BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg470642

Length=2964
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT1G06220.2 | Symbols: MEE5 | Ribosomal protein S5/Elongation f...  5048    0.0  
  AT5G25230.1 | Symbols:  | Ribosomal protein S5/Elongation facto...  4540    0.0  


> AT1G06220.2 | Symbols: MEE5 | Ribosomal protein S5/Elongation 
factor G/III/V family protein | chr1:1899964-1904873 FORWARD 
LENGTH=3543
Length=3543

 Score = 5048 bits (2733),  Expect = 0.0
 Identities = 2881/2955 (97%), Gaps = 0/2955 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  10    AGCTTATATGATGAGTTTGGTAACTATATTGGACCTGAGATTGAGTCTGACAGAGACAGT  69
             ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  299   AGCTTGTATGATGAGTTTGGTAACTATGTTGGACCTGAGATTGAGTCTGACAGAGATAGT  358

Query  70    GATGATGAAATAGAAGATGAAGATCTCCAAGATAAGCAACTTGAAGAAAATGGATCGGAT  129
             ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||
Sbjct  359   GATGATGAAGTAGAAGATGAAGATCTCCAAGATAAGCATCTTGAAGAAAATGGTTCCGAT  418

Query  130   GGCGAACATGGTCCTGGGGGTTCCAATGGCTGGATTACCACTATCAATGATGTTGAGATG  189
             |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  419   GGCGAACAAGGGCCTGGGGGTTCTAATGGCTGGATTACCACTATCAATGATGTTGAGATG  478

Query  190   GAGAACCAAATTGTTCTTCCTGAGGATAAGAAGTACTACCCTACTGCTGAGGAGGTTTAT  249
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479   GAGAACCAAATTGTTCTTCCTGAGGATAAGAAGTACTACCCTACTGCTGAGGAGGTTTAT  538

Query  250   GGTGAGGGTGTTGAGACCTTGGTTATGGATGAAGATGAGCAGCCTCTTGAGCAACCCATT  309
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  539   GGTGAGGATGTTGAGACCTTGGTTATGGATGAAGATGAGCAGCCTCTTGAGCAACCCATT  598

Query  310   ATCAAACCTGTTAGAGATATTAGATTTGAGGTGGGGGTCAAGGATCAATCAACCTATGTG  369
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||
Sbjct  599   ATCAAACCTGTTAGAGATATTAGATTTGAGGTGGGGGTCAAAGATCAAGCAACGTATGTG  658

Query  370   TCTACACAGTTTCTTATCGGCCTCATGTCTAATCCCGCGCTTGTGAGGAATGTTGCTCTC  429
             || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  659   TCAACACAGTTTCTTATCGGCCTCATGTCTAATCCTGCGCTTGTGAGGAATGTTGCTCTT  718

Query  430   GTGGGGCATCTACAGCACGGCAAAACTGTCTTCATGGATATGTTGGTAGAGCAGACGCAT  489
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719   GTGGGGCATCTACAGCACGGCAAAACTGTCTTCATGGATATGTTGGTAGAGCAGACGCAT  778

Query  490   CATATGTCTACTTTTAATACTAAAAACGAGAAGCATATGAAATATACAGACACAAGAGTC  549
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  779   CATATGTCTACTTTTAATGCTAAAAACGAGAAGCATATGAAATATACAGACACACGAGTC  838

Query  550   GATGAGCAGGAGAGAAATATATCAATCAAGGCGGTTCCAATGTCTCTTGTCCTTGAGGAC  609
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  839   GATGAGCAGGAGAGAAATATATCAATCAAGGCGGTTCCAATGTCTCTTGTCCTTGAGGAC  898

Query  610   AGTAGATCCAAATCATACCTGTGCAATATCATGGATACCCCTGGACACGTCAATTTCTCT  669
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  899   AGTAGATCCAAATCATACCTGTGCAATATCATGGATACCCCTGGACATGTCAATTTCTCT  958

