BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg470142 Length=5756 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G01320.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like s... 9125 0.0 AT4G28080.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like s... 507 6e-142 > AT1G01320.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | chr1:121124-130570 REVERSE LENGTH=6015 Length=6015 Score = 9125 bits (4941), Expect = 0.0 Identities = 5520/5793 (95%), Gaps = 66/5793 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGCTCCcaagaacaaccgtggaaagacaaaaggagacaagaagaagaaggaagagaaa 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 250 ATGGCTCCCAAGAACAACCGTGGAAAGACAAAAGGAGATAAGAAGAAGAAGGAAGAGAAA 309 Query 61 gTTCTCCCGGTTATCGTGGATGTCATTGTAAACCTTCCGGATGAGACGGAGGCTATTTTG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 310 GTTCTCCCGGTTATCGTGGATGTCATTGTAAACCTTCCGGATGAAACGGAGGCTATTTTG 369 Query 121 AAGGGCATATCAACGGACAGGATCATAGATGTTCGGCGGCTTTTATCGGTTAACTTTGAC 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 370 AAGGGCATATCAACGGACAGGATCATAGATGTTCGGCGGCTGTTATCGGTTAACTTCGAC 429 Query 181 ACTTGCCACGTCACCAATTATTCACTCTCCCATGAGATAAGAGGATCGCGGTTAAAAGAC 240 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 430 ACCTGCCACGTCACCAATTATTCGCTCTCCCATGAGATAAGAGGATCGCGGTTAAAAGAC 489 Query 241 ACGGTAGATGTGTCGGCGCTTAAACCCTGTGTTCTCACGTTAACGGAAGAGGATTACAAT 300 || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 490 ACAGTGGATGTGTCGGCCCTTAAACCCTGTGTTCTCACGTTAACGGAAGAGGATTACAAT 549 Query 301 GAAGGAACAGCAGTGGCGCACGTTAGACGGCTGCTTGACATCGTCGCCTGCACCACTTGC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 550 GAAGGAACAGCAGTGGCGCACGTTAGACGGCTGCTTGACATCGTCGCCTGTACCACTTGC 609 Query 361 TTCGGTCCATCGCCGGAGAAATCAGACACCGTGAAAAGTGCGCAGGTTAAGGGAGGTGGA 420 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 610 TTCGGTCCGTCGCCGGAGAAATCAGACTCCGTGAAAAGTGCGCAGGTTAAGGGAGGTGGA 669 Query 421 AAGAATTCCAAACACTCGGAGACGTCGCCTCCGCCGTCTCCTGCGTCGAAGGATGCGGTG 480 |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| Sbjct 670 AAGAATTCTAAACAGTCGGATACGTCGCCTCCGCCGTCTCCTGCGTCGAAGGATACTGTG 729 Query 481 GTTGATGAAGCCGGAGAAACTAGCCACTCATTCCCTAAGCTTGGAAGTTTCTACGAGTTT 540 ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 730 GTTGATGAAGCCGGAGAGACTAGCCACTCTTTCCCTAAGCTTGGAAGTTTCTACGAGTTT 789 Query 541 TTCTCTCTTGCTCATCTCACTCCTCCTCTTCAATATATTCGGCTTGTGAGTAAGCGGGAA 600 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| Sbjct 790 TTCTCTCTCGCTCATCTCACTCCTCCTCTTCAATATATTCGGCTCGCGACTAAGCGGGAA 849 Query 601 ACTGAAGATATAGCGGCGGAAGATCATCTTCTCTCCATTGATGTGAAGCTTTGTAATGGG 660 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 850 ACTGAAGATATAGCCAAGGAAGATCATCTTCTCTCCATTGATGTGAAGCTTTGTAATGGG 909 Query 661 AAGCTCGTTCATATTGAAGGTTGCAGAAAAGGATTCTACAGCATTGGGAAACAAAGAATC 720 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 910 AAGCTCGTTCATATTGAAGGTTGCAGAAAAGGATTTTACAGCATTGGGAAACAAAGAATA 969 Query 721 