BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg347608 Length=2379 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G45190.1 | Symbols: | SIT4 phosphatase-associated family pr... 3836 0.0 > AT3G45190.1 | Symbols: | SIT4 phosphatase-associated family protein | chr3:16541673-16548278 REVERSE LENGTH=2808 Length=2808 Score = 3836 bits (2077), Expect = 0.0 Identities = 2286/2385 (96%), Gaps = 21/2385 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTTTTGGAAGTTGACTGCTCTCTCTGCTGCTTCACCGGTCGAATCGATATTAGACAAG 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 118 ATGTTTTGGAAGTTGACTGCTCTCTCTGCTGCTTCACCGGTTGAATCCATATTAGACAAG 177 Query 61 GAAGATTTCACTTTGGAAGAACTATTGGATGAGGAAGATATAATCCAAGAATGCAGAGCT 120 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 178 GAAGATTTCACTTTGGAAGAACTTTTGGATGAGGAAGACATAATCCAAGAATGCAGAGCT 237 Query 121 TTGAACAGCCGTCTCATAAATTTTCTGAGAGAAAGAGCCCAAGTGGAACAGTTGTTACGT 180 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 238 TTGAACAGCCGGCTCATAAATTTTCTGAGAGAAAGAGCCCAAGTGGAACAGTTATTACGT 297 Query 181 TTTATTGTTGAAGAATCTCCTGAAGATGCTGATAGCAAGCGCGCTTTCAAGTTTCCTTTC 240 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 298 TTTATTGTTGAAGAATCTCCTGAAGATGCAGACAGCAAGCGCGCTTTCAAGTTTCCTTTC 357 Query 241 ATCTCCTCTGAAGTCTTGACCTGTGAAATTGATGTTATTCTTAAGACTTTGGTAGACGAG 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| Sbjct 358 ATCTCCTCTGAAGTCTTGACCTGTGAAATTGATGTAATTCTCAAGACTTTAGTGGACGAG 417 Query 301 GAGGAGCTAATGAACCTACTTTTCTCCTTTTTGGAACCCAACCGTTCCCACAGTGTAATG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 418 GAGGAGCTAATGAACCTACTTTTCTCCTTTTTGGAACCCAACCGTTCCCACAGTGTAATG 477 Query 361 CTAGCTGGGTATTTCAGCAAGGTTGTCATATGCCTCATGTTGAGGAAGACGGTCCCGCTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 478 CTAGCTGGGTATTTCAGCAAGGTTGTCATATGCCTCATGTTGAGGAAGACGGTCCCGCTG 537 Query 421 ATGAACTATGTAAAAGCTCATCAGAATGTTTTCCAGCAACTGGTTGATTTGATAGGGATC 480 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 538 ATGAACTATGTAAAAGCCCATCAGAATGTTTTCCAGCAACTGGTTGATTTGATAGGGATC 597 Query 481 ACGTCCATTATGGAGGTTCTAATCCGGTTGGTTGGTGCGGATGATCATGTGTATCCCAAC 540 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 598 ACGTCCATTATGGAGGTTCTTATCCGGTTGGTTGGTGCGGATGATCATGTGTATCCTAAC 657 Query 541 CACCTAGATGTGATGCAATGGTTAGCTGATAGCAATCTGCTTGAAATGATTGTGGATAAG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 658 CACCTAGATGTGATGCAATGGTTAGCTGATAGCAATCTGCTTGAAATGATTGTGGATAAG 717 Query 601 CTTAGCCCATCAAACTCTCTTGAAGTTCATGCAAATGCTGCCGAAACACTGTGCACTATC 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 718 CTTAGCCCATCAAACTCTCTTGAAGTTCATGCAAATGCTGCTGAAACACTGTGCACTATC 777 Query 661 GCTCAAAATGCACCGTCACCGTTGGCTACCAAACTCTCTAGTTCAAGTTTTGTTGGAAGG 720 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct 778 GCTCAAAATGCACCGTCACCGTTGGCTACCAAACTTTCTAGTTCAAGTTTTGTTGCAAGG 837 Query 721 