BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg478716 Length=5256 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G13330.1 | Symbols: PA200 | proteasome activating protein 20... 4139 0.0 > AT3G13330.1 | Symbols: PA200 | proteasome activating protein 200 | chr3:4319647-4330061 REVERSE LENGTH=5608 Length=5608 Score = 4139 bits (2241), Expect = 0.0 Identities = 2394/2469 (97%), Gaps = 6/2469 (0%) Strand=Plus/Plus Query 480 CTTTATCGACTGGGAGTCGTACTTTCCCATGCTTTTCAGTAGATTCTTGAATATGTTTGA 539 |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 708 CTTTATCGACTGGGAGTCTTACTTGCCCATGCTTTTCAGTAGATTTTTGAATATGTTTGA 767 Query 540 GGTTCCTGTTGCAAATGGGAGTGGATCATATCCTTTTTCAGTTGATGTTCCCAGAAACAC 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct 768 GGTTCCTGTTGCAAATGGGAGTGGATCATATCCTTTCTCCGTTGATGTTCCCAGAAACAC 827 Query 600 AAGATTCTTGTTCTCTAACAGGACTACTACTCCATCAAAATCAATTGCACAATCTATTGT 659 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 828 AAGATTCTTGTTCTCCAACAGGACTACTACTCCATCTAAATCAATTGCACAATCTATTGT 887 Query 660 ATACTTTCTAAAACCTGGAAGTACGGCACATGAGCAGTTCGAGAAGTTGGTCAACCTCTT 719 ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| Sbjct 888 ATACTTTCTGAAACCTGGAAGTTCGGCACATGAGCAGTTAGAGAAATTGGTCAATCTCTT 947 Query 720 AGAACAGTATTATCATCCTTCTAATGGTGGCCGTTGGACTTATTCCTTGGAACGGTTTTT 779 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 948 AGAACAGTATTATCATCCTTCTAATGGTGGCCGTTGGACTTATTCCTTGGAACGGTTTTT 1007 Query 780 GCTTCACCTGGTGATAGCTTTCCAAAAGCGTTTACAGCGTGAGCAGCAATCCTATTCCTA 839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1008 GCTTCACCTGGTGATAGCTTTCCAAAAGCGTTTACAGCGTGAGCAGCAATCCTATTGCTA 1067 Query 840 CAGAGATCCAGATAGTCTGCCAGCAGTCTGTTTAGGAAAGCCGGAAAGGATAGCTTTTGT 899 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1068 CAGAGATCCAGATAGTCTGCCAGCAACCTGTTTAGGAAAGCCGGAAAGGGTAGCTTTTGT 1127 Query 900 TGGCGTGGTGTTGAAGTTGATTGATCGTGGCCAATATAGCAAGAATGAACATCTTTCCGA 959 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1128 TGGCGTGGTGTTGAAGTTGATTGATCGTGGTCAATATAGCAAGAACGAACATCTTTCCGA 1187 Query 960 GACAGTTGCTGCAGCGACATCCATGTTATCTTATGTGGAGCCTTCTTTGGTCCTTCCTTT 1019 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1188 AACAGTTGCTGCAGCGACATCCATGTTGTCTTATGTGGAGCCTTCTTTGGTCCTTCCTTT 1247 Query 1020 TGTGGCGTCTCGGTTCCATTTGGCTTTGGAAACGACAACTGCCACCCACCAGCTGAAAAC 1079 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1248 TGTGGCTTCTCGGTTCCATTTGGCTTTGGAAACGACAACTGCCACCCACCAGTTGAAAAC 1307 Query 1080 TGCTATGATGTCCGTAGCATTTGCTGGCCGGTCAATCCTGCAGTCTTCCATGTCAACTGC 1139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1308 TGCTATGATGTCCGTAGCATTTGCTGGCCGGTCAATCCTGCAGTCTTCCATGTCAACTGC 1367 Query 1140 