ATATGTCACAATCTTGTTGATTTGCTTAGACAAATCAGTAGAGCCTTTGATAATGCTTAC 780 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 970 ATATGTCACAATCTTGTTGATTTGCTTAGACAAATCAGTAGAGCCTTCGATAATGCTTAC 1029 Query 781 AGTGATCTTCTAAAAGCATTTTCGGAGCGCAATAAGTTTGGAAATCTTCCATATGGGTTT 840 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1030 AGTGATCTTCTGAAAGCATTTTCGGAGCGCAATAAGTTTGGAAATCTTCCATATGGGTTT 1089 Query 841 AGAGCTAACACATGGCTCATCCCGCCTACTGCGGCGCAGTCACCAGCAGCGTTTCCGCCT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1090 AGAGCTAACACATGGCTCATCCCGCCTACTGCGGCGCAGTCACCAGCAGCGTTTCCGCCT 1149 Query 901 CTCCCTGTTGAGGATGAGAGATGGGGAGGGGATGGTGGTGGTCAAGGGAGAGATGGCAGT 960 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1150 CTCCCTGTTGAGGATGAGAGATGGGGAGGGGATGGTGGTGGTCAAGGGAGAGATGGCAGC 1209 Query 961 TACGATTTGGTTCCATGGTCCAACGAATTCGCCTTTATTGCATCTATGCCTTGCAAAACA 1020 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1210 TACGACTTGGTTCCATGGTCCAACGAATTCGCCTTTATCGCATCTATGCCTTGCAAAACA 1269 Query 1021 GCTGAGGAGAGACAAGTCAGAGACAGAAAAGTGTTTCTTCTTCACAACCTCTTTGTTGAT 1080 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1270 GCAGAGGAGAGACAAGTCAGAGACAGAAAAGTGTTTCTTCTTCACAACCTCTTTGTTGAT 1329 Query 1081 GTCGCGACTTTCAGAGCCATCAAGGCTGTTCAGAAAGTAATGGCTGAGCCAGTACTTGCT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1330 GTCGCGACTTTCAGAGCCATCAAGGCTGTTCAGAAAGTAATGGCTGAGCCAGTACTGGCT 1389 Query 1141 GAAGAAGACTCCGAAGTTCTATATTCCGAGACAGTTGGAGACTTGAGTGTTACGGTTACA 1200 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1390 GAAGAAGACTCCGAAGTTCTCTATTCCGAGACAGTTAGAGACTTGACTGTTACGGTTACA 1449 Query 1201 AGGGATACTTCAAATGCAAGTAGTAAAGTGGATACAAAAATTGATGGAATTCAAGCCACT 1260 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1450 AGGGATACTTCAAATGCAAGTAGTAAAGTGGATACAAAAATCGATGGAATTCAAGCCACT 1509 Query 1261 GGTTTGGATAAAAAGAAGCTGATGGAACGGAACCTTCTCAAGGGACTTACTGCTGATGAA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1510 GGTTTGGATAAAAAGAAGCTGATGGAACGGAACCTTCTCAAGGGACTTACAGCTGATGAA 1569 Query 1321 AATACTGCTGCTCATGTCGTTGCTACTTTAGGAACTATAAGTCTTAAGTACTGTGGTTAC 1380 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1570 AATACTGCTGCTCATGACGTTGCTACTTTAGGAACTATAAGTCTTAAGTACTGTGGTTAC 1629 Query 1381 ATTGCTGTTGTGAAAATAGAGAAGGAGAGTGAGGAGTTAAGCCCACCTTCTCAAATTGTT 1440 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1630 ATTGCTGTTGTGAAATTAGAGAAGGAGAGTGAGGAGTTAAGCCCACCTTCTCAAATTGTT 1689 Query 1441 GACCTCCTTGAACAGCCTGAAGGTGGTGCTAATGCTCTAAATATCAACAGTTTGAGATTC 1500 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1690 GACCTCCTTGAACAGCCTGAAGGTGGTGCTAATGCTCTAAATATCAATAGTTTGAGATTC 1749 Query 1501 CTTCTCCATAAATCCTCTCCTGAGCAGAACAAGAAAACACCTCAGCAACAGGATGATGAG 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1750 CTTCTCCATAAATCCTCTCCTGAGCAGAACAAGAAAACACCTCAGCAACACGATGATGAA 1809 Query 1561 CTTACATCTTCACGGGAATTTGTTAGTAAAATGCTGGAAGAAAGCATTGTTAGGCTTGAG 1620 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 1810 