BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg480005
Length=6139
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G24880.1 | Symbols: | Helicase/SANT-associated, DNA binding... 5616 0.0
AT3G24870.1 | Symbols: | Helicase/SANT-associated, DNA binding... 5574 0.0
> AT3G24880.1 | Symbols: | Helicase/SANT-associated, DNA binding
protein | chr3:9086242-9095537 REVERSE LENGTH=6089
Length=6089
Score = 5616 bits (3041), Expect = 0.0
Identities = 3369/3526 (96%), Gaps = 27/3526 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCATGGAAGCGTTTCAGGATATCTTCTAGTAAATGCTGAGGTTGATTCCATGGGAGGA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCATGGAAGCGTTTCAGGATATCTTCTAGTAAATGCTGAGGTTGATTCCATGGGAGGA 60
Query 61 GTTATTGATAGTGGAGGTGGTATTGGTGTCAAAACTTCTCCGCGCCGAACAGCAATTGAG 120
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 61 GTTATCGATAGTGGAGGTGGTATTGGTGTTAAAACATCTCCGCGCCGAACAGCTATTGAG 120
Query 121 AAGGCTCAAGCGGAGCTAAGGCAAGAGTATGATGTCCGTGAGGAAAGGAGGAGAGAACTG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 121 AAGGCTCAAGCGGAGCTAAGGCAAGAGTATGATGTTCGTGAGGAAAGGAGGAGAGAATTG 180
Query 181 GAGTTTCTGGAAAAAGGCGGTAATCCCTTGGATTTCAAGTTCGGTATTGCAACTTCACAT 240
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 181 GAGTTTCTAGAGAAAGGCGGTAATCCCTTGGATTTCAAGTTTGGTATTGCAACTTCACAT 240
Query 241 AGCGTCCAATCTACATCACTCACAGATCAGCAAGCAGAGCATTTTATAAACAGTGAAGTC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 241 AGCGTCCAATCTACATCACTCACAGATCAGCAAGCAGAGCATTTTGTAAACAGTGAAGTC 300
Query 301 AAGGATAGTTTTGCCCTGACTGCCTCACCACATGGAGACTCTGTGGAGAGTAGCGGTAGA 360
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 301 AAAGATAGTTTTGCCCTGACTGCCTCACCACATGGTGACTCGGTGGAGAGTAGCGGTAGA 360
Query 361 CCTGGAGTTCCTACAATTTCTGAACCTAATACAGCAGATAATCTTTTACTGTTTGATTCT 420
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CCTGGAGTTCCTACAATTTCTGAACCCAATACAGCAGATAATCTTTTACTGTTTGATTCT 420
Query 421 GAAAACAAGTCAGTTGAAGGAGAAAGAAATTTGAGATATCCTAATAGGCAAAACAGAACT 480
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GAAAACAAGTCAGTTGAAGGGGAAAGAAATTTGAGACATCCTAATAGGCAAAACAGAACT 480
Query 481 TCTGACTCAGAACGATCTTCCAAAGCAAACACCAACCAGAATACCAAAGAAACAGAAGAT 540
||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TCTGAGTCAGAACGATCTTCCAAAGCACACACCAACCAGAATACCAAAGAAACAGAAGAT 540
Query 541 TCTGCCATCTTTCGCCCGTATGCTCGGAGGAACAGATCAAAGATAAATCGGGATCCAGCG 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 541 TCTGCCATCTTTCGCCCGTATGCTCGGAGGAACAGATCGAAGATAAGTCGGGATCCAGCA 600
Query 601 CGGTCAAGCTCTACAGATTTAGTTCAGAATCGTGGTGGTCTTGCAACATCTATATCCATT 660
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 601 CGGTCAAGCTCTACGGATTTAGTTCAGAATCGTGGTGGTCTTGCAACGTCTATATCTATT 660
Query 661 CGCAGAGGATCAGTAGAAGGAGAGGGTTGCATTCCTGAAGCAGCCAATCAAAAGGATAGG 720
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 661 CGCAGAGGATCAGTGGAAGGAAAGGGTTGCATTCCCGAAGCAGCCAATCAAAAGGATATG 720
Query 721 CATACAACTTCTGTATCTTGTCCAATATTTGCAAATACAAATGGTAATAACGTTCCAAAA 780
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||
Sbjct 721 CATACAACTTCTGTATCTTGTCCAGTATTTGCAAATTCAAATGGTAATATCGTTCCGAAA 780
Query 781 AATAGAGTTCCCAGCAATTCTCTGAATACTAAGGTGGATGGTGAACCTGTTGTACGAGAG 840
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AATAGAGTTTCCAGCAATTCGCTGAATACTAAGGTGGATGGTGAACCTGTTGTACGAGAG 840
Query 841 AGTACTGCTGGATCCAAGACTAGTCTATTTAAAGATGAAGCCGACATTACATATAGAAAA 900
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||
Sbjct 841 AGTACTGCTGGATCCAAGACTAGTCTATTGAAAGATGAAGCCGACATTTCGTATAGTAAA 900
Query 901 AGGTCTGCATATTTGCCAGTTGGAGAGTCTGGCCTTGCTGGGGAGAAGGCACAGCTAGTT 960
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 901 AGCTCTGCATATTTGCCAGTTGGAGAGTCTGGCCTTGCTGGGGAGAAGGCACAACTAGTT 960
Query 961 TCGAGTGGTACAGAGATTGGTTCTCCCAAAGCTGCAACAATAGCTAGG-CAGGAAAATAA 1019
|| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||
Sbjct 961 TC-----G-ACTG-G--TGGTTCTCCCAAAGCTGCAACAATAGCT-GGCCAGAAAAATAG 1010
Query 1020 TTCTACCCAACTGAATGGCCTAAGAGATTCCATGGGAGAGGAAGAAAGCTTAACAAATAG 1079
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 TTCTACCCAACTGAATGGCCTAAGAGATTCCACGGTAGAGGAAGAAAGCTTAACAAATAG 1070
Query 1080 AGGAGCTGCAGGGACTAAAGGGATAGAGTCAGAGTCTTCTCATGCTAACAACGTAGAAGT 1139
||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1071 AGGAGCTACAGGGACTAATGGGTTAGAGTCAGAGTCTTCTCATGCGAACAACGTAGAAGT 1130
Query 1140 AGATGTAGATAATGAAAGAGATCTTTATAAAGTGGAGAAACTTGACTCTGATGAAATCTC 1199
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131 AAATGTAGATAATGAAAGAGATCTTTATAAAGTGGACAAACTTGACTCTGATGAAATCTC 1190
Query 1200 TATGCAGAAGACTTTGAGAGTAGAGGGGTTACTAGATCAAACAGTTGGTGAAATAACGC- 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 1191 TATGCAGAAGACTTTGAGAGTAGAGGGGTTACTAGATCAAACAGTTGGTGAAATGAC-CA 1249
Query 1259 AAACTAAGATTGAAGATGAGACAGGTCAATCTACCACCATTATTACTGAGTGCATTCCTG 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1250 AAACTAAGATTGAAGATGAGACAGGTCAATCTACCACCATTATCAGTGAGTGCATTCCTG 1309
Query 1319 AGCGTGAAATGCAGATGAAATCGGTTAAAATTGAAAATCAAAGTCACAGAAGTACAGCTG 1378
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310 AATGTGAAATGCAGATGAAATCGGTTAAAATTGAAAATCAAAGTCACAGAAGTACAGCTG 1369
Query 1379 AGATGCAAAATGAGGAGAAAGGTTTTGAGACTGAGAAAAGGCTTCAAGATGGGTTGGTTG 1438
||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1370 AGATGCAAACTAAGGAGAAAAGTTCCGAGACTGAGAAAAGGCTTCAAGATGGGTTGGTTG 1429