TAAAGCACAAGATCTTGGTGGTGATGTGGACGATAGGATGTTTCTTGATCTTATTGGGAT 1199 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1368 TAAATCACAAGATCTTGGTGGTGATGTGGACGATAGGATGTTTCTTGATCTTATTGGGAT 1427 Query 1200 TTCTCTATCAAATGCATTGCTTGGTATGGATGCCAATGACCCCCCTAAAACCTTGGCAAC 1259 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1428 TTCTCTATCAAATGCATTGCTTGGTATGGATGCCAATGACCCCCCTAAAACCTTGGCCAC 1487 Query 1260 TATGCAACTGATTGGCTCCATATTTTCCAATATGGCTGTTTTGGACGATAGTTCTGATGA 1319 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1488 TATGCAACTAATTGGCTCCATATTTTCCAATATGGCTGTTTTGGACGATAGTTCTGATGA 1547 Query 1320 CTTATCATTCATGCCAATGGATTCCTTCTCTGAGTGGCTGGATGAATTTTTGTGTCGTTT 1379 ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1548 CTTATCATTCATGACAATGGCTTCCTTCTCGGAGTGGCTGGATGAATTTTTGTGTCGTTT 1607 Query 1380 GATTGCTTTGTTACAGCATTTGGAACCCAACAGTGTTATAAATGAAGGCCTAAGTTCATC 1439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1608 GATTGCTTTGTTACAGCATTTGGAACCCAACAGTGTTATAAATGAAGGCCTAAGTTCATC 1667 Query 1440 TGCAACATCAGGAACGTTTTTGGTTGAGGATGGTCCATATTACTATTGCATGCTTGAAAT 1499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1668 TGCAACATCAGGAACGTTTTTGGTTGAGGATGGTCCATATTACTATTGCATGCTTGAAAT 1727 Query 1500 CCTACTTGGAAGGCTATCTGGATCTCTATATAACCAGGCCTTGAGAAAGATATCAAAATT 1559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || Sbjct 1728 CCTACTTGGAAGGCTATCTGGATCTCTATATAACCAGGCCTTGAAAAAGATATCAAAGTT 1787 Query 1560 TGTTCAGACAAATATCCTTCCTGGTGCAATTGCTGAGGTTGGGTTGCTTTGTTGTGCCTG 1619 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1788 TGTTCAGACAAATATCCTTCCTGGTGCAATTGCCGAGGTTGGGTTGCTTTGTTGTGCATG 1847 Query 1620 TGTTCATTCCAACCCC-GAAGAAGCAGTTGCTCAAATTGTTGAACCAATGCTCCTTGCTG 1678 ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1848 TGTTCATTC-AACCCCCGAAGAAGCAGTTGCTCAAATTGTTGAACCAATGCTCCTTGCTG 1906 Query 1679 TTATATCTTCTCTGAAAGAAATCCCTGTCACTGGGTATGGAGGAAAAGGAAGTGCAGAGA 1738 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1907 TTATATCTTCTCTGAAAGAAATCCCTGTCAATGGGTATGGAGGAAAAGGAAGTGCAGAGA 1966 Query 1739 CCCGTGTTTCCAATAAGCAAGACAAACACTCACTTTCTCCAGCGCTTGAGGCAGCTATAG 1798 ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1967 CCCTTGTTTCCAATAAGCAAGACAAACAAACACTTTCTCCAGCGCTTGAGGCAGCTATAG 2026 Query 1799 ATTATCAGCTGAAAGTATTGTCAGTTGCGATCACTTATGGAGGCATCTCACTTCTTCGGT 1858 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 2027 ATTATCAGCTGAAAGTATTGTCAGTTGCCATCACTTATGGAGGCAGCTCACTTCTTCCGT 2086 Query 1859 ACAAAGGTCATTTGATCGAAGCTATATCTTCCGCATTTAATTCCTCATCTTGGAAGGTTA 1918 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2087 ACAAAGGTCTTTTGATCGAAGCTATATCTTCCGCATTTAATTCCTCATCTTGGAAGGTTA 2146 Query 1919 ACGGAGCTGGGGATCATCTTCTTCGATCTCTCCTTGGAAGTCTGATTCTTTACTATCCTA 