BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg480680
Length=4013
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G17820.1 | Symbols: ATHK1, AHK1, HK1 | histidine kinase 1 | ... 6292 0.0
> AT2G17820.1 | Symbols: ATHK1, AHK1, HK1 | histidine kinase 1
| chr2:7742924-7748220 REVERSE LENGTH=4040
Length=4040
Score = 6292 bits (3407), Expect = 0.0
Identities = 3842/4044 (95%), Gaps = 62/4044 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCCTTCATGGGTTTCTGATTTGTCTACTAAAGTTTTGAtttttttAATTTGGGTATTA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 15 TTTCCTTCATGGGTTTCTGATTTGTCTACTAAAGTTTTGATTTTTTTAATTTGGGTATTA 74
Query 61 AT-TAAAAAGTGGGGAGTGACACAAGAAGCAGTATAGTCATTAG-TTTCCACTAAGCAAA 118
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 75 ATAAAAAAAGTGGGGAGTGACACAAGAAGCAGTATAGTCATTAGTTTTCCACTAAGCAAA 134
Query 119 GCACCCAAAAGTTCACCAACAACAACAACAAAGAAAGAACC-AATATGTGTCTTTGTTTG 177
||||||||||||| | || ||||||||||| | || |||||||||||||||||
Sbjct 135 GCACCCAAAAGTT---C-AC--CAACAACAAAG---G--CCTAATATGTGTCTTTGTTTA 183
Query 178 TGATTTGGGATCATCTGAAACAAGATGAGAGGAGATAGCTTCTCAATGAGTATTGAGAAT 237
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 TGATTTGGGATCATCTGAAACAAGATGCGAGGAGATAGCTTCTCAATGAGTATTGAGAAT 243
Query 238 AC-TCCTGATTCTCCAATGGTTTC------G-AG--GA---AGATCAGGAAGGTGTTCGA 284
| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||
Sbjct 244 -CTTCCTGATTCTCCAATGGGTTCGAGGAAGAAGAAGATGCAGATCAGGAAGGTGTTCGA 302
Query 285 TAAAATGACTCAATGGGTTACCCCTTGGAGAAGTAATTTGGAGAGTCCAAGAGAGATGAT 344
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 TAAAATGACTGAATGGGTTACCCCTTGGAGAAGTAATTTGGAGAGTCCAAGAGAGATGAT 362
Query 345 GATTTTGCGTGGAGATGTTGAACAAGATGAGTTTCAATACGCAAGTAGTCACTGTTTGTC 404
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 363 GATTTTGCGTGGAGATGTTGAACAAGATGAGTTTCAATACGCTAGTAGTCACTGTTTGTC 422
Query 405 TTCTTACTACAGTGTCTTTGTTGTTCGCCTCGCTATAATGGTGATGTTAGCAATTCTGAT 464
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 423 TTCTTACTACAGTGTCTTTGTTGTTCGCCTCGCTATAATGGTTATGTTAGCAATTTTGAT 482
Query 465 AGGGCTTTTAACCGTTCTAACATGGCATTTCACAAGGATTTACACGAAGCAATCGCTTAA 524
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |
Sbjct 483 AGGGCTTTTAACGGTTCTAACATGGCATTTCACAAGGATTTATACAAAGCAGTCGCTTCA 542
Query 525 AACATTAGCATATGGCCTTAGATACGAGCTTCTTCAGCGTCCGGTCTTACGGATGTGGAG 584
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 543 AACATTAGCGTATGGCCTTAGATACGAGCTTCTTCAGCGTCCAGTCTTACGGATGTGGAG 602
Query 585 CGTTTTAAACACCACATCCGAGCTAACAACAGCTCAAGTCAAGTTATCTGAATATGTCAT 644
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 603 CGTTTTAAACACCACATCAGAGCTAACAACAGCTCAAGTCAAGTTATCTGAATATGTCAT 662
Query 645 CAAAAAATATGACAAGCCAACAACTCAAGAAGAGCTCGTCGAGATGTATCAAGCAATGAA 704
||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||
Sbjct 663 CAAAAAATATGACAAGCCAACAACTCAAGAAGAACTTGTGGAGATGTATCAAGCAATGAA 722
