BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg470078
Length=5484
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G01960.1 | Symbols: EDA10 | SEC7-like guanine nucleotide exc... 9234 0.0
> AT1G01960.1 | Symbols: EDA10 | SEC7-like guanine nucleotide exchange
family protein | chr1:330588-337582 REVERSE LENGTH=5495
Length=5495
Score = 9234 bits (5000), Expect = 0.0
Identities = 5331/5492 (97%), Gaps = 18/5492 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCTTCTACGGAAGTCGATTCCCGCTTAGGTCGAGTTGTTGTCCCTGCTTTGGACAAG 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTCTACGGAAGTCGATTCCCGCTTAGGTCGAGTTGTTATCCCTGCTTTGGACAAG 60
Query 61 GTCATTAAGAACGCCTCCTGGCGTAAGCACTCCAAGCTCGCTCACGAGTGCAAATCCGTC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 61 GTCATTAAGAACGCCTCCTGGCGTAAGCACTCCAAGCTCGCCCACGAGTGCAAATCCGTC 120
Query 121 ATCGAACGCCTCAGATCGCCGGAAAATTCCTCTCCCGTTGCCGACTCTGATTCTGGATCC 180
||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 121 ATCGAACGCCTTAGATCCCCTGAAAATTCCTCTCCTGTTGCCGACTCTGAATCTGGATCC 180
Query 181 TCCATTCCTGGACCACTTCACGACGGAGGGGCCGCCGAATACTCTCTCGCCGAGTCCGAG 240
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCCATTCCTGGACCACTTCACGACGGAGGAGCCGCCGAATACTCTCTCGCCGAGTCCGAG 240
Query 241 ATCATCCTCAGCCCTCTCATTAACGCCTCCTCCACCGGCGTTCTCAAAATTGTCGATCCG 300
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 241 ATCATCCTCAGCCCTCTCATCAACGCCTCCTCCACCGGCGTTCTCAAGATTGTCGATCCC 300
Query 301 GCCGTTGATTGCATCCAGAAGCTTATTGCTCATGGCTATGTTCGCGGTGAGGCCGATCCC 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 301 GCCGTTGATTGCATCCAGAAGCTTATTGCTCATGGCTACGTTCGCGGTGAGGCTGATCCC 360
Query 361 ACCGGCGGACCTGAGGCGCTACTCCTTTCCAAGCTCATCGAAACCATCTGCAAATGTCAC 420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ACCGGCGGACCTGAGGCGCTACTCCTTTCCAAGCTCATTGAAACCATCTGCAAATGTCAC 420
Query 421 GAGCTAGACGACGAAGGACTCGAGTTGCTCGTGCTGAAGACGCTCTTAACTGCGGTCACT 480
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 421 GAGCTAGACGACGAAGGGCTCGAGTTGCTCGTGCTGAAGACGCTCTTGACTGCGGTAACT 480
Query 481 TCAATTTCCCTGAGGATCCATGGAGATTCTTTGCTACAGATCGTCAGGACTTGTTATGGT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TCAATTTCCCTGAGGATCCATGGAGATTCTTTGCTACAGATCGTCAGGACTTGTTATGGT 540
Query 541 ATCTACTTGGGAAGCAGAAACGTGGTTAACCAGGCGACTGCTAAGGCCTCGCTCGTGCAG 600
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 541 ATCTACTTGGGAAGCAGAAACGTGGTTAATCAGGCGACTGCTAAAGCCTCGCTCGTGCAG 600
Query 601 ATGTCTGTTATCGTGTTCAGAAGAATGGAGGCAGATTCATCCACTGTCCCCATTCAGCCC 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 601 ATGTCTGTTATCGTGTTCAGAAGAATGGAGGCAGATTCATCCACCGTCCCCATTCAGCCC 660