1978 | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2147 ATGGAGCTGGGGATCATCTTCTTCGATCTCTCCTCGGAAGTCTGATTCTTTACTATCCTA 2206 Query 1979 TTGATCAATACAAATGTTTGTCTCGTCACCCTGCTGCTCCTGCTTTGGAGGAATGGATCA 2038 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2207 TTGATCAATACAAATGTTTGTCTCGTCACCCTGCTGCTCCTGCTTTGGAGGAATGGATAA 2266 Query 2039 GCACCAAAGCTTCTTATAAGGATGAGCAGGTGGCGCATTCCAGGTGGCATGTTCCCACCA 2098 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2267 GCACCAAAGCTTCTTCTAAGGATGAGCAGGTGGCGCATTCCAGGTGGCATGTTCCCACCC 2326 Query 2099 AAGAGGAAACTCAGTTTGCCAATGAGCTCTTAGATCTCCATCTTCAGTCAGCGTTAGATG 2158 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2327 AAGAGGAAACTCAGTTTGCCAATGAGCTCTTAGATCTCCATCTTCAGTCAGCACTAGATG 2386 Query 2159 ATCTTTTGAGTATTTGCCAATCAAACATCCACTCTGATGCAGGAGATGAGAAAACACACC 2218 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2387 ATCTTTTGAGTATTTGCCAATCGAACATCCACTCTGATGCAGGAGATGAGAAAACACACC 2446 Query 2219 TTAAAGTGACTCTTTTGCGTATAGATTCTACATTGCAAGGTGTTTTGTCCTGCCTACCTG 2278 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2447 TTAAAGTGACTCTATTGCGTATAGATTCTACATTGCAAGGTGTTTTGTCCTGCCTACCTG 2506 Query 2279 ATTTCAGGCCATCACCTAGACATGATATGGTTGAAGATCTGCCGTTCTTTATAGCTGGAG 2338 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| Sbjct 2507 ATTTCAGGCCATCACCTAGACATGATATGGTTGAAGATCTACAGTTCTTTATAGCTGGAG 2566 Query 2339 CATCGGGTTCATGTGTTGGCAGTGCTGAAATACGAGAAAAAACTGCTAAAACAATTCATG 2398 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 2567 CATCGGGTTCATGTGTTGGCAGCGCTGAGATACGAGAAAAAACTGCTATAACTATTCATG 2626 Query 2399 CAGCCTGCAAATACTTGTTAGAGAAAAAGTCAGATGACAGCATCTTGTTGATATTAATAA 2458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2627 CAGCCTGCAAATACTTGTTAGAGAAAAAGTCAGATGACAGCATCTTGTTGATATTAATAA 2686 Query 2459 TCCGCATAATGGATGCCCTGGGAAACTATGGCAGTTTGGAGTATGATGAATGGTCAAATC 2518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2687 TCCGCATAATGGATGCCCTGGGAAACTATGGCAGTTTGGAGTATGATGAATGGTCAAATC 2746 Query 2519 ACAGGCAGGCTTGGAAACTGGAATCTGCTGCGATTGTAGAGCCTCCAGCAAACTTTATTA 2578 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2747 ACAGGCAGGCTTGGAAACTGGAATCCGCTGCGATTGTAGAGCCCCCAGCAAACTTTATTA 2806 Query 2579 CTGAGTTTAATTCTAAGGGCAAGAGAAGGCCTAGATGGGCACTCATTGATAAAGCGTACA 2638 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2807 CTGAGTTTAATTCTAAGGGCAAGAGAAGGCCTAGATGGGCACTCATTGATAAAGCGTACA 2866 Query 2639 TGCACAACACTTGGAGATCATCACAATCGTCATATCATCTGTTTCGTACAGATGGGAACT 2698 |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2867 TGCACAACACATGGAGATCATCACAATCGTCCTATCATCTGTTTCGTACAGATGGGAACT 2926 Query 2699 TCTCTCCACCAGAAGCCTTGACACTTTTGGTTGATGACCTTTTGACCCTCTGTCTGCACA 2758 |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2927 