BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg481566
Length=4567
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G26910.1 | Symbols: PDR4, ATPDR4 | pleiotropic drug resistan... 7236 0.0
> AT2G26910.1 | Symbols: PDR4, ATPDR4 | pleiotropic drug resistance
4 | chr2:11481623-11488186 FORWARD LENGTH=4575
Length=4575
Score = 7236 bits (3918), Expect = 0.0
Identities = 4374/4591 (95%), Gaps = 43/4591 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTGGAACTCGGCGGAGAACGCATTCTCGCGTTCGACGTCGTTTAAAGACGAAATCGAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTGGAACTCGGCGGAGAACGCATTCTCGCGTTCGACGTCGTTTAAAGACGAAATCGAA 60
Query 61 GACGAAGAAGAGCTTCGTTGGGCGGCGTTACAACGTCTTCCAACTTATTCACGAATCCGC 120
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GACGAAGAAGAGCTTCGTTGGGCAGCTTTACAACGTCTTCCAACTTATTCACGAATCCGC 120
Query 121 CGTGGTATTTTCAGAGATATGGTTGGTGAGCCTAAAGAGATCCAAATTGGTAACCTTGAA 180
|| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 121 CGCGGGATTTTCAGAGATATGGTTGGTGAGCCTAAAGAGATCCAAATTGGTAACCTAGAA 180
Query 181 GCTAGCGAACAACGTCTTCTTCTCGACCGTCTTGTGAATTCCGTCGAAAATGATCCTCAA 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 181 GCTAGCGAACAACGTCTTCTTCTCGACCGTCTTGTGAATTCCGTTGAAAATGATCCTGAA 240
Query 241 CAGTTCTTCGCTCGCGTTAGGAAGAGATTCGACGCTGTGGATTTGAAGTTTCCGAAAATC 300
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 241 CAGTTCTTCGCTCGTGTTAGGAAGAGATTCGACGCTGTGGATTTGAAATTTCCGAAGATT 300
Query 301 GAAGTTCGATTTCAGAATCTTATGGTGGAATCATTTGTTCATGTTGGAAGCAGAGCATTA 360
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GAAGTTCGATTTCAGAATCTGATGGTAGAATCATTTGTTCATGTTGGAAGCAGAGCATTA 360
Query 361 CCAACAATTCCCAATTTCATCATTAACATGGCAGAAGGTTTGTTGAGGAACATTCATGTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CCAACAATTCCCAATTTCATCATTAACATGGCAGAAGGTTTGTTGAGGAACATTCATGTG 420
Query 421 ATTGGTGGAAAAA-GAAGCAAATTAACGATTTTAGATGGTATCAGTGGAATTATTAGACC 479
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 421 ATTGGTGGAAAAAGGAA-CAAATTAACGATTTTAGATGGTATCAGTGGTGTTATTAGACC 479
Query 480 TTCAAGATTGACACTACTACTAGGTCCTCCAAGTTCAGGGAAGACAACATTACTCTTAGC 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TTCAAGATTGACACTACTACTAGGTCCTCCAAGTTCAGGGAAGACAACATTACTCTTAGC 539
Query 540 TTTAGCTGGACGCCTTGGAACTAATCTTCAGACATCTGGGAAAATAACATACAATGGTTA 599
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 540 TTTAGCTGGACGTCTTGGAACTAATCTTCAGACATCAGGGAAAATAACGTACAATGGCTA 599
Query 600 CGATCTCAAAGAGATAATCGCGCCAAGGACGTCCGCGTATGTGAGCCAACAGGATTGGCA 659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 CGATCTCAAAGAGATAATCGCGCCAAGGACGTCCGCATATGTGAGCCAACAGGATTGGCA 659
Query 660 TGTGGCGGAGATGACAGTTCGGCAGACTCTCGAGTTTGCTGGTCGTTGTCAAGGTGTTGG 719
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TGTGGCGGAGATGACAGTGAGGCAGACTCTTGAGTTTGCTGGTCGTTGTCAAGGTGTTGG 719
Query 720 ATTCAAATATGATATGCTTTTGGAGTTAGCAAGAAGGGAAAAGCTTGCAGGAATAGTACC 779
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 720 ATTCAAATATGATATGCTTTTGGAGTTAGCAAGAAGGGAAAAGCTTGCAGGAATTGTACC 779
Query 780 TGATGAAGATCTTGATATATTTATGAAGTCTTTAGCTCTCGGAGGACA-GGAGACAAGCC 838
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||
Sbjct 780 TGATGAAGATCTTGATATATTTATGAAGTCTTTAGCTCTCGGGGGA-ATGGAGACAAGCC 838
Query 839 TCGTCGTGGAGTATGTTATGAAGATTCTAGGGTTGGACTCATGCGCGGACACATTGGTCG 898
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |
Sbjct 839 TCGTCGTGGAGTATGTTATGAAGATTCTAGGATTGGACACATGTGCGGACACATTGGTTG 898
Query 899 GAGATGAGATGATTAAAGGAATTTCAGGGGGACAGAAGAAACGACTCACAACAGGGGAAC 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 899 GAGATGAGATGATTAAAGGAATTTCAGGGGGACAGAAGAAACGGCTAACAACAGGGGAAC 958
Query 959 TATTAGTTGGTCCAGCAAGGGTCCTTTTCATGGATGAAATATCGAATGGTTTAGATAGTT 1018
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 959 TATTAGTTGGTCCAGCAAGAGTCCTTTTCATGGATGAAATATCAAATGGTTTAGATAGTT 1018
Query 1019 CGACGACTCATCAGATTATCATGTATATGAGGCATTCTACTCATGCACTCGAAGGAACCA 1078
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1019 CGACGACTCATCAGATTATAATGTATATGAGGCATTCTACTCATGCGCTCGAAGGAACCA 1078
Query 1079 CCGTCATTTCTTTACTCCAACCGTCTCCCGAGACTTACGAGTTGTTTGATGATGTTATCC 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 CCGTCATTTCTTTACTCCAACCGTCTCCCGAGACTTACGAGTTGTTTGATGATGTTATCC 1138
Query 1139 TAATGTCTGAAGGACAGATTATATACCAGGGACCTCGCGACGAGGTTCTTGATTTCTTTT 1198
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 TTATGTCTGAGGGACAGATTATATACCAGGGACCTCGTGACGAGGTTCTTGATTTCTTTT 1