Query  670   GACGAAATGACTGCTTCTTTAAGACTTGCTGATGGTGCTGTTCTGATTGTTGATGCTGCT  729
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959   GACGAAATGACTGCTTCTTTAAGACTTGCTGATGGTGCTGTTCTGATTGTTGATGCTGCT  1018

Query  730   GAAGGAGTGATGGTAAACACAGAGAGAGCTATACGGCATGCAATCCAGGACCGTCTCCCT  789
             |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1019  GAAGGAGTGATGGTTAACACAGAGAGAGCTATACGGCATGCAATCCAGGACCATCTCCCT  1078

Query  790   ATTGTTGTTGTCATCAATAAGGTTGACAGGCTCATAACTGAGCTCAAACTACCTCCAAGG  849
             ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1079  ATTGTAGTTGTTATCAATAAGGTTGACAGGCTCATAACTGAGCTCAAACTACCTCCAAGG  1138

Query  850   GATGCTTACTACAAGCTGAGGCATACAATTGAAGTCATTAACAACCACATATCTGCTGCT  909
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1139  GATGCTTACTACAAGCTGAGGCATACAATTGAAGTCATTAATAACCACATATCTGCTGCT  1198

Query  910   TCAACAACTGCTGGAAACTTACCTCTTATAGACCCTGCAGCTGGAAATGTATGTTTTGCC  969
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1199  TCAACAACTGCTGGAGACTTACCTCTTATAGACCCTGCAGCTGGAAATGTATGTTTTGCC  1258

Query  970   AGTGGCACAGCCGGATGGTCGTTCACATTGCAATCTTTTTCTAAAATGTATGCCAAGCTT  1029
             ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  1259  AGTGGTACAGCCGGATGGTCCTTCACATTACAATCTTTTGCTAAAATGTATGCCAAGCTT  1318

Query  1030  CATGGGGTGGCCATGGACGTGGATAAGTTTGCATCTCGACTTTGGGGAGATGTTTATTAT  1089
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1319  CATGGTGTGGCCATGGACGTGGATAAGTTTGCATCTCGACTTTGGGGAGATGTATATTAT  1378

Query  1090  CACCCTGATACTAGGGTATTCAAGAGAAGTCCTCCTGTAGGTGGTGGAGAAAGAGCATTT  1149
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1379  CACTCTGATACTAGGGTATTCAAGAGAAGTCCTCCAGTAGGTGGTGGAGAAAGAGCATTT  1438

Query  1150  GTTCAGTTTATTCTGGAGCCTCTGTACAAAATATACAGCCAAGTGATAGGTGAACATAAG  1209
             |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1439  GTTCAGTTTATTCTGGAGCCCCTATACAAGATATACAGCCAAGTGATAGGTGAACATAAG  1498

Query  1210  AAGAGTGTAGAGACAACCCTTGCAGAATTAGGAGTGACTCTGAGTAATAGTGCATATAAG  1269
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1499  AAGAGTGTAGAGACCACCCTTGCAGAATTAGGAGTGACTCTGAGTAATAGTGCATATAAG  1558

Query  1270  CTGAACGTCAGACCTTTACTTAGGTTAGCCTGTAGTTCAGTTTTTGGTTCGGCATCAGGG  1329
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1559  CTGAACGTCAGACCTCTACTTAGGTTAGCCTGTAGTTCAGTGTTTGGTTCGGCATCAGGG  1618

Query  1330  TTCACTGATATGTTGGTAAAGCACATTCCTTCCCCCCGAGAGGCCGCAGCTAGGAAAGTC  1389
             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||
Sbjct  1619  TTCACTGATATGTTGGTAAAGCACATTCCTTCACCCAGAGAGGCTGCAGCTAGGAAGGTC  1678

