BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg478644
Length=6691
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G12810.1 | Symbols: PIE1, SRCAP, chr13 | SNF2 domain-contain... 1.081e+04 0.0
> AT3G12810.1 | Symbols: PIE1, SRCAP, chr13 | SNF2 domain-containing
protein / helicase domain-containing protein | chr3:4065042-4074078
FORWARD LENGTH=6848
Length=6848
Score = 1.081e+04 bits (5851), Expect = 0.0
Identities = 6439/6718 (96%), Gaps = 59/6718 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 TTGGAATTTTCTACATCTATTTGCGCCGCTAGCTCGGGTTTC--T-T-TCTGAAGC--AG 60
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||||||| ||
Sbjct 148 TTGGAATTTTCTACATCTGTTTGCGCCGCGAGCTCGGGTTTCTTTCTCTCTGAAGCAGAG 207
Query 61 GCTCTTCTGGATT----aaaaaaaaaaTCTCAAAACCAAAGCTTCTTCC-TTTTTTACAA 115
|||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 208 GCTCTTCTAGATTAAAAAAAAAAAAAATCTCAAAACCAAAGCTTCTTCCTTTTTTTACCA 267
Query 116 ATTCGTTCGTATCTCCCAttttttatttttC-TCGATCTCCTATCACATCATCTTAGTAA 174
| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 268 A----TTCGTATCTCCCA-TTTTTAGTTTTCTTCGATCTCAAATCACACCATCTTAGTAA 322
Query 175 GAATGAAGTGAAGAGATTT---CAG---AAAAA-TCTAATCTTGTTCCCGTTCGATTC-- 225
||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 GAATGAAGTGAAGAGATTTGAGAAGAAAAAAAACACTAATCTTGTTCCCGTTCGATTCTT 382
Query 226 GAGGAAAACAAATTTCAGCTAGATTTGAGATTTGGAATCGAAAATTACTGTAATGTTTTG 285
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 383 GAGGAAAACAAATTTCAGCTAGATTTAAGATTTGGAATCGAATATTACTGTAATGTTTTG 442
Query 286 GGTGAC-GGAACCTAGTGATGAAATCTTTGCTTGGGtttttttGCGCTGAAGTGGAAACC 344
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 GGTGACGGGAACCTAGTGATGAAATCGTTGCTTGGGTTTTTTTGCGCTGAAGTGGAAACC 502
Query 345 CTAATTTCTCGGGCTTTGTGTACTCGCAAACTTTGCACTCTGCAGTCACTAGTCATCTTC 404
||||||||| |||||||||| | || || | |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 503 CTAATTTCTTGGGCTTTGTGCAGTCACACAGTTTGCACTCTGCAGTCACTAACCATCTTC 562
Query 405 TTCGCTCTTTGAAGATTTTGCTTAGAGGCGTTAGTAAATGGCGTCTAAAGGTGGGAAATC 464
| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 563 -T---TCTTGGAAGATTTTGCTTAAAGGCGTTAGT-AATGGCGTCTAAAGGTGGTAAATC 617
Query 465 TAAACCTGATATAGTAATGGCGTCCAAAG-GTGGCAAATCTAAACCTGATAATGACTCCA 523
||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 618 TAAACCTGATATAGTAATGGCGTCC-AAGAGTGGGAAATCTAAACCTGATAATGAATCCA 676
Query 524 GAGCTAAACGTCACAAGACGCTCGAAGCTCCTAAAGAACCACGTCGCCCGAAAACTCACT 583
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 677 GAGCTAAGCGTCAGAAGACGCTCGAAGCTCCTAAAGAACCACGTCGTCCTAAAACTCACT 736
Query 584 GGGACCATGTTTTGGAGGAGATGGCTTGGCTCTCAAAGGACTTTGAGTCTGAGAGGAAGT 643
|||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 737 GGGACCATGTATTGGAGGAGATGGCTTGGCTGTCAAAGGACTTTGAGTCTGAGAGGAAAT 796
Query 644 GGAAGCTGGCGCAGGCGAAGAAGGTTGCTTTGAGGGCCAGCAAAGGAATGCTAGATCAGG 703
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 797 GGAAGCTGGCGCAGGCGAAGAAGGTTGCTTTGAGAGCCAGCAAAGGAATGCTAGATCAGG 856
