BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg472581
Length=4920
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G23230.1 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mediator ... 7251 0.0
> AT1G23230.1 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mediator
complex subunit Med23 (InterPro:IPR021629); Has 187 Blast
hits to 184 proteins in 67 species: Archae - 0; Bacteria - 0;
Metazoa - 135; Fungi - 0; Plants - 43; Viruses - 0; Other
Eukaryotes - 9 (source: NCBI BLink). | chr1:8244440-8251741
FORWARD LENGTH=4889
Length=4889
Score = 7251 bits (3926), Expect = 0.0
Identities = 4160/4276 (97%), Gaps = 4/4276 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 647 AGGTTAAATCGT-TGGAGAATGGGCAGCAGATTGCAAGAGCAGGCCAGACTGTAAGAGAG 705
|||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 616 AGGTGAAATC-TGTGGAGAATGGGCAGCAGATTGCAAGAGCTGGCCAGATTGTAAGAGAG 674
Query 706 AATGCTATGAGAAATAGTCAACGGATTAGAGCTGCTGCTATAAACAGTCTGCGCCAGCTC 765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct 675 AATGCTATGAGAAATAGTCAACGGATTAGAGCTGCTGCTGTAAACAGTCTGCGTCAGCTC 734
Query 766 AGTTGCAAGATTATCTTGATTGGCGTTGAATTTAGTCTCAAACCCGTTACTCATGCCGAG 825
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 AGTTGCAAGATTATCTTGATTGGCGTTGAATCTAGTCTCAAACCCGTTACTCATGCCGAG 794
Query 826 ATTTTCCAGTACATGTTGAATTGGCTTGTTAACTGGGACAGGAGAGATCCGGGAACTGAG 885
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 795 ATTTTCCAGTACATGATGAATTGGCTTGTTAACTGGGACAGGAGAGATCTGGGAACTGAG 854
Query 886 GACTCTGCAGGTACGTCGTGGAGATCTGAGAAGACTTTAGCTGAATGGTTGCGGAGTTGT 945
||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 GACTCTGTAGGAAAGTCGTGGAGATCTGAGAAGACTTTAGCTGAATGGTTGCGGAGTTGT 914
Query 946 TTGGATGTGATCTGGCTGTTGGTAGAAGAGGGTGAATCTCGAATTCCGTTTTATGAGTTA 1005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 TTGGATGTGATCTGGCTGTTGGTAGAAGAGGGTGAATCTCGAATTCCGTTTTATGAGTTA 974
Query 1006 TTGCGCAGTGGTCTACAGTTTATAGAGAACATACCTGATGATGAAGCCTTGTTCACTCTT 1065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 975 TTGCGCAGTGGTCTACAGTTTATAGAGAACATACCTGATGATGAAGCCTTGTTCACTCTT 1034
Query 1066 ATCATGGAGATACACCGGAGGCGAGATGCGATGGCCATGCACATGCTCATGTTGGACCAA 1125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1035 ATCATGGAGATACACCGGAGGCGAGATGCGATGGCCATGCATATGCTCATGTTGGACCAA 1094
Query 1126 CATCTTCACTGTCCAACATTTGGTACCCATCGTATAGTGTCCCAAGTAACTGCCAATGTT 1185
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1095 CATCTTCACTGTCCATCATTTGGTACCCATCGTATAGTCTCCCAAATAACTGCCAATGTT 1154
Query 1186 TCAGCCGAAGCTGTGCAACACTTACGACATTCACCAATTACATATCCAAGTGTGCTTGGG 1245
|| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 CCACCCGAAGCTGTGCCACACTTACGACATTCACCAATTACATATCCAAGTGTGCTTGGG 1214
Query 1246 GAACCTTTGTATGGAGAGGATCTGGCGATGTCTATTCCAAAAGGAAGCCTCGATTGGGAG 1305
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1215 GAACCTTTATATGGAGAGGATCTGGCGATGTCTATTCCAAAAGGAAGCCTGGATTGGGAG 1274