Query 705 GGATGTGACATGGGCTCTGTTTGCTAGTGCCAAAGCTCTAAATGCCATAACTATAAACTA 764
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 723 GGATGTGACATGGGCTCTGTTTGCGAGTGCCAAAGCTCTAAATGCCATAACCATAAACTA 782
Query 765 CAGAAATGGATTTGTCCAAGCTTTTCACAGAGATCCAGCAAGTAGTAGCACATTCTACAT 824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 783 CAGAAATGGATTTGTCCAAGCTTTTCACAGAGATCCAGCAAGTAGCAGCACATTCTACAT 842
Query 825 CTTCTCCGATCTAAAAAACTATTCCATCAGTGGAATAGGGCCTGAAGATGTAAGCGGGTG 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 843 CTTCTCCGATCTAAAAAACTATTCCATCAGTGGAACAGGGCCTGAAGATGTAAGTGGGTG 902
Query 885 GAACAACCAGTCAATACACGGGAACATGTCTGCCATTTGGTACCAGCAACAGCTTGATCC 944
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 903 GAACAACAAGTCAATACACGGGAACATGTCTGCCATTTGGTATCAGCAACAGCTTGATCC 962
Query 945 AGTAACAGGGGAAAAATTGGGAAAGCCTCTTAAAATTCCACCCGATGATCTGATCAACAT 1004
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 963 AGTAACAGGGGAAAATTTGGGAAAGCCTCTTAAAATTCCACCGGATGATCTGATCAACAT 1022
Query 1005 CGCAGGAATCTCACAAGTGCCAGATGGTGAAGCTTCTTGGCATGTGGCAGTGAGCAAATA 1064
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1023 CGCAGGAATCTCACAAGTGCCTGATGGTGAAGCTTCTTGGCATGTGACAGTGAGCAAATA 1082
Query 1065 CATGGACTCTCCGCTTCTCTCAGCGGCTTTGCCTGTCTTTGATGCATCAAACAAGAGTAT 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083 CATGGACTCTCCGCTTCTCTCAGCGGCTTTGCCTGTCTTTGATGCATCAAACAAGAGTAT 1142
Query 1125 CGTGGATGTTGTGGGGGTGACAACTGCACTTTACAGCGTAGGGCAGTTGATGAGAGATCT 1184
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1143 TGTGGCTGTTGTGGGGGTGACAACTGCACTTTACAGCGTAGGACAGTTGATGAGAGATCT 1202
Query 1185 TGTAGATGTCCATGGTGGACATATCTATTTGACATCTCAGGAAGGATACTTGCTTGCTAC 1244
|||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1203 TGTAGAAGTCCACGGTGGACATATTTATTTGACATCTCAAGAAGGATACTTGCTTGCTAC 1262
Query 1245 CTCCACAAATGATCCTCTTTTAAAAAATACAACAAACGGGCCTAAGCTAATGAAAGCCAT 1304
||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1263 CTCCACAGATGGTCCTCTTTTGAAAAATACATCAAACGGGCCTCAGCTAATGAAAGCCAC 1322
Query 1305 TGATTCAGAGGAGTGGGTTATAAGGGCAGGAGCTCAGTGGTTAGAGAAAACTTATGGAAG 1364
||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 TGATTCAGAAGAGTGGGTTATAAAGTCAGGAGCTCAGTGGTTAGAGAAAACTTATGGAAG 1382
Query 1365 TAAACGCCCTCAAGAAGTTCATGCTGAGAATGTAAAGCTTGGTAACCAACGATATTACAT 1424
||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1383 TAAGCGCCCTCACGTTGTTCATGCTGAGAATGTAAAGCTTGGTGACCAACGATATTACAT 1442
Query 1425 TGATTCATTCTATCTTAATCTCAAGAGACTTCCAATTATAGGTGTTGTCATTATTCCCAG 1484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1443 TGATTCATTCTATCTTAATCTCAAGAGACTTCCAATTGTAGGTGTTGTCATTATTCCCAG 1502
Query 1485 GAAGTTCATTATGGGAAAAGTGGATGAAAGGGCCTTCAAGACTTTGATTATACTGATTTC 1544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1503 GAAGTTCATTATGGGAAAAGTGGATGAAAGGGCCTTCAAGACTTTGATTATTCTGATTTC 1562
