BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg471776 Length=4169 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G15780.1 | Symbols: | unknown protein; BEST Arabidopsis tha... 6647 0.0 AT1G15770.1 | Symbols: | unknown protein; BEST Arabidopsis tha... 545 1e-153 > AT1G15780.1 | Symbols: | unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT2G10440.1); Has 103701 Blast hits to 43153 proteins in 1828 species: Archae - 30; Bacteria - 7385; Metazoa - 38639; Fungi - 11531; Plants - 7727; Viruses - 307; Other Eukaryotes - 38082 (source: NCBI BLink). | chr1:5430183-5436412 REVERSE LENGTH=4338 Length=4338 Score = 6647 bits (3599), Expect = 0.0 Identities = 3959/4129 (96%), Gaps = 40/4129 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGATAATAACAACTGGAGGCCTTCTCTTCCAAACGGAGAACCTGCCATGGACT-CAGC 59 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| Sbjct 68 ATGGATAATAACAATTGGAGGCCTTCTCTTCCAAACGGAGAGCCTGCCATGGA-TACAGG 126 Query 60 TGACTGGAGAACTCAATTGCCTCCTGATTCACGTCAGAAGATCGTCAACAAGATAATGGA 119 |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 127 TGACTGGAGAACGCAATTGCCACCTGATTCTCGTCAGAAGATCGTCAACAAGATAATGGA 186 Query 120 AACACTAAAGAAGCACCTTCCGTTTTCTGGACCGGAGGGAATTAACGAGCTCAGGAGAAT 179 ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 187 AACACTAAAGAAGCACCTTCCATTTTCCGGACCAGAGGGAATTAACGAGCTCAGGAGAAT 246 Query 180 TGCAGCCAGATTCGAGGAGAAAATTTTCAGCGGTGCTGTTAACCAGACTGATTACCTTCG 239 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 247 TGCAGCTAGATTCGAGGAGAAAATTTTCAGCGGTGCTCTTAACCAGACTGATTACCTTCG 306 Query 240 GAAAATATCAATGAAGATGCTGACAATGGAGACTAAATCACAAAATGCTGCTGGTTCTTC 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 307 GAAAATATCAATGAAGATGCTGACAATGGAGACTAAATCACAAAATGCAGCTGGTTCTTC 366 Query 300 CGCATCTATCCCTGCCGCTAATAATGGCACATCCATAGATTCGATACCCACCAATCAAGG 359 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 367 CGCAGCTATCCCTGCCGCTAATAATGGCACATCCATAGATTCGATACCCACCAATCAAGG 426 Query 360 TCATCTTCTTCCAGGATCGTTACCAACCAATCAATCTCAAGCACCTCAGCCGTTACTGTC 419 || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 427 CCAACTTCTTCCAGGATCGTTATCAACCAATCAATCTCAAGCACCTCAGCCGTTGCTGTC 486 Query 420 CCAAACCATGCAGAATAATAGC-GCCTCTGGAATGACGGGTTCTACTGCTTTACCATCTT 478 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 487 CCAAACCATGCAGAATAATA-CTGCCTCTGGAATGACGGGTTCTACTGCTTTACCATCTT 545 Query 479 CCATGCCGCCGGTTTCTTCCATAGCCAATAATAACGTCACAAGCGTTGTAAACCAGAATG 538 ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct 546 CCATGCCACCTGTTTCTTCCATAACCAATAATAACACCACAAGCGTTGTGAACCAGAATG 605 Query 539 CCAATATGCAAAATGTAGCTGGAATGTTGCAAGATTCATCTGGGCAGCATGGCCTTTCCT 