Query  1390  GACCATTCATACACTGGAACCAAAGATTCCCCCATTTATGAATCAATGGTAGAATGTGAT  1449
             ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1679  GACCATTCATATACCGGAACCAAAGATTCCCCCATTTATGAATCAATGGTAGAATGTGAT  1738

Query  1450  CCATCTGGACCTCTCATGGTTAATGTGACAAAGTTGTACCCCAAATCAGATACTAGTGTT  1509
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1739  CCATCTGGACCTCTCATGGTTAATGTGACAAAGTTGTACCCCAAATCAGATACTAGTGTT  1798

Query  1510  TTTGATGTGTTTGGAAGAGTTTATAGCGGTAGGCTTCAAACAGGGCAAAGCGTACGTGTA  1569
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1799  TTTGATGTGTTTGGAAGAGTTTATAGTGGTAGGCTTCAAACAGGGCAAAGCGTACGTGTA  1858

Query  1570  CTAGGAGAAGGGTATTTACCTGAGGATGAGGAGGACATGACTATAAAAGAAGTGACGAAG  1629
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1859  CTAGGAGAAGGGTATTCACCTGAGGATGAGGAGGACATGACTATAAAAGAAGTGACGAAG  1918

Query  1630  CTATGGATATATCAAGCTAGGTATAGAATACCAGTAAGCAGTGCCCCTCCTGGTTCCTGG  1689
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1919  CTATGGATATATCAAGCTAGGTATAGAATACCAGTAAGCAGTGCCCCTCCCGGTTCCTGG  1978

Query  1690  GTTTTAATTGAAGGTGTCGATGCATCCATCATGAAAACTGCGACTCTGTGTAATGCAAGC  1749
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1979  GTTTTAATTGAAGGTGTCGATGCATCCATCATGAAAACTGCGACTCTGTGTAATGCAAGC  2038

Query  1750  TACGATGAAGATGTTTACATATTCCGGGCTCTCCAATTTAATACCCTCCCAGTAGTCAAG  1809
             || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2039  TATGATGAAGATGTCTACATATTCCGGGCTCTCCAATTTAATACCCTCCCAGTAGTCAAG  2098

Query  1810  ACTGCAACTGAGCCTTTGAATCCTAGTGAGCTGCCTAAAATGGTGGAAGGGCTTAGGAAA  1869
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2099  ACTGCAACTGAGCCTTTGAATCCTAGTGAGCTGCCTAAAATGGTGGAAGGGCTTAGGAAA  2158

Query  1870  ATTAGCAAAAGCTATCCCCTTGCGATTACCAAAGTCGAGGAGTCTGGGGAACATACTATT  1929
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2159  ATTAGCAAAAGCTATCCCCTTGCGATTACCAAAGTTGAGGAGTCTGGGGAACATACTATT  2218

Query  1930  CTAGGCACTGGTGAGTTGTACTTGGATTCCATCATGAAGGACCTCAGGGAACTCTATTCA  1989
             |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  2219  CTAGGCACAGGTGAGTTGTACTTGGATTCAATCATGAAGGACCTCAGGGAGCTCTATTCA  2278

Query  1990  GAGGTCGAAGTAAAGGTAGCAGATCCGGTGGTCTCCTTCTGTGAGACAGTAGTTGAATCT  2049
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  2279  GAGGTCGAAGTAAAGGTTGCAGATCCGGTGGTCTCCTTCTGTGAGACAGTGGTTGAATCT  2338

Query  2050  TCGTCGATGAAGTGTTTTGCTGAGACACCAAACAAAAAGAACAAAATAACTATGATTGCA  2109
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2339  TCGTCGATGAAGTGTTTTGCTGAGACACCAAACAAAAAGAACAAAATAACTATGATTGCA  2398

Query  2110  GAGCCATTGGATAGAGGACTTGCAGAGGACATTGAGAATGGCGTTGTAAGCATTGACTGG  2169
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2399  GAGCCATTGGATAGAGGACTTGCAGAGGACATTGAGAATGGCGTTGTAAGCATTGACTGG  2458