Query 704 CATCTAGGGAAGAAAGGAAGCTAAAGGAAGAAGAACAGCGGCTACGGAAAGTAGCTCTCA 763
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||
Sbjct 857 CATCTAGGGAAGAAAGGAAGCTAAAGGAAGAAGAACAGCGACTTCGGAAAGTAGCCCTCA 916
Query 764 ATATCTCGAAAGACATGAAAAAGTTTTGGATGAAAGTAGAGAAGCTGGTGCTTTACAAGC 823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 917 ATATCTCGAAAGACATGAAAAAGTTTTGGATGAAAGTTGAGAAGCTGGTGCTTTACAAGC 976
Query 824 ATCAGCTGGTACGCAATGAGAAGAAGAAGAAGGCTATGGACAAGCAACTTGAATTTCTGT 883
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 977 ATCAGTTGGTACGCAATGAGAAGAAGAAGAAGGCTATGGACAAGCAACTTGAATTTCTGT 1036
Query 884 TAGGCCAAACTGAGAGGTACTCAACCATGTTGGCCGAAAATTTAGTGGAGCCTTATAAAC 943
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TAGGCCAAACTGAGAGGTACTCAACCATGTTGGCAGAAAATTTAGTGGAGCCTTATAAAC 1096
Query 944 AGGGCCAAAATACTCCTTCAAAACCTCTACTAGCTATCGAATCAAAAAGTGACGAGGAGA 1003
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1097 AGGGCCAAAATACTCCTTCAAAACCTCTACTAACTATCGAATCAAAAAGTGATGAGGAGA 1156
Query 1004 GGGCAGAACAGATACCTCCAGAGATAAATTCTTCTGCAGGTCTTGAATCAGGAAGTCCTG 1063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 GGGCAGAACAGATACCTCCAGAGATAAATTCTTCTGCAGGTCTTGAATCAGGAAGTCCTG 1216
Query 1064 AACTCGATGAGGACTATGATCTAAAATCCGAGGATGAGACCGAAGATGATGAAGATACTA 1123
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1217 AACTCGATGAGGATTATGATCTAAAATCTGAGGATGAGACCGAAGATGATGAAGATACTA 1276
Query 1124 TTGAGGAGGATGAAAAACACTTCACCAAACGGGAAAGACAGGAAGAGTTGGAAGCTTTGC 1183
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1277 TTGAGGAGGATGAAAAACACTTCACCAAACGTGAAAGACAGGAAGAGTTGGAAGCTTTGC 1336
Query 1184 AAAATGAAGTGGATCTACCAGTTGAGGAGCTGCTCAGACGTTATA-CTGCTGGAAGAGTT 1242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1337 AAAATGAAGTGGATCTACCAGTTGAGGAGCTGCTCAGACGTTATACCT-CTGGAAGAGTT 1395
Query 1243 AGCCGAGAAACCAGCCCAGTAAAAGATGAAAATGTGGACAATCTGGCCTCAGTTAGCCGA 1302
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1396 AGCCGAGAAACCAGCCCAGTAAAAGATGAAAATGAGGACAATCTGACCTCAGTTAGCCGA 1455
Query 1303 GAAACCAGCCCAGTAAAAGATGAAAATGAGGACAATCTGGCCTCAGTAGGTCAAGATCAT 1362
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1456 GTAACCAGCCCAGTAAAAGATGAAAATCAGGACAATCTGGCCTCAGTAGGTCAAGATCAT 1515
Query 1363 GGAGAGGACAAGAACAATCTTACAGCTTCTGAAGAAACTGAAGGGAACCCAAGTGTTCGT 1422
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516 GGAGAGGACAAGAACAATCTTGCAGCTTCTGAAGAAACTGAAGGGAACCCAAGTGTTCGT 1575
Query 1423 CGTTCTAATGATAGCTATGGCCATTTGGCAATATCTGAGACCCATTCTCATGACCTCGAA 1482
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1576 CGTTCTAATGATAGCTATGGTCATTTGGCAATATCCGAGACCCATTCACATGACCTTGAG 1635
Query 1483 CCAGGCATGACGACTGCATCTGTGAAGTCCAGAAAGGAAGATCATACCTATGATTTCAAT 1542
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1636 CCAGGCATGACGACTGCATCTGTGAAGTCCAGAAAGGAAGATCATACCTATGATTTTAAC 1695
Query 1543 GATGAACTGGAAGATGTTGACTTTGTTGTTGCCACTGGTGAGGAGAAGGATGATGAGACA 1602
||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 1696 GATGAACAGGAAGATGTTGACTTTGTTCTTGCCAATGGTGAGGAAAAGGATGATGAGGCG 1755