Query 661 ATCGTCGTGGCCGAGCTGATGGAGCCCATGGACAAATCCGAATCAGACCCGTCTACGACG 720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 661 ATCGTCGTGGCCGAGCTGATGGAGCCCATGGACAAATCCGAATCAGACCCATCTACGACG 720
Query 721 CAGTCTGTTCAAGGTTTCATTACCAAGATTATGCAGGATATTGACGGAGTCTTCAATTCA 780
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CAGTCTGTTCAAGGTTTCATTACCAAGATTATGCAGGACATTGACGGAGTCTTCAATTCA 780
Query 781 GCTAACGCCAAGGGCACATTCGGCGGCCATGACGGGGCCTTCGAGACTTCATTGCCTGGG 840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GCTAACGCCAAGGGCACATTCGGCGGCCATGACGGGGCCTTCGAGACTTCATTGCCTGGC 840
Query 841 ACTGCCAATCCTACAGATTTGTTGGATTCTACTGATAAGGATATGTTGGATGCCAAGTAC 900
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 ACTGCCAATCCTACTGATTTGTTGGATTCTACTGATAAGGATATGTTGGATGCCAAGTAC 900
Query 901 TGGGAGATCAGTATGTATAAGTCGGCCCTCGAGGGAAGAAAAGGGGAGCTGGCCGATGGA 960
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 901 TGGGAGATCAGTATGTATAAGTCGGCCCTCGAGGGAAGAAAAGGAGAGCTGGCCGATGGA 960
Query 961 GAAGTAGAGAAAGACGATGATTCTGAGGTTCAGATTGGGAATAAGCTGAGAAGAGACGCC 1020
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GAAGTGGAGAAAGACGATGATTCTGAAGTTCAGATTGGGAATAAGCTGAGAAGAGACGCC 1020
Query 1021 TTCTTGGTTTTCAGGGCACTTTGCAAGCTGTCCATGAAGACGCCTCCCAAAGAAGATCCA 1080
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1021 TTCTTGGTTTTCAGGGCACTTTGCAAGCTGTCCATGAAGACGCCTCCCAAGGAAGATCCA 1080
Query 1081 GAGTTGATGAGAGGGAAGATTGTGGCTCTCGAGTTATTGAAGATTCTGCTAGAGAATGCC 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1081 GAGTTGATGAGAGGGAAGATTGTGGCTCTCGAGTTATTGAAGATTCTGCTTGAGAATGCC 1140
Query 1141 GGGGCTGTCTTTAGAACCAGCGATAGGTTCTTAGGCGCCATCAAGCAGTATCTCTGTCTC 1200
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1141 GGTGCTGTCTTTAGAACCAGCGATAGGTTCTTAGGCGCCATCAAGCAGTATCTGTGTCTC 1200
Query 1201 TCCTTGCTGAAGAATAGTGCTTCAAATCTTATGATCATTTTCCAGCTTTCCTGCTCGATT 1260
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TCCTTGCTGAAGAACAGTGCTTCAAATCTTATGATCATTTTCCAGCTTTCCTGCTCGATT 1260
Query 1261 TTACTTAGCTTGGTTTCGAGATTTCGTGCTGGGCTGAAGGCAGAGATTGGGGTGTTCTTC 1320
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 TTACTTAGCTTGGTTTCGAGGTTTCGTGCTGGGCTGAAGGCAGAGATTGGGGTGTTCTTC 1320
Query 1321 CCTATGATTGTTCTAAGAGTATTGGAGAATGTTGCTCAACCTGATTTTCAACAGAAGATG 1380
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1321 CCTATGATTGTTCTAAGAGTATTAGAGAATGTTGCTCAACCTGATTTCCAACAGAAGATG 1380
Query 1381 ATAGTGCTTCGTTTCCTGGACAAGCTCTGCTTTGATTCACAGATTTTGGTAGATATCTTC 1440
||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 ATAGTGCTTCGGTTCTTGGACAAGCTCTGCGTTGATTCACAGATTTTGGTAGATATCTTC 1440
Query 1441 ATCAACTATGATTGCGATGTCAACTCATCCAATATATTCGAGAGGATGGTCAATGGTCTC 1500
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 ATCAACTATGATTGCGATGTCAACTCATCCAATATATTTGAGAGGATGGTCAATGGTCTC 1500