598 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 606 CCAATATGCAAAATGTAGCTGGAATGTTGCAAGATTCATCTGGGCAGCATGGCCTTTCCT 665 Query 599 CGAATATGTTTTCTGGATCCCAAAGGCAGATGCTTGGAAGGCCACATGCTATGTCTTCAC 658 |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 666 CGAACATGTTTTCAGGACCCCAAAGGCAGATGCTGGGTAGGCCACATGCTATGTCTTCAC 725 Query 659 AGCAACAACAGCAGCCATATCTTTATCAGCAGCAGCTACAGCAGCAACTTCTCAAGCAGA 718 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 726 AGCAACAACAGCAGCCATATCTTTACCAGCAGCAGCTACAGCAGCAACTTCTCAAGCAGA 785 Query 719 ACTTCCAGTCAGGGAATGTTCCCAATCCCAATTCGCTTTTGCCATCACACATTCAACAAC 778 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 786 ACTTCCAGTCAGGGAATGTTCCCAATCCCAATTCGCTTTTGCCATCACACATTCAACAAC 845 Query 779 AGCAACAAAATGTGCTGCAGCCAAATCAACTGCATTCGTCTCAACAACCAGGTGTTCCAA 838 |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 846 AGCAGCAAAATGTGCTGCAGCCTAATCAACTGCATTCATCTCAACAACCTGGTGTTCCAA 905 Query 839 CATCTGCTACGCAGCCCTCCACTGTGAACTCAGCTCCTCTCCAGGGTCTCCACACAAATC 898 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 906 CATCTGCGACTCAGCCCTCCACTGTGAACTCAGCTCCTCTCCAAGGTCTCCACACCAATC 965 Query 899 AGCAATCAAGTCCGCAATTGTCTTCTCAGCAGACGACACAATCTATGCTTCGTCAGCATC 958 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 966 AGCAATCAAGTCCGCAATTGTCTTCTCAGCAGACGACACAATCTATGCTTCGTCAGCATC 1025 Query 959 AATCGTCGATGCTAAGGCAACATCCGCAATCACAACAAGCCTCTGGCATCCATCAGCAGC 1018 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1026 AATCGTCGATGCTAAGGCAACATCCGCAATCACAACAAGCCTCTGGTATCCATCAGCAGC 1085 Query 1019 AAACTTCATTGCCGCAGCAATCAATTTCTCCTCTACAACAGCAGCAAACACAAATAATGC 1078 || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| Sbjct 1086 AATCTTCATTGCCGCAACAATCAATTTCTCCTCTACAGCAGCAGCCTACACAATTAATGC 1145 Query 1079 GGCAACAAGCTGCAAATAGCTCAGGCATCCAACAGAAGCAGATGATGGGGCAGCATGTTG 1138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1146 GGCAACAAGCTGCAAATAGCTCAGGCATCCAACAGAAGCAGATGATGGGGCAGCATGTTG 1205 Query 1139 TTGGGGATATGCAGCAGCAACATCAGCAAAGGTTACTGAACCAACAAAATAATATTATGA 1198 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1206 TTGGGGATATGCAGCAGCAACATCAGCAAAGGTTACTGAACCAACAAAATAATGTTATGA 1265 Query 1199 ACATacaacagcagcagtcgcagcagcaaccactgcagcagccactgcagcagccacaac 1258 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | Sbjct 1266 ACATACAACAGCAGCAGTCGCAGCAGCAACCACTGCAGCAG---C--CA-CAG------C 1313 Query 1259 aacagcagaaacagcagccaccggcccagcagcagTTGATGTCTCAACAAAACAGCCTCC 1318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1314 AACAGCAGAAACAGCAGCCACCGGCCCAGCAGCAGTTGATGTCTCAACAAAACAGCCTCC 1373 Query 1319 AGGCAACGCATCAGCAA-CCACTGGGCCCTCAAAGCAATGTTGCAGGATTGCAGCAACCA 