BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg323999
Length=3774
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G54670.3 | Symbols: TTN8 | Structural maintenance of chromos... 3022 0.0
> AT3G54670.3 | Symbols: TTN8 | Structural maintenance of chromosomes
(SMC) family protein | chr3:20235483-20243954 FORWARD
LENGTH=4308
Length=4308
Score = 3022 bits (1636), Expect = 0.0
Identities = 1771/1833 (97%), Gaps = 21/1833 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCCTGCGATACAAACCCCATCGGGGAAGATCTTGCAGCTTGAGATGGAGAATTTCAAA 60
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336 ATGCCTGCGATACAATCCCCATCGGGGAAGATCTTGCAGCTTGAGATGGAGAATTTCAAA 395
Query 61 TCTTACAAGGGTCATCAATTGGTTGGTCCTTTCAAGGATTTCACTGCTATTATTGGTCCC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 TCTTACAAGGGTCATCAATTGGTTGGTCCTTTCAAGGATTTCACTGCTATTATTGGTCCC 455
Query 121 AACGGTGCTGGCAAATCTAACCTAATGGACGCTATTAGCTTTGTGCTCGGTGTTCGTACC 180
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||
Sbjct 456 AACGGTTCTGGCAAATCTAACCTAATGGACGCTATTAGCTTCGTCCTCGGCGTTCGTACC 515
Query 181 GGTCAACTTCGTGGTTCTCAGCTTAAGGATCTTATCTACGCTTTTGATGATCGTGACAAG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 GGTCAACTTCGTGGTTCTCAGCTTAAGGATCTTATCTACGCTTTTGATGATCGTGACAAG 575
Query 241 GAACAGAGAGGTCGGAGAGCGTTTGTTCGACTCGTTTATCAGATGGACGATGGAGTAGAG 300
|||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 576 GAACAGAGAGGTCGTAAAGCTTTTGTTCGACTCGTTTATCAGATGGACGATGGAGTAGAG 635
Query 301 CTTCATTTCACACGTACTATTACTAGCGCTGGTGGGAGTGAGTACCGTATCGATAATAGG 360
|||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 636 CTTCGTTTCACTCGTTCTATTACTAGCGCTGGTGGGAGTGAGTACCGTATTGATAATAGG 695
Query 361 GTTGTGAATTTGGATGAGTACAATGGGAAGCTACGATCTCTAGGGATACTTGTTAAGGCT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 696 GTTGTGAATTTGGATGAGTACAATGGGAAGCTACGATCTCTTGGGATACTTGTTAAGGCT 755
Query 421 CGTAATTTCTTGGTGTTTCAGGGTGATGTTGAATCTATTGCTTCGAAGAATCCAAAAGAA 480
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 756 CGTAATTTCTTGGTCTTTCAGGGTGATGTTGAATCTATTGCTTCGAAGAATCCAAAAGAA 815
Query 481 CTTACTGGACTCCTCGAAGAGATTTCTGGGTCCGAGGAGCTTAAGAAAGAGTATGAAGAA 540
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 816 CTTACTGGACTCCTCGAGGAGATTTCTGGTTCCGAGGAGCTTAAGAAAGAGTATGAAGGA 875
Query 541 CTAGAAGAAAAGAAGGCCAGTGCTGAAGAAAAAGCAGCTCTTATATACCagaagaagaaa 600
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 876 CTAGAAGAAAAGAAGGCCAGCGCTGAAGAAAAAGCAGCTCTTATATACCAGAAGAAGAAA 935
Query 601 accattgggaatgagaagaagctgaagaaagcacagaaggaagaagctgagaagcatcta 660
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 936 ACAATTGGAAATGAGAAGAAGCTGAAGAAAGCACAAAAGGAAGAAGCTGAGAAGCATCTA 995