TCTCTCCACCAGAACCCTTAACATTTTTGGTTGATGATCTTTTGACCCTCTGTCTGCACA 2986 Query 2759 ACTATGAAACTGTTCGAGTGCTTGCTGGAAAATCTTTGCTGAAACTGTTAAAAAGATGGC 2818 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| Sbjct 2987 ACTATGAAACTGTTCGAGTGCTTGCTGGAAAATCTTTGATAAAACTGTTAAAGAGATGGC 3046 Query 2819 CGACA-TTGCTTTCAAAGTGTGTTCTGTCCCTTACTGAGAACTTGCGAAAGCCGGATGTA 2877 || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3047 CG-CAGTTGCTTTCAAAGTGTGTTCTGTCCCTTACTGAGAACTTGCGAAAGCCGGATGTA 3105 Query 2878 GAAGAGA-ATGTAGTCCTTGGTTCTTGTGCCATTCTCTCTTCACAGAGTGTTCTCAAGCA 2936 |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3106 CAAGA-ATATGTAGTCCTTGGTTCTTGTGCCATTCTCTCTTCACACAGTGTTCTCAAGCA 3164 Query 2937 TTTGACTAC 2945 ||| ||||| Sbjct 3165 TTTAACTAC 3173 Score = 3725 bits (2017), Expect = 0.0 Identities = 2208/2301 (96%), Gaps = 9/2301 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2947 CTTTTTGTCAAATATAACATTCACTTTGCGGGGCTGTCGAGAAACATACTTCGCTCATTG 3006 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3262 CTTTTTGTCAAATATAATATTCACTTTGCGGGACTGTCGAGAAACATACTTCGCTCATTG 3321 Query 3007 GAAAGCCATGTTGAGGGGTCTACTTCTGGAGATCTTGTTTCTCAGATTGGCTCCATGAGT 3066 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3322 GAAAGCCATGTTGAGGGCTCTACTTCTGGAGATCTTGTTTCTCAGATTGGCTCCATGAGT 3381 Query 3067 TTTGATTCTTCCAGCTTGCATTGGCGGTACAACTTGATGGCTAACAGAGTGCTCCTTCTG 3126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3382 TTTGATTCTTCCAGCTTGCATTGGCGGTACAACTTGATGGCTAACAGAGTGCTCCTTCTG 3441 Query 3127 TTAGTTATGTCCTCTAGGATTGACCCAAGCTTCTCTTTCAAAATCCTTGATGAAACTGCT 3186 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3442 TTAGTTATGTCCTCTAGGATTGACCCAAGCTTCTCTCTCAAAATCCTTGATGAAACCGCT 3501 Query 3187 GGCCACTTCTTGAAAAACTTGAAAAGTCAACTTCCTCAGACGAGAATACTGGCGATTTCA 3246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| Sbjct 3502 GGCCACTTCTTGAAAAACTTGAAAAGTCAACTTCCTCAGACCAGAATACTTGCCATTTCA 3561 Query 3247 GCGT-TAAACACCCTACTTAAAGAGTCACCTCATAAGATGCAAGGCAAGGATCAGCCTTC 3305 || | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3562 GC-TCTAAACATTCTACTTAAAGAGTCGCCTCATAAGATGCAAGGCAAGGATCAGCCTTC 3620 Query 3306 TGTGTCTTCACAAGAAATTGAAAATGCGAACTCATCCCTTGATTTAGCATTAAGCCAAAT 3365 ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3621 TGTGTCTTCACAAGAAACTGAAAATGCCAACTCATCCCTTGATTTAGCATTGAGCCAAAT 3680 Query 3366 TTTTAGAGAGGAAGGATTCTTCAAGGAGACTTTTGAAAGTCTTTCTCATATTCATGTCAC 3425 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3681 TTTTAGAGAAGAAGGATTCTTCAAGGAGACTTTTGAAAGTCTTTCTCATATTCATATCAC 3740 Query 3426 TGACACAGATAGTTCCTCTAGAGGTAATCACGGAAGTTCATCCTTCCAGAGCATGGCGGA 3485 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3741 