BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg479540
Length=2797
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G20200.1 | Symbols: | Protein kinase protein with adenine n... 4252 0.0
> AT3G20200.1 | Symbols: | Protein kinase protein with adenine
nucleotide alpha hydrolases-like domain | chr3:7047581-7051342
FORWARD LENGTH=2854
Length=2854
Score = 4252 bits (2302), Expect = 0.0
Identities = 2670/2838 (94%), Gaps = 63/2838 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 AATTACTATGGCGGAGAATTCGCGACTACGAGAGCTACGGAGACACAGATGAT------- 54
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8 AATTACTATGGCGGAGAATTCGCGGCTACGAGAGCTACGGAGACACAGATGATGAAAGAG 67
Query 55 -----GA-A-agagagagagagag---G-CCGG----AATTATCCATTGTTGTTCTTCAG 99
|| | |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 AGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGTGAGGTTAAAATTATCCATTGTTGTTCTTCAG 127
Query 100 TTCACCACTGAATCGAA-ATTTCTAATTTGGGGAAAGAGGATTTCTTGAAAGCCCTAATT 158
| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 128 TGCACCACTGAATCGAAGTTTTCTAATTTGGAGAAAGAGGATTTCTCAAAACCCCTAATT 187
Query 159 TTGGAATACCGCAGATTTCTTTAGTATTGAGAATGAGATTTTCCAAGAAGACAGAGGCAA 218
| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| |
Sbjct 188 TAGGAAGACCGCAGATTTCTTTAGTATTGAGAATGAGATTCTCC--G-AGA-AGATG--- 240
Query 219 AGATTGTTCTAGTGAATCGAGAGATTGATATCGTTAAATGCGGGGA-TTTGCAATCTAGG 277
|| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 241 -GA----T-TAGTGAATCGAGAGGTTGATATCGTTAAATGCGGGGATTTTGCAATCTAGG 294
Query 278 GTTCTTAAGCTTTGTAATCGATGAAGGCCCAAAAGGGAAGCTCGAAGAAGAAAAGTGCGA 337
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 295 GTTCTTAAGCATTGTAATCGATGAAGGCTCAAAAGGGAAGCTCGAAGAAGAAAGGTACGA 354
Query 338 ATTCTGGGTTAGTCGCTGTAGCAGTTGATAATAACAAAGGAAGCCAACATGCTCTCAAAT 397
||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 ATTCTGGGTTAGTCGCTGTAGCAGTGGATAACAATAAAGGAAGCCAACATGCTCTCAAAT 414
Query 398 GGGCTGCTGATCATCTTGTCTCTAAAGGACAAACCATTATCCTCCTCCATGTTATCCTTA 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415 GGGCTGCTGATCATCTTGTCTCTAAAGGACAAACCATTATCCTCCTCCATGTTATCCTTA 474
Query 458 GATCACCCTCTGATTCAGGTGAGATTACTGCAGAAAAACATAAGCAAGCTGAGAATCTTT 517
| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 475 GGTCATCCTCTGATTCAGGTGAGATTACTGCAGAGAAACATAAGCAAGCTGAAAATCTTT 534
Query 518 TCGTGACATTCCATTGCTACTGCAGTCGAAAAGAGATACAATGCCTTGATGTCACGCTTG 577
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 TTGTGACATTTCATTGCTACTGCAGTCGAAAAGAGATACAATGCCTTGATGTCACGCTTG 594
Query 578 AGGATGACAACATTGTCAAGTCCCTTGCTGAATATGTTTCCTCTGGCGTGATTGAGAATT 637
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 595 AGGATGACAACATTGTCAAGTCCCTTGCGGAATATGTTTCCTCTGGTGTGATTGAGAATT 654
Query 638 TGGTTCTTGGTGCCCCTTCCAGGCATGGATTCATGAGGAAATTTAAGATTTCTGATACAC 697
|| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 TGATTCTTGGTGCTCCTTCGAGGCATGGATTCATGAGGAAATTTAAGATTTCTGATACAC 714
Query 698 CGAGCAATGTAGCGAAAGCAGCACCTGATTTCTGTACAGTTTACGTTATTTCAAAAGGGA 757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 CGAGCAATGTAGCGAAAGCAGCACCTGATTTCTGTACAGTTTACGTTATTTCAAAAGGGA 774
Query 758 AGATATCATCTGTCCGCTATGCCTCACGAGCTGCCCCATATCGGTCTCCGCTTATGGGTC 817
||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 AGATATCATCTGTCCGCCATGCCTCACGAGCTGCTCCATATCGGTCTCCGCTTATGGGTC 834
Query 818 AGATTGAAAACCACTCTGAAATCATTAACTACGAAAAGTTCAAAAACACCATGAGCTTTA 877