Query  2170  AACAGAAAACAACTTGGTGACTTCTTCAGGACGAAATATGACTGGGATTTACTTGCTGCA  2229
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2459  AACAGAAAACAACTTGGTGACTTCTTCAGGACGAAATATGACTGGGATTTACTTGCTGCA  2518

Query  2230  CGTTCCATCTGGGCTTTTGGCCCTGACAAACAGGGGCCAAATATATTATTGGATGACACG  2289
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| 
Sbjct  2519  CGTTCCATCTGGGCTTTTGGCCCTGACAAACAGGGGCCAAACATATTATTGGATGACACC  2578

Query  2290  CTTCCAACTGAGGTGGACAGGAACTTGATGATGGCAGTGAAAGACTCCATTGTTCAAGGG  2349
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2579  CTTCCAACTGAGGTGGACAGGAACTTGATGATGGCAGTGAAAGACTCCATTGTTCAAGGG  2638

Query  2350  TTCCAGTGGGGTGCTCGTGAAGGTCCCCTCTGTGATGAGCCCATCAGAAATGTAAAGTTC  2409
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2639  TTCCAGTGGGGTGCTCGTGAAGGTCCCCTCTGTGATGAGCCCATCAGAAATGTAAAGTTC  2698

Query  2410  AAGATTGTTGATGCAAGGATAGCACCAGAGCCGTTGCATAGAGGATCTGGTCAGATGATT  2469
             ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2699  AAGATTGTTGATGCACGGATAGCACCAGAGCCATTGCATAGAGGATCTGGTCAGATGATT  2758

Query  2470  CCAACAGCAAGACGTGTTGCATATTCAGCCTTTCTTATGGCAACTCCAAGGCTAATGGAA  2529
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2759  CCAACAGCAAGACGTGTTGCATATTCAGCTTTTCTAATGGCAACTCCAAGGCTAATGGAA  2818

Query  2530  CCTGTCTACTATGTGGAGATACAAACGCCAATCGACTGTGTAACTGCAATCTACACAGTT  2589
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2819  CCTGTCTACTATGTGGAGATACAAACACCAATCGACTGTGTAACTGCAATCTACACAGTT  2878

Query  2590  TTGTCACGTAGACGTGGGCATGTCACATCTGATGTTCCTCAACCCGGTACTCCGGCTTAT  2649
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  2879  TTGTCACGTAGACGTGGGCATGTCACATCTGATGTTCCTCAACCCGGTACTCCAGCTTAT  2938

Query  2650  ATTGTGAAGGCTTTTCTGCCTGTGATAGAGTCATTTGGGTTTGAGACAGATCTGAGGTAC  2709
             || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2939  ATCGTGAAGGCCTTTCTGCCTGTGATAGAGTCCTTTGGGTTTGAGACAGATCTGAGGTAC  2998

Query  2710  CACACTCAGGGACAAGCCTTTTGCCTATCTGTGTTTGATCACTGGGCCATAGTGCCAGGA  2769
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  2999  CACACTCAGGGACAAGCCTTTTGCCTATCTGTGTTTGATCACTGGGCCATTGTGCCAGGA  3058

Query  2770  GACCCTCTAGACAAAGCCATACAATTGCGCCCACTTGAGCCCGCCCCTATTCAGCATCTA  2829
             |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  3059  GACCCTCTAGACAAAGCCATCCAGTTGCGCCCACTTGAGCCCGCTCCTATTCAGCATCTA  3118

Query  2830  GCTCGTGAATTCATGGTCAAGACCCGCCGTAGAAAGGGAATGAGCGAAGACGTCAGCGGG  2889
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  3119  GCTCGGGAATTCATGGTCAAGACCCGCCGTAGAAAGGGAATGAGCGAAGACGTCAGCGGA  3178