Query 1603 ACATTGGCTATCGAAGAGGAATTGGCGAAAGCTGATAATGAAGACCATGTGGAAGAGATT 1662
||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 1756 ACATTGGCTGTCGAAGAGGAACTGGCGAAAGCAGATAATGAAGATCATGTCGAAGAGATT 1815
Query 1663 GCTCTGCTGCAAAAAGAGAATGAAATGCCTATTGAAGTACTACTTGCAAGGTATAAGGAG 1722
|| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1816 GCCCTGCTGCAAAAAGAGAGTGAAATGCCTATTGAAGTACTACTTGCAAGGTATAAGGAG 1875
Query 1723 GATTTCGG-GGACAAGGATATATCTGAGGATGACTCTGAATATTCATGTGCTCAATCTGA 1781
|||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||
Sbjct 1876 GATTTCGGTGG-CAAGGATATATCTGAGGATGAATCTGAATCTTCATTTGCTGTATCTGA 1934
Query 1782 AGACTCTATAGTAGACTCTGACGAAAATAGGCAGCAAGCTGATTCAGATAATGAAAACGT 1841
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||
Sbjct 1935 AGACTCTATAGTAGACTCTGACGAAAATAGGCAGCAAGCTGATTTAGATGATGACAACGT 1994
Query 1842 TGATTCAACAGAATGTAAGCCAGATCCAGAGCCTTGCTCAGAAAATGTTGAAGGCACATT 1901
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 TGATTTAACAGAATGTAAGCTAGATCCAGAGCCTTGCTCAGAAAATGTTGAAGGCACATT 2054
Query 1902 CCATGAAATAACAGAAGATAATGGTAAAGATAGTAGTGATAAAATTGCTGATGCAGCAGC 1961
||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2055 CCATGAAGTAGCAGAAGATAATGATAAAGATAGTAGTGATAAAATTGCTGATGCAGCAGC 2114
Query 1962 AGCAGCAAGATCTGCGCAGCCAACTGGATTTACATACTCCACAACAAAAGTTCGAACGAA 2021
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2115 AGCAGCAAGATCTGCCCAGCCAACTGGATTTACATACTCCACAACAAAAGTTCGAACGAA 2174
Query 2022 ACTGCCGTTTCTACTCAAGCATTCTCTGCGTGAGTACCAACACATTGGTTTGGACTGGCT 2081
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2175 ACTGCCGTTTCTACTTAAGCATTCTCTGCGTGAGTACCAACACATTGGTTTGGACTGGCT 2234
Query 2082 TGTCACGATGTATGAGAAAAGGCTGAACGGTATTCTGGCTGATGAAATGGGTCTTGGAAA 2141
|||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2235 TGTCACGATGTATGAGAAAAAGTTGAACGGTATTCTGGCTGATGAAATGGGTCTTGGAAA 2294
Query 2142 GACAATTATGACCATTGCTCTTCTAGCACACCTCGCATGTGATAAGGGGATATGGGGTCC 2201
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2295 GACAATTATGACCATTGCTCTTCTAGCTCACCTTGCATGTGATAAGGGAATATGGGGTCC 2354
Query 2202 CCATCTGATTGTGGTTCCAACAAGTGTGATGCTTAATTGGGAGACTGAGTTTCTTAAATG 2261
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2355 CCATCTGATTGTGGTTCCTACAAGTGTGATGCTTAATTGGGAGACTGAGTTTCTTAAATG 2414
Query 2262 GTGTCCTGCATTTAAAATTCTCACCTACTTTGGTAGTGCAAAGGAGCGGAAACTCAAGAG 2321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2415 GTGTCCTGCATTTAAAATTCTCACCTACTTTGGTAGTGCAAAGGAGCGGAAACTCAAGAG 2474
Query 2322 ACAAGGATGGATGAAGCTTAACTCATTTCATGTATGCATAACGACCTATAGGCTAGTTAT 2381
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2475 ACAAGGATGGATGAAGCTTAACTCATTTCATGTATGCATAACAACCTATAGGCTAGTTAT 2534
Query 2382 TCAAGACAGTAAAATGTTCAAGCGCAAGAAGTGGAAATATTTGATTCTTGACGAAGCCCA 2441
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2535 TCAGGACAGTAAAATGTTCAAGCGCAAGAAGTGGAAATACTTGATTCTTGACGAAGCCCA 2594
