BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg335224
Length=4473
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G19720.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR-like) s... 4200 0.0
AT1G19715.3 | Symbols: | Mannose-binding lectin superfamily pr... 2837 0.0
> AT1G19720.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR-like)
superfamily protein | chr1:6819564-6822711 REVERSE LENGTH=3069
Length=3069
Score = 4200 bits (2274), Expect = 0.0
Identities = 2482/2586 (96%), Gaps = 0/2586 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAAAAGCTCTTCGTACCATCATTTCCCAAAACTTTTTTGAATTATCAGACTCCAGCA 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 ATGGAAAAGCTCTTCGTACCATCATTTCCCAAAACTTTTTTGAATTATCAGACTCCAGCT 161
Query 61 AAAGTGGAGAATTCGCCTGAAGTTCATCCAAAATCCAGAAAGAAGAATCTATCATTCACC 120
||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 162 AAAGTAGAGAATTCGCCTGAACTTCATCCAAAATCCAGAAAGAAAAACCTATCATTCACC 221
Query 121 AAGAAGAAAGAACCCAATATCATTCCCGACGAGCAATTGGATTACTTGTGTAGAAATGGA 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 222 AAGAAGAAAGAACCCAATATCATTCCCGACGAGCAATTCGATTACTTGTGTAGAAACGGA 281
Query 181 AGTCTGCTCGAAGCTGAGAAAGCTCTGGACTCTTTGTTTCAACAAGGTTCCAAGGTAAAA 240
||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282 AGTTTGCTCGAAGCTGAGAAAGCTCTGGACTCGTTGTTTCAACAAGGTTCCAAGGTAAAA 341
Query 241 CGAAGCACTTACCTCAACTTGTTGGAGTCGTGCATTGATTCTGGTTCTATCCATTTGGGT 300
||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 CGAAGCACTTACCTCAAATTGTTGGAATCGTGTATTGATTCTGGTTCTATCCATTTGGGT 401
Query 301 CGTATCCTTCATGCTCGGTTTGGTCTGTTTCCTGAACCTGACGTCTTTGTGGAGACGAAG 360
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 402 CGTATCCTTCATGCTCGGTTTGGTTTGTTTACTGAACCTGACGTCTTTGTGGAGACGAAG 461
Query 361 CTGTTGAGCATGTATGCTAAATGCGGGTGTCTTGTTGATGCCCGTAAGGTGTTTGATTCA 420
||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 462 CTGTTGAGCATGTATGCTAAATGTGGGTGTATTGCTGATGCACGTAAGGTGTTTGATTCA 521
Query 421 ATGCGTGAGAGAAATCTGTATACATGGTCTGCTATGATTGGTGCTTACTCGAGGGAGAAT 480
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 522 ATGCGTGAGAGAAATCTGTTTACATGGTCTGCTATGATTGGTGCTTACTCGAGGGAGAAT 581
Query 481 CGGTGGAGAGAGGTCTCTAAGCTCTTTCGTTTGATGATGGAAGACGGTGTTTTGCCTGAT 540
|||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 582 CGGTGGAGAGAGGTGGCGAAGCTCTTTCGTTTGATGATGAAAGATGGTGTTTTGCCTGAT 641
Query 541 GATTTCTTGTTTCCCAAGATTTTACAGGGATGTGCGAATTGTGGAGATGTTGAGACTGGG 600
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 642 GATTTCTTGTTTCCTAAGATATTACAGGGATGTGCTAATTGTGGAGATGTTGAGGCTGGG 701
Query 601 AAGTTGATTCATTCGGTGGTTATAAAACTCGGGATGAGTTCGTGTCTTCGTGTTAGCAAC 660