Query 1501 CTTAAGACTGCTCAAGGAGTGCCTCCTGGTATAGTTACTACCTTGTTGCCACCTCAGGAA 1560
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 CTTAAGACTGCTCAAGGAGTGCCTCCTGGTACAGTTACTACCTTGTTGCCACCTCAGGAA 1560
Query 1561 GCATCTATGAAGCTTGAAGCCATGAAATGCTTAGTTGCTGTTTTAAGGTCTATGGGAGAC 1620
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 GCAGCCATGAAGCTTGAAGCCATGAAATGCTTAGTTGCTGTTTTAAGGTCTATGGGAGAC 1620
Query 1621 TGGGTGAATAAGCAGTTGCGTCTTCCAGATCCTTATTCGGCAAAAATAATAGAAATTGAT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
Sbjct 1621 TGGGTGAATAAGCAGTTGCGTCTTCCAGATCCTTATTCGGCAAAAATGCTGGAAATTGTT 1680
Query 1681 GATAGAAATCTTGAAGAAGGAAGTCATCCGGTGGAAAATGGTAAGGGGGATGGAGGCCAT 1740
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 GATAGAAATCTTGAAGAAGGAAGTCATCCAGTAGAAAATGGTAAGGGGGATGGAGGCCAT 1740
Query 1741 GGTGGTTTTGAAAGATCAGAATCTCAGTCTGAATTGTCCAGTGGGACTTCTGATGCCTTA 1800
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1741 GGTGGTTTTGAAAGATCAGACTCTCAGTCTGAATTGTCCAGTGGGAATTCTGATGCCTTA 1800
Query 1801 GCAATAGAGCAGCGCCGAGCTTACAAGCTTGAACTTCAGGAAGGTATTTCTATTTTCAAC 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 GCAATAGAGCAGCGCCGAGCTTACAAGCTTGAACTTCAGGAAGGTATTTCTATTTTCAAC 1860
Query 1861 CAGAAACCTAAGAAAGGCATTGAATTTTTAATCAAGGCAAACAAGGTGGGGGACTCGCCA 1920
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 CAGAAACCTAAGAAAGGTATTGAATTTTTAATCAAGGCAAACAAGGTGGGGGACTCGCCA 1920
Query 1921 GAGGAAATAGCAGCTTTTCTCAAAGATGCATCAGGGTTGAACAAGACTTTGGTAGGGGAT 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1921 GAGGAAATAGCAGCTTTTCTCAAAGATGCATCAGGGTTGAACAAGACTTTGATAGGGGAT 1980
Query 1981 TATCTGGGTGAAAGAGAAGACCTATCTCTGAAAGTGATGCATGCATATGTGGATTCTTTC 2040
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 TATCTGGGGGAAAGAGAAGACTTATCTCTGAAAGTGATGCATGCATATGTGGATTCTTTC 2040
Query 2041 GAATTTCAAGGCATGGAATTTGATGAGGCAATTCGAGCCTTTCTCCGAGGCTTTAGGCTG 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2041 GAATTTCAAGGCATGGAATTTGATGAGGCAATTCGAGCCTTTCTCCGGGGCTTTAGGCTG 2100
Query 2101 CCAGGAGAAGCACAAAAAATCGATCGTATCATGGAAAAATTTGCAGAGCGATACTGTAAA 2160
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2101 CCAGGAGAAGCACAAAAAATCGATCGTATAATGGAAAAATTTGCAGAGCGATTCTGTAAA 2160
Query 2161 TGTAACCCAAAGGCTTTTTCTAGCGCTGATACGGCATATGTCCTTGCTTACTCAGTCATT 2220
|| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2161 TGCAACCCAAAGGATTTTTCTAGCGCTGATACGGCATATGTCCTCGCTTACTCAGTCATT 2220
Query 2221 TTGCTCAACACAGATGCACATAACCCTATGGTGAAGAGCAAGATGACAGCTGATGGTTTT 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TTGCTCAACACAGATGCACATAACCCTATGGTGAAGAGCAAGATGACAGCTGATGGTTTT 2280
Query 2281 ATTAGAAATAATCGTGGTATAGATGATGGGAAAGATTTGCCTGAGGAATATCTACGTGCA 2340
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 ATTAGAAACAATCGTGGTATAGATGATGGGAAAGATTTGCCTGAGGAATATCTACGTGCA 2340
