BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg479149
Length=3773
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G16830.1 | Symbols: TPR2 | TOPLESS-related 2 | chr3:5731534-... 6032 0.0
> AT3G16830.1 | Symbols: TPR2 | TOPLESS-related 2 | chr3:5731534-5737772
FORWARD LENGTH=3812
Length=3812
Score = 6032 bits (3266), Expect = 0.0
Identities = 3626/3796 (96%), Gaps = 40/3796 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TTTTCTTCATTTTCGCTTTGCGACGCGAGGAAATGCAACCTTGAAACCCTAGAAAAC-CA 60
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5 TTTTCTTAATGTTCGCTTTGCGACGCGAGGAAATGCAACCTTGAAACCCTAGAAAACTCA 64
Query 61 TTC-CAACTACGACTAAATCGATTTCACAAACTTTGACCTACCCTTCTTTCACCATAAAC 119
||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 65 TTCTCAACTACGACTAAATCGATTTCGCAAACTTTGACCTACCCTTCTTTCACGATAAAC 124
Query 120 CCAGATCGCTTTAATTCCTTGAA-----T-TTC---------TA-GCAAAAATGTCGTCT 163
||||||||||| ||||||||||| | ||| || | |||||||||||||
Sbjct 125 CCAGATCGCTTAAATTCCTTGAATTTCTTCTTCTGAGAGTTTTAGGAAAAAATGTCGTCT 184
Query 164 TTGAGCAGAGAGTTAGTTTTCCTAATCCTCCAGTTCTTAGATGAGGAGAAGTTCAAGGAA 223
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 185 TTGAGCAGAGAGTTAGTTTTCTTAATTCTCCAGTTCTTAGATGAGGAGAAGTTCAAGGAA 244
Query 224 TCTGTTCACAAGCTAGAGCAAGAATCTGGCTTCTTTTTTAATATTAAGTACTTTGAAGAG 283
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 245 TCTGTTCACAAGCTAGAGCAAGAATCTGGCTTCTTCTTTAACATTAAGTACTTTGAAGAG 304
Query 284 AAAGCTCTTGCTGGAGAGTGGGACGAAGTGGAGAAGTATCTTTCTGGTTTCACTAAAGTC 343
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 AAAGCTCTTGCTGGAGAGTGGGATGAAGTGGAGAAGTATCTTTCTGGTTTCACTAAAGTC 364
Query 344 GATGATAATCGTTACTCTATGAAAATCTTCTTTGAGATTAGGAAGCAAAAGTATCTCGAA 403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 GATGATAATCGTTACTCTATGAAAATCTTCTTTGAGATTAGGAAGCAAAAGTATCTCGAA 424
Query 404 GCTCTAGATCGAAATGACAGAGCAAAAGCTGTTGAGATATTAGCCAAAGACTTGAAAGTT 463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 GCTCTAGATCGAAATGACAGAGCAAAAGCTGTTGAGATATTAGCCAAAGACTTGAAAGTT 484
Query 464 TTCGCGACCTTTAACGAGGAGCTTTACAAGGAGATTACTCAGCTGCTAACTCTGGAGAAT 523
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 485 TTCGCTACATTTAACGAGGAGCTTTACAAGGAGATTACTCAGCTGCTTACTCTGGAGAAT 544
Query 524 TTTAGGGAAAATGAGCAATTGTCTAAATATGGTGATACGAAATCAGCGAGGTCTATAATG 583
|||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 545 TTTAGGGAAAATGAGCAACTGTCGAAATATGGTGATACTAAATCTGCAAGGTCTATAATG 604
Query 584 TATACTGAGTTGAAGAAATTGATTGAGGCAAATCCTCTGTTTCGAGAGAAGCTAGCCTTC 643
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 605 TATACTGAGTTGAAGAAATTGATTGAGGCGAATCCTCTGTTTCGAGAGAAGCTAGCCTTC 664
Query 644 CCCAGTTTCAAAGCTTCTCGCCTGCGAACTTTGATCAATCAAAGCTTAAACTGGCAGCAC 703