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 702 AAGGTGATTCATTCGGTGGTTATAAAACTCGGGATGAGTTCGTGTCTTCGTGTTAGTAAC 761
Query 661 TCTATTTTAGCTGTGTATGCGAAATGCGGTGAATTGGATTTCGCTACCAAGTTTTTTAGA 720
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 TCGATTTTAGCTGTGTATGCGAAATGTGGTGAATTGGATTTCGCTACCAAGTTTTTTAGA 821
Query 721 CGCATGAAGGAGAGAGATGTGGTTGCTTGGAACTCAGTACTGTTAGCTTACTGCCAAAAT 780
|| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 CGTATGAGGGAGAGAGATGTGATTGCTTGGAACTCAGTACTGTTAGCTTACTGCCAAAAT 881
Query 781 GGTAAACATGAAGAAGCTGTAGAATTGGTTGAAGAGATGGAAAAGGAAGGAATTTCTCCA 840
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 GGTAAACATGAAGAAGCTGTAGAATTGGTTAAAGAGATGGAAAAGGAAGGAATTTCTCCT 941
Query 841 GGGTTAGTTACTTGGAACATATTGATTGGGGGTTATAACCAGCTAGGGAAATGTGATGCT 900
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 942 GGGTTAGTTACTTGGAACATACTGATTGGGGGTTATAACCAGCTAGGGAAATGTGATGCT 1001
Query 901 GCCATGGATTTGATGCAGAAGATGGAGAATTTTGGTATAACTGCTGACGTGTTTACGTGG 960
|| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1002 GCAATGGATTTGATGCAGAAGATGGAGACTTTTGGTATAACTGCTGATGTGTTTACGTGG 1061
Query 961 ACTGCTATGATTTCGGGTTTGATTCATAATGGGATGAGATATCAGGCATTAGATATGTTT 1020
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 ACAGCTATGATTTCGGGTTTGATTCATAATGGGATGAGATATCAGGCATTAGATATGTTT 1121
Query 1021 AGGAAGATGTTTTTAGCGGGTGTAGTGCCGAATGCAGTCACTATTATGAGTGCTGTGTCT 1080
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122 AGGAAGATGTTTTTAGCGGGTGTAGTGCCAAATGCAGTCACTATTATGAGTGCTGTGTCT 1181
Query 1081 GCTTGTTCATATTTGAAAGTTATAAACCTGGGCTCAGAAGTTCACTCTATTGCTGTGAAG 1140
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1182 GCTTGTTCATGTTTGAAAGTTATAAACCAGGGCTCAGAAGTTCATTCTATTGCTGTGAAG 1241
Query 1141 ATGGGGTTTATCGACGATGTGCTTGTGGGCAATTCTCTGGTTGATATGTATTCAAAGTGT 1200
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1242 ATGGGATTTATCGATGATGTGCTTGTGGGCAATTCTCTGGTTGATATGTATTCAAAGTGT 1301
Query 1201 GGAAAACTGGAAGATGCAAGGAAAGTTTTTGATTCGGTAAAGAATAAGGATGTATATACT 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302 GGAAAACTGGAAGATGCAAGGAAAGTTTTTGATTCGGTAAAGAATAAGGATGTATATACT 1361
Query 1261 TGGAACTCAATGATAACAGGGTATTGCCAAGCAGGCTATTGTGGGAAGGCTTATGAATTG 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1362 TGGAACTCAATGATAACAGGGTATTGCCAAGCAGGCTATTGTGGGAAGGCTTATGAGTTG 1421
Query 1321 TTTACAAGGATGCAAGATGCAAATGTAAGACCAAATATTATCACATGGAACACGATGATC 1380
||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1422 TTTACGAGGATGCAAGATGCAAATTTAAGACCAAATATTATCACATGGAACACAATGATC 1481
Query 1381 TCAGGATATATTAAGAATGGAGACGAGGGTGAGGCTATGGACTTATTTCAGAGGATGGAA 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482 TCAGGATATATTAAGAATGGAGACGAGGGTGAGGCTATGGACTTATTTCAGAGGATGGAA 1541