Query  2890  AATAAATTCTTTGATGAAGCGATGATGGTAGAGCTTGCCCAGCAAACAGGCGATCTCCAT  2949
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3179  AATAAATTCTTTGATGAAGCGATGATGGTAGAGCTTGCCCAGCAAACAGGCGATCTCCAT  3238

Query  2950  CTGCAGATGATTTGA  2964
             |||||||||||||||
Sbjct  3239  CTGCAGATGATTTGA  3253


> AT5G25230.1 | Symbols:  | Ribosomal protein S5/Elongation factor 
G/III/V family protein | chr5:8739709-8743594 FORWARD LENGTH=2922
Length=2922

 Score = 4540 bits (2458),  Expect = 0.0
 Identities = 2708/2829 (96%), Gaps = 15/2829 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  142   CCTGGGGGTTCCAATGGCTGGATTACCACTATCAATGATGTTGAGATGGAGAACCAAATT  201
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    || |   | ||  | |||
Sbjct  103   CCTGGGGGTTCTAATGGCTGGATTACCACTATCAATGA----GA-A-CCA-AA--ATATT  153

Query  202   GTTCTTCCTGAGGATAAGAAGTACTACCCTACTGCTGAGGAGGTTTATGGTGAGGGTGTT  261
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct  154   GTTCTTCCTGAGGATAAGAAGTACTACCCTATTGCTAAGGAGGTTTATGGTGAGGATGTT  213

Query  262   GAGACCTTGGTTATGGATGAAGATGAGCAGCCTCTTGAGCAACCCATTATCAAACCTGTT  321
             |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  214   GAGACCTTGGTTATGGATGAAGATGAGCAGTCTCTTGAGCAACCCATTATCAAACCCGTT  273

Query  322   AGAGATATTAGATTTGAGGTGGGGG---TCAAGGATCAATCAAC--C-TATGTGTCTACA  375
             |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||  | |||||||| |||
Sbjct  274   AGAGATATTAGATTTGAGGTGGGGGTCATCAAGGATCAAACAACAACGTATGTGTCAACA  333

Query  376   CAGTTTCTTATCGGCCTCATGTCTAATCCCGCGCTTGTGAGGAATGTTGCTCTCGTGGGG  435
             | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  334   CTGTTTCTTATCGGCCTCATGTCTAATCCTGCGCTTGTGAGGAATGTTGCTCTTGTGGGG  393

Query  436   CATCTACAGCACGGCAAAACTGTCTTCATGGATATGTTGGTAGAGCAGACGCATCATATG  495
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  394   CATCTCCAGCACGGCAAAACTGTCTTCATGGATATGTTGGTAGAGCAGACGCATCGTATG  453

Query  496   TCTACTTTTAATACTAAAAACGAGAAGCATATGAAATATACAGACACAAGAGTCGATGAG  555
             |||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  454   TCTACTTTTAATGCTGAAAACGACAAGCATATGAGATATACGGACACAAGAGTCGATGAG  513

Query  556   CAGGAGAGAAATATATCAATCAAGGCGGTTCCAATGTCTCTTGTCCTTGAGGACAGTAGA  615
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514   CAGGAGAGAAATATATCTATCAAGGCGGTTCCAATGTCTCTTGTCCTTGAGGACAGTAGA  573

Query  616   TCCAAATCATACCTGTGCAATATCATGGATACCCCTGGACACGTCAATTTCTCTGACGAA  675
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct  574   TCCAAATCATACCTGTGCAATATCATGGATACACCTGGAAATGTCAATTTCTCTGACGAA  633

Query  676   ATGACTGCTTCTTTAAGACTTGCTGATGGTGCTGTTCTGATTGTTGATGCTGCTGAAGGA  735
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||
Sbjct  634   ATGACTGCTTCTTTAAGACTTGCTGATGGTGCTGTTTTCATTGTTGATGCTGCTCAAGGA  693

