BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg479911 Length=3489 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G24180.1 | Symbols: | Beta-glucosidase, GBA2 type family pr... 5073 0.0 > AT3G24180.1 | Symbols: | Beta-glucosidase, GBA2 type family protein | chr3:8734634-8741725 REVERSE LENGTH=3626 Length=3626 Score = 5073 bits (2747), Expect = 0.0 Identities = 3204/3414 (94%), Gaps = 73/3414 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1 CGCACGCAAATCAAAAGCCAGACTTT-AAAACCACTTGCCACCGTACGAGAAACCTT-TC 58 ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| || Sbjct 6 CGCACGCAAATCAAAAG--AG--TTTAAAAACCACTTGCCACCGTATGAG-AACCTTGTC 60 Query 59 TCTGACGGTCGATCCTCCGCTCGCCACGCCGCCGCCACGTCAGCAGT---C-T--CCTCC 112 ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | | | ||| Sbjct 61 TCTGACGGTCGATTCTCCGCTCGCCACGACGACGCCACGTCAGCA-TCCACATAGATTCC 119 Query 113 ATC-AAA-AT-A--GATTCC-T--AACCAATTTTCGAAGATTCGAATCCAA----T-T-C 158 || ||| | | || || | |||| |||||||||||||||||||||| | | | Sbjct 120 -TCTAAATCTCACCAATACCATCAAACCGATTTTCGAAGATTCGAATCCAATTCTTCTCC 178 Query 159 T--T-CT-C--CTTCTTCTGAGAAAATCTCAT-ATTTTTGCGA-ATTTCT-ACCGATTCG 209 | | || | ||||||||||||||||||||| ||| | | |||| | || ||| | Sbjct 179 TCCTCCTCCTTCTTCTTCTGAGAAAATCTCATCGGATTT-C-ATATTTTTGTCCTATT-G 235 Query 210 --T-CTGAA--TG--AGATGCGTTTTCATTGTCACTTCCTTTAGGTTTTGAATCGGGGAT 262 | | || || |||| || | || |||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 236 ACTATTCAACGTGACAGAT-CGAATACA---AAACTT--TTT-GGTTTTGAATCGGGGAT 288 Query 263 TGTTCCGACTGAAACGGTGCCGTTTTAATTCGCTGCAAATGCTTGCCTGAGAAACACCTT 322 |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct 289 TGTTGCGACTGAGACGGTGCCGTTTCAATTCGCTGCAAATGCTTCCCTGAGAAATACCTT 348 Query 323 TTGTTCTTTTATGTAAATACAAGTGTAGAGTCGAGAA-TTTGAGTAGAGATGGTGGGGGC 381 ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||| | ||||| || || Sbjct 349 TTGTTCTTTTATGTAAATAAAAGTGTAGAATCGAGAAGTAT-AGTAAATATGGTTGGAGC 407 Query 382 AACTTTGTTTCACCGTAGAAAGCATTCATGGCCGGCTGAGGAATTTATCAGTAGAAGTAC 441 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 408 AACTTTGTTTCACCGTAGAAAGCATTCATGGCCGACTGAGGAATTCATCAGCAGAAGTAC 467 Query 442 TCTGCAATTACTTGATTCTGATAGTGCTGCTCCGCCACCACACGCATGGAGGAGGAGATT 501 | ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 468 TTTGCAATTGCTCGATTTTGATAGTGCTGCTCCGCCACCACACGCATGGAGGAGGAGATT 527 Query 502 AAACTGCCATGCCAATATCCTT-AAAGAATTCACTATTACTTTTAGGGAAGCCATTAAAA 560 |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 528 AAACTGCCATGCCAATAT-CTTAAAAGAATTCACTATTACTTTTAGGGAAGCCATTAAAA 586 Query 561 TGGTACGCTTGGGGATACGATTATGGTCTTATGTCAGAGAAGAGGCCTCCCATGGAAGGA 620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 587 TGGTACGCTTGGGGATACGATTATGGTCTTATGTCAGAGAAGAGGCCTCCCATGGAAGGA 646 Query 621 AAGCACCTATCGATCCCTTCACCAAAGAGAACTGCAAACCATCTGCATCCCAAGGTGTTC 680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 647 AAGCACCTATCGATCCCTTCACCAAAGAGAACTGCAAACCATCTGCATCCCAAGGTGTTC 706 Query 681 CACTCGGAGGAATGGGAAGTGGAAGCATATCTAGGGGCTTCAG-GGGTGAGTTTAAGCAG 739 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct 707 CACTCGGAGGAATGGGAAGTGGAAGCATATCTAGGGGCTTCAGAGGG-GAGTTTAAGCAG 765 Query 740 TGGCAAATCACTCCCGGAACTTGTGATCCTTCACCTATGATGTCTAATCAGTTTTCTATT 