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 835 AGATTGAAAACCACTCTGAAATCATAAACTACGAAAAGTTCAGAAACACCATGAGCTTTA 894
Query 878 GAGATAGGGCTCCGGCCAGGTCTTCGACTGCTAGCTCCATTGAAGATTATGGAAAGTCAC 937
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 GAGATAGGGCTCCTCCCAGGTCTTCGACTGCTAGCTCCATTGAAGATTATGGAAAGTCAC 954
Query 938 CTATGGCAAGGACATCAAATTATGCAAACTCATTCTTTGAGTTGGAAGACTCCGAAAACG 997
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 955 CTATGGCAAGGACGTCAAATTACGCAAACTCATTCTTTGATTTGGAAGATTCCGAAAACG 1014
Query 998 ACATATCATTTGTTTGCTCAGGCAGGCCAAGTACCACAAGCTCAGGCCGGCCAAGTACAA 1057
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 ACATATCATTTGTTTGCTCAGGCAGGCCAAGTACCGCAAGCTCAGGCCGGCCAAGTACAA 1074
Query 1058 GTACCGGAAGGTCTGACATATCTTTTGTGAGCTCAGGCAGGCCGAGTACAAGCACCACCG 1117
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1075 GTACCGGAAGGTCTGACATATCTTTTGTGAGCTCAGGCAGGCCGAGTACAAGCACCACTG 1134
Query 1118 GAAGCCCTTCCTTCATCTACGATTTTCCTGATTCTGGTTTAACTCCGAGAAAGTCGACGA 1177
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1135 GAAGCCCTTCCTTCATCTACGATTTTCCTGATTCTGGTTTAACTCCGAGAGAGTCGACGA 1194
Query 1178 GCTCTGGACACTCTATGCGTCTAGGAATCAGGTTCAATGACACCAATATCCAACATGATT 1237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1195 GCTCTGGACACTCTATGCGTCTAGGAATCAGGTTCAATGACACAAATATCCAACATGATT 1254
Query 1238 TCTCATTCGTCTCACAAGATAGCGGTCGGTCATCTTGTTCTTGTTCACCACAAAACTTGG 1297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 TCTCATTCGTCTCACAAGATAGCGGTCGGTCATCTTGTTCTTGTTCACCACAAAACTTGG 1314
Query 1298 AAGAAGTGGAAGCTGAGATGCGGAGATTGAAGCAGGAACTGAAACACGCAATTGACATGT 1357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 AAGAAGTGGAAGCTGAGATGCGGAGATTGAAGCAGGAACTGAAACACGCAATTGACATGT 1374
Query 1358 ATGGATCAGCTTGCAGAGAAGCACTAGCTGCAAAGCAAGAGGCGAAGGAGCTCCAACGTC 1417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 ATGGATCAGCTTGCAGAGAAGCACTAGCTGCAAAGCAAGAGGCGAAGGAGCTCCAACGTC 1434
Query 1418 AGAAAATTGAAGAGGAAGGATGGGTGCAAGAAGGACAGTTATCAGAGAAATCTACAAAGT 1477
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435 AGAAAATTGAAGAGGAAGGGTGGGTGCAAGAAGGACAGTTATCAGAGAAATCTACAAAGT 1494
Query 1478 CCATAGTGGAAAAAGAGAGAGCACATAAAGCTGCCATGGAGGCTTCTGAAACAGCAGGCA 1537
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1495 CCATAGTGGAAAAAGAGAGAGCACATAAAGCTGCGAAGGATGCTTCTGAAACAGCAGGCA 1554
Query 1538 AGATAGCAGATCTCGAAACACAAAGAAGAGCCATAGAAGCTGCAGGCTCTTTCTCTGATT 1597
|||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1555 AGATAGCAGAGCTCGAAACACAAAGAAGAGCTATAGAAGCTGCAGGTTCTTTCTCTGATT 1614
Query 1598 CCAGTTTAAGGTATCGAAGGTATGTTATTGGTGAGATTGAAGAAGCCACAAACTCATTCG 1657
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 CCAGTTTAAGGTATCGAAGGTATGTCATTGGTGAGATTGAAGAAGCCACAAACTCATTCG 1674
Query 1658 ACAAGGCTAATAAAATAGGCGAAGGCGGGTATGGTCCTGTCTATAAGGGTTATCTTGATC 1717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 ACAAGGCTAATAAAATAGGCGAAGGCGGGTATGGTCCTGTCTATAAGGGTTATCTTGATC 1734
Query 1718 ATACCCCTGTTGCTATCAAGGTTTTGAGAGCAGATGCAGTTCAAGGAAGATCTCAATTTC 1777
|||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1735 ATACCCCTGTTGCTATTAAGGCTTTGAAAGCAGATGCAGTTCAAGGAAGATCTCAATTTC 1794
Query 1778 AAAGAGAGGTAGAAGTTCTTAGCTGCATAAGACATCCACATATGGTGCTACTTATTGGTG 1837
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |
Sbjct 1795 AAAGAGAGGTAGAAGTTCTTAGCTGCATAAGACACCCACACATGGTACTACTAATTGGAG 1854
Query 1838 CATGTCCAGAGTATGGAGTGCTTGTTTATGAGTATATGGCCAAAGGTAGTTTAGCTGATA 1897