Query 1306 AGAGCAGTGCGTTGCATTAGACATGCTATCCGCACTACGCCGTCACCGGACTGGTGGAAA 1365
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1275 AGAGCAGTGCGTTGCATTAGACATGCTATTCGCACTACACCGTCACCGGACTGGTGGAAG 1334
Query 1366 CGTGTTCTTGTTGTGGCCCCTTGTTATAGACCATCTACACAACCAGGGCCTATCCCTGGT 1425
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1335 CGTGTTCTTGTTGTGGCCCCTTGTTATAGACCATCTACACAAGCAGGGCCTATCCCTGGT 1394
Query 1426 GCTGTATTCACTTCTGACATGATTTGTGAGGCAATCATTGACAGGATTGTTGAGCTTCTT 1485
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1395 GCTGTATTCACTTCTGACATGATTTGTGAGGCAATCATTGACAGAATTGTTGAGCTTCTT 1454
Query 1486 AAGCTGACCAACTCAGGCAATGATTGCTTTGGTATTGATTTGGTATCTGTTACTTTTTCC 1545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1455 AAGCTGACCAACTCAGGCAATGATTGCTTTGGTATTGATTTGGTATCTGTTACTTTTCCC 1514
Query 1546 CCTCTCTATGCAGATGCAAATTGTTGGCAAGAGTGGCTGGTTTTCTCGGATATCTTCTTC 1605
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1515 CCTCTCTATGCAGATGCAAATTGCTGGCAAGAGTGGCTGGTTTTCTCGGATATATTCTTC 1574
Query 1606 TTTCTAATTAAAAGTGGGTGTACTGATTTTGTTGATTTCATTGACAAGTTGGTTTCACGT 1665
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1575 TTTCTAATCAAAAGTGGGTGTACTGATTTTGTTGATTTCATTGACAAGTTGGTTTTACGC 1634
Query 1666 CTTAACGGTGTTGATAACCATATTCTTCGGACGAATCATGTGACGTGGCTGCTTGCACAA 1725
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1635 CTTAACGGTGTTGATAACCATATTCTTCGGACGAATCATGTGACTTGGCTGCTTGCACAA 1694
Query 1726 ATAATACGCGTGGAGCTTGTGATGACTGCTTTGAACTCAGATGCTAAAAAGGTGGAGACT 1785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1695 ATAATACGCGTGGAGCTTGTGATGACTGCTTTGAACTCAGATGCTAAAAAGGTGGAGACT 1754
Query 1786 ACTAGGAAGATCTTATCATTTCACAGGGAAGACAGAAATTCTGATCCCAATAATCCTCAG 1845
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1755 ACTAGGAAGATCTTATCATTTCACAGGGAAGACAGAAATTCTGATCCCAACAATCCTCAG 1814
Query 1846 AGTGTGTTGCTTGACTTCGTTAGCAGTTGTCAGAATCTACGGATTTGGTCACTAAGCACA 1905
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 AGTGTGTTGCTTGACTTCGTAAGCAGTTGTCAGAATCTACGGATTTGGTCACTAAGCACA 1874
Query 1906 ACAACTAGGGCATACCTAAACAATGAACAGCTGTTGAAGGGAAAACAGATCGATGAGTGG 1965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1875 ACAACTAGGGCATACCTAAACAATGAACAGCTGTTGAAGGGAAAACAGATCGATGAGTGG 1934
Query 1966 TGGAGAAGCAAAGGAGAGCGGATGATGGATTATATGAATATGGATGATAGGTCGATTGGC 2025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1935 TGGAGAAGCAAAGGAGAGCGGATGATGGATTATATGAATATGGATGATAGGTCGATTGGC 1994
Query 2026 ATGTTTTGGGTTGTTTCCTACACTATGGCACAACCAGCGTGTGAAACAGTTATAAATTGG 2085
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 ATGTTTTGGGTTGTTTCCTACACCATGGCACAACCAGCATGTGAAACAGTTATAAATTGG 2054
Query 2086 CTATCTTCAGCTGGCATGGCTGAGTTACCGGGATTACAGCCAAACGACCGAGTAATGATG 2145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2055 CTATCTTCAGCTGGCATGGCTGAGTTACCGGGATTACAGCCAAACGACCGAGTAATGATG 2114
Query 2146 ACGCAGGAAGTGACCCCGTTACCTATGTCATTGCTATCTGGCTTTTCAATGAATTTGTGC 2205
