BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg352131 Length=2742 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT4G10590.2 | Symbols: UBP10 | ubiquitin-specific protease 10 |... 3980 0.0 AT4G10570.1 | Symbols: UBP9 | ubiquitin-specific protease 9 | c... 3971 0.0 > AT4G10590.2 | Symbols: UBP10 | ubiquitin-specific protease 10 | chr4:6538541-6543448 REVERSE LENGTH=3287 Length=3287 Score = 3980 bits (2155), Expect = 0.0 Identities = 2564/2758 (93%), Gaps = 41/2758 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGACGATCCCTAATTCCGATTTCATGATTGAAAACGGAGTCTGTGATTTTCCGACTACT 60 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 177 ATGACGATCCCTAATTCCGATTTCATGATCGAGAACGGAGTCTGTGATTTTCCGACTACT 236 Query 61 CCTGCCGAAGAGAAACGTATTGTATCGGAGCTGATTACCGAATCGGAAGATAATTTGAAA 120 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 237 CCTGAAGAAGAGAAACGGATTGTATCGGAGCTGATTACCGAATCGGAGGATAATTTGAAG 296 Query 121 GAAGGAAACTTGTATTTTGTCATCTCTAAAAGGTGGTATGCAAGCTGGCAGAAATATGTT 180 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 297 GAAGGGAACTTGTATTTTGTCATCTCTAAAAGGTGGTATACAAGCTGGGAGAAATATGTT 356 Query 181 GAGCAATCGACAGATGAATGTATAAGTGGGGAGTCCTC----G-----AGGCCTGGAGCG 231 |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||| | ||||| ||| || Sbjct 357 GAGCAATCGACAAAAGAATATATAAGTGGAGAGTCCTCTGAAGCTTCAAGGCCAGGACCG 416 Query 232 ATTGATAACCATGATATTATCGAAAGTGAAAGCGACGCGAATGATCCACAGCTTCGTAGA 291 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 417 ATTGATAACCATGATATTATCGAAAGTGAAAGCGACGTTAATGATCCACAACTTCGTAGA 476 Query 292 TTGTTGGTGGAAGGGGTTGACTACGTTTTAGTTCCTCAAGAAGTCTGGAAAAGACTTGTT 351 |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 477 TTGTTGATGGAACGGGTTGACTACGTTTTAGTTCCTCAAGAAGTTTGGAAAAGACTTGTT 536 Query 352 GAATGGTATAGCGGAGGTCCTCCGATAGAAAGGAAGTTGATCTGTCAAGGCTTTTATAGT 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | Sbjct 537 GAATGGTATAGCGGAGGTCCTCCGATAGAAAGGAAGTTGATCTGTCAAGGATTTTATACT 596 Query 412 AGGAGTTATAGTGTAGAGGTTTACCCACTCTGCCTTATGTTGACAGACGGACGAGATGAG 471 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 597 AGGAGTTATAGTGTAGAGGTTTACCCACTCTGCCTTATGTTGACGGACGGACGAGATGAA 656 Query 472 AGTAGAACTACAATACGGTTGGGAAAACAAACCTCTATAAGGGAACTTTGTGAGAAGGTT 531 ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 657 AGTAGAACTGTAATACGGTTGGGAAAACAGGCCTCTATAAGGGAACTTTATGAGAAGGTT 716 Query 532 TGCACTATGACAGGGGTAGCGCAAGAAAAGGCTCACATATGGGATTATTTCCATAAGAGG 591 || || ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||| Sbjct 717 TGTGCTTTGACAGGGGTACCACAAGAAAAGGCTCATATCTGGGATTACTTCGATAAGAGG 776 Query 592 AAAAACGGACTCTTGGATCCTTCATCTAACAAGAGCCTGGAAGAGTCTAGCCTTCAGATG 651 |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 777 AAAAACGGACTCTTGGATTCTTTATCTTACAAGAGCCTGGAAGAGTCAAGCCTTCATATG 836 Query 652 GACCAAGATATTCTTCTTGAAGTTGATGGGTCGTCTTCCTCTCAATATGCTATGAGCTCG 