BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg470642 Length=2964 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G06220.2 | Symbols: MEE5 | Ribosomal protein S5/Elongation f... 5048 0.0 AT5G25230.1 | Symbols: | Ribosomal protein S5/Elongation facto... 4540 0.0 > AT1G06220.2 | Symbols: MEE5 | Ribosomal protein S5/Elongation factor G/III/V family protein | chr1:1899964-1904873 FORWARD LENGTH=3543 Length=3543 Score = 5048 bits (2733), Expect = 0.0 Identities = 2881/2955 (97%), Gaps = 0/2955 (0%) Strand=Plus/Plus Query 10 AGCTTATATGATGAGTTTGGTAACTATATTGGACCTGAGATTGAGTCTGACAGAGACAGT 69 ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 299 AGCTTGTATGATGAGTTTGGTAACTATGTTGGACCTGAGATTGAGTCTGACAGAGATAGT 358 Query 70 GATGATGAAATAGAAGATGAAGATCTCCAAGATAAGCAACTTGAAGAAAATGGATCGGAT 129 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| Sbjct 359 GATGATGAAGTAGAAGATGAAGATCTCCAAGATAAGCATCTTGAAGAAAATGGTTCCGAT 418 Query 130 GGCGAACATGGTCCTGGGGGTTCCAATGGCTGGATTACCACTATCAATGATGTTGAGATG 189 |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 419 GGCGAACAAGGGCCTGGGGGTTCTAATGGCTGGATTACCACTATCAATGATGTTGAGATG 478 Query 190 GAGAACCAAATTGTTCTTCCTGAGGATAAGAAGTACTACCCTACTGCTGAGGAGGTTTAT 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 479 GAGAACCAAATTGTTCTTCCTGAGGATAAGAAGTACTACCCTACTGCTGAGGAGGTTTAT 538 Query 250 GGTGAGGGTGTTGAGACCTTGGTTATGGATGAAGATGAGCAGCCTCTTGAGCAACCCATT 309 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 539 GGTGAGGATGTTGAGACCTTGGTTATGGATGAAGATGAGCAGCCTCTTGAGCAACCCATT 598 Query 310 ATCAAACCTGTTAGAGATATTAGATTTGAGGTGGGGGTCAAGGATCAATCAACCTATGTG 369 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| Sbjct 599 ATCAAACCTGTTAGAGATATTAGATTTGAGGTGGGGGTCAAAGATCAAGCAACGTATGTG 658 Query 370 TCTACACAGTTTCTTATCGGCCTCATGTCTAATCCCGCGCTTGTGAGGAATGTTGCTCTC 429 || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 659 TCAACACAGTTTCTTATCGGCCTCATGTCTAATCCTGCGCTTGTGAGGAATGTTGCTCTT 718 Query 430 GTGGGGCATCTACAGCACGGCAAAACTGTCTTCATGGATATGTTGGTAGAGCAGACGCAT 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 719 GTGGGGCATCTACAGCACGGCAAAACTGTCTTCATGGATATGTTGGTAGAGCAGACGCAT 778 Query 490 CATATGTCTACTTTTAATACTAAAAACGAGAAGCATATGAAATATACAGACACAAGAGTC 549 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 779 CATATGTCTACTTTTAATGCTAAAAACGAGAAGCATATGAAATATACAGACACACGAGTC 838 Query 550 GATGAGCAGGAGAGAAATATATCAATCAAGGCGGTTCCAATGTCTCTTGTCCTTGAGGAC 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 839 GATGAGCAGGAGAGAAATATATCAATCAAGGCGGTTCCAATGTCTCTTGTCCTTGAGGAC 898 Query 610 AGTAGATCCAAATCATACCTGTGCAATATCATGGATACCCCTGGACACGTCAATTTCTCT 669 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 899 AGTAGATCCAAATCATACCTGTGCAATATCATGGATACCCCTGGACATGTCAATTTCTCT 958 Query 670 GACGAAATGACTGCTTCTTTAAGACTTGCTGATGGTGCTGTTCTGATTGTTGATGCTGCT 729 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 GACGAAATGACTGCTTCTTTAAGACTTGCTGATGGTGCTGTTCTGATTGTTGATGCTGCT 1018 