Query 1545 TGCTTCTGTCTGCATCTTCTTTATTGGATGTGTCTGCATTTTGATTCTCACAAATGGAGT 1604
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 1563 TGCTTCTGTCTGCATCTTCTTTATTGGATGTGTCTGCATTTTAATACTCACAAATGGAGT 1622
Query 1605 TTCAAAGGAGATGAAACTAAGAGCAGAACTGATAAGGCAACTGGATGCAAGAAGAAGAGC 1664
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1623 TTCAAAGGAGATGAAGCTAAGAGCAGAACTGATAAGGCAACTGGATGCAAGAAGAAGAGC 1682
Query 1665 TGAAGCTTCAAGCAACTACAAAAGCCAGTTTTTGGCAAATATGAGCCATGAGTTGAGGAC 1724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1683 TGAAGCTTCAAGCAACTACAAAAGCCAGTTTTTGGCAAATATGAGTCATGAGTTGAGGAC 1742
Query 1725 ACCTATGGCTGCTGTGATTGGATTACTAGATATTCTTATATCAGATGATTGTCTTTCAAA 1784
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1743 ACCAATGGCTGCTGTAATTGGATTACTAGATATTCTTATATCGGATGATTGTCTTTCAAA 1802
Query 1785 TGAGCAATACGCAACAGTCACTCAGATCAGAAAGTGCTCTACCGCTCTCCTCCGGCTTCT 1844
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1803 TGAGCAATACGCAACAGTCACTCAGATCAGAAAGTGCTCTACAGCTCTCCTTCGGCTTCT 1862
Query 1845 CAATAACATACTGGACTTGAGCAAGGTTGAGTCAGGAAAGCTTGTTCTGGAAGAAGCTGA 1904
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1863 CAATAATATACTGGACTTGAGCAAGGTTGAGTCAGGAAAGCTTGTTCTGGAAGAAGCTGA 1922
Query 1905 GTTTGATTTGGGGCGAGAACTTGAAGGACTTGTTGACATGTTCTCAGTGCAGTGTATTAA 1964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1923 GTTTGATTTGGGGCGAGAACTTGAAGGACTTGTTGACATGTTCTCGGTGCAGTGTATTAA 1982
Query 1965 TCACAATGTAGAGACAGTTCTAGACCTCTCTGATGATATGCCAGCATTAGTCAGAGGAGA 2024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1983 TCACAATGTAGAGACAGTTCTAGACCTCTCTGATGATATGCCAGCATTAGTCAGAGGAGA 2042
Query 2025 CTCGGCAAGACTTGTTCAAATATTTGCAAATCTTATAAGCAATTCTATAAAGTTTACAAC 2084
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2043 CTCAGCAAGACTTGTTCAAATATTTGCAAATCTTATAAGCAATTCTATAAAGTTTACAAC 2102
Query 2085 AACGGGTCACATAATTCTACGTGGATGGTGCGAGAACATAAATTCTCTACATGATGAGAT 2144
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2103 AACGGGTCACATTATTCTTCGTGGATGGTGCGAGAACATAAATTCTCTACATGATGAGAT 2162
Query 2145 GAGCTTAACTGTTGACAGGAA-GAAACCATGGGCTCCAATGAAGACAAAACTGGTGCAAC 2203
|||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2163 GAGCGTATCTGTTGACA-GAAGGAAACCATGGGCTCCAATGAAGACAAAACAGGTGCAAC 2221
Query 2204 ACAGAAATCATTTGCAGAAGTCTTGTAAGAACGCTAACAAAATGGTTCTTTGGTTTGAGG 2263
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2222 ACAGAAATCACTTGCAGAAGTCTTGTAAGAACGCGAACAAAATGGTTCTTTGGTTTGAGG 2281
Query 2264 TTGATGACACTGGATGTGGAATAGAAT-CAAGCAAATGGGACTCTGTTTTTGAGAGCTTT 2322
||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2282 TTGATGATACTGGATGTGGAATAG-ATCCAAGCAAATGGGACTCTGTTTTTGAGAGCTTT 2340
Query 2323 GAGCAAGCTGATCCTTCTACCACTCGGACGCATGGAGGAACTGGTCTTGGACTATGTATC 2382
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2341 GAGCAAGCTGATCCTTCTACCACTCGGACGCACGGAGGAACTGGACTTGGACTATGTATT 2400
Query 2383 GTCCGAAACTTGGTTAACAAAATGGGTGGAGAAATTAAAGTAGTGCAGAAGAATGGCTTA 2442
