BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg470924
Length=4614
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G08600.3 | Symbols: ATRX | P-loop containing nucleoside trip... 7023 0.0
> AT1G08600.3 | Symbols: ATRX | P-loop containing nucleoside triphosphate
hydrolases superfamily protein | chr1:2723824-2733613
FORWARD LENGTH=4853
Length=4853
Score = 7023 bits (3803), Expect = 0.0
Identities = 4248/4460 (95%), Gaps = 41/4460 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 184 GAGCAAAAAGATGTACTGATGGAAGAAGACAACAATCAGGCTGAACAAAAAGATGAGGAG 243
|||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 391 GAGCAAAATGATGTACTGATGGAAGAAAACAACAATCAGGGTGAGCAAAAAGATGAGGAG 450
Query 244 ATGCAAGATACTTTTAGTAGATCTGAAAGTTCTGATTTCAATTCAGACGAAGATGAAC-A 302
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 451 ATGCAAGATGCTTCTAGTAGATCTGAAAGTTCTGACTTCAATTCAGATGAAGATGAACAA 510
Query 303 ATTCCTG-CCGGGGCGTGATGATGAGTTGGATTTTGAGAAACCTCTGAGCGAGGAAGAAA 361
||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 511 ATT-CTGTCC-CGGCGTGATGATGAGTTGGATCTTGAGAAACCTTTGAGCGAGGAAGAAA 568
Query 362 TAGAAGAGTTAATTTCAGATCTTCTGGGAGTTGAGAGCAAGGCTGCAGAAGCTCAAGAAG 421
|||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569 TAGATGAGTTAATTTCAGATCTTCTGGCAGTTGAGAGCAAGGCTGCAGAAGCTCAAGAAG 628
Query 422 CACTTGAAAAGGAGTCTCTTTCTAAGGTAGAGAGTGAAGTTAGGGAGGAATTAGCACAAG 481
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 629 CACTCGAAAAGGAGTCTCTTTCTAAAGTAGAGAGTGAAGTTAGGGAGGAATTAGCACAAG 688
Query 482 CACTCCGTGGTGATGAGTTGGATAAAGCTGTTGCTGCTGAAATGGTGACTTTTAAAGACG 541
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 689 CACTCCGTGGTGATGAGTTGGATGAAGCTGTTGCTGCTGAAATGATGACTTTTAAAGACG 748
Query 542 AATGGGAGGCAAATCTTGATGAGCTTGAAACAGAAAGTGC-ACACTTGTTGGAGCAACTT 600
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 749 AATGGGAGGCAACTCTTGATGAGCTTGAAACAGAAAGTGCAAC-CTTGTTGGAGCAACTT 807
Query 601 GATGGTGCTGGAATCGAGCTTCCAAAATTGTACGAAATGATAGAAAGTCAAGCCCCTAAT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 GATGGTGCTGGAATCGAGCTTCCAAAATTGTACGAAATGATAGAAAGTCAAGCCCCTAAT 867
Query 661 GGTTGCTATACTGAAGCTTGGAAACAAAGAGCCCACTGGGTTGGTACTCAGGTGACAAAA 720
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 868 GGTTGCTACACTGAAGCTTGGAAGCAAAGAGCCCATTGGGTTGGTACTCAGGTGACAAAA 927
Query 721 GAAACTGGGGAATCATTAGCTAACGCTGAGAGGTTTCTTCAAACTCATCGGCCTGTCCGA 780
||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 928 GAAACTGTGGAATCATTGGCTAACGCTGAGAGGTTTCTGCACACTCATCGGCCTGTCCGA 987
Query 781 AAACGACATGGAAAACTTTTGGAGGAGGGAGCTAGTGGTTTTCTGGa-aaaaaaGTTAGC 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||
Sbjct 988 AAACGACATGGAAAACTTTTGGAGGAGGGAGCTAGTGGTTTTCTGGAGAAAAAA-CTCGC 1046
Query 840 TGATGGTGATGTTAAAGAATCTCTAGCTGGAACATCTGAGCTTGAGTGGTCGTCTCTAAA 899