Query 2341 TTATATGAAAGGATATCTAGAAATGAGATAAAGATGAAGGACGATGGTTTGGGTCCGCAA 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2341 TTATATGAAAGGATATCTAGAAATGAGATAAAGATGAAGGATGATGGTTTGGGTCCGCAG 2400
Query 2401 CAGAAGCAGCCGACAAACTCAAGTAGATTACTTGGCTTAGATACTATCTTGAATATTGTT 2460
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2401 CAGAAGCAGCCTACAAACTCAAGTAGATTACTTGGCTTAGATACTATCTTAAATATTGTT 2460
Query 2461 GTTCCTAGGCGTGGTGACGATATGTACATGGAGACCAGTGATGATCTTATCAGGCATATG 2520
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2461 GTTCCTAGGCGTGGTGACGATATGAACATGGAGACCAGTGATGATCTTATCAGGCATATG 2520
Query 2521 CAAGAGAGGTTTAAAGAAAAAGCTCGCAAATCTGAGTCAGTTTATTATGCAGCCTCGGAT 2580
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 CAAGAGAGATTTAAAGAAAAGGCTCGCAAATCTGAGTCAGTTTATTATGCAGCCTCGGAT 2580
Query 2581 GTGGTTATACTCAGATTTATGGTTGAGGTTTGTTGGGCTCCTATGTTGGCAGCTTTCAGT 2640
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 GTGATTATACTCAGATTTATGGTTGAGGTTTGTTGGGCTCCTATGTTGGCAGCTTTCAGT 2640
Query 2641 GTTCCACTTGACCAGAGTGATGATGCAGTAATTACAACATTATGTCTGGAGGGTTTCCAC 2700
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641 GTTCCACTTGACCAGAGTGATGATGCAGTAATAACAACATTATGTCTGGAGGGTTTCCAT 2700
Query 2701 CATGCCATCCATGTCACTTCTGTAATGTCCTTAAAAACGCACAGAGATGCTTTTGTGACT 2760
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2701 CATGCCATCCATGTCACTTCTGTAATGTCCTTAAAAACGCACAGAGATGCCTTTGTGACT 2760
Query 2761 TCACTAGCAAAATTTACTTCCCTCCACTCTCCTGCTGATATCAAGCaaaaaaaCATTGAA 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2761 TCACTAGCAAAATTTACTTCCCTCCACTCTCCTGCTGATATCAAGCAAAAAAACATTGAA 2820
Query 2821 GCCATAAAGGCAATAGTAAAACTGGCGGAGGAAGAAGGTAACTATCTACAAGATGCTTGG 2880
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2821 GCAATAAAGGCAATAGTAAAACTGGCGGAGGAAGAAGGAAACTATCTACAAGATGCTTGG 2880
Query 2881 GAGCATATACTGACTTGTGTTTCACGGTTTGAGCATCTTCATCTCTTGGGGGAAGGAGCG 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2881 GAGCATATACTGACTTGTGTTTCACGGTTTGAGCATCTTCATCTCTTGGGGGAAGGAGCG 2940
Query 2941 CCTCCTGATGCCACTTTCTTTGCATTTCCTCAAACCGAGTCAGGAAACTCTCCACTGGCT 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2941 CCTCCTGATGCCACTTTCTTTGCATTTCCTCAAACGGAGTCAGGAAACTCTCCACTGGCT 3000
Query 3001 AAGCCAAATTCCGTACCTGCAGTTAAAGAAAGAGCACCTGGAAAACTTCAGTATGCTGCA 3060
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3001 AAGCCAAATTCCGTACCTGCAATTAAAGAAAGAGCACCTGGAAAACTTCAGTATGCTGCA 3060
Query 3061 TCTGCTGTGATAAGGGGTTCCTACGATGGTTCCGGTGTTGCTGGAAAGGCTTCTAATACA 3120
|||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3061 TCTGCTATGATAAGGGGTTCCTACGATGGTTCTGGTGTTGCTGGAAAGGCTTCTAATACA 3120
