BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg471053
Length=3795
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G09570.1 | Symbols: PHYA, FHY2, FRE1, HY8 | phytochrome A | ... 6268 0.0
> AT1G09570.1 | Symbols: PHYA, FHY2, FRE1, HY8 | phytochrome A
| chr1:3095256-3100357 REVERSE LENGTH=3829
Length=3829
Score = 6268 bits (3394), Expect = 0.0
Identities = 3677/3812 (96%), Gaps = 25/3812 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGGCATGCGTATTCGGGGTGGTCCCATTCATCGTCGTCGTCGTCTGTGTTAGGGAGCAC 60
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TGGGCATACGTATTCGGGGTGGTCCCATTCA---TCGTCGTCGTCTGTGTTAGGGAGCAC 57
Query 61 AAATAATAGAGAGGCGTAGCAGAAGAGAGAAGGCGGTGATCGAGGTCAAGATTTAG---- 116
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 58 AAATAATAGAGAGGCGTAGCACAAGAGAGAAGGTGGTGATCGAGGCCAAGATTTAGAATT 117
Query 117 -----------AAAA-CCTCTGAAGAGTGTGACTAGACACGAGATCTGATCATGGcttct 164
|||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 118 TAACTATAACAAAAAGCCTCTGACGAGTGTGACTAGTCACAAGATCTGATCATGGCTTCT 177
Query 165 tgaaacttcttcttcttctttcttcttctcttTAAAGGaaaaaaaTGTCAGGGTCTAGGC 224
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 178 TGAAACTTCTTCTTCTTC--T-TTCTTCTCTTTAAAGGAAAAAAATGTCAGGCTCTAGGC 234
Query 225 CGACTCAGTCCTCTGAGGGCTCGAGGCGATCAAGGCACAGCGCTAGGATCATTGCGCAGA 284
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 CGACTCAGTCCTCTGAGGGCTCAAGGCGATCAAGGCACAGCGCTAGGATCATTGCGCAGA 294
Query 285 CCACTGTAGATGCGAAGCTCCATGCTGATTTTGAGGAGTCAGGCAGCTCCTTTGATTACT 344
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 CCACTGTAGATGCGAAACTCCATGCTGATTTTGAGGAGTCAGGCAGCTCCTTTGATTACT 354
Query 345 CAACCTCAGTGCATGTCACTGGCCCGGGCGTGGAGAACCAGCCACCGAGGTCTGACAAGG 404
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |
Sbjct 355 CAACCTCAGTGCGTGTCACTGGCCCGGTTGTGGAGAATCAGCCACCAAGGTCTGACAAAG 414
Query 405 TTACCACGACTTATCTTCATCACATACAGAAGGGAAAGCTGATTCAGCCCTTCGGTTGTT 464
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415 TTACCACGACTTATCTTCATCATATACAGAAGGGAAAGCTGATTCAGCCCTTCGGTTGTT 474
Query 465 TGCTTGCCTTGGATGAGAAGACCTTCAAAGTCATTGCATACAGCGAGAATGCATCTGAGC 524
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 475 TACTTGCCTTGGATGAGAAGACCTTCAAAGTTATTGCATACAGCGAGAATGCATCTGAGC 534
Query 525 TGTTGACAATGGCCAGTCATGCAGTTCCTAGTGTTGGTGAACACCCTGTTCTAGGCATTG 584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 TGTTGACAATGGCCAGTCATGCAGTTCCTAGTGTTGGCGAACACCCTGTTCTAGGCATTG 594
Query 585 GGACAGATATAAGGAGTCTTTTCACTGCTCCTAGTGCCTCTGCATTGCAGAAAGCCCTTG 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 GGACAGATATAAGGAGTCTTTTCACTGCTCCTAGTGCGTCTGCATTGCAGAAAGCCCTTG 654