TGACACAGATAGTTCCTCTAGAGGGAATCACGGAAGTTCATCTTTCCAGAGCATGGCGGA 3800 Query 3486 CAAGTCGATCACTCGTTTCTATTTTGAATTCTCGGCTTCATGGCCAAGAACTCCTAGTTG 3545 |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3801 CAAGTCAATCACTCGTTTCTATTTTGAATTTTCGGCTTCATGGCCTAGAACTCCTAGTTG 3860 Query 3546 GATATCTTTGTTAGGCAGTGATATATTTTACCCAAGTTTTGCTCGCATCTTCAAGCGATT 3605 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3861 GATATCTTTGTTAGGCAGTGATATATTTTACCCAAGTTTTGCTCGCATCTTCAAGCGATT 3920 Query 3606 AGCACAAGAATGTGGAGTGCCTGTGTTACTGGCACTAAAAAGCCCCTTAGAGGAGTTTTG 3665 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3921 AGCACAAGAATGTGGAGTGCCTGTGTTACTGGCACTAAAAAGCCCCTTAGAGGAGTTTTG 3980 Query 3666 TAACGCCAAGGAGAGACCAAAACAGTGTGTTGCTGCTGAAGCATTAGCAGGTGTACTGCA 3725 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3981 TAACGCCAAGGAGAGACCAAAACAGTGTGTTGCTGCTGAAGCATTAGCAGGTGTACTGCA 4040 Query 3726 CTCTGATGTTAATGGTCTTCTTGGTGAGTGGGATAGCTGGATAATGGTTCAGTTGCAGAA 3785 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4041 CTCTGATGTTAATGGTCTTTTTAATGAGTGGGATAGCTGGATAATGGTTCAGTTGCAGAA 4100 Query 3786 TGTTATTCTTGGCCAATCAGTAGAATCCATACCGGAATGGGCTGCTTGCATACGTTATGC 3845 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4101 TGTTATTCTTGGCCAATCAGTAGAATCCATACCGGAGTGGGCTGCTTGCATACGTTATGC 4160 Query 3846 TGTCACGGGGAAAGGGAAGCAAGGAACCAAAATTCCTGTCATTAGACAACAAATTTTGGA 3905 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4161 TGTCACAGGGAAAGGGAAGCAAGGAACCAAAATTCCTGTCATGAGACAACAAATTTTGGA 4220 Query 3906 CTGTATAGTGGCACCATTACCACCAACTGCGACCACCACTGTTGTTGCAAAGCGGTATGC 3965 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4221 CTGTATAGTGGCACCATTACCACCAACTGCGACCACAACTGTTGTTGCAAAGCGGTATGC 4280 Query 3966 TTTTCTTTCGGCTGCTCTGATAGAACTATCTCCACCAAAGATGCCTGTATCAGAAGTGAA 4025 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| Sbjct 4281 TTTTCTTTCGGCTGCTCTAATAGAACTATCTCCACCAAAGATGCCCGTAACAGAAGTGAA 4340 Query 4026 GCTGCATATCGTGCTTCTTGATGAGTTGATCTGTAATATGTCCCATTCCTCGGCACAAAT 4085 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 4341 GCTGCATATCGTGCTTCTTGATGAGTTGATCTGTAATATGTCCCACTCCTCGGCACAAAT 4400 Query 4086 AAGGGAAGCTATCGGTGTAATTCTTTCAGTATTATGTTCTAACATTCGGCTGCGGATGTC 4145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4401 AAGGGAAGCTATCGGTGTAATTCTTTCAGTATTATGTTCTAACATTCGGCTGCGGATGTC 4460 Query 4146 ATATCAACAAGAACATCCATCTGAAGAAGGGAGAACAGATGTTGATAGCCAACTTAAGGA 4205 ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4461 ATATCAACAAGAATATCCAACTGAAGAAGGGAAAACGGATGTTGATAGCCAACTTAAGGA 4520 Query 4206 GGAAAATTGGTTCAAGTTGATTGGTGCAAAAGCATCTGAAGCTGTAAAAAACATTCAACA 4265 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4521 GGAAAATTGGTTCAAATTGATTAGTGCAAAAGCATCTGAAGCTGTAAAAAACATTCAACA 