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 CCCAGTTTCAAAGCTTCTCGCCTGCGAACTTTGATCAATCAAAGCTTAAACTGGCAGCAT 724
Query 704 CAGCTATGTAAAAATCCAAGGCCTAATCCTGACATCAAGACATTGTTCTTGGATCACTCT 763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725 CAGCTATGTAAAAATCCAAGGCCTAATCCTGACATCAAGACATTGTTCTTGGATCACTCT 784
Query 764 TGCTCACCATCAAATGGTGCTCGTGCTCTCACTCCTGTGAATCTTCCAGTTGCTGCTGTT 823
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 785 TGCTCACCATCAAACGGTGCTCGTGCACTCACTCCTGTCAATCTTCCAGTTGCTGCTGTT 844
Query 824 GCAAGACCTTCAAACTTTGTTCCTCTTGGAGTACATGGTGGACCGTTTCAACCTAGCCCT 883
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||
Sbjct 845 GCAAGACCTTCAAACTTTGTTCCTCTTGGAGTGCATGGTGGACCCTTTCAATCTAATCCT 904
Query 884 GCCCCGGCTCCTAATGCCAATGCTTTAGCTGGATGGATGGCAAACCCAAATCCTTCTTCA 943
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 905 GCTCCGGCTCCTAATGCCAATGCTTTAGCTGGATGGATGGCAAACCCAAATCCTTCTTCA 964
Query 944 TCAGTTCCATCTGGTGTCGTCGCTGCTTCCCCATTTCCTATGCAGCCAAGTCAAGTTAAT 1003
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 TCAGTTCCATCTGGTGTTGTCGCTGCTTCCCCATTTCCTATGCAGCCAAGTCAAGTTAAT 1024
Query 1004 GTGTTGAAACACCCTCGGGCACCGTCTAACTCTCTAGGGTTGATGGATTATCAAAATGCT 1063
| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||
Sbjct 1025 GAGCTGAAACACCCTCGGGCACCGTCTAACTCTCTAGGATTAATGGATTATCAAAGTGCT 1084
Query 1064 GATCACGAGCAACTCATGAAACGCTTACGGTCTGCACAAACATCCAACGAGGTCACATAT 1123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085 GATCACGAGCAACTCATGAAACGCTTACGGTCTGCACAAACATCCAACGAGGTCACATAT 1144
Query 1124 CCTGCCCATTCTCATCCCGCTGCGTCACTTGATGACCTCCCTAGAAATGTCGTGAGCACA 1183
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 1145 CCTGCTCATTCTCATCCCCCTGCGTCACTTGATGACCTCCCTAGAAATGTAGTGAGTACA 1204
Query 1184 ATTCGCCAAGGGTCGGTGGTGATAAGCATGGATTTTCACCCTTCTCATCACACTTTACTC 1243
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1205 ATTCGCCAAGGGTCGGTGGTGATAAGCATGGATTTTCACCCTTCTCATCACACTTTGCTC 1264
Query 1244 GCTGTTGGTTGTTCAAGCGGCGAAGTCACCTTGTGGGAAGTTGGATCCAGAGAGAAGGTT 1303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1265 GCTGTTGGTTGTTCAAGCGGCGAAGTCACCTTGTGGGAAGTTGGATCCAGAGAAAAGGTT 1324
Query 1304 GTCACAGAACCTTTCAAGATATGGAATATGGCGGCTTGTTCTGTGATCTTCCAGGGTTCT 1363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 GTCACAGAACCTTTCAAGATATGGAATATGGCGGCTTGTTCTGTGATCTTCCAGGGTTCT 1384
Query 1364 ATAGTCAAAGAGCCATCGATATCTGTCACTCGTGTAGCATGGAGCCCAGATGGAAATTTG 1423
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1385 ATAGTCAAAGAGCCATCGATATCCGTCACTCGTGTAGCATGGAGCCCAGATGGAAACTTG 1444
Query 1424 CTTGGGGTTTCTTTTACTAAACATCTGATCCATGTATATGCTTACCAAGGCTCAGACCTA 1483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1445 CTTGGGGTTTCTTTTACTAAACATCTGATCCATGTATATGCTTACCAAGGCTCAGACCTA 1504