Query 730 GAAGGAGTGATGGTAAACACAGAGAGAGCTATACGGCATGCAATCCAGGACCGTCTCCCT 789 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1019 GAAGGAGTGATGGTTAACACAGAGAGAGCTATACGGCATGCAATCCAGGACCATCTCCCT 1078 Query 790 ATTGTTGTTGTCATCAATAAGGTTGACAGGCTCATAACTGAGCTCAAACTACCTCCAAGG 849 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1079 ATTGTAGTTGTTATCAATAAGGTTGACAGGCTCATAACTGAGCTCAAACTACCTCCAAGG 1138 Query 850 GATGCTTACTACAAGCTGAGGCATACAATTGAAGTCATTAACAACCACATATCTGCTGCT 909 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1139 GATGCTTACTACAAGCTGAGGCATACAATTGAAGTCATTAATAACCACATATCTGCTGCT 1198 Query 910 TCAACAACTGCTGGAAACTTACCTCTTATAGACCCTGCAGCTGGAAATGTATGTTTTGCC 969 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1199 TCAACAACTGCTGGAGACTTACCTCTTATAGACCCTGCAGCTGGAAATGTATGTTTTGCC 1258 Query 970 AGTGGCACAGCCGGATGGTCGTTCACATTGCAATCTTTTTCTAAAATGTATGCCAAGCTT 1029 ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1259 AGTGGTACAGCCGGATGGTCCTTCACATTACAATCTTTTGCTAAAATGTATGCCAAGCTT 1318 Query 1030 CATGGGGTGGCCATGGACGTGGATAAGTTTGCATCTCGACTTTGGGGAGATGTTTATTAT 1089 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1319 CATGGTGTGGCCATGGACGTGGATAAGTTTGCATCTCGACTTTGGGGAGATGTATATTAT 1378 Query 1090 CACCCTGATACTAGGGTATTCAAGAGAAGTCCTCCTGTAGGTGGTGGAGAAAGAGCATTT 1149 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1379 CACTCTGATACTAGGGTATTCAAGAGAAGTCCTCCAGTAGGTGGTGGAGAAAGAGCATTT 1438 Query 1150 GTTCAGTTTATTCTGGAGCCTCTGTACAAAATATACAGCCAAGTGATAGGTGAACATAAG 1209 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1439 GTTCAGTTTATTCTGGAGCCCCTATACAAGATATACAGCCAAGTGATAGGTGAACATAAG 1498 Query 1210 AAGAGTGTAGAGACAACCCTTGCAGAATTAGGAGTGACTCTGAGTAATAGTGCATATAAG 1269 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1499 AAGAGTGTAGAGACCACCCTTGCAGAATTAGGAGTGACTCTGAGTAATAGTGCATATAAG 1558 Query 1270 CTGAACGTCAGACCTTTACTTAGGTTAGCCTGTAGTTCAGTTTTTGGTTCGGCATCAGGG 1329 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1559 CTGAACGTCAGACCTCTACTTAGGTTAGCCTGTAGTTCAGTGTTTGGTTCGGCATCAGGG 1618 Query 1330 TTCACTGATATGTTGGTAAAGCACATTCCTTCCCCCCGAGAGGCCGCAGCTAGGAAAGTC 1389 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 1619 TTCACTGATATGTTGGTAAAGCACATTCCTTCACCCAGAGAGGCTGCAGCTAGGAAGGTC 1678 Query 1390 GACCATTCATACACTGGAACCAAAGATTCCCCCATTTATGAATCAATGGTAGAATGTGAT 1449 ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1679 GACCATTCATATACCGGAACCAAAGATTCCCCCATTTATGAATCAATGGTAGAATGTGAT 1738 Query 1450 CCATCTGGACCTCTCATGGTTAATGTGACAAAGTTGTACCCCAAATCAGATACTAGTGTT 1509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1739 CCATCTGGACCTCTCATGGTTAATGTGACAAAGTTGTACCCCAAATCAGATACTAGTGTT 1798 Query 1510 TTTGATGTGTTTGGAAGAGTTTATAGCGGTAGGCTTCAAACAGGGCAAAGCGTACGTGTA 1569 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1799 TTTGATGTGTTTGGAAGAGTTTATAGTGGTAGGCTTCAAACAGGGCAAAGCGTACGTGTA 1858 Query 1570 CTAGGAGAAGGGTATTTACCTGAGGATGAGGAGGACATGACTATAAAAGAAGTGACGAAG 1629 