAGATATGTTTGGACAAG 3810 Query 3437 GTCGACCTGTTTTAGTAGGAACAACAAGTGTAGAGAATTCTGAATATTTATCAGAACTGC 3496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3811 GTCGACCTGTTTTAGTAGGAACAACAAGTGTAGAGAATTCTGAATATTTATCAGAACTGC 3870 Query 3497 TGAAAGAATGGGGTATACCTCACAATGTCCTGAATGCACGACCCAAGTATGCTGCCAGGG 3556 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3871 TGAAAGAATGGGGTATACCTCACAATGTCCTGAATGCACGACCCAAGTATGCTGCCAGGG 3930 Query 3557 AAGCTGATTTTATAGCCCAAGCAGGAAGAAAATATGCCATCACCATTTCTACAAATATGG 3616 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3931 AAGCTGATTTTATAGCCCAAGCAGGAAGAAAATATGCCATCACCATTTCCACAAATATGG 3990 Query 3617 CTGGTAGGGGTACTGACATTATTCTGGGAGGAAATCCGAAGATGCTTGCAAGGGAAATCA 3676 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3991 CTGGTAGGGGTACTGACATTATTCTGGGAGGAAATCCGAAGATGCTTGCAAGGGAAATCA 4050 Query 3677 TAGAAGATAGCATCCTTTCATATCTAACGAGTGAAGTTTTGGCTGATAATATTGACGACA 3736 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4051 TAGAAGATAGCATCCTTTCATATCTAACGAGTGAAGTTTTGGCTGATAATATTGACGATG 4110 Query 3737 ATGAGTTATCACAGAAGGTGTTGTCAAAAATAAAAGTGGGACCATCGTCCTTAGCTTTGC 3796 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 4111 ATGAGTTATCACAGAAGGTATTGTCAAAAATAAAAGTAGGACCATCGTCATTAGCTTTGC 4170 Query 3797 TAGCCAGAGCTTCTCTTATGGCAAAATATGTTGGCAAAAGTGAAAGTAAGAGCTGGACAA 3856 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4171 TAGCCAGAGCTTCTCTTATGGCAAAATATGTTGGCAAAAGTGAAAGTAAGAGCTGGACAA 4230 Query 3857 GGAAAAAAGCAAAGTCCGTGGTCACAGAATCTTTGGAGAAAAGCCAGACCATGGATCCTA 3916 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4231 GGAAAAAAGCAAAGTCCGTGGTCACAGAATCTTTGGAGAAAAGCCAGACCATGGATCCTA 4290 Query 3917 TGAAACTGCAGAATCTTGTCAATGAGCAGTCAGAAATGTACCCATTAGGCCCTGCTATTG 3976 || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4291 TGGAACTGCAGAATCTTATCAATGAGCAGTCAGAGATGTACCCATTAGGCCCTGCTATTG 4350 Query 3977 CTCTGGCTTATCTGTCCGTCTTAAAGGACTGTGAGGCCCATTGTCTGCATGAAGGATCTG 4036 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 4351 CTCTGGCTTATCTGTCCGTCTTAAAGGACTGTGAGGCCCATTGTCTGCATGAAGGGTCTG 4410 Query 4037 AAGTGAAGAGGCTTGGAGGCCTTCATGTAATTGGGACTTCTTTGCATGAGTCTCGGAGGA 4096 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct 4411 AAGTGAAGAGGCTTGGAGGCCTTCATGTGATTGGGACTTCATTGCATGAGTCTCGGAGAA 4470 Query 4097 TTGATAACCAGCTTCGTGGCAGAGCTGGAAGGCAAGGAGATCCTGGATCCACGCGGTTTA 4156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4471 TTGATAACCAGCTTCGTGGCAGAGCTGGAAGGCAAGGAGATCCTGGATCCACGCGGTTTA 4530 Query 4157 TGATAAGCTTGCAAGATGAGATGTTTCAGAAGTTTAATTTTGACACTGAGTGGGCTGTGA 4216 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4531 TGATAAGCTTGCAAGATGAGATGTTTCAGAAGTTTAATTTTGATACTGAGTGGGCTGTGA 4590 Query 4217 GACTTATATCAAAGATTACAAACGATGAAGACTTACCAATTGAAGGTGACACAATAGTAA 4276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4591 GACTTATATCAAAGATTACAAACGATGAAGACTTACCAATTGAAGGTGACACAATAGTAA 4650 Query 4277 