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1047 TGATGGTGCTGTTAAAGAATCTCTAGCTGGAACATCTGAGCTTGACTGGTCGTCTCTAAA 1106
Query 900 CAAAGTGTTTTCGGAAAAAAGGGACGAGTC-GATTTCCTTTGGTAGTAAGCATTGGGCTT 958
|||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1107 CAAAGTGTTTTCGGAAAAAAGGGATGAGTCTG-TTTCCTTTGGTAGTAAGCAGTGGGCTT 1165
Query 959 CTGTTTACTTGGCAAGCACTCCACACCAAGCTGCAGCCATGGGATTAGAATTTCCAGGAG 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 CTGTTTACTTGGCAAGCACTCCACACCAAGCTGCAGCCATGGGATTAGAATTTCCAGGAG 1225
Query 1019 TCAACGAGGTGGAGGAAATTGAAGAGATTGATGCAAGCTTGGCAGACCCATTTTTAGCTG 1078
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1226 TCAATGAGGTGGAGGAAATTGAAGAGATTGATGCAAGCTTAGCAGACCCATTTTTAGCTG 1285
Query 1079 ATGCAATTGACAACGAACGAGAACTTGCCCTTACTGAAGAACAAAAGACAAATTATATAA 1138
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1286 ATGCAATTGACAACGAAAGAGAACTTGCCCTTACTGAAGAACAAAAGACAAATTATATAA 1345
Query 1139 GGGTCAAAGAAGAGGATGATATAAATTGTGATCGTGAACTTCAACTTCGTTTGAAACGGA 1198
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1346 GGGTCAAAGAAGAGGATGATATAACTTGTGATCGTGTACTTCAACTTCGTTTGAAACGGA 1405
Query 1199 AGAGACGCAAGAAAAGATCTAAACAGGTTATCAGGTGTGCTGCAGAGAATATGGATGACG 1258
| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 1406 AAAGACGCAAGAAAAGATCTAAACAGGTTATTAGGTGTGCGGCAGAGAATATGGATGATG 1465
Query 1259 ATTCTGTGTATTTGGATGGGAATTATATTGCCCCAAATTTGGCCAATGATCAAGTGAAAA 1318
||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 1466 ATTCTGTGTATTTGGATGGGAATAATACTACCCCAAATTTTGCCAAAGATCAAGTGAAAA 1525
Query 1319 GTCCGGAGACTAGCACTCAAGTTCATAATAATGAAGTCAACAAAGAGGGAAACGGGAATT 1378
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1526 GTCCGGAGACTAGCACTCAAGTTCATAATAGTGAAGTCAACATAGAGGAAAACGGGAATT 1585
Query 1379 TGTCTAATTCAGATGTAGATAAGATGGTCTCCAGCCCAAATATAAATGTAGATACCATGA 1438
| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||| ||| ||
Sbjct 1586 TTTCTAATTCAGATGTAGATAAGATGACCCCCAGCACACATATTAATGTAGATGCCAAGA 1645
Query 1439 GAGATGATTCACAGAATCCAGCAAACAGTTTTATGTGTACTGCCTGTAATAATGTAGCTG 1498
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1646 GAGATGATTCACAGAATCCAGCAAACAATTTTAGGTGTACTGCCTGTAATAAAGTAGCTG 1705
Query 1499 TGGAAGTGCATAGTCATCCCCTTTTAGAAGTAATAGTTTGCATGGATTGCAAACGTTCAA 1558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1706 TGGAAGTGCATAGTCATCCCCTTTTAGAAGTAATAGTTTGCATGGATTGCAAACGTTCAA 1765
Query 1559 TTGAAGATAGAGTTTCTAAGGTTGATGACTCTTTGGAACGTCATTGTGAATGGTGTGGTC 1618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766 TTGAAGATAGAGTTTCTAAGGTTGATGACTCTTTGGAACGTCATTGTGAATGGTGTGGTC 1825
Query 1619 ATATTGCTGACTTAATAGATTGTAGGACATGCGAAAAACTTTTCTGTGCATCATGTATAA 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1826 ATATTGCTGACTTAATAGATTGTAGGACATGCGAAAAACTTTTCTGTGCATCATGTATAA 1885
