BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg477628 Length=2596 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G03780.1 | Symbols: ATMS2, MS2 | methionine synthase 2 | chr... 4362 0.0 AT5G17920.1 | Symbols: ATCIMS, ATMETS, ATMS1 | Cobalamin-indepe... 2761 0.0 > AT3G03780.1 | Symbols: ATMS2, MS2 | methionine synthase 2 | chr3:957235-960980 FORWARD LENGTH=2617 Length=2617 Score = 4362 bits (2362), Expect = 0.0 Identities = 2502/2569 (97%), Gaps = 12/2569 (0%) Strand=Plus/Plus Query 34 GTACaaaaaa-aaaaaaGAATCAAAAATGGCTTCCCACATTGTTGGATATCCACGTATGG 92 ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 55 GTA-AAAAAACAAAAAACAAACAAAAATGGCTTCCCACATTGTTGGATATCCACGTATGG 113 Query 93 GACCTAAGAGAGAGCTCAAGTTTGCATTGGAGTCTTTCTGGGATGGCAAGAGCAGTGCCG 152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 114 GACCTAAGAGAGAGCTCAAGTTTGCATTGGAGTCTTTCTGGGATGGCAAGAGCAGTGCCG 173 Query 153 AGGATTTGCAGAAGGTGTCTGCTGATCTAAGGTCTGATATCTGGAAACAGATGTCTGCTG 212 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 174 ATGATTTGCAGAAGGTGTCTGCTGATCTCAGGTCTGATATCTGGAAACAGATGTCTGCTG 233 Query 213 CTGGGATTAAGTATATCCCAAGCAACACCTTTTCTCATTATGACCAGGTGCTTGACACCA 272 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 234 CTGGGATTAAGTATATCCCAAGCAACACCTTTTCTCATTATGACCAGGTGCTTGACACCA 293 Query 273 CCGCCATGCTTGGTGCTGTTCCACCTAGATATGGATTTACTAGTGGTGAGATCGGTCTCG 332 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 294 CCGCCATGCTTGGTGCTGTTCCATCTAGATATGGATTTACCAGTGGTGAGATCGGTCTCG 353 Query 333 ATGTTTACTTCTCCATGGCTAGAGGAAATGCCTCTGTTCCAGCTATGGAGATGACCAAGT 392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 354 ATGTTTACTTCTCCATGGCTAGAGGAAATGCCTCTGTTCCAGCTATGGAGATGACCAAGT 413 Query 393 GGTTTGACACCAACTACCATTACATCGTCCCAGAGTTGGGCCCTGAAGTGAAATTCTCTT 452 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 414 GGTTTGACACCAACTACCATTACATCGTCCCAGAGTTGGGCCCTGAAGTGAAATTTTCTT 473 Query 453 ACGCATCTCACAAGGCTGTGAATGAGTACAAGGAGGCTAAGGCTCTTGGTGTTGAGACGG 512 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct 474 ACGCATCTCACAAGGCTGTCAATGAGTACAAGGAGGCCAAGGCTCTTGGTGTTGAGACCG 533 Query 513 TCCCTGTACTTGTTGGCCCTGTCTCTTACTTGCTTCTTTCCAAGCTTGCTAAGGGTGTTG 572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 534 TCCCTGTACTTGTTGGCCCTGTCTCTTACTTGCTTCTTTCCAAGCTTGCTAAGGGTGTTG 593 Query 573 ACAAGTCATTTGATCTTCTCTCCCTTCTCCCCAAAATTCTCCCAGTCTACAAGGAAGTCA 632 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 594 ACAAGTCATTTGATCTTCTCTCCCTTCTCCCCAAAATCCTCCCAGTTTACAAGGAAGTCA 653 Query 633 TTGCAGAACTTAAGGCAGCTGGTGCCTCTTGGATTCAGCTTGATGAGCCTCTCTTTGTCA 692 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 654 TTGCAGAGCTTAAGGCAGCTGGTGCCTCCTGGATTCAGCTTGATGAGCCTCTCTTTGTCA 713 Query 693 TGGATCTTGAGGGTCAAAAACTCCAGGCTTTTAGCGGTGCCTATGCTGAGCTTGAATCAA 752 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 714 TGGATCTCGAGGGTCACAAACTCCAGGCTTTTAGCGGTGCCTATGCTGAGCTTGAATCAA 773 Query 753 CTCTCTCTGGTCTGAATGTTCTTGTGGAGACCTACTTTGCTGATATCCCTGCTGAAGCAT 812 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 774 CTCTCTCTGGTCTGAATGTTCTTGTGGAGACCTACTTCGCTGATATCCCTGCTGAAGCAT 833 Query 813 