AACAGCTTCTAGCTCTCCAGATCAACGCAGAGAAATACTTCTTTGGAATAAGAAAAAGCC 4336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4651 AACAGCTTCTAGCTCTCCAGATCAACGCAGAGAAATACTTCTTTGGCATAAGAAAAAGCC 4710 Query 4337 TGGTCGAGTTTGACGAAGTGCTAGAGGTTCAAAGGAAGCATGTCTATGACCTAAGGCAAC 4396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 4711 TGGTCGAGTTTGACGAAGTGCTAGAGGTTCAAAGGAAGCATGTCTATGACTTAAGGCAAC 4770 Query 4397 TGCTTTTGACGGGTGAAAACGAAAGTTGCTCTCAGCATATATTCCAGTACATGCAAGCTG 4456 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4771 TGCTGTTGACGGGTGAAAACGAAAGTTGCTCTCAGCATATATTCCAGTACATGCAAGCTG 4830 Query 4457 TTGTAGATGAAATCGTCGTTGGAAATGCTAATCCACAGAAGCATCCAAGATACTGGAGCT 4516 |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4831 TTGTAGATGAAATCGTTGTTGGGAATTCTAATCCGCAGAAGCATCCAAGATACTGGAGCT 4890 Query 4517 TGGCCAAGCTATTGAAAGAGTTTATGGCTATTTCGGGAAACCTACTGGATGA---A---- 4569 |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 4891 TGGCCAAGTTATTGAAAGAGTTCATGGCTATTTCGGGAAACCTACTGGATGAGTCATTTT 4950 Query 4570 --G--A--A-A-------CCATGTTACAGTCCCTTGAAAACCTGCATGAGAGGAT-TTCA 4614 | | | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct 4951 CTGGGATCACAGAAGAGACCATGTTACAGTCCCTTGAAAACCTGCATGAG-GGAAGTTCA 5009 Query 4615 ATAGATATGGAAGACTTGTACCTTCCGCACCTGCCAAAACCTCCTAACGCTTTCAGGGGA 4674 ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 5010 ATAGAAATGGAAGACTTGTCCCTTCCGCACCTGCCAAAACCTCCAAACGCTTTCAGAGGA 5069 Query 4675 ATCCGCAGAAAGAATTCTTCACTAAGACGTTGGCTTGATATCTGCTCAGATAATTTGACG 4734 || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 5070 ATTCGCAGGAAGAATTCTTCACTAAGACGTTGGCTTGATATCTGCTCCGATAATTTGACG 5129 Query 4735 GGG 4737 ||| Sbjct 5130 GGG 5132 Score = 2416 bits (1308), Expect = 0.0 Identities = 1509/1607 (94%), Gaps = 10/1607 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGAGGCACCGGAGTGTCCGGTGTGTCTACAGTCTTTCGACGGCGAGTCTACAGTCCCG 60 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct 78 ATGGAGGAACCGGAGTGTCCGGTGTGTCTACAGTCTTACGACGGCGAGTCTACTGTCCCG 137 Query 61 CGTGTACTCGCCTGCGGACACACGGCGTGCGAAGAATGCTTAACGAATCTACCCAAGAAG 120 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 138 CGCGTACTCGCCTGCGGACACACGGCGTGCGAAGAATGCTTAACAAATCTACCCAAGAAG 197 Query 121 TTTCCGAACACAATCCGATGTCCTGCTTGCACCGTTCTCGTCAAGTTTCCTCCTCAAGGA 180 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 198 TTTCCGGACACAATCCGATGTCCTGCTTGCACCGTTCTCGTCAAGTTTCCACCTCAAGGA 257 Query 181 CCATCAGCTCTCCCCAAAAACATCGATCTTCTCAGATTTTTCCCTTCTATTTCGAAGATT 240 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || Sbjct 258 CCATCAGCTCTCCCCAAAAACATTGATCTTCTCAGATTGTTCCCTTCGATTTCGAAGCTT 317 Query 241 AAGCTGGAACCTGGTCGGAATTGTAAAAAAGCCGTTGAATTTGTCATTCGATCATGGTCC 300 |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 318 AAGCTGGAACCTGGCCGGAATTTTGAAAAAGTCGTTGAATTTGTCACTCGATCATGGTCC 377 Query 301 GACGACTTTTACGCCACTTGGAAGGATCGGATCCTAGTGCACGACGCCGTTTCCGTGGAA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 