1377 |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1374 AGGCAACGCATCAG-AACCCACTGGGCACTCAAAGCAATGTTGCAGGATTGCAGCAACCA 1432 Query 1378 CAACAACAGATGCTCAATTCCCAGGTTGGCAATTCGAGTTTGCAGAATAACCAGCACTCG 1437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1433 CAACAACAGATGCTCAATTCCCAGGTTGGCAATTCGAGTTTGCAGAATAACCAGCACTCG 1492 Query 1438 GTGCATATGTTATCACAACCAACGGTTGGGCTGCAAAGAACACATCAGGCTGGCCATGGC 1497 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1493 GTGCACATGTTATCACAACCAACGGTTGGGCTGCAACGAACACATCAGGCTGGCCATGGC 1552 Query 1498 TTGTTTTCTTCTCAGGGCCAACAGTCACAAAATCAGCCATCCCAACAGCAGATGATGCCA 1557 |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1553 TTGTATTCTTCTCAGGGACAACAGTCACAAAATCAGCCATCACAACAGCAGATGATGCCA 1612 Query 1558 CAGCTTCAATCGCATCATCAGCAGCTAGGTTTGCAACAACAACCTAATCTGCTACAACAG 1617 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1613 CAGCTTCAATCGCATCATCAGCAGCTGGGTTTGCAACAACAACCTAATCTGCTACAACAG 1672 Query 1618 GATGTGCAACAAAGGCTACAAGCTTCAGGCCAAGTCACAGGTTCCCTGCTTCCACCTCAA 1677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1673 GATGTGCAACAAAGGCTACAAGCTTCAGGCCAAGTCACTGGTTCCCTGCTTCCACCTCAA 1732 Query 1678 AATGTTGTGGACCAACAGAGACAACTATATCAATCCCAAAGAACCCTTCCGGAGATGCCA 1737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1733 AATGTTGTGGACCAACAGAGACAACTATATCAATCCCAAAGAACCCTTCCGGAGATGCCA 1792 Query 1738 TCATCATCGCTGGATTCGACGGCACAGACGGAAAGTGCAAATGGAGGTGATTGGCAAGAG 1797 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1793 TCATCATCGCTGGATTCGACAGCACAGACGGAAAGTGCAAATGGAGGTGATTGGCAAGAG 1852 Query 1798 GAGGTTTATCAAAAGATCAAATCTATGAAAGAGACGTATTTACCAGATCTGAATGAAATC 1857 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 1853 GAGGTTTACCAAAAGATCAAATCTATGAAAGAGACTTACTTACCAGATCTGAATGAAATC 1912 Query 1858 TACCAGAGAGTTGCAGCTAAGTTGCAGCAAGATTCTGTTCCACAGCAACAAAGATCAGAT 1917 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 1913 TACCAGAGAGTTGCAGCAAAGTTGCAGCAAGATTCTATGCCACAGCAACAAAGATCAGAT 1972 Query 1918 CAGTTTGAGAAATTGAAACAATTCAAAACAATGTTGGAGCGAATGATTCAATTTCTATCT 1977 ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1973 CAGCTTGAGAAACTGAGACAATTCAAAACAATGTTGGAGCGAATGATACAATTTCTATCT 2032 Query 1978 GTTTCAAAGAGCAATATCATGCCCGCATTAAAGGATAAGGTGGCTTATTATGAGAAGCAG 2037 |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2033 GTTTCAAAGAGCAACATCATGCCCGCATTAAAAGATAAGGTGGCTTATTATGAGAAGCAG 2092 Query 2038 ATTATAGGTTTCTTAAATATGCACAGGCCGAGGAAGCCAGTACAGCAAGGGCAGCTTCCG 2097 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2093 ATTATAGGTTTCTTAAATATGCACAGGCCGAGGAAGCCAGTACAGCAAGGGCAGCTTCCG 2152 Query 2098 