Query 661 aggctgcaggaagaaCTGAAAGCTCTGAAGAGAGAACGCTTCCTATGGCAATTGTATAAC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 996 AGGCTGCAGGAAGAACTGAAAGCTCTGAAGAGAGAACGCTTCCTATGGCAATTATATAAC 1055
Query 721 ATTGAAAATGATATCGAGAAGGCGACTGAGGATGTTGATGCTGAAAAGAGCAATCGTAAA 780
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1056 ATTGAAAATGATATCGAGAAGGCGAATGAGGATGTTGATTCTGAAAAGAGCAATCGTAAA 1115
Query 781 GATGTCATGAGAGAGCTGGAAAAGTTTGAACGTGAGGCAGGTAAGAGAAAGGTAGAACAA 840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1116 GATGTCATGAGAGAGCTGGAAAAGTTTGAACGTGAGGCAGGTAAGAGAAAGGTAGAGCAA 1175
Query 841 GCAAAGTATCTGAAAGAAATTGCTCAACGTGAGAAGAAGATTGCTGAGAAAAGCTCGAAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176 GCAAAGTATCTGAAAGAAATTGCTCAACGTGAGAAGAAGATTGCTGAGAAAAGCTCGAAG 1235
Query 901 CTTGGAAAAATTGTGAGTATACCTTGGAAATCTGTGCAACCTGAGCTTCTGAGATTTAAG 960
||||| |||| | | | | | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236 CTTGG-AAAA-----A-T-T--C------A-----GCAACCTGAGCTTCTGAGATTTAAG 1274
Query 961 GAGGAGATAGCTCGCATAAAAGCAAAAATTGAGAGCAACAGAAAGGACGTGGATAAGAGG 1020
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1275 GAGGAGATAGCTCGCATAAAAGCAAAAATTGAGACCAATAGAAAGGACGTGGATAAGAGG 1334
Query 1021 aaaaaagaaaaaGGGAAGCATTCCAAAGAAATTGAACAGATGCAGGATAGCATTAAGGAG 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 1335 AAAAAAGAAAAAGGGAAGCATTCCAAAGAAATTGAACAGATGCAGAAAAGCATTAAGGAG 1394
Query 1081 CTGAATAAGAAAATGGAATTATATAATGAGAAGAGACAAGATAGCAGCGGAAAACTCCCA 1140
|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395 CTGAATAAGAAAATGGAATTATTTAATAAGAAGAGACAAGATAGCAGCGGAAAACTCCCA 1454
Query 1141 ATGCTTGACAGTCAACTGCAAGATTATTTTCGACTAAAAGAAGAAGCTGGAATGAAAACC 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1455 ATGCTTGACAGTCAACTGCAAGATTATTTTCGACTAAAAGAAGAAGCTGGAATGAAAACC 1514
Query 1201 ATTAAGCTAAGAGATGAGCACGAGGTTCTAGAGAGGCAACGGCGTACTGATCTCGAAGCA 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1515 ATTAAGCTAAGAGATGAGCACGAGGTTCTAGAGAGGCAACGGCGTACCGATCTTGAAGCA 1574
Query 1261 TTGAGAAATCTGGAAGAAAATTACCAGCAACTAATAAACAGGAAGAATGATCTTGATGAA 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1575 TTGAGAAATCTGGAAGAAAATTACCAGCAACTAATAAATAGGAAGAATGATCTTGATGAA 1634
Query 1321 CAAATTAAGCGATTTAAAGACAGGCAAGAAGAGATTGAAACATCTTCTTCGAAATATAAG 1380
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1635 CAAATTAAGCGATTTAAAGACAGGCAAGGAGAGATTGAAACATCTTCGTCGAAATATAAG 1694
Query 1381 AATGAAACAACTAGTCTGAAAAAGGAGTTACGTGCACTGCAAGAGAAGCATGTAAATGCC 1440
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1695 AATGAAACAACTAGTCTGAAAACGGAGTTACGTGCACTGCAAGAGAAGCACGTAAATGCC 1754
Query 1441 AGGAATGCCTCTGAGAAGTTGAAGACTAGAATCGCGGAATTAGAAGACCAGTTAAGTGAT 1500
