BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg481065

Length=4298
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT2G22010.2 | Symbols: RKP | related to KPC1 | chr2:9363109-936...  6804    0.0  


> AT2G22010.2 | Symbols: RKP | related to KPC1 | chr2:9363109-9369461 
REVERSE LENGTH=5143
Length=5143

 Score = 6804 bits (3684),  Expect = 0.0
 Identities = 4156/4372 (95%), Gaps = 79/4372 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     tctctctctctctctctctTCGAGG-AG--GAAG---aaaaaa-aaGCGAAAAGTCTTCT  53
             ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||   |||||| ||||||||||||||||
Sbjct  165   TCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCGAGGAAGAAGAAGAAAAAAAAAGAAGCGAAAAGTCTTCT  224

Query  54    CCtttttttATTTATTTGAAAAACCCTAACACGAGTCCGCCGTCTTTGGTCTGAAGAATC  113
             || | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  225   CC-TGTTTAATTTATTTGAAAAACCCTAGCACAAGTCCGCCGTCTTTGGTTTGAAGAATC  283

Query  114   TGGGTATTGATTGATTTTGGCTTCTGGGTTAATCG-TTTTGATGTCAATTTCTCCGCTTT  172
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct  284   TGGGTATTGATTGATTTTGGCTTCTGGGTTAATCGCTTTTCATGTCAATTTCTCCGCTTT  343

Query  173   TCTGAATCATTTTCGAATCGTGTCTGATGAGTTCTTGATG-A-AGATTCAGACTTTGGTT  230
             |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | || | |||| ||||||||||||
Sbjct  344   TCTGAATCATTTTCGAATTGTCTCTGATGAGGTCTCGTTGAATAGATACAGACTTTGGTT  403

Query  231   CTCTTGTAATTGATCAT-TT---A-CGTGTTTGATTCACAATCAATGCCATATGGCTGAA  285
             |||||||||||| |  | ||   | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  404   CTCTTGTAATTGGTTGTGTTGAAAGCGCGTTTGGTTCACAATCAATGCCATATGGCTGAA  463

Query  286   GACAGCCTACGGGTTGGTATGATTTCATCTGGTTTGGCTGTTTTACTGAATGGTGAAGAT  345
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  464   GACAGCCTACGGGTTGGTATGATTTCATCTGGTTTGGCTGTTTTACTGAATGGTGAAGAT  523

Query  346   GCTAAAGAGAATTCGTCGAAAGCTCGTATTGTTCCACATTTTGATTATTCTGGTCACCGG  405
             |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  524   GCTAAAGAAAATTCCTCGAAAGCTCGTATTGTTCCACATTTTGATTATTCTGGTCACCGG  583

Query  406   CCTTTAGAACGGACTATCGAATTTATATTTGGTCTAGCAGAAAAGTCGGTTGGTCCATTG  465
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584   CCTTTAGAACGGACTATCGAATTCATATTTGGTTTAGCAGAAAAGTCGGTTGGTCCATTG  643

Query  466   GATGGTCAAGTAGACAGTAGCTTGATTAGAGCCGTGATTAAGAATCAGTTTTCGAAGCTT  525
             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  644   GATGGTCAAGTAGACAGTAGCTTGATTAGAGCTGTGATTAAGAATCAGTTCTCGAAGCTT  703

Query  526   CATGGTGAATTGGATGTTTCAGTTAGTCAGAGAGAAGGAATCAGTGTAGTTCATCATGGT  585
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  704   CATGGTGATTTGGATGTTTCAGTTAGTCAGAGAGAAGGAATCAGTGTAGTTCATCATGGT  763

Query  586   GTTGGACCTCCTGTTGTTGGCCTTGAAGAGTATAGCTTATGTGGTGATATCAGGATTGTG  645
             |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  764   GTTGGACCTCCTATTGTTGGCCTTGAAGAGTTTAGCATATGTGGTGATATCAGGATTGTG  823