799 |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 766 TGGCAAATCACTCCTGGGACTTGCGATCCATCACCTATGATGTCTAATCAGTTCTCTATT 825 Query 800 TTTATTTCTCGAGATGGTGGACACAAAAAGTATGCATCAGTTTTGTCTCCAGGCCAGCAT 859 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 826 TTTATTTCACGAGATGGTGGACACAAAAAGTATGCATCAGTTTTGTCTCCAGGCCAGCAT 885 Query 860 GGAAGTTTAGGAAAATCGCGTGATAAAGGTCTTTCTTCATGGGGCTGGAATCTGAATGGC 919 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 886 GGAAGTTTAGGAAAGTCGCGTGATAAAGGTCTTTCTTCATGGGGCTGGAATCTGAATGGC 945 Query 920 CAGCATTCAACTTATCATGCTCTTTTTCCTCGGGCTTGGACTATATATGATGGTGAGCCT 979 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 946 CAGCATTCAACTTATCATGCTCTATTTCCTCGGGCTTGGACTATATATGATGGTGAGCCT 1005 Query 980 GATCCAGAGTTAAAGATCTCCTGCCGGCAAATATCTCCTTTTATACCAAACAATTATCGA 1039 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1006 GATCCAGAGTTAAAGATTTCCTGCCGGCAAATATCACCTTTTATACCAAACAATTATCGA 1065 Query 1040 GATAGTAGTCTTCCAGCAGCTGTTTTTGTATATACTTTGGTGAACACTGGAAAGGAAAGG 1099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1066 GATAGTAGTCTTCCAGCAGCTGTTTTTGTATATACTTTGGTGAACACTGGAAAGGAAAGG 1125 Query 1100 GCAAAAGTCAGCCTCCTATTCACATGGGCGAATTCAATAGGTGGGACTTCACATATGTCA 1159 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1126 GCAAAAGTCAGCCTTCTTTTCACATGGGCGAATTCAATGGGTGGGACTTCACATATGTCA 1185 Query 1160 GGGGGTCATGTGAATGAGCCATTCATAGGCGAAGATGGGGTCTCTGGTGTCCTCTTACAT 1219 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1186 GGGGGTCATGTGAATGAGCCATTCATAGGTGAAGATGGGGTCTCTGGCGTCCTCTTACAT 1245 Query 1220 CACAAGACAGGCAAGGGAAATCCTCCTGTTACATTTGCGATTGCTGCTTCTGAGACTCAG 1279 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1246 CACAAGACAGGCAAAGGAAATCCTCCTGTTACATTTGCGATTGCTGCTTCTGAGACTCAG 1305 Query 1280 AATGTTAATGTAACTGTTTTACCATACTTTGGATTGTCTGAAGATAGTTCTTTTACAGCG 1339 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1306 AATGTTAATGTAACTGTTTTACCATGCTTTGGATTGTCTGAAGATAGTTCTTTTACAGCG 1365 Query 1340 AAAGATATGTGGGATACAGTGGAAAAGGATGGGAAATTTGATCAAGAAAACTTCAATAGC 1399 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1366 AAAGATATGTGGGATACAATGGAACAGGATGGGAAATTTGATCAAGAAAACTTCAATAGC 1425 Query 1400 GGGCCAAGCACGCCTTCATTAGCTGGAGACACTATTTGTGCAGCAGTCTCAGCTTCGGCA 1459 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1426 GGGCCAAGCACACCTTCATTAGCTGGAGACACTATTTGTGCAGCAGTCTCGGCTTCGGCA 1485 Query 1460 TGGGTAGAAGCTCATGGCAAGTGCACTGTGTCTTTTGCTCTTTCGTGGTCATCACCAAAA 1519 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| Sbjct 1486 TGGGTAGAAGCTCATGGCAAGTGCACTGTGTCTTTTGCACTTTCATGGTCATCGCCAAAA 1545 Query 1520 GTGAAATTTTCAAAGGGAAGCACATATGACAGGAGATACACTAAATTTTATGGAACTTCG 1579 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1546 GTGAAATTTTCAAAGGGAAGCACATATGACAGGAGATACACTAAATTTTATGGTACTTCG 1605 Query 1580 CCAAGAGCAGCGCTGGACCTTGTGCATGATGCACTGACAAATTATAAGAGGTGGGAGGAA 1639 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1606 CCAAGAGCAGCGTTGGACCTTGTGCATGATGCACTGACAAATTATAAGAGGTGGGAGGAA 1665 Query 1640 GATATTGAGGCATGGCAAAATCCCATTCTCAGAGATGAAAGGCTCCCTGAGTGGTACAAG 1699 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1666 GATATTGAAGCATGGCAGAATCCCATTCTCAGAGATGAAAGGCTCCCTGAGTGGTACAAG 1725 Query 1700 