CTTACATCTTCACGGGAATTTGTAAGTAAAATGCTGGAAGAAAGCATTGCTAAGCTTGAG 1869 Query 1621 GAAGAGGAGATAGACAGGGATAGTATCATGAGATGGGAGCTTGGAGCTTGTTGGATACAG 1680 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1870 GGAGAGGAGATAGACAGGGATAGTATCATGAGATGGGAGCTTGGAGCTTGTTGGATACAG 1929 Query 1681 CATTTACAAGACCAAAAGAATACAGAGAAGGACAAAAAACAAACCAGTGAAAAGTCTAAG 1740 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1930 CATTTACAAGACCAAAAGAATACAGAAAAGGACAAAAAACAAACCGGTGAAAAGTCTAAG 1989 Query 1741 AATGAATTGAAGGTTGAAGGGCTTGGAAAACCGCTTAAGTCCCTCAATAGCAGCAAGaaa 1800 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1990 AATGAATTGAAGGTTGAAGGGCTTGGGAAACCGCTTAAGTCCCTCAATAGCAGCAA-AAA 2048 Query 1801 -aaaaCAGATGTAAATAGCCCTAAGACG-C-C-G---G---TATCGTCTCAAGTTGATGC 1850 ||||||||||| | |||||||||||| | | | | ||||||||||||| ||||| Sbjct 2049 GAAAACAGATGTGAGCAGCCCTAAGACGCCGCAGACTGCATTATCGTCTCAAGTCGATGC 2108 Query 1851 GATTTCTTCAGAGGCTGATATTGCTGCAACAACTGCATCTTTGCAATCCGATGCTGAGAA 1910 | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2109 GGTTTCTTCAGAGGCTGATA---CTG------CTGCATCTTTGCAATCCGATGCTGAGAA 2159 Query 1911 GAATGCTCAAGAAAATGTGCTCATCTTGAAGAATTTGTTGTCTGATGCAGCCTTCACTCG 1970 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2160 GAATGCTCAAGAAAATGTGCTCATCTTGAAGAATTTGTTGTCTGATGCAGCCTTCACTCG 2219 Query 1971 CCTAAAAGAGTCAGATACTGGACTTCATCACAAGTCTTTGCAAGAACTTGTCGACTTGGC 2030 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2220 CCTAAAAGAGTCAGATACTGGACTTCATCACAAGTCTTTGCAAGAACTTGTCGACTTGGC 2279 Query 2031 ACAGAATTATTATACTGAAGTTGCTATACCAAAACTGGTTGCAGATTTTGGTTCGTTGGA 2090 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2280 ACAGAATTATTATACTGAAGTTGCTATTCCGAAACTGGTTGCAGATTTTGGTTCATTGGA 2339 Query 2091 GCTCTCCCCAGTCGATGGCCGGACTCTAACTGATTTTATGCACACAAGAGGTCTTCGGAT 2150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2340 GCTCTCCCCAGTCGATGGCCGGACTCTAACTGATTTTATGCACACAAGAGGTCTTCGGAT 2399 Query 2151 GCGTTCTTTAGGATATGTTGTGAAGCTTTCAGATAAATTGTCACATGTACAATCTCTGTG 2210 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2400 GCGTTCTTTAGGATATGTTGTGAAGCTTTCAGATAAATTGTCACATGTACAATCGCTGTG 2459 Query 2211 TGTTCATGAGATGATAGTAAGAGCCCTTAAGCATATCCTCCAGGCGGTGATTTCTGCTGT 2270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2460 TGTTCATGAGATGATAGTAAGAGCCCTTAAGCATATCCTCCAGGCGGTGATTTCTGCTGT 2519 Query 2271 TGCTACTGACACTGACAAAGTAGCTACAAAAGTAGCTGCTGCTTTGAACATGATGCTTGG 2330 ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2520 TGCTACTGACACTGACAAAATAGCTATAAAAGTAGCTGCTGCTTTGAACATGATGCTTGG 2579 Query 2331 GATTCCTGAAAATGTTGCAGCAGCACCACATAACTCTTGGAATGTACATCCTCTGATCTT 2390 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2580 GATTCCTGAAAATGTTGCAGCAACACCACATAACCCTTGGAATGTACATCCTCTGATCTT 2639 Query 2391 CCGGTGGTTGGAGAAATTCTTGAAGAAACGATATGATTATGATCTTAATGCCTTCAGTTA 2450 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2640 CCGATGGTTGGAGAAATTCTTGAAGAAACGGTATGATTATGATCTTAATGCCTTCAGTTA 2699 Query 2451 