Query  646   AAGCCACCTCTTGTGTTGGAGAGCTTAGCACTATTCAGTAGCGCCAGGGCTAATGCTTGT  705
             |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  824   AAGCCACCTCTTGTATTGGAGAGCTTAGCACTTTTCAGTAGCGCCAGGGCTAATGCTTGT  883

Query  706   ATTTGGAAAGGAAAATGGATGTATGAAGTCGCTTTAGAGACCTCGGGAATTCAACAACTT  765
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884   ATTTGGAAAGGAAAATGGATGTATGAAGTCGCTTTAGAGACCTCGGGAATTCAACAACTT  943

Query  766   GGATGGGCAACACTTGCTTGTCCTTTCACTGACCAGAAAGGTGTGGGTGATGCTGATGAT  825
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  944   GGATGGGCAACACTTGCTTGCCCTTTCACTGACCAGAAAGGTGTGGGTGATGCTGATGAT  1003

Query  826   TCATATGCTTTTGATGGTCGAAGGGTAAGCAAATGGAACAAGGAGGCTGAACCTTATGGT  885
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1004  TCATATGCTTTTGATGGTCGAAGGGTAAGCAAATGGAACAAGGAAGCTGAACCTTATGGT  1063

Query  886   CAATCATGGGTAGCTGGGGATGTCATCGGTTGCTGCATAGATTTGAACTGTGATGAGATA  945
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  1064  CAATCATGGGTTGCTGGGGATGTCATCGGTTGCTGCATAGATTTGAACTGTGATGAGATT  1123

Query  946   TACTTCTACAGGAATGGTGTCTCCCTCGGTGCTGCATTTACTGGTATTAGAAAACTTGGA  1005
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1124  TACTTCTACAGGAATGGTGTCTCCCTCGGGGCTGCATTTACTGGTATTAGAAAACTTGGA  1183

Query  1006  CCTGGATTTGGGTATTACCCTGCTATATCTCTCTCCCAAGGTGAGAGATGCGAGTTAAAT  1065
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1184  CCTGGATTTGGGTATTACCCTGCTATATCTCTCTCCCAAGGTGAGAGATGCGAGTTAAAT  1243

Query  1066  TTCGGCGCTTACCCGTTTAAGTACCCTGTTGAAGGCTTCCAACCTCTTCAAGAAGCTCCA  1125
             |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1244  TTCGGCGCTTACCCGTTTAAGTACCCTGTTGACGGTTTCCAACCTCTTCAAGAAGCTCCA  1303

Query  1126  CCTCGATTTTCTTTTGCAACAGAGCTACTACGATGCTTCTCAAGACTGCTGGATAGGCCA  1185
              |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1304  ACTCGATTTTCATTTGCAACAGAGCTACTACGATGCTTCTCAAGACTGCTGGATAGGCCA  1363

Query  1186  GACCGCTCGTTGGCTGATACATTAAGTCGACTGAGGAGATTTGCCTCGGTTGAAGAACTC  1245
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct  1364  GACCGCTCATTGGCTGATACATTAAGTCGACTGAGGAGATTTGCCTCAGTCGAAGAACTC  1423

Query  1246  TTTTCCCCTGTTTCCTCTGCCATATGTGATGAGTTCTTTTACATACTTGAACAAGACCCT  1305
             |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct  1424  TTTTGCCCTGTTTCGTCTGCCATATGTGATGAGTTCTTTTATATACTTGAGCAAGACCCT  1483

Query  1306  TTGTTGCCTGAGTACTTGGGACGGGGTGCATTTCTGTCATTCCTCTTGGAGATTTTCAGA  1365
             |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1484  TTGTTGGCGGAGTACTTAGGACGGGGTGCATTTCTGTCATTCCTCTTGGAGACTTTCAGA  1543