CAATCTCAGATGCAGCCTATGCAGCAACCGCAATCTCAGACAGTTCAAGATCAATCTCAT 2157 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2153 CAATCTCAGATGCAGCCTATGCAGCAACCACAATCTCAGACAGTTCAAGATCAATCCCAT 2212 Query 2158 GATAACCAAACAAATCAGCAAATGCAATCAATGAGCATGCAGGGTGCTGGGCCAAGGGCA 2217 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2213 GATAACCAAACAAATCCGCAGATGCAATCAATGAGCATGCAGGGTGCTGGGCCAAGGGCA 2272 Query 2218 CAACAGAGTAGTCTGCCAAATATGCAGAACAATGTTCTATCATCTCGTCCCGGAGTTTCA 2277 |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2273 CAACAGAGTAGTATGACAAATATGCAGAGCAATGTTCTATCATCTCGTCCTGGAGTTTCA 2332 Query 2278 GCTCCACAGCAGAACATTCCCAGTTCCATACCGGCTTCTAGTTTAGAATCAGGCCAAGGA 2337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2333 GCTCCACAGCAGAACATTCCCAGTTCCATACCGGCTTCTAGTTTAGAATCAGGCCAAGGA 2392 Query 2338 AATGCCTTGAATAATGGCCAGCAGGTTGCCATGGGATCCATGCAACAAAATACTTCTCAA 2397 ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2393 AATACCTTGAACAATGGACAGCAGGTTGCCATGGGATCTATGCAACAAAATACTTCTCAA 2452 Query 2398 CAAGTTAATAACAGTTCTGCCTCTGCTCAAAGTGGGTTAAGCACACTGCAGTCTAATGTA 2457 | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 2453 CTAGTAAATAACAGTTCTGCCTCTGCTCAAAGTGGGTTGAGCACACTGCAGTCGAATGTG 2512 Query 2458 AATCAACCCCAGTTAAGTTCCAGTTTGCTTCAGCATCAGCACCTCAAGCAACAGCAAGAT 2517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2513 AATCAACCCCAGTTAAGTTCCAGTTTGCTTCAGCATCAGCACCTCAAGCAACAGCAAGAT 2572 Query 2518 CAACAAATGACGCAGCAGCTCAAACAGCAATTTCAACAGCGCCAGATgcaacagcaacag 2577 ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2573 CAACAAATG-C--AGC---TCAAACAGCAATTTCAACAGCGCCAGATGCAACAGCAACAG 2626 Query 2578 ttgcaagcaagacatcaacagcaacagcaacagttgcaagcaagacagcaagcggcacaa 2637 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2627 TTGCAAGCAAGACAGCAACAGCAACAGCAACAGTTGCAAGCAAGACAGCAAGCGGCACAA 2686 Query 2638 ttacagcagATGAATGATATGAATGATTTAACATCAAGGCAGGGGATGAATGTCAGTCGT 2697 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2687 TTACAGCAGATGAATGATATGAATGATTTAACATCGAGGCAGGGGATGAATGTCAGTCGT 2746 Query 2698 GGGATGTTCCAGCAACATTCTCTGCAGGGTCAGCGTGCTACTTATCCTCTTCAACAGTTA 2757 |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct 2747 GGGATGTTTCAGCAACATTCTATGCAGGGTCAGCGTGCGAATTATCCTCTTCAACAGTTA 2806 Query 2758 AAACCAGGAGCTGTTTCGTCGCCTCAACTTCTGCAAGGTGCATCTCCTCAGATGTCACAA 2817 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2807 AAACCAGGAGCTGTTTCGTCGCCTCAACTTCTGCAAGGTGCATCTCCTCAGATGTCACAA 2866 Query 2818 CAACATTTGTCTCCTCAGGTTGACCAGAAAAATCTGTCAACTGTCAACAAGATGGGAACT 2877 || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct 2867 CA---TTTGTCTCCTCAGGTTGACCAGAAAAAT-----A-CTGTCAACAAGATGGGAACT 