Query 645 GATTTGGAGATGTCTCTCTTTTGAATCCCATTCTTGTGCACTGCAAGACTTCTGCCAAGC 704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 655 GATTTGGAGATGTCTCTCTTTTGAATCCCATTCTTGTGCACTGCAGGACTTCTGCAAAGC 714
Query 705 CCTTTTATGCGATTATCCACCGGGTTACAGGGAGCATCATCGTCGACTTTGAACCGGTGA 764
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 715 CCTTTTATGCGATTATCCACAGGGTTACAGGGAGCATCATCATCGACTTTGAACCCGTGA 774
Query 765 AGCCTTATGAAGTCCCCATGACAGCTGCTGGTGCCTTACAATCATACAAGCTCGCTGCCA 824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 AGCCTTATGAAGTCCCCATGACAGCTGCTGGTGCCTTACAATCATACAAGCTCGCTGCCA 834
Query 825 AAGCAATCACTAGGTTGCAATCTTTACCCAGCGGGAGCATGGAAAGGCTTTGCGATACAA 884
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 835 AAGCAATCACTAGGCTGCAATCTTTACCCAGCGGGAGTATGGAAAGGCTTTGTGATACAA 894
Query 885 TGGTTCAAGAGGTTTTTGAACTCACGGGGTATGACAGGGTGATGGCTTATAAGTTTCATG 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 TGGTTCAAGAGGTTTTTGAACTCACGGGGTATGACAGGGTGATGGCTTATAAGTTTCATG 954
Query 945 AAGATGATCACGGTGAGGTTGTCTCCGAGGTTACAAAACCTGGGCTGGAGCCTTATCTTG 1004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 AAGATGATCACGGTGAGGTTGTCTCCGAGGTTACAAAACCTGGGCTGGAGCCTTATCTTG 1014
Query 1005 GGCTGCATTATCCAGCCACCGACATCCCTCAAGCAGCCCGTTTTCTGTTTATGAAGAACA 1064
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 GGCTGCATTATCCTGCCACCGACATCCCTCAAGCAGCCCGTTTTCTGTTTATGAAGAACA 1074
Query 1065 AGGTCCGGATGATAGTTGATTGCAATGCAAAACATGCTAGGGTGCTTCAAGATGAAAAGC 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 AGGTCCGGATGATAGTTGATTGCAATGCAAAACATGCTAGGGTGCTTCAAGATGAAAAGC 1134
Query 1125 TTTCCTTTGACCTTACCTTGTGTGGCTCCACCCTTAGAGCACCGCACAGCTGCCATTTGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 TTTCCTTTGACCTTACCTTGTGTGGCTCCACCCTTAGAGCACCGCACAGCTGCCATTTGC 1194
Query 1185 AGTACATGGCCAACATGGATTCAATTGCATCTCTGGTTATGGCGGTTGTAGTTAACGAGG 1244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 AGTACATGGCCAACATGGATTCAATTGCATCTCTGGTTATGGCGGTTGTAGTTAACGAGG 1254
Query 1245 AAGATGGAGAAGGGGATGCTCCTGATTCTACTACACAGCCTCAAAAGAGAAAGAGACTAT 1304
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 AAGATGGAGAAGGGGATGCTCCTGATGCTACTACACAGCCTCAAAAGAGAAAGAGACTAT 1314
Query 1305 GGGGTTTAGTGGTTTGTCACAACACAACTCCGAGGTTTGTTCCATTTCCTCTCAGGTATG 1364
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 GGGGTTTAGTGGTTTGTCACAATACGACTCCGAGGTTTGTTCCATTTCCTCTCAGGTATG 1374
Query 1365 CCTGTGAGTTTCTAGCTCAAGTGTTTGCCATACACGTCAATAAGGAGGTGGAACTGGAGA 1424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 1375 CCTGTGAGTTTCTAGCTCAAGTGTTTGCCATACACGTCAATAAGGAGGTGGAACTCGATA 1434
Query 1425 ACCAGATGGTGGAGAAGAACATTTTGCGTACGCAGACACTCTTGTGTGATATGCTGATGC 1484
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1435 ACCAGATGGTGGAGAAGAACATTTTGCGCACGCAGACACTCTTGTGCGATATGCTGATGC 1494