Query  1366  TCCCAAGCACCGCATGATTCGTCAAGTTTAGACAAAGTTCTTGATGTGCTTCTTGAGTTC  1425
              | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1544  ACTCAAGCACCGCATGATTCGTCAAGTTTAGACAAAGTTCTTGATGTGTTTCTTGAGTTC  1603

Query  1426  CCACAATCTCATTTGATCTTTGAGCATGTAGTAAACGCTCTGGCTTGTGGCTGCAAAACA  1485
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1604  CCACAATCTCATTTGATCTTTGAGCATGTAGTAAACGCTCTGGCTTGTGGCTGCAAAACA  1663

Query  1486  GCGACACTGATTCTAACCGAATGTCCATACTCCGGACCTTATCCCTATCTTGCGCTGGCT  1545
             |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1664  GCGACACTGATTTTAACCGAGTGTCCATACTCCGGACCTTATCCCTATCTGGCGCTGGCT  1723

Query  1546  TGTCATTTGTTAAAACGGGAAGAATTGATGGTACAATGGTGGAGATCTTTGCATTTCGAG  1605
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1724  TGTCATTTGTTTAAACGGGAAGAATTGATGGTACAATGGTGGAGATCTTTGCATTTCGAG  1783

Query  1606  TTTTTGTTTGAAGCTTTCTTGTCATGTAGGAGTTCCAACAAGCATGACTTACAGCAGTTA  1665
             ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  1784  TTTTTGTTTGAAGGTTTCTTGTCATGCAGGAGTTCCAACAAGCATGACTTACAGCACTTA  1843

Query  1666  ATGCCTGTTGTTTGGTGGCCTGGATCCTCTGAAGATATATCCCACGAGAGTAGCATGGGA  1725
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  1844  ATGCCTGTTGTTTGGTGGCCTGGATCCTCTGAAGATATATCCTACGAGAGTAGCATGGGA  1903

Query  1726  TTTACGATCTCCGCTCTCTCTGAAGCCATTAACAAGATTGAGGAGAAGCAGAGGAACCTC  1785
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1904  TTTACGATCTCCGCTCTCTCTGAAGCCATTAACAAGATTGAGGAGAAGCAGAGGAACCTC  1963

Query  1786  TGTCTCTTGGTCATACAATTCATACCACCTGTAACACCTCCCCAGCTTCCTGGTTCAGCG  1845
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  1964  TGTCTCTTGGTCATACAATTCATACCACCTGTATCACCTCCCCAGCTTCCTGGTTCAGCT  2023

Query  1846  TTCCGCGGATTCCTACAGAACCTTTTATTGAAGAACAGAGGCGCAGATAGGACTCTGGCC  1905
             ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2024  TTCAGGGGATTCCTACAGAACCTTTTATTGAAGAACAGAGGCGCAGATAGGACTCTGGCC  2083

Query  1906  CCTTCTGGAGTTACACGCAATTCAGTTCTTGTCTCTCTGTTCTCAGTTATACTCCATTTT  1965
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || 
Sbjct  2084  CCTTCTGGAGTTACACGCAATTCGGTTCTTGTCTCTTTGTTCTCAGTTATACTCCACTTC  2143

Query  1966  TTGTCAGAAGGTTTCGCAATGCTGAAGAGTAGTGAAGCCGTCCATCACAATGTTGGTTTT  2025
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2144  TTGTCAGAAGGTTTTGCAATGCTGAAGAGTAGTGAAGCCGTCCATCACAATGTTGGTTTT  2203

Query  2026  CTTCACAGAGGTGGACAGCAGAAGTTTCCATTGAGTTTGTTTCTTAAAAATGATCCACAT  2085
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2204  CTTCACAGAGGTGGTCAGCAGAAGTTTCCATTGAGTTTGTTTCTTAAAAATGATCCACAT  2263

Query  2086  CGAGCTGATATCACTAGGCTTGGCGGGCTATTTAGTCATATATCGAAGTCCTACCCCACA  2145
             || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2264  CGCGCTGATATTACTAGGCTTGGCGGGCTATTTAGTCATATATCGAAGTCCTACCCCACA  2323