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 GTGCGAAACTTGGTTAACAAAATGGGTGGAGAAATCAAAGTAGTGCAGAAGAATGGCTTA 2460
Query 2443 GGGACTCTAATGAGACTGTATTTGATTTTGAGTACTCCTGAAACTGCAGATCAAAATATC 2502
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||
Sbjct 2461 GGGACTCTTATGAGACTGTACTTGATTTTGAGTACTCCTGACACTGTAGATCAAAACATC 2520
Query 2503 CAGCCAGATTTCTCCAAATATGGTCTCGTGGTTTTGCTTTCCATGTATGGAAGTACAGCA 2562
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 CAGCCAGATTTCTCCAAATACGGTCTCGTGGTTATGCTTTCCATGTATGGAAGTACAGCA 2580
Query 2563 AGAATGATCACATCAAAGTGGTTGCGTAAACACGGCATTGCAACTGTTGAAGCATCAGAC 2622
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 AGAATGATCACATCAAAGTGGTTGCGAAAACACGGCATTGCAACTGTTGAAGCATCAGAC 2640
Query 2623 TGGAACGAGCTGACTCAGATCATTAGAGACCTTTTGGAGATGGGAAGCGGTGACAACAGC 2682
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 2641 TGGAACGAGCTGACTCAGATCATTAGAGACCTCTTGGAGACGGGAAGCCGTGACAACAGC 2700
Query 2683 TTTGATTCACAGAACAATAT-TGCTGATTCACTGAGAGCAGAGCTTTCAAATATAGAAGA 2741
|||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2701 TTTGATTCACAGCACAATATAT-CTGATCCACTGAGAGCAGAGCTTTCAAATATAGTAGA 2759
Query 2742 AATCAAGAACCCTGTGTTTGTCATAGTGGTGGATATCGGAGTACTTGATCTCACCACAGA 2801
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2760 AATCAAGAACCCTGTGTTTGTCATAGTGGTGGATATCGGAGTACTTGATCTCACCACAAA 2819
Query 2802 TATATGGAAGGAACAGCTTAACTACCTCGACAGATTCTCCATCAAAGCAAAGTTTGCTTG 2861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2820 TATATGGAAGGAACAGCTTAACTACCTCGACAGATTCTCCAACAAAGCAAAGTTTGCTTG 2879
Query 2862 GCTGCTGAAGCATGACACCTCCAATACAGTTAAAACAGAACTTAGACGAAAAGGGCATGT 2921
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 GCTACTGAAGCATGACACCTCCAATACAGTTAAAACAGAACTTAGACGAAAAGGGCATGT 2939
Query 2922 CATGATGGTTAACAAACCGTTGTACAAGGCCAAAATGATTCAGATTCTGGAGGCTGTAAT 2981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2940 CATGATGGTTAACAAACCGTTGTACAAGGCCAAAATGATCCAGATTCTGGAGGCTGTAAT 2999
Query 2982 AAAAAACCGGAAGAGA------TGTAATGGA-TTAAGAAACAGAGGAAACGGAAGTGATG 3034
|||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3000 AAAAAACCGGAAGAGAGGCTTGTGTAAT-GACTTAAGAAACAGAGGAAACGGAAGTGATG 3058
Query 3035 AATCCCACGATTGCTTAGAAATTGATCCAACACAATTCGACACTTGCAGTTCCGATGATT 3094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3059 AATCCCACGATTGCTTAGAAATTGATCCAACACAATTCGACACTTGCAGTTCCGATGATT 3118
Query 3095 CCTCTGAGACATCTGGCGAGAAACATA-TAGATAAACCTGTGCAACCAAGCACCTTGCAC 3153
|||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 3119 CCTCGGAGACATCTGGCGAGAAACA-AGTAGATAAATCTGTTAAACCAAGCACCTTGCAC 3177
Query 3154 TCTCCAGTTCTTAAGAACTATCTCATTGACGCCACTAACAGCAATGATGACTCAACATCT 3213
|||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3178 TCTCCAGTGCTTAAGAACTATCTCATCGATGCCACTACCAGCAATGATGACTCAACATCT 3237
Query 3214 GCAAGTACGACTCAAAAGAACCTAGAAGAAGAAGATTGGAAAGATCGGCTGTATTCAGGA 3273