4580 Query 4266 AGCTAGCATATCAGATAGCTTGGACACTTCAGCAGATGTGGATATGGAAAATGCTCAATC 4325 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct 4581 AGCTAGCATATCAGATAGCTTGGACACTTCAACAGATGTAGATATGGGAAATGCTCAATC 4640 Query 4326 AAATGGCGACTCTCTTGATGATGTTAAATGGATGGAGACGCTCTTCCATTTCATTATCTC 4385 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4641 AAATGGCGATTCTCTTGATGATGTTAAATGGATGGAGACGCTCTTCCATTTCATTATCTC 4700 Query 4386 ATCTTTCAAATCTGGAAGGGCTTCGTATCTGCTAGACGTAATTGCGGGATTCCTCTATCC 4445 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 4701 CTCTTTCAAATCTGGAAGAGCTTCGTATCTGCTAGACGTAATTGCTGGATTCCTCTATCC 4760 Query 4446 AGTGATATCCTTACAGGAAACATCACATAAAGATCTATCAATATTGGCTAAGGCAGCCTT 4505 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4761 AGTGATGTCCTTACAGGAAACATCACATAAAGATCTGTCAATATTGGCCAAGGCAGCCTT 4820 Query 4506 TGAGCTGCTGAAATGGCGAGTTTTCCCAGAATCTCATCTACAGAAAGTTATTGGAGTCAT 4565 |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4821 TGAGCTGCTGAAGTGGCGAGTTTTCCCAGAGTCTCATCTACAGAAAGTTATTGGAGTCAT 4880 Query 4566 TCTTTCTTCTGCTGATGACTGTAACTGGCGGATAAGATCTTCAACCCTGACATATCTGCG 4625 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4881 TCTTTCTTCTGCTGATGACTCTAACTGGCGGATAAGATCTTCAACCCTGACATATCTGCG 4940 Query 4626 AACTTTTATGTATAGGCATACTTTCATCCTCACTCATGAAGATAAACAGAAAATCTGGAA 4685 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4941 AACTTTTATGTATAGGCATACTTTCATCCTCACTCATGAAGATAAACAAAAAATCTGGAA 5000 Query 4686 AACGGTGGAAAAGCTCCTTGTTGACAGCCAAGTAGAGGTACGAGAACATGCAGCAGCAGT 4745 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 5001 AACAGTGGAAAAGCTCCTTGTTGACAGCCAAGTAGAGGTACGAGAGCATGCAGCAGCAGT 5060 Query 4746 TCTAGCAGGCCTAATGAAAGGAGGAGATGAAGAATTTGCTGCAGATTTTCGTGATAGATC 4805 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5061 TCTAGCAGGCCTAATGAAAGGAGGAGATGAAGATTTTGCTGCAGATTTTCGTGATAGATC 5120 Query 4806 CTACACAGAGGCAAACTCAATCCAGAAGAGAAGAAATCGGAGGAAAGCAAGTTCAACTCA 4865 ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 5121 CTATGCAGAGGCAAACTCAATCCAAAAGAGAAGAAATCGGAGGAAATCAAGTTCAACTCA 5180 Query 4866 GTCCATTGCAGAGGTGCATGGAGCCGTTCTTGGTTTAGTAGCTTCAGTTTTGTCTGTTCC 4925 ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 5181 GTCCATTGCGGGGGTGCATGGAGCCGTTCTTGGTTTGGTAGCTTCAGTTTTGTCTGTTCC 5240 Query 4926 TTATGACATGCCCAGCTGGCTGCCGGATCATGTGACCTTACTGGCTCGTTTCGCGGGTGA 4985 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5241 TTATGACATGCCCAGCTGGCTGCCGGAGCATGTGACCTTACTGGCTCGGTTCGCGGGTGA 5300 Query 4986 ACCTACACCTATAAAATCGACTGTGACTAAAGCAGTGGCTGAGTTCCGGCGAACCCATGC 5045 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5301 ACCTACACCTATAAAATCGACTGTGACTAAAGCAGTGGCTGAGTTCCGGCGAACCCATGC 5360 Query 5046 