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1855 CATGTCCAGAGTATGGAGTGCTTGTATATGAGTATATGGCCAAAGGGAGTTTAGCTGATA 1914
Query 1898 GGCTCTACAAGTATGGAAACACGCCACCGCTCTCGTGGGAGCTCAGGTTCCGAATTGCAG 1957
||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 GGCTCTATAAGTATGGAAACACACCACCACTCTCGTGGGAGCTCAGGTTCCGAATTGCAG 1974
Query 1958 CCGAAGTTGCGACGGGTCTGCTCTTCCTTCACCAGACAAAACCCGAGCCTATAGTGCACC 2017
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975 CCGAAGTTGCGACGGGTCTGCTCTTCCTACACCAGACGAAACCCGAGCCTATAGTGCACC 2034
Query 2018 GTGATCTGAAACCTGGAAACATTTTGATTGACCAGAACTACGTAAGCAAAATAGGGGATG 2077
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2035 GTGATCTTAAACCCGGAAACATTTTGATTGACCAGAACTACGTAAGCAAAATAGGGGACG 2094
Query 2078 TTGGATTAGCTAAACTGGTGCCTGCAGTTGCTGAAAACGTCACGCAGTGCCACGTGTCAT 2137
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2095 TTGGATTAGCCAAACTAGTGCCTGCAGTTGCTGAAAACGTCACGCAGTGCCACGTGTCAT 2154
Query 2138 CAACCGCTGGGACATTCTGTTACATTGACCCTGAGTACCAACAAACTGGAATGCTCGGTG 2197
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2155 CAACCGCTGGGACTTTCTGTTACATTGACCCTGAGTACCAACAAACTGGAATGCTAGGTG 2214
Query 2198 TGAAATCTGATGTATACTCTTTCGGTATCTTGCTTCTCGAACTGCTCACAGCGAAAAGGC 2257
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 TGAAATCTGATGTCTACTCTTTTGGTATCTTGCTTCTCGAACTGCTCACAGCGAAAAGGC 2274
Query 2258 CGACGGGTTTGGCTTATACCGTTGAGCAAGCGATGGAGCAAGGGAAATTCAAGGACATGT 2317
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2275 CGACGGGTTTGGCTTATACCGTTGAGCAAGCAATGGAGCAAGGGAAATTCAAGGATATGT 2334
Query 2318 TAGACCCAGCAGTGCCTAATTGGCCTGTGGAAGAAGCTTTGTCTCTAGCAAAGATTGCAC 2377
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| |
Sbjct 2335 TAGACCCAGCAGTGCCTAACTGGCCGGTGGAAGAAGCTATGTCTTTGGCAAAGATTGCTC 2394
Query 2378 TTAAATGTGCACAGCTGAGAAGGAAAGACAGACCAGACCTCGGAAAGGAGGTTTTACCAG 2437
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2395 TTAAATGTGCACAGCTGAGAAGGAAAGACCGACCAGACCTCGGAAAAGAGGTTTTACCAG 2454
Query 2438 AGCTACA-TAGACTGAGAGCTCGTGCAGATACGAATATGGAATGGATGATGTTCAACTTA 2496
|||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2455 AGCT-CAATAAATTGAGAGCTCGTGCAGATACGAATATGGAATGGATGATGTTCAACTTA 2513
Query 2497 AGCAGAGGACGTCTAACACCAAATCATAGCCAAGTTTCCTTGCCACCAGTTGATGAACTA 2556
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514 AGTAGAGGTCGTCTAACACCAAATCATAGCCAAGTGTCCTTGCCACCAGTTGATGAACTA 2573
Query 2557 AGTGTATGCTCGGATA-GCTCTTATACACATTCAAGCACTTTATCCGACACAGAGAAGAA 2615
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2574 AGTGTATGCTCGGATAAG-TCTTATACACATTCAAGCACTGTATCCGACACAGAGAAGAA 2632
Query 2616 CTCAGACCAAAACGAAGAGGATTAG-AT-----G-GAGT-GA-GGCCATTCT-T-AGT-- 2662
||||||||||||||||||||||||| || | | || || || || | ||
Sbjct 2633 CTCAGACCAAAACGAAGAGGATTAGCATATTTTGTGTGTTGAAGGAAATGGAGTGAGACC 2692
Query 2663 -TTGGTTAA-GCTTATGTAATTGTGAATATTGACCCTTGTATAGT-TGTATGTATAAAAT 2719
||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||
Sbjct 2693 ATTG-TTAAAGCTTATGTAATTGTGAATATTG----TTGTAT-GTATGTATGTATATAAT 2746
Query 2720 TCGTAAATGAAGaaaaaaaaTGAAGGAAAAAGTTGAGTAGGTTTGTTATAATATCTCTGC 2779
||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2747 TCGTAAAGGAAGAAAATAACTGAAGGAAAAAGTTGAGTAGGTTTGTTATAATATCTCTGC 2806
Query 2780 AAAGACGCAAACTCTTTT 2797
||||||||||||||||||
Sbjct 2807 AAAGACGCAAACTCTTTT 2824
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 138962432110
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5