2917 Query 2878 CCATTGCAACCTGCAAATTCCCCTTTTGTTGTCCCATCTCCTTC---AACCCCCTTGGCT 2934 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2918 CCATTGCAACCTGCAAATTCCCCTTTTGTTGTCCCATCTCCTTCTTCAACCCCCTTGGCT 2977 Query 2935 CCATCCCCTATGCAAGTTGACTCTGAGAAACCTGGTGCTTCTTCGTTGTCAATGGGAAAT 2994 || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2978 CCGTCCCCTATGCAAGTTGACTCTGAGAAACCTGGTTCTTCTTCGTTGTCAATGGGAAAT 3037 Query 2995 ATTGCACGCCAACAAGCAACTGGCATGCAAGGTGTAGTTCAGTCCCTAGCAATTGGCACT 3054 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3038 ATTGCACGCCAACAAGCAACCGGCATGCAAGGTGTAGTTCAGTCCCTAGCAATTGGCACT 3097 Query 3055 CCAGGGATCTCTGCCTCTCCTCTCCTTCAGGAGTTTACTAGTCCTGATGGAAATATTTTA 3114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3098 CCAGGGATCTCTGCCTCTCCTCTCCTTCAGGAGTTTACTAGTCCTGATGGGAATATTTTA 3157 Query 3115 AATCCTTTGGCAATTACATCTGGAAAACCGAGTGCTACTGAGCTGCCTATTGAACGCCTT 3174 ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3158 AATTCTTCGACAATTACATCTGGAAAACCGAGTGCTACTGAGCTGCCTATTGAACGCCTT 3217 Query 3175 ATTAGAGCCGTGAAGTCCATCTCACCACAAGCGCTTTCTTCTGCAGTAAGTGACATCGGA 3234 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3218 ATTAGAGCCGTGAAGTCCATCTCACCACAAGCCCTTTCTTCTGCAGTAAGTGACATCGGA 3277 Query 3235 TCGGTTGTAAGCATGGTTGATAGGATAGCTGGTTCAGCACCAGGAAACGGTTCAAGAGCT 3294 || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3278 TCTGTTGTAAGCATGGTTGATCGGATAGCTGGTTCAGCACCAGGAAACGGTTCAAGAGCT 3337 Query 3295 TCAGTTGGTGAGGACTTGGTTGCAATGACTAAGTGTCGTCTCCAAGCAAGAAACTTCATG 3354 || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3338 TCCGTTGGTGAAGACTTGGTTGCAATGACTAAGTGCCGTCTCCAAGCAAGAAACTTCATG 3397 Query 3355 ACGCAAGAGGGAATGATGGCGACCAAGAAAATGAAGCGTCACACAACCGCAATGCCACTA 3414 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3398 ACCCAAGAGGGAATGATGGCGACTAAGAAAATGAAGCGTCACACAACCGCAATGCCACTA 3457 Query 3415 AGTGTTGCTTCGCTGGGAGGAAGCGTTGGTGATAACTACAAGCAGTTTGCTGGTTCAGAA 3474 || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3458 AGCGTTGCTTCACTGGGAGGAAGTGTTGGTGATAACTACAAGCAGTTTGCTGGTTCAGAA 3517 Query 3475 ACATCAGATCTAGAATCTACTGCGACTTCTGATGGCAAGAAGGCAAGAACTGAGACCGAG 3534 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3518 ACATCCGATCTAGAATCTACTGCGACTTCGGATGGCAAGAAGGCAAGAACTGAGACCGAG 3577 Query 3535 CATGCCCTTTTGGAGGAAATAAAGGAAATAAACCAGCGGCTGATAGATACAGTTGTTGAG 3594 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3578 CATGCCCTTTTGGAGGAAATAAAGGAAATAAACCAGCGGCTGATAGATACAGTTGTTGAG 3637 Query 3595 ATAAGTGATGATGAAGATGCTGCTGATCGTAGTGAGAGA-GCAATATCAAGCATAGGGTG 3653 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct 3638 ATAAGTGATGATGAAGATGCTGCTGATCCTAGTGAG-GTTGCAATATCAAGCATAGGGTG 