BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg473044 Length=2386 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G28320.1 | Symbols: DEG15 | protease-related | chr1:9920507-... 3858 0.0 > AT1G28320.1 | Symbols: DEG15 | protease-related | chr1:9920507-9924488 REVERSE LENGTH=2437 Length=2437 Score = 3858 bits (2089), Expect = 0.0 Identities = 2296/2393 (96%), Gaps = 26/2393 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 CCCGAAAACTAAAAAGATCCAAACTTCTG--CAATTTTGGTGTCTGCTATACAGAATCCA 58 ||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 43 CCCAAAAACTTAAAAGATCCAAACTTC-GAACAATTTTGGTGTCTGCTATACAGAATCCA 101 Query 59 AATCCACCATCTTCCGATTGAAAA-CGCCTTCTCTTTCGATCATGGATGTGTCGAAAGTC 117 |||||||| || ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 102 AATCCACCTTC-TCCGATTAAAAATC-CCTTCTCTTTCGATCATGGATGTGTCTAAAGTT 159 Query 118 GTCAGCTTTTCCCGGAATTTCGCCGTCTTGGTCAAAGTCGAAGGCCCTGATCCAAAGGGA 177 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 160 GTCAGCTTTTCCCGGAATTTCGCCGTCTTGGTCAAAGTCGAAGGCCCTGATCCAAAGGGA 219 Query 178 TTGAAGATGAGGAAGCATGCTTTTCATCAATACCATTCTGGCAATGCAACACTTTCAGCT 237 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 220 TTGAAGATGAGGAAGCATGCTTTTCATCAATACCATTCTGGCAATGCAACACTTTCAGCT 279 Query 238 TCTGGGATCTTGTTTCCAAGAAATATCTTCAGTG-GTGGTGAGGTCACGGCTAAGGTTCT 296 |||||||||||| |||||||| |||| || || ||||||||||| | ||||||||||| Sbjct 280 TCTGGGATCTTGCTTCCAAGAGATAT-TTTTTTGAGTGGTGAGGTCGCTGCTAAGGTTCT 338 Query 297 GTTTGAAGCTGGTCAGGACATGGCCCTGGTTTTGACTGTTGCATCTGTTGTAGAGCCATT 356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 339 GTTTGAAGCTGGTCAGGACATGGCCCTGGTTTTGACCGTTGCATCTGTTGTTGAGCCATT 398 Query 357 CTTAACATTAGGTCACAGAACTAGTAGTAGTATCTCTCAGGATCCGGTGAAGCTTATTCC 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 399 CTTAACATTAGGTCACAGAACTAGTAGTAGTATCTCTCAGGATCCGGTGAAGCTTATTCC 458 Query 417 GGGTGCTCGGATTGAGATTATGGTGGAGGGTCAGCTAAAGTCAGGAAAGGAAGCTCCTTT 476 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 459 GGGTGCTATGATTGAGATTATGGTGGAGGGTCAGCTAAAGTCAGAAAAGGAAGCTCCTTT 518 Query 477 TTGGGTTCCTGCGCAACTTCTTTCGCTGGTTGATGTCCCTGTATCTTCTGCTGCACTCCA 536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 519 TTGGGTTCCTGCGCAACTTCTTTCGCTGGTTGATGTCCCTGTATCTTCTGCTGCACTTCA 578 Query 537 ATCTCTTATTGAAGCTTCTTCCGGTTCGAAAGATTCTGGATGGGATGTTGGTTGGTCTTT 596 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 579 ATCTCTTATTGAAGCTTCTTCTGGTTCGAAAGATTCTGGATGGGATATTGGTTGGTCTTT 638 Query 597 GGTTTCTGCTGCTAATGGTTCTCAGCCTTCAACCAATATTGAACATTACAGAAAGCCCTT 656 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 639 GGTTTCTGCTGCTAATGGTTCTCAGCCTTCAATCAATATTGAACATTACAGCAAGCCCTT 698 Query 657 GATGCAACTTGATGAGCCACTCAATGCTAACTTCATGGCCAAGTCTGCCACTCGAATGGC 716 |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 699 GATGCAACTTGATGAGCCACACAACGCTAACTTCATGGCCAAGTCTGCCACTCGAATGGC 758 Query 717 