Query 1439 TACCCGAAAATGACAGGAAAGTTGGTAGTATTTTACCTGAAAATCCTAGCAGCTCGTTGT 1498
||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1430 TACTCGAAAATGACAGTAAAGTTGGTAGTATTTTATCTGAAAATCCTAGCAGCACGTTGT 1489
Query 1499 GCTCGGGAATTCCTCAGGCATCTGTAGACACAAGTTCTTGCACAGTTGGCAATAATTTAT 1558
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1490 GCTCTGGAATTCCTCAGGCATCTGTAGACACAAGTTCTTGCACAGTTGGCAATAGTTTAT 1549
Query 1559 TGTCAGGAACTGATATTGAATCACTAAAACATCAGCCGAGCTCAGATGCAGTTGTGTTAG 1618
||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1550 TGTCAGGAACTGACATTGAAGCATTAAAACATCAGCCGAGCTCAGATGCAGTTATGTTAG 1609
Query 1619 ATACTATCAAGGAGGACTCTATCCTTGAAGAGGCACGGATTATACAGGCAAAGAGAAAAA 1678
||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1610 ATACTGTCAAGGAGGACGCTATTCTTGAGGAGGCCCGGATTATACAGGCAAAGAAAAAAA 1669
Query 1679 GAATTGCCGAGTTATCTTTTGGTACTGCACCATTGGAGGTCCGTGAGAAATCTCAATGGG 1738
|||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1670 GAATTGCCGAATTATCTTGTGGTACTGCACCAGTGGAGGTCCGTGAGAAATCTCAATGGG 1729
Query 1739 ATTTTGTCCTCGAAGAAATGGCATGGCTGGCAAATGATTTTGCGCAGGAGCGCCTTTGGA 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1730 ATTTTGTCCTCGAAGAAATGGCATGGCTGGCAAATGATTTTGCGCAGGAGCGCCTTTGGA 1789
Query 1799 AGATGACTGCTGCAGCACAAATTTGCCATCGAGTTGCTTTGACTTGTCAGTTGAGATTTG 1858
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1790 AAATGACTGCTGCCGCACAAATTTGCCATCGAGTTGCTTTGACTTGTCAGTTGAGATTTG 1849
Query 1859 AGGAACGAAATCAGCACAAAAAGCTGaaaaaaaTAGCTTCAGTCCTATCTAATGCTATCT 1918
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 AGGAACGAAATCAGCACAGAAAGCTGAAAAAAATAGCTTCAGTCCTATCTAATGCTATCT 1909
Query 1919 TAGAATTCTGGAGTTCTGT----G--GAGGTTCCTGGGGAGCTGGAGGAGACGAGCTTGG 1972
|| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1910 TACAATTCTGGAGTTCTGTGGAGGCCGAGGTTCCTGGGGAGCTGGAGGAGACGAGCTTGG 1969
Query 1973 GTATTGTTAAGGAGACTTGCCAAGAATCTAATTGTGTGAATGGCAG-AGTATGTTTGGCT 2031
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||
Sbjct 1970 GAATTGTTAAGGAGACTTGCCAAGAATCTAATTGTTTGAATGGCAGAAG-ATGTTTAGCT 2028
Query 2032 GGGGGTGTCAAGGAGTATGCAAGTAGATTTTTGAAGTACAACAACTCTTCCATCTCCTAT 2091
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2029 GCGGGTGTCAAGGAATATGCAAGTAGATTTTTGAAGTACAACAACTCTTCCATCTCCTAT 2088
Query 2092 CATTCAGCTGCACTGTCAACACCGGACAATATGTGCAACCCAGAAATATTGGATATATCT 2151
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089 CATTCAGCTGCACCGTCAACACCTGACAATATGTGCGACCCAGAAATATTGGATATATCT 2148
Query 2152 ATGGTTGATCAGCTTACAGAAGCAAGCCTCTTTTATTCAGTTCCATCTGGTGCAATGGAG 2211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2149 ATGGTTGATCAGCTTACAGAAGCAAGCCTCTTTTATTCAGTTCCATCTGGTGCAATGGAG 2208
Query 2212 GTGTACCATAAGTCCATTGAGTCGCATCTTACACGCTGTGAGAAGTCTGGAAGTAGCATG 2271
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 GTGTACCTTAAGTCCATTGAGTCGCATCTTACACGTTGTGAGAAGTCTGGAAGTAGCATG 2268
Query 2272 CAGGAGGAGGTTGATACATCAGCCTATGATACTGCT-G-G----AGGATATAATGGTACT 2325
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||
Sbjct 2269 CAGGAGGAGGTTGATACATCAGCCTATGATACTGCTGGAGATATAGGATATAATGTTACT 2328
Query 2326 GCGTTCGATGAGGATGAAGGAGAAACAAGTACCTATTATCTTCCAGGAGCTTTCGAGTCT 2385
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2329 GCGTTCGATGAGGATGAAGGAGAAACAAGTACCTATTATCTTCCGGGAGCTTTCGAGTCT 2388
Query 2386 AGCAGATCATTTAATATAAGCCACaaaaaaaGGAAGAATCTGATGAAGTCTCATTCTGCC 2445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2389 AGCAGATCATTTAATATAAGCCACAAAAAAAGGAAGAATCTGATGAAGTCTCATTCTGCC 2448
Query 2446 CGGTCATATGATCTTGGGGATGATTTACCATATGTCAACTACACAGGTGGCTCTAACTCA 2505
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2449 CGGTCATATGATCTTGGGGACGATTTACCATACGTCAACAACACAGGTGGCTCTAACTCA 2508
Query 2506 TCAAGTTTGATGGCAAAAAGGCCTGCCAGTAATATTAATGCCGGCTCAGTTCCGACGAGG 2565
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2509 TCAAGTTTGATGGCAAAAAGGCCTGACAGTAATATTAATGCCGGCTCAGTTCCAACAAGG 2568
Query 2566 CGAGTGCGCACTGCTTCCAGGCAGAGGATTGTGAGTCCTTTTGGGTGTGCTACTGCTGGG 2625
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2569 CGAGTGCGCACTGCTTCCAGGCAGAGGGTTGTGAGTCCTTTTGGGTGTGCTACTACTGGG 2628
Query 2626 AATTTACCAGTGCCCTCGAAGACAGATGCGTCTAGTGGGGATACTAGTTCTTTCCAGGAT 2685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2629 AATTTACCAGTGCCCTCGAAGACAGATGCGTCTAGTGGGGATACTAGTTCTTTCCAGGAT 2688
Query 2686 GAGCAAAGTAGTTTGCATGGTGGATCGGCAGTCCAAAAAGGCACAGAGGTTGAGTCAAGT 2745
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2689 GAGTATAGTAGTTTGCATGGTGGATCGGCAGTCCAAAAAGGCACAGAGGTTGAGTCAAGT 2748
Query 2746 GGTAATTTTGAAAAGATGTTACCTTATGACATGGCTGAAACCTCAGGAAAACCTAAAAAG 2805
| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2749 GTTAACTTTGAAAAGCTGTTACCTTATGACATGGCTGAAACCTCAGGAAGACCTAAAAAG 2808
Query 2806 AAGAAGAAGACTCATCAGGGATCCGCATATGACCAAACCTGGCATCTCGATCCGTCAGTC 2865
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2809 AAAAAGAAGACTCATCAGGGCTCCGCATATGACCAAACTTGGCATCTCGATCCGTCAGTC 2868
Query 2866 CATGTTGAACAGAAGGACCACTGGAAGAAGCGACCAGAGAATCATTTCGATATGAATGGC 2925
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2869 CATGTTGAACAGAAGGACCACTGGAAGAAGCGACCAGAGAATAATTTCGATATGAATGGT 2928
Query 2926 CTGTATGGTCCTCATAGTGCAAAGAAGCAAAAGACCACCAAGCAATTGGTAGACAATAAT 2985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2929 CTGTATGGTCCTCATAGTGCAAAGAAGCAAAAGACCACCAAGCAATTGGTAGAGAATAAT 2988