3696 Query 3654 TGAAGGAACAACAGTTAGATTCTCGTTTATAGCTGTTTCTCTCAGCCCAGCCTTGAAGGC 3713 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3697 TGAAGGAACAACAGTTAGATTCTCGTTTATAGCTGTTTCTCTCAGCCCAGCCTTGAAGGC 3756 Query 3714 TCATCTTTCATCAACACAAATGTCTCCTATTCAACCATTGCGTCTGCTGGTTCCTTGTAG 3773 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3757 TCATCTCTCATCAACACAAATGTCTCCTATTCAACCATTGCGTCTGCTGGTTCCTTGTAG 3816 Query 3774 CTACCCCAATGGCTCTCCTTCTCTTCTGGATAAACTCCCGGTCGAAACCAGCAAAGAAAA 3833 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3817 CTACCCCAATGGCTCTCCATCTCTTCTAGATAAACTCCCGGTCGAAACCAGCAAAGAAAA 3876 Query 3834 TGAGGACCTCTCGTCCAAAGCTATGGCAAGGTTCAACATATTGCTAAGAAGTTTGTCACA 3893 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3877 CGAGGACCTGTCGTCCAAAGCTATGGCAAGGTTCAACATATTGCTAAGAAGTTTGTCACA 3936 Query 3894 GCCAATGTCGCTCAAAGACATAGCCAAGACATGGGACGCCTGTGCTCGGGCTGTGATCTG 3953 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3937 GCCGATGTCGCTCAAAGACATAGCCAAGACATGGGACGCCTGTGCTCGGGCAGTGATCTG 3996 Query 3954 TGAGTACGCACAGCAATTTGGCGGTGGAACTTTCAGCTCAAAATACGGAACTTGGGAGAA 4013 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3997 TGAGTACGCACAGCAATTTGGCGGTGGAACTTTCAGCTCAAAATACGGCACTTGGGAGAA 4056 Query 4014 ATATGTAGCAGCTTCATGAATCTGGCGGATCTCTCAAGTCCTCAACGGCAACTCTGTGAT 4073 ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||| Sbjct 4057 ATATGTAGCAGCTTCCTGAATCTGACGGATCTCTCTCGTCTTCAATAGCAGCTCTGTGAT 4116 Query 4074 TCACTTGCAGTTTCATGTCAAAACTATTGGaaaaaaaaGCCAAAAAGTT 4122 |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| Sbjct 4117 TCACTTGCAGGTTCATGTCAAAACTAAAG-AAAAAAA-GCCAAAAAGTT 4163 > AT1G15770.1 | Symbols: | unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G15780.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | chr1:5426892-5428280 REVERSE LENGTH=947 Length=947 Score = 545 bits (295), Expect = 1e-153 Identities = 402/452 (89%), Gaps = 13/452 (3%) Strand=Plus/Plus Query 3021 GCAAGGTGTAGTTCAGTCCCTAGCAATTGGCACTCCAGGGATCTCTGCCTCTCCTCTCCT 3080 |||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 500 GCAAGGTGTACTTCAATCCCTTGAAATTGGCACTCCAGGGATCTCTGCCTCTCCTCTCCT 559 Query 3081 TCAGGAGTTTACTAGTCCTGATGGAAATATTTTAAATCCTTTGGCAATTACATCTGGAAA 3140 || |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| Sbjct 560 TCCGGAGCTTACCAGTCCTGATGGAAATATTATAAATCCTTTGACAAGTACTTGTGGAAA 619 Query 3141 ACCGAGTGCTACTGAGCTGCCTATTGAACGCCTTATTAGAGCCGTGAAGTCCATCTCACC 3200 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| Sbjct 620 ATCGAGTGCTACTGAGCTGCCTATTGAACGCCTTATTAGAGCCATGAAATCCATCTCACC 679 Query 3201 