TTCACTCTGTTCAATGAGCTTTACTTTTTGGTAGCCGGTGGTACAGTTTGGATAGACTCT 1759 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1726 TTCACTCTGTTCAATGAGCTTTACTTTTTGGTTGCCGGTGGTACAGTTTGGATAGACTCT 1785 Query 1760 TCTTCACTCAATGCCAATGGGAATAGTCAGCATCAACAATCGGGTTTAGGAAATTCAGAT 1819 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1786 TCTTCACTCAATGCTAATGGGAATAGTCAGCATCAACAATCGGGATTAGGAAATTCAGAT 1845 Query 1820 GGTATGG-CGGGTGGACTCGACATCAATGATCAACGGAATGACCTTGGTAATGGAAACAG 1878 |||| || ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1846 GGTAAGGTCGG-TGGACTTGACATTAATGATCAACGGAATGACCTTGGTAATGGCAACAG 1904 Query 1879 CGTTGGAGTAAAAAGCAATGATGAAGTATCAGCTATTCATAACCGGAATGGTTTATTTGT 1938 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1905 CGTTGGAGTAAAAAGCAATGATGAAGTATCAGCCATTCATAACCGGAATGGTTTATTTGT 1964 Query 1939 CGACACTCGCCATGTAGATGATGGCGATGATGTTGGTCGGTTTCTGTATTTGGAAGGTGT 1998 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1965 CGATACTCCCCATGTAGATGATGGCGATGATGTTGGTCGGTTTCTGTATTTGGAAGGTGT 2024 Query 1999 GGAGTATGTGATGTGGTGCACATATGACGTGCACTTTTACGCATCATATGCGCTCCTTAT 2058 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2025 GGAGTATGTGATGTGGTGCACATATGATGTACACTTTTACGCATCATATGCGCTCCTTAT 2084 Query 2059 GCTATTCCCAAAGATCGAACTAAACATCCAGCGGGATTTTGCAAAAGCTGTGTTGTCTGA 2118 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 2085 GCTATTCCCAAAGATCGAACTAAACATCCAGCGTGATTTTGCGAAAGCCGTGTTGTCTGA 2144 Query 2119 AGATGGGAGGAAGGTTAAGTTCCTGGCAGAAGGAAATGTGGGGATTCGCAAGGTCAGAGG 2178 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2145 AGATGGTAGGAAGGTTAAGTTCCTGGCAGAAGGAAATGTGGGAATTCGCAAGGTCAGAGG 2204 Query 2179 TGCTGTTCCTCACGATCTGGGGATGCATGATCCGTGGAATGAAATGAATGCCTACAACAT 2238 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2205 TGCTGTTCCTCACGATCTGGGGATGCATGATCCTTGGAATGAAATGAATGCCTACAACAT 2264 Query 2239 ACATGACACAAGCAAGTGGAAGGATCTTAATCCAAAGTTTGTGCTTCAGGTGTATAGAGA 2298 |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2265 ACATGACACAAGCAGGTGGAAGGATCTGAACCCAAAGTTTGTGCTTCAGGTGTATAGAGA 2324 Query 2299 TTTTGCAGCTACAGGGGATTACCAATTTGGAATAGACGTTTGGCCCGCAGTTCGTGCTGC 2358 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2325 TTTTGCAGCTACAGGGGATTACCAATTTGGAATAGACGTGTGGCCCGCAGTTCGTGCTGC 2384 Query 2359 TATGGAGTACATGGAACAGTTTGATAGAGACAATGACGATCTAATAGAGAATGATGGTTT 2418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2385 TATGGAGTACATGGAACAGTTTGATAGAGACAATGACGATCTAATAGAGAATGATGGTTT 2444 Query 2419 CCCAGATCAGACATATGATACATGGACTGTTCATGGTGTGAGTGCATACTGCGGTTGCCT 2478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 2445 CCCAGATCAGACATATGATACATGGACTGTTCATGGCGTGAGTGCCTACTGCGGTTGCCT 2504 Query 2479 TTGGCTGGCTGCTCTTCAAGCTGCAGCGGCAATGGCTCTCCAAATCGGTGACAAATTCTT 2538 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2505 GTGGCTGGCTGCTCTTCAAGCTGCAGCAGCAATGGCTCTCCAAATTGGTGACAAATTCTT 2564 Query 2539 TGCAGAA-TTGTGTAAAAATAAGTTTTTGAATGCAAAGGCAGCAATGGAAACGAAACTCT 2597 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2565 TGCAGAACTT-TGTAAAAATAAGTTTTTGAATGCAAAGGCAGCACTGGAAACGAAACTCT 2623 Query 2598 GGAACGGATCATACTTCAATTATGACAGTGGGGCAAGCAGCAACAGCAAATCTATACAGA 2657 |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2624 GGAATGGATCATACTTCAATTACGACAGTGGGTCAAGCAGCAACAGCAAATCTATACAGA 