Query 1679 AGAGGAATATTGGTGAAGAATACTTGGCTGAAGCTCAATCCTCTGGCTGGGATTGTTGTT 1738
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1886 AGAGGAATATTGGTGAAGAATACATGTCTGAAGCTCAATCCTCTGGTTGGGATTGTTGTT 1945
Query 1739 GTTGCTCTCCAATTCCCTTGCAAAGATTGACACTGGAACTGGAGAAAGCCATGAGAGATA 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1946 GTTGCTCTCCAATTCCCTTGCAAAGATTGACACTGGAACTGGAGAAAGCTATGAGAGATA 2005
Query 1799 AAAAGTCAATAGAATCGAGCTCTGATTCGAGTTCTGATTCCAGCTCTGATAACAATTCTG 1858
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2006 AAAAGTCAATAGAATTGAGCTCTGATTCGAGTTCTGATTCCAGCTCTGATAACAATTCTG 2065
Query 1859 TTGATACAGATGCTGATGTCAATGTAACAATCAGCTCAAAGAAGAAATCGAAAAAGAAAA 1918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2066 TTGATACAGATGCTGATGTCAATGTAACAATCAGCTCAAAGAAGAAATCGAAAAAGAAAA 2125
Query 1919 TTCGGCGGATAATCGATGACGCTGAACTAGGGAAAGATACGAGAACAAAAATTGCAATTG 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2126 TTCGGCGGATAATCGATGACGCTGAACTAGGGAAAGATACGAGAACAAAGATTGCAATCG 2185
Query 1979 AAAAGGCACGACAGGAGCGCCTTAGGTCCTTGCAGTTTTCTGCCAGATACAAAACAATTA 2038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2186 AAAAGGCACGACAGGAGCGCCTTAGGTCCTTGCAGTTTTCTGCCAGATACAAAACAATTA 2245
Query 2039 GCTCTATGGGAGACGTGAAATCTATTCCAGAAGGTGCGGAAGTTGAGGTTCTTGGTGATG 2098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2246 GCTCTATGGGAGACGTGAAATCTATTCCAGAAGGTGCGGAAGTTGAGGTTCTTGGTGATG 2305
Query 2099 CTCACAGTGGTTACATAGTGAATGTGGTTAGGGAGATTGGTGAAGAAGCTGTGAGAGTTC 2158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2306 CTCACAGTGGTTACATAGTGAATGTGGTTAGGGAGATTGGTGAAGAAGCTGTGAGGGTTC 2365
Query 2159 CTCGTAGCATATCTGCCAAACTAAAAGTCCATCAGGTAACAGGGATAAGATTTATGTGGG 2218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 CTCGTAGCATATCTGCCAAACTAAAAGTCCATCAGGTAACAGGGATAAGATTTATGTGGG 2425
Query 2219 AAAATATTATACAGTCTATCAGCAGAGTGAAGTCTGGTGATAAAGGTCTTGGGTGCATTC 2278
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2426 AAAATATTATTCAGTCTATCAGCAGAGTCAAGTCTGGTGATAAAGGTCTTGGTTGCATTC 2485
Query 2279 TAGCACATACAATGGGCCTGGGCAAAACTTTTCAGGTTATAGCGTTCCTGTACACTGCAA 2338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 2486 TAGCACATACAATGGGCCTGGGCAAAACTTTTCAGGTTATAGCATTCCTGTACACCGCAA 2545
Query 2339 TGAGATGTGTTGATTT-GGGATTGAAAACTGCTCTTATCGTGACTCCTGTAAATGTGTTG 2397
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2546 TGAGATGTGTTGATTTAGGG-TTGAAAACTGCTCTTATTGTGACTCCTGTAAATGTGTTG 2604
Query 2398 CACAATTGGCGAAGTGAGTTTGTGAAGTGGGGGCCTTCAGAAGTGAAACCACTTCGCATC 2457
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2605 CACAATTGGCGAAGTGAGTTTGAGAAGTGGATGCCTTCAGAAGTGAAACCGCTTCGCATT 2664
Query 2458 TTCATGATTGAAGACGTTTCAAGGGAGAGGAGATTGGACTTGTTAACAAAGTGGCGAAAT 2517
|| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||
