BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg477628

Length=2596
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT3G03780.1 | Symbols: ATMS2, MS2 | methionine synthase 2 | chr...  4362    0.0  
  AT5G17920.1 | Symbols: ATCIMS, ATMETS, ATMS1 | Cobalamin-indepe...  2761    0.0  


> AT3G03780.1 | Symbols: ATMS2, MS2 | methionine synthase 2 | chr3:957235-960980 
FORWARD LENGTH=2617
Length=2617

 Score = 4362 bits (2362),  Expect = 0.0
 Identities = 2502/2569 (97%), Gaps = 12/2569 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  34    GTACaaaaaa-aaaaaaGAATCAAAAATGGCTTCCCACATTGTTGGATATCCACGTATGG  92
             ||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  55    GTA-AAAAAACAAAAAACAAACAAAAATGGCTTCCCACATTGTTGGATATCCACGTATGG  113

Query  93    GACCTAAGAGAGAGCTCAAGTTTGCATTGGAGTCTTTCTGGGATGGCAAGAGCAGTGCCG  152
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  114   GACCTAAGAGAGAGCTCAAGTTTGCATTGGAGTCTTTCTGGGATGGCAAGAGCAGTGCCG  173

Query  153   AGGATTTGCAGAAGGTGTCTGCTGATCTAAGGTCTGATATCTGGAAACAGATGTCTGCTG  212
             | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174   ATGATTTGCAGAAGGTGTCTGCTGATCTCAGGTCTGATATCTGGAAACAGATGTCTGCTG  233

Query  213   CTGGGATTAAGTATATCCCAAGCAACACCTTTTCTCATTATGACCAGGTGCTTGACACCA  272
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  234   CTGGGATTAAGTATATCCCAAGCAACACCTTTTCTCATTATGACCAGGTGCTTGACACCA  293

Query  273   CCGCCATGCTTGGTGCTGTTCCACCTAGATATGGATTTACTAGTGGTGAGATCGGTCTCG  332
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  294   CCGCCATGCTTGGTGCTGTTCCATCTAGATATGGATTTACCAGTGGTGAGATCGGTCTCG  353

Query  333   ATGTTTACTTCTCCATGGCTAGAGGAAATGCCTCTGTTCCAGCTATGGAGATGACCAAGT  392
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  354   ATGTTTACTTCTCCATGGCTAGAGGAAATGCCTCTGTTCCAGCTATGGAGATGACCAAGT  413

Query  393   GGTTTGACACCAACTACCATTACATCGTCCCAGAGTTGGGCCCTGAAGTGAAATTCTCTT  452
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  414   GGTTTGACACCAACTACCATTACATCGTCCCAGAGTTGGGCCCTGAAGTGAAATTTTCTT  473

Query  453   ACGCATCTCACAAGGCTGTGAATGAGTACAAGGAGGCTAAGGCTCTTGGTGTTGAGACGG  512
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct  474   ACGCATCTCACAAGGCTGTCAATGAGTACAAGGAGGCCAAGGCTCTTGGTGTTGAGACCG  533

Query  513   TCCCTGTACTTGTTGGCCCTGTCTCTTACTTGCTTCTTTCCAAGCTTGCTAAGGGTGTTG  572
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  534   TCCCTGTACTTGTTGGCCCTGTCTCTTACTTGCTTCTTTCCAAGCTTGCTAAGGGTGTTG  593

Query  573   ACAAGTCATTTGATCTTCTCTCCCTTCTCCCCAAAATTCTCCCAGTCTACAAGGAAGTCA  632
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct  594   ACAAGTCATTTGATCTTCTCTCCCTTCTCCCCAAAATCCTCCCAGTTTACAAGGAAGTCA  653

Query  633   TTGCAGAACTTAAGGCAGCTGGTGCCTCTTGGATTCAGCTTGATGAGCCTCTCTTTGTCA  692
             ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654   TTGCAGAGCTTAAGGCAGCTGGTGCCTCCTGGATTCAGCTTGATGAGCCTCTCTTTGTCA  713

Query  693   TGGATCTTGAGGGTCAAAAACTCCAGGCTTTTAGCGGTGCCTATGCTGAGCTTGAATCAA  752
             ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714   TGGATCTCGAGGGTCACAAACTCCAGGCTTTTAGCGGTGCCTATGCTGAGCTTGAATCAA  773