711 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 837 GACCAAGATATTCTACTTGAAGTTGATGGGTCGTCTTCCTCTCAGTCTGCTATGAGCTCG 896 Query 712 GCAGGAAATGAGTTAGCTCTGGTACCTCTGGAACCTTCAAGGTCGCGTGTTACAATTGCT 771 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| Sbjct 897 ACAGGAAATGAGTTAGCTCTGGTACCTCTGGAACCTTCCAGGTCGAGTGTTACAATTGCT 956 Query 772 GGGGGGCCTACCCTATCAAATGGTCATTCCACTACGTCCAAGTTTAGTCTCTTTCCGAGA 831 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 957 GGGGGGCCTACCCTATCAAATGGTCATTCCACTACGTCCAACTTTAGTCTCTTTCCGAGA 1016 Query 832 ATAACTTCTGAAGACGACGGCTGCAATTCTTTGAGTATTCTTGGAAAAGGAGAAAAGGGA 891 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1017 ATAACTTCTGAAGACGACGGCAGCAATTCTTTGAGTATTCTTGGAAAAGGAGAAAAGGGA 1076 Query 892 GGATTAGCAGGATTGAGTAATTTGGGAAATACCTGCTTTATGAATAGCGCTCTTCAGTGT 951 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1077 GGATTAGCAGGATTGAGTAATTTGGGAAATACCTGCTTTATGAATAGCGCTCTTCAGTGT 1136 Query 952 TTGGCCCACACACCTCCAATTGTTGAATACTTCTTGCAAGATTACAGTGATGACATAAAT 1011 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1137 TTGGCCCACACACCTCCAATTGTTGAATACTTCTTGCAAGATTACAGTGACGACATAAAT 1196 Query 1012 AGAGATAATCCTTTGGGAATGTGTGGTGAGCTTGCTATCGCATTTGGTGATTTGTTGAAG 1071 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1197 AGAGATAATCCTTTGGGAATGTGTGGTGAGCTTGCTATCGCGTTTGGTGATTTGTTGAAG 1256 Query 1072 AAATTATGGTCATC---AAGGAACGCAGTTGCACCACGCTCTTTTAAGACAAAGTTGGCT 1128 |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| Sbjct 1257 AAATTATGGTCATCAGGAAGGAACTCAGTTGCACCACGCGCATTTAAGACAAAATTGGCT 1316 Query 1129 AGATTTGCTCCACAGTTTAGTGGTTACAATCAGCATGATTCTCAAGAACTGCTTGCTTTC 1188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1317 AGATTTGCTCCACAGTTTAGTGGTTACAATCAGCATGATTCTCAAGAACTGCTTGCTTTC 1376 Query 1189 TTATTGGATGGGCTGCATGAAGATTTGAATAAGGTCAAACGAAAACCTTACATCGAACTT 1248 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1377 TTATTGGATGGGCTGCATGAAGATCTGAATAAGGTCAAACGAAAACCTTACATCGAACTT 1436 Query 1249 AAAGATTCTGACAGTCGTCCGGATGATGAAGTTGCTGAAGAGCTTTGGAATTATCATAAG 1308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1437 AAAGATTCTGACAGTCGTCCGGATGATGAAGTTGCTGAAGAGCTTTGGAATTATCATAAG 1496 Query 1309 GCCCGAAATGATTCTGTAATAGTTAACGTCTGTCAAGTATTCGATTTCTGTCAAGGCCAA 1368 ||||||||||||||||| | | | | | | | | | | | || |||||||||||| Sbjct 1497 GCCCGAAATGATTCTGT-A-A--T-A-G--T-T---G-A-T-G--TT-TGTCAAGGCCAA 1538 Query 1369 TACAAGTCAACTCTGGTTTGTCCAGTTTGCGGAAAAATATCAATCACTTTTGATCCCTTC 1428 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1539 TACAAGTCCACTCTGGTTTGTCCAGCTTGCGGAAAAATATCAATCACTTTTGATCCCTTC 1598 Query 1429 ATGTACTTGTCTGTACCTTTGCCATCAACACTTACGCGATCCATGACAGTTACGGTGTTT 1488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1599 ATGTACTTGTCTGTACCTTTGCCATCAACACTTACGCGATCCATGACAGTTACGGTGTTT 1658 Query 1489 TATTGCGATGGAAGTCGTCTTCCGATGCCGTATACTGTAACAGTGCCTAAACATGGATCT 