Query 2986 TTTGATATTGCTATTCCTCACGCTGGATCGATTCCTTCTCCGGCAGCTTCCCAGATGAGC 3045
|||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2989 TTTGATATGGCTATTCCTCACACTGGATCGATTCCTTCTCCGGCTGCTTCCCAGATGAGC 3048
Query 3046 AATATGTCCAACCCCAACAAATCTATCAAATTTATTGGAGGTCGTGATAGGGCCAGAAAA 3105
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3049 AATATGTCCAACCCCAACAAATCTATCAAATTTATTGGAGGTCGTGATAGGGGCAGAAAA 3108
Query 3106 ATAAAAGGCCTGAAGATTTCTCCTGGTCAGCATGGTTCTGGAAATCCGTGGTCACTATTT 3165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3109 ATAAAAGGCCTGAAGATTTCTCCTGGTCAGCATGGTTCTGGAAATCCATGGTCACTATTT 3168
Query 3166 GAGGATCAGGCGCTTGTTGTCCTAGTGCATGACATGGGCCCTAACTGGGAGCTCATTAGT 3225
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3169 GAGGATCAGGCGCTTGTTGTCCTGGTGCATGATATGGGCCCTAACTGGGAGCTCATTAGT 3228
Query 3226 GATGCTATGAACAGCACCCTTAAAATTAAGTGTATATATCGCAATCCGACTGAGTGCAAG 3285
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3229 GATGCAATGAACAGCACTCTTAAAATTAAGTGTATATATCGCAATCCGACTGAGTGCAAG 3288
Query 3286 GAGCGGCATAAGATTCTGATGGATAAGACTGCTGGTGATGGGGCTGATAGTGCTGAAGAT 3345
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3289 GACCGGCATAAGATTCTGATGGATAAAACTGCTGGTGATGGGGCTGATAGTGCAGAAGAT 3348
Query 3346 TCAGGGAATTCCCAGTCTTATCCATCCACTTTGCCTGGCATCCCAAAGGGAAGTGCGAGA 3405
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3349 TCAGGGAATTCTCAGTCTTATCCATCCACTTTGCCTGGCATCCCAAAGGGAAGTGCGAGA 3408
Query 3406 CAGTTGTTTCAACGACTGCAAGGGCCAATGGAGGAAGATACCCTGAAGTCTCATTTTGAG 3465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3409 CAGTTGTTTCAACGACTGCAAGGGCCAATGGAGGAAGATACCCTGAAGTCTCATTTTGAG 3468
Query 3466 AAGATTTGTTTGATTGGGAAGAAGTTACATTATAGAAAGACACAGA 3511
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3469 AAGATTTGTTTGATTGGGAAGAAATTACATTATAGAAAGACACAGA 3514
Score = 3747 bits (2029), Expect = 0.0
Identities = 2398/2565 (93%), Gaps = 70/2565 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 3554 AGAGTGTTATCAGAGTTTCTGTGGTTTCTTTTGTTCACGGAATTCAGTTTTCAAGTTGCA 3613
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3512 AGAGTGTTATCGGGGTTTCTGTGGTTTCTTTTGTTCACGGAATTCAGTTTTCAAGTTGCA 3571
Query 3614 CTGGAGCTGGCATATCTCAATCACCT-GACATACCAGGTTTGCATGTTTCTAAGTATAGC 3672
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3572 CTGGAGCTGGCATATCTCAATCA-CTCGACATACCAGGTCTGCATGTTTCTAAGTATAGC 3630
Query 3673 TGCAAATCTTGGCTAACATTTGCTGAAAATGATGGTCGGGATCCCAAGCAAATAGTACCA 3732
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3631 TGCAAATCTTGGCTAGGATTTCCTGAAAATGATGGTCGGGATTCCAAGCAAATAGTACCA 3690
Query 3733 GTTCACAATTCACAAGTTATGGCTCTTTCTCAAGTATTCCCGAATAATCTGAATGGAGGT 3792
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3691 GTTCACAATTCACAAGTCATGGCTCTCTCTCAAGTATTCCCGAATAATCTGAATGGAGGT 3750
Query 3793 GTTCTTACGCCCCTTGATGTCTGTGATGCATCAACTTCAGGTCAAGATGTATTTTCACTT 3852
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3751 GTTCTTACGCCCCTTGATGTCTGTGACGCATCAACTTCAGGTCAAGATGTATTTTCACTT 3810
Query 3853 GAAAATCCAGGTCTTCCAATTTTGAATCAGGGAACGCCAGTGCTCCATACTTCTGGAGCA 3912
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3811 GAAAATCCAGGTCTTCCAATGTTGAATCAGGGAACGCCAGTGCTCCCTACTTCTGGAGCA 3870
Query 3913 CATCCATCCACTCCTGGATCGTCTGGTGTGGTTCTGAGTAACAATTTGCCAACCACATCT 3972
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3871 CATCCATCCACTCCTGGATCATCTGGTGTTGTTCTGAGCAACAATTTGCCAACCACATCT 3930
Query 3973 GGCCTACAGAGTGCTTCTGTCAGGGATGGTAGATTCAATGTTCCTAGAGGGTCTTTGCCA 4032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3931 GGCCTACAGAGTGCTTCTGTCAGGGATGGTAGATTCAATGTTCCTAGAGGGTCTTTGCCA 3990
Query 4033 CTTGATGAACAACACCGACTACAACAATTTAATCAGATGTTATCCGGTAGAAACCTACAG 4092
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||
Sbjct 3991 CTTGATGAACAACACCGACTACAACAATTTAATCAAACGTTATCTGGTAGAAACCTGCAG 4050
Query 4093 CAGCCCTCCTTATCAACTCCTGGAGCTGTCTCAGGATCTGATCGTGGACATCGCATGGTT 4152
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4051 CAGCCCTCCTTATCAACTCCTGCAGCTGTCTCAGGATCTGATCGTGGACATCGCATGGTT 4110
Query 4153 CCTGGTGGAAATGCTATGGGTGTAACTGGAATGAACAGGAACACACCCATGTCAAGGCCT 4212
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4111 CCTGGTGGAAATGCTATGGGTGTAAGTGGAATGAACAGGAACACACCCATGTCAAGGCCT 4170
Query 4213 GGTTTCCAAGGGATGGCCTCATCAGCAATGCCAAATACTGGTAGTATGCTTTCTTCTGGT 4272
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4171 GGTTTTCAAGGGATGGCCTCATCAGCAATGCCAAATACTGGTAGTATGCTTTCCTCTGGC 4230
Query 4273 ATGGTAGGAATTCCAAACACTGGAAATGTTCATTCCGGAGGAGGAGCTTCTCAAGGAAAC 4332
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4231 ATGGTAGAAATTCCAAACACTGGAAATATTCATTCCGGAGGAGGAGCTTCTCAAGGAAAC 4290
Query 4333 TCCATGCTCAGGCCTCGTGAAGCTGTGCAGCATATGATGCGGATGCAAGCTGCTCAAGGG 4392
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4291 TCCATGATCAGGCCTCGTGAAGCTGTGCAGCATATGATGCGGATGCAGGCTGCTCAAGGG 4350
Query 4393 AACAGTCCGGGGATCCCAGCTTTCAGTAATTTGAGTTCTGGATTTACCAACCAGACAACT 4452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4351 AACAGTCCGGGGATCCCAGCTTTCAGTAATTTGAGTTCTGGATTTACCAACCAGACAACT 4410
Query 4453 CCTGTTCAGGCATACCCAGGCCAACTTTCCCAGCAGCATCAGATGTCACCGCAGTCACAT 4512
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4411 CCTGTTCAGGCGTACCCAGGCCATCTTTCCCAGCAGCATCAGATGTCACCGCAGTCACAT 4470
Query 4513 GTGCTTGGCAACTCGCATCATCCTCATCTCCAGAGCCCAAGTCAAGCCACTGGGGCACAG 4572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4471 GTGCTTGGCAACTCGCATCATCCTCATCTCCAGAGCCCAAGTCAAGCCACTGGGGCACAG 4530