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1859 CTAGGAGAAGGGTATTCACCTGAGGATGAGGAGGACATGACTATAAAAGAAGTGACGAAG 1918 Query 1630 CTATGGATATATCAAGCTAGGTATAGAATACCAGTAAGCAGTGCCCCTCCTGGTTCCTGG 1689 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1919 CTATGGATATATCAAGCTAGGTATAGAATACCAGTAAGCAGTGCCCCTCCCGGTTCCTGG 1978 Query 1690 GTTTTAATTGAAGGTGTCGATGCATCCATCATGAAAACTGCGACTCTGTGTAATGCAAGC 1749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1979 GTTTTAATTGAAGGTGTCGATGCATCCATCATGAAAACTGCGACTCTGTGTAATGCAAGC 2038 Query 1750 TACGATGAAGATGTTTACATATTCCGGGCTCTCCAATTTAATACCCTCCCAGTAGTCAAG 1809 || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2039 TATGATGAAGATGTCTACATATTCCGGGCTCTCCAATTTAATACCCTCCCAGTAGTCAAG 2098 Query 1810 ACTGCAACTGAGCCTTTGAATCCTAGTGAGCTGCCTAAAATGGTGGAAGGGCTTAGGAAA 1869 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2099 ACTGCAACTGAGCCTTTGAATCCTAGTGAGCTGCCTAAAATGGTGGAAGGGCTTAGGAAA 2158 Query 1870 ATTAGCAAAAGCTATCCCCTTGCGATTACCAAAGTCGAGGAGTCTGGGGAACATACTATT 1929 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2159 ATTAGCAAAAGCTATCCCCTTGCGATTACCAAAGTTGAGGAGTCTGGGGAACATACTATT 2218 Query 1930 CTAGGCACTGGTGAGTTGTACTTGGATTCCATCATGAAGGACCTCAGGGAACTCTATTCA 1989 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2219 CTAGGCACAGGTGAGTTGTACTTGGATTCAATCATGAAGGACCTCAGGGAGCTCTATTCA 2278 Query 1990 GAGGTCGAAGTAAAGGTAGCAGATCCGGTGGTCTCCTTCTGTGAGACAGTAGTTGAATCT 2049 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2279 GAGGTCGAAGTAAAGGTTGCAGATCCGGTGGTCTCCTTCTGTGAGACAGTGGTTGAATCT 2338 Query 2050 TCGTCGATGAAGTGTTTTGCTGAGACACCAAACAAAAAGAACAAAATAACTATGATTGCA 2109 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2339 TCGTCGATGAAGTGTTTTGCTGAGACACCAAACAAAAAGAACAAAATAACTATGATTGCA 2398 Query 2110 GAGCCATTGGATAGAGGACTTGCAGAGGACATTGAGAATGGCGTTGTAAGCATTGACTGG 2169 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2399 GAGCCATTGGATAGAGGACTTGCAGAGGACATTGAGAATGGCGTTGTAAGCATTGACTGG 2458 Query 2170 AACAGAAAACAACTTGGTGACTTCTTCAGGACGAAATATGACTGGGATTTACTTGCTGCA 2229 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2459 AACAGAAAACAACTTGGTGACTTCTTCAGGACGAAATATGACTGGGATTTACTTGCTGCA 2518 Query 2230 CGTTCCATCTGGGCTTTTGGCCCTGACAAACAGGGGCCAAATATATTATTGGATGACACG 2289 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2519 CGTTCCATCTGGGCTTTTGGCCCTGACAAACAGGGGCCAAACATATTATTGGATGACACC 2578 Query 2290 CTTCCAACTGAGGTGGACAGGAACTTGATGATGGCAGTGAAAGACTCCATTGTTCAAGGG 2349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2579 CTTCCAACTGAGGTGGACAGGAACTTGATGATGGCAGTGAAAGACTCCATTGTTCAAGGG 2638 Query 2350 TTCCAGTGGGGTGCTCGTGAAGGTCCCCTCTGTGATGAGCCCATCAGAAATGTAAAGTTC 2409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2639 TTCCAGTGGGGTGCTCGTGAAGGTCCCCTCTGTGATGAGCCCATCAGAAATGTAAAGTTC 2698 Query 2410 AAGATTGTTGATGCAAGGATAGCACCAGAGCCGTTGCATAGAGGATCTGGTCAGATGATT 2469 ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2699 AAGATTGTTGATGCACGGATAGCACCAGAGCCATTGCATAGAGGATCTGGTCAGATGATT 