CAAGGATCTACGGAAGTTTGCCATTCTCCGTGGATTATGCCATAAGGTTGGTATTGAGTT 2510 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2700 CAAGGATCTACGGAAGTTTGCCATTCTCCGAGGCTTATGCCATAAGGTTGGTATTGAGTT 2759 Query 2511 GATTCCAAGGGACTTTGACATGGATTCTCCTGCACCTTTCCGGAAAACAGATGTGGTCAG 2570 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2760 GATTCCAAGGGACTTTGACATGGATTCTCCTGCACCTTTCCGGAAAACAGATGTGGTTAG 2819 Query 2571 TCTTGTCCCAGTGCATAAGACTTTCTATTTAAAATCTCTGCAGCAAGCAGCATGTTCATC 2630 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2820 TCTTGTCCCAGTGCATAAGACTTTCTATTTTAAATCTATGCAGCAAGCAGCATGTTCATC 2879 Query 2631 TGCTGATGGAAGGCAACTTCTGGAGTCATCTAAAACAGCTTTAGACAAAGGAAAGCTTGA 2690 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2880 TGCTGATGGAAGGCAACTTCTGGAGTCATCTAAAACAGCTTTAGACAAAGGAAAGCTTGA 2939 Query 2691 AGATGCAGTTACATATGGAACGAAGGCTCTTGCTAAACTTGTAGCAGTTTGCGGTCCCTA 2750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2940 AGATGCAGTTACATATGGAACGAAGGCTCTTGCTAAACTCGTAGCAGTTTGCGGTCCCTA 2999 Query 2751 TCACAGAATGACAGCCGGAGCTTACAGTTTACTTGCTGTAGTTCTATATCACACTGGTGA 2810 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3000 TCACAGAATGACAGCCGGAGCTTACAGTTTACTTGCTGTGGTTCTATATCACACTGGTGA 3059 Query 2811 CTTTAACCAGGCTACAATATATCAGCAAAAGGCTTTAGACATCAATGAAAGGGAACTTGG 2870 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3060 CTTTAACCAGGCTACAATATATCAGCAAAAGGCTTTAGACATCAATGAGAGGGAACTTGG 3119 Query 2871 ACTTGATCATCCAGATACAATGAAGAGTTATGGTGATCTTGCTGTCTTCTATTATAGGCT 2930 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3120 ACTTGATCATCCAGATACAATGAAGAGTTATGGTGATCTTGCTGTCTTCTATTATAGGCT 3179 Query 2931 TCAGCATACAGAGCTGGCTCTCAAGTATGTTAAGCGTGCGTTGTATCTCTTACATCTCAC 2990 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3180 TCAGCATACAGAGCTGGCTCTCAAGTATGTTAAGCGTGCGTTGTATCTCTTACATCTCAC 3239 Query 2991 ATGCGGTCCATCTCATCCAAACACTGCTGCTACATACATCAATGTAGCCATGATGGAAGA 3050 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3240 ATGCGGTCCATCTCATCCAAATACTGCTGCTACATACATCAATGTAGCCATGATGGAGGA 3299 Query 3051 AGGTCTAGGAAATGTACACGTTGCGTTGAGGTATCTTCACAAAGCTCTCAAGTGTAATCA 3110 ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3300 AGGTCTAGGAAATGTGCATGTTGCCTTGAGGTATCTTCACAAAGCTCTCAAGTGTAATCA 3359 Query 3111 AAGGTTGCTTGGTCCGGACCATATCCAGACTGCTGCAAGCTACCATGCCATAGCAATTGC 3170 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3360 AAGGTTGCTTGGTCCGGACCATATCCAGACTGCTGCAAGCTACCATGCCATAGCAATTGC 3419 Query 3171 GCTCTCGTTGATGGAGGCATACCATTTAAGTGTTCAGCATGAGCAAACAACCTTAAGAAT 3230 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3420 GCTCTCCTTGATGGAGGCATACCATTTAAGTGTTCAGCATGAGCAAACAACCTTAAGAAT 3479 Query 3231 CCTCCGAGCAAAGCTGGGGCCAGATGATTTACGTACTCAAGATGCTGCTGCTTGGCTAGA 3290 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3480 CCTTCGAGCAAAGCTGGGGCCAGATGATTTACGTACTCAGGATGCTGCTGCTTGGCTAGA 3539 Query 3291 ATACTTTGAGTCCAAGGCTTTTGAACAACAAGAAGCTGCGCGAAATGGTACTCCGAAGCC 3350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3540 