378 GACGACTTTTACGCCACTTGGAAGGATCGGATTCTAGTGCACGACGCCGTTTCCGTGGAA 437 Query 361 ATTAGGGAGAGTGAAAGTAGTGATTTTGCTTCAGCTTCGCTTTTATGTGGAAGTCTGAGG 420 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 438 ATTAGGGAGAGTGAAAGTAGTGATTTTGATTCATCTTCGCGTTTATGTGGAAGTCTGAGG 497 Query 421 GATGATTTGAAGGTGAGTCTTTTACGGGTTGCTTCGTTCGAGCATGATGATTGTGATTCT 480 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 498 GATGATTCGAAGGTGAGTCTTTTACGGGTTGCTTCGTTCGAGCATGGTGATTGTGATTCT 557 Query 481 GTTCTCAAGTATAGTTATGTCCAGAGGATGATGAGTTGTCTGTGGGGGATGAGAGAGGAG 540 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct 558 GTCCTCAAGTATAGTTATGTCCAGAGGATGATGAGTTGTCTGTGGGGTATGCGAGAGGAG 617 Query 541 GAAAGAGATGAGCTTGATGCGATCATCTCTGTTAAACAAAGAGGTGTTTCTATAGTTTTT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| Sbjct 618 GAAAGAGATGAGCTTGATGCGATCATCTCTGTTAAACAGAGAGGTGTTTCTAAAGTTTTT 677 Query 601 GGCTTGTGGGGTGATTTGAAGAATGGTGTTTTGTATTTAGTGGGTGAGAAGCTCACTGGA 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct 678 GGCTTGTGGGGTGATTTGAAGAATGGTGTTTTGTATTTAGTGGGTGAAAAGCTCATTGGA 737 Query 661 CTTTT-GTT---GGAGTTTGATAGCCTCACTGAAGATTATACTTCGCGTTTAGCAATAAT 716 |||| ||| ||||||||||||||| | |||||| | |||| ||||||| |||||| Sbjct 738 -TTTTCGTTGGAGGAGTTTGATAGCCT--C-GAAGATGAGACTTTACGTTTAGGAATAAT 793 Query 717 TGGCATGCAAATATGTGAGGCACTACTCAATTTGCACAAGGAAGGGTTGATCACAGGCTG 776 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 794 TGGTATGCAAATATGTGAGGCACTACTTAATTTGCATAAGGAAGGGTTGATCACAGGCTG 853 Query 777 TTTGAGTGTTTCTTGTGTGAAGTTTGACGAATATGAGAATGCTTATGTTGATTTGATTGA 836 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 854 TTTGAGTGTTTCTTGTGTGAAGTTTGACGAATATGAGAATGCTTATGTTGATTTGATTGA 913 Query 837 GTTGATTGAAACTGGAAGGAATGTGTATCAAATTATCGCCGAAGAAACTAGCTCTTTTAG 896 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct 914 GTTGATTGAAACTGGAAGGAATGTGTATCGAATTATCGCTGAAGAAACTAGCTCTTTGAG 973 Query 897 CAAACCAGTTGGGGCTTCGGAAATGGGTTTGATTTTGGTTGGATTACTACAAAAGGGGAt 956 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| Sbjct 974 AAAACCAGTTGGTGCTTCGGAAATGGGTTTGATTTTTGTTGGGTTACAACAGAAGGGGAT 1033 Query 957 tttt-ttGAGCTCAGAGGTGTTGTTTGAATTGTTGAAAGAACGGAATATGTTGATAAAAG 1015 |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct 1034 TTTTATT-AGCTCAGAGGTGTTGTTTGAATTTTTGAAAGAACAGAATATGTTAATAAAAA 1092 Query 1016 ATTCCGGCTCAAAGTCGTTGGTTTCATATAACTCTGATGTTTGGCCAGTTTGTTTTCTTG 1075 || || ||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1093 ATACCAGCTCAAAATCTTTTGTTTCACATAACTCTGATGTTTGGCCAGTGTGTTTTCTTC 1152 Query 1076 TCCTCAAGCTTCGTCTTGGAAAACGGTTTATGGAGGAGCTTATTGAAAGTGTAAATTGTG 1135 ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||| Sbjct 1153 TCCTCAAGCTTCGTCTTGGAAAACGGTGTACCGAGGAGTTTATTGAAAGTGTGAATTGTG 1212 Query 1136 TGGATGCAAAAGGATGTGAAGAGGGTATTGAGGATCTCTTGGTGCTATACACAGGTATTA 1195 |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1213 