Query 1441 AAAGATGGAAAAGTTCAGCGAAATACTGCAACATGGAACCTAATTATTGCGGGTTACATA 1500
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1542 AAAGATGGAAAAGTTCAGCGGAATACTGCAACATGGAATCTAATTATTGCAGGTTACATA 1601
Query 1501 CAAAACGGAAAAAAGGACGAGGCCTTGGAAATTTTTCGGAAAATGCAGTTTTCTCGCTTC 1560
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1602 CAAAACGGAAAAAAAGACGAGGCCTTGGAACTTTTTCGAAAAATGCAGTTTTCTCGCTTC 1661
Query 1561 ATGCCAAATTCGGTTACCATTCTAAGTCTTTTACCCGCTTGTGCTAATCTTCTTGGGACA 1620
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||
Sbjct 1662 ATGCCAAATTCAGTTACCATTCTAAGTCTCTTACCAGCGTGTGCTAATCTTCTTGGGGCA 1721
Query 1621 AAAATGGTAAGAGAGATACACGGTTGTGTATTGCGGAGAAACCTAGATGCTATTCATGCC 1680
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 1722 AAAATGGTAAGAGAGATACACGGTTGCGTATTGCGGAGAAATCTTGATGCTATTCATGCC 1781
Query 1681 GTTAAAAACGCTTTAACAGATACTTATGCTAAGTCAGGGGATATAGGATATTCAAGAACC 1740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 1782 GTTAAAAACGCTTTAACAGATACTTATGCTAAGTCAGGGGATATAGAATACTCAAGAACC 1841
Query 1741 ATCTTCATGGGTATGGAAACGAAAGACATCATAACTTGGAACTCGCTGATTGGAGGTTAT 1800
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 ATCTTCCTGGGTATGGAAACGAAAGACATCATAACTTGGAACTCGCTGATTGGAGGTTAT 1901
Query 1801 GTTTTACATGGTAGCTATGGTCCAGCTCTTGAACTTTTTAATCAAATGAAGACACAGGGG 1860
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1902 GTTTTACATGGTAGCTATGGTCCAGCTCTTGCTCTTTTTAATCAAATGAAGACACAGGGG 1961
Query 1861 ATTAAGCCGAATAGGGGAACTCTTTCGAGTATTATTCTTGCACACGGTCTAATGGGAAAT 1920
|||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1962 ATTACGCCGAACAGGGGAACGCTTTCGAGTATTATTCTTGCGCACGGTCTAATGGGAAAT 2021
Query 1921 GTAGACGAAGGAAAGAAAGTCTTCTACAGCATTGCGAATGATTACCATATTATTCCTGCT 1980
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2022 GTAGACGAAGGAAAGAAAGTTTTCTACAGCATTGCGAATGATTACCATATTATTCCTGCT 2081
Query 1981 CTGGAACACTGTTCTGCTATGGTATCTTTGTATGGACGATCCAACAGACTTGAAGAAGCT 2040
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2082 CTGGAACATTGTTCTGCTATGGTATATTTGTATGGACGAGCCAACAGACTTGAAGAAGCT 2141
Query 2041 CTGCAGTTTATCCAGGAGATGAATATTCAATCAGAGACACCCATCTGGGAAAGCTTCTTA 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2142 CTGCAGTTTATCCAGGAGATGAATATTCAATCAGAGACACCCATCTGGGAAAGCTTCTTA 2201
Query 2101 ACTGGCTGCAGGATTCATGGTGATATTGACATGGCAATCCATGCCGCAGAGAACTTATTC 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202 ACTGGCTGCAGGATTCATGGTGATATTGACATGGCAATCCATGCCGCAGAGAACTTATTC 2261
Query 2161 TCCTTGGAACCTGAAAATACGGTCACTGAAAATATTGTTTCGCAGATCTATGCATTAGGT 2220
|||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2262 TCCTTGGAACCTGAAAATACAGCCACTGAAAGTATTGTTTCGCAGATCTATGCATTAGGT 2321
Query 2221 GCAAAACTTGGGAGGTCATTAGAAGGAAAGAAGCCGAGGAGAGATAACTTGCTGAAGAAA 2280