Query 3121 GTGACATCTGAACAGATGAACAACTTGATATCTAATCTGAACTTGCTAGAACAAGTTGGT 3180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3121 GTGACATCTGAACAGATGAACAACTTGATATCTAATCTAAACTTGCTAGAACAAGTTGGT 3180
Query 3181 GACATGAGTCGGATATTTACTCGTAGTCAAAGATTGAATAGTGAAGCCATAATTGACTTT 3240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3181 GACATGAGTCGGATATTTACTCGTAGTCAAAGATTGAATAGTGAAGCCATAATTGACTTT 3240
Query 3241 GTTAAAGCCCTCTGCAAAGTTTCCATGGATGAGTTACGATCTCCATCTGATCCACGGGTC 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3241 GTTAAAGCCCTCTGCAAAGTTTCCATGGATGAGTTACGATCTCCATCTGATCCACGGGTC 3300
Query 3301 TTCAGCCTAACAAAGATTGTGGAAATAGCGCACTATAACATGAACCGCATAAGACTTGTC 3360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3301 TTCAGCCTAACAAAGATTGTGGAAATAGCGCACTATAACATGAACCGCATAAGACTTGTC 3360
Query 3361 TGGTCGAGCATCTGGCATGTGCTCTCCGATTTCTTTGTGACTATTGGCTGTTCTGATAAC 3420
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3361 TGGTCGAGCATCTGGCATGTGCTCTCTGATTTCTTTGTGACTATTGGCTGTTCTGATAAC 3420
Query 3421 CTCTCCATTGCAATATTTGCTATGGATTCTTTGCGCCAGCTGTCTATGAAGTTCTTAGAG 3480
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3421 CTCTCCATTGCAATTTTTGCAATGGATTCTTTGCGCCAGCTGTCTATGAAGTTCTTAGAG 3480
Query 3481 CGGGAAGAGTTGGCAAATTATAACTTCCAAAATGAATTTATGAAACCTTTTGTTGTTGTC 3540
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3481 CGGGAAGAGTTGGCGAATTATAACTTCCAAAATGAATTTATGAAGCCTTTTGTTGTTGTC 3540
Query 3541 ATGCGCAAAAGTGGTGCTGTTGAGATCAGGGAATTGATTATAAGATGTGTCTCACAGATG 3600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3541 ATGCGCAAAAGTGGTGCTGTTGAGATCAGGGAATTGATTATACGATGTGTCTCACAGATG 3600
Query 3601 GTTTTATCCCGTGTTGACAATGTTAAGTCGGGATGGAAGAGTATGTTCATGATTTTCACG 3660
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3601 GTTTTATCCCGTGTTGACAATGTCAAGTCGGGATGGAAGAGTATGTTCATGATTTTCACG 3660
Query 3661 ACAGCAGCACATGATGCACATAAAAATATTGTGTTCCTGTCTTTTGAAATGGTTGAGAAG 3720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3661 ACAGCAGCACATGATGCACATAAAAATATTGTGTTCCTGTCTTTTGAAATGGTTGAGAAG 3720
Query 3721 ATTATCCGAGACTACTTCCCACACATCACGGAGACAGAGACAACCACCTTCACAGACTGT 3780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3721 ATTATCCGAGACTACTTCCCACACATCACGGAGACAGAGACAACCACCTTCACAGACTGT 3780
Query 3781 GTGAATTGCCTTGTTGCGTTCACCAATTGTAAATTTGAGAAAGATATTAGTCTCCAAGCC 3840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3781 GTGAATTGCCTTGTTGCGTTCACCAATTGTAAATTTGAGAAAGATATTAGTCTCCAAGCC 3840
Query 3841 ATTGCTTTCCTTCAATACTGCGCAAGAAAACTTGCTGAAGGCTATGTTGGTTCATCACAG 3900
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 3841 ATTGCTTTCCTTCAGTATTGCGCAAGAAAACTTGCTGAAGGCTATGTTGGTTCGTCACTG 3900
Query 3901 AGGAGGAACCCTCCATCATCTCCTCAGAGTGGAAAAAGTGGAAAACAAGACAGTGGAAAG 3960
||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||