Query  753   CTCTCTCTGGTCTGAATGTTCTTGTGGAGACCTACTTTGCTGATATCCCTGCTGAAGCAT  812
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  774   CTCTCTCTGGTCTGAATGTTCTTGTGGAGACCTACTTCGCTGATATCCCTGCTGAAGCAT  833

Query  813   ACAAGACTCTTACTTCCTTGAAGGGTGTGACTGCCTTTGGATTTGATTTGGTTCGTGGTA  872
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct  834   ACAAGACCCTTACTTCCTTGAAGGGTGTGACTGCCTTCGGATTTGATTTGGTTCGTGGCA  893

Query  873   CCAAGACCATTGACTTGATCAAGGCTGGTTTCCCCCAGGGCAAGTACCTCTTTGCTGGTG  932
             ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  894   CCAAGACCATTGACTTGATCAAGTCAGGTTTCCCACAGGGCAAGTACCTCTTTGCTGGTG  953

Query  933   TTGTTGACGGAAGGAACATCTGGGCCAATGACCTCGCTGCCTCTCTCATCACCTTGCAGT  992
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954   TTGTTGACGGAAGGAACATCTGGGCCAATGACCTCGCTGCCTCTCTCATCACCTTGCAGT  1013

Query  993   CACTTGAGGGTGTTGTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCTTGCTCTCTTCTCC  1052
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1014  CACTTGAGGGTGTTGTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCTTGCTCTCTTCTCC  1073

Query  1053  ACACTGCCGTTGACCTTGTTAACGAGACTAAGCTTGATGCTGAAATCAAGTCGTGGCTAG  1112
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1074  ACACTGCCGTTGACCTTATTAACGAGACTAAGCTTGATGCTGAAATCAAGTCGTGGCTAG  1133

Query  1113  CTTTTGCCGCCCAGAAGGTTGTTGAAGTTGACGCATTGGCCAAGGCTTTAGCCGGTCAGA  1172
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  1134  CTTTTGCTGCCCAGAAGGTTGTTGAAGTTGACGCATTGGCCAAGGCTTTGGCCGGTCAGA  1193

Query  1173  CGAATGAGAGTTTCTTCACTGCCAACGCTGATGCTTTGTCTTCGAGGAGGTCTTCCCCAA  1232
             | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1194  CAAATGAGAGTTTCTTCACTGCCAACGCTGACGCATTGTCTTCGAGGAGGTCTTCCCCAA  1253

Query  1233  GAGTCACTAATGAGGCTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTGAAGGGGTCTGACCACCGCC  1292
             ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  1254  GAGTCACCAATGAGTCTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTGAAGGGATCTGACCACCGCC  1313

Query  1293  GTACAACCGAAGTTAGCGCAAGGCTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTTAACCTTCCAATCC  1352
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1314  GTACAACTGAAGTTAGCGCAAGGCTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTTAACCTTCCAATCC  1373

Query  1353  TCCCAACCACCACCATTGGATCCTTCCCACAGACCGTGGAACTCAGGAGAGTTCGCCGTG  1412
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1374  TCCCAACCACAACCATTGGATCCTTCCCACAGACCGTGGAACTCAGGAGAGTTCGCCGTG  1433

Query  1413  AATACAAGGCGAAGAAAATCTCTGAAGAGGATTACGTCAAGGCCATCAAGGAAGAGATCA  1472
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1434  AATACAAGGCCAAGAAAATCTCTGAAGAGGATTACGTCAAGGCCATCAAGGAAGAGATCA  1493

Query  1473  AGAAAGTTGTTGACATCCAAGAGGACCTTGACATTGATGTTCTTGTTCACGGAGAGCCTG  1532
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1494  AGAAAGTTGTTGACATCCAAGAGGACCTTGACATTGATGTTCTTGTTCACGGAGAGCCTG  1553

Query  1533  AGAGAAACGATATGGTTGAGTACTTTGGAGAGCAATTGTCAGGTTTCGCATTCACAGCAA  1592
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1554  AGAGAAACGACATGGTTGAGTACTTTGGAGAGCAATTGTCAGGTTTCGCATTCACAGCAA  1613

Query  1593  ATGGGTGGGTGCAATCCTATGGATCTCGCTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTACGGTGACG  1652
             | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1614  ACGGATGGGTGCAATCCTATGGATCTCGCTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTATGGTGACG  1673