TGGATGGAAAAGGCTGTGAAGAGGGTATTGAGGATATCTTGGTGCTATACACAGGTATTA 1272 Query 1196 CGGAGAAAGTAAGTCTGGAATCTGAACTCCAAGGGAAGTTTAAAACGATGGTTGAAATTC 1255 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1273 CGGAGAAACTAAGTTTGGAATCTGAACTCCAAGGGAAGTTTAAATCGATGGTTGAAATTC 1332 Query 1256 TTCGCCAATGTTGCTGTCTTAATCCTCAGGCACGTCCCGTTTTGACTGATCTATGGAAAT 1315 |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1333 TTCGTCAATGTTGCTGTCTTGATCCTCAGGCACGTCCCGTTTTGACTGATCTATGGAAAT 1392 Query 1316 GCATCAGGGAGCTGGTGGTGAAACCTAGGTTTAATTCTATGAGTGGATTGCATAAGACGA 1375 |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1393 GCATCAGGGAGCTGGTCATGAAACCTAGGTTCAATTCTATGAGTAGATTGCATAAGACGA 1452 Query 1376 TTTCTGGGAAAAGGAAAGAGTTCTGTTTGGCTCAAAGTGAATTATGTCGTCGGGTAGAAG 1435 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct 1453 TTTATGGGAAAAGGAAACAGTTCTGTTTGGCTCAAAGTGAATTATGTCGCCTGGTAGAAG 1512 Query 1436 TGGAATCCAAAGAACTGGACGAAGAGTTGCCTGGAATGAAAACTGGCGATGAAGCAGAGG 1495 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1513 TGGAATCCAAAGAAGTGGACAAAGAGTTGCCTGGAATGAAAATTGGCGATGAAGCAGAGG 1572 Query 1496 AGGGTAAGGTTGACATAGATTTTGCTAGGAGACTCTCAGAAGGAAAGGTGAAATCTAAAG 1555 ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1573 AGGGTAAGGTTGACATAGATTTTCCGGGGAGAGTCTCAGAAGGAAAGGTGAGATCTAAAG 1632 Query 1556 ACATGCGGGGACACCAAGACTCTGTCACAGGTTTAGCGGTTGGAGGT 1602 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1633 ACATGCGGGGACACCAAGACTCTGTCACAGGTTTAGCCGTTGGAGGT 1679 Score = 701 bits (379), Expect = 0.0 Identities = 401/412 (97%), Gaps = 0/412 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1599 AGGTCATCAGGATAAAGTAATGGCCTTGATACACATCGAGGGAACAGAACCAGTATGTGT 1658 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1760 AGGTCATCAGGATAAAGTAATGGCCTTGATACACATCGAGGGAACAGAACCAGTATGTGT 1819 Query 1659 CAGTGGCGACGGTGGAGGAGGTATCTTTGTATGGAGCACTACTTTCCCTCTGAAAGAACA 1718 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct 1820 TAGTGGCGATGGTGGAGGAGGTATCTTTGTATGGAGCACTACTTTTCCTCTGGAAGAACA 1879 Query 1719 GCCACTAAGAAAGTGGTACGAGCCAAAAGACTGGCGTTATACTGGCATTCATGCATTGGC 1778 ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1880 GCCGCTAAGAAAGTGGTATGAGCCAAAAGACTGGCGATATACTGGCATTCATGCATTGGC 1939 Query 1779 ATACTCAGAATATGGGCATGTGTACACTGGCAGTGGAGATAACACTATCAAAGCTTGGTC 1838 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1940 ATACTCAGAATATGGGCATGTGTACACTGGCAGTGGAGATAACACTATCAAAGCTTGGTC 1999 Query 1839 ACTGCAAGATGGAAGCCTGGTTTGCACTATGAGTGGCCATAAATCTGTAGTCTCAACGCT 1898 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2000 ACTGCAAGATGGAAGCCTGCTTTGCACTATGAGTGGTCATAAATCTGTAGTCTCAACGCT 2059 Query 1899 TGTTGTGGTAAATGGAGTACTATACAGTGGAAGTTGGGATGGAACCGTTCGTTTGTGGAG 1958 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2060 TGTTGTGGTAAATGGAGTACTATACAGTGGAAGTTGGGATGGAACCGTTCGTTTGTGGAG 2119 Query 1959 TCTAAGTGACCACAGTTTGTTGACAGTGTTGGGTGAAGAGACTCCAGGTATT 