Query 4573 CAGGAAGCATTTGCTATCCGTCAAAGGCAAATACACCAGAGGTATTTGCAGCAACAGCA- 4631
|| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4531 CAAGAAGCATTTGCTATCCGTCAAAGACAAATTCACCAGAGGTATTTGCAGCAACAGCAA 4590
Query 4632 --GCA---GCAGTTTCCAGCATCTGGTACTATGATGCCACATGTACAACAACCTCAGGGC 4686
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4591 CAGCAACAGCAGTTTCCAGCATCTGGTTCTATGATGCCACATGTACAACAACCTCAGGGC 4650
Query 4687 TCGTCTGTTTCTTCTTCTCCACAAAACAGTCCTCAGACTCAACCACCTGTTTCGCCCCAG 4746
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4651 TCTTCTGTTTCTTCTTCTCCACAAAACAGTCCTCAGACTCAACCACCTGTTTCGCCCCAG 4710
Query 4747 CCATTATCGATGCCCCCAGTGTCGCCCTCTCCTAATATTAATGCTATGGCACAACAGAAC 4806
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4711 CCATTATCCATGCCCCCGGTGTCGCCCTCTCCTAATATTAATGCTATGGCACAACAGAAA 4770
Query 4807 CCTAAAAAATCTCAGTTGCCGCTTCATGGTCTGGGTAGGAGTCCTCAGTCTGGTACTTCT 4866
||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4771 CCTCAAAAATCTCAGTTGGCGCTTCATGGTTTGGGTAGGAGTCCTCAGTCTGGTACTTCT 4830
Query 4867 GGAGTGAACAATCAAGCTGGAAAACAACGGCAGCGACAACTTCAGCAGCAGTTGCAGCAG 4926
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
Sbjct 4831 GGAGTGAACAATCAAGCTGGAAAACAAAGGCAGCGACAACTTCAGCAG---T--C----- 4880
Query 4927 TCTGCAAGACAACATCCACACCAGCGGCAGCCAACACAAGGTCAACAGCAGAATAAA-AA 4985
| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 4881 T--GCAAGACAGCATCCACACCAGCGGCAGCCAACACAAGGTCAACAGCTGAATAAACAA 4938
Query 4986 --G--GGG-ATGGGTAGAGGCAGCATGATCCATCAGAACATCACTGTCGATCAGTCACAC 5040
| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4939 CTGAAGGGGATGGGTAGAGGCAACATGATCCATCAGAACATCACTGTTGATCAGTCACAC 4998
Query 5041 CTGAATGGTCTTACCATGGCCCCA-GGAAATCAGGCTACCGAAAAAGGAGAG-TCAGCGG 5098
|||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||
Sbjct 4999 CTGAATGGCCTTACCATG-CCCCAAGGAAACCAGGCTACTGAAAAAGGAGAGAT-AGCGG 5056
Query 5099 TTCCAGTTAGGCCTGATCAGCAGTCTAGTGCAGGGACTAGCACGAGCAC-ACATCTGCAG 5157
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||
Sbjct 5057 TTCCAGTTAGGCCTGATCAGCAGTCTAGTGTGGGGACTACCACGAGCACGA-ATCTGCAG 5115
Query 5158 TCTAAACCATTTGTTCCTCCCTTATCTTCAAATCATTCACAGCAACTGCCAAACTCATTC 5217
||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5116 TCTAAACCATTTGTTTCTCCCTTGTCTTCAAATCATTCACAGCAACTGCCAAAATCATTC 5175
Query 5218 CCTGGTGCTTCGTCTCCGTCCC---AACAACAGATGCAATTACATTCAGACAATAGCATC 5274
|||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5176 CCTGGTGCTTTGCCTCCATCCCCTCAACAACAGATGCAATTACATTCAGACAATAGCATC 5235
Query 5275 CAAGGCCAGACCTCACCTGCGGCCCCATGTAACATCTTATCCACCTCTAGCCCGTCAATT 5334
|||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5236 CAAGGCCAGAGCTCACCTGCGACCCCATGTAATATTTTATCCACCTCTAGCCCGTCAATT 5295
Query 5335 ACACCTGCAGTTGCACCTTCCAACCATCAGCATTTGTTGATACACCAAAAGCAGCGCAAT 5394
|||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5296 GCACCAGCGGTTGCACCTTCTAACCATCAGCATTTGTTGATACACCAAAAGCAGCGCAAT 5355
Query 5395 CAAGTGCAATCAGCAGCTCAGCGAGTTGTTCATCATAATCATCTAGGAAACTCTGAGTTA 5454
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5356 CAAGTGCAATCAACAGCTCAGCGAGTTGTTCAACATAATCATCTAGGGAACTCTGAGTTA 5415
Query 5455 TCAAAGAAGTCCCAAGCTGAACGTATGCCACGTGTTCCGCTGTCTGTCACCAATACAACC 5514
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||
Sbjct 5416 TCAAAGAAGTCCCAAGCTGAACGCATGCCACGTGTTCCACAGTCTGTAACCAATACTACC 5475
Query 5515 CAAACTGCTAGTATGGGTACGACCAAGGGTATGCATCAAGCGAGTAATGATTTGAAAAAC 5574
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5476 CAAACTGTTAGTATGGGTACGACCAAGGGTATGCCTCAAGCGAGTAATGATTTGAAAAAC 5535
Query 5575 ATAAAAGCAGTTGGTTCTACTGCGGCGCCTGCTTTGGAACCTCCATCTTGTGTTGCCTCT 5634
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5536 ATAAAAGCAGTTGGTTCTACTGCGGTGCCTGCTTTGGAACCTCCATCTTGTGTTGCTTCT 5595
Query 5635 GTGCAAAGCACTGCTTCTAAAGTAGTAAACAGTTCCAATACAGATTCAGCTGGGAATGAT 5694
||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 5596 GTGCAAATCACTGCTTCGAAAGTAGTAAACAGTTCCAATACAGATTCAGCAGGAAATGAT 5655
Query 5695 CCAGTAACAACACCGAACCAAGGACTAGCTCAGGAGCATCTATCTGGTGACTTGCCTAGT 5754
|||||| ||||||||||||||||||||||||| | | | | | |
Sbjct 5656 CCAGTATCAACACCGAACCAAGGACTAGCTCA--A--A---A---G----C------A-- 5693
Query 5755 CACGGGATCAAGGGCGTGACACAGAGACAACAACAGTCTCTACCTTCAGAAGAAAAGAGA 5814
| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5694 C--GGGATCAAGGGCGTTACACAGAGACAACAACAGTCTCTACCTTCAGAAGAAAAGAGA 5751
Query 5815 CC-AAAGTTGCCAGAGAAGCTGACTGTACAAAATCAAAAACACCTTGCTTCTGAGCAGCA 5873
|| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
Sbjct 5752 CCGAAA-TTGCCAGAGAAGCCGACTGTACAAAATCAGAAACACCTTGCTTCTGAG--G-A 5807
Query 5874 ACAGCAGCCTCAATTAGAAGAAGCACTGGAAGTATCATCTTCCAAGCCTCCTGATACAAA 5933
||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5808 ---GCAGCCTCATTTAGAAGAAGCACAAGAATTATCATCTTCCAAGCCTCCTGATACAAA 5864
Query 5934 AGTGGAATGAGAGGCATGACAGATGAACCTAGAACCTTGAGTAGTTGTAGATCCTGCAAA 5993
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5865 AGTGGAATGAGAGGCATGACAGATGAACCTAGAACCTTGAGTAGCTGTAGATCCTGCAAA 5924
Query 5994 GCTTAATGCTGGCCCTTACCAACAACAACCCTGTACAGGAACCCAAACTGGTTTATCTCC 6053
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 5925 GCTTAACGCTGGCCCTTACCGACAACAACCCTGTACAGGAACCCAAACTGGTTTGTGTCC 5984
Query 6054 TCCGCCTTCAGATTCGGGTCCTCACTTTTTGGCATTAACATCTTG 6098
||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 5985 TCCACCTTCAGAGTCGGGTC-TC--TTTTTGGCATTAACATCTTG 6026