Query  1653  TGAGCCGCCCCAAGCCAATGACAGTCTTCTGGTCCTCAACAGCTCAGAGCATGACCAAAC  1712
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1674  TGAGCCGCCCCAAGCCAATGACAGTCTTCTGGTCCTCAACAGCTCAGAGCATGACCAAAC  1733

Query  1713  GTCCAATGAAGGGAATGCTTACAGGTCCAGTCACAATTCTTAACTGGTCTTTTGTTAGAA  1772
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct  1734  GTCCAATGAAGGGTATGCTTACAGGTCCAGTCACAATTCTCAACTGGTCTTTTGTCAGAA  1793

Query  1773  ACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAAGACGAAGTGG  1832
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1794  ACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAAGATGAAGTGG  1853

Query  1833  AAGACCTCGAGAAAGGCGGTATTGGAGTCATTCAGATCGATGAAGCCGCACTCAGAGAAG  1892
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1854  AAGACCTCGAGAAAGGCGGTATTGGAGTCATTCAGATCGATGAAGCCGCACTTAGAGAAG  1913

Query  1893  GATTGCCTCTTAGGAAAGCCGAACACTCTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCTTTCA  1952
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1914  GATTGCCTCTTAGGAAAGCCGAACACTCTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCTTTCA  1973

Query  1953  GAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACAGCACTCAGATTCACACTCACATGTGTTACTCAA  2012
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1974  GAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACAGCACTCAGATTCACACTCACATGTGTTACTCAA  2033

Query  2013  ACTTCAATGACATCATCCACTCAATCATCGACATGGACGCTGATGTCATCACCATTGAGA  2072
             ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2034  ACTTCAACGACATCATCCACTCAATCATTGACATGGACGCTGATGTCATCACCATTGAGA  2093

Query  2073  ACTCTCGTTCAGACGAGAAGCTTCTATCAGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGTGCAG  2132
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2094  ACTCTCGTTCAGACGAGAAGCTTCTCTCAGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGTGCAG  2153

Query  2133  GAATCGGTCCTGGTGTTTACGACATTCACTCTCCAAGAATACCATCCACAGAAGAAATTG  2192
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  2154  GAATCGGTCCTGGTGTTTACGACATTCACTCTCCGAGAATACCATCCACAGATGAAATTG  2213

Query  2193  CAGACAGGATCAACAAGATGCTTGCGGTTCTTGAGCAGAACATCTTGTGGGTTAACCCTG  2252
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2214  CAGACAGGATCAACAAGATGCTTGCGGTTCTTGAGCAGAACATCTTGTGGGTTAACCCTG  2273

Query  2253  ACTGTGGTCTGAAGACAAGGAAGTACACTGAGGTTAAACCAGCACTTAAAGCCATGGTTG  2312
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2274  ACTGTGGTCTGAAGACAAGGAAGTACACTGAGGTTAAACCAGCACTTAAAGCCATGGTTG  2333

Query  2313  ACGCGGCTAAGCTTATCCGCTCCCAGCTCGCTAGTGCCAAGTGAAGAACTTGAAGATATC  2372
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| 
Sbjct  2334  ACGCGGCTAAGCTTATCCGCTCCCAGCTCGGTAGTGCCAAGTGAAGAGCTTGAAGATATT  2393

Query  2373  ATTTCTAT-TTCCGGGATTTTTATACGTGGTTTGTGTTTGTTCAGTTTCAATAACTTTTC  2431
             |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2394  ATTTCTATATTCCGGGATTTTTCTACGTGGTTTGTGTTTGTTCAGTTTCAATAACTTTTC  2453

Query  2432  TTCCAAGAAAAATATTTTTAGCCAAAGTTAGGTTTTGAGGGAATGGAGTCACACTCTCTC  2491
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2454  TTCCAAGAAAAATATTTT-AGCCAAAGTTAGGTTTTGAGGGAATGGAGTCACACTCTCTC  2512

Query  2492  GCTTTCGTTGAAGAGAGTTTATGGCTTTCAT-CTTATAT-TCTTCTTTTGTTGCAATGTT  2549
             ||||||||||||||||||||| |||||| || || |||| | |||| |||||||||||||
Sbjct  2513  GCTTTCGTTGAAGAGAGTTTACGGCTTT-ATACT-ATATGT-TTCTCTTGTTGCAATGTT  2569