Query 1485 GTGATGCTCCACTTGGTATTGTGTCGCAAAGCCCCAACATAATGGACCTTGTGAAATGTG 1544
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 GTGATGCTCCACTGGGTATTGTGTCGCAAAGCCCCAACATAATGGACCTTGTGAAATGTG 1554
Query 1545 ATGGAGCAGCTCTCTTGTATAAAGACAAGATATGGAAACTGGGAACAACTCCAAGTGAGT 1604
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATGGAGCAGCTCTCTTGTATAAAGACAAGATATGGAAACTGGGAACAACTCCAAGTGAGT 1614
Query 1605 TCCATCTGCAGGAGATAGCTTCATGGTTGTGTGAATACCACTTGGATTCAACGGGTTTGA 1664
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1615 TCCACCTGCAGGAGATAGCTTCATGGTTGTGTGAATACCACATGGATTCAACGGGTTTGA 1674
Query 1665 GCACTGATAGTTTGCATGACGCTGGGTTTCCTAAGGCTCTATCTCTCGGGGATTCGGTAT 1724
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 GCACTGATAGTTTGCATGACGCCGGGTTTCCTAGGGCTCTATCTCTCGGGGATTCGGTAT 1734
Query 1725 GTGGAATGGCGGCTGTGAGGATATCATCCAAAGACATGATTTTCTGGTTCCGTTCTCATA 1784
|||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1735 GTGGGATGGCAGCTGTGAGGATATCATCGAAAGACATGATTTTCTGGTTCCGTTCTCATA 1794
Query 1785 CTGCTGGTGAAGTGAGATGGGGAGGTGCAAAGCATGATCCAGATGATAGGGATGATGCAA 1844
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 CCGCTGGTGAAGTGAGATGGGGAGGTGCGAAGCATGATCCAGATGATAGGGATGATGCAA 1854
Query 1845 GGAGAATGCACCCGAGGTCATCGTTCAAGGCTTTCCTTGAAGTGGTCAAGACAAGGAGTT 1904
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 GGAGAATGCACCCAAGGTCATCGTTCAAGGCTTTCCTTGAAGTGGTCAAGACAAGGAGTT 1914
Query 1905 TACCTTGGAAGGACTATGAGATGGATGCCATTCACTCCTTGCAACTTATTCTGAGGAATG 1964
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1915 TACCTTGGAAGGACTATGAGATGGATGCCATACACTCCTTGCAACTTATTTTGAGGAATG 1974
Query 1965 CTTTCAAGGATGGTGAAACTACTGATGTGAATACAAATGTCATTCACTCAAAGCTAAATG 2024
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||
Sbjct 1975 CTTTCAAGGATAGTGAAACTACTGATGTGAATACAAAGGTCATTTACTCGAAGCTAAATG 2034
Query 2025 ATCTAAAAATTGATGGTATACAAGAATTAGAAGCTGTGACCAGTGAGATGGTTCGTTTGA 2084
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2035 ATCTCAAAATTGATGGTATACAAGAACTAGAAGCTGTGACCAGTGAGATGGTTCGTTTAA 2094
Query 2085 TTGAGACTGCTACGGTGCCAATATTGGCGGTTGATTCTGATGGATTGGTTAATGGTTGGA 2144
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2095 TTGAGACTGCTACGGTGCCAATATTGGCGGTTGATTCTGATGGACTGGTTAATGGTTGGA 2154
Query 2145 ACACGAAAATTGCTGAGCTGACTGGTCTTACGGTTGATGAAGCAATCGGGAAGCATCTCC 2204
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2155 ACACGAAAATTGCTGAGCTGACTGGTCTTTCGGTTGATGAAGCAATCGGGAAGCATTTCC 2214
Query 2205 TCACACTTGTTGAAGATTCTTCAGTAGAAATCGTCAAAAGGATGCTAGAGAATGCATTAG 2264
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2215 TCACACTTGTTGAAGATTCTTCAGTGGAAATCGTTAAAAGGATGCTAGAGAACGCATTAG 2274