|||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 2322 GCAAAACTTGGGAGATCATTAGAAGGAAATAAACCGAGGAGAGATAACCTGTTGAAGAAA 2381
Query 2281 CCTCTTGGGCAGAGCTGGATTGAAGTCAAAAATTTAATTCACACATTCACGACAGGTGAT 2340
||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2382 CCTCTCGGGCAGAGCTGGATTGAAGTCAGAAATTTAATTCACACATTCACGACAGGTGAT 2441
Query 2341 CAGTCGAAATTATGTACTGATCTTCTGTATCCCTGGGTGGAAAAAATGTGTAGGCTGGAT 2400
||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2442 CAGTCGAAATTATGTACTGATGTGCTGTATCCCTTGGTGGAAAAAATGAGTAGGCTGGAT 2501
Query 2401 AATAGAAGTGACCAATATAATGGAGAACTTTTGATCGAGGAAGAAGGAAGGGAAGAAATT 2460
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2502 AATAGAAGTGACCAATATAATGGAGAACTTTGGATTGAGGAAGAAGGAAGGGAAGAAACT 2561
Query 2461 TGTGGAATCCATAGCGAAAAAATTGCCATGGCGTTTGGTCTCATTTCCTCATCCCGTGCA 2520
||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 2562 TGTGGAATCCACAGTGAAAAATTTGCCATGGCGTTTGGTCTCATTTCGTCATCCGGTGCA 2621
Query 2521 CCTAAGGCGACGATAAGGATCTTGAAAAATCTTAGGATGTGCCGAGACTGCCATAATACT 2580
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2622 TCTAAGACGACGATAAGGATCTTGAAAAATCTTAGGATGTGCCGAGACTGCCATGATACT 2681
Query 2581 GCAAAG 2586
||||||
Sbjct 2682 GCAAAG 2687
Score = 126 bits (68), Expect = 2e-27
Identities = 68/68 (100%), Gaps = 0/68 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2586 GACACAAGATGCTTGCACCACTTTAAGAATGGAGATTGTTCCTGTAAAGATTATTGGTAG 2645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2727 GACACAAGATGCTTGCACCACTTTAAGAATGGAGATTGTTCCTGTAAAGATTATTGGTAG 2786
Query 2646 AGTGATTA 2653
||||||||
Sbjct 2787 AGTGATTA 2794
> AT1G19715.3 | Symbols: | Mannose-binding lectin superfamily
protein | chr1:6816896-6819513 REVERSE LENGTH=1925
Length=1925
Score = 2837 bits (1536), Expect = 0.0
Identities = 1706/1790 (95%), Gaps = 4/1790 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2686 AGTGTTGAAGGCAAGCCTGCATCAGTCGGCCCATGGGGAGGCCA-ATGTGGTCATGCCTG 2744
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 103 AGTGTTGAAGGCAAGCCTGCATCACTTGGCCCATGGGGAGGCCAGA-GTGGTCATGCCTG 161
Query 2745 GGATGATGGAATGTACACCACAGTAAAGCAAATAATTATAGCCCATGGTTCTGGAATAGA 2804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 GGATGATGGAATGTACACCACAGTAAAGCAAATAATTATAGCCCATGGTTCTGGAATAGA 221
Query 2805 CTCCATACAAGTTGAGTACGACAAAAACGGTAGCTCTGTTTGGTCTGAAAAACGCGGAGG 2864
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 222 CTCCATACAAATTGAGTATGACAAAAACGGTAGCTCGGTTTGGTCTGAAAAACGTGGAGG 281
Query 2865 AAAGGGAGGCAAGAAGTTTGATAAGGTCAAACTTGATTACCCACATGAGTATCTGATTTC 2924
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282 AAAGGGAGGCAAGAAGTTTGATAAGGTCAAATTTGATTACCCACATGAGTATCTGATTTC 341