||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755 AGGGAGGCCTCTGCGAAGTTGAAGACTAGAATCGCGGAATTAGAAGACCAGTTAAGTGAT 1814
Query 1501 TTAACGGCTGAAAGGTATGAAAATGAGAGAGATAGTAGGCTAACACAGGCTGTTGAGTCT 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 TTAACGGCTGAAAGGTATGAAAATGAGAGAGATAGTAGGCTAACACAGGCTGTTGAGTCT 1874
Query 1561 CTCAAGCGTCTATTTCAAGGAGTTCATGGTCGGATGACTGATCTTTGTCGGCCAAATCGG 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1875 CTCAAGCGTCTATTTCAAGGAGTTCATGGTCGGATGACTGATCTTTGTCGGCCAAATCGG 1934
Query 1621 AAGAAGTATAACCTTGCTGTCACTGTTGCCATGGGAAGATTTATGGATGCAGTAGTTGTA 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1935 AAGAAGTATAACCTTGCTGTCACTGTTGCCATGGGAAGATTTATGGATGCAGTAGTTGTA 1994
Query 1681 GAAGATGAAAACACGGGAAAGGATTGCATCAAGTACTTGAAAGAGCAAAGGCTTCCTCCT 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 GAAGATGAAAACACGGGAAAGGATTGCATCAAGTACTTGAAAGAGCAAAGGCTTCCTCCT 2054
Query 1741 ATGACATTTATTCCTCTTCAGTCAGTACGTGTCAAGCAAGTGTTTGAAAGATTGAGAAAT 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2055 ATGACATTTATTCCTCTTCAGTCAGTACGTGTCAAGCAAGTGTTTGAAAGATTGAGAAAT 2114
Query 1801 TTGGGTGGCACAGCAAAGCTGGTGTTCGATGTT 1833
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2115 TTGGGTGGCACAGCAAAGCTGGTGTTCGATGTT 2147
Score = 1781 bits (964), Expect = 0.0
Identities = 1000/1018 (98%), Gaps = 0/1018 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2757 AGAGTGCAAACAAAAGTCGGAGGAGTATGAGAAGGAAATCCTGGATTGGAAAAAGCAGGC 2816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3038 AGAGTGCAAACAAAAGTCGGAGGAGTATGAGAAGGAAATCCTGGATTGGAAAAAGCAGGC 3097
Query 2817 TTCTCAAGCGACAACTAGCATAACCAAGCTCAATCGTCAAATACATTCGAAGGAAACACA 2876
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3098 TTCTCAAGCGACAACAAGCATAACCAAGCTCAATCGTCAAATACATTCGAAGGAAACACA 3157
Query 2877 AATTGAGCAGCTGATCTCGCAGAAGCAGGAAATAACTGAGAAGTGTGAGCTCGAACATAT 2936
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3158 AATTGAGCAGCTGATCTCACAGAAACAGGAAATAACTGAGAAGTGTGAGCTCGAACATAT 3217
Query 2937 TACCCTTCCTGTTTTATCAGATGCTATGGAGGAAGATGACTCAGATGGGCCACAGTTTGA 2996
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3218 TACCCTTCCTGTCTTATCAGATGCTATGGAGGAAGATGATTCAGATGGGCCACAGTTTGA 3277
Query 2997 CTTTAGTGAGCTAGATAGAGCTTATCTCCAAGAACGGAGACCATCTGCTCGTGAAAAAGT 3056
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3278 CTTTAGTGAGCTGGGTAGAGCTTATCTCCAAGAACGGAGACCATCTGCTCGTGAAAAAGT 3337
Query 3057 GGAGGCGGAATTTAGGCAGAAAATAGAATCTAAAACATCCGAGATTGAAAGAACGGCTCC 3116
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3338 GGAGGCAGAATTTAGGCAGAAAATAGAATCTAAAACATCCGAGATTGAAAGAACGGCTCC 3397
Query 3117 AAATTTGAGAGCGCTTGACCAGTATGAGGCTATACAAGAGAAGGAAAAACAAGTTAGCCA 3176