1548 |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||| |||||||||| |||||||| Sbjct 1659 TATTGCGATGGAAGTCATCTTCCGATGCCATACACAGTAATAGTGCCTAAAAATGGATCT 1718 Query 1549 ATTAGAGATCTCATTACCGCATTAGGTACTGCTTGCTGTCT-AGCCGATGATGAGAGCCT 1607 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||| || Sbjct 1719 ATTAGAGATCTCATTACCGCATTAGGTACTGCTTGTT-TATTAGCCGAAGATGAGAGTCT 1777 Query 1608 ATTACTTGCAGAGGTATATGATCACAAGATCTTTAGATATTTTGAGAATCCCCTGGAGTC 1667 |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct 1778 TTTACTTGCAGAGGTATATGACCACAAGATTTTTAAATATTTTGAGAATCCCCTGGATTC 1837 Query 1668 ACTGAGTGT-GATAAAAGATGATGAGCATATTGTGGCGTATCGGTTAAATCAGATGCCGA 1726 ||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 1838 ACTGAGT-TCGATAAAAGATGATGAGCATATTGTAGCCTATCGGTTAAATCAGATGCCGA 1896 Query 1727 AAGGATCAGGAAAAGCAAAACTCGAGATTCTTCATGGAGGGCTGGAAAGGGATGTTCTGG 1786 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||| Sbjct 1897 AAGGATCAGGGAAAGCAAAACTCGAAATTCTTCATGGAGGGCAGAAAAGGCCTATTCTGG 1956 Query 1787 AGAGTGTTAGAGGCAGAGACGTGAAGCTTTTTGGAACTCCTTTAGTGACTTATGTCAACA 1846 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1957 AGAGTGTTAGAGGCAGAGATGTGAAGCTCTTTGGAACTCCTTTTGTGACTTATGTCAACA 2016 Query 1847 CAGACCCACTAAGTGGAACTGACATTGATGCAGTTATCTCTGGATTTCTGTCACCTCTGC 1906 |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| Sbjct 2017 CAGAACCACTAAGTGGAGCTGACATTGATGCAGTTCTCTCTCGATTTCTGTCGCCTCTGC 2076 Query 1907 ACAGGGTCCATGCCTCATCTAAGATTCATAACGGAAGTGACAATGGCCACCTTGCTGATG 1966 ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| Sbjct 2077 ACAAGGTCCATGCCCCATCTAAGATTCATAACGGAAGTGAAAATGGCCACCTTCCTGATG 2136 Query 1967 CGACTGCTGACGAAACATCCGGAAGTTTATCATCCCCAGATACCGAGATAGACGATGCAT 2026 | |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2137 CTACTGTTGACGAAGCATCCGAAATTTTATCATCCCCAGATACCGAGATAGACGATGCAT 2196 Query 2027 CTGATGGACAGTTATCCTTCAGGATATTCTTGACAGATGAACGTGGTTTGAACTATAAAC 2086 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2197 CTGATAGAGAGTTATCCTTCAGGATATTCTTGACAGATGAACGTGGTTTGAACTTTAAAC 2256 Query 2087 CACTTCAGTCTGAATCTTCTGTGAGCCCGGGTA-CAATTACAAGAGTTTTAGTTGAGTGG 2145 |||| |||||||||||||| | |||| ||||| | | |||||||||||||| |||||| Sbjct 2257 CACTGCAGTCTGAATCTTCCATAAGCCTGGGTATCGCT-ACAAGAGTTTTAGTCGAGTGG 2315 Query 2146 AATGAGGGTGAGCATGAAACATATGATTCCAGCTACTTGAATGAACTTCCGGAGGTTCAT 2205 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct 2316 AATGAGGGTGAGCATGAAAGATATGATTCCAGCTACTTGAGTGATCTTCCGGAGGTTCAT 2375 Query 2206 AAAACAAGTTTCTCTGCAAAGAAGACAAGACAAGAAGCGATATCCCTGTTTTCGTGTTTG 2265 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2376 AAAACAAGTTTCTCTGCAAAGAAGACAAGGCAAGAATCGATATCCCTGTTTTCGTGTTTG 2435 Query 2266 GAGGCCTTTTTAGCAGAAGAACCTCTGGGACCAGATGACATGTGGTTTTGTCCGAGCTGC 2325 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2436 