2683 Query 2658 CTGATCAGTTGGCGGGTCAATGGTATGCTGCATCTTCAGGTCTGCCTCCAATATTCGAGG 2717 | |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||| Sbjct 2684 CCGATCAGCTGGCGGGTCAATGGTATGCCGCGTCTTCAGGTCTGCCTCCATTATTTGAGG 2743 Query 2718 AATCTAAAATCAGAAGCACTATGCAAAAGATCTTTGATTTCAATGTGATGAAGACCAAAG 2777 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2744 AATCCAAAATCAGAAGCACTATGCAAAAGATCTTTGATTTCAATGTGATGAAGACAAAAG 2803 Query 2778 GAGGCAAAATGGGTGCAGTAAATGGGATGCATCCTGATGGGAAAGTGGATGACACATGCA 2837 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2804 GAGGTAAAATGGGTGCTGTAAATGGGATGCATCCGGATGGGAAAGTGGATGACACGTGCA 2863 Query 2838 TGCAGTCGCGTGAGATATGGACAGGCGTCACTTATGCAGCTGCAGCTACAATGATCCTCT 2897 ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 2864 TGCAGTCTCGTGAGATATGGACAGGTGTTACTTATGCAGCTGCGGCTACTATGATCCTCT 2923 Query 2898 CTGGAATGGAAGAACAAGGATTCACCACTGCTGAGGGAATTTTTACAGCTGGCTGGTCAG 2957 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2924 CTGGAATGGAAGAACAAGGTTTCACCACTGCTGAGGGAATTTTCACAGCTGGCTGGTCAG 2983 Query 2958 AAGAAGGTTTCGGATATTGGTTCCAGACACCGGAAGGTTGGACAATGGATGGGCATTACA 3017 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2984 AAGAAGGTTTCGGATATTGGTTCCAGACACCGGAAGGTTGGACAATGGATGGGCATTACC 3043 Query 3018 GGTC-CTTGATATACATGAGACCGCTTGCGATATGGGGAATGCAATGGGCATTATCGCTG 3076 |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3044 GGTCACT-GATATACATGAGACCGCTCGCGATATGGGGAATGCAATGGGCATTATCGTTG 3102 Query 3077 CCAAAGGCAATTCTGGACGCTCCTCAGATCAACATGATGGACAGAGTACACTTATCCCCA 3136 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3103 CCAAAGGCAATTCTGGACGCTCCACAGATCAACATGATGGACAGAGTACACTTATCCCCT 3162 Query 3137 AGAAGCCGCAGATTCTCTAACAACTTCAAAGTTGTGAAACACAAGGCTAAGTGTTTTGGC 3196 |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3163 AGAAGCCGAAGATTCTCGAACAACTTCAAAGTTGTGAAACACAAGGCAAAGTGTTTTGGT 3222 Query 3197 AATTCAGCATTAAGCTGTTCTTGCTAAATCATTCCGTCTTATTATATATAACATACAAGT 3256 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| Sbjct 3223 AATTCAGCATTAAGCTGTTCTTGCTAAATCATTCGGTCTTGTTATATATAAGATACAAGT 3282 Query 3257 AACATTCACATCTCTGATATGATTATCGGAGTAACTTATATaaaaaaaagtaaaaaaTGT 3316 || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| Sbjct 3283 AA-ATTCACATCTCTGATATGATTATCGGAGTAACATATATAAAAAAGAGGAAA---TGT 3338 Query 3317 TATTTAAGGAGAGGAATTAGCCGACATGGTTCCTGAGTTGTAATAA-AT-AATA 3368 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| Sbjct 3339 TATTTAAGGAGAGGAACTAGCCGACATAGTTCCTGAGTTGTAATAATATTAATA 3392 Score = 183 bits (99), Expect = 7e-45 Identities = 123/134 (92%), Gaps = 4/134 (3%) Strand=Plus/Plus Query 3357 TAATAAATAATAACCTGAGAAGAACAATTTGTGTTCTTCTTTTCTTCTGTTGGTTTAT-A 3415 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct 3494 TAATAAATAATAATCTGAGAAGAACAATTTGTGTTCTTCTTTTCTTCTGTTGGTTT-TGA 3552 Query 3416 TTTATTGGCTTAAAGAAAAGCCACGTAAGAGCATATAAAACGGCAACACCTACGTACGCT 3475 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| Sbjct 3553 ATTATTGGCTAAAAGAAAAGCCACGTAAGAGCATATAAT--GACAACGCCTACGTACGCT 3610 Query 3476 TTATAGCGTTCAAT 3489 || ||||||||||| Sbjct 3611 TTTTAGCGTTCAAT 3624 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 173677956666 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5