TCTTCTAGGAGTCCCCTTAAGTTTACTGGGTCAGCCAAACATGAATTTTGCTTCATCAAG 776 | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 759 TATTCTAGGAGTCCCCTTAAGTTTACTGGGTCAACCAAGCATGAATTTTGCTTCATCAAG 818 Query 777 TAGCAAGGGTGATACACTTGTAGCACTAGGTTCTCCTTTTGGAATCCTTTCACCTGTTAA 836 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 819 TAGCAAGGGTGATACACTTGTAGCACTAGGCTCTCCCTTTGGAATCCTTTCACCTGTTAA 878 Query 837 CTTTTTTAACAGTGTATCAACTGGTTCCATTGCGAATTGCTATCCTTCTGGATCCCTAAA 896 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 879 CTTTTTTAACAGCGTATCAACTGGTTCCATTGCGAATAGCTATCCTTCTGGATCCCTAAA 938 Query 897 GAAGTCACTGATGATAGCTGATGTTCGATGTCTCCCTGGAATGGAAGGGGCTCCGGTGTT 956 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 939 GAAGTCACTGATGATAGCTGATGTTCGATGTCTCCCTGGAATGGAAGGGGCTCCGGTGTT 998 Query 957 TGATAAGAATGGGCACTTAATTGGCATTTTGATTAGACCACTAAGGCAAAAGAATAGCGG 1016 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 999 TGCTAAGAATGGGCACTTAATTGGCATTTTGATTAGACCACTAAGGCAAAAGAATAGCGG 1058 Query 1017 CGTTGAAATTCAGCTGGTGGTTCCATGGGGAGCAATCACAACTGCTTGCAGCCACTTGCT 1076 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1059 CGTTGAAATTCAGCTGGTGGTTCCATGGGGAGCAATCACAACTGCTTGCAGCCACTTGCT 1118 Query 1077 GCTTGAGGAACCATCTGAAGCAGGAAAAGCAAGTCAGTGGGGGAGTGAAG-CACTAAATG 1135 ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| | |||| || Sbjct 1119 GCTTGAGGAACCATCTGTAGAAGGAAAAGCAAGTCAGTGGGGGAGCGAAGTC-CTAAGTG 1177 Query 1136 TTAAATCAGATACTAGTATTCCTGCACAAGTGGCTATTGAGAAGGCGATGGAATCAGTTT 1195 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1178 TTAAATCAGATGCTAGTATTCCTGCACAAGTGGCTATTGAGAAGGCGATGGAATCAGTTT 1237 Query 1196 GTCTTATTACAGTCAATGATGGTGTTTGGGCATCTGGTATTATTCTTAACGAACATGGTC 1255 |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1238 GTCTTATTACGGTCAATGATGGTGTTTGGGCTTCTGGTATTATTCTTAACGAACATGGTC 1297 Query 1256 TCATACTAACAAATGCTCACCTGCTTGAGCCGTGGAGGTATGGAAAAGGTGGTGTATATG 1315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1298 TCATACTAACAAATGCTCACCTGCTTGAGCCGTGGAGGTATGGAAAAGGTGGTGTATATG 1357 Query 1316 GTGAAGGAAACGACGCTGGTTTAAAACCCTATGTCTTAGGAGCCGAGGAGTTTTCTTCCA 1375 |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1358 GTGAAGGA--------T--TT-AAA-CCCTATGTCTTAGGAGCCGAGGAATTTTCTTCCA 1405 Query 1376 CGGGAGGTAAAGTTTGGGAACAGAAGAGTCAAACATTGCCACGGAAAGCTCCA-GCAAAT 1434 ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 1406 CGGGAAGTAAATTTTGGGAACAGAAGAGTCAAACATTGCCACGGAAAGCTCCACG-AAAT 1464 Query 1435 CTTTATTCGTCTGTTGGAGAGAACATTAGGGAATACAAACACAATTTCCTTCAGACTGGG 1494 | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1465 CATTATTCGTCTGTTGGAGAGAACATCAGGGAATACAAACACAATTTCCTTCAGACTGGG 1524 Query 1495 CATAGAGATATACGTGTACGATTGTGTCACCTAGATTCTTGGACTTGGTGTACTGCAAAC 1554 |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1525 CATAGAGACATACGTGTGCGTTTGTGTCACCTAGATTCTTGGACTTGGTGTCCTGCAAAC 1584 Query 1555 GTGGTCTATATTTGCAAGGAACAATTAGATATTGCTTTACTGCAGCTAGAATATGTCCCT 1614 