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2115 ACGCAGGAAGTTACCCCGTTACCTATGTCATTGCTATCTGGCTTTTCAATGAATTTGTGC 2174
Query 2206 TTGAAATTGGCCCTTCAGATGGAAGAAGCTTTGTTTGTTAGCCAGGTTGTTCCTAGCATT 2265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2175 TTGAAATTGGCCCTTCAGATGGAAGAAGCTTTGTTTGTTAGCCAGGTTGTTCCTAGCATT 2234
Query 2266 GCAATGGTTGAGACATACACAAGATTGCTTCTGATTTCCCCTCATTCGATGTTCCGTTCG 2325
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2235 GCAATGGTTGAGACATACACAAGATTGCTTCTGATTTCCCCTCATTCGATGTTCCGTTCA 2294
Query 2326 CATTTCAGTCAATTGGCCCAGCGAAATGCTTCTCTGCTAAGCAAGCCTGGAGTGACTTTG 2385
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2295 CATTTCAGTCAATTGGCCCAGCGAAATGCTTCTCTGCTAAGCAAGCCTGGAGTGACGTTA 2354
Query 2386 CTTGTTCTTGAGATTCTGAACTATCGGTTGCTTCCGCTCTACAGATACCAAGGAAAGAGT 2445
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2355 CTTGTTCTTGAGATTCTGAACTATCGGTTGCTGCCACTCTACAGATACCAAGGAAAGAGT 2414
Query 2446 AAAACTTTAATGTATGATGTTACTAAAATAATATCTGCATTGAAAGGAAAACGTGGTGAC 2505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2415 AAAACTTTAATGTATGATGTTACTAAAATAATATCTGCATTGAAAGGAAAACGTGGTGAC 2474
Query 2506 CACCGTATATTCAGACTAGCTGAAAACTTATGCATGAATCTCATTTTATCACTCAGAGAC 2565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2475 CACCGTATATTCAGACTAGCTGAAAACTTATGCATGAATCTCATTTTATCACTCAGAGAC 2534
Query 2566 tttttttCTGTGAAACGGGAGGGAAAAGGGCCAACTGAATTCACTGAAACATTAAACCGC 2625
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 2535 TTTTTCTCTGTGAAACGGGAGGGAAAAGGGCCAACTGAATTCACTGAGACGTTAAATCGC 2594
Query 2626 ATAACCATCATGACTCTTGCTATCACTATCAAAACACGTGGTATCGCAGACCCTGATCAC 2685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2595 ATAACCATCATGACTCTTGCTATCACTATCAAAACACGTGGTATCGCAGACCCTGATCAC 2654
Query 2686 TTGGTTTATCTGCAAACCATGTTGGAACAAATACTCGCGACGAGTCAGCATACATGGTCA 2745
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2655 ATGGTTTATCTGCAAACCATGTTGGAACAAATACTCGCGACGAGTCAGCATACATGGTCA 2714
Query 2746 GAGAAGACGATGCGGCATTTCCCATCCCTTCTCCGTGACACATTGAATGGACGGGTAGAC 2805
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||
Sbjct 2715 GAGAAGACGATGCGGCATTTCCCATCCCTTCTCCGTGAAACTTTGAAAGGACGGGTAGAC 2774
Query 2806 AAGAGGGGCCTATCCATTCAGGCATGGCAACAGGCTGAAACAACTGTGATAAACCAGTGC 2865
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2775 AAGAGGGGCCTATCAATTCAGGCATGGCAACAGGCTGAAACAACTGTGATAAACCAGTGC 2834
Query 2866 ACTCAGCTTCTCTCACCATCTGCTGAACCCGCTTACGTTTCAACATACCTCAGTCACAGT 2925
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2835 ACTCAACTTCTCTCACCATCTGCTGAACCCGCTTACGTTTCAACATACCTCAGTCACAGT 2894
Query 2926 TTTCCTCAACACCGTCAGTATCTATGTGCTGGTGCTTGTCTGCTGATGCAAGGCCACGCT 2985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2895 TTTCCTCAACACCGTCAGTATCTATGTGCTGGTGCTTGTCTGCTGATGCAAGGCCACGCT 2954
Query 2986 GAAAACATCAACAGCACAAATCTGGCACGGGTTCTGAGAGAAGTTTCTCCTGAAGAAGTC 3045
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2955 GAAAACATCAACAGCACAAATCTGGCACGAGTTCTGAGAGAAGTTTCTCCTGAAGAAGTC 3014