2010 |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2120 TCTAAGTGACAACAGTTTGTTGACAGTGTTGGGGGAAGAGACTCCAGGTATT 2171 Score = 191 bits (103), Expect = 6e-47 Identities = 115/121 (95%), Gaps = 0/121 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2011 ATATGGAGGGATGATACATTGATGAAGTCAATGCAGATACAGAGTGGCGCAATCCTCACC 2070 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | Sbjct 2244 ATATGGAGGGATGATACATTGATGAAGTCAATGAAAATACAGAATGGCGCAATCCTCAGC 2303 Query 2071 ATTACCGTGAACGGTAAATGGCTATTCACTGGAGGTTGGGACAAAACCATCAATGTACAG 2130 ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2304 ATTGCCGTGAATGGTAAATGGCTATTCACTGGAGGTTGGGACAAAACCATCAATGTACAG 2363 Query 2131 G 2131 | Sbjct 2364 G 2364 > AT1G21651.1 | Symbols: | zinc ion binding | chr1:7600805-7604215 REVERSE LENGTH=2755 Length=2755 Score = 2416 bits (1308), Expect = 0.0 Identities = 1509/1607 (94%), Gaps = 10/1607 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGAGGCACCGGAGTGTCCGGTGTGTCTACAGTCTTTCGACGGCGAGTCTACAGTCCCG 60 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct 64 ATGGAGGAACCGGAGTGTCCGGTGTGTCTACAGTCTTACGACGGCGAGTCTACTGTCCCG 123 Query 61 CGTGTACTCGCCTGCGGACACACGGCGTGCGAAGAATGCTTAACGAATCTACCCAAGAAG 120 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 124 CGCGTACTCGCCTGCGGACACACGGCGTGCGAAGAATGCTTAACAAATCTACCCAAGAAG 183 Query 121 TTTCCGAACACAATCCGATGTCCTGCTTGCACCGTTCTCGTCAAGTTTCCTCCTCAAGGA 180 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 184 TTTCCGGACACAATCCGATGTCCTGCTTGCACCGTTCTCGTCAAGTTTCCACCTCAAGGA 243 Query 181 CCATCAGCTCTCCCCAAAAACATCGATCTTCTCAGATTTTTCCCTTCTATTTCGAAGATT 240 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || Sbjct 244 CCATCAGCTCTCCCCAAAAACATTGATCTTCTCAGATTGTTCCCTTCGATTTCGAAGCTT 303 Query 241 AAGCTGGAACCTGGTCGGAATTGTAAAAAAGCCGTTGAATTTGTCATTCGATCATGGTCC 300 |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 304 AAGCTGGAACCTGGCCGGAATTTTGAAAAAGTCGTTGAATTTGTCACTCGATCATGGTCC 363 Query 301 GACGACTTTTACGCCACTTGGAAGGATCGGATCCTAGTGCACGACGCCGTTTCCGTGGAA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 364 GACGACTTTTACGCCACTTGGAAGGATCGGATTCTAGTGCACGACGCCGTTTCCGTGGAA 423 Query 361 ATTAGGGAGAGTGAAAGTAGTGATTTTGCTTCAGCTTCGCTTTTATGTGGAAGTCTGAGG 420 |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 424 ATTAGGGAGAGTGAAAGTAGTGATTTTGATTCATCTTCGCGTTTATGTGGAAGTCTGAGG 483 Query 421 GATGATTTGAAGGTGAGTCTTTTACGGGTTGCTTCGTTCGAGCATGATGATTGTGATTCT 480 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 484 GATGATTCGAAGGTGAGTCTTTTACGGGTTGCTTCGTTCGAGCATGGTGATTGTGATTCT 543 Query 481 GTTCTCAAGTATAGTTATGTCCAGAGGATGATGAGTTGTCTGTGGGGGATGAGAGAGGAG 540 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct 544 GTCCTCAAGTATAGTTATGTCCAGAGGATGATGAGTTGTCTGTGGGGTATGCGAGAGGAG 603 Query 541 GAAAGAGATGAGCTTGATGCGATCATCTCTGTTAAACAAAGAGGTGTTTCTATAGTTTTT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| Sbjct 