Sbjct 2665 TTTATGCTTGGAGATGTTTCAAGGGAGAGAAGATTTGATTTGCTAACAAAGTGGCGAAAG 2724
Query 2518 AAGGGTGGAGTCTTTTTGATTGGATATACAAAATTTAGAAACCTGTCTCTTGGGACGGGG 2577
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2725 AAGGGTGGAGTCTTTTTGATGGGATATACAAATTTTAGAAACCTGTCTCTTGGGAGGGGG 2784
Query 2578 GTGAAGGACTTAAGTGCTGCCAGAGAGATCTGTAAGGCCTTGAGGGATGGACCTGATATA 2637
||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2785 GTGAAGGACTTAAATGCGGCCAGAGGGATCTGTAATGCCTTGAGGGATGGACCTGATATA 2844
Query 2638 CTTGTTTGCGACGAGGCTCACATCATTAAGAACACCAGGGCTGACACAACACAAGCATTG 2697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 2845 CTTGTTTGCGACGAGGCTCACATCATTAAGAACACCAAGGCTGACACAACGCAAGCATTG 2904
Query 2698 AAGCAAGTTAAATGCCAGAGAAGAATTGCCTTAACTGGCTCACCCCTTCAAAACAATCTT 2757
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2905 AAGCAAGTTAAATGCCAGAGAAGAATTGCCTTAACTGGCTCACCCCTTCAAAACAATCTC 2964
Query 2758 ATGGAGTATTATTGTATGGTTGATTTTGTGAGAGAAGGATTCTTGGGAAGTAGCCCTGAG 2817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2965 ATGGAGTATTATTGTATGGTTGATTTTGTGAGAGAAGGATTCTTGGGAAGTAGCCCTGAG 3024
Query 2818 TTTAGAAACCGATTCCAAAATCCAATAGAAAACGGACAGCATATGAATTCAACTGCGGAG 2877
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3025 TTTAGAAACCGCTTCCAAAATCCAATAGAAAACGGACAGCATATGAATTCAACTGCGGAG 3084
Query 2878 GATGTAAAAATTATGAACCAGAGGTCACACATTCTGTATGAGCAATTGAAAGGTTTTGTG 2937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3085 GATGTAAAAATTATGAACCAGAGGTCACACATTCTGTATGAGCAATTGAAAGGTTTTGTG 3144
Query 2938 CAACGAATGGATATGAATGTGGTGAAAAAGGATCTGCCACCTAAAACAGTCTTCGTAATA 2997
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3145 CAAAGAATGGATATGAATGTGGTGAAAAAGGATCTGCCACCTAAAACAGTCTTCGTAATA 3204
Query 2998 TCTGTCAAGCTATCTCCCTTGCAACGGAAATTGTATAAGAGATTTCTTAAGCTTTATGGG 3057
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3205 TCTGTCAAGCTATCTCCCTTGCAACGGATATTGTATCAGAGATTTCTTGAGCTTTATGGG 3264
Query 3058 TTCAGCGATGGAAGAACAGATGAAAGGATGAGAAAAAACTTTTTTGCTGCCTACCAGGTC 3117
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3265 TTCAGCGATGGAAGAACAGATGAAAGGATGAGAAAAAACTTTTTTGCTGCTTACCAGGTC 3324
Query 3118 TTGGCTCAGATTTTGAATCATCCAGGGATTCCGCAATTAAGAAGTGAAGATAGCAAGAAT 3177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3325 TTGGCTCAGATTTTGAATCATCCAGGGATTCCGCAATTAAGAAGTGAAGATAGCAAGAAT 3384
Query 3178 GGGCGCCGTGGTAGCATTGTTGATATTCCAGATGACTGTTCAAGTGATGAAAATATAGAT 3237
|| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3385 GGTCGTCGTGGTAGCATTGTTGATATTCCAGATGACTGTTCAAGTGATGAAAATATAGAC 3444
Query 3238 TACAACATGGTTACAGGAGAAAAACAGAGAACTATGAATGATTTGCAGGATAAAGTTGAT 3297
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3445 TACAACATGGTTACAGGAGAGAAACAGAGAACTATGAATGATCTGCAGGATAAAGTTGAT 3504