Query 2442 TTTAATTAAGAATTGGAAGTCTCAGAGATGGCAGACACTATTGAACTTCAATTCTAAACG 2501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2595 TTTAATTAAGAATTGGAAGTCTCAGAGATGGCAGACACTATTGAACTTCAATTCTAAACG 2654
Query 2502 CAGAATTTTGTTGACTGGTACACCACTGCAGAATGATCTTATGGAATTGTGGTCACTTAT 2561
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2655 CAGAATTTTGTTGACTGGTACACCCCTGCAGAATGATCTTATGGAACTGTGGTCACTTAT 2714
Query 2562 GCATTTTCTGATGCCACATGTTTTTCAGTCTCACCAGGAATTCAAAGATTGGTTCTGTAA 2621
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2715 GCACTTTCTGATGCCACATGTCTTTCAGTCTCACCAGGAATTCAAAGACTGGTTCTGTAA 2774
Query 2622 CCCGATAGCAGGGATGGTTGAGGGACAAGAAAAAATCAACAAAGAAGTTATTGATCGCTT 2681
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2775 CCCAATAGCAGGGATGGTCGAGGGACAAGAAAAAATCAACAAAGAAGTTATTGATCGCTT 2834
Query 2682 ACATAATGTCCTCCGTCCTTTCCTTCTACGGCGCCTAAAAAGGGATGTGGAGAAGCAACT 2741
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2835 ACATAATGTCCTCCGTCCTTTCCTTCTACGGCGCCTAAAAAGGGATGTGGAGAAGCAACT 2894
Query 2742 TCCTTCGAAACATGAGCATGTTATTTTCTGTAGACTGTCTAAGAGGCAACGCAACTTGTA 2801
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2895 TCCTTCGAAACATGAGCATGTTATTTTCTGTAGACTGTCTAAGAGGCAGCGCAACTTGTA 2954
Query 2802 TGAGGACTTCATAGCGAGCACAGAAACACAGGCTACGCTTAACAGTGGAAGCTTTTTTGG 2861
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2955 TGAGGACTTCATAGCAAGCACAGAAACACAGGCTACGCTTACCAGTGGAAGCTTTTTTGG 3014
Query 2862 GATGATAAGTATCATAATGCAGTTGCGGAAAGTTTGTAATCATCCTGATCTCTTTGAGGG 2921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3015 GATGATAAGTATCATAATGCAGTTGCGGAAAGTTTGTAATCATCCTGATCTCTTTGAGGG 3074
Query 2922 TCGTCCTATTGTAAGTTCTTTTGATATGGCTGGCATTGATGTGCAGTTGAGTTCAACGAT 2981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3075 TCGTCCTATTGTAAGTTCTTTTGATATGGCTGGCATTGATGTGCAGTTGAGTTCAACAAT 3134
Query 2982 CTGTTCGCTGCTTTTGGAAAGTCCGTTTTCCAAGGTTGATCTTGAGGCTTTGGGATTCTT 3041
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3135 CTGTTCGCTACTATTGGAAAGTCCGTTTTCCAAGGTTGATCTTGAGGCTTTGGGATTCTT 3194
Query 3042 ATTCACCCATCTTGATTTTTCGATGACTTCTTGGGAAGGAGATGAGATAAAAGCTATTTC 3101
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3195 ATTCACCCATCTTGATTTTTCTATGACTTCTTGGGAAGGAGATGAGATCAAAGCTATTTC 3254
Query 3102 AACACCCTCAGAATTAATCAAACAGCGTGTGAACTTGAAGGATGATATGGAAGCAATCCC 3161
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 3255 AACACCCTCAGAATTAATCAAACAGCGTGTGAACTTGAAGGATGATCTAGAAGCAATCCC 3314
Query 3162 TTTGAGTTTGAAAAACCGCAAAAATCTGCAAGGGACAAATATTTTTGAAGAAATTCGTAA 3221
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3315 TTTGAGTCCAAAAAACCGCAAAAATCTGCAAGGGACAAATATTTTTGAAGAAATTCGTAA 3374
Query 3222 GGCTGTTTTTGAGGAAAGGGTTA-AAGAAACTAAGGATCGGGCAGCAGCCATTGCCTGGT 3280
|||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3375 GGCTGTCTTTGAGGAAA-GGATACAAGAATCTAAGGATCGGGCAGCAGCCATTGCATGGT 3433
Query 3281 GGAATTCTTTGAGATGCCAGAGAAAGCCGACTTACTCTACATCTCTAAGAACTCTTTTGA 3340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 3434 GGAATTCTTTGAGATGCCAGAGAAAGCCGACTTACTCTACATCACTAAGAACTCTTTTAA 3493