ATACTTTGAGTCCAAGGCTTTTGAACAACAAGAAGCTGCGCGAAATGGTACTCCTAAGCC 3599 Query 3351 AGACGCGTCTATAGCCAGCAAAGGCCACCTAAGTGTTTTCGATCTACTCGACTATATCAA 3410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3600 AGACGCGTCTATAGCCAGCAAAGGCCACCTAAGTGTTTCCGATCTACTCGACTATATCAA 3659 Query 3411 CCCAAGCCATAACGCAAAAGGGAAAGAGAGTGTTGCAGCAAAGAGGAAGAACTATATTAT 3470 |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3660 CCCAAGTCATAACGCAAAAGGCAAAGAGAGCGTGGCAGCAAAGAGGAAGAACTATATTCT 3719 Query 3471 GAAGCTAAAGGAAAAATCCAAGCAGAGCAATGTTTCTGACCACTTGGCAGTGGCAGACAC 3530 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | | | Sbjct 3720 GAAGCTAAAGGAAAAATCCAAGCAAAGCAATGTTTCTGAACACTTGG---TGG-A-A-AT 3773 Query 3531 TCCGAGAGAAAATCAAAAGGAGATGTCTGAGGAGGAGACGGAAGAAACTGGATCAGAAGA 3590 |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3774 TCCGAGAGAAAAGCAAAAGGAGATGTCTGAAGAGGATACGGAAGAAACTGGATCAGAAGA 3833 Query 3591 AGGTAAATCAAGCGAAGACAATCACGACACAATTCTTGCACCAGTAGAAGAATCACCTTC 3650 |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct 3834 AGGTAAATCAAGCGAAGAGAATCACGAGACAATTCTTGCACCAGTTGAAGAACCACCTTC 3893 Query 3651 TCCTCCAGTCATTGAGGAGGCTATTATGGATAACAGTAATCCAATTACAGCTAGTGAAGT 3710 ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || || Sbjct 3894 TCCTCCAGTAATTGAGGACGCTACTATGGATAACAGTAATCCAATTACATCTAGCGACGT 3953 Query 3711 TTCAACTGAGCCACAACACCCTGATGGTAGTGAAGATGGATGGCAACCGGTGCAAAGACC 3770 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3954 TTCAACCGAGCCACAACACCCTGATGGTAGTGAAGATGGATGGCAACCGGTGCAAAGACC 4013 Query 3771 AAGGTCTACTGGATCATATGGTCGCAGGATGAAGCAACGACGAGCATCTATCGGGAAGGT 3830 || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 4014 GAGATCTGCTGGATCATATGGTCGCAGGATGAAGCAACGGCGAGCATCCATCGGGAAGGT 4073 Query 3831 ATATACATATCAGAAGAAGAATGTTGAAGCTGATATCGATAACCCTCTTTTCCAGAAAGC 3890 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4074 ATATACATATCAGAAGAAGAATGTTGAAGCTGATATCGATAACCCTCTTTTCCAGAATGC 4133 Query 3891 TACTCAGCAGAACGGCAAATACTACATTCTCAAGAAGAGAACAGCATCATATGCAAGCTA 3950 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct 4134 TACTCAGCAGAACGACAAATACTACATTCTCAAGAAGCGAACAGCATCATATTCAAGCTA 4193 Query 3951 TGCAGATCATCATTCTCCCGGTTTAACAACTCAAGGCACCAAATTTGGCAGGAAGATAGT 4010 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4194 TGCAGATCATCATTCTCCTGGTTTAACAACTCAAGGCACCAAATTTGGCAGGAAGATAGT 4253 Query 4011 TAAAACCTTGGCGTATCGGGTTAAATCGATGCAGCCATCTTCTGGTAGCACTAAGACTGC 4070 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||| Sbjct 4254 TAAAACCTTGGCGTATCGGGTTAAATCGACGCAGCCGTCTTCTGGTAACGCTAAGACTGC 4313 Query 4071 TGGTGAAACTTCAGAAGAAGATGGGTTGAAGACAGATGCTTCTTCTGTTGAGCCATCTAC 4130 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 4314 TGGTGAAACTTCAGAAGAAGATGGGTTGAAGACAGATGCTTCTTCTGTTGAGCCACCTAC 4373 Query 4131 TTTGTCTAGTACAGTGCAAAGTGAAGCCTACCACACGAAAAACTCTGTTGTAAGTCTTGG 4190 | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4374 TCTGTCTAGTACTGTGCAAAGTGAAGCCTACCACACGAAAAACTCTGTTGTAAGTCTTGG 