Score = 56.5 bits (30), Expect = 3e-06
Identities = 30/30 (100%), Gaps = 0/30 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6110 GTATAACATAACAAACTCTACAGATTGTGG 6139
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6059 GTATAACATAACAAACTCTACAGATTGTGG 6088
> AT3G24870.1 | Symbols: | Helicase/SANT-associated, DNA binding
protein | chr3:9074665-9085048 REVERSE LENGTH=6365
Length=6365
Score = 5574 bits (3018), Expect = 0.0
Identities = 3363/3528 (95%), Gaps = 29/3528 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCATGGAAGCGTTTCAGGATATCTTCTAGTAAATGCTGAGGTTGATTCCATGGGAGGA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70 ATGCATGGAAGCGTTTCAGGATATCTTCTAGTAAATGCTGAGGTTGATTCCATGGGAGGA 129
Query 61 GTTATTGATAGTGGAGGTGGTATTGGTGTCAAAACTTCTCCGCGCCGAACAGCAATTGAG 120
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 130 GTTATCGATAGTGGAGGTGGTATTGGTGTTAAAACATCTCCGCGCCGAACAGCTATTGAG 189
Query 121 AAGGCTCAAGCGGAGCTAAGGCAAGAGTATGATGTCCGTGAGGAAAGGAGGAGAGAACTG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 190 AAGGCTCAAGCGGAGCTAAGGCAAGAGTATGATGTTCGTGAGGAAAGGAGGAGAGAATTG 249
Query 181 GAGTTTCTGGAAAAAGGCGGTAATCCCTTGGATTTCAAGTTCGGTATTGCAACTTCACAT 240
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 250 GAGTTTCTAGAGAAAGGCGGTAATCCCTTGGATTTCAAGTTTGGTATTGCAACTTCACAT 309
Query 241 AGCGTCCAATCTACATCACTCACAGATCAGCAAGCAGAGCATTTTATAAACAGTGAAGTC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 310 AGCGTCCAATCTACATCACTCACAGATCAGCAAGCAGAGCATTTTGTAAACAGTGAAGTC 369
Query 301 AAGGATAGTTTTGCCCTGACTGCCTCACCACATGGAGACTCTGTGGAGAGTAGCGGTAGA 360
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 370 AAAGATAGTTTTGCCCTGACTGCCTCACCACATGGTGACTCGGTGGAGAGTAGCGGTAGA 429
Query 361 CCTGGAGTTCCTACAATTTCTGAACCTAATACAGCAGATAATCTTTTACTGTTTGATTCT 420
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 CCTGGAGTTCCTACAATTTCTGAACCCAATACAGCAGATAATCTTTTACTGTTTGATTCT 489
Query 421 GAAAACAAGTCAGTTGAAGGAGAAAGAAATTTGAGATATCCTAATAGGCAAAACAGAACT 480
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 490 GAAAACAAGTCAGTTGAAGGGGAAAGAAATTTGAGACATCCTAATAGGCAAAACAGAACT 549
Query 481 TCTGACTCAGAACGATCTTCCAAAGCAAACACCAACCAGAATACCAAAGAAACAGAAGAT 540
||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 550 TCTGAGTCAGAACGATCTTCCAAAGCACACACCAACCAGAATACCAAAGAAACAGAAGAT 609
Query 541 TCTGCCATCTTTCGCCCGTATGCTCGGAGGAACAGATCAAAGATAAATCGGGATCCAGCG 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 610 TCTGCCATCTTTCGCCCGTATGCTCGGAGGAACAGATCGAAGATAAGTCGGGATCCAGCA 669
Query 601 CGGTCAAGCTCTACAGATTTAGTTCAGAATCGTGGTGGTCTTGCAACATCTATATCCATT 660
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 670 CGGTCAAGCTCTACGGATTTAGTTCAGAATCGTGGTGGTCTTGCAACGTCTATATCTATT 729
Query 661 CGCAGAGGATCAGTAGAAGGAGAGGGTTGCATTCCTGAAGCAGCCAATCAAAAGGATAGG 720
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 730 CGCAGAGGATCAGTGGAAGGAAAGGGTTGCATTCCCGAAGCAGCCAATCAAAAGGATATG 789
Query 721 CATACAACTTCTGTATCTTGTCCAATATTTGCAAATACAAATGGTAATAACGTTCCAAAA 780
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||
Sbjct 790 CATACAACTTCTGTATCTTGTCCAGTATTTGCAAATTCAAATGGTAATATCGTTCCGAAA 849
Query 781 AATAGAGTTCCCAGCAATTCTCTGAATACTAAGGTGGATGGTGAACCTGTTGTACGAGAG 840
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 AATAGAGTTTCCAGCAATTCGCTGAATACTAAGGTGGATGGTGAACCTGTTGTACGAGAG 909
Query 841 AGTACTGCTGGATCCAAGACTAGTCTATTTAAAGATGAAGCCGACATTACATATAGAAAA 900
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||
Sbjct 910 AGTACTGCTGGATCCAAGACTAGTCTATTGAAAGATGAAGCCGACATTTCGTATAGTAAA 969
Query 901 AGGTCTGCATATTTGCCAGTTGGAGAGTCTGGCCTTGCTGGGGAGAAGGCACAGCTAGTT 960
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 970 AGCTCTGCATATTTGCCAGTTGGAGAGTCTGGCCTTGCTGGGGAGAAGGCACAACTAGTT 1029
Query 961 TCGAGTGGTACAGAGATTGGTTCTCCCAAAGCTGCAACAATAGCTAGG-CAGGAAAATAA 1019
|| | || | | |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||
Sbjct 1030 TC-----G-ACTG-G--TGGTTCTCCCAAAGCTGCAACAATAGCT-GGCCAGAAAAATAG 1079
Query 1020 TTCTACCCAACTGAATGGCCTAAGAGATTCCATGGGAGAGGAAGAAAGCTTAACAAATAG 1079
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 TTCTACCCAACTGAATGGCCTAAGAGATTCCACGGTAGAGGAAGAAAGCTTAACAAATAG 1139
Query 1080 AGGAGCTGCAGGGACTAAAGGGATAGAGTCAGAGTCTTCTCATGCTAACAACGTAGAAGT 1139
||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1140 AGGAGCTACAGGGACTAATGGGTTAGAGTCAGAGTCTTCTCATGCGAACAACGTAGAAGT 1199
Query 1140 AGATGTAGATAATGAAAGAGATCTTTATAAAGTGGAGAAACTTGACTCTGATGAAATCTC 1199
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 AAATGTAGATAATGAAAGAGATCTTTATAAAGTGGACAAACTTGACTCTGATGAAATCTC 1259
Query 1200 TATGCAGAAGACTTTGAGAGTAGAGGGGTTACTAGATCAAACAGTTGGTGAAATAACGC- 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 1260 TATGCAGAAGACTTTGAGAGTAGAGGGGTTACTAGATCAAACAGTTGGTGAAATGAC-CA 1318
Query 1259 AAACTAAGATTGAAGATGAGACAGGTCAATCTACCACCATTATTACTGAGTGCATTCCTG 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1319 AAACTAAGATTGAAGATGAGACAGGTCAATCTACCACCATTATCAGTGAGTGCATTCCTG 1378
Query 1319 AGCGTGAAATGCAGATGAAATCGGTTAAAATTGAAAATCAAAGTCACAGAAGTACAGCTG 1378
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 AATGTGAAATGCAGATGAAATCGGTTAAAATTGAAAATCAAAGTCACAGAAGTACAGCTG 1438
Query 1379 AGATGCAAAATGAGGAGAAAGGTTTTGAGACTGAGAAAAGGCTTCAAGATGGGTTGGTTG 1438