Sbjct 3901 AGGAGGAACCCACCATTATCTCCTCAGGGTGGAAAAATTGGAAAACAAGATAGTGGGAAG 3960
Query 3961 TTTCTAGAAAGTGACGAACATTTGTATTCTTGGTTCCCACTGTTAGCCGGTTTATCTGAA 4020
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3961 TTTCTAGAAAGTGATGAACATTTGTATTCTTGGTTTCCACTGTTAGCCGGTTTATCTGAA 4020
Query 4021 CTTAGTTTCGACCCAAGAGCAGAAATTAGGAAGGTTGCATTGAAAGTCCTGTTTGATACT 4080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4021 CTTAGTTTCGACCCAAGAGCAGAAATTAGGAAGGTTGCATTGAAAGTCCTGTTTGATACT 4080
Query 4081 CTGAGGAACCATGGTGACCATTTCAGTCTTTCGTTATGGGAACGGGTTTTTGAGTCTGTT 4140
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4081 CTGAGGAACCATGGTGACCATTTCAGTCTGGCGTTATGGGAACGGGTTTTTGAGTCTGTT 4140
Query 4141 TTATTTCGGATATTCGACTATGTGCGTCAGGACGTTGACCCATCTGAGGATGATTCAACA 4200
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4141 TTATTTCGAATATTCGACTATGTGCGTCAGGACGTTGACCCATCTGAGGATGATTCAACA 4200
Query 4201 GATCAGAGAGGTTACAATGGTGAAGTCGACCAAGAGTCTTGGCTTTATGAGACATGCTCG 4260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4201 GATCAGAGAGGTTACAATGGTGAAGTCGACCAAGAGTCTTGGCTTTATGAGACATGCTCG 4260
Query 4261 TTGGCTCTACAGCTAGTTGTAGACCTCTTTGTAAATTTCTACAAGACAGTTAACCCTCTC 4320
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 4261 TTAGCTCTACAGCTGGTTGTAGACCTCTTTGTAAATTTTTACAAGACGGTTAACCCTCTC 4320
Query 4321 CTTAAGAAGGTACTGATGTTATTCGTAAGCTTGATAAAACGTCCTCACCAAAGTCTTGCT 4380
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4321 CTTAAGAAGGTACTGATGTTATTTGTAAGCTTGATAAAACGTCCTCACCAAAGTCTTGCT 4380
Query 4381 GGTGCGGGTATTGCTGCGCTTGTCCGTCTGATGAGAGATGTCGGTCATCAATTCTCTGAC 4440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4381 GGTGCGGGTATTGCTGCGCTTGTCCGTCTGATGAGAGATGTCGGTCATCAATTCTCTAAC 4440
Query 4441 GAACAATGGCTCGAGGTTGTGTCATGTATCAAAGAAGCAGCAGATGCTACAGCTCCTGAC 4500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 4441 GAACAATGGCTCGAGGTTGTGTCATGTATCAAAGAAGCAGCAGATGCTACATCCCCTGAC 4500
Query 4501 TTCTCATACGTTACCAGTGAAGAATTGATGGAGGATGTAAGCAATGAGGACGAAACAAAT 4560
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4501 TTCTCATACGTTACCAGTGAAGATTTGATGGAGGATGTAAGCAATGAGGACGAAACAAAC 4560
Query 4561 GATAATTCCAACGACGCAATGAGAAGAAGGAACAGGCAGCTTCAAGCTGTCGTGGCAGAT 4620
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 4561 GATAATTCCAACGACGCACTGAGAAGAAGGAACAGGCAGCTTCATGCTGTCGTCACAGAT 4620
Query 4621 GCCAAATCAAAAGCTTCAATTCAGATCTTTGTGATTCAGGCGGTAACAGATATCTACGAC 4680
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4621 GCCAAATCTAAAGCTTCAATTCAGATTTTTGTGATTCAGGCGGTAACAGATATCTACGAC 4680
Query 4681 ATGTATCGTATGTCTCTCACAGCCAATCACATGTTGATGCTCTTCGACGCTATGCACGGC 4740
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4681 ATGTACCGTATGTCTCTCACAGCCAATCACATGTTGATGCTCTTCGACGCTATGCACGGC 4740