Query 2925 AATCAATGGAACATACGGTAGCTTTGACGTCTGGGGAACTTTATGTGTCCGATCACTTAC 2984
| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 342 AGTAAATGGAACCTACGGTAGCTTTGACGTCTGGGGAACTATATGTGTCCGATCACTTAC 401
Query 2985 TTTTGAGAGTAACCGCAGAAAATATGGACCATTTGGTGTTGAGTCAGGTACATTCTTCGC 3044
||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 402 TTTCGAGAGTAACCGCAGAAAATATGGACCGTTTGGTGTTGATTCAGGTACATTCTTTGC 461
Query 3045 ATTACCAAAATCAGGGTCAAAGATTGTTGGGTTCCATGGGAAGGCTGGTTGGTATTTGGA 3104
||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 ATTGCCAAAATCAGGATCGAAGATTATTGGGTTCCATGGGAAGGCTGGTTGGTATTTGGA 521
Query 3105 TGCTATTGGTGTTCACATTCAGCCAGTTCCTAAAGAGAATAATCCTTCGTCGAAAATCCT 3164
||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 522 TGCTATTGGTGTTCACACTCAACCAATTCCTAAAGAGAATAATCCTTCGTCGAAAATCCT 581
Query 3165 TTTGCATTCGCATCAAAGTTTCCCTCAGGGTGATAAGAAACATGAGTACTCAGTGATACA 3224
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 582 TTTGCACTCGCATCAAAGTTTTTCTCAGGGTGATAAGAAACATGAGTACTCAGTGCTACA 641
Query 3225 AGGAAGTGTAGGGCAAAACTTTGATATAGTTGTTGCCCTCAGAAAGAAAGATCCAACTTT 3284
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 642 AGGAAGTGTAGGGCAAAACTTTGATATAGTTGTTACCCTCAGAAAGAAAGATCCAACTTT 701
Query 3285 GCCTTCTTTTGAATCCCGGGATTCCGCAGGTGCCGAGATCACCAAACATAAGTTGGTGAC 3344
|||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 GCCTTCTTTTGAGTCCCGAGATTCCGCAGGAGCCGAGGTCACCAAACATAAGTTGGTGAC 761
Query 3345 AGATACTGAGAAGTCACAGTCAAAAGTTGAAGGTGGCGCGAAAACATATGGACCATGGGG 3404
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 AGATACTGAGAAGTCACAGTCAAAAATTGAAGGTGGCGCGAAAACATATGGACCATGGGG 821
Query 3405 TGGAACCGGTGGTATCATGTTTGACGATGGGATTTATACCGGTA-TCAGACAAATCAATT 3463
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 822 CGGAACCGGTGGAATCATGTTTGACGATGGGATTTATACCGGTATTC-GACAAATCAATT 880
Query 3464 TGTCACGTAGTGTCGGGATTGTGTCGATAAAGGTCTGTTATGATTTTAGAGGACAAGCTG 3523
||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 TGTCACGCAATGTCGGGATTGTGTCGATGAAGGTCTGTTATGATTTTAGAGGACAAGCTG 940
Query 3524 TGTGGGGAAGCAAACATGGTGGCATGGGAGGATTCAAACATGATAAGATTGTATTTGACT 3583
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 TGTGGGGAAGCAAACATGGTGGCGTGGGAGGATTCAAACATGATAAGATTGTATTTGACT 1000
Query 3584 ACCCATCAGAGGTTTTAACACATGTAACGGGAACATATGGGCCGCTGATGTACATGGGAC 3643
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1001 ACCCTTCAGAGGTTTTAACACATGTAACGGGAACATATGGGCCGCTGATGTATATGGGAC 1060
Query 3644 CTAATGTGATAAAGTCACTGACTTTCCGCACCAACAGAGGAAAACATGGACCTTATGGAG 3703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1061 CTAATGTGATAAAGTCACTGACTTTCCGCACCAACAGAGGAAAGCATGGACCTTATGGAG 1120
Query 3704 AAGAACAAGGTCCTTCTTTTACACATCAAATTGATGAGGGTAAAGTTGTTGGATTCCTTG 3763