ACAAGACTCTTACTTCCTTGAAGGGTGTGACTGCCTTTGGATTTGATTTGGTTCGTGGTA 872 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct 834 ACAAGACCCTTACTTCCTTGAAGGGTGTGACTGCCTTCGGATTTGATTTGGTTCGTGGCA 893 Query 873 CCAAGACCATTGACTTGATCAAGGCTGGTTTCCCCCAGGGCAAGTACCTCTTTGCTGGTG 932 ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 894 CCAAGACCATTGACTTGATCAAGTCAGGTTTCCCACAGGGCAAGTACCTCTTTGCTGGTG 953 Query 933 TTGTTGACGGAAGGAACATCTGGGCCAATGACCTCGCTGCCTCTCTCATCACCTTGCAGT 992 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 954 TTGTTGACGGAAGGAACATCTGGGCCAATGACCTCGCTGCCTCTCTCATCACCTTGCAGT 1013 Query 993 CACTTGAGGGTGTTGTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCTTGCTCTCTTCTCC 1052 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1014 CACTTGAGGGTGTTGTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCTTGCTCTCTTCTCC 1073 Query 1053 ACACTGCCGTTGACCTTGTTAACGAGACTAAGCTTGATGCTGAAATCAAGTCGTGGCTAG 1112 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1074 ACACTGCCGTTGACCTTATTAACGAGACTAAGCTTGATGCTGAAATCAAGTCGTGGCTAG 1133 Query 1113 CTTTTGCCGCCCAGAAGGTTGTTGAAGTTGACGCATTGGCCAAGGCTTTAGCCGGTCAGA 1172 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1134 CTTTTGCTGCCCAGAAGGTTGTTGAAGTTGACGCATTGGCCAAGGCTTTGGCCGGTCAGA 1193 Query 1173 CGAATGAGAGTTTCTTCACTGCCAACGCTGATGCTTTGTCTTCGAGGAGGTCTTCCCCAA 1232 | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1194 CAAATGAGAGTTTCTTCACTGCCAACGCTGACGCATTGTCTTCGAGGAGGTCTTCCCCAA 1253 Query 1233 GAGTCACTAATGAGGCTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTGAAGGGGTCTGACCACCGCC 1292 ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1254 GAGTCACCAATGAGTCTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTGAAGGGATCTGACCACCGCC 1313 Query 1293 GTACAACCGAAGTTAGCGCAAGGCTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTTAACCTTCCAATCC 1352 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1314 GTACAACTGAAGTTAGCGCAAGGCTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTTAACCTTCCAATCC 1373 Query 1353 TCCCAACCACCACCATTGGATCCTTCCCACAGACCGTGGAACTCAGGAGAGTTCGCCGTG 1412 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1374 TCCCAACCACAACCATTGGATCCTTCCCACAGACCGTGGAACTCAGGAGAGTTCGCCGTG 1433 Query 1413 AATACAAGGCGAAGAAAATCTCTGAAGAGGATTACGTCAAGGCCATCAAGGAAGAGATCA 1472 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1434 AATACAAGGCCAAGAAAATCTCTGAAGAGGATTACGTCAAGGCCATCAAGGAAGAGATCA 1493 Query 1473 AGAAAGTTGTTGACATCCAAGAGGACCTTGACATTGATGTTCTTGTTCACGGAGAGCCTG 1532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1494 AGAAAGTTGTTGACATCCAAGAGGACCTTGACATTGATGTTCTTGTTCACGGAGAGCCTG 1553 Query 1533 AGAGAAACGATATGGTTGAGTACTTTGGAGAGCAATTGTCAGGTTTCGCATTCACAGCAA 1592 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1554 AGAGAAACGACATGGTTGAGTACTTTGGAGAGCAATTGTCAGGTTTCGCATTCACAGCAA 1613 Query 1593 ATGGGTGGGTGCAATCCTATGGATCTCGCTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTACGGTGACG 1652 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1614 ACGGATGGGTGCAATCCTATGGATCTCGCTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTATGGTGACG 1673 Query 1653 TGAGCCGCCCCAAGCCAATGACAGTCTTCTGGTCCTCAACAGCTCAGAGCATGACCAAAC 