Query  2146  GATGATCAAGAAGAAGAAATAATGCGGTGGGAAGAAGGTTGTATGGATGATGAACAGAAT  2205
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2324  GATGATCAAGAAGAAGAAATAATGCGGTGGGAAGAAGGTTGTATGGATGATGAACAGAAT  2383

Query  2206  AGAGTAACTCACGCGACTGATCAGAAGCCATGCTGTTGCTTAGCTTATGATACCGATCTT  2265
             |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2384  AGAGTAACTCACGCGACTGAGCAAAAGCCATGCTGTTGCTTAGCTTATGATACCGATCTT  2443

Query  2266  ACTAAATCCTTGAAGGATCGAGGAAAAAATACTGCTCAAAGTTCTCGTGGTCGATGCAGT  2325
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2444  ACTAAATCCTTGAAGGATCGAGGAAAAAATACTGCTCAAAGTTCTCGTGGTCGATGCAGT  2503

Query  2326  TCCATTCCTGAGAGATCCTCTCAAGTTGCTGCAGAATGTAGTGCTGGAAGTTTCAGTGAA  2385
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2504  TCCATTCCTGAGAGATCCTCTCATGTTGCTGCAGAATGTAGTGCTGGAAGTTTCAGTGAA  2563

Query  2386  GAAATAGAGGACAAACCTAGCACAAGTAATCAGTCTGACCCTGACTTTGGTTATCGTCCA  2445
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2564  GAAATAGACGACAAACCTAGCACAAGTAATCAGTCTGACCCTGACTTTGGTTATCGTCCA  2623

Query  2446  GTAAGATTTATGCGGACTGCACTTCAAGAGAGTAGAATCTCATCTGCTATACTAAGCGAA  2505
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2624  GTAAGATTTATGCGGACTGCACTTCAAGAGAGTAGAATCTCATCTGCTATACTAAGCGAA  2683

Query  2506  GAAGAACTATTGGATGCTCTATTGCTATTATACCATATTGCTGTTGCTCCAAATTTTAAG  2565
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2684  GAAGAACTATTGGATGCTCTATTGCTATTATACCATATTGCTGTTGCTCCAAATTTTAAG  2743

Query  2566  CAGGCATCATATTACATGTCTCACCAAACGCAATCAATATCACTTCTTGAAGAAACTGAT  2625
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2744  CAGGCATCATATTACATGTCTCACCAATCGCAATCAATATCACTTCTTGAAGAAACTGAT  2803

Query  2626  AAACAGATAAGAGAGCGGGCTTCTAGTGACCAATTAAAGCGCTTGAAGGAAGCTCGCAAC  2685
             |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2804  AAACAGATAAGAGAACGGGCTTCTTGTGACCAAATAAAGCGCTTGAAGGAAGCTCGCAAC  2863

Query  2686  AACTACAAGGAAGACGTGATGGAGTGTGTTAGACATTCCGCATGGTTCCGCATCTCATTG  2745
             |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2864  AACTACAAAGAAGACGTGATGGACTGTGTTAGACATTCCGCATGGTTCCGCATCTCATTG  2923

Query  2746  CTCTCTCGATGGAAGCAAAGAGGAATGTACGCATTGTGCATGTGGGTTGTACAGCTACTT  2805
              ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2924  TTCTCTCGATGGAAGCAAAGGGGAATGTATGCATTGTGCATGTGGGTTGTACAGCTACTT  2983

Query  2806  CTGGTTCTCAGCAAAATGGATTCTGTGTTTGTTTATATTCCAGAGTTCTACGTTGAATCT  2865
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  2984  CTGGTTCTCAGCAAAATGGATTCTGTGTTTGTTTATATTCCAGAGTTCTACCTTGAATCT  3043