Query 1484 CGTCAGCACCTCGAGATTGATGCTCATGTAGGCTGTGTGAATGACTTGGCGTTCGCCCAC 1543
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1505 CGTCAACACCTCGAGATTGATGCTCATGTAGGCTGTGTGAATGACTTGGCGTTCGCCCAC 1564
Query 1544 CCAAATAAGCAAATGTGTGTTGTGACTTGTGGTGATGACAAATTGATTAAGGTGTGGGAT 1603
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565 CCAAATAAGCAAATGTGTGTTGTGACTTGTGGGGATGACAAATTGATTAAGGTGTGGGAT 1624
Query 1604 TTGAGTGGGAAGAAGCTTTTCACTTTTGAAGGCCACGAGGCACCGGTTTATTCCATTTGC 1663
||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1625 TTGAGTGGGAAGAAGCTCTTCACCTTTGAAGGGCACGAGGCACCAGTTTATTCCATTTGC 1684
Query 1664 CCTCACCAGAAGGAAAATATTCAGTTTATATTCTCAACAGCTCTTGATGGAAAGATCAAG 1723
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1685 CCTCACCAGAAGGAAAATATTCAGTTTATATTCTCAACCGCTCTTGATGGAAAGATCAAG 1744
Query 1724 GCGTGGCTCTATGATAATGTTGGTTCTCGGGTTGATTACGACGCACCAGGACAGTGGTGT 1783
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1745 GCGTGGCTCTATGATAATGTTGGTTCTCGGGTTGATTATGACGCACCGGGACAGTGGTGT 1804
Query 1784 ACAACAATGCTCTACAGTGCTGATGGAAGCAGATTATTTTCTTGTGGTACGAGTAAAGAG 1843
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1805 ACAACAATGCTCTACAGTGCTGATGGAAGCAGACTATTTTCTTGTGGGACGAGTAAAGAA 1864
Query 1844 GGAGACTCTTTCCTCGTTGAGTGGAATGAGAGCGAAGGTGCCCTAAAGAGGACATATTTA 1903
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1865 GGAGACTCTTTCCTCGTCGAGTGGAATGAGAGTGAAGGTGCCCTAAAGAGGACATATTTA 1924
Query 1904 GGCTTTAGGAAGAAATCACCTGGAGTTGTTCAGTTTGATACAACCCGTAACCGTTTCTTG 1963
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GGCTTTAGGAAGAAATCAGCTGGAGTTGTTCAGTTTGATACAACCCGTAACCGTTTCTTG 1984
Query 1964 GCTGTTGGTGAAGACAATCATGTAAAATTCTGGGACATGGACAATACAAATCTTTTGACA 2023
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1985 GCTGTTGGTGAAGACAATCAAATAAAATTCTGGAACATGGACAATACAAATCTTTTGACA 2044
Query 2024 ACTGTTGAGGCTGAAGGAGGACTTCCGAATCTACCCCGACTGAGATTCAACAAGGATGGG 2083
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2045 GTTGTTGAGGCTGAAGGTGGACTTCCGAATCTACCCCGATTGAGATTCAACAAGGATGGG 2104
Query 2084 AATCTTCTTGCAGTTACTACAGCAGATAACGGATTCAAGATCCTTGCAAATACTGATGGT 2143
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2105 AATCTTCTTGCAGTTACTACAGCAGATAATGGATTCAAGATCCTTGCAAATACTGATGGT 2164
Query 2144 CTCAGAACATTAAGAGCATTTGAAGCGCGGTCTTTTGAAGCATCTAAAGCATCCATTGAT 2203
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2165 CTCAGAACCTTAAGAGCATTTGAAGCGCGGTCTTTTGAAGCATCTAAAGCATCCATTGAT 2224
Query 2204 ATGAAGGTATCCCCCTCCGCAATGGCTACAAGCATCAGCCCAGCTATTGGTAAAATTGAA 2263
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2225 ATGAAGGTATCCACCTCCGCAATGGCTTCAAGCATCAGCCCCGCTATTGGTAAAATTGAA 2284