4433 Query 4191 AAAATCTCCATCCTACAAAGAAGTAGCACTGGCACCACCTGGTTCCATAGCCAAGTATCA 4250 |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||| Sbjct 4434 AAAATCTCCATCCTACAAGGAAGTAGCATTGGCACCACCTGGTTCAATTGCTAAGTATCA 4493 Query 4251 AGTCTGGGTTCCACAAGCTGAAGTTTCAGATAAGCAAGAGGATGATGAGGTGGAGaaaaa 4310 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 4494 AGTCTGGGTTCCACAAGCGGAAGTTTCAGATAAGCAAGAGGATGATGAGATGGAGAAAAA 4553 Query 4311 aaCTGAACAGGGTACATCAGTGGAGCTTACGAGGGATGAGAAAATGATAACAGGGTTAGA 4370 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 4554 AACTGAACAGGGTACATCAATGGAGCTTACAAGGGATGAGCAAATGATAACAGGGTTAGA 4613 Query 4371 GGAAGAGGTaaaaaaaGAAATTTCTGCAGACACAGAATCTAACAGAACTCAAGGCGAAGA 4430 ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| Sbjct 4614 GGAAGAGGTAAAAAAGGAAATTTCTGCAGACCCAGAATCTAACATAACCCAAGGCGAAGA 4673 Query 4431 AGAGATCAAAGTAGAGTTACAACCATCTGAAGGTGTAGTAGGAGGAAACCTTTTGAATGA 4490 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | | | ||||| Sbjct 4674 AGAGATCAAAGTAGAGTTACAACCATCTGAAGGAGTACTCGGAGGAAGTCATATAAATGA 4733 Query 4491 AAATGAAGAATCTGGAGGTGGCATTCAGGTGGAAGAACAAGTCGAAGCTGAATTGATAGA 4550 ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct 4734 AAACGACGAATCTGGGGGTGGAATTCAGGTTGAAGAACAAGTCGAAGTTGAATTGATAAA 4793 Query 4551 CGACGGTGTAACAGATATGATTGATTCGACCAGAGAGCAAGAAGTGATAGATCAATTAGC 4610 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 4794 CGATGGTGTAACAGATATGATTCATTCGACCAGAGAGCAACAAGTGATAGATCAATTAGC 4853 Query 4611 TGCCGATTCCGAAGATCTGAAGGCAAAACTGTTAATATCTACCACAGACTCAGGCGATGC 4670 ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| Sbjct 4854 TGCTGATTCCGAAGATCTGAAGGCAAAACTGTCAATTTCTACTACGGACTCAGGCGATGC 4913 Query 4671 CTCACGAGGATTGTTACCTAACAAGAAGTTATCTGCGTCAGCTGCTCCATTCAACCCATC 4730 ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4914 CTCACGAGGATTGTTGCCTAACAAGAAGCTATCTGCGTCAGCTGCTCCATTCAACCCATC 4973 Query 4731 ATCACCTCCAAGTATTGTACGTCCTACTCCAATAGGCATGAACATTGGACCGTCGTGGCC 4790 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4974 ATCACCTCCAAGTATTATACGTCCTACTCCAATAGGCATGAACATTGGACCGTCGTGGCC 5033 Query 4791 AGTGAACATGACTCTCCATCACGGACCTCCTCCTCCTTACCCTTCACCTCCGACAACTCC 4850 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5034 AGTGAACATGACTCTTCATCACGGACCTCCTCCTCCTTACCCTTCACCTCCGACAACTCC 5093 Query 4851 AAACTTGATGCAGCCAATGTCCTTTGTTTACCCTCCTCCTTACACTCAATCAGTCCCCAC 4910 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 5094 AAACTTGATGCAGCCAATGTCCTTTGTTTACCCTCCTCCTTACAGTCAATCAGTCCCCAC 5153 Query 4911 AAGTACTTACCCTGTAACAAGCGGTCCTTTTCATCCCAATCAGTTCCCATGGCAGCTCAA 4970 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5154 AAGTACTTACCCTGTAACAAGCGGTCCTTTTCATCCCAATCAGTTCCCATGGCAGCTCAA 5213 Query 4971 TGTGTCGGATTTTGTACCAAGAACGGTTTGGCCCGGATGCCATCCCGTTGAGTTTCCCCC 5030 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5214 TGTGTCGGATTTTGTACCAAGAACGGTTTGGCCTGGATGCCATCCCGTTGAGTTTCCCCC 5273 Query 5031 