Query 3341 CCATTAAGGGTCCTCTTGATGATATACACCATCTTAAAGCTAACTGTTCATCTTACATGT 3400
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3494 CCATTAAGGGTCCTCTTGATG---------ATCTTAAAGCTAACTGTTCATCTTACATGT 3544
Query 3401 ATTCCTCAATCCTCGCTGACATAGTTCTTTCACCGATCGAGCGTTTTCAGCAA-ATGATT 3459
|||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 3545 ATTCATCAATCCTCGCTGACATAGTCCTTTCACCAATCGAGCGTTTTCAG-AAGATGATT 3603
Query 3460 GAGCTAGTTGAAGCTTTCACATTTGCGATTCCAGCTGCACGAGTGCCTTCACCTGCTTGC 3519
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3604 GAGCTAGTTGAAGCTTTCACATTTGCGATTCCAGCTGCACGAGTGCCTTCACCTACTTGC 3663
Query 3520 TGGTGCAGCAAAAGTGACTCTCCTGTTTTTCTTAGTCCATCATACAAGGAGAAAGTTACA 3579
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 3664 TGGTGCAGTAAAAGTGACTCTCCTGTTTTTCTTAGTCCATCGTACAAGGAAAAAGTTACA 3723
Query 3580 GATTTATTGTCACCTCTTTTATCTCCGATTAGACCTGCAATCGTTAGGAGACAAGTATAT 3639
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3724 GATTTATTGTCACCTCTTTTATCTCCAATTAGACCTGCAATCGTTAGGAGACAAGTATAT 3783
Query 3640 TTTCCAGATAGGCGACTGATACAGTTTGATTGTGGTAAGCTGCAGGAGCTTGCTATGTTA 3699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3784 TTTCCAGATAGGCGACTGATACAGTTTGATTGTGGTAAGCTGCAGGAGCTTGCTATGTTA 3843
Query 3700 TTGAGGAAATTAAAATTTGGGGGTCACAGAGCGTTGATATTCACGCAAATGACCAAGATG 3759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3844 TTGAGGAAATTAAAATTTGGGGGTCACAGAGCGTTGATATTCACGCAAATGACCAAGATG 3903
Query 3760 CTTGACGTCTTGGAGGCTTTCATTAATTTATATGGTTATACCTACATGCGTCTTGACGGC 3819
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3904 CTTGACGTCTTGGAGGCTTTCATTAATTTATATGGTTATACCTACATGCGTCTTGATGGC 3963
Query 3820 TCTACTCCACCAGAAGAGAGGCAGACATTAATGCAGCGGTTTAATACAAATCCCAAGATC 3879
||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3964 TCTACACCTCCAGAAGAGAGGCAGACGTTAATGCAGCGGTTTAATACAAATCCCAAGATC 4023
Query 3880 TTTCTTTTCATTTTGTCAACCCGTAGTGGGGGCGTTGGCATCAACCTTGTGGGTGCGGAC 3939
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4024 TTTCTTTTCATTTTGTCAACCCGAAGTGGGGGCGTTGGCATCAACCTTGTGGGTGCGGAC 4083
Query 3940 ACAGTTATATTCTATGACAGTGACTGGAATCCTGCTATGGATCAACAAGCTCAAGATCGC 3999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4084 ACAGTTATATTCTATGACAGTGACTGGAATCCTGCTATGGATCAACAAGCTCAAGATCGC 4143
Query 4000 TGCCACAGGATAGGTCAGACACGTGAAGTGCATATTTACCGGTTGATAAGTGAGAGCACC 4059
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4144 TGCCACAGGATAGGTCAGACACGTGAAGTGCATATATACCGGTTGATAAGTGAGAGCACC 4203
Query 4060 ATTGAGGAGAATATCTTAAAGAAAGCAAACCAGAAGCGTGTGCTTGATAACCTAGTAATT 4119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4204 ATTGAGGAGAATATCTTAAAGAAAGCAAACCAGAAGCGTGTGCTTGATAACCTAGTAATT 4263
Query 4120 CAAAACGGAGAGTATAACACCGAATTTTTCAAGAAGCTCGATCCAATGGAATTGTTCTCT 4179
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4264 CAAAACGGTGAGTATAACACCGAATTTTTCAAGAAGCTCGATCCCATGGAATTGTTCTCT 4323
Query 4180 GGACATAAGACTCTGACTACAAAGGATGAAAAGGAAACAAGCAAAAATTGCGGGGCGGAG 4239
|| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 4324 GGGCATAAGGCTCTGACTACAAAGGATGAAAAGGAAACAAGCAAGCATTGTGGGGCGGAT 4383
Query 4240 ATACCTCTGTCAAATGCAGATGTTGAGGCTGCTTTAAAACAGGCAGAAGATGAGGCAGAT 4299
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4384 ATACCTCTATCAAATGCAGATGTTGAGGCTGCTCTAAAACAGGCCGAAGATGAGGCAGAT 4443
Query 4300 TATATGGCTCTTAAAAGAGTAGAACAAGAAGAAGCTGTGGACAATCAAGAGTTTACAGAA 4359
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4444 TATATGGCTCTCAAAAGAGTAGAACAAGAAGAAGCTGTGGACAATCAAGAGTTCACAGAA 4503
Query 4360 GAACCTGTAGAGAGACCAGAAGACGATGAGCTAGTAAATGAAGATGACATAAAGGCTGAT 4419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4504 GAACCTGTAGAGAGACCAGAAGACGATGAGCTAGTAAATGAAGATGACATAAAGGCTGAT 4563
Query 4420 GAGCCTGCTGATCATGGTTTAGTTGCAGCCGGGTTGGCCAAAGAAGAAATTTCATTGTTA 4479
|||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4564 GAGCCTGCTGATCAAGGTTTAGTTGCAGCAGGGCCGGCCAAAGAAGAAATGTCATTGTTA 4623
Query 4480 CATAGTGATATCAGGGATGAGAGAGCTGTAATCACTACTTCAAGCCAAGAAGATGACGCT 4539
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4624 CATAGTGATATCAGGGATGAGAGAGCTGTTATCACTACTTCAAGCCAAGAAGATGACACT 4683
Query 4540 GATGTGTTAGATGATGTCAAGCAAATGGCTGCAGCAGCCGCTGATGCTGGACAAGCTATC 4599
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4684 GATGTATTAGATGATGTCAAGCAAATGGCTGCAGCAGCGGCTGATGCTGGACAAGCTATC 4743
Query 4600 TCATCTTTTGAGAATCAGCTACGTCCTATTGATAGATATGCGATTAGATTTTTAGAGCTT 4659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4744 TCATCTTTTGAGAATCAGCTACGTCCTATTGATAGATATGCGATTAGATTTTTAGAGCTT 4803
Query 4660 TGGGACCCCATCATTGTTGAGGCTGCAATGGAAAATGAAGCGGGATTTGAAGAGAAAGAA 4719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4804 TGGGACCCCATCATTGTTGAGGCTGCAATGGAAAATGAAGCAGGATTTGAAGAGAAAGAA 4863
Query 4720 TGGGAACTTGACCACATTGAGAAGTACAAGGAGGAAATGGAAGCTGAGATTGATGATGGG 4779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4864 TGGGAACTTGACCACATTGAGAAGTACAAGGAGGAAATGGAAGCTGAGATTGATGATGGG 4923
Query 4780 GAAGAGCCTCTTGTTTACGAGAAATGGGATGCTGATTTTGCAACCGAGGCATACAGGCAG 4839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4924 GAAGAGCCTCTTGTTTACGAGAAATGGGATGCTGATTTTGCAACTGAGGCATACAGGCAG 4983
Query 4840 CAAGTGGAAGTCTTAGCTCAGCACCAGTTGATGGAAGATTTGGAAAATGAAGCTAGAGAG 4899
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4984 CAAGTGGAAGTCTTAGCTCAGCACCAGTTAATGGAAGATTTGGAAAATGAAGCTAGAGAG 5043
Query 4900 AGGGAAGCTGCAGAGGTGGCTGATATGGATTTGACACAGAACGAAAGTGCTCATGTACCG 4959
|||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5044 AGGGAAGCGGCAGAGGTGGCTGAAATGGTTTTGACACAGAACGAAAGTGCTCATGTACTG 5103
Query 4960 AAGCCTAAGAAGAAGAAAAAGGCGAAGAAAGCCAAATATAAATCCCTGAAGAAAGGATCA 5019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5104 AAGCCTAAGAAGAAGAAAAAGGCGAAGAAAGCCAAATATAAATCCCTGAAGAAAGGATCA 5163
Query 5020 CTGGCTGCCGAAGCAAAACATGTGAAGTCAGTTGTGAAAATTGAAGATTCGACTGATGAT 5079
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5164 CTGGCTGCCGAATCAAAACATGTGAAGTCAGTTGTGAAAATTGAAGATTCTACTGATGAT 5223