||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 AGATGCAAACTAAGGAGAAAAGTTCCGAGACTGAGAAAAGGCTTCAAGATGGGTTGGTTG 1498
Query 1439 TACCCGAAAATGACAGGAAAGTTGGTAGTATTTTACCTGAAAATCCTAGCAGCTCGTTGT 1498
||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1499 TACTCGAAAATGACAGTAAAGTTGGTAGTATTTTATCTGAAAATCCTAGCAGCACGTTGT 1558
Query 1499 GCTCGGGAATTCCTCAGGCATCTGTAGACACAAGTTCTTGCACAGTTGGCAATAATTTAT 1558
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1559 GCTCTGGAATTCCTCAGGCATCTGTAGACACAAGTTCTTGCACAGTTGGCAATAGTTTAT 1618
Query 1559 TGTCAGGAACTGATATTGAATCACTAAAACATCAGCCGAGCTCAGATGCAGTTGTGTTAG 1618
||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1619 TGTCAGGAACTGACATTGAAGCATTAAAACATCAGCCGAGCTCAGATGCAGTTATGTTAG 1678
Query 1619 ATACTATCAAGGAGGACTCTATCCTTGAAGAGGCACGGATTATACAGGCAAAGAGAAAAA 1678
||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1679 ATACTGTCAAGGAGGACGCTATTCTTGAGGAGGCCCGGATTATACAGGCAAAGAAAAAAA 1738
Query 1679 GAATTGCCGAGTTATCTTTTGGTACTGCACCATTGGAGGTCCGTGAGAAATCTCAATGGG 1738
|||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 GAATTGCCGAATTATCTTGTGGTACTGCACCAGTGGAGGTCCGTGAGAAATCTCAATGGG 1798
Query 1739 ATTTTGTCCTCGAAGAAATGGCATGGCTGGCAAATGATTTTGCGCAGGAGCGCCTTTGGA 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 ATTTTGTCCTCGAAGAAATGGCATGGCTGGCAAATGATTTTGCGCAGGAGCGCCTTTGGA 1858
Query 1799 AGATGACTGCTG-CAGCACAAATTTGCCATCGAGTTGCTTTGACTTGTCAGTTGAGATTT 1857
| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 AAATGACTGCTGCCA-CACAAATTTGCCATCGAGTTGCTTTGACTTGTCAGTTGAGATTT 1917
Query 1858 GAGGAACGAAATCAGCACAAAAAGCTGaaaaaaaTAGCTTCAGTCCTATCTAATGCTATC 1917
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1918 GAGGAACGAAATCAGCACAGAAAGCTGAAAAAAATAGCTTCAGTCCTATCTTATGCTATT 1977
Query 1918 TTAGAATTCTGGAGTTCTGT----G--GAGGTTCCTGGGGAGCTGGAGGAGACGAGCTTG 1971
||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1978 TTACAATTCTGGAGTTCTGTGGAGGCCGAGGTTCCTGGGGAGCTGGAGGAGACGAGCTTG 2037
Query 1972 GGTATTGTTAAGGAGACTTGCCAAGAATCTAATTGTGTGAATGGCA-GAGTATGTTTGGC 2030
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||
Sbjct 2038 GGAATTGTTAAGGAGACCTGCCAAGAATCTAATTGTTTGAATGGCATAAG-ATGTTTAGC 2096
Query 2031 TGGGGGTGTCAAGGAGTATGCAAGTAGATTTTTGAAGTACAACAACTCTTCCATCTCCTA 2090
|| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2097 TGCGGGTGTCAAGGAATATGCAAGTAGATTTTTGAAGTACAACAACTCTTCCATCTCCTA 2156
Query 2091 TCATTCAGCTGCACTGTCAACACCGGACAATATGTGCAACCCAGAAATATTGGATATATC 2150
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2157 TCATTCAGCTGCACTGTCAACACCTGACAATATGTGCGACCCAGAAATATTGGATATATC 2216
Query 2151 TATGGTTGATCAGCTTACAGAAGCAAGCCTCTTTTATTCAGTTCCATCTGGTGCAATGGA 2210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217 TATGGTTGATCAGCTTACAGAAGCAAGCCTCTTTTATTCAGTTCCATCTGGTGCAATGGA 2276
Query 2211 GGTGTACCATAAGTCCATTGAGTCGCATCTTACACGCTGTGAGAAGTCTGGAAGTAGCAT 2270
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2277 GGTGTACCTTAAGTCCATTGAGTCGCATCTTACACGTTGTGAGAAGTCTGGAAGTAGCAT 2336
Query 2271 GCAGGAGGAGGTTGATACATCAGCCTATGATACTGCT-G-G----AGGATATAATGGTAC 2324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||
Sbjct 2337 GCAGGAGGAGGTTGATACATCAGCCTATGATACTGCTGGAGATATAGGATATAATGTTAC 2396
Query 2325 TGCGTTCGATGAGGATGAAGGAGAAACAAGTACCTATTATCTTCCAGGAGCTTTCGAGTC 2384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2397 TGCGTTCGATGAGGATGAAGGAGAAACAAGTACCTATTATCTTCCGGGAGCTTTCGAGTC 2456
Query 2385 TAGCAGATCATTTAATATAAGCCACaaaaaaaGGAAGAATCTGATGAAGTCTCATTCTGC 2444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2457 TAGCAGATCATTTAATATAAGCCACAAAAAAAGGAAGAATCTGATGAAGTCTCATTCTGC 2516
Query 2445 CCGGTCATATGATCTTGGGGATGATTTACCATATGTCAACTACACAGGTGGCTCTAACTC 2504
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CCGGTCATATGATCTTGGGGACGATTTACCATACGTCAACAACACAGGTGGCTCTAACTC 2576
Query 2505 ATCAAGTTTGATGGCAAAAAGGCCTGCCAGTAATATTAATGCCGGCTCAGTTCCGACGAG 2564
|||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2577 ATCAAGTTTGATAGTAAAAAGGCCTGACAGTAATATTAATGCCGGCTCAGTTCCGACAAG 2636
Query 2565 GCGAGTGCGCACTGCTTCCAGGCAGAGGATTGTGAGTCCTTTTGGGTGTGCTACTGCTGG 2624
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2637 GCGAGTGCGCACTGCTTCCAGGCATAGGGTTGTGAGTCCTTTTGGGTGTGCTACTACTGG 2696
Query 2625 GAATTTACCAGTGCCCTCGAAGACAGATGCGTCTAGTGGGGATACTAGTTCTTTCCAGGA 2684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2697 GAATTTACCAGTGCCCTCGAAGACAGATGCGTCTAGTGGGGATACTAGTTCTTTCCAGGA 2756
Query 2685 TGAGCAAAGTAGTTTGCATGGTGGATCGGCAGTCCAAAAAGGCACAGAGGTTGAGTCAAG 2744
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2757 TGAGTATAGTAGTTTGCATGGTGGATCGGCAGTCCAAAAAGGCACAGAGGTTGAGTCAAG 2816
Query 2745 TGGTAATTTTGAAAAGATGTTACCTTATGACATGGCTGAAACCTCAGGAAAACCTAAAAA 2804
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2817 TGTTAATTTTGAAAAGCTGTTACCTTATGACATGGCTGAAACCTCAGGAAAACCTAAAAA 2876
Query 2805 GAAGAAGAAGACTCATCAGGGATCCGCATATGACCAAACCTGGCATCTCGATCCGTCAGT 2864
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 2877 GAAAAAGAAGACTCATCAGGGCTCCGCATATGACCAAACTTGGCATCTCAATCCGTCAGT 2936
Query 2865 CCATGTTGAACAGAAGGACCACTGGAAGAAGCGACCAGAGAATCATTTCGATATGAATGG 2924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2937 CCATGTTGAACAGAAGGACCACTGGAAGAAGCGACCAGAGAATAATTTCGATATGAATGG 2996
Query 2925 CCTGTATGGTCCTCATAGTGCAAAGAAGCAAAAGACCACCAAGCAATTGGTAGACAATAA 2984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2997 TCTGTATGGTCCTCATAGTGCAAAGAAGCAAAAGACCACCAAGCAATTGGTAGAGAATAA 3056