Query  736   GTGATGGTAAACACAGAGAGAGCTATACGGCATGCAATCCAGGACCGTCTCCCTATTGTT  795
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct  694   GTCATGGTAAACACAGAGAGAGCTATACGGCATGCAATCCAGGATCATCTCCCTATTGTT  753

Query  796   GTTGTCATCAATAAGGTTGACAGGCTCATAACTGAGCTCAAACTACCTCCAAGGGATGCT  855
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754   GTTGTGATCAATAAGGTTGACAGGCTCATAACTGAGCTCAAACTACCTCCAAGGGATGCT  813

Query  856   TACTACAAGCTGAGGCATACAATTGAAGTCATTAACAACCACATATCTGCTGCTTCAACA  915
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  814   TACTACAAGCTGAGGTATACAATTGAAGTCATTAATAACCATATATCTGCTGCTTCAACA  873

Query  916   ACTGCTGGAAACTTACCTCTTATAGACCCTGCAGCTGGAAATGTATGTTTTGCCAGTGGC  975
             | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| 
Sbjct  874   AATGCTGCAGACTTACCTCTTATAGACCCTGCAGCTGGAAATGTATGTTTCGCCAGTGGT  933

Query  976   ACAGCCGGATGGTCGTTCACATTGCAATCTTTTTCTAAAATGTATGCCAAGCTTCATGGG  1035
             |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| 
Sbjct  934   ACAGCCGGATGGTCCTTCACATTACAATCTTTTGCTAGAATGTATGCCAAGCTTCATGGT  993

Query  1036  GTGGCCATGGACGTGGATAAGTTTGCATCTCGACTTTGGGGAGATGTTTATTATCACCCT  1095
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  994   GTGGCCATGGACGTGGATAAGTTTGCATCTAGACTTTGGGGAGATGTATATTATCACCCT  1053

Query  1096  GATACTAGGGTATTCAAGAGAAGTCCTCCTGTAGGTGGTGGAGAAAGAGCATTTGTTCAG  1155
             ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1054  GATACTAGGGTATTCAATACAAGTCCTCCAGTAGGTGGTGGAGAAAGAGCATTTGTTCAG  1113

Query  1156  TTTATTCTGGAGCCTCTGTACAAAATATACAGCCAAGTGATAGGTGAACATAAGAAGAGT  1215
             ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1114  TTTATTCTGGAGCCTCTATACAAGATATACAGCCAAGTGATAGGTGAACATAAGAAGAGT  1173

Query  1216  GTAGAGACAACCCTTGCAGAATTAGGAGTGACTCTGAGTAATAGTGCATATAAGCTGAAC  1275
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1174  GTAGAGACCACCCTTGCAGAATTAGGAGTGACTCTGAGTAATAGTGCATATAAGCTGAAC  1233

Query  1276  GTCAGACCTTTACTTAGGTTAGCCTGTAGTTCAGTTTTTGGTTCGGCATCAGGGTTCACT  1335
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1234  GTCAGACCTTTACTTAGGTTAGCCTGTAGTTCAGTGTTTGGTTCGGCATCAGGGTTCACT  1293

Query  1336  GATATGTTGGTAAAGCACATTCCTTCCCCCCGAGAGGCCGCAGCTAGGAAAGTCGACCAT  1395
             |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct  1294  GATATGTTGGTAAAGCACATTCCTTCACCCAGAGAGGCTGCAGCTAGGAAAGTGGACCAT  1353

Query  1396  TCATACACTGGAACCAAAGATTCCCCCATTTATGAATCAATGGTAGAATGTGATCCATCT  1455
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1354  TCATACACTGGAACCAAAGATTCTCCCATTTATGAATCAATGGTAGAATGTGATCCATCT  1413

Query  1456  GGACCTCTCATGGTTAATGTGACAAAGTTGTACCCCAAATCAGATACTAGTGTTTTTGAT  1515
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1414  GGACCTCTCATGGTTAATGTGACAAAGTTGTACCCCAAATCAGATACTAGTGTTTTTGAT  1473