GAGGCGTTTTTAGCAGAAGAACCTCTGGGACCAGATGACATGTGGTTTTGTCCGAGCTGC 2495 Query 2326 AAAGAACACAGACAAGCGAACAAAAAGCTAGACCTGTGGAAGTTGCCCGATATCCTTGTG 2385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| Sbjct 2496 AAAGAACACAGACAAGCGAACAAAAAGCTAGACCTGTGGAAGTTACCAGATATTCTTGTG 2555 Query 2386 TTCCATTTAAAACGGTTCACATATAGCAGATATCTCAAGAACAAGATTGATACGTTTGTG 2445 || ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2556 TTTCATTTAAAAAGGTTCACTTACAGCAGATATCTCAAGAATAAGATTGATACGTTTGTG 2615 Query 2446 AATTTCCCAATTCAGGATTTAGACTTGAGCAAGTACGTGAAAAACAAGAATGGCCAGTCA 2505 ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2616 AATTTCCCAGTTCATGATCTAGACTTGAGCAAGTATGTGAAAAACAAGAATGACCAGTCA 2675 Query 2506 TATCTATATGAACTATATGCCATTAGTAATCATTACGGTGGACTTGGTGGTGGTCATTAC 2565 |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| Sbjct 2676 TATCTATATGAACTGTATGCCGTTAGTAATCATTATGGTGGACTTGGTGGTGGCCACTAC 2735 Query 2566 ACTGCCTACGCGAAGTTGATTGATGACAACAAATGGTATCATTTCGATGATAGTCACGTT 2625 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || Sbjct 2736 ACTGCCTACGCTAAGTTGATTGATGACAATGAATGGTACCATTTCGACGACAGTCATGTG 2795 Query 2626 TCATCAGTAAATGAATCTGAAATCAAAAACTCAGCTGCATATGTACTGTTCTACCGAAGA 2685 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 2796 TCATCTGTAAATGAATCTGAAATAAAAAACTCAGCTGCATATGTTCTTTTCTACCGAAGA 2855 Query 2686 GTGGGAAGTGAAACAGAGACACAAACAGCTG-AGATGCCGAGGAGTGATATGGATTAG 2742 ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| Sbjct 2856 GTGAGAAGTGAAACAGAGACACAAACAG-TGGAGATGTCGAC---TGATATGGATTAG 2909 > AT4G10570.1 | Symbols: UBP9 | ubiquitin-specific protease 9 | chr4:6523255-6528173 REVERSE LENGTH=3289 Length=3289 Score = 3971 bits (2150), Expect = 0.0 Identities = 2567/2763 (93%), Gaps = 50/2763 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGACGATCCCTAATTCCGATTTCATGATT-GAAAACGGAGTCTGTGATTTTCCGACTAC 59 ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 116 ATGACGATCCCTAATTCCGATTTCATG-TTAGAAAACGGAGTCTGTGATTTGCCTTTTAC 174 Query 60 TCCTGCCGAAGAGAAACGTATTGTATCGGAGCTGATTACCGAATCGGAAGATAATTTGAA 119 ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| Sbjct 175 TCCTGAGGAAGAGAAACGGATTGTATCGGAGCTTACTAGCGAATCGGAGGATAATTTGAA 234 Query 120 AGAAGGAAACTTGTATTTTGTCATCTCTAAAAGGTGGTATGCAAGCTGGCAGAAATATGT 179 | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 235 ACAAGGCAACTTGTATTTTGTCATCTCTAAAAGGTGGTATACAAGCTGGCAGGAATATGT 294 Query 180 TGAGCAA-TCGAC-AGATGAATGTAT-AAGTGGGGAG---TC-----CT-CGAGGCCTGG 227 |||| || ||| | | |||||||| | || ||| ||| || || |||||||||| Sbjct 295 TGAG-AATTCGGCTA-ATGAATGT-TCAACTGGAGAGTCTTCGGAAGCTCCGAGGCCTGG 351 Query 228 AGCGATTGATAACCATGATATTATCGAAAGTGAAAGCGACGCGAATGATCCACAGCTTCG 287 | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 352 ACCGATTGATAACCATGATATTATCGAAAGTGATAGCGACATTAATGATCCACAACTTCG 411 Query 288 TAGATTGTTGGTGGAAGGGGTTGACTACGTTTTAGTTCCTCAAGAAGTCTGGAAAAGACT 