1712 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1674 TGAGCCGCCCCAAGCCAATGACAGTCTTCTGGTCCTCAACAGCTCAGAGCATGACCAAAC 1733 Query 1713 GTCCAATGAAGGGAATGCTTACAGGTCCAGTCACAATTCTTAACTGGTCTTTTGTTAGAA 1772 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 1734 GTCCAATGAAGGGTATGCTTACAGGTCCAGTCACAATTCTCAACTGGTCTTTTGTCAGAA 1793 Query 1773 ACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAAGACGAAGTGG 1832 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1794 ACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAAGATGAAGTGG 1853 Query 1833 AAGACCTCGAGAAAGGCGGTATTGGAGTCATTCAGATCGATGAAGCCGCACTCAGAGAAG 1892 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1854 AAGACCTCGAGAAAGGCGGTATTGGAGTCATTCAGATCGATGAAGCCGCACTTAGAGAAG 1913 Query 1893 GATTGCCTCTTAGGAAAGCCGAACACTCTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCTTTCA 1952 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1914 GATTGCCTCTTAGGAAAGCCGAACACTCTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCTTTCA 1973 Query 1953 GAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACAGCACTCAGATTCACACTCACATGTGTTACTCAA 2012 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1974 GAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACAGCACTCAGATTCACACTCACATGTGTTACTCAA 2033 Query 2013 ACTTCAATGACATCATCCACTCAATCATCGACATGGACGCTGATGTCATCACCATTGAGA 2072 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2034 ACTTCAACGACATCATCCACTCAATCATTGACATGGACGCTGATGTCATCACCATTGAGA 2093 Query 2073 ACTCTCGTTCAGACGAGAAGCTTCTATCAGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGTGCAG 2132 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2094 ACTCTCGTTCAGACGAGAAGCTTCTCTCAGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGTGCAG 2153 Query 2133 GAATCGGTCCTGGTGTTTACGACATTCACTCTCCAAGAATACCATCCACAGAAGAAATTG 2192 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2154 GAATCGGTCCTGGTGTTTACGACATTCACTCTCCGAGAATACCATCCACAGATGAAATTG 2213 Query 2193 CAGACAGGATCAACAAGATGCTTGCGGTTCTTGAGCAGAACATCTTGTGGGTTAACCCTG 2252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2214 CAGACAGGATCAACAAGATGCTTGCGGTTCTTGAGCAGAACATCTTGTGGGTTAACCCTG 2273 Query 2253 ACTGTGGTCTGAAGACAAGGAAGTACACTGAGGTTAAACCAGCACTTAAAGCCATGGTTG 2312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2274 ACTGTGGTCTGAAGACAAGGAAGTACACTGAGGTTAAACCAGCACTTAAAGCCATGGTTG 2333 Query 2313 ACGCGGCTAAGCTTATCCGCTCCCAGCTCGCTAGTGCCAAGTGAAGAACTTGAAGATATC 2372 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2334 ACGCGGCTAAGCTTATCCGCTCCCAGCTCGGTAGTGCCAAGTGAAGAGCTTGAAGATATT 2393 Query 2373 ATTTCTAT-TTCCGGGATTTTTATACGTGGTTTGTGTTTGTTCAGTTTCAATAACTTTTC 2431 |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2394 ATTTCTATATTCCGGGATTTTTCTACGTGGTTTGTGTTTGTTCAGTTTCAATAACTTTTC 2453 Query 2432 TTCCAAGAAAAATATTTTTAGCCAAAGTTAGGTTTTGAGGGAATGGAGTCACACTCTCTC 2491 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2454 TTCCAAGAAAAATATTTT-AGCCAAAGTTAGGTTTTGAGGGAATGGAGTCACACTCTCTC 2512 Query 2492 GCTTTCGTTGAAGAGAGTTTATGGCTTTCAT-CTTATAT-TCTTCTTTTGTTGCAATGTT 2549 ||||||||||||||||||||| |||||| || || |||| | |||| ||||||||||||| Sbjct 