Query 3298 GGATACCTCCAGAAGGATTGGTGGGTCGACCTACTTCaaaaaaaTAATTATAAGGTGTCG 3357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3505 GGATACCTCCAGAAGGATTGGTGGGTCGACCTACTTCAAAAAAATAATTATAAGGTGTCG 3564
Query 3358 GACTTTAGTGGCAAAATGATTCTGCTATTGGATATTTTATCCATGAGTGCTGATGTGGGG 3417
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3565 GACTTCAGTGGCAAAATGATTCTGCTATTGGATATTTTATCTATGAGTGCTGATGTGGGG 3624
Query 3418 GATAAAGCGCTTGTGTTTAGCCAGAGTATCCCGACATTGGATCTCATAGAACTTTATCTT 3477
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3625 GATAAGGCGCTTGTGTTTAGCCAGAGTATCCCGACATTGGATCTCATAGAACTTTATCTT 3684
Query 3478 TCAAGAGTACCTCGGCATGGGAAACAAGGAAAGTTCTGGAAAAAGGGAAAAGACTGGTAT 3537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3685 TCAAGAGTACCTCGGCATGGGAAACAAGGAAAGTTCTGGAAAAAGGGGAAAGACTGGTAT 3744
Query 3538 AGAATTGATGGAAAAACTGAAAGCTCAGAACGCCAGAAGTTGGTTGATAGGTTTAATGAG 3597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3745 AGAATTGATGGAAAAACTGAAAGCTCAGAACGCCAGAAGTTGGTTGATAGGTTTAATGAG 3804
Query 3598 CCTGACAACAAAAGGGTGAAATGTACACTAATTTCAACCAGAGCGGGATCCCTTGGAATT 3657
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3805 CCTGACAACAAAAGAGTGAAATGTACACTAATTTCAACCAGAGCGGGATCCCTTGGAATT 3864
Query 3658 AATCTTTATGCTGCTAACCGTGTGATCATTGTTGATGGTTCATGGAATCCAACCTATGAT 3717
|| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3865 AACCTTTATGCTGCTAACCGTGTGATCATCGTCGATGGTTCATGGAATCCAACCTATGAT 3924
Query 3718 CTTCAAGCTATATTTCGAGCTTGGAGGTATGGCCAAAAGAAGCCAGTATTTGCGTACAGA 3777
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3925 CTTCAAGCTATATTTCGAGCTTGGAGGTATGGCCAAAAGAAGCCCGTATTTGCGTACAGA 3984
Query 3778 TTGATGGCACGTGGGACTATTGAAGAAAAAATATATAAACGTCAGGTAACCAAGGAAGGG 3837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3985 TTGATGGCACGTGGGACTATTGAAGAAAAAATATATAAACGTCAGGTAACCAAGGAAGGG 4044
Query 3838 CTAGCTGCGAGAGTAGTGGATAGACAACAAGTGCACAGGACTATCTCCAAAGAAGAGATG 3897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4045 CTAGCTGCGAGAGTAGTGGATAGACAACAAGTGCACAGGACTATCTCCAAAGAAGAGATG 4104
Query 3898 TTGCATCTTTTTGAATTTGACGATGATGATGAGAAATCCGACGCGGTAACTGAGATAAGC 3957
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||
Sbjct 4105 TTACATCTTTTTGAATTTGACGATGATGATGAAAAATCTGAAGCCGTAACTGAGATAAGC 4164
Query 3958 AAGCAAAATGAAGCGGCACAAAGCAATCTGGTGGAT-AATTCA--CA-GAA-ACA--GAA 4010
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || | | ||| |||
Sbjct 4165 AAGCAAAATGAAGCGGGACATAGCAATCTGGTGGAGCAAG-CAATCTTGTGGACAAAGAA 4223
Query 4011 GGCCACTTTATCTCGTGTTGGTTGCGACAAATTGATGGAGAACTTACTACAGAGACATGG 4070
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4224 GGCCACTTTATCTCGTGTTGGTGGCGACAAATTGATGGAGAACTTACTACAGAGACACGG 4283
Query 4071 CCCGAACTGGATTTCCAGTTTCCATGAGCACGAGACATTGCTACAAGAGAATGAAGAAGA 4130
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4284 CCCCAACTGGATTTCCAGTTTCCATGAGCACGAGACATTGCTACAAGAGAATGAAGAAGA 4343