347 ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| Sbjct 412 TAGATTGCTGGTGGAAGGGGAGGACTACGTTTTAGTTCCTAAACAAGTTTGGAAAAGACT 471 Query 348 TGTTGAATGGTATAGCGGAGGTCCTCCGATAGAAAGGAAGTTGATCTGTCAAGGCTTTTA 407 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 472 TGTTGAATGGTATAGCGGAGGTCCTCCGATAGAAAGGAAGTTGATCTGTCAAGGCTTTTA 531 Query 408 TAGTAGGAGTTATAGTGTAGAGGTTTACCCACTCTGCCTTATGTTGACAGACGGACGAGA 467 || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 532 TACAAGGAGTTATAGTGTAGAGGTTTATCCACTCTGCCTTATGTTGACAGACGGACGAGA 591 Query 468 TGAGAGTAGAACTACAATACGGTTGGGAAAACAAACCTCTATAAGGGAACTTTGTGAGAA 527 ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct 592 TGAAAGTAGAACTGTAATACGGTTGGGAAAACAGGCCTCTATAAGGGAACTTTATGAGAA 651 Query 528 GGTTTGCACTATGACAGGGGTAGCGCAAGAAAAGGCTCACATATGGGATTATTTCCATAA 587 |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| Sbjct 652 GGTTTGTGCTATGACAGGGGTACCGCAAGAAAAGGCTCATATCTGGGATTACTTCGATAA 711 Query 588 GAGGAAAAACGGACTCTTGGATCCTTCATCTAACAAGAGCCTGGAAGAGTCTAGCCTTCA 647 ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 712 GAGGAAAAACGGACTGTTGGATCCTTTATCTTACAAGAGCCTGGAAGAGTCAAGCCTTCA 771 Query 648 GATGGACCAAGATATTCTTCTTGAAGTTGATGGGTCGTC-T--TCCTCTCAATATGCTAT 704 |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| Sbjct 772 TATGGACCAAGATATTCTTGTTGAAGTTGATGGGTTGTCTTCCTCCTCTCAATCTGCTAT 831 Query 705 GAGCTCGGCAGGAAATGAGTTAGCTCTGGTACCTCTGGAACCTTCAAGGTCGCGTGTTAC 764 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 832 GAGCTCGACAGGAAATGAGTTAGCTCTGGTACCTCTGGAACCTTCAAGGTCGATTGTTAC 891 Query 765 AATTGCTGGGGGGCCTACCCTATCAAATGGTCATTCCACTACGTCCAAGTTTAGTCTCTT 824 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 892 AATTGCTGGGGGGCCTACCCTATCAAATGGTCATTCCACTACGTCCAACTTTAGTCTCTT 951 Query 825 TCCGAGAATAACTTCTGAAGACGACGGCTGCA-ATTCTTTGAGTATTCTTGGAAAAGGAG 883 |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 952 TCCGAGAATAACTTCTGAAGACGACGGCAG-AGATTCTTTGAGTATTCTTGGAAAAGGAG 1010 Query 884 AAAAGGGAGGATTAGCAGGATTGAGTAATTTGGGAAATACCTGCTTTATGAATAGCGCTC 943 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1011 AAAAGGGAGGATTAGCAGGATTGAGTAATTTGGGAAATACCTGCTTTATGAATAGCGCTC 1070 Query 944 TTCAGTGTTTGGCCCACACACCTCCAATTGTTGAATACTTCTTGCAAGATTACAGTGATG 1003 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1071 TTCAGTGTTTGGCCCACACACCTCCAATTGTTGAATACTTCTTGCAAGATTACAGTGACG 1130 Query 1004 ACATAAATAGAGATAATCCTTTGGGAATGTGTGGTGAGCTTGCTATCGCATTTGGTGATT 1063 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1131 ACATAAATAGAGATAATCCTTTGGGAATGTGTGGTGAGCTTGCTATCGCGTTTGGTGATT 1190 Query 1064 TGTTGAAGAAATTATGGTCATC---AAGGAACGCAGTTGCACCACGCTCTTTTAAGAC-A 1119 |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct 1191 TGTTGAAGAAATTATGGTCATCAGGAAGGAATGCAGTTGCACCACGCGCTTTTAAGACGA 1250 Query 1120 AAGTTGGCTAGATTTGCTCCACAGTTTAGTGGTTACAATCAGCATGATTCTCAAGAACTG 