Query 2265 AAGGAACTGAAGAGCAGAATGTCCAATTTGAGATCAAGACACATCTGTCCAGGGCTGATG 2324
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2275 AAGGAACTGAGGAGCAGAATGTCCAGTTTGAGATCAAGACACATCTGTCCAGGGCTGATG 2334
Query 2325 CTGGGCCAATAAGTTTAGTTGTAAATGCATGCGCAAGTAGAGATCTCCATGAAAACGTGG 2384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2335 CTGGGCCAATAAGTTTAGTTGTAAATGCATGCGCAAGTAGAGATCTCCATGAAAACGTGG 2394
Query 2385 TTGGGGTGTGTTTTGTAGCCCATGATCTTACTGGCCAGAAGACTGTGATGGACAAGTTTA 2444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2395 TTGGGGTGTGTTTTGTAGCCCATGATCTTACTGGCCAGAAGACTGTGATGGACAAGTTTA 2454
Query 2445 CTCGGATTGAAGGTGATTACAAGGCAATCATCCAAAATCCAAACCCGCTGATCCCGCCAA 2504
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2455 CGCGGATTGAAGGTGATTACAAGGCAATCATCCAAAATCCAAACCCGCTGATCCCGCCAA 2514
Query 2505 TATTTGGCACCGATGAGTTTGGATGGTGCACAGAGTGGAATCCAGCGATGTCAAAGTTAA 2564
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2515 TATTTGGTACCGATGAGTTTGGATGGTGCACAGAGTGGAATCCAGCAATGTCAAAGTTAA 2574
Query 2565 CCGGTTTGAAGCGAGAGGAAGTGATCGACAAAATGCTCTTAGGAGAAGTCTTCGGGACAC 2624
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |
Sbjct 2575 CCGGTTTGAAGCGAGAGGAAGTGATTGACAAAATGCTCTTAGGAGAAGTATTTGGGACGC 2634
Query 2625 AGAAGTCATGTTGTCGTCTAAAGAACCAAGAAGCCTTTGTAAACCTTGGAATTGTACTGA 2684
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 2635 AGAAGTCATGTTGTCGTCTAAAGAATCAAGAAGCCTTTGTAAACCTTGGGATTGTGCTGA 2694
Query 2685 ACAATGCTGTGACCAGTCAAGATCCAGAGAAAGTGTCGTTTGCTTTCTTTACAAGAGGTG 2744
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2695 ACAATGCTGTGACCAGTCAAGATCCAGAGAAAGTATCGTTTGCTTTCTTTACAAGAGGTG 2754
Query 2745 GCAAGTATGTGGAGTGTCTGTTGTGTGTGAGTAAGAAACTGGACAGGGAAGGTGTAGTGA 2804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755 GCAAGTATGTGGAGTGTCTGTTGTGTGTGAGTAAGAAACTGGACAGGGAAGGTGTAGTGA 2814
Query 2805 CAGGTGTCTTCTGTTTCCTGCAACTTGCCAGCCATGAGCTGCAGCAAGCGCTCCATGTTC 2864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2815 CAGGTGTCTTCTGTTTCCTGCAACTTGCCAGCCATGAGCTGCAGCAAGCGCTCCATGTTC 2874
Query 2865 AGCGTCTAGCTGAGCGAACCGCAGTGAAGAGACTAAAGGCTCTAGCATACATAAAAAGGC 2924
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2875 AACGTTTAGCTGAGCGAACCGCAGTGAAGAGACTAAAGGCTCTAGCATACATAAAAAGAC 2934
Query 2925 AGATCAGGAATCCGCTATCTGGTATCATGTTTACAAGGAAAATGATAGAGGGTACTGAAT 2984
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935 AGATCAGGAATCCGCTATCTGGGATCATGTTTACAAGGAAAATGATAGAGGGTACTGAAT 2994
Query 2985 TAGGACCAGAGCAGAGACAGATTTTGCAAACTAGCGCGTTATGTCAGAAGCAACTAAGCA 3044
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2995 TAGGACCAGAGCAAAGACGGATTTTGCAAACTAGCGCGTTATGTCAGAAGCAACTAAGCA 3054