Query 4741 ATTGGATCCAACGCTCACAAAATCAACGCTGATCTACTCTTACGTTCCAAGCTCCAGGAG 4800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4741 ATTGGATCCAACGCTCACAAAATCAACGCTGATCTACTCTTACGTTCCAAGCTCCAGGAG 4800
Query 4801 CTCGGGTTGTCCCCTGAATCCCAAGAAGCTCCTCTGCTGCGCCTGGAGAACGAATCTTTC 4860
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4801 CTCGGGTCGTCCCTTGAATCCCAAGAAGCTCCTCTGCTGCGCCTGGAGAACGAATCTTTC 4860
Query 4861 CAAACATGTATGACCTTCTTAGACAACCTCATCTCAGATCAGCCTGTGGGATACAACGAG 4920
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4861 CAAACATGTATGACCTTCTTAGACAACCTCATCTCAGATCAGCCTGTGGGTTACAACGAG 4920
Query 4921 GCTGAAATAGAAGCCCACCTCATAAGCCTCTGCAGAGAGGTGTTAGAGTTCTACATAAAT 4980
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4921 GCTGAAATAGAATCCCACCTCATAAGCCTCTGCAGAGAGGTGTTAGAGTTCTACATAAAT 4980
Query 4981 ATTTCATGTTCAAAGGAGCAGTCGTCTAGGTGGGCGGTGCCCTCGGGGTCGGGAAAAAAG 5040
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 4981 ATTTCATGTTCAAAGGAGCAGTCTTCAAGGTGGGCGGTTCCCTCGGGGTCAGGAAAAAAG 5040
Query 5041 AAGGAGCTAACAGCACGGGCTCCGCTAGTGGTGGCTGCAATTCAGACACTAGGAAACATG 5100
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 5041 AAAGAGCTAACAGCGCGGGCTCCGCTAGTGGTGGCTGCAATTCAGACATTGGGAAACATG 5100
Query 5101 GGAGAGTCACTGTTCAAGAAGAACTTGCCGGAGTTGTTTCCGTTGATAGCGACGTTGATA 5160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5101 GGAGAGTCACTGTTCAAGAAGAACTTGCCGGAGTTGTTTCCATTGATAGCGACGTTGATA 5160
Query 5161 AGCTGTGAACATGGGTCAGGGGAGGTGCAAATAGCTCTAAGTGACATGCTTCAGACATCA 5220
|||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 5161 AGCTGTGAACATGGGTCAGGAGAGGTACAAGTAGCTCTTAGTGATATGCTTCAGACATCA 5220
Query 5221 ATGGGACCTGTTGTCCTCCGCTCTTGCTGCTAA-TATCTATCT--CTCT--GTAAGATTT 5275
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 5221 ATGGGACCTGTTCTCCTCCGCTCTTGCTGCTAAATATCTATCTATCTCTCTGTAAGATTT 5280
Query 5276 CTTCATTTTCTCCCTCGATTTTCATCATAATTCAGTTTGGGTCTTCTCTTGAGTTTTTAT 5335
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5281 CTTCATTTACTCCCTCGATTTTCATCATAATTCTGTTTGGGTCTTCT-TTGAGTTTTTAT 5339
Query 5336 CACAAAATTACTACATTTGCTTCATTGTTTGGTAGCCATGGGAAGAGATTAGCGTTCACG 5395
|||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5340 CACAAA-TTACTT-A----C---ATTGTTTGGTAGCCATGGGAAGAGATTAGTGTTCACG 5390
Query 5396 AGGGAtttttttCC---CTTTCTTATATGTAAATTGTAAAATATTAGACAGTCTGTGTTT 5452
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5391 AGGGATTTTTTTTTTAACTTTCTTATATGTAAATTGTAAAATATTAGACAGTCTGTGTTT 5450
Query 5453 TTGACACGTTGTTGCATAATAAGTCTTAGCAA 5484
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5451 TTGACACGTTGTTGCATAATAAGTCTTAGCAA 5482
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 273761007951
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5