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3398 AAATTTGAGAGCGCTTGACCAGTATGAGGCTATACAAGAGAAAGAAAAACAAGTTAGCCA 3457
Query 3177 GGAGTTTGAAGCGGCCAGGAAAGAGGAGAAGCAAGTAGCGGATGCCTTTAATACTGTTAA 3236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3458 GGAGTTTGAAGCGGCCAGGAAAGAGGAGAAGCAAGTAGCGGATGCCTTTAATACTGTTAA 3517
Query 3237 GCAGAAGAGGTATGAGCTATTTATGGAAGCTTTCAACCACATTGCTAGCAACATTGACAA 3296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3518 GCAGAAGAGGTATGAGCTATTTATGGAAGCTTTCAACCACATTGCTAGCAACATTGACAA 3577
Query 3297 GATCTATAAGCAACTAACCAAGAGTAATACGCACCCACTGGGTGGGACTGCCTATCTAAA 3356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3578 GATCTATAAGCAACTAACCAAGAGTAATACGCACCCACTGGGTGGGACTGCTTATCTAAA 3637
Query 3357 CCTAGAAAATGAGGATGATCCGTTTCTACATGGTATAAAGTATACTACAATGCCCCCAAC 3416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3638 CCTAGAAAATGAGGATGATCCGTTTCTACATGGTATAAAGTATACTACAATGCCCCCAAC 3697
Query 3417 AAAGCGATTTCGTGACATGGAACAGCTCTCTGGAGGAGAGAAAACAGTTGCGGCCTTGGC 3476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3698 AAAGCGATTTCGTGACATGGAACAGCTCTCTGGAGGAGAGAAAACAGTTGCGGCCTTGGC 3757
Query 3477 GTTGCTCTTCTCCATCCATAGCTATAGGCCTTCACCCTTTTTCATACTTGATGAAGTGGA 3536
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3758 GTTGCTCTTCTCCATACATAGCTATAGGCCTTCACCCTTTTTCATACTTGATGAAGTGGA 3817
Query 3537 TGCTGCGCTTGATAATTTAAACGTGGCAAAAGTTGCTAAATTCATACGTAGCAAGTCATG 3596
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3818 TGCTGCGCTTGATAATCTAAACGTGGCAAAAGTTGCTAAATTCATTCGTAGCAAGTCATG 3877
Query 3597 CCAAGCGGCACGTGACAATCAGGATGCAGAGGATGGGAATGGCTTCCAAAGCATTGTAAT 3656
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3878 CCAAGCCGCACGTGACAATCAGGATGCAGAGGATGGGAATGGCTTCCAAAGCATTGTAAT 3937
Query 3657 ATCTCTCAAGGACAGCTTCTATGACAAGGCAGAAGCTCTGGTTGGAGTTTACAGAGACAC 3716
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3938 ATCTCTCAAGGACAGCTTCTATGACAAGGCGGAGGCTCTGGTTGGAGTTTACAGAGACAC 3997
Query 3717 TGAGAGGAGTTGCTCAAGTACAATGTCATTTGACCTTCGGAACTACCAAGAATCGTGA 3774
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3998 CGAGAGGAGTTGCTCAAGTACAATGTCATTTGACCTTAGGAACTACCAAGAATCGTGA 4055
Score = 1410 bits (763), Expect = 0.0
Identities = 837/872 (96%), Gaps = 8/872 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1831 GTTTCTAAAGTATATGTTTTGGTCCTTAACTACTCCACGTTCGATCCTGAATTGGAGAAG 1890
||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2175 GTTTCTAAAATATATATTTTTGTCCTTAACTACTCCACGTTCGATCCTGAATTGGAGAAG 2234
Query 1891 GCGGTCCTCTTTGCTGTTGGAAATACTCTTGTCTGCGACGAACTTGAAGAAGCCAAGGTT 1950
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2235 GCGGTTCTCTATGCTGTTGGAAATACTCTTGTCTGCGACGAACTTGAAGAAGCCAAGGTT 2294
