BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg476565
Length=3122
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G74310.1 | Symbols: ATHSP101, HSP101, HOT1 | heat shock prot... 4782 0.0
> AT1G74310.1 | Symbols: ATHSP101, HSP101, HOT1 | heat shock protein
101 | chr1:27936508-27940190 REVERSE LENGTH=3165
Length=3165
Score = 4782 bits (2589), Expect = 0.0
Identities = 2987/3171 (94%), Gaps = 59/3171 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATATACAAAAGCACTCATGCCTCCTCGCTCTCTCGCAATTCACAAAGTTTCCAAACATCT 60
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1 ATATACAAAAGCAGTCATGCCTCCTCGCTCTCTCGCAATTCACAAAGTATCCAAACATCT 60
Query 61 AAAGGTT-TCAATTTTACAACATTATCGTTACAATCTACTTGATTCTCTGCAAAAAGAGA 119
||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAA-GTTATCAATTTTACAACATTACCGCTATAATCTGCTTGATTCTCTGCAAAAAGAGA 119
Query 120 AG-------A---AGAAGAAG---TCTGATTCATTGAAGAAACTCTGCGAAACAAACCCA 166
|| | |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 120 AGACTTTTTACCGAGAAGAAGTCCTCTGGCTCATTGAAGAAACTCAACGAAACAAACCCA 179
Query 167 GTTCTCATATCTCCTTTTCAGGGATTACAAGGGCTAATTCGAAGATGAATCCGGAGAAAT 226
|||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 180 GTTCTCATATATCGTTTTAAGGGATTACAAAAGCTAA-TCGAAGATGAATCCAGAGAAAT 238
Query 227 TTACACACAAGACAAATGAGACAATTGCTACAGCTCATGAGCTAGCTGTGAATGCAGGAC 286
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 TCACACACAAGACAAACGAGACAATTGCTACAGCTCATGAGCTAGCTGTGAATGCAGGAC 298
Query 287 ATGCTCAATTCACTCCTCTGCATTTGGCTGGTGCTTTGATCTCTGATCCCACTGGTATAT 346
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 299 ATGCTCAATTCACTCCTTTGCATTTAGCTGGTGCTTTGATCTCTGATCCCACCGGTATAT 358
Query 347 TCCCTCAAGCAATCTCTAGTGCCGGTGGCGAGAACGCAGCACAATCTGCTGAAAGAGTGA 406
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 359 TTCCTCAAGCAATCTCTAGTGCCGGTGGCGAGAACGCAGCTCAATCTGCTGAAAGAGTGA 418
Query 407 TCAACCAAGCCTTGAAGAAGCTTCCTTCACAATCTCCTCCACCTGATGATATTCCAGCGA 466
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 TCAATCAAGCCTTGAAGAAGCTTCCTTCACAATCTCCTCCACCTGATGATATTCCAGCGA 478
Query 467 GTTCTAGTCTTATCAAGGTCATACGTCGTGCTCAAGCTGCTCAGAAGTCACGCGGTGACA 526
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 479 GTTCTAGTCTTATTAAGGTCATTCGTCGTGCTCAAGCTGCTCAGAAGTCACGAGGTGATA 538
Query 527 CTCATTTGGCTGTTGATCAGTTGATTATGGGTCTTCTTGAAGATTCTCAAATCAGGGATT 586
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 CTCATTTGGCTGTTGACCAGTTGATTATGGGTCTTCTTGAAGATTCTCAAATCAGGGATT 598
Query 587 TGTTGAATGAAGTTGGTGTTGCAACCGCGAGGATCAAGTCGGAGGTTGAGAAGCTTCGTG 646
||||||| ||||| ||||| || || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 599 TGTTGAACGAAGTCGGTGTAGCGACGGCGAGGGTAAAGTCTGAGGTTGAGAAGCTTCGTG 658
Query 647 GGAAAGAAGGGAAGAAAGTGGAGAGTGCTTCAGGGGATACAAATTTTCAAGCTTTGAAGA 706
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 659 GGAAAGAAGGGAAGAAAGTTGAGAGTGCTTCAGGGGACACAAATTTTCAAGCTTTAAAGA 718