2513 GCTTTCGTTGAAGAGAGTTTACGGCTTT-ATACT-ATATGT-TTCTCTTGTTGCAATGTT 2569 Query 2550 ATATGTATCTTTGTTTTCTCTTAATGAAATAT--GCTTCTTTGATCTCT 2596 ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2570 ATATGTATCTTTGTTTTCTCT-AATGAAATATATGCTTCTTTGATCTCT 2617 > AT5G17920.1 | Symbols: ATCIMS, ATMETS, ATMS1 | Cobalamin-independent synthase family protein | chr5:5935038-5939487 FORWARD LENGTH=2771 Length=2771 Score = 2761 bits (1495), Expect = 0.0 Identities = 2060/2334 (88%), Gaps = 34/2334 (1%) Strand=Plus/Plus Query 43 aaaaaaaGAATCAAAAATGGCTTCCCACATTGTTGGATATCCACGTATGGGACCTAAGAG 102 |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 168 AAAAGAA-AATC-AAAATGGCTTCACACATTGTTGGATACCCACGTATGGGCCCTAAGAG 225 Query 103 AGAGCTCAAGTTTGCATTGGAGTCTTTCTGGGATGGCAAGAGCAGTGCCGAGGAT-TTGC 161 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || | Sbjct 226 AGAGCTCAAGTTTGCATTGGAATCTTTCTGGGATGGTAAGAGCACTGCTGAGGATCTT-C 284 Query 162 AGAAGGTGTCTGCTGATCTAAGGTCTGAT--ATCTGGAAACAGATGTCTGCTGCTGGGAT 219 ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 285 AGAAGGTGTCTGCTGATCTCAGGTC--ATCCATCTGGAAACAGATGTCTGCCGCTGGGAC 342 Query 220 TAAGTAT-ATCCCAAGCAACACCTTTTCTCATTATGACCAGGTGCTTGACACCACCGCCA 278 ||||| | ||||| |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 343 TAAGT-TCATCCCTAGCAACACCTTTGCTCACTACGACCAGGTTCTTGACACCACCGCCA 401 Query 279 TGCTTGGTGCTGTTCCACCTAGATATGGATTTACTAGTGGTGAGATCGGTCTCGATGTTT 338 |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| Sbjct 402 TGCTCGGTGCTGTTCCACCTAGGTATGGATACACTGGTGGTGAGATCGGCCTTGATGTTT 461 Query 339 ACTTCTCCATGGCTAGAGGAAATGCCTCTGTTCCAGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTG 398 ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| | Sbjct 462 ACTTCTCCATGGCTAGAGGAAATGCCTCTGTGCCTGCCATGGAAATGACCAAGTGGTTCG 521 Query 399 ACACCAACTACCATTACATCGTCCCAGAGTTGGGCCCTGAAGTGAAATTCTCTTACGCAT 458 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||| Sbjct 522 ACACCAACTACCATTACATCGTCCCTGAGTTGGGCCCTGAGGTTAACTTCTCTTACGCAT 581 Query 459 CTCACAAGGCTGTGAATGAGTACAAGGAGGCTAAGGCTCTTGGTGTTGAGACGGTCCCTG 518 | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 582 CCCACAAGGCGGTGAATGAGTACAAGGAGGCCAAGGCTCTTGGTGTTGACACCGTCCCTG 641 Query 519 TACTTGTTGGCCCTGTCTCTTACTTGCTTCTTTCCAA-GCTTGCTAAGGGTGTTGACAAG 577 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| Sbjct 642 TACTTGTTGGCCCAGTCTCTTACTTGCTGCTTTCCAAGGC-TGCCAAGGGTGTTGACAAG 700 Query 578 TCATTTGATCTTCTCTCCCTTCTCCCCAAAATTCTCCCAG-TCTACAAGGAAGTCATTGC 636 ||||| || ||||| || |||||||| || |||||||| | ||||||||||||| ||| | Sbjct 701 TCATTCGAACTTCTTTCTCTTCTCCCTAAGATTCTCCC-GATCTACAAGGAAGTGATTAC 759 Query 637 AGAACTTAAGGCAGCTGGTGCCTCTTGGATTCAGCTTGATGAGCCTCTCTTTGTCATGGA 696 || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||| ||||| Sbjct 760 CGAGCTTAAGGCTGCTGGTGCCACCTGGATTCAGCTTGACGAGCCTGTCCTTGTTATGGA 819 Query 697 TCTTGAGGGTCAAAAACTCCAGGCTTTTAGC-GGTGCCTATGCTGAGCTTGAATCAACTC 755 |||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 820 TCTTGAGGGTCAGAAACTCCAGGCCTTTA-CTGGTGCCTATGCTGAACTTGAATCAACTC 878 Query 756 TCTCTGGTCTGAATGTTCTTGTGGAGACCTACTTTGCTGATATCCCTGCTGAAGCATACA 