2758 Query 2470 CCAACAGCAAGACGTGTTGCATATTCAGCCTTTCTTATGGCAACTCCAAGGCTAATGGAA 2529 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2759 CCAACAGCAAGACGTGTTGCATATTCAGCTTTTCTAATGGCAACTCCAAGGCTAATGGAA 2818 Query 2530 CCTGTCTACTATGTGGAGATACAAACGCCAATCGACTGTGTAACTGCAATCTACACAGTT 2589 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2819 CCTGTCTACTATGTGGAGATACAAACACCAATCGACTGTGTAACTGCAATCTACACAGTT 2878 Query 2590 TTGTCACGTAGACGTGGGCATGTCACATCTGATGTTCCTCAACCCGGTACTCCGGCTTAT 2649 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2879 TTGTCACGTAGACGTGGGCATGTCACATCTGATGTTCCTCAACCCGGTACTCCAGCTTAT 2938 Query 2650 ATTGTGAAGGCTTTTCTGCCTGTGATAGAGTCATTTGGGTTTGAGACAGATCTGAGGTAC 2709 || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2939 ATCGTGAAGGCCTTTCTGCCTGTGATAGAGTCCTTTGGGTTTGAGACAGATCTGAGGTAC 2998 Query 2710 CACACTCAGGGACAAGCCTTTTGCCTATCTGTGTTTGATCACTGGGCCATAGTGCCAGGA 2769 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2999 CACACTCAGGGACAAGCCTTTTGCCTATCTGTGTTTGATCACTGGGCCATTGTGCCAGGA 3058 Query 2770 GACCCTCTAGACAAAGCCATACAATTGCGCCCACTTGAGCCCGCCCCTATTCAGCATCTA 2829 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3059 GACCCTCTAGACAAAGCCATCCAGTTGCGCCCACTTGAGCCCGCTCCTATTCAGCATCTA 3118 Query 2830 GCTCGTGAATTCATGGTCAAGACCCGCCGTAGAAAGGGAATGAGCGAAGACGTCAGCGGG 2889 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3119 GCTCGGGAATTCATGGTCAAGACCCGCCGTAGAAAGGGAATGAGCGAAGACGTCAGCGGA 3178 Query 2890 AATAAATTCTTTGATGAAGCGATGATGGTAGAGCTTGCCCAGCAAACAGGCGATCTCCAT 2949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3179 AATAAATTCTTTGATGAAGCGATGATGGTAGAGCTTGCCCAGCAAACAGGCGATCTCCAT 3238 Query 2950 CTGCAGATGATTTGA 2964 ||||||||||||||| Sbjct 3239 CTGCAGATGATTTGA 3253 > AT5G25230.1 | Symbols: | Ribosomal protein S5/Elongation factor G/III/V family protein | chr5:8739709-8743594 FORWARD LENGTH=2922 Length=2922 Score = 4540 bits (2458), Expect = 0.0 Identities = 2708/2829 (96%), Gaps = 15/2829 (1%) Strand=Plus/Plus Query 142 CCTGGGGGTTCCAATGGCTGGATTACCACTATCAATGATGTTGAGATGGAGAACCAAATT 201 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | || | ||| Sbjct 103 CCTGGGGGTTCTAATGGCTGGATTACCACTATCAATGA----GA-A-CCA-AA--ATATT 153 Query 202 GTTCTTCCTGAGGATAAGAAGTACTACCCTACTGCTGAGGAGGTTTATGGTGAGGGTGTT 261 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct 154 GTTCTTCCTGAGGATAAGAAGTACTACCCTATTGCTAAGGAGGTTTATGGTGAGGATGTT 213 Query 262 GAGACCTTGGTTATGGATGAAGATGAGCAGCCTCTTGAGCAACCCATTATCAAACCTGTT 321 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 214 GAGACCTTGGTTATGGATGAAGATGAGCAGTCTCTTGAGCAACCCATTATCAAACCCGTT 273 Query 322 AGAGATATTAGATTTGAGGTGGGGG---TCAAGGATCAATCAAC--C-TATGTGTCTACA 375 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||| Sbjct 274 AGAGATATTAGATTTGAGGTGGGGGTCATCAAGGATCAAACAACAACGTATGTGTCAACA 333 Query 376 CAGTTTCTTATCGGCCTCATGTCTAATCCCGCGCTTGTGAGGAATGTTGCTCTCGTGGGG 435 | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 334 