ATATTTGGTCATGCTTTCGAAGATCCCCAGTCCAAATCTAGCCTTGTCCACACACTTTCA 780 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 838 ATATTTGGTCATGCTTTCGAAGATCCTCAGTCCAAATCTAGCCTTGTCCACACACTTTCG 897 Query 781 GTGTGCATTTCATTGTTGAGCCCAAGAAGATCTGTAGTTTCTTCCCCCTTTATGTATTCA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 GTGTGCATTTCATTGTTGAGCCCAAGAAGATCTGTAGTTTCTTCCCCCTTTATGTATTCA 957 Query 841 TTCAGGGGCCAACAAATCTTCGAGTCTCCAATTTCTGTGAATCCGGAGACTATTGCCACC 900 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 958 TTCAGGGGACAACAAATCTTCGAGTCTCCAATTTCTGTGAATCCGGAGACTATTGCCACC 1017 Query 901 ATGCTGCCTAGACTTGGTGACTTTGTCGCGCTTTTAAATGTGACCTCTGATGAAAAGATT 960 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1018 ATGCTGCCTAGACTTGGTGACTTTGTCGCACTTTTAAATGTGACCTCTGATGAAAAGATT 1077 Query 961 TTACCTACAACCTATGGGCAGTTGAGGCCTCCTCTTGGCAGTCATCGGCTAAAGATTGTG 1020 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct 1078 TTACCTACAACCTATGGGCAGTTGAGGCCTCCTCTTGGCAGTCATCGTCTGAAGATTGTG 1137 Query 1021 GAGTTCATTGCTGTCTTGCTGAAAACTCGGAGTGAAGTGACAGGAAAAGAACTAGCCAAC 1080 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | Sbjct 1138 GAGTTCATTGCTGTCTTGCTGAAAACTCGAAGTGAAGCAACAGGAAAAGAACTAGCTAGC 1197 Query 1081 TCAGGAGCTATTAGAAGAGTCCTTGATCTGTTTTTTGAGTACCCGTATAATAATGCACTG 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1198 TCAGGAGCTATTAGAAGAGTCCTTGATCTGTTCTTTGAGTACCCGTATAATAATGCTCTG 1257 Query 1141 CACCATCAGGTGGAGAGTATAATAGTATCGTGTTTGGAAAGCAAAAACGATGAGATTGTT 1200 || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 1258 CATCATCAGGTGGAGAGTATAATTTTATCGTGTTTAGAAAGCAAGAACGATGAGATAGTT 1317 Query 1201 GACCATCTTCTCCGAGAGTGTGATTTGATTGGAAAAATTATTAAAACAGAGAAACAGCCA 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1318 GACCATCTTCTCCGAGAGTGTGATTTGATTGGAAAAATTATTAAAACAGAGAAACAGCCA 1377 Query 1261 ATTCTTTCTGGTGATAAGCAGCCAACATTAGCTGCTGCTGGAAAGCAGGCTCCACGGGTG 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1378 ATTCTTTCTGGTGATAAGCAGCCAACATTAGCTGCTGCTGGAAAGCAGGCTCCACGGGTG 1437 Query 1321 GGAAATGTTGGTCATATCTCAAGAATTTCAAACAAGCTTGTTCAGCTGTCAACTAACAGT 1380 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1438 GGGAATGTTGGTCATATCTCAAGAATCTCAAACAAGCTTGTTCAGCTGTCAACTAACAGT 1497 Query 1381 AACCAGATAAAGACTTTACTTGAGGAAAATAACGATTGGGGTGAGTGGGAAGCAAATACG 1440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1498 AACCAGATAAAGACTTTACTTGAGGAAAATAACGATTGGGGTGAGTGGGAAGCTAATACG 1557 Query 1441 TTGCATGATCGAAATGCAGTTGAGAATGTGTATCGCTGGGTTTGCGGACGCCCGACTGCA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1558 TTGCATGATCGAAATGCAGTTGAGAATGTGTATCGCTGGGTTTGCGGACGCCCGACTGCA 1617 Query 1501 TTACATGATAGAACTAGGGACAGTGACGATGATGAAGTTCATGATAGGGATTATGATCTT 1560 ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1618 TTACATGATAGGACTAGGGACAGTGATGATGACGAAGTCCATGATAGGGATTATGATCTT 1677 Query 1561 GCTGGGTTGGCTAATAACTTGAACCAGTTCAGATACAACATGCAAGAGAACAATGGTGCT 1620 