815 | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 879 TTTCTGGTTTGAATGTTCTTGTCGAGACCTACTTCGCTGATATCCCTGCTGAGGCATACA 938 Query 816 AGACTCTTACTTCCTTGAAGGGTGTGACTGCCTTTGGATTTGATTTGGTTCGTGGTACCA 875 |||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 939 AGACCCTAACCTCATTGAAGGGTGTGACTGCCTTTGGATTTGATTTGGTTCGTGGCACCA 998 Query 876 AGACCATTGACTTGATCAAGGCTGGTTTCCCCCAGGGCAAGTACCTCTTTGCTGGTGTTG 935 ||||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 999 AGACCCTTGATTTGGTCAAGGCAGGTTTCCCTGAGGGAAAGTACCTCTTTGCTGGTGTTG 1058 Query 936 TTGACGGAAGGAACATCTGGGCCAATGACCTCGCTGCCTCTCTCATCACCTTGCAGTCAC 995 |||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || | |||||||||| ||| Sbjct 1059 TTGATGGAAGGAACATCTGGGCCAACGACTTTGCTGCGTCCCTAAGCACCTTGCAGGCAC 1118 Query 996 TTGAGGGTGTTGTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCTTGCTCTCTTCTCCACA 1055 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1119 TTGAAGGCATTGTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCCTGCTCTCTTCTCCACA 1178 Query 1056 CTGCCGTTGACCTTGTTAACGAGACTAAGCTTGATGCTGAAATCAAGTCGTGGCTAGCTT 1115 | || ||||| ||| | || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || | Sbjct 1179 CCGCTGTTGATCTTATCAATGAGACTAAGCTTGATGATGAAATCAAGTCATGGTTGGCGT 1238 Query 1116 TTGCCGCCCAGAAGGTTGTTGAAGTTG-ACGCATTGGCCAAGGCTTTAGCCGGTCAGACG 1174 |||| ||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||| | Sbjct 1239 TTGCTGCCCAGAAGGTCGTTGAAG-TGAACGCTTTGGCCAAGGCTTTGGCTGGTCAGAAG 1297 Query 1175 AATGAGAG-T-TTCTTCACTGCCAACGCTGATGCTTTGTCTTCGAGGAGGTCTTCCCCAA 1232 | ||| | | || ||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||||| Sbjct 1298 GACGAG-GCTCTT-TTCTCTGCCAATGCTGCGGCTTTGGCTTCAAGGAGATCTTCCCCAA 1355 Query 1233 GAGTCACTAATGAGGCTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTGAAGGGGTCTGACCACCGCC 1292 ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct 1356 GAGTCACCAACGAGGGTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTGAAGGGATCTGACCACCGTC 1415 Query 1293 GTACAACCGAA-GTTAGCGCAAGGCTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTTAACCTTCCAATC 1351 || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| Sbjct 1416 GTGCAACC-AATGTTAGTGCTAGGCTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTCAATCTCCCAATC 1474 Query 1352 CTCCCAACCACCACCATTGGATCCTTCCCACAGACCGTGGAACTCAGGAGAGTTCGCCGT 1411 || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| Sbjct 1475 CTACCAACCACAACCATTGGATCCTTCCCACAGACTGTAGAGCTCAGGAGAGTTCGTCGT 1534 Query 1412 GAATACAAGGCGAAGAAA-ATCTCTGAAGAGGATTACGTCAAGGCCATCAAGGAAGAGAT 1470 || |||||||| || ||| |||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 1535 GAGTACAAGGCCAA-AAAGGTCTCAGAGGAGGACTACGTTAAAGCCATCAAGGAAGAGAT 1593 Query 1471 CAAGAAAGTTGTTGACATCCAAGAGGACCTTGACATTGATGTTCTTGTTCACGGAGAGCC 1530 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1594 CAAGAAAGTTGTTGACCTCCAAGAGGAACTTGACATCGATGTTCTTGTCCACGGAGAGCC 1653 Query 1531 TGAGAGAAACGATATGGTTGAGTACTTTGGAGAGCAATTGTCAGGTTTCGCATTCACAGC 1590 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || Sbjct 1654 AGAGAGAAACGACATGGTTGAGTACTTTGGTGAGCAGTTGTCTGGTTTTGCCTTCACTGC 