Query 2264 CACATGGACACAGACTCTCCTGCAAGGCCAACCCCAATTCCTAATGGAATTGAGGCAATG 2323
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285 CACATGGACGCAGGCTCTCCTGCAAGGCCAACCCCAATTCCTAATGGAATTGAGGCAATG 2344
Query 2324 TCAAGAACTATGGAAAAGCCAAGAAACGTGGACCCTGTTGATAAGTCTAAAACTTTAGAG 2383
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2345 TCAAGAACTATGGAAAAGCCAAGAAACTTGGACTCTGTTGATAAGTCTAAACCTTTAGAG 2404
Query 2384 CTCACAGAAATTGTTGATCCGACTCAGTGCCGACAAGTAAACA-TGCCAGATAGCAAGGA 2442
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||
Sbjct 2405 CTCACAGAAATTGTTGATCCGACTCAGTGCCGACAAGTGA-CAATGCCAGATAGCAAGGA 2463
Query 2443 TTCTGTTAGCAAGGTTGCTCGGCTTCTGTATACAAATTCTGGTGTCGGTGTTTTGGCTCT 2502
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 2464 CTCTGTTAGCAAGGTTGCTCGGCTTCTTTACACAAATTCTGGCGTTGGTGTTTTGGCTCT 2523
Query 2503 TGGATCAAATGGTGTCCAAAGACTATGGAAGTGGAGCCGCAATGAGCAAAATCCAACTGG 2562
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2524 TGGATCAAATGGTGTTCAAAGACTATGGAAGTGGATCCGCAATGAGCAAAATCCAACTGG 2583
Query 2563 GAAGGCAACTGCTAGTGTAACTCCACAGCATTGGCAGCCAAACAGCGGTCTCCTAATGGC 2622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2584 GAAGGCAACTGCTAGTGTAACTCCACAGCATTGGCAGCCAAACAGCGGTCTCCTAATGGC 2643
Query 2623 AAATGATGTTCCTGAGAATCCTGAAGGG-GCTGTTCCGTGTATAGCGCTTTCTAAGAATG 2681
|||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 2644 AAATGATGTTCCCGAGAATCCTGAAGGGAG-TGTTCCGTGTATAGCACTTTCCAAGAATG 2702
Query 2682 ACTCATATGTAATGTCAGCTTGTGGTGGAAAAGTTTCGTTATTCAATATGATGACTTTCA 2741
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2703 ACTCATACGTAATGTCAGCTTGTGGTGGAAAGGTTTCGTTATTCAATATGATGACTTTCA 2762
Query 2742 AAGTAATGACAACGTTCATGCCACCACCACCAGCTTCAACTTTCTTGGCGTTTCATCCTC 2801
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2763 AAGTAATGACAACTTTCATGCCACCGCCACCAGCTTCAACTTTCTTGGCATTTCATCCTC 2822
Query 2802 AAGATAATAACATTATTGCAATCGGGATGGAGGACTCGAGTATACATATTTACAACGTCA 2861
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2823 AAGATAATAATATTATTGCAATCGGGATGGAGGACTCGAGTATACATATTTACAACGTCA 2882
Query 2862 GGGTAGATGAGGTGAAAACAAAGTTGAAAGGTCACCAGAAGCACATAACTGGTCTAGCAT 2921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2883 GGGTAGATGAGGTGAAAACAAAGTTGAAAGGTCACCAGAAGCACATAACTGGTCTAGCAT 2942
Query 2922 TCTCTACCGCACTCAATATTCTTGTCTCTTCTGGTGCCGATGCTCAGCTCTTCTTCTGGA 2981
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2943 TCTCTACCGCGCTCAATATTCTTGTCTCTTCTGGTGCCGATGCTCAGCTCTTCTTCTGGA 3002
Query 2982 CCGCTGACTCGTGGGAGAAGAAGAAATCTTCAGCGATACAGCTACCACCTGGAAAAGCAC 3041
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3003 CCGCTGACTCGTGGGAGAAAAAGAAATCTTCAGCGATACAGCTACCACCTGGCAAAGCAC 3062