Query 4131 AAGACTGACAAAGGAAGAAAAAGACATGGCCTGGGAAGTTTACAGGAGAGCGCTTGAGTG 4190
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 4344 AAGACTGACAAAGGAAGAAAAAGACATGGCCTGGGAAGTTTATAGGAGAGCACTTGAGTG 4403
Query 4191 GGAGGAAGTTCAACGTGTCCCACTGAGCGAATCTCCAGTGGTTCCAAAACCTTCTCCTTC 4250
||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4404 GGAGGAAGTTCAACGGGTCCCATTCAGTGAATCTCCAGTGGTTCCAAAACCTTCTCCTTC 4463
Query 4251 CATACAAACAGAACCCTTACCCCAGCCAAAGGGGTTCAACAGAAGTCGTTTTGTGAACCG 4310
|| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 4464 CACACAAACAGAGCCCTTGCCCCAGCCAAAGGGGTTCAACAGGAGTCGTTTTGTAAACCG 4523
Query 4311 CAACTGCACTAGAACCGCGCACCAGCTTACACTCATAAGCCAAGGAAGAAAAGTTGGTAG 4370
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||
Sbjct 4524 CAACTGCACTAGAATCGCGCACCAGCTTACACTCATAAGCCAAGGATTAAAAGTCGGCAG 4583
Query 4371 CAGCACGGTCTGTGGGGAGTGTGGGCGCGTCTTAAGGTGGGAAGATGTTATACCCGCATC 4430
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4584 CAGCACAGTCTGTGGGGAGTGTGGGCGCGTCATAAGGTGGGAAGATGTTATACCCGCATC 4643
Query 4431 CAAACTTTCAGCGGTAAAC-TAAA-TAGTATATGAACATTGCAAAATTGGTGAGTTCATT 4488
||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 4644 CAAACTTTCAGCGGTAATTGTAAACTAA-ATA-GAACATTGCAAAAATGTTGAGTTCATT 4701
Query 4489 TTTCCTT-TTTaaaaaaa--a-aTCTGAGACTGAAA---AT---A---GTAACATTTGAG 4535
||||||| ||| ||| | | | |||| || ||| || | |||||||||||
Sbjct 4702 TTTCCTTCTTTTAAATTATGAGA-CTGA-ACCAAAATTTATGGGAATAGTAACATTTGAA 4759
Query 4536 ACTCCCTTTAGATTAT-TGATGAGTTAGATTATAAATCAGGGCGTTTGTTAGGGGCATGT 4594
|||||||| |||||| || ||||||| | | ||| |||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 4760 ACTCCCTTCAGATTAGATG-TGAGTTATAATGTAACTCAGGGCGTTTGGTAGGAGCATGT 4818
Query 4595 TGAAATTTGTAATGGCACCT 4614
|||||||||||||| |||||
Sbjct 4819 TGAAATTTGTAATGACACCT 4838
Score = 191 bits (103), Expect = 6e-47
Identities = 168/197 (85%), Gaps = 13/197 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 8 TGAA-GGAAAAAGATGAAGTGCTAGAGGAAAAGGAGGATACTGTCGAGGCAAAAGAGGAT 66
|||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||| ||| |||||||||||
Sbjct 254 TGAAGGGAAAAA-TTGAAAAGCTAGAGGGAAAGGAGGTTATTGTGGAGTCAAAAGAGGAT 312
Query 67 GAGATGGATATAATAATAGCTGAAGAAAGA-ATGGAGGC--CA-AGCTTG-AA--GAGGT 119
|||||||||||||||||| ||||||| | | ||| || | || | || |||||
Sbjct 313 GAGATGGATATAATAATA---GAAGAAA-ATAGGGAAGCAGAACAGGAGGTAATGGAGGT 368
Query 120 GAAAGCAAGAGATGAAAGAGGGGAGCAAAATGATGTACTGATGGAAGAAAACAACAATCA 179
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 GAAAGCAAGAGATGGAAGAGGGGAGCAAAATGATGTACTGATGGAAGAAAACAACAATCA 428
Query 180 GGCTGAGCAAAAAGATG 196
|| ||||||||||||||
Sbjct 429 GGGTGAGCAAAAAGATG 445
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 230115767541
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5