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1585 GTGGTCTATATTTGCAAGGAACAATTAGATATTGCCTTACTGCAGCTAGAATATGTCCCT 1644 Query 1615 GGAAAGCTCCAACCTATTGCTGCCAATTTTTCTTCTCCTCCTTTGGGTACAACAGCGCAT 1674 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1645 GGAAAGCTCCAACCTATTACTGCCAATTTTTCTTCTCCTCCTTTGGGTACAACAGCGCAT 1704 Query 1675 GTTGTTGGACATGGACTCTTCGGACCAAGATGTGGGCTTTCTCCTTCTATTTGTTCTGGA 1734 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1705 GTTGTTGGACATGGACTCTTCGGACCAAGATGTGGGCTTTCTCCTTCTATTTGTTCTGGA 1764 Query 1735 GTTGTAGCAAAGGTAGTTTACGCGAAGAGGAGATTGAATACGCAATCCATTT-TGCAAGA 1793 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct 1765 GTTGTAGCAAAGGTAGTTCACGCAAAGAGGAGATTGAATACGCAATCCATTTCT-CAAGA 1823 Query 1794 AGTCGCAGAGTTCCCCGCTATGCTCGAAACAACAGCTGCTGTGCATCCTGGTGGTAGTGG 1853 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1824 AGTCGCAGAGTTCCCCGCTATGCTCGAAACAACAGCTGCTGTGCATCCTGGTGGCAGTGG 1883 Query 1854 TGGTGCTGTTCTCAATTCAAGTGGCCATATGATTGGACTTGTTACCAGCAACGCAAGACA 1913 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1884 TGGTGCTGTTCTCAATTCAAGTGGCCATATGATTGGACTTGTTACCAGCAACGCAAGACA 1943 Query 1914 TGGAGCGGGGACTGTTATACCGCATCTCAACTTCAGCATCCCATGTGCAGTCTTGGCACC 1973 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1944 TGGAGCGGGGACTGTTATACCGCATCTCAACTTCAGCATCCCATGTGCAGTCTTGGCACC 2003 Query 1974 AATCTTCAAGTTTGCAGAAGATATGCAGAACATAAAGCTCCTTCAAACACTTGATCAACC 2033 |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| Sbjct 2004 AATCTTCAAGTTTGCAGAAGATATGCAGAACACAACGATCCTTCAAACACTTGATCAACC 2063 Query 2034 AAGCGAAGAACTCTCATCCATTTGGGCTTTGATGCCATCACTATCACCAAAGACTGAGCA 2093 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2064 TAGCGAAGAACTCTCATCCATTTGGGCTTTGATGCCATCACTATCACCAAAGACTGAGCA 2123 Query 2094 GTCTCTACCCAATCTACCTAAGTTACTCAAAGATGGTAATAACAAACAAAAGAAAGGATC 2153 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2124 GTCTCTACCCAATCTGCCTAAGTTACTCAAAGATGGTAATAACAAACAAACGAAAGGATC 2183 Query 2154 TCAGTTTGCCAAGTTCATTGCAGAGACCCAAGACATGTTTGTAAAGCCGACCAAGCTTTC 2213 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2184 TCAGTTTGCCAAGTTCATTGCAGAGACCCAAGACATGTTTGTAAAGCCGACCAAGCTTTC 2243 Query 2214 CCGTGATGTGATCCCTAGCAAGTTATGACAAGATTGGCTTCTTTGCAGAGTGTGCGCCTT 2273 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| Sbjct 2244 CCGTGATGTGATCCCTAGCAAGTTATGACAAGATTGGCTTCTTTGCAGAATTTGTGCCTT 2303 Query 2274 CTTTTCCCCCTTTTGCTGGAGTGGCAACTTTAACTTTTGTATAGATAGAGAGATTACAAT 2333 ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2304 CTTTTACTCCTTTTGCTGGAGTGGCAACTTTAACTTTTGTATAGATAGAGAAATTACAAA 2363 Query 2334 GTGTTGCTGCTGTTTCTGGATTCTTCTGCTTGTAACATATGTAAAACCTTATA 2386 ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2364 ATGTTGCTGCTGTTTCTGGATTATTCTGTTTGTAACATATATAAAACCTTATA 2416 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 118473286200 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5