604 GAAAGAGATGAGCTTGATGCGATCATCTCTGTTAAACAGAGAGGTGTTTCTAAAGTTTTT 663 Query 601 GGCTTGTGGGGTGATTTGAAGAATGGTGTTTTGTATTTAGTGGGTGAGAAGCTCACTGGA 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct 664 GGCTTGTGGGGTGATTTGAAGAATGGTGTTTTGTATTTAGTGGGTGAAAAGCTCATTGGA 723 Query 661 CTTTT-GTT---GGAGTTTGATAGCCTCACTGAAGATTATACTTCGCGTTTAGCAATAAT 716 |||| ||| ||||||||||||||| | |||||| | |||| ||||||| |||||| Sbjct 724 -TTTTCGTTGGAGGAGTTTGATAGCCT--C-GAAGATGAGACTTTACGTTTAGGAATAAT 779 Query 717 TGGCATGCAAATATGTGAGGCACTACTCAATTTGCACAAGGAAGGGTTGATCACAGGCTG 776 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 TGGTATGCAAATATGTGAGGCACTACTTAATTTGCATAAGGAAGGGTTGATCACAGGCTG 839 Query 777 TTTGAGTGTTTCTTGTGTGAAGTTTGACGAATATGAGAATGCTTATGTTGATTTGATTGA 836 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 TTTGAGTGTTTCTTGTGTGAAGTTTGACGAATATGAGAATGCTTATGTTGATTTGATTGA 899 Query 837 GTTGATTGAAACTGGAAGGAATGTGTATCAAATTATCGCCGAAGAAACTAGCTCTTTTAG 896 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct 900 GTTGATTGAAACTGGAAGGAATGTGTATCGAATTATCGCTGAAGAAACTAGCTCTTTGAG 959 Query 897 CAAACCAGTTGGGGCTTCGGAAATGGGTTTGATTTTGGTTGGATTACTACAAAAGGGGAt 956 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| Sbjct 960 AAAACCAGTTGGTGCTTCGGAAATGGGTTTGATTTTTGTTGGGTTACAACAGAAGGGGAT 1019 Query 957 tttt-ttGAGCTCAGAGGTGTTGTTTGAATTGTTGAAAGAACGGAATATGTTGATAAAAG 1015 |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct 1020 TTTTATT-AGCTCAGAGGTGTTGTTTGAATTTTTGAAAGAACAGAATATGTTAATAAAAA 1078 Query 1016 ATTCCGGCTCAAAGTCGTTGGTTTCATATAACTCTGATGTTTGGCCAGTTTGTTTTCTTG 1075 || || ||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1079 ATACCAGCTCAAAATCTTTTGTTTCACATAACTCTGATGTTTGGCCAGTGTGTTTTCTTC 1138 Query 1076 TCCTCAAGCTTCGTCTTGGAAAACGGTTTATGGAGGAGCTTATTGAAAGTGTAAATTGTG 1135 ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||| Sbjct 1139 TCCTCAAGCTTCGTCTTGGAAAACGGTGTACCGAGGAGTTTATTGAAAGTGTGAATTGTG 1198 Query 1136 TGGATGCAAAAGGATGTGAAGAGGGTATTGAGGATCTCTTGGTGCTATACACAGGTATTA 1195 |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1199 TGGATGGAAAAGGCTGTGAAGAGGGTATTGAGGATATCTTGGTGCTATACACAGGTATTA 1258 Query 1196 CGGAGAAAGTAAGTCTGGAATCTGAACTCCAAGGGAAGTTTAAAACGATGGTTGAAATTC 1255 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1259 CGGAGAAACTAAGTTTGGAATCTGAACTCCAAGGGAAGTTTAAATCGATGGTTGAAATTC 1318 Query 1256 TTCGCCAATGTTGCTGTCTTAATCCTCAGGCACGTCCCGTTTTGACTGATCTATGGAAAT 1315 |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1319 TTCGTCAATGTTGCTGTCTTGATCCTCAGGCACGTCCCGTTTTGACTGATCTATGGAAAT 1378 Query 1316 GCATCAGGGAGCTGGTGGTGAAACCTAGGTTTAATTCTATGAGTGGATTGCATAAGACGA 1375 |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1379 GCATCAGGGAGCTGGTCATGAAACCTAGGTTCAATTCTATGAGTAGATTGCATAAGACGA 1438 Query 1376 TTTCTGGGAAAAGGAAAGAGTTCTGTTTGGCTCAAAGTGAATTATGTCGTCGGGTAGAAG 1435 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct 1439 