Query  2550  ATATGTATCTTTGTTTTCTCTTAATGAAATAT--GCTTCTTTGATCTCT  2596
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||
Sbjct  2570  ATATGTATCTTTGTTTTCTCT-AATGAAATATATGCTTCTTTGATCTCT  2617


> AT5G17920.1 | Symbols: ATCIMS, ATMETS, ATMS1 | Cobalamin-independent 
synthase family protein | chr5:5935038-5939487 FORWARD 
LENGTH=2771
Length=2771

 Score = 2761 bits (1495),  Expect = 0.0
 Identities = 2060/2334 (88%), Gaps = 34/2334 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  43    aaaaaaaGAATCAAAAATGGCTTCCCACATTGTTGGATATCCACGTATGGGACCTAAGAG  102
             |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct  168   AAAAGAA-AATC-AAAATGGCTTCACACATTGTTGGATACCCACGTATGGGCCCTAAGAG  225

Query  103   AGAGCTCAAGTTTGCATTGGAGTCTTTCTGGGATGGCAAGAGCAGTGCCGAGGAT-TTGC  161
             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |
Sbjct  226   AGAGCTCAAGTTTGCATTGGAATCTTTCTGGGATGGTAAGAGCACTGCTGAGGATCTT-C  284

Query  162   AGAAGGTGTCTGCTGATCTAAGGTCTGAT--ATCTGGAAACAGATGTCTGCTGCTGGGAT  219
             ||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||||| 
Sbjct  285   AGAAGGTGTCTGCTGATCTCAGGTC--ATCCATCTGGAAACAGATGTCTGCCGCTGGGAC  342

Query  220   TAAGTAT-ATCCCAAGCAACACCTTTTCTCATTATGACCAGGTGCTTGACACCACCGCCA  278
             ||||| | ||||| |||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  343   TAAGT-TCATCCCTAGCAACACCTTTGCTCACTACGACCAGGTTCTTGACACCACCGCCA  401

Query  279   TGCTTGGTGCTGTTCCACCTAGATATGGATTTACTAGTGGTGAGATCGGTCTCGATGTTT  338
             |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| || |||||||
Sbjct  402   TGCTCGGTGCTGTTCCACCTAGGTATGGATACACTGGTGGTGAGATCGGCCTTGATGTTT  461

Query  339   ACTTCTCCATGGCTAGAGGAAATGCCTCTGTTCCAGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTG  398
             ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |
Sbjct  462   ACTTCTCCATGGCTAGAGGAAATGCCTCTGTGCCTGCCATGGAAATGACCAAGTGGTTCG  521

Query  399   ACACCAACTACCATTACATCGTCCCAGAGTTGGGCCCTGAAGTGAAATTCTCTTACGCAT  458
             ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||
Sbjct  522   ACACCAACTACCATTACATCGTCCCTGAGTTGGGCCCTGAGGTTAACTTCTCTTACGCAT  581

Query  459   CTCACAAGGCTGTGAATGAGTACAAGGAGGCTAAGGCTCTTGGTGTTGAGACGGTCCCTG  518
             | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct  582   CCCACAAGGCGGTGAATGAGTACAAGGAGGCCAAGGCTCTTGGTGTTGACACCGTCCCTG  641

Query  519   TACTTGTTGGCCCTGTCTCTTACTTGCTTCTTTCCAA-GCTTGCTAAGGGTGTTGACAAG  577
             ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||
Sbjct  642   TACTTGTTGGCCCAGTCTCTTACTTGCTGCTTTCCAAGGC-TGCCAAGGGTGTTGACAAG  700

Query  578   TCATTTGATCTTCTCTCCCTTCTCCCCAAAATTCTCCCAG-TCTACAAGGAAGTCATTGC  636
             ||||| || ||||| || |||||||| || |||||||| | ||||||||||||| ||| |
Sbjct  701   TCATTCGAACTTCTTTCTCTTCTCCCTAAGATTCTCCC-GATCTACAAGGAAGTGATTAC  759

Query  637   AGAACTTAAGGCAGCTGGTGCCTCTTGGATTCAGCTTGATGAGCCTCTCTTTGTCATGGA  696
              || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||| |||||
Sbjct  760   CGAGCTTAAGGCTGCTGGTGCCACCTGGATTCAGCTTGACGAGCCTGTCCTTGTTATGGA  819