CTGTTTCTTATCGGCCTCATGTCTAATCCTGCGCTTGTGAGGAATGTTGCTCTTGTGGGG 393 Query 436 CATCTACAGCACGGCAAAACTGTCTTCATGGATATGTTGGTAGAGCAGACGCATCATATG 495 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 394 CATCTCCAGCACGGCAAAACTGTCTTCATGGATATGTTGGTAGAGCAGACGCATCGTATG 453 Query 496 TCTACTTTTAATACTAAAAACGAGAAGCATATGAAATATACAGACACAAGAGTCGATGAG 555 |||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| Sbjct 454 TCTACTTTTAATGCTGAAAACGACAAGCATATGAGATATACGGACACAAGAGTCGATGAG 513 Query 556 CAGGAGAGAAATATATCAATCAAGGCGGTTCCAATGTCTCTTGTCCTTGAGGACAGTAGA 615 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 514 CAGGAGAGAAATATATCTATCAAGGCGGTTCCAATGTCTCTTGTCCTTGAGGACAGTAGA 573 Query 616 TCCAAATCATACCTGTGCAATATCATGGATACCCCTGGACACGTCAATTTCTCTGACGAA 675 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 574 TCCAAATCATACCTGTGCAATATCATGGATACACCTGGAAATGTCAATTTCTCTGACGAA 633 Query 676 ATGACTGCTTCTTTAAGACTTGCTGATGGTGCTGTTCTGATTGTTGATGCTGCTGAAGGA 735 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| Sbjct 634 ATGACTGCTTCTTTAAGACTTGCTGATGGTGCTGTTTTCATTGTTGATGCTGCTCAAGGA 693 Query 736 GTGATGGTAAACACAGAGAGAGCTATACGGCATGCAATCCAGGACCGTCTCCCTATTGTT 795 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 694 GTCATGGTAAACACAGAGAGAGCTATACGGCATGCAATCCAGGATCATCTCCCTATTGTT 753 Query 796 GTTGTCATCAATAAGGTTGACAGGCTCATAACTGAGCTCAAACTACCTCCAAGGGATGCT 855 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 754 GTTGTGATCAATAAGGTTGACAGGCTCATAACTGAGCTCAAACTACCTCCAAGGGATGCT 813 Query 856 TACTACAAGCTGAGGCATACAATTGAAGTCATTAACAACCACATATCTGCTGCTTCAACA 915 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| Sbjct 814 TACTACAAGCTGAGGTATACAATTGAAGTCATTAATAACCATATATCTGCTGCTTCAACA 873 Query 916 ACTGCTGGAAACTTACCTCTTATAGACCCTGCAGCTGGAAATGTATGTTTTGCCAGTGGC 975 | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 874 AATGCTGCAGACTTACCTCTTATAGACCCTGCAGCTGGAAATGTATGTTTCGCCAGTGGT 933 Query 976 ACAGCCGGATGGTCGTTCACATTGCAATCTTTTTCTAAAATGTATGCCAAGCTTCATGGG 1035 |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 934 ACAGCCGGATGGTCCTTCACATTACAATCTTTTGCTAGAATGTATGCCAAGCTTCATGGT 993 Query 1036 GTGGCCATGGACGTGGATAAGTTTGCATCTCGACTTTGGGGAGATGTTTATTATCACCCT 1095 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 994 GTGGCCATGGACGTGGATAAGTTTGCATCTAGACTTTGGGGAGATGTATATTATCACCCT 1053 Query 1096 GATACTAGGGTATTCAAGAGAAGTCCTCCTGTAGGTGGTGGAGAAAGAGCATTTGTTCAG 1155 ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1054 GATACTAGGGTATTCAATACAAGTCCTCCAGTAGGTGGTGGAGAAAGAGCATTTGTTCAG 1113 Query 1156 TTTATTCTGGAGCCTCTGTACAAAATATACAGCCAAGTGATAGGTGAACATAAGAAGAGT 1215 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1114 TTTATTCTGGAGCCTCTATACAAGATATACAGCCAAGTGATAGGTGAACATAAGAAGAGT 1173 Query 1216 GTAGAGACAACCCTTGCAGAATTAGGAGTGACTCTGAGTAATAGTGCATATAAGCTGAAC 1275 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1174 GTAGAGACCACCCTTGCAGAATTAGGAGTGACTCTGAGTAATAGTGCATATAAGCTGAAC 1233 Query 1276 