1179 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1251 AA-TTGGCTAGATTTGCCCCACAGTTTAGTGGTTACAATCAGCATGATTCTCAAGAACTG 1309 Query 1180 CTTGCTTTCTTATTGGATGGGCTGCATGAAGATTTGAATAAGGTCAAACGAAAACCTTAC 1239 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1310 CTTGCTTTCTTATTAGATGGGCTGCATGAAGATTTGAATAAGGTCAAACGAAAACCTTAC 1369 Query 1240 ATCGAACTTAAAGATTCTGACAGTCGTCCGGATGATGAAGTTGCTGAAGAGCTTTGGAAT 1299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1370 ATCGAACTTAAAGATTCTGACAGTCGTCCGGATGATGAAGTTGCTGAAGAGCTTTGGAAT 1429 Query 1300 TATCATAAGGCCCGAAATGATTCTGTAATAGTTAACGTCTGTCAAGTATTCGATTTCTGT 1359 |||||||||||||||||||||||||| | | | | | | | | | || ||||| Sbjct 1430 TATCATAAGGCCCGAAATGATTCTGT-A-A--T-A-G--T-T---G-A--CG---TCTGT 1471 Query 1360 CAAGGCCAATACAAGTCAACTCTGGTTTGTCCAGTTTGCGGAAAAATATCAATCACTTTT 1419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1472 CAAGGCCAATACAAGTCAACTCTGGTTTGTCCAGTTTGCGGAAAAATATCAATCACTTTT 1531 Query 1420 GATCCCTTCATGTACTTGTCTGTACCTTTGCCATCAACACTTACGCGATCCATGACAGTT 1479 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1532 GATCCCTTCATGTACTTGTCTGTACCTTTGCCATCAACACTTACGCGATCCATGACAATT 1591 Query 1480 ACGGTGTTTTATTGCGATGGAAGTCGTCTTCCGATGCCGTATACTGTAACAGTGCCTAAA 1539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| Sbjct 1592 ACGGTGTTTTATTGCGATGGAAGTCGTCTTCCGATGCCATACACAGTAATAGTGCCTAAA 1651 Query 1540 CATGGATCTATTAGAGATCTCATTACCGCATTAGGTACTGCTTGCTGTCTAGCCGATGAT 1599 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| Sbjct 1652 CAGGGATCTATTAGAGATCTCATTACCGCATTAGGTACTGCTTGTTGTTTAGCTGAAGAT 1711 Query 1600 GAGAGCCTATTACTTGCAGAGGTATATGATCACAAGATCTTTAGATATTTTGAGAATCCC 1659 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1712 GAGAGTCTTTTACTTGCAGAGGTATATGATCACAAGATCTTTAGATATTTTGAGATTCCC 1771 Query 1660 CTGGAGTCACTGAGTGTGATAAAAGATGATGAGCATATTGTGGCGTATCGGTTAAATCAG 1719 ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1772 CTGGATTCACTGAGTGCGATAAAAGATGATGAGCATATTGTGGCGTATCGGTTGAATCAG 1831 Query 1720 ATGCCGAAAGGATCAGGAAAAGCAAAACTCGAGATTCTTCATGGAGGGCTGGAAAGGGAT 1779 || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | Sbjct 1832 ATTCCGAAAGGATCAAGAAAAGCAAAACTCGAAATTCTTCATGGAGGGCAGGAAAGGGCT 1891 Query 1780 GTTCTGGAGAGTGTTAGAGGCAGAGACGTGAAGCTTTTTGGAACTCCTTTAGTGACTTAT 1839 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1892 GTTCTGGATAGTGTTAGAGGCAGCGACGTGAAGCTTTTTGGAACTCCTTTTGTGACTTAT 1951 Query 1840 GTCAACACAGACCCACTAAGTGGAACTGACATTGATGCAGTTATCTCTGGATTTCTGTCA 1899 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1952 GTCAACACAGAACCACTAAGTGGAACTGACATTGATGCAGTTATCTCTGGATTTTTGTCG 2011 Query 1900 CCTCTGCACAGGGTCCATGCCTCATCTAAGATTCATAACGGAAGTGACAATGGCCACCTT 1959 |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2012 CCTCTGCACAAGGTCCATGCCCCATCTAAGATTCATAACGGAAGTGATAATGGCCACCTT 2071 Query 1960 