Query 3042 CAGTAGGTGACACGCGAGTCCAATTCCATAACGACCAAATCCAGTTATTGGTTTCACATG 3101
||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3063 CAGTAGGCGACACACGAGTCCAATTCCACAACGACCAAATCCAGTTATTGGTTTCACATG 3122
Query 3102 AGACACAGCTAGCCATTTACGATGCTGCGAAGATGGAATGCATTCATAAGTGGGTGCCAC 3161
|||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3123 AGACACAGCTCGCCATTTACGATGCTTCGAAGATGGAATGCATTCATAAGTGGGTGCCCC 3182
Query 3162 AAGACGCTCTCTCGTCGCCCATAACCTCTGCATCTTACTCATGCAACAGCCAACTGGTTT 3221
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AAGAAGCTCTCTCTTCGCCCATAACCTCTGCATCTTACTCATGCAACAGCCAACTGGTTT 3242
Query 3222 ACTCGTCATTCGCTGATGGAAACATTGGAGTCTTTGATGCTGAATCCTTGAGACTCAGAT 3281
|| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3243 ACGCGTCATTCGCTGATGGAAACATTGCAGTCTTTGATGCTGAATCCTTGAGACTCAGAT 3302
Query 3282 GTCGCATTGCCCCATCAGCTTACATGCCTCAACCAACACCGAACAGTGCACCGATCATTC 3341
| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 3303 GCCGCATTGCCCCATCAGCCTACATGCCTCAACCTACACCAAACAGTGCACCGATT-TTC 3361
Query 3342 C-ACAGGTGATCACAACTCATCCACAAGAACCGAATCAATTAGCGGTTGGACTCTCTGAT 3400
| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3362 CCACAGGTGATCACAGCTCATCCACAAGAACCGAATCAATTAGCGGTTGGACTGTCTGAT 3421
Query 3401 GGTTCGGTTAAAGT-ACTTGAGCCATCGGAACTTTCTAGAAGATGGGGTGTTGGCGTCAC 3459
|||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3422 GGTTCGGTTAAAGTGA-TTGAGCCATCAGAACTTTCTAGAAGATGGGGTGTTGGCGTCGC 3480
Query 3460 GGCCGGTTCAGATAAAGCAGGGACTGAAAATGGACGGCCGTCTAGTTCATCAGCGGCTAA 3519
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3481 AGCTGGTTCAGATAAAGCAGGGACTGAAAATGGACGGCCGTCTAGTTCATCAGCGGCTAA 3540
Query 3520 CAACTCAAGTTCAGATCAGATTCAAAGGTAAAAATAGCTGATGTCAGTTAAGTTAGTTGA 3579
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 3541 CAACTCAAGTTCGGATCAGATTCAAAGGTAAAAATAGTTTATGTCAGTTAAGTTAGTTGA 3600
Query 3580 CATATCTTTT-TTATTTTGGATTGTAAAGTTGTGATAGCTTGTGCTGTTTTTGTAAATGA 3638
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3601 CATATCTCTTGTTATTTTGGATTGTAAAGTTGTGATAGCTTGTGCTGTTTTTGTAAATGA 3660
Query 3639 GATTCTTAAATTAAATCAGTAGGCGTAATAACAGTTGTTAttttttattttttatttCGG 3698
|||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |||
Sbjct 3661 GATTCTCAAATTAAATCAGTAGGCGCAATAACAGTT-T-ATTTTATATTTTT-----CGG 3713
Query 3699 CGTTATAACAGTTTTA-GAAAGGCTATAATACTCTTGAATGTAGTGGCTTTTAATGTGTA 3757
|||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| |||| | ||
Sbjct 3714 CGTTTTAACAGTTTTAAGAT-GGCTATA---CTCTTGAATGTAGTAGCTCTTAAA-TCTA 3768
Query 3758 TGGATTTGTCAAAAAT 3773
||||||||||||||||
Sbjct 3769 TGGATTTGTCAAAAAT 3784
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 187925368478
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5