Query 3046 ACTGCTAACATATACACTTTGGTCGATGTTTTGCTTCACCACGTTCATGTAGACCTTCAG 3105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3015 ACTGCTAACATATACACTTTGGTCGATGTTTTGCTTCACCACGTTCATGTAGACCTTCAG 3074
Query 3106 CAAGGACAATCTTTAGAGGCAGTTCTAGACAAGGCAGGCGCAAATCTTGCATTTTTCTTC 3165
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3075 CAAGGACAATCTCTAGAGGCAGTTCTAGACAAGGCAGGCGCAAATCTTGCATTTTTCTTC 3134
Query 3166 TGGACACATGAAATGCTTCCTCTCGACATTTTTCTTCTGGCGCTCATTGACCGTGATGAT 3225
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3135 TGGACACATGAAATGCTTCCTCTCGACATTTTTCTTTTGGCGCTCATTGACCGTGATGAT 3194
Query 3226 GATCCGCACGCCTTGATAATTGCAATGAGCCTACTTAAAACGCCAGACCTTCTGCTGAGG 3285
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3195 GATCCTCACGCCTTGATAATTGCAATGAGCCTACTTAAAACGCCAGACCTTCTGCTGAGG 3254
Query 3286 ATTAAAAACTACTGCCAAAACCGTGGGTCTCCTGAGCACTGGCTTGTCACACAGGTGTTC 3345
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3255 ATAAAAAACTACTGCCAAAACCGTGGGTCTCCTGAGCACTGGCTTGTCACACAGGTGTTC 3314
Query 3346 AAACGCAATGAACTCCAGAAGGCCCTTGGTAACCATCTTTCTTGGAAGGACAGGTATCCA 3405
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3315 AAACGCAATGAACTCCAGAAGGCCCTGGGTAACCATCTTTCTTGGAAGGACAGGTATCCA 3374
Query 3406 ACGTTCTTTGATGATATTGCAGCGCGTTTGCTTCCAGTTATCCCTCTAGTGGTTTACAGG 3465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3375 ACGTTCTTTGATGATATTGCAGCGCGTTTGCTTCCAGTTATCCCTCTAGTGCTTTACAGG 3434
Query 3466 CTCATCGAGAACAATGCGATGGACCAAGCTGATAATCTTTTGCTTGCACACTCGCATTTT 3525
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3435 CTCATCGAGAACAATGCGATGGAGCAAGCTGATAATCTTTTGCTTGCACACTCGCATTTT 3494
Query 3526 CTAGCTTATCATCCTCTCAGATTCACGTTTGTCCGAGATATACTCGCCTATTTCTATGGT 3585
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3495 CTAGCGTATCATCCTCTCAGATTCACGTTTGTCCGTGATATACTAGCCTATTTCTATGGC 3554
Query 3586 CATCTTCCTGGGAAACTTGTTCTGCGCATGCTCAAAGTACTTGATCTCAGCAAGATTCCA 3645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3555 CATCTTCCTGGGAAACTTGTTCTGCGCATGCTCAAAGTACTTGATCTCAGCAAGATTCCA 3614
Query 3646 TTCTCTGAATCATTCCCGCAGTACATTAGCCCTGCCGGTGC-CGCTGTATGCCCACCTCT 3704
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 3615 TTCTCTGAATCATTCCCGCAGTACATTAGCCCTACCGGTGCAC-CTGTATGCCCACCTCT 3673
Query 3705 AGATTACTTTGCCTCTCTTCTGCTTAATCTTGTAAACAACGTTATACCTCCACTTAGCAG 3764
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3674 AGATTACTTTGCCTCTCTTCTGCTTAATCTCGTAAACAATGTTATACCTCCACTTAGCAG 3733
Query 3765 CAGCAGCAACTGCAGCTCGAGGTCTGGCTCAATGGCAGACATCTTAAACAGCTCAGCAAG 3824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3734 CAGCAGCAACTGCAGCTCGAGGTCTGGCTCAATGGCAGACATCTTAAACAGCTCAGCAAG 3793
Query 3825 ACCTCCTCATGGAAAAACTCCAGGAACATCTCAGCCTGGACCAGCAAACGCCTCTGAGGG 3884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3794 ACCTCCTCATGGAAAAACTCCAGGAACATCTCAGCCTGGACCAGCAAACGCCTCTGAGGG 3853
Query 3885 CCAGAAAGCATTCTACCAGATCCAAGACCCAGGAACTTACACTCAATTGGTTCTTGAGAC 3944