Query  1516  GTGTTTGGAAGAGTTTATAGCGGTAGGCTTCAAACAGGGCAAAGCGTACGTGTACTAGGA  1575
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1474  GTGTTTGGAAGAGTTTATAGTGGTAGGCTTCAAACAGGGCAAAGCGTACGTGTACTAGGA  1533

Query  1576  GAAGGGTATTTACCTGAGGATGAGGAGGACATGACTATAAAAGAAGTGACGAAGCTATGG  1635
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  1534  GAAGGGTATTCACCTGAGGATGAGGAGGACATGACTATAAAAGAAGTCACGAAGCTATGG  1593

Query  1636  ATATATCAAGCTAGGTATAGAATACCAGTAAGCAGTGCCCCTCCTGGTTCCTGGGTTTTA  1695
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct  1594  ATATATCAAGCTAGGTATAGAATACCAGTAAGCAGTGCCCCTCCCGGTTCTTGGGTTTTA  1653

Query  1696  ATTGAAGGTGTCGATGCATCCATCATGAAAACTGCGACTCTGTGTAATGCAAGCTACGAT  1755
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||
Sbjct  1654  ATTGAAGGTGTCGATGCATCCATCATGAAAACTGCAACTCTGTGTAATGCAAGTTATGAT  1713

Query  1756  GAAGATGTTTACATATTCCGGGCTCTCCAATTTAATACCCTCCCAGTAGTCAAGACTGCA  1815
             |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1714  GAAGATGTCTACATATTCCGGGCTCTCAAATTTAATACCCTCCCAGTAGTCAAGACTGCA  1773

Query  1816  ACTGAGCCTTTGAATCCTAGTGAGCTGCCTAAAATGGTGGAAGGGCTTAGGAAAATTAGC  1875
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1774  ACTGAGCCTTTGAATCCTAGTGAGCTGCCTAAAATGGTGGAAGGGCTTAGGAAAATTAGC  1833

Query  1876  AAAAGCTATCCCCTTGCGATTACCAAAGTCGAGGAGTCTGGGGAACATACTATTCTAGGC  1935
             |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1834  AAAAGCTATCCCCTTGCGATAACCAAAGTTGAGGAGTCTGGGGAACATACTATTCTAGGC  1893

Query  1936  ACTGGTGAGTTGTACTTGGATTCCATCATGAAGGACCTCAGGGAACTCTATTCAGAGGTC  1995
             || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1894  ACAGGTGAGTTGTACTTGGATTCCATCATCAAGGACCTCAGGGAACTCTATTCAGAGGTC  1953

Query  1996  GAAGTAAAGGTAGCAGATCCGGTGGTCTCCTTCTGTGAGACAGTAGTTGAATCTTCGTCG  2055
              |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| 
Sbjct  1954  CAAGTAAAGGTTGCAGATCCTGTGGTCTCCTTCTGTGAGACAGTGGTTGAATCTTCGTCA  2013

Query  2056  ATGAAGTGTTTTGCTGAGACACCAAACAAAAAGAACAAAATAACTATGATTGCAGAGCCA  2115
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  2014  ATGAAGTGCTTTGCTGAGACACCAAACAAAAAGAACAAACTAACTATGATTGCAGAGCCA  2073

Query  2116  TTGGATAGAGGACTTGCAGAGGACATTGAGAATGGCGTTGTAAGCATTGACTGGAACAGA  2175
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2074  TTGGATAGAGGACTTGCAGAGGATATTGAGAATGGCGTTGTAAGCATTGACTGGAACAGA  2133

Query  2176  AAACAACTTGGTGACTTCTTCAGGACGAAATATGACTGGGATTTACTTGCTGCACGTTCC  2235
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2134  GTACAACTTGGTGACTTCTTCAGGACGAAATATGACTGGGATTTACTTGCTGCACGTTCC  2193