|||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121 AAGAACAAGGACCGTCTTTTACACATCAAATGGACGAGGGTAAAGTTGTTGGATTCCTTG 1180
Query 3764 GAAGAGAGGGTTTGTTTCTTGATTCCATTGGTGTTCATGTTATGGAATGCAAGATAAGTT 3823
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1181 GAAGAGAGGGTTTATTTCTTGATTCCATAGGTGTTCATGTTATGGAATGCAAAATAAGTT 1240
Query 3824 CCCTTAAGCCAGCATCTCCTAACAATTCAATTGTTCCTCATAATAACTCCGGCACTGCGC 3883
||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241 CCCTTAAGCCATCATCTCCTCACAATGCAATTGTTCCTCATAATAACTCCGGCACTGCGC 1300
Query 3884 AAATCGAAAATTCCCCATGGGCTAATAAGCTAGTCCTTGCAGCAAACGGCCATGGCGAAG 3943
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 AAATAGAAAATTCCCCATGGGCTAATAAGCTAGTCCTTGCAGCAAACGGCCATGGCGAAG 1360
Query 3944 AGGTTGATCGTGGAGTCGTCAAAGAACCAACACCGAGCGGTTCTGGACCGTGGGGAGGCG 4003
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 1361 AGGTTGATCGTGGAGTCGTCAAAGAACCAACACCGAGCGGGCCTGGACCGTGGGGAGGTG 1420
Query 4004 ACGGAGGTCAAGCTTGGGATGATGGAGTATTTTCAGGGATCAAGCAGATATTTGTGACAA 4063
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1421 ACGGAGGTCAAGCTTGGGACGATGGAGTATTTTCAGGGATCAAGCAGATATTTGTGACAA 1480
Query 4064 GAGGAAATGATGTTATCTCTTCAATACAAGTCGAGTACGATAGAAATGGACAATCTGTTT 4123
|||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1481 GAGGAAATGATGCTATCACTTCAATACAAATTGAGTACGATAGGAATGGACAATCTGTTT 1540
Query 4124 GGTCCACTAAACATGGTGGTGATAACAATGGAGTCGCCACACACAGAATTAAACTTGAGT 4183
|||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1541 GGTCCATTAAACATGGTGGTGACAGCAATGGAGTCGCTACACACAGAATTAAATTTGAGT 1600
Query 4184 ATCCAAACGAAACGATCACCTGCATTTCAGGGTATTACGGACCTCTGAACAATTCAGACA 4243
||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601 ATCCAGATGAATCGATCACCTGCATTTCAGGGTATTACGGACCTCTGAACAATTCAGACC 1660
Query 4244 GATATAATGTTGTCAAGTCTCTGAGTTTTTACACGAGCCGTGGGAAGTATGGTCCATACG 4303
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||
Sbjct 1661 GATATAATGTTGTCAAGTCTCTGAGTTTCTACACGAGCCGTGGGAGGTACGGGCCATACG 1720
Query 4304 GTGAAGAAACCGGGACGTTTTTCACTTCAACTACAACACAAGGAAAAGTTTTGGGGTTCC 4363
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1721 GTGAAGAAACCGGGACGTTTTTCACTTCGACTACAACACAAGGAAAAGTTTTGGGGTTCC 1780
Query 4364 ATGGAAGGAGTAGCTCGCACTTGGACGCCATTGGAGTGCATATGCAGCATTGGCTTGGCA 4423
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781 ATGGAAGGAGTAGCTTTCACTTGGACGCCATTGGAGTGCATATGCAGCATTGGCTTGGCA 1840
Query 4424 ACAATAAGCCTTATTACAGCAGGGCTAGTTGTTTCAAGCTCTTTTCATAA 4473
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 1841 ACAATAAGTCTTATTACAGCAGGGCTAGTTGTTTCAAGCTCTTCTGATAA 1890
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 223042228578
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5