GCTGATGCGACTGCTGACGAAACATCCGGAAGTTTATCATCCCCAGATACCGAGATAGAC 2019 |||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2072 GCTGATGCTACTGTTGACCAAGCATCCGGAATTTTATCATCCCCAGATACCGAGATAGAC 2131 Query 2020 GATGCATCTGATGGACAGTTATCCTTCAGGATATTCTTGACAGATGAACGTGGTTTGAAC 2079 ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2132 AATGCATCTGATAGAGAGTTATCCTTCAGGATATTCTTGACAGATGAACGTGGTTTGAAC 2191 Query 2080 TAT-AAACCACTTCAGTCTGAATCTTCTGTGAGCCCGGGTACAATTACAAGAGTTTTAGT 2138 || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2192 -ATTAAACCACTGCAGTCTGAATCTTCTATAAGCCCGGGTACCGTTACAAGAGTTTTAGT 2250 Query 2139 TGAGTGGAATGAGGGTGAGCATGAAACATATGATTCCAGCTACTTGAATGAACTTCCGGA 2198 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || Sbjct 2251 CGAGTGGAATGAGGGTGAGCATGAAAGATATGATTCCAGCTACTTGAGTGATCTTCCAGA 2310 Query 2199 GGTTCATAAAACAAGTTTCTCTGCAAAGAAGACAAGACAAGAAGCGATATCCCTGTTTTC 2258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| Sbjct 2311 GGTTCATAAAACAAGTTTCTCTGCAAAGAAGACAAGGCAAGAATCGATATCCCTGTTTTC 2370 Query 2259 GTGTTTGGAGGCCTTTTTAGCAGAAGAACCTCTGGGACCAGATGACATGTGGTTTTGTCC 2318 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2371 GTGTTTGGAGGCTTTTTTAGCAGAAGAACCTCTGGGACCAGATGACATGTGGTTTTGTCC 2430 Query 2319 GAGCTGCAAAGAACACAGACAAGCGAACAAAAAGCTAGACCTGTGGAAGTTGCCCGATAT 2378 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 2431 GAGCTGCAAAGAACACAGACAAGCGAACAAAAAGCTAGACCTGTGGAAGTTACCAGATAT 2490 Query 2379 CCTTGTGTTCCATTTAAAACGGTTCACATATAGCAGATATCTCAAGAACAAGATTGATAC 2438 |||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2491 TCTTGTGTTTCATTTAAAAAGGTTCACTTACAGCAGATATCTGAAGAACAAGATTGATAC 2550 Query 2439 GTTTGTGAATTTCCCAATTCAGGATTTAGACTTGAGCAAGTACGTGAAAAACAAGAATGG 2498 |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2551 GTTTGTGAATTTCCCAGTTCATGATCTAGACTTGAGCAAGTATGTGAAAAACAAGAATGG 2610 Query 2499 CCAGTCATATCTATATGAACTATATGCCATTAGTAATCATTACGGTGGACTTGGTGGTGG 2558 |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2611 CCAGTCATATCTTTATGAACTGTATGCCGTTAGTAATCATTACGGTGGACTTGGTGGTGG 2670 Query 2559 TCATTACACTGCCTACGCGAAGTTGATTGATGACAACAAATGGTATCATTTCGATGATAG 2618 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || Sbjct 2671 CCACTACACTGCCTACGCTAAGTTGATTGATGACAACAAATGGTACCATTTCGACGACAG 2730 Query 2619 TCACGTTTCATCAGTAAATGAATCTGAAATCAAAAACTCAGCTGCATATGTACTGTTCTA 2678 ||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 2731 TCATGTGTCATCTGTAAATGAATCTGAAATCAGAAACTCAGCTGCATATGTTCTTTTCTA 2790 Query 2679 CCGAAGAGTGGGAAGTGAAACAGAGACACAAACAGCTGAGATGCCGAGGAGTGATATGGA 2738 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct 2791 CCGAAGAGTGAGAAGTGAAACAGAGACACAAACAGCTGAGATGTCGAC---TGATATGGA 2847 Query 2739 TTA 2741 ||| Sbjct 2848 TTA 2850 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 136203250245 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5