Query  2866  TTGGTAGACTGTTTCCATGTGCTCCGCAAGAGCGATCCTCCGTTTGTCCCCTCAACAACA  2925
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  3044  TTGGTAGACTGTTTCCATGTGCTTCGCAAGAGCGATCCTCCGTTTGTCCCATCAACAACA  3103

Query  2926  TTTATCAAACAAGGACTTTCATCATTTATCACTTTCGTAGTTACACACTTCAATGATTCA  2985
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  3104  TTCATCAAACAAGGACTTTCATCATTTATCACTTTCGTAGTTACACACTTCAACGATTCA  3163

Query  2986  AGGATATCGAATACAGATCTTAAAGATTTACTTCTCCAGTCAATATCCGTCCTGGTACAG  3045
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3164  AGGATATCGAATACAGATCTTAAAGATCTACTTCTCCAGTCAATATCCGTCCTGGTACAG  3223

Query  3046  TACAAAGAGTACTTGGAAGCTTTCGAGAACAATGAGGCAGCTACTAAACACATGCCTGCA  3105
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||
Sbjct  3224  TACAAAGAGTACTTGGAAGCTTTCGAGAACAATGAGGCAGCTACTCGACACATGCCTGCA  3283

Query  3106  GCACTACTGGCAGCGTTTGACAACAGATCTTGGATCCCTGTCACAAATATATTTCTTCGT  3165
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3284  GCACTACTGGCAGCGTTTGACAACAGATCTTGGATCCCTGTCACAAATATATTTCTTCGT  3343

Query  3166  CTTTGCAAAGGTTCTGGCTTTAGTTCTTTAAAGAACGGGGAGTCTTCGGTTTCATCTACT  3225
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||
Sbjct  3344  CTTTGCAAAGGTTCTGGGTTTAGTTCTTTAAAGAACGGAGAGTCTTCGTTTTCGTCTACT  3403

Query  3226  GTTTTCCAGGTGCTTCTACGAGATGCTTGTATCAATGATGGTGAATTACTGTCTACTTTT  3285
             |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  3404  GTTTTCCAGGCGCTTCTACGAGATGCTTGTATCAATGATGGTGAATTACTTTCTACTTTT  3463

Query  3286  CTTAACCGGCTATTCAACACACTGAGCTGGACCATTACTGAATTTTCTGTCTCGGTGCGA  3345
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3464  CTTAACCGTCTATTCAACACACTGAGCTGGACCATCACTGAATTTTCTGTCTCGGTGCGA  3523

Query  3346  GAAATGCAAGAAAAGTATCAGGTAATGGAGTTTCAACAAAGGAAATGTTGTGTGATATTT  3405
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3524  GAAATGCAAGAAAAGTATCAGGTAATGGAGTTTCAGCAAAGGAAATGTTGTGTGATATTT  3583

Query  3406  GAGCTTTCAAGCAATCTCGCAAGAGTCTTAGAGTTCTGCACTTACGCAATACCACAAGCA  3465
             ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  3584  GAGCTTTCAAGCAATCTCGCAAGGGTCTTAGAATTCTGCACTTACGCAATGCCACAAGCA  3643

Query  3466  TTTCTTGCTGGGACTGACACGAATCTTCGTAGGCTCACTGAGTTGATTCTTTTTATCTTG  3525
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  3644  TTTCTTGCTGGGACTGACACGAATCTTCGTAGGCTCACTGAGTTGATTCTTTTCATCTTG  3703

Query  3526  AATCACATGACCTCAGCAGTAGATGACGAGTTCTTTGATCT----GTCA---C--TTAGA  3576
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||   |  |||||
Sbjct  3704  AATCACATGACCTCAGCAGTAGATGACGAGTTCTTTGATCTATCTGTCAGGTCACTTAGA  3763

Query  3577  CGGCAAGGACAACCTTCAGAGAAAGTTAGCCGAGGGGTCTTATTAGCTCCTTTGGTGGGT  3636
             ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct  3764  CGGCAGGGACAACCTTCAGAGAAAGTTAGCCGAGGGATCTTATTAGCTCCTTTGGTTGGT  3823