GTCAGACCTTTACTTAGGTTAGCCTGTAGTTCAGTTTTTGGTTCGGCATCAGGGTTCACT 1335 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1234 GTCAGACCTTTACTTAGGTTAGCCTGTAGTTCAGTGTTTGGTTCGGCATCAGGGTTCACT 1293 Query 1336 GATATGTTGGTAAAGCACATTCCTTCCCCCCGAGAGGCCGCAGCTAGGAAAGTCGACCAT 1395 |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct 1294 GATATGTTGGTAAAGCACATTCCTTCACCCAGAGAGGCTGCAGCTAGGAAAGTGGACCAT 1353 Query 1396 TCATACACTGGAACCAAAGATTCCCCCATTTATGAATCAATGGTAGAATGTGATCCATCT 1455 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1354 TCATACACTGGAACCAAAGATTCTCCCATTTATGAATCAATGGTAGAATGTGATCCATCT 1413 Query 1456 GGACCTCTCATGGTTAATGTGACAAAGTTGTACCCCAAATCAGATACTAGTGTTTTTGAT 1515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1414 GGACCTCTCATGGTTAATGTGACAAAGTTGTACCCCAAATCAGATACTAGTGTTTTTGAT 1473 Query 1516 GTGTTTGGAAGAGTTTATAGCGGTAGGCTTCAAACAGGGCAAAGCGTACGTGTACTAGGA 1575 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1474 GTGTTTGGAAGAGTTTATAGTGGTAGGCTTCAAACAGGGCAAAGCGTACGTGTACTAGGA 1533 Query 1576 GAAGGGTATTTACCTGAGGATGAGGAGGACATGACTATAAAAGAAGTGACGAAGCTATGG 1635 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1534 GAAGGGTATTCACCTGAGGATGAGGAGGACATGACTATAAAAGAAGTCACGAAGCTATGG 1593 Query 1636 ATATATCAAGCTAGGTATAGAATACCAGTAAGCAGTGCCCCTCCTGGTTCCTGGGTTTTA 1695 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 1594 ATATATCAAGCTAGGTATAGAATACCAGTAAGCAGTGCCCCTCCCGGTTCTTGGGTTTTA 1653 Query 1696 ATTGAAGGTGTCGATGCATCCATCATGAAAACTGCGACTCTGTGTAATGCAAGCTACGAT 1755 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| Sbjct 1654 ATTGAAGGTGTCGATGCATCCATCATGAAAACTGCAACTCTGTGTAATGCAAGTTATGAT 1713 Query 1756 GAAGATGTTTACATATTCCGGGCTCTCCAATTTAATACCCTCCCAGTAGTCAAGACTGCA 1815 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1714 GAAGATGTCTACATATTCCGGGCTCTCAAATTTAATACCCTCCCAGTAGTCAAGACTGCA 1773 Query 1816 ACTGAGCCTTTGAATCCTAGTGAGCTGCCTAAAATGGTGGAAGGGCTTAGGAAAATTAGC 1875 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1774 ACTGAGCCTTTGAATCCTAGTGAGCTGCCTAAAATGGTGGAAGGGCTTAGGAAAATTAGC 1833 Query 1876 AAAAGCTATCCCCTTGCGATTACCAAAGTCGAGGAGTCTGGGGAACATACTATTCTAGGC 1935 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1834 AAAAGCTATCCCCTTGCGATAACCAAAGTTGAGGAGTCTGGGGAACATACTATTCTAGGC 1893 Query 1936 ACTGGTGAGTTGTACTTGGATTCCATCATGAAGGACCTCAGGGAACTCTATTCAGAGGTC 1995 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1894 ACAGGTGAGTTGTACTTGGATTCCATCATCAAGGACCTCAGGGAACTCTATTCAGAGGTC 1953 Query 1996 GAAGTAAAGGTAGCAGATCCGGTGGTCTCCTTCTGTGAGACAGTAGTTGAATCTTCGTCG 2055 |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1954 CAAGTAAAGGTTGCAGATCCTGTGGTCTCCTTCTGTGAGACAGTGGTTGAATCTTCGTCA 2013 Query 2056 ATGAAGTGTTTTGCTGAGACACCAAACAAAAAGAACAAAATAACTATGATTGCAGAGCCA 2115 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2014 ATGAAGTGCTTTGCTGAGACACCAAACAAAAAGAACAAACTAACTATGATTGCAGAGCCA 2073 Query 2116 TTGGATAGAGGACTTGCAGAGGACATTGAGAATGGCGTTGTAAGCATTGACTGGAACAGA 2175 