Query 2985 TTTTGATATTGCTATTCCTCACGCTGGATCGATTCCTTCTCCGGCAGCTTCCCAGATGAG 3044
||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3057 TTTTGATATGGCTATTCCTCACACTGGATCGATTCCTTCTCCGGCTGCTTCCCAGATGAG 3116
Query 3045 CAATATGTCCAACCCCAACAAATCTATCAAATTTATTGGAGGTCGTGATAGGGCCAGAAA 3104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3117 CAATATGTCCAACCCCAACAAATCTATCAAATTTATTGGAGGTCGTGATAGGGGCAGAAA 3176
Query 3105 AATAAAAGGCCTGAAGATTTCTCCTGGTCAGCATGGTTCTGGAAATCCGTGGTCACTATT 3164
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3177 AATAAAAGGCCTGAAGATTTCTCCTGGTCAGCATGGTTCTGGAAATCCATGGTCACTATT 3236
Query 3165 TGAGGATCAGGCGCTTGTTGTCCTAGTGCATGACATGGGCCCTAACTGGGAGCTCATTAG 3224
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3237 TGAGGATCAGGCGCTTGTTGTCCTGGTGCATGATATGGGGCCTAACTGGGAGCTCATTAG 3296
Query 3225 TGATGCTATGAACAGCACCCTTAAAATTAAGTGTATATATCGCAATCCGACTGAGTGCAA 3284
|||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3297 TGATGCAATGAACAGCACTCTTAAAATTAAGTATATATATCGCAATCCGACTGAGTGCAA 3356
Query 3285 GGAGCGGCATAAGATTCTGATGGATAAGACTGCTGGTGATGGGGCTGATAGTGCTGAAGA 3344
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3357 GGACCGGCATAAGATTCTGATGGATAAAACTGCTGGTGATGGGGCTGATAGTGCAGAAGA 3416
Query 3345 TTCAGGGAATTCCCAGTCTTATCCATCCACTTTGCCTGGCATCCCAAAGGGAAGTGCGAG 3404
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3417 TTCAGGGAATTCTCAGTCTTATCCATCCACTTTGCCTGGCATACCAAAGGGAAGTGCGAG 3476
Query 3405 ACAGTTGTTTCAACGACTGCAAGGGCCAATGGAGGAAGATACCCTGAAGTCTCATTTTGA 3464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3477 ACAGTTGTTTCAACGACTGCAAGGGCCAATGGAGGAAGATACCCTGAAGTCTCATTTTGA 3536
Query 3465 GAAGATTTGTTTGATTGGGAAGAAGTTACATTATAGAAAGACACAGAA 3512
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3537 GAAGATTTGTTTGATTGGGAAGAAATTACATTATAGAAAGACACAGAA 3584
Score = 3533 bits (1913), Expect = 0.0
Identities = 2253/2408 (94%), Gaps = 60/2408 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 3703 GATGGTCGGGATCCCAAGCAAATAGTACCAGTTCACAATTCACAAGTTATGGCTCTTTCT 3762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 3586 GATGGTCGGGATCCCAAGCAAATAGTACCAGTTCACAATTCACAAGTCATGGCTCTCTCT 3645
Query 3763 CAAGTATTCCCGAATAATCTGAATGGAGGTGTTCTTACGCCCCTTGATGTCTGTGATGCA 3822
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3646 CAAGTATTCCCGAATAATCTGAATGGAGGTGTTCTTACGCCCCTTGATGTCTGTGACGCA 3705
Query 3823 TCAACTTCAGGTCAAGATGTATTTTCACTTGAAAATCCAGGTCTTCCAATTTTGAATCAG 3882
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3706 TCAACTTCAGGTCAAGATGTATTTTCACTTGAAAATCCAGGTCTTCCAATGTTGAATCAG 3765
Query 3883 GGAACGCCAGTGCTCCATACTTCTGGAGCACATCCATCCACTCCTGGATCGTCTGGTGTG 3942
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3766 GGAACGCCAGTGCTCCCTACTTCTGGAGCACATCCATCCACTCCTGGATCATCTGGTGTT 3825
Query 3943 GTTCTGAGTAACAATTTGCCAACCACATCTGGCCTACAGAGTGCTTCTGTCAGGGATGGT 4002
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3826 GTTCTGAGCAACAATTTGCCAACCACATCTGGCCTACAGAGTGCTTCTGTCAGGGATGGT 3885
Query 4003 AGATTCAATGTTCCTAGAGGGTCTTTGCCACTTGATGAACAACACCGACTACAACAATTT 4062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3886 AGATTCAATGTTCCTAGAGGGTCTTTGCCACTTGATGAACAACACCGACTACAACAATTT 3945
Query 4063 AATCAGATGTTATCCGGTAGAAACCTACAGCAGCCCTCCTTATCAACTCCTGGAGCTGTC 4122
||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3946 AATCAAACGTTATCTGGTAGAAACCTGCAGCAGCCCTCCTTATCAACTCCTGCAGCTGTC 4005
Query 4123 TCAGGATCTGATCGTGGACATCGCATGGTTCCTGGTGGAAATGCTATGGGTGTAACTGGA 4182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4006 TCAGGATCTGATCGTGGACATCGCATGGTTCCTGGTGGAAATGCTATGGGTGTAAGTGGA 4065
Query 4183 ATGAACAGGAACACACCCATGTCAAGGCCTGGTTTCCAAGGGATGGCCTCATCAGCAATG 4242
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4066 ATGAACAGGAACACACCCATGTCAAGGCCTGGTTTTCAAGGGATGGCCTCAGCAGCAATG 4125
Query 4243 CCAAATACTGGTAGTATGCTTTCTTCTGGTATGGTAGGAATTCCAAACACTGGAAATGTT 4302
||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4126 CCAAATACTGGTAATATGCATACCTCTGGCATGGTAGGAATTCCAAACACTGGAAATATT 4185
Query 4303 CATTCCGGAGGAGGAGCTTCTCAAGGAAACTCCATGCTCAGGCCTCGTGAAGCTGTGCAG 4362
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4186 CATTCCGGAGGAGGAGCTTCTCAAGGAAACTCCATGATCAGGCCTCGTGAAGCTGTGCAG 4245
Query 4363 CATATGATGCGGATGCAAGCTGCTCAAGGGAACAGTCCGGGGATCCCAGCTTTCAGTAAT 4422
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4246 CATATGATGCGGATGCAGGCTGCTCAAGGGAACAGTCCGGGGATCCCAGCTTTCAGTAAT 4305
Query 4423 TTGAGTTCTGGATTTACCAACCAGACAACTCCTGTTCAGGCATACCCAGGCCAACTTTCC 4482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 4306 TTGAGTTCTGGATTTACCAACCAGACAACTCCTGTTCAGGCGTACCCAGGCCATCTTTCC 4365
Query 4483 CAGCAGCATCAGATGTCACCGCAGTCACATGTGCTTGGCAACTCGCATCATCCTCATCTC 4542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4366 CAGCAGCATCAGATGTCACCGCAGTCACATGTGCTTGGCAACTCGCATCATCCTCATCTC 4425
Query 4543 CAGAGCCCAAGTCAAGCCACTGGGGCACAGCAGGAAGCATTTGCTATCCGTCAAAGGCAA 4602
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4426 CAGAGCCCAAGTCAAGCCACTGGGGCACAGCAGGAAGCATTTGCTATCCGTCAAAGACAA 4485
Query 4603 ATACACCAGAGGTATTTGCAGCAACAGCAGCAGCAGTTTCCAGCATCTGGTACTATGATG 4662
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4486 ATTCACCAGAGGTATTTGCAGCAACAGCAACAGCAGTTTCCAGCATCTGGTTCTATGATG 4545
Query 4663 CCACATGTACAACAACCTCAGGGCTCGTCTGTTTCTTCTTCTCCACAAAACAGTCCTCAG 4722