Query  3637  ATAATCTTGAATCTTTTGGAGGCTAGTGAAGACTCAAAACCGAAGCAACA---TGATGTA  3693
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||
Sbjct  3824  ATAATCTTGAATCTCTTGGAGGCTAGTGAAGACTCAAAACCAAAGCAACAACATGATGTA  3883

Query  3694  ATTGGTCTTTTTGCAAGCATGGACTGTCCCGATACAGTGTATTACGGGTTTCAATATCTC  3753
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct  3884  ATTGGTCTTTTCGCAAGCATGGACTGTCCCGATACAGTCTATTACGGGTTTCAGTATCTC  3943

Query  3754  TTGGAATATAATTGGGACGGTTGTGTAAGCGGGGATGATGCGTATGTAAAGAAACTTGGA  3813
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  3944  TTGGAATATAATTGGGACGGTTGTGTAAGCGGGGATGATGCCTATGTAAAGAAACTTGGA  4003

Query  3814  CAACTTGAGAACTTCTTGAACAATCTCATAAACCGGGCGTCATCGCAAGAACCCGAAGGA  3873
             || |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct  4004  CAGCTTGAGAACTTCTTGAGCCATCTCATAAACCGGGCTTCATCGCAAGAACCCGAAAGA  4063

Query  3874  AAAGAAGAG-CTGTTCAACAAAGACATGACGGATATAGAAGACAACACTTGCTGTATCTG  3932
             ||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4064  AAAGAAGAGTCA-TTCAACAAAGACACGACAGATATAGAAGACAACACTTGCTGTATCTG  4122

Query  3933  CTACGCGGGGGAGGCTAATGCAATGATTGCTCCATGTTCACATCGATCATGTTATGGCTG  3992
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4123  CTACGCGGGGGAGGCTAATGCAATGATTGCTCCGTGTTCACATCGATCATGTTATGGCTG  4182

Query  3993  CATAACTAGACATCTTCTCAATTGTCAGAGATGTTTTTTCTGCAATGCTACGGTGATAGA  4052
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4183  CATAACTAGACATCTTCTCAACTGTCAGAGATGTTTTTTCTGCAATGCTACGGTGATAGA  4242

Query  4053  CGTTATAAGAGACAAAGAAGTAGAAGA---------CGATGATGATCACAAAAGAAGCAC  4103
              ||||||||||| ||||||| ||||||         |||||||| |||||||||||||||
Sbjct  4243  TGTTATAAGAGATAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACGATGATGGTCACAAAAGAAGCAC  4302

Query  4104  CTGAAGCTCGGGTTAGTTGCGGTTACA------------------CA--GAAGGAAAGAT  4143
              ||||||||||||||||||||||||||                  ||  |||||||||||
Sbjct  4303  ATGAAGCTCGGGTTAGTTGCGGTTACAGGTTGTTGATGTAGTAGACACAGAAGGAAAGAT  4362

Query  4144  CTTTAGGATGGGGAGCAAAGGAAGAAGGATTATAGATTTTTATAGGATAAATAAGAAACA  4203
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |
Sbjct  4363  CTTTAGGATGGG-AGCAAAGGAAGAAGGATTATATAGATTTATAGGATAAATAAGAAA-A  4420

Query  4204  AAAAGAAA-AA-CAAAGGTCTGTGATAATTTTGTAGGACCTGGTCTTGTG-T-T-T----  4254
             || | ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |    
Sbjct  4421  AACACAAACAAACAAAGGTCTGTGATAATTTTGTAG-ACCTGGTCTTGTGATCTCTAGGC  4479

Query  4255  -T-T-T-----CTTGTATATATGAGAATGAAATGGAAATGAATTAAAGGCTC  4298
              | | |     |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct  4480  CTCTCTTTTTTCTTGTATATATGAGAATGAAATGGAAATTATTTAAAGGCTC  4531



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 214263013553


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5