Query  697   TCTTGAGGGTCAAAAACTCCAGGCTTTTAGC-GGTGCCTATGCTGAGCTTGAATCAACTC  755
             |||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  820   TCTTGAGGGTCAGAAACTCCAGGCCTTTA-CTGGTGCCTATGCTGAACTTGAATCAACTC  878

Query  756   TCTCTGGTCTGAATGTTCTTGTGGAGACCTACTTTGCTGATATCCCTGCTGAAGCATACA  815
             | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  879   TTTCTGGTTTGAATGTTCTTGTCGAGACCTACTTCGCTGATATCCCTGCTGAGGCATACA  938

Query  816   AGACTCTTACTTCCTTGAAGGGTGTGACTGCCTTTGGATTTGATTTGGTTCGTGGTACCA  875
             |||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  939   AGACCCTAACCTCATTGAAGGGTGTGACTGCCTTTGGATTTGATTTGGTTCGTGGCACCA  998

Query  876   AGACCATTGACTTGATCAAGGCTGGTTTCCCCCAGGGCAAGTACCTCTTTGCTGGTGTTG  935
             ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  999   AGACCCTTGATTTGGTCAAGGCAGGTTTCCCTGAGGGAAAGTACCTCTTTGCTGGTGTTG  1058

Query  936   TTGACGGAAGGAACATCTGGGCCAATGACCTCGCTGCCTCTCTCATCACCTTGCAGTCAC  995
             |||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || | |||||||||| |||
Sbjct  1059  TTGATGGAAGGAACATCTGGGCCAACGACTTTGCTGCGTCCCTAAGCACCTTGCAGGCAC  1118

Query  996   TTGAGGGTGTTGTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCTTGCTCTCTTCTCCACA  1055
             |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1119  TTGAAGGCATTGTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCCTGCTCTCTTCTCCACA  1178

Query  1056  CTGCCGTTGACCTTGTTAACGAGACTAAGCTTGATGCTGAAATCAAGTCGTGGCTAGCTT  1115
             | || ||||| ||| | || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || |
Sbjct  1179  CCGCTGTTGATCTTATCAATGAGACTAAGCTTGATGATGAAATCAAGTCATGGTTGGCGT  1238

Query  1116  TTGCCGCCCAGAAGGTTGTTGAAGTTG-ACGCATTGGCCAAGGCTTTAGCCGGTCAGACG  1174
             |||| ||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||| |
Sbjct  1239  TTGCTGCCCAGAAGGTCGTTGAAG-TGAACGCTTTGGCCAAGGCTTTGGCTGGTCAGAAG  1297

Query  1175  AATGAGAG-T-TTCTTCACTGCCAACGCTGATGCTTTGTCTTCGAGGAGGTCTTCCCCAA  1232
              | ||| | | || ||| ||||||| ||||  |||||| |||| ||||| ||||||||||
Sbjct  1298  GACGAG-GCTCTT-TTCTCTGCCAATGCTGCGGCTTTGGCTTCAAGGAGATCTTCCCCAA  1355

Query  1233  GAGTCACTAATGAGGCTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTGAAGGGGTCTGACCACCGCC  1292
             ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct  1356  GAGTCACCAACGAGGGTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTGAAGGGATCTGACCACCGTC  1415

Query  1293  GTACAACCGAA-GTTAGCGCAAGGCTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTTAACCTTCCAATC  1351
             || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||
Sbjct  1416  GTGCAACC-AATGTTAGTGCTAGGCTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTCAATCTCCCAATC  1474

Query  1352  CTCCCAACCACCACCATTGGATCCTTCCCACAGACCGTGGAACTCAGGAGAGTTCGCCGT  1411
             || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||
Sbjct  1475  CTACCAACCACAACCATTGGATCCTTCCCACAGACTGTAGAGCTCAGGAGAGTTCGTCGT  1534

Query  1412  GAATACAAGGCGAAGAAA-ATCTCTGAAGAGGATTACGTCAAGGCCATCAAGGAAGAGAT  1470
             || |||||||| || |||  |||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||
Sbjct  1535  GAGTACAAGGCCAA-AAAGGTCTCAGAGGAGGACTACGTTAAAGCCATCAAGGAAGAGAT  1593

Query  1471  CAAGAAAGTTGTTGACATCCAAGAGGACCTTGACATTGATGTTCTTGTTCACGGAGAGCC  1530
             |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1594  CAAGAAAGTTGTTGACCTCCAAGAGGAACTTGACATCGATGTTCTTGTCCACGGAGAGCC  1653