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4546 CCACATGTACAACAACCTCAGGGCTCTTCTGTTTCTTCTTCTTCACAAAACAGTCCTCAG 4605
Query 4723 ACTCAACCACCTGTTTCGCCCCAGCCATTATCGATGCCCCCAGTGTCGCCCTCTCCTAAT 4782
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4606 ACTCAACCACCTGTTTCGCCCCAGCCATTATCCATGCCCCCGGTGTCGCCCTCTCCTAAT 4665
Query 4783 ATTAATGCTATGGCACAACAGAACCCTAAAAAATCTCAGTTGCCGCTTCATGGTCTGGGT 4842
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 4666 ATTAATGCTATGGCACAACAGAAACCTCAAAAATCTCAGTTGGCGCTTCATGGTTTGGGT 4725
Query 4843 AGGAGTCCTCAGTCTGGTACTTCTGGAGTGAACAATCAAGCTGGAAAACAACGGCAGCGA 4902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4726 AGGAGTCCTCAGTCTGGTACTTCTGGAGTGAACAATCAAGCTGGAAAACAAAGGCAGCGA 4785
Query 4903 CAACTTCAGCAGCAGTTGCAGCAGTCTGCAAGACAACATCCACACCAGCGGCAGCCAACA 4962
|||||||||||| | | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4786 CAACTTCAGCAG---T--C-----T--GCAAGACAGCATCCACACCAGCGGCAGCCAACA 4833
Query 4963 CAAGGTCAACAGCAGAATAAA-AA--G--GGG-ATGGGTAGAGGCAGCATGATCCATCAG 5016
||||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4834 CAAGGTCAACAGCTGAATAAACAACTGAAGGGGATGGGTAGAGGCAACATGATCCATCAG 4893
Query 5017 AACATCACTGTCGATCAGTCACACCTGAATGGTCTTACCATGGCCCCA-GGAAATCAGGC 5075
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||
Sbjct 4894 AACATCACTGTCGATCAGTCACACCTGAATGGCCTTACCATG-CCCCAAGGAAATCAAGC 4952
Query 5076 TACCGAAAAAGGAGAG-TCAGCGGTTCCAGTTAGGCCTGATCAGCAGTCTAGTGCAGGGA 5134
|||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4953 TACCGAAAAAGGAGAGAT-AGCGGTTTCAGTTAGGCCTGATCAGCAGTCTAGTGTGGGGA 5011
Query 5135 CTAGCACGAGCACACATCTGCAGTCTAAACCATTTGTTCCTCCCTTATCTTCAAATCATT 5194
||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 5012 CTACCACGAGCACGGATCTGCAGTCTAAACCATTTGTTTCTCCCTTGTCTTCAAATCATT 5071
Query 5195 CACAGCAACTGCCAAACTCATTCCCTGGTGCTTCGTCTCCGTCCC---AACAACAGATGC 5251
|||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 5072 CACAGCAACTGCCAAAATCATTCCCTGGTGCTTTGTCTCCATCCCCTCAACAACAGATGC 5131
Query 5252 AATTACATTCAGACAATAGCATCCAAGGCCAGACCTCACCTGCGGCCCCATGTAACATCT 5311
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |
Sbjct 5132 AATTACATTCAGACAATAGCATCCAAGGCCAGAGCTCACCTGCGACCCCATGTAATATTT 5191
Query 5312 TATCCACCTCTAGCCCGTCAATTACACCTGCAGTTGCACCTTCCAACCATCAGCATTTGT 5371
||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5192 TATCCACCTCTAGCCTGTCAATTGCACCAGCGGTTGCACCTTCTAACCATCAGCATTTGT 5251
Query 5372 TGATACACCAAAAGCAGCGCAATCAAGTGCAATCAGCAGCTCAGCGAGTTGTTCATCATA 5431
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 5252 TGATACACCAAAAGCAGCGCAATCAAGTGCAATCAACAGCTCAGAGAGTTGTTCAACATA 5311
Query 5432 ATCATCTAGGAAACTCTGAGTTATCAAAGAAGTCCCAAGCTGAACGTATGCCACGTGTTC 5491
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5312 ATCATCTAGGGAACTCTGAGTTATCAAAGAAGTCCCAAGCTGAATGTATGCCACGTGTTC 5371
Query 5492 CGCTGTCTGTCACCAATACAACCCAAACTGCTAGTATGGGTACGACCAAGGGTATGCATC 5551
| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5372 CACAGTCTGTAACCAATACCACCCAAACTGCTAGTATGGGTACGACCAAGGGTATGCCTC 5431
Query 5552 AAGCGAGTAATGATTTGAAAAACATAAAAGCAGTTGGTTCTACTGCGGCGCCTGCTTTGG 5611
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5432 AAGCGAGTAATGATTTGAAAAACATAAAAGCAGTTGGTTCTACTGCGGTGCCTGCTTTGG 5491
Query 5612 AACCTCCATCTTGTGTTGCCTCTGTGCAAAGCACTGCTTCTAAAGTAGTAAACAGTTCCA 5671
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 5492 AACCTCCATCTTGTGTTGCTTCTGTGCAAAGCACTGCTTCGAAAGTAGTAAACAATTCCA 5551
Query 5672 ATACAGATTCAGCTGGGAATGATCCAGTAACAACACCGAACCAAGGACTAGCTCAGGAGC 5731
||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5552 ATACAGATTCAGCAGGAAATGATCCAGTATCAACACCGAACCAAGGACTAGCTCA--A-- 5607
Query 5732 ATCTATCTGGTGACTTGCCTAGTCACGGGATCAAGGGCGTGACACAGAGACAACAACAGT 5791
| | | | | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5608 A---A---G----C------A--C--GGGATCAAGGGCGTTACACAGAGACAACAACAGT 5647
Query 5792 CTCTACCTTCAGAAGAAAAGAGACC-AAAGTTGCCAGAGAAGCTGACTGTACAAAATCAA 5850
||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5648 CTCTACCTTCAGAAGAAAAGAGACCGAAA-TTGCCAGAGAAGCCGACTGTACAAAATCAG 5706
Query 5851 AAACACCTTGCTTCTGAGCAGCAACAGCAGCCTCAATTAGAAGAAGCACTGGAAGTATCA 5910
|||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 5707 AAACACCTTGCTTCTGAG--G-A---GCAGCCTCATTTAGAAGAAGCACAAGAATTATCA 5760
Query 5911 TCTTCCAAGCCTCCTGATACAAAAGTGGAATGAGAGGCATGACAGATGAACCTAGAACCT 5970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5761 TCTTCCAAGCCTCCTGATACAAAAGTGGAATGAGAGGCATGACAGATGAACCTAGAACCT 5820
Query 5971 TGAGTAGTTGTAGATCCTGCAAAGCTTAATGCTGGCCCTTACCAACAACAACCCTGTACA 6030
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5821 TGAGTAGCTGTAGATCCTGCAAAGCTTAACGCTGGCCCTTACCGACAACAACCCTGTACA 5880
Query 6031 GGAACCCAAACTGGTTTATCTCCTCCGCCTTCAGATTCGGGTCCTCACTTTTTGGCATTA 6090
||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||
Sbjct 5881 GGAACCCAAACTGGTTTGTGTCCTCCACCTTCAGAGTCGGGTC-TC--TTTTTGGCATTA 5937
Query 6091 ACATCTTG 6098
||||||||
Sbjct 5938 ACATCTTG 5945
Score = 56.5 bits (30), Expect = 3e-06
Identities = 30/30 (100%), Gaps = 0/30 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6110 GTATAACATAACAAACTCTACAGATTGTGG 6139
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5978 GTATAACATAACAAACTCTACAGATTGTGG 6007
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 306364846851
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5