Query 1951 CTTAGCTGGACCGGAGAGAGACATAAAGTTGTGACTGTTGATGGTATATTACTCACAAAG 2010
|||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CTTAGCTGGAGCGGAGAGAGATTTAAAGTTGTGACTGTTGATGGTATATTACTCACAAAG 2354
Query 2011 GCGGGAACAATGACTGGTGGTACCAGTGGTGGAATGGAAGCAAAGTCTAATAAATGGGAT 2070
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2355 GCGGGAACAATGACTGGTGGTACAAGTGGTGGAATGGAAGCAAAGTCTAATAAATGGGAT 2414
Query 2071 GATaagaaaattgaaggtttgaagaaaaagaaagaagaacat-gaactagaattggaaaa 2129
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | || | |||||
Sbjct 2415 GATAAGAAAATTGAAGGTTTGAAGAAAAATAAAGAAG-ATTTCGAACAACAACTAGAAAA 2473
Query 2130 TATTGGATCTATTCGAGAAATGCAAATGAAGGAGTCTGAAATATCGGGTAAAATAAGTGG 2189
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2474 TATTGGATCTATTCGAGAAATGCAAATGAAAGAGTCTGAAATATCGGGTAAAATAAGTGG 2533
Query 2190 ACTTGaaaaaaaGATTCAGTATGCTGAAATTGAGAAGAAAAGCATCAAAGACAAACTTCC 2249
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2534 ACTTGAAAAAAAGATTCAGTATGCTGAAATTGAGAAGAAAAGTATCAAAGACAAACTTCC 2593
Query 2250 ACAGCTTGAGCAAGAGAAGCGGAATATCATTGAAGAAATTGATCGCATAAAGCCTGAACT 2309
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2594 ACAGCTTGAGCAAGAGGAGCGGAATATCATTGAAGAAATTGATCGCATAAAACCTGAACT 2653
Query 2310 CTCTAAGGCAATTGCAAAAACTGAGGTCGATAAGAGAAAGACAGAAATGAATAAGTTGGA 2369
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2654 CTCTAAGGCAA--G----AACTGAGGTCGATAAGAGAAAGACAGAAATGAATAAGTTGGA 2707
Query 2370 GAAAAGAATGAATGAGATTGTGGACCGTATCTATAAGGATTTTAGCCAGTCTGTTGGGGT 2429
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2708 GAAAAGAATGAATGAGATCGTGGACCGTATCTATAAGGATTTTAGCCAGTCTGTTGGGGT 2767
Query 2430 TCCAAACATACGTGTATATGAAGAAACTCAGCTGAAGACTGCTGAAAAGGAGGCTGAAGA 2489
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2768 TCCAAACATACGTGTATATGAAGAAACTCAGCTCAAGACTGCTGAAAAGGAGGCTGAAGA 2827
Query 2490 AAGGCTGGAACTGAGTAATCAGCTTGCTAAGTTAAAATACCAGCTGGAATATGAGCAAAA 2549
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2828 AAGGCTGGAACTGAGTAACCAGCTTGCTAAGTTAAAATACCAGCTGGAATATGAGCAAAA 2887
Query 2550 CCGAGATGTGGGGTCACGGATTCGAAAGCTAGAGTCTTCTATCAGTTCTCTGGAAACTGA 2609
||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2888 CCGTGATGTGGGGTCACGGATTCGAAAGATAGAGTCTTCTATCAGTTCTCTGGAAACTGA 2947
Query 2610 TTTGGAAGGTATACAGAAGACAATGTCTGAACGTAAGGAGACAGCAGTAAAAATTACTAA 2669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2948 TTTGGAAGGTATACAGAAGACAATGTCTGAACGTAAGGAGACAGCGGTAAAAATAACTAA 3007
Query 2670 TGAAATCAACAATTGGAAGAAGGAAATGGAAG 2701
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3008 TGAAATCAACAATTGGAAGAAGGAAATGGAAG 3039
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 187975535421
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5