TCCGCACATGATCACGGAGCCAATAGCTGCAACTGTGTTAGAGCCAACTGTGATTCTGCC 5090 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5274 ACCGCACATGATCACCGAGCCAATAGCTGCAACTGTGTTAGAGCCAACTGTGATTCTGCC 5333 Query 5091 AACGGATATTGACACATCAGGGGTAGAAGAAGA--AAACAA---A-G-AAGAAG-G-CAG 5141 ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| || | | |||| | | ||| Sbjct 5334 AACGGATATTGACACTTCAGGTGTAGAAGAA-ACCAAAGAAGGCACGCAAGATGTGGCAG 5392 Query 5142 --GCA-A-GATGT---GG---CAGTTGACCATGTGAACAACGCAGTTGCACGCAGTGAAA 5191 || | || || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5393 TCGCCGATGAAGTTATGGATTCTGTTAACCATGTGAACAACGCAGTTGCACGCAGTGAAA 5452 Query 5192 TGGAGAATGGAAACCGGAAATCCGAGGATGGTGAGAAAACTTTCAGCATTTTGTTAAGAG 5251 ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5453 CGGAGAATGGAAACCGGAAATCTGAGGAAGGTGAGAAAACTTTCAGCATTTTGTTAAGAG 5512 Query 5252 GGAGGAGAAACAGGAAACAAACACTGAGAATGCCAATCAGTTTGCTTAATCGACCTTATG 5311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 5513 GGAGGAGAAACAGGAAACAAACACTGAGAATGCCAATCAGTTTGCTTAACCGGCCTTATG 5572 Query 5312 ATTCTCAACCGTTCAAGCTTGGTTATAGCAGAGTGATCAGAGACAGCGAGGCTCCAAAGT 5371 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5573 ATTCTCAACCGTTCAAGCTTGGCTATAGCAGAGTTATCAGAGACAGCGAGGCTCCAAAGT 5632 Query 5372 CTGTAGCTTGAAACACTCTCCAAAGATTCAGCCAATTCGATGAAATGCAAAACTTACTCA 5431 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || || || Sbjct 5633 CTGTAGCTTGAAACACTCTCCAAAGATTGAGCTAATTCGATGAAATGCAAA-CTCACACA 5691 Query 5432 CACATCTCTGATCTTTGCTGTTTCATAGGGGCAGTATAAAGGTAGTTTTGTT-ATTAGTC 5490 |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||| Sbjct 5692 CACATCTCTGATATTTGCTGTTTCATAGGGACAATATAAAGGTAGTTTCATTCAC-AGTC 5750 Query 5491 AAGGGAAACTGAGGCTTGTGATAGCCTCGAAATGAAGTTACAATGATTTGGATTTTAACC 5550 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| Sbjct 5751 ATGGGAAACTGAGGCTTGTGATAGCCTCGAAATGAAGTTACAATGTTTTGGATTTTGACC 5810 Query 5551 GGGAAAGGTTGTGCAGAGG-GaaaaaaaGCCAAACCATTCTTTTGTTTACCAAGTGAGGT 5609 || |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5811 GG-AAAGGTTGTGCAGAGGTGAGAAAAAGCCAAGCCATTCTTTTGTTTACCAAGTGAGGT 5869 Query 5610 GATGTATCATTTTTCTGGGGttttttttttttttATTTTAATTCAGCCAATAAAACGTAG 5669 ||| || |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| Sbjct 5870 GATATAACATTTTTCTGGGGTTTTTCTTTT----A----A-TTCAGCCAATAAAACGTAG 5920 Query 5670 GAAATTTTGGACATAAtttttt-t-----GGTTCTCCATGTTTAAACGTTAGTTTTCACT 5723 |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5921 GAAATTTTGGACATAATTTTTTCTTTTATGGTTCTTCATGTTTAAACATTAGTTTTCACG 5980 Query 5724 TAATTTACTTCCGTATTTGTCATCGATTACATC 5756 |||||||||| ||||||| |||||||||||||| Sbjct 5981 TAATTTACTTGCGTATTTCTCATCGATTACATC 6013 > AT4G28080.