GGATACATGGAACATCCAGAAAGATTCGTTCACTGAAGATCAGCTCGAGATCTTGACGGA 5105 |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| | || Sbjct 5361 GGATACATGGAACATCCAGAAAGACTCATTCACCGAAGATCAGCTTGAGATCTTGGCCGA 5420 Query 5106 TACATCTTCCTCTTCCTCATACTTTGCTTGATTTATGTCGGGGAATTGAGTTTCGTGAAA 5165 |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||| Sbjct 5421 TACATCTTCCTCTTCCTCGTACTTTGCTTGATTAATGTCGAGGAACTGAGTCTCGTCAAA 5480 Query 5166 AAA-GA-ACCACATCTTTGTAACTCCACCTTTTATTGATTTTTAATTTTGC-CCAATATA 5222 | | || | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct 5481 AGACGATAATAC-TAAA-GTAACTCCACCTTTTATTGATTTTTAATTTTGTGCCAAAATA 5538 Query 5223 GATGTAATAATAA-AACCATG 5242 ||||||||||||| ||| ||| Sbjct 5539 GATGTAATAATAATAAC-ATG 5558 Score = 649 bits (351), Expect = 0.0 Identities = 369/378 (98%), Gaps = 0/378 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGCATCTGTACAATGAATGGCTACCGCCGCCTGTAGCGGAGGAGACGAAGAAGGAGAAA 60 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGCATCTGTACAATGAATGGTTACCGCCGCCTGTAGCGGAGGAGACGAAGAAGGAGAAA 60 Query 61 GAGTCCTTCGCTCGTGTCGTGCGATGCGTCAAAGAGTTACACCGACCCGATGATCCAGAG 120 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GAGTCCTTCGCGCGTGTCGTGAGATGCGTCAAAGAGTTGCACCGACCCGATGATCCAGAG 120 Query 121 TCTGTTTACGCCACTCTTAAATGGATCTCCGTTATCGAACTCTTTGTTAGAGCGAAAAGT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TCTGTTTACGCCACTCTTAAATGGATCTCCGTTATCGAACTCTTTGTTAGAGCGAAAAGT 180 Query 181 GAATTGTCTGTGGAAGATGTTAGTGAACTCGTGGAAATTGGCTTACAAATTTTTCATTCA 240 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GAATTGTCCGTGGAAGATGTTAGTGAACTCGTGGAAATTGGCTTACAAATTTTTCATTCA 240 Query 241 TCTGAGAATAAGTTGTATGCACAGGTTAGATGGGGTAATGTTTTAGTCAGACTGATCAAC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TCTGAGAATAAGTTGTATGCACAGGTTAGATGGGGTAATGTTTTAGTCAGACTGATCAAC 300 Query 301 AAGTATCGTAAGAAGCTTTCTTTGAAAGTTCAGTGGAGACCCTTGTATGATACCTTGATT 360 |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AAGTTTCGTAAGAAGCTGTCTTTGAAAGTTCAGTGGAGGCCCTTGTATGATACCTTGATT 360 Query 361 CATGCACATTTCAGCAGG 378 ||||| |||||||||||| Sbjct 361 CATGCTCATTTCAGCAGG 378 Score = 172 bits (93), Expect = 2e-41 Identities = 99/102 (97%), Gaps = 0/102 (0%) Strand=Plus/Plus Query 378 GTCTCTTTTGGAGAATCCTTGGCATAATTCCTCGTTTGAGGGCTCTGGTTTTGTGAGATT 437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 501 GTCTCTTTTGGAGAATCCTTGGCATAATTCCTCGTTTGAGGGCTCTGGCTTTGTGAGATT 560 Query 438 GTTCCTTCCTACGAACCCTGGAAATCAGGATTTCTTCTCCGA 479 |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 561 GTTCCTTCCTACGAACCCCGAAAATCAGGATTTCTTCTCCGA 602 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 262322944947 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5