Query 707 CTTATGGAAGAGATTTGGTTGAGCAAGCAGGGAAGCTTGATCCTGTAATTGGTCGGGACG 766
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |
Sbjct 719 CTTATGGAAGAGATTTGGTTGAGCAAGCAGGGAAGCTTGATCCTGTGATTGGTCGTGATG 778
Query 767 AGGAGATTAGAAGAGTTGTTAGGATTCTTTCGAGGAGAACAAAGAACAATCCTGTGCTTA 826
|||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 779 AGGAGATTAGAAGAGTCGTGAGGATTCTTTCGAGGAGAACGAAGAACAATCCTGTGCTTA 838
Query 827 TTGGAGAGCCAGGAGTTGGTAAAACAGCTGTGGTTGAAGGCTTAGCGCAAAGGATTGTGA 886
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 839 TTGGAGAGCCAGGAGTTGGTAAAACAGCTGTGGTTGAAGGTTTAGCACAAAGGATTGTGA 898
Query 887 AAGGAGATGTGCCCAACAGTCTTACTGATGTGAGATTGATTTCTTTGGACATGGGTGCAT 946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
Sbjct 899 AAGGAGATGTGCCCAACAGTCTTACTGATGTGAGATTAATTTCGTTGGACATGGGTGCGT 958
Query 947 TAGTTGCTGGTGCTAAGTACCGAGGAGAGTTTGAAGAAAGATTGAAAGCTGTTTTGAAAG 1006
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 959 TAGTTGCTGGTGCTAAATACCGAGGAGAGTTTGAAGAAAGGTTGAAATCTGTTTTGAAAG 1018
Query 1007 AAGTTGAGGAAGCTGAAGGCAAAGTGATTCTCTTTATTGATGAGATTCACTTGGTTCTTG 1066
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1019 AAGTTGAGGACGCTGAAGGCAAAGTGATTCTCTTTATTGATGAGATTCATTTGGTTCTTG 1078
Query 1067 GTGCTGGCAAAACTGAAGGTTCAATGGATGCAGCTAATCTGTTCAAGCCCATGTTAGCTA 1126
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 GTGCTGGCAAAACTGAAGGGTCGATGGATGCAGCTAATCTGTTCAAGCCCATGTTAGCTA 1138
Query 1127 GAGGGCAACTTCGATGCATTGGTGCTACAACGCTTGAAGAGTACAGGAAATATGTTGAGA 1186
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1139 GAGGGCAGCTTCGATGCATTGGTGCTACAACGCTTGAAGAATACAGGAAATATGTTGAGA 1198
Query 1187 AAGATGCTGCCTTTGAGAGGAGGTTCCAGCAAGTCTATGTCGCTGAGCCAAGTGTGCCTG 1246
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 1199 AAGATGCTGCCTTTGAGAGGAGGTTCCAACAAGTCTATGTTGCGGAGCCAAGTGTGCCTG 1258
Query 1247 ATACTATCAGTATTCTTAGAGGGCTCAAAGAGAAGTATGAGGGACATCATGGTGTTCGTA 1306
| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 1259 ACACCATTAGTATCCTTAGAGGACTCAAGGAGAAGTATGAGGGACATCATGGTGTGCGAA 1318
Query 1307 TCCAGGACAGAGCTCTTATAAATGCTGCTCAGCTGTCTGCTCGTTACATAACTGGTCGGC 1366
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 TCCAAGACAGAGCTCTTATAAATGCTGCTCAGCTGTCTGCTCGTTACATAACTGGTCGGC 1378
Query 1367 ATTTACCGGATAAAGCGATTGATTTGGTTGATGAGGCTTGTGCGAATGTGAGAGTCCAGC 1426
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 ATTTACCGGATAAAGCAATTGATTTGGTTGATGAGGCTTGTGCGAATGTGAGAGTCCAGC 1438
Query 1427 TTGATAGTCAACCTGAAGAGATTGATAACCTTGAAAGGAAGAGGATGCAGCTGGAAATTG 1486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 TTGATAGTCAACCTGAAGAGATTGATAACCTTGAAAGGAAGAGGATGCAGCTGGAAATTG 1498
Query 1487 AACTTCACGCCTTGGAAAGGGAGAAGGATAAAGCCAGCAAAGCTCGACTTATAGAGGTGC 1546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 AACTTCACGCCTTGGAAAGGGAGAAGGATAAAGCCAGCAAAGCTCGACTTATAGAGGTGC 1558