ACAAGCGCTTTCTTCTGCAGTAAGTGACATCGGATCGGTTGTAAGCATGGTTGATAGGAT 3260 |||||||||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 680 ACAAGCGCTTTCGTCTGCAGTATGTGATATTAGATCTGTTGTAAGCATGGTTGATAGGAT 739 Query 3261 AGCTGGTTCAGCACCAGG-AAACGGTTCAAGAGCTTCAGTTGGTGAGGACTTGGTTGCAA 3319 |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| Sbjct 740 TGCTGGTTCAGTACCAGGCAAA-GGTTCAAGAGCTTCATTTGGTGTGGACTTGGTTGCAA 798 Query 3320 TGACTAAGTGTCGTCTCCAAGCAAGAAACTTCATGACGCAAGAGGGAATGATGGCGACCA 3379 |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| Sbjct 799 TGACTAAGTGCCATCTCCAAGAAAGAAACTTCATGACGCAAGA-----TG--G-CGACCA 850 Query 3380 AGAAAATGAAGCGTCACACAACCGCAATGCCA-CTAAGTGTTGCTTCGCTGGGAGGAA-G 3437 ||||| ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| | Sbjct 851 TGAAAAGGAAGCGTCAGACAACCCCAATGCCATC-AAGTGTTGCTTCATTGGGAGGAAAG 909 Query 3438 CGTTGGTGATAACTACAAGCAGTTTGCTGGTT 3469 ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| Sbjct 910 CGTTGGTAATAGCTACAAGCATTTTGCTGGTT 941 Score = 359 bits (194), Expect = 1e-97 Identities = 330/394 (84%), Gaps = 16/394 (4%) Strand=Plus/Plus Query 1842 AGATCTGAATGAAATCTACCAGAGAGTTGCAGCTAAGTTGCAGC-A-A-GATTCT-GTTC 1897 ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | | |||||| ||| Sbjct 107 AGACCTCAATGAAATCTACCAGAGAGTAGCAGCCAAGTTGCAGCAAGAGGATTCTCTTTC 166 Query 1898 -CA-CAGCAACAAAGATCAGATCAGTTTGAGAAATTGAAACAATTCAAAACAATGTTGGA 1955 || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| Sbjct 167 GCATCAGAAACAAAGATCAGATCAGTTTGAGAAATTGAAACGAGGCAAGACAGTGTTGGA 226 Query 1956 GCGAATGATTCAATTTC-TATCTGTTTCAAAGAGCAATATCATGCCCG-CATTAAAGGAT 2013 | ||||| | | |||| ||||| |||||||||||||||||| || | | || |||||| Sbjct 227 GGGAATGCTACG-TTTCCTATCTCTTTCAAAGAGCAATATCAAACCTGAC-TTGAAGGAT 284 Query 2014 AAGG-TGGCTTATTATGAGAAGCAG-ATTAT-AGGTTTCTTAAATATGCACAGGCCGAGG 2070 | | ||| |||| |||| || ||||| | ||||||||||||||| || | |||| Sbjct 285 A-GTATGGATTATCGCAAGAA-CAACATTATGAA-TTTCTTAAATATGCAGAGTCTGAGG 341 Query 2071 AAGCCAGTACAGCAAGGGCAGCTTCCGCAATCTCAGATGCAGCCTATGCAGCAACCGCAA 2130 ||| |||||||| || ||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| | | Sbjct 342 AAGACAGTACAGAAACTGCAGCTTACGAAATCTGAGATTCAGCCTATGCAGCAACCACTA 401 Query 2131 TCTCAGACAGTTCAAGATCAATCTCATGATAACCAAACAAATCAGCAAATGCAATCAATG 2190 |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct 402 TCTCAGACAGTTCAAGATCAGTCTCATGATGACCAAACAACTCTGCAGATGCAATCAATG 461 Query 2191 AGCATGCAGGGTGCTGGGCCAAGGGCACAACAGA 2224 |||||||||||||||||| |||||| |||||||| Sbjct 462 AGCATGCAGGGTGCTGGGTCAAGGGTACAACAGA 495 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 207791477906 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5