||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3238 GCAAGTATGACTCAAAAGAACCCAGAAGAAGAAGATTGGAAGGATCGGCTGTATTCAGGA 3297
Query 3274 ATTGCGTTGGATGGAAAGAATCTGAAATCTCTTGAAGGTATTAGGATCTTGCTGGCAGAA 3333
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3298 ATTGCGTTGGATGGAAAGAATCAGAAATCTCTTGAAGGTATAAGGATCTTGCTGGCAGAG 3357
Query 3334 GATACACCCGTTCTTCAACGAGTAGCCACCATAATGCTTGAGAAAATGGGAGCAACTGTA 3393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3358 GATACACCCGTTCTTCAACGAGTAGCCACCATAATGCTTGAGAAAATGGGAGCAACTGTA 3417
Query 3394 ACTGCAGTCTGGGATGGACAACAAGCAGTTGATTCCCTCAACTACAAGTCTATCAATGCT 3453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3418 ACTGCAGTCTGGGATGGACAACAAGCAGTTGATTCCCTCAACTACAAGTCTATCAATGCT 3477
Query 3454 CAAGATCCAACTGGAGAAC-CGACATCGT-CAGAAGAAGAAACCGCCAACAAC-TCTATA 3510
|||| |||||||| ||||| | | ||||| | |||||||||||||| ||||| | || |
Sbjct 3478 CAAGCTCCAACTGAAGAACACAA-ATCGTTC-GAAGAAGAAACCGCTAACAAAGT-TACA 3534
Query 3511 AAGCCGCAGAGTAGTTTACGGAATTCGTCACCTTATGACTTGATCCTCATGGACTGCCAG 3570
| | | ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3535 ACTCGGGAGACTAGTTTACGGAATTCCTCGCCTTATGACTTGATCCTCATGGACTGCCAG 3594
Query 3571 ATGCCAAAAATGGATGGATATGAGGCAACAAAGGCGATAAGGAGAGCAGAGATTGGCACT 3630
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3595 ATGCCAAAAATGGATGGATATGAGGCAACAAAGGCGATAAGGAGAGCAGAGATTGGCACA 3654
Query 3631 GAGCTTCACATTCCAATCGTGGCATTGACAGCGCATGCAATGTCTTCTGACGAAGCGAAA 3690
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3655 GAGCTGCACATTCCAATCGTGGCGTTGACAGCGCATGCAATGTCTTCTGATGAAGCGAAA 3714
Query 3691 TGCTTGGAGGTTGGGATGGATGCTTATCTCACAAAGCCTATTGATCGGAAGCTTATGGTC 3750
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3715 TGCTTGGAGGTTGGAATGGATGCTTATCTCACAAAGCCTATTGATCGAAAGCTTATGGTC 3774
Query 3751 TCTACCATTTTGTCACTCACTAAACCATCAATATTCCAAACTTCATTGTCCGCTTGAAGC 3810
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 TCTACCATTTTGTCACTCACTAAACCATCAGCATTCCAAACTTCATTGTCCGCTTGAAGA 3834
Query 3811 ATCGGGTTAAAAA-CTAACAAGAGAACTTGTTTTAGTAGGTACGGGATCTTGCATTTTGT 3869
||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 3835 ATCGGGT-AAAAATCTAACAAGTGAACTT-TTTTAGTAGGTTCAGGATCTTGCATTTTGT 3892
Query 3870 ATATATTTGAATTTGTAGTTGACGATGAGGTTTTTGGGGGTAAAGAAAATCCTGTTTTTT 3929
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3893 ATATATGTGAATTTGTAGTTGACGATGAGGTTTTTGGGGGTAAAGAAAATCCTGTTTTTT 3952
Query 3930 GGTCAGTTTTTGTTTACTGCGATACCAAGAATGTTTTGTACTTAAAATAAGAATACATTG 3989
||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3953 GGTCATTTTTTGTTTACTGCAATACGAAGAATGTTTTGTACTTAAA---------CATTG 4003
Query 3990 TATACTTGTTTTGAAGATGTGAAG 4013
|||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4004 TATACTTGTTTTAAAGATGTGAAG 4027
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 199965434798
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5