Query 1547 GGAAAGAGCTTGATGACCTGAGAGACAAGCTTCAGCCACTCACGATGAAATACAGAAAGG 1606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 GGAAAGAGCTTGATGACCTGAGAGACAAGCTTCAGCCTCTCACGATGAAATACAGAAAGG 1618
Query 1607 AGAAAGAGAGAATTGATGAGATTCGAAGGCTTAAACAGAAAAGGGAAGAGCTCATGTTTT 1666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1619 AGAAAGAGAGAATTGATGAGATTCGAAGGCTTAAACAGAAAAGAGAAGAGCTCATGTTTT 1678
Query 1667 CTTTGCAGGAGGCAGAACGAAGATATGACCTTGCAAGAGCTGCTGATCTAAGATATGGGG 1726
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1679 CTTTGCAGGAGGCAGAACGAAGATATGACCTTGCAAGAGCTGCTGATCTAAGATATGGCG 1738
Query 1727 CAATTCAAGAAGTGGAATCTGCAATTGCCCAACTTGAAGGAACTTCTTCTGAAGAGAATG 1786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 CAATTCAAGAAGTGGAATCTGCAATTGCCCAACTTGAAGGAACTTCTTCTGAAGAGAATG 1798
Query 1787 TGATGCTTACAGAAAACGTTGGGCCGGAACATATTGCTGAGGTTGTGAGCCGTTGGACGG 1846
||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1799 TGATGCTCACAGAAAACGTTGGGCCTGAACACATTGCTGAGGTTGTGAGCCGTTGGACAG 1858
Query 1847 GGATTCCAGTTACGAGACTCGGCCAAAATGAGAAGGAGAGGTTGATTGGTCTTGCTGATA 1906
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 GGATTCCAGTGACGAGACTTGGCCAAAATGAGAAGGAGAGGTTGATTGGTCTTGCTGATA 1918
Query 1907 GGTTGCACAAGAGGGTTGTGGGACAGAATCAAGCGGTAAATGCAGTTTCTGAGGCTATTC 1966
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1919 GGTTGCATAAGCGGGTTGTGGGACAGAATCAAGCGGTAAATGCAGTTTCTGAGGCAATTC 1978
Query 1967 TAAGGTCAAGGGCAGGACTTGGAAGGCCACAACAGCCAACTGGATCATTCTTATTTCTTG 2026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1979 TAAGGTCAAGGGCAGGACTTGGAAGGCCACAACAGCCAACTGGATCATTCTTATTCCTTG 2038
Query 2027 GACCAACTGGTGTTGGCAAAACTGAGCTCGCCAAGGCTCTTGCTGAGCAGCTGTTTGATG 2086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 GACCAACTGGTGTTGGCAAAACTGAGCTCGCCAAGGCTCTTGCTGAGCAGCTGTTTGATG 2098
Query 2087 ATGAAAACCTCTTAGTTCGGATTGATATGTCGGAATATATGGAACAACACTCTGTTTCTC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2099 ATGAAAACCTCTTAGTTCGGATTGATATGTCGGAATATATGGAACAACACTCTGTCTCTC 2158
Query 2147 GCCTCATTGGGGCACCACCTGGGTATGTTGGTCACGAGGAAGGTGGACAACTAACTGAGG 2206
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 GCCTCATTGGGGCACCACCAGGGTATGTTGGTCACGAGGAAGGTGGACAACTAACTGAGG 2218
Query 2207 CTGTGAGGAGGCGACCCTATTGTGTCATACTCTTTGATGAAGTGGAGAAGGCTCATGTTG 2266
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 CTGTGAGGAGGCGACCTTATTGTGTCATACTCTTTGATGAAGTGGAGAAGGCTCATGTTG 2278
Query 2267 CTGTCTTCAACACTCTGCTCCAAGTGTTGGATGACGGTCGATTGACAGACGGGCAAGGCA 2326
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2279 CTGTCTTCAACACTCTGCTCCAAGTTTTGGATGATGGTCGATTGACAGACGGGCAAGGCA 2338
Query 2327 GGACAGTCGATTTCAGGAACTCGGTGATAATCATGACATCAAACCTTGGTGCCGAGCACC 2386
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 2339 GGACAGTCGATTTCAGGAACTCGGTGATAATCATGACATCAAACCTTGGTGCTGAACACC 2398