Query  1531  TGAGAGAAACGATATGGTTGAGTACTTTGGAGAGCAATTGTCAGGTTTCGCATTCACAGC  1590
              ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||
Sbjct  1654  AGAGAGAAACGACATGGTTGAGTACTTTGGTGAGCAGTTGTCTGGTTTTGCCTTCACTGC  1713

Query  1591  AAATGGGTGGGTGCAATCCTATGGATCTCGCTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTACGGTGA  1650
             ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1714  AAACGGATGGGTCCAATCTTATGGATCTCGCTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTATGGTGA  1773

Query  1651  CGTGAGCCGCCCCAAGCCAATGACAGTCTTCTGGTCCTCAACAGCTCAGAGCATGACCAA  1710
              |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||  
Sbjct  1774  TGTGAGCCGTCCCAAGGCAATGACCGTCTTCTGGTCCGCAATGGCTCAGAGCATGACCTC  1833

Query  1711  ACGTCCAATGAAGGGAATGCTTACAGGTCCAGTCACAATTCTTAACTGGTCTTTTGTTAG  1770
              || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct  1834  TCGCCCAATGAAGGGTATGCTTACTGGTCCCGTCACCATTCTCAACTGGTCCTTTGTCAG  1893

Query  1771  AAACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAAGACGAAGT  1830
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  1894  GAACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAGGACGAAGT  1953

Query  1831  GGAAGACCTCGAGAAAGGCGGTATTGGAGTCATTCAGATCGATGAAGCCGCACTCAGAGA  1890
              || || || |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||
Sbjct  1954  CGAGGATCTTGAGAAAGGTGGAATCGGTGTCATTCAGATTGATGAGGCTGCACTTAGAGA  2013

Query  1891  AGGATTGCCTCTTAGGAAAGCCGAACACT-CTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCTT  1949
             |||| | || || |||||| |||| || | ||||||||||||||||||| || ||||| |
Sbjct  2014  AGGACTACCACTCAGGAAATCCGAGCA-TGCTTTCTACTTGGACTGGGCCGTCCACTCCT  2072

Query  1950  TCAGAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACAGCACTCAGATTCACACTCACATGTGTTACT  2009
             ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct  2073  TCAGAATCACCAACTGTGGAGTCCAAGACAGCACCCAGATCCACACTCACATGTGCTACT  2132

Query  2010  CAAACTTCAATGACATCATCCACTCAATCATCGACATGGACGCTGATGTCATCACCATTG  2069
             |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  2133  CCCACTTCAATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGATGCTGATGTCATCACCATTG  2192

Query  2070  AGAACTCTC-GTTCAGACGAGAAGCTTCTATCAGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGT  2128
             ||||||| | | || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2193  AGAACTC-CAGGTCTGATGAGAAGCTTCTTTCCGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGT  2251

Query  2129  GCAGGAATCGGTCCTGGTGTTTACGACATTCACTCTCCAAGAATACCATCCACAGAAGAA  2188
             || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||
Sbjct  2252  GCTGGAATCGGTCCAGGAGTCTACGACATCCACTCTCCAAGAATACCATCTTCTGAGGAA  2311

Query  2189  ATTGCAGACAGGATCAACAAGATGCTTGCGGTTCTTGAGCAGAACATC-TTGTGGGTTAA  2247
             || ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||| || ||||||||
Sbjct  2312  ATCGCAGACAGGGTCAACAAGATGCTTGCTGTCCTAGAGCAGAACATCCTT-TGGGTTAA  2370

Query  2248  CCCTGACTGTGGTCTGAAGACAAGGAAGTACACTGAGGTTAAACCAGCACTTAA-AGCCA  2306
             ||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| || || ||||| || | | |
Sbjct  2371  CCCTGACTGTGGTCTCAAGACCCGTAAGTACACCGAGGTCAAGCCTGCACTCAAGAAC-A  2429

Query  2307  TGGTTGACGCGGCTAAGCTTATCCGCTCCCAGCTCGCTAGTGCCAAGTGAAGAA  2360
             ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  2430  TGGTTGATGCGGCTAAGCTCATCCGCTCCCAGCTCGCCAGTGCCAAGTGAAGAA  2483



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 128878876567


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5