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 3854 CCAGAAAGCATTCTATCAGATCCAGGACCCAGGAACTTACACGCAACTGGTTCTTGAGAC 3913
Query 3945 AGCCGTGATCGAGATCCTCTCGCTTCCCGTCTCCGCTGCTCAGATTGTCTCTTCGCTTGT 4004
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3914 AGCCGTGATCGAGATCCTCTCGCTTCCTGTCTCTGCTGCTCAGATTGTCTCTTCGCTTGT 3973
Query 4005 CCAGATAATTGTCAACATACAATCGACTCTGATTCAATCTGGAAACGGGTTCCACGGCGC 4064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3974 CCAGATAATTGTCAACATACAATCGACTCTGATTCAATCTGGAAACGGGTTCCACGGCGC 4033
Query 4065 TGCGAACGGGGTGGGGCAAGGGTCGGTACTGCCAACGTCTCCCTCAGGAGGGAGCACGGA 4124
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 4034 TGCCAACGGGGTGGGACAAGGGTCGGTACTGCCAACGTCTCCCTCTGGAGGGAGCACAGA 4093
Query 4125 CTCCATGAGCGCTAGCCGGTCCACTTGTCTGATTCCTGGTATCAACACGGCGAGCTTTGT 4184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4094 CTCCATGAGCGCTAGCCGGTCCACTTGTCTGATTCCTGGTATCAACACAGCGAGCTTTGT 4153
Query 4185 CTCTAGAAGTGGTTATACATGTCAGCAACTGTCGTGTCTTTTGATTCAAGCTTGTGGGCT 4244
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 4154 CTCTAGAAGCGGTTATACATGTCAGCAACTGTCGTGTCTGTTGATTCAAGCTTGTGGACT 4213
Query 4245 TCTGCTGGCCCAGCTCCCTCCAGATTTTCACATGCAGCTTTACTTGGAGGCAACACGTGT 4304
|||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4214 TCTGTTGGCTCAGCTCCCTCCAGATTTTCACGTACAGCTTTACTTGGAGGCAGCACGTGT 4273
Query 4305 GACAAGGGAAACATGGTGGCTTAAGGACGGGAAGAGATCACAAGGTGAACTAGACTCGGC 4364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4274 GACAAGGGAAACATGGTGGCTTAAGGACGGGAAGAGATCACAAGGTGAACTAGACTCAGC 4333
Query 4365 TGTTGGATACGCTTTGATGGATCCGACATGGGCTGCTCAGGACAACACCTCGACCGCAAT 4424
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 4334 TGTTGGATACGCTTTGATGGATCCTACATGGGCTGCTCAGGATAACACCTCGACCGCCAT 4393
Query 4425 AGGAAATATAGTCGCCTTGCTTCATGCTTTCTTCAGCAATCTCCCACAAGAATGGCTTGA 4484
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4394 AGGAAATATTGTCGCCTTGCTTCATGCTTTCTTCAGCAATCTCCCACAAGAATGGCTTGA 4453
Query 4485 TGGCACGAATGCCATCATCAAGAACCTCCGGCCTGTGACATCTGTCGCAATGCTCAGAGT 4544
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4454 TGGCACGAATGCTATCATCACGAACCTCCGGCCTGTGACATCTGTGGCAATGCTCAGAGT 4513
Query 4545 TGTATTCCGTATTATGGGGCCACTGCTTCCGAGGCTTGCCAGCACACATACTCTCTTTAA 4604
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4514 TGTATTCCGTATCATGGGGCCACTGCTTCCGAGGCTTGCCAGTACACATACTCTCTTTAA 4573
Query 4605 CAAGACGTTAACCCTTCTCTTATCCGCGCTGGTCGATGTTTTCGGAAAGAACGCACAGAC 4664
||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 4574 CAAGACGCTAATGCTTCTCTTAAGCGCACTGGTCGATGTTTTTGGAAAGACCGCACAGAC 4633
Query 4665 AACAGCCCCTGTTGAAGCATCCCAGATTACAGATCTTATTGATTTCCTACACCATATTAT 4724
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4634 AACAGCCCCTGTTGAAGCATCCCAGATTGCAGATCTTATTGATTTCCTACACCATATTAT 4693
Query 4725 TCACTACGAGGGACAAGGAGGAGCTGTCCAAACTAGCAGCAAGCCGAGACCCGACATCTT 4784