Query 2387 TCCTTTCAGGGCTAACTGGGAAAGTAACAATGGAAGTGGCTCGGGAATGTGTGATGCGGG 2446
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 2399 TCCTTGCAGGGCTAACTGGGAAAGTAACAATGGAAGTGGCCCGGGACTGTGTGATGCGGG 2458
Query 2447 AGGTGAGGAAACACTTCAGACCAGAGCTCTTGAACAGGCTTGACGAGATTGTGGTGTTCG 2506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459 AGGTGAGGAAACACTTCAGACCAGAGCTCTTGAACAGGCTTGACGAGATTGTGGTGTTCG 2518
Query 2507 ATCCCCTTTCACATGACCAGTTGAGGAAAGTAGCCCGGCTTCAAATGAAAGACGTTGCTG 2566
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 ACCCCCTTTCACATGACCAGTTGAGGAAAGTAGCTCGGCTTCAAATGAAAGACGTTGCTG 2578
Query 2567 TCCGGCTTGCCGAAAGAGGAGTTGCTTTGGCAGTCACTGATGCTGCTTTGGACTATATTT 2626
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2579 TCCGGCTTGCTGAAAGAGGAGTTGCTTTGGCAGTCACTGATGCTGCTTTGGACTATATCT 2638
Query 2627 TGGCAGAGAGTTATGACCCGGTGTATGGAGCCAGGCCTATAAGGAGATGGATGGAGAAGA 2686
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639 TGGCAGAGAGTTATGACCCGGTGTATGGTGCTAGGCCTATAAGGAGATGGATGGAGAAGA 2698
Query 2687 AGGTGGTGACAGAACTGTCAAAGATGGTTGTGCGTGAGGAAATCGATGAAAACTCCACTG 2746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2699 AGGTGGTGACAGAACTGTCAAAGATGGTTGTGCGTGAGGAAATCGATGAAAACTCCACTG 2758
Query 2747 TTTACATAGATGCAGGCGCTGGTGGATCTGATCTTGTGTACCGGGTAGAAAGTGGAGGTC 2806
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2759 TTTACATAGATGCAGGCGC---TGG---TGATCTTGTGTACCGGGTAGAAAGTGGAGGTC 2812
Query 2807 TAGTGGACGCTTCAACAGGGAAGAAGTCGGATGTGCTAATTCATATTGCTAACGGGCCAA 2866
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TAGTGGACGCTTCAACAGGCAAGAAGTCAGATGTGCTGATTCATATTGCTAACGGGCCAA 2872
Query 2867 AGAGAAGTGATGCAGCTCAGGCGGTGAAAAAGATGAGGATCGAGGAAAT---AGAT---G 2920
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 2873 AGAGAAGTGATGCAGCTCAGGCGGTGAAGAAGATGAGGATCGAGGAAATAGAAGATGACG 2932
Query 2921 ATGATGAGGAAATGGTGGAGGATTAAAGTCTTGA----C--C-TTT-AGGGC-CTCCA-A 2970
|| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | | ||| || | | |
Sbjct 2933 ATAATGAGGAAATGATCGAGGATTAAAGTCTTGACCTCCAACGTTTGAGTTCTTTTGAGG 2992
Query 2971 CGTT-T-A----A-GAGTT---CTTT--TGAGGTGTTGT-G-TTTG--TCTTTTGGTAGA 3014
||| | | | || || |||| || |||| | | |||| ||||||||||||
Sbjct 2993 TGTTGTGATTGTATGACTTGAGCTTTCATGCTCTGTTTTGGTTTTGACTCTTTTGGTAGA 3052
Query 3015 CTATAATGGTGTGGAACTGTAAAAAAGTCTACTTTTTATTATGTTTTCGTATATGTAAAC 3074
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3053 CTATAATGGTGTGGAACTGTAAAAAAGTCTACTTT--ATTATGTTTTCGTATATGTAAAT 3110
Query 3075 CATTTTACATAAGAAATCTATTGTAC--CC-ATAATCTTTTAGGCTTTTTT 3122
|||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| || ||||||
Sbjct 3111 CATTTTACATAAGAAATCCATTGTACGTCCCATAATCTTTTGGGGTTTTTT 3161
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 155266688585
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5