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2074 TTGGATAGAGGACTTGCAGAGGATATTGAGAATGGCGTTGTAAGCATTGACTGGAACAGA 2133 Query 2176 AAACAACTTGGTGACTTCTTCAGGACGAAATATGACTGGGATTTACTTGCTGCACGTTCC 2235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2134 GTACAACTTGGTGACTTCTTCAGGACGAAATATGACTGGGATTTACTTGCTGCACGTTCC 2193 Query 2236 ATCTGGGCTTTTGGCCCTGACAAACAGGGGCCAAATATATTATTGGATGACACGCTTCCA 2295 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2194 ATCTGGGCTTTTGGCCCTGACAAACAGGGGACAAACATATTATTGGATGACACCCTTCCA 2253 Query 2296 ACTGAGGTGGACAGGAACTTGATGATGGCAGTGAAAGACTCCATTGTTCAAGGGTTCCAG 2355 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2254 ACTGAGGTGGACAGGAACTTGATGATGGGAGTGAAAGACTCCATTGTTCAAGGGTTCCAG 2313 Query 2356 TGGGGTGCTCGTGAAGGTCCCCTCTGTGATGAGCCCATCAGAAATGTAAAGTTCAAGATT 2415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2314 TGGGGTGCTCGTGAAGGTCCCCTCTGTGATGAGCCCATCAGAAATGTAAAGTTCAAGATT 2373 Query 2416 GTTGATGCAAGGATAGCACCAGAGCCGTTGCATAGAGGATCTGGTCAGATGATTCCAACA 2475 ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2374 GTTGATGCACGGATAGCACCTGAGCCGTTGCATAGAGGATCTGGTCAGATGATTCCAACG 2433 Query 2476 GCAAGACGTGTTGCATATTCAGCCTTTCTTATGGCAACTCCAAGGCTAATGGAACCTGTC 2535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2434 GCAAGACGTGTTGCATATTCAGCCTTTCTTATGGCAACTCCAAGGCTAATGGAACCTGTC 2493 Query 2536 TACTATGTGGAGATACAAACGCCAATCGACTGTGTAACTGCAATCTACACAGTTTTGTCA 2595 |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2494 TACTATGTGGAGATACAAACACCAATAGACTGTGTAACTGCCATCTACACAGTTTTGTCA 2553 Query 2596 CGTAGACGTGGGCATGTCACATCTGATGTTCCTCAACCCGGTACTCCGGCTTATATTGTG 2655 |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 2554 CGTAGACGTGGGTATGTCACATCTGATGTTCCACAACCCGGTACTCCTGCTTATATCGTG 2613 Query 2656 AAGGCTTTTCTGCCTGTGATAGAGTCATTTGGGTTTGAGACAGATCTGAGGTACCACACT 2715 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2614 AAGGCTTTTCTGCCTGTGATAGAGTCGTTTGGGTTTGAGACAGATCTGAGGTACCACACT 2673 Query 2716 CAGGGACAAGCCTTTTGCCTATCTGTGTTTGATCACTGGGCCATAGTGCCAGGAGACCCT 2775 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| Sbjct 2674 CAGGGCCAAGCCTTTTGCCTATCTGTGTTTGATCATTGGGCCATAGTCCCTGGAGACCCT 2733 Query 2776 CTAGACAAAGCCATACAATTGCGCCCACTTGAGCCCGCCCCTATTCAGCATCTAGCTCGT 2835 |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2734 CTAGACAAAGCCATCCAATTGCGCCCACTTGAACCCGCCCCTATTCAGCATCTAGCTCGG 2793 Query 2836 GAATTCATGGTCAAGACCCGCCGTAGAAAGGGAATGAGCGAAGACGTCAGCGGGAATAAA 2895 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2794 GAATTCATGGTCAAGACCCGCCGTAGAAAGGGAATGAGCGAAGATGTCAGCGGGAATAAA 2853 Query 2896 TTCTTTGATGAAGCGATGATGGTAGAGCTTGCCCAGCAAACAGGCGATCTCCATCTGCAG 2955 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2854 TTCTTTGATGAAGCGATGATGGTAGAGCTTGCCCAGCAAACAGGCGATCTCCATCTGCAG 2913 Query 2956 ATGATTTGA 2964 ||||||||| Sbjct 2914 ATGATTTGA 2922 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 147340311591 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5