TTTATGGGAAAAGGAAACAGTTCTGTTTGGCTCAAAGTGAATTATGTCGCCTGGTAGAAG 1498 Query 1436 TGGAATCCAAAGAACTGGACGAAGAGTTGCCTGGAATGAAAACTGGCGATGAAGCAGAGG 1495 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1499 TGGAATCCAAAGAAGTGGACAAAGAGTTGCCTGGAATGAAAATTGGCGATGAAGCAGAGG 1558 Query 1496 AGGGTAAGGTTGACATAGATTTTGCTAGGAGACTCTCAGAAGGAAAGGTGAAATCTAAAG 1555 ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1559 AGGGTAAGGTTGACATAGATTTTCCGGGGAGAGTCTCAGAAGGAAAGGTGAGATCTAAAG 1618 Query 1556 ACATGCGGGGACACCAAGACTCTGTCACAGGTTTAGCGGTTGGAGGT 1602 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1619 ACATGCGGGGACACCAAGACTCTGTCACAGGTTTAGCCGTTGGAGGT 1665 Score = 701 bits (379), Expect = 0.0 Identities = 401/412 (97%), Gaps = 0/412 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1599 AGGTCATCAGGATAAAGTAATGGCCTTGATACACATCGAGGGAACAGAACCAGTATGTGT 1658 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1746 AGGTCATCAGGATAAAGTAATGGCCTTGATACACATCGAGGGAACAGAACCAGTATGTGT 1805 Query 1659 CAGTGGCGACGGTGGAGGAGGTATCTTTGTATGGAGCACTACTTTCCCTCTGAAAGAACA 1718 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct 1806 TAGTGGCGATGGTGGAGGAGGTATCTTTGTATGGAGCACTACTTTTCCTCTGGAAGAACA 1865 Query 1719 GCCACTAAGAAAGTGGTACGAGCCAAAAGACTGGCGTTATACTGGCATTCATGCATTGGC 1778 ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1866 GCCGCTAAGAAAGTGGTATGAGCCAAAAGACTGGCGATATACTGGCATTCATGCATTGGC 1925 Query 1779 ATACTCAGAATATGGGCATGTGTACACTGGCAGTGGAGATAACACTATCAAAGCTTGGTC 1838 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1926 ATACTCAGAATATGGGCATGTGTACACTGGCAGTGGAGATAACACTATCAAAGCTTGGTC 1985 Query 1839 ACTGCAAGATGGAAGCCTGGTTTGCACTATGAGTGGCCATAAATCTGTAGTCTCAACGCT 1898 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1986 ACTGCAAGATGGAAGCCTGCTTTGCACTATGAGTGGTCATAAATCTGTAGTCTCAACGCT 2045 Query 1899 TGTTGTGGTAAATGGAGTACTATACAGTGGAAGTTGGGATGGAACCGTTCGTTTGTGGAG 1958 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2046 TGTTGTGGTAAATGGAGTACTATACAGTGGAAGTTGGGATGGAACCGTTCGTTTGTGGAG 2105 Query 1959 TCTAAGTGACCACAGTTTGTTGACAGTGTTGGGTGAAGAGACTCCAGGTATT 2010 |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2106 TCTAAGTGACAACAGTTTGTTGACAGTGTTGGGGGAAGAGACTCCAGGTATT 2157 Score = 191 bits (103), Expect = 6e-47 Identities = 115/121 (95%), Gaps = 0/121 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2011 ATATGGAGGGATGATACATTGATGAAGTCAATGCAGATACAGAGTGGCGCAATCCTCACC 2070 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | Sbjct 2230 ATATGGAGGGATGATACATTGATGAAGTCAATGAAAATACAGAATGGCGCAATCCTCAGC 2289 Query 2071 ATTACCGTGAACGGTAAATGGCTATTCACTGGAGGTTGGGACAAAACCATCAATGTACAG 2130 ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2290 ATTGCCGTGAATGGTAAATGGCTATTCACTGGAGGTTGGGACAAAACCATCAATGTACAG 2349 Query 2131 G 2131 | Sbjct 2350 G 2350 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 236436802359 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5