1713 Query 1591 AAATGGGTGGGTGCAATCCTATGGATCTCGCTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTACGGTGA 1650 ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1714 AAACGGATGGGTCCAATCTTATGGATCTCGCTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTATGGTGA 1773 Query 1651 CGTGAGCCGCCCCAAGCCAATGACAGTCTTCTGGTCCTCAACAGCTCAGAGCATGACCAA 1710 |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct 1774 TGTGAGCCGTCCCAAGGCAATGACCGTCTTCTGGTCCGCAATGGCTCAGAGCATGACCTC 1833 Query 1711 ACGTCCAATGAAGGGAATGCTTACAGGTCCAGTCACAATTCTTAACTGGTCTTTTGTTAG 1770 || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || Sbjct 1834 TCGCCCAATGAAGGGTATGCTTACTGGTCCCGTCACCATTCTCAACTGGTCCTTTGTCAG 1893 Query 1771 AAACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAAGACGAAGT 1830 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1894 GAACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAGGACGAAGT 1953 Query 1831 GGAAGACCTCGAGAAAGGCGGTATTGGAGTCATTCAGATCGATGAAGCCGCACTCAGAGA 1890 || || || |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| Sbjct 1954 CGAGGATCTTGAGAAAGGTGGAATCGGTGTCATTCAGATTGATGAGGCTGCACTTAGAGA 2013 Query 1891 AGGATTGCCTCTTAGGAAAGCCGAACACT-CTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCTT 1949 |||| | || || |||||| |||| || | ||||||||||||||||||| || ||||| | Sbjct 2014 AGGACTACCACTCAGGAAATCCGAGCA-TGCTTTCTACTTGGACTGGGCCGTCCACTCCT 2072 Query 1950 TCAGAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACAGCACTCAGATTCACACTCACATGTGTTACT 2009 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 2073 TCAGAATCACCAACTGTGGAGTCCAAGACAGCACCCAGATCCACACTCACATGTGCTACT 2132 Query 2010 CAAACTTCAATGACATCATCCACTCAATCATCGACATGGACGCTGATGTCATCACCATTG 2069 | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2133 CCCACTTCAATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGATGCTGATGTCATCACCATTG 2192 Query 2070 AGAACTCTC-GTTCAGACGAGAAGCTTCTATCAGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGT 2128 ||||||| | | || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2193 AGAACTC-CAGGTCTGATGAGAAGCTTCTTTCCGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGT 2251 Query 2129 GCAGGAATCGGTCCTGGTGTTTACGACATTCACTCTCCAAGAATACCATCCACAGAAGAA 2188 || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| Sbjct 2252 GCTGGAATCGGTCCAGGAGTCTACGACATCCACTCTCCAAGAATACCATCTTCTGAGGAA 2311 Query 2189 ATTGCAGACAGGATCAACAAGATGCTTGCGGTTCTTGAGCAGAACATC-TTGTGGGTTAA 2247 || ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||| || |||||||| Sbjct 2312 ATCGCAGACAGGGTCAACAAGATGCTTGCTGTCCTAGAGCAGAACATCCTT-TGGGTTAA 2370 Query 2248 CCCTGACTGTGGTCTGAAGACAAGGAAGTACACTGAGGTTAAACCAGCACTTAA-AGCCA 2306 ||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| || || ||||| || | | | Sbjct 2371 CCCTGACTGTGGTCTCAAGACCCGTAAGTACACCGAGGTCAAGCCTGCACTCAAGAAC-A 2429 Query 2307 TGGTTGACGCGGCTAAGCTTATCCGCTCCCAGCTCGCTAGTGCCAAGTGAAGAA 2360 ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2430 TGGTTGATGCGGCTAAGCTCATCCGCTCCCAGCTCGCCAGTGCCAAGTGAAGAA 2483 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 128878876567 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5