Query  2236  ATCTGGGCTTTTGGCCCTGACAAACAGGGGCCAAATATATTATTGGATGACACGCTTCCA  2295
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  2194  ATCTGGGCTTTTGGCCCTGACAAACAGGGGACAAACATATTATTGGATGACACCCTTCCA  2253

Query  2296  ACTGAGGTGGACAGGAACTTGATGATGGCAGTGAAAGACTCCATTGTTCAAGGGTTCCAG  2355
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2254  ACTGAGGTGGACAGGAACTTGATGATGGGAGTGAAAGACTCCATTGTTCAAGGGTTCCAG  2313

Query  2356  TGGGGTGCTCGTGAAGGTCCCCTCTGTGATGAGCCCATCAGAAATGTAAAGTTCAAGATT  2415
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2314  TGGGGTGCTCGTGAAGGTCCCCTCTGTGATGAGCCCATCAGAAATGTAAAGTTCAAGATT  2373

Query  2416  GTTGATGCAAGGATAGCACCAGAGCCGTTGCATAGAGGATCTGGTCAGATGATTCCAACA  2475
             ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2374  GTTGATGCACGGATAGCACCTGAGCCGTTGCATAGAGGATCTGGTCAGATGATTCCAACG  2433

Query  2476  GCAAGACGTGTTGCATATTCAGCCTTTCTTATGGCAACTCCAAGGCTAATGGAACCTGTC  2535
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2434  GCAAGACGTGTTGCATATTCAGCCTTTCTTATGGCAACTCCAAGGCTAATGGAACCTGTC  2493

Query  2536  TACTATGTGGAGATACAAACGCCAATCGACTGTGTAACTGCAATCTACACAGTTTTGTCA  2595
             |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  2494  TACTATGTGGAGATACAAACACCAATAGACTGTGTAACTGCCATCTACACAGTTTTGTCA  2553

Query  2596  CGTAGACGTGGGCATGTCACATCTGATGTTCCTCAACCCGGTACTCCGGCTTATATTGTG  2655
             |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct  2554  CGTAGACGTGGGTATGTCACATCTGATGTTCCACAACCCGGTACTCCTGCTTATATCGTG  2613

Query  2656  AAGGCTTTTCTGCCTGTGATAGAGTCATTTGGGTTTGAGACAGATCTGAGGTACCACACT  2715
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2614  AAGGCTTTTCTGCCTGTGATAGAGTCGTTTGGGTTTGAGACAGATCTGAGGTACCACACT  2673

Query  2716  CAGGGACAAGCCTTTTGCCTATCTGTGTTTGATCACTGGGCCATAGTGCCAGGAGACCCT  2775
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||
Sbjct  2674  CAGGGCCAAGCCTTTTGCCTATCTGTGTTTGATCATTGGGCCATAGTCCCTGGAGACCCT  2733

Query  2776  CTAGACAAAGCCATACAATTGCGCCCACTTGAGCCCGCCCCTATTCAGCATCTAGCTCGT  2835
             |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2734  CTAGACAAAGCCATCCAATTGCGCCCACTTGAACCCGCCCCTATTCAGCATCTAGCTCGG  2793

Query  2836  GAATTCATGGTCAAGACCCGCCGTAGAAAGGGAATGAGCGAAGACGTCAGCGGGAATAAA  2895
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  2794  GAATTCATGGTCAAGACCCGCCGTAGAAAGGGAATGAGCGAAGATGTCAGCGGGAATAAA  2853

Query  2896  TTCTTTGATGAAGCGATGATGGTAGAGCTTGCCCAGCAAACAGGCGATCTCCATCTGCAG  2955
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2854  TTCTTTGATGAAGCGATGATGGTAGAGCTTGCCCAGCAAACAGGCGATCTCCATCTGCAG  2913

Query  2956  ATGATTTGA  2964
             |||||||||
Sbjct  2914  ATGATTTGA  2922



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 147340311591


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5