Query 5080 GATAATGAAGAATTCGGCTATGTGAGTAGCAGTGACTCAGATATGGTTACACCGCTTTCG 5139
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5224 GATAATGAAGAATTCGGCTATGTGAGTAGCAGTGACTCGGATATGGTTACACCGCTTTCG 5283
Query 5140 CGGATGCATATGAAAGGCAAGAAAAGAGATTTAATTGTTGACACTGAAGAAGAGAAAACC 5199
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 5284 CGGATGCATATGAAGGGCAAGAAAAGAGATTTAATTGTTGACACTGATGAAGAGAAGACC 5343
Query 5200 TCGCAGAAGAAAGCAAAGAAGCACAAGAAGTCTATTCCGAATTCAGATATCAAATATAAG 5259
|| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5344 TCAAAGAAGAAAGCAAAGAAGCACAAGAAGTCTCTCCCGAATTCAGATATCAAATATAAG 5403
Query 5260 CAAACAAGTGCTCTACTTGAGGAACTGGAACCATCAAAGCAGTCTGACAGTATGGTTGTT 5319
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5404 CAAACAAGTGCACTACTTGATGAACTGGAACCATCAAAGCCGTCTGACAGTATGGTTGTT 5463
Query 5320 GATAATGAATTGAAACTGACGAACAGGGGTAAAACTATAGGGAAAAAATTCATCACTTCC 5379
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5464 GATAATGAGTTGAAATTGACGAACAGGGGTAAAACTGTAGGGAAAAAATTCATCACTTCC 5523
Query 5380 ATGCCAATAAAGCGTGTTCTTATGATCAAGCCAGAGAAATTGAAGAAAGGAAATCTGTGG 5439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5524 ATGCCAATAAAGCGTGTTCTTATGATCAAGCCAGAGAAATTGAAGAAAGGAAATCTGTGG 5583
Query 5440 TCTAGAGATTGTGTTCCCTCGCCTGATTCTTGGTTGCCTCAGGAAGACGCTATATTGTGT 5499
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 5584 TCTAGAGATTGTGTTCCCTCGCCTGATTCTTGGTTGCCGCAGGAAGATGCTATATTGTGT 5643
Query 5500 GCCATGGTTCATGAATATGGGCCTAATTGGAATTTGGTTAGCGGAACTCTTTATGGAATG 5559
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5644 GCCATGGTTCATGAATATGGGCCTAACTGGAATTTTGTTAGCGGAACTCTTTATGGAATG 5703
Query 5560 ACAGCTGGTGGGGCTTACAGAGGACGGTATCGACATCCTGCATATTGTTGTGAGAGATAT 5619
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5704 ACAGCTGGTGGGGCTTACAGAGGACGGTATCGGCATCCTGCATATTGTTGTGAGAGATAT 5763
Query 5620 AGAGAGCTTATCCAACGACATATTTTGTCTGCTTCCGACAGTGCAGTGAACGAGAAGAAC 5679
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5764 AGAGAGCTTATTCAACGACATATTTTGTCTGCTTCCGACAGTGCAGTGAACGAGAAGAAC 5823
Query 5680 GTCAACACAGGTTCTGGGAAGGCTCTCCTTAAAGTCACTGAGGAAAATATTCGGACACTC 5739
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5824 CTCAACACAGGTTCTGGGAAGGCTCTCCTTAAAGTCACTGAGGAAAATATTCGGACACTC 5883
Query 5740 CTAAATGTTGCAGCTGAGCAGCCAGATACGGAGATGCTCCTACAAAAACATTTTTCTTGC 5799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5884 CTAAATGTTGCAGCTGAGCAGCCAGATACGGAGATGCTCCTACAAAAACATTTTTCTTGC 5943
Query 5800 TTGCTGTCATCAATTTGGAGGACGTCGACCCGAACTGGGAATGATCAAATGCTCTCCTTA 5859
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5944 TTGCTGTCATCAATTTGGAGGACGTCTACCCGCACTGGGAATGATCAAATGCTCTCCTTA 6003
Query 5860 AACAGTCCTATTTTCAACAGACAGTTTATGGGTTCCGTGAATCGCACCCAAGATTTAGCT 5919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 6004 AACAGTCCTATTTTCAACAGACAGTTTATGGGTTCCGTGAATCACACCCAAGATTTAGCT 6063
Query 5920 AGAAAGCCTTGGCAGGGGATGAAGGTCACCAGCTTAAGTAGAAAGTTGTTAGAATCTGCT 5979