Query 3045 AGATCCTTGATGATTCGGATCTTGAAAGCATCATTGAAGGGTGCTTGGATCTGGAAATGA 3104
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 3055 AGATCCTCGATGATTCGGATCTTGAAAGCATCATTGAAGGATGCTTGGATTTGGAAATGA 3114
Query 3105 AAGAATTTAGCTTAAACGAAGTGTTGACTGCTTCCACAAGCCAAGTAATGATGAAGAGTA 3164
||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3115 AAGAATTCACCTTAAATGAAGTGTTGACTGCTTCCACAAGTCAAGTAATGATGAAGAGTA 3174
Query 3165 ACGGGAAGAGTGTTCGGATAACAAATGAGACCGGAGAAGAAGTAATGTCTGACACTTTGT 3224
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3175 ACGGAAAGAGTGTTCGGATAACAAATGAGACCGGAGAAGAAGTAATGTCTGACACTTTGT 3234
Query 3225 ATGGAGACAGTATTAGGCTTCAACAAGTCTTGGCAGATTTCATGCTGATGTCTGTAAACT 3284
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3235 ATGGAGACAGTATTAGGCTTCAACAAGTCTTGGCAGATTTCATGCTGATGGCTGTAAACT 3294
Query 3285 TTACACCATCCGGAGGTCAGCTAACTGTTACAGCTTCCCTGAGCAAGGATCAGCTCGGGC 3344
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3295 TTACACCATCCGGAGGTCAGCTAACTGTTTCAGCTTCCCTGAGGAAGGATCAGCTCGGGC 3354
Query 3345 GTTCTGTGCATCTTGCTAATCTAGAGATCAGGTTAACGCATACAGGAGCTGGGATACCTG 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3355 GTTCTGTGCATCTTGCTAATCTAGAGATCAGGTTAACGCATACCGGAGCTGGGATACCTG 3414
Query 3405 AGTTTTTACTAAACCAAATGTTTGGGACTGAGGAAGATGTGTCAGAAGAAGGATTGAGCT 3464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3415 AGTTTTTACTAAACCAAATGTTTGGGACTGAGGAAGATGTGTCAGAAGAAGGATTGAGCT 3474
Query 3465 TGATGGTTAGCCGGAAACTAGTGAAGCTGATGAATGGAGATGTTCAGTACTTGAGACAAG 3524
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3475 TAATGGTTAGCCGGAAACTGGTGAAGCTGATGAATGGAGATGTTCAGTACTTGAGACAAG 3534
Query 3525 CTGGGAAATCGAGTTTCATTATCACTGCGGTACTCGCTGCAGCAAACAAGTAGTCCTCGA 3584
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 3535 CTGGGAAATCAAGTTTCATTATCACTGCGGAACTCGCTGCAGCAAACAAGTAGTCCCCAA 3594
Query 3585 AAGAAAAGGGGTCATGGCTTGATATAAAATAGTCACTGGTTGTTCTTTGTTTGTAACGTT 3644
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 3595 AAGAAAAGGGGTC-TGGCTTGATATAAAATAGTCACTGGTTGTTCTTTGCTTGTAACTTT 3653
Query 3645 GCTTGGCGCTTTTGCTTTCGTTTTCAAATTTCAATAACGATGAAATATCCATCCATTTAC 3704
||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3654 CCTTATCGCTTTTGTTTTCGTTTTCAAATTTCAGTAACGATGAAATATCCATCCATTTAC 3713
Query 3705 ATCTTCTCTTAAACTCTTTTCTGAAGCTGTAAATATGGATGCATATTTAATCTCC-CCTT 3763
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 3714 ATCTTCTGTTGAACTCTTTTCTGAAGCTGTAAATATGGATGCATATCTAATCTCCTCCT- 3772
Query 3764 GAGTGTTTTGGTTTCATGATGTATCATTCAAA 3795
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3773 GAGTGTTTTGGTTTCATGATGTATCATTCAAA 3804
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 189029041224
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5