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1678 GCTGGTTTAGCTAATAACTTGAACCAGTTCAGATACAACATGCAAGAGAACAATGGTGCT 1737 Query 1621 GGAGAGGAGCATGGTTCCAATGACAGAGATGAAGAGGATGTCTATTTTGATGATGAATCT 1680 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1738 GGAGAGGAGCATGGTTCTAATGACAGAGATGAAGAGGATGTCTATTTTGATGATGAATCT 1797 Query 1681 GCTGAAGTTGTTATATCATCTCTAAGGCTTGGTGATGAACAGGCAAACAATTTATTCACA 1740 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct 1798 GCTGAAGTTGTTATATCATCTCTAAGGCTTGGTGATGAACAAGCGAACAATTTATTCACC 1857 Query 1741 AACTCGAACTGGTTCACGTTCCAAGGAGATGAATTGGGCGAAAACACAGGAACAGGAGCG 1800 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1858 AACTCGAACTGGTTCACGTTCCAAGGAGATGAATTAGGCGAAAACACAGGAACAGGAGCG 1917 Query 1801 ATATCTTCGGAGGAAGCAATGGAAGATGTAAGCTTGAATGAAACTTCCGGTGGTGGAGAT 1860 || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| Sbjct 1918 ATTTCTTCCGAGGAAGCAATGGAAGATGTAAGCTTGAATGAAACTTCCGATGGCGGAGAT 1977 Query 1861 GAAGAAGATGAAGAC------TGTTTGATTACAGAAAGCAAGAACCCTTTTGTTGACTCG 1914 |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1978 GAAGAAGACGAAGACGAAGACTGTTTGATTACAGAAAGCAAGAACCCTTTTGTTGACTCA 2037 Query 1915 GCTGCAGCCACAGCCTCAACCTCAGAAGCAGTCTCTGTAGACGCTGATATCGAGATTGAC 1974 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2038 ACTGCAGCCACAGCCTCAACCTCAGAAGCAGTCTCTGTAGACGCTGATATCGAGATTGAT 2097 Query 1975 GAAGATGTGGGTACAGATGAATTGTCACCGGAATGGATTGAACGTGGTGATTCATCTTCA 2034 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 2098 GAAGATGTGGGTACAGATGAATTGTCACCTGAATGGGTTGAACGTAATGATTCATCTTCA 2157 Query 2035 TCCGTTCCACCGGTCACTACAGATCCGTTCCCGGAAGATGATGTGAAGATGCCTGATGTG 2094 || || |||||| | | | | | | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2158 GCCATTGCACCGGG-A--A--G-TAC--------A-GATGATGTGAAGATGCCTGATGTG 2202 Query 2095 AGAATCCCGAACGGTTCTTCATCCTCGGAAGGTGAGATTAGCCCAAGATCACCGCCCGTA 2154 |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 2203 AGAATCCCAAACGGTTCTTCATCCTCAGAAGGTGAGATTAGCCCGAGATCACCGCCTGTA 2262 Query 2155 CCTTCATTGTTTGGAAAGGACGTTGAGTTTGTGGGAGTTGAGCCAGAAGGAACAGAAAGG 2214 ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2263 CCTTCATTGTTTGGAAAAGATGTTGAGTTTGTGGGAGTTGAGCCAGAAGGAACTGAAAGG 2322 Query 2215 GCAATGGATCAAGCTCTCAAGGAAGGCATAGTGGGAGAAGCAGGGCCGATGAAGAGGAAC 2274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2323 GCAATGGATCAAGCTCTCAAGGAAGGCATAGTGGGAGAAGCAGGACCGATGAAGAGGAAC 2382 Query 2275 ACCACCACAGCCTCACCGGGAAAGGATAGCCCCGATGATAGTATGCAGGAGTACAACGAC 2334 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2383 ACCACCACAGCCTCACCGGGAAAGGAGAGCCCTGATGATAGTATGCAGGAGTACAACGAC 2442 Query 2335 ACTAACTACTGGAAGGTTGATCAGGAGGTGACTGTAGTTGAATGA 2379 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2443 ACTAACTACTGGAAGGTTGATCAGGAGGTGACTGTAGTTGAATGA 2487 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 118121882385 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5