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | chr4:13948603-13957840 REVERSE LENGTH=5850 Length=5850 Score = 507 bits (274), Expect = 6e-142 Identities = 626/793 (79%), Gaps = 36/793 (5%) Strand=Plus/Plus Query 2612 AGCAAGCAGCATGTTCATCTGCTGATGGAAG-GCAAC-TT-CTGGAGTCATCTAAAACAG 2668 |||| | |||||||||||| || ||||| | || || || |||| ||||| ||||| Sbjct 2648 AGCACGTAGCATGTTCATCCGCAGATGG--GCGC-ACTTTGTTGGAATCATCCAAAACCT 2704 Query 2669 CTTTAGACAAAGG-AAAGCTTGAAGATGCAGTTACA-TATGGAACGAAGGCTCTT-GCTA 2725 | ||||| ||||| ||| || || ||||| || | | ||||| || ||||| || || | Sbjct 2705 CCTTAGATAAAGGCAAA-CTGGAGGATGCTGTCA-ATTATGGCACCAAGGC-ATTGGCCA 2761 Query 2726 AACTTGTAGCAGTTTGCGGTCCC-TATCACAGAATGACAGCCGGAGCTTACAGT-TTACT 2783 | |||||||| || ||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| || ||| || || Sbjct 2762 AGCTTGTAGCTGTGTGCGG-CCCATATCATAGAATGACCGCTGGAGCGTATAGTCTT-CT 2819 Query 2784 TGCTGTAGTTCTATATCACACTGGTGACTTTAACCAGGCTACAATATATCAGCA-AAAGG 2842 ||||| || || || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||| | Sbjct 2820 CGCTGTTGTGCTGTACCATACTGGGGATTTTAACCAGGCTACCATTTATCAGCAGAAA-G 2878 Query 2843 CTTTAGACATCAATGAAAGGGAACTTGGACTTGATCATCCAGATACAATGAAGAGTTATG 2902 | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || | Sbjct 2879 CACTCGACATAAATGAAAGGGAACTTGGACTTGATCACCCAGACACAATGAAAAGCTACG 2938 Query 2903 GTGATCTTGCTGTCTTCTATTATAGGCTTCAGCATACAGAGCT-GGCTCTCAAGTATGTT 2961 | || || ||||||||||||||| | |||||||| |||||| | | || | |||||||| Sbjct 2939 GCGACCTGGCTGTCTTCTATTATCGTCTTCAGCACACAGAGTTAGCCT-TGAAGTATGTC 2997 Query 2962 AAGCGTGCGTTGTATCTCTTACATCTCACATGCGGTCCATCTCATCCAAACACTGCTGCT 3021 || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| Sbjct 2998 AACCGTGCCTTGTATCTTTTGCATCTAACATGTGGACCATCACATCCAAATACAGCTGCC 3057 Query 3022 ACATACATCAATGTAGCCATGATGGAAGAAGGTCTAGGA-AATGTACACGTTGCGTTGAG 3080 || || || || ||||| ||||||||||||||| | | | |||| || || || || || Sbjct 3058 ACTTATATAAACGTAGCAATGATGGAAGAAGGTAT-GAAGAATGCCCATGTGGCTTTAAG 3116 Query 3081 GTATCTTCACAAAGC-TCTCAAGTGTAATCAAAGGTTGCTTGGTCCGGACCATATCCAGA 3139 || ||||| |||| | | || ||||| || || | ||||| | || |||||||||| Sbjct 3117 ATACCTTCATGAAGCAT-TGAAATGTAACCAGAGACTACTTGGAGCTGATCATATCCAGA 3175 Query 3140 CTGCTGCAAGCTACCATGCCATAGCAATTGCGCTCTCGT-TGATGGAGGCATAC-CATTT 3197 |||||||||||||||||||||| || ||||| || || | ||||||| |||||| | || Sbjct 3176 CTGCTGCAAGCTACCATGCCATTGCTATTGCTCTTTC-TCTGATGGACGCATACTCCTTG 3234 Query 3198 AAGTGTTCAGCATGAGCAAACAAC-CTTA-AGAATCCTCCGAGCAAAGCTGGGGCCAGAT 3255 | | ||||| |||||||| || || || | ||| || | | |||||| || || || || Sbjct 3235 A-GCGTTCAACATGAGCAGACCACTCT-ACAGATTC-TACAAGCAAAACTAGGCCCTGAG 3291 Query 3256 GAT-TTACGTACTCAAGATGCTGCTGCTTGGCTAGAATACTTT-GAGTCCAAGGCTTTTG 3313 ||| || || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||| | | Sbjct 3292 GATCTT-CGGACACAGGATGCGGCTGCGTGGCTTGAATA-TTTCGAGTCCAAAGCTCTGG 3349 Query 3314 AACAACAAGAAGCTGCGCGAAATGGTACTCCGAAGCCAGACGCGTCTATAGCCAGCAAAG 3373 |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 3350 AACAGCAAGAAGCTGCACGAAATGGTACTCCCAAGCCAGACGCCTCTATTTCCAGCAAAG 3409 Query 3374 GCCACCTAAGTGT 3386 |||| || ||||| Sbjct 3410 GCCATCTCAGTGT 3422 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 287163777248 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5