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4694 TCACTACGAGGGACAAGGAGGAGCTGTTCAAACTAGCAGCAAGCCGAGACCGGACATCTT 4753
Query 4785 GGCGTTAATCGGAAGAGCAGCAGATTCTCTCCGACCAGATGTACAACACCTTCTCGCTCA 4844
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4754 GGCGTTAATCGGAAGAGCAGCAGAGACTCTCCGACCAGATGTACAACACCTTCTCGCTCA 4813
Query 4845 CCTCAAAACCAACCCGAATTCTTCGATATACGCAGCTGCTCATCAGCAGAATACCGCAAA 4904
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4814 CCTCAAAACCAACCCGAATTCTTCCATATACGCAGCTGCTCATCAGCAGAATACTGCAAA 4873
Query 4905 GACCAACACCTCTTAA 4920
||| ||||||||||||
Sbjct 4874 GACTAACACCTCTTAA 4889
Score = 837 bits (453), Expect = 0.0
Identities = 505/530 (95%), Gaps = 3/530 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 aaaaaaaTGGATCAATCTCAGCGAACAGTCGCTGCAACGCCTTCGTCTTCTCGATCGTAC 60
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 36 AAAAAAATGGATCAATCGCAGCGAACAGTCGCTGCAACGCCATCGTCTTCTCGATCGTAC 95
Query 61 CAATTCCACCCTGCCCGTGCTGCAATTATCGATCTTTTCAATCTCTACTTAGGGAGAGGA 120
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 96 CAATTCCACCCAGCTCGTGCTGCAATTATCGATCTTTTCAATCTCTACTTAGGGAGAGGA 155
Query 121 AGCCGTCAAAAGCCCGATGAGTCCCTCAGAGATCCTCCGAACAAATCACAGAAGCGTGTT 180
|||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 156 AGCCGTCAAAAGCCTGATGAGTCCCTCCGAGATCCCCCGAACAAATCACAGAAGCGTGTT 215
Query 181 CATGCTCCAAACAGAGACTTACCACCAAGAAACGAGCAATTCATTTTGGATTTTGAGCAG 240
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 216 CATGCTCCTAATAGAGACTTACCACCAAGAAACGAGCAATTCCTTTTGGATTTTGAGCTG 275
Query 241 CTTCAAAGCCAATTCAATGATCCAGAGCAATTGAGGACGATTACTGAGTCAGTTTTGATA 300
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 276 CTTCAGAGCCAATTCAATGATCCAGAGCAATTGAGGACGATTACTGAGTCAGTTTTGATA 335
Query 301 TCTTTGGTGGTGCAATGTAGCAATCATGCGCCTCGTGCTGAGTTTCTTCTCTTTGCTTTG 360
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 336 TCTCTGGTGGTGCAATGTAGCAATCATGCGCCTCGTGCTGAGTTTCTACTCTTTGCTTTG 395
Query 361 CGTACATTGTGTAGGATTAGTTATATCAATTGGGATACTTTTTTACCATCCCTTCTCTCT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 CGTACATTGTGTAGGATTAGTTATATCAATTGGGATACTTTTTTACCATCCCTTCTCTCT 455
Query 421 TCGGTTTCTGCTGCTGAGGCTTCGTTAAGCCAAGGTGTTCAAGC--C-GCGGCAACGGCT 477
|| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 456 TCCGTTTCCGCTGCTGAGGCGTCGTTAAGCCAAGGTGTTCAAGCAGCAGCGGCAACGGCT 515
Query 478 GCTTCTTCTGCTACTTCTTCACAGTCTTTAGTTCCTGTGTCTGCCAATCC 527
| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 516 GGTTCTTCTGCTACTTCTTCGCAGTCTGTAGTTCCTGTGTCTGTGAATCC 565
Score = 97.1 bits (52), Expect = 1e-18
Identities = 54/55 (98%), Gaps = 0/55 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 559 AATCCAACGTCATTGTTGCCTTCAGCTCATGGTATTGGTTCTCCATCAGCTTCAG 613
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 561 AATCCAACGTCATTGCTGCCTTCAGCTCATGGTATTGGTTCTCCATCAGCTTCAG 615
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 245466852099
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5