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6064 AGAAAGCCTTGGCAGGGGATGAAGGTCACCAGCTTAAGTAGAAAGTTGTTAGAATCCGCT 6123
Query 5980 CTCCAGGATTCCGGCACGAGTCAACCAGACGATACTGTTTCCCGTTCTAGGTTGCAGGAG 6039
||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 6124 CTCCAGGATTCTGGCCCGAGTCAGCCAGACAATACTATTTCCCGTTCTAGGTTGCAGGAG 6183
Query 6040 AATCAACCTATCAATAAAGTGGGATTAGACTTAACCTTGGAATTCCCACGCGGCAAAGAT 6099
| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 6184 ACTCAACCTATCAATAAATTGGGATTAGAGTTAACCTTGGAATTCCCACGTGGCAATGAT 6243
Query 6100 GATTCCCTGACA-CAGTTTCCACCCATGATAAATCTGTCCATTGATGAGTCAGATTCATT 6158
|||||||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6244 GATTCCCTGA-ATCAGTTTCCACCGATGATTAGTCTGTCCATTGATGGGTCAGATTCATT 6302
Query 6159 AAATTATGTGAATGAGCCCCCAGGGGAAGATGTTCTAAAAGGTTCTAGGGTTGCTGCAGA 6218
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6303 AAATTATGTGAACGAGCCCCCAGGGGAAGATGTTCTAAAAGGTTCTAGGGTTGCTGCAGA 6362
Query 6219 GAACCGTTACAGGAATGCTGCAAATGCTTGTATTGAAGATTCATTTGGATGGGCTTCAAA 6278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6363 GAACCGTTACAGGAATGCTGCAAATGCTTGTATTGAAGATTCATTTGGATGGGCTTCAAA 6422
Query 6279 CACGTTCCCAGCCAATGATCTGAAGTCAAAAACAGGCACGAAAACACAGTCCCTGGGGAA 6338
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 6423 CACGTTCCCAGCCAATGATCTGAAGTCAAGAACAGGCACGAAAGCACAGTCCCTGGGGAA 6482
Query 6339 ACACAAGCTATCCGGCTCAGACTCAGCCAAGTCTACAAAAAGCAAACACCGCAAACTCTT 6398
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6483 ACACAAGCTATCCGCCTCAGACTCAGCCAAGTCTACAAAAAGCAAACACCGCAAACTCTT 6542
Query 6399 AGCAGAGCAATTGGAAGTGGCATGGGTTAGGCCAAATGACCCGAATCTCAAGTTTGATTT 6458
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6543 AGCAGAGCAATTGGAAGGGGCATGGGTTAGGCCAAATGATCCGAATCTCAAGTTTGATTT 6602
Query 6459 CACACCTGCTGATAGGGAGGACGAGGAG---CAGGAGGTGGAGGAGAAAGCGGTTTCAGA 6515
|||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 6603 CACACCTGGTGATAGGGAGGAGGAGGAGGAGCAGGAGGTGGATGAGAAAGCGAATTCAGC 6662
Query 6516 AGAGATAGAGATGATAAGTTGTTCACAATGGTATGATCCATTCTTTACCTCAGGCCTTGA 6575
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6663 AGAGATAGAGATGATAAGCTGTTCACAATGGTATGATCCATTCTTTACCTCAGGCCTTGA 6722
Query 6576 TGATTGCTCATTAGCTTCGGATATCTCAGAAATAGAGTAGTAAAA--GCCTTTTTGTAAA 6633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 6723 TGATTGCTCATTAGCTTCGGATATCTCAGAAATAGAGTAGTAAAAAAGCCTTTT-GTAAA 6781
Query 6634 AGTAAAAACCTGCTTGCAGAAGAAAATGCTGATTATTATGGATGACCATTTTCTTAAC 6691
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 6782 AGTAAAAACCTGCTTGCAGAAGAAAATGCTGATGATTGTGGATGATCATTTTCTTAAC 6839
Score = 100 bits (54), Expect = 1e-19
Identities = 56/57 (98%), Gaps = 0/57 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1293 AGTTAGCCGAGAAACCAGCCCAGTAAAAGATGAAAATGAGGACAATCTGGCCTCAGT 1349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1392 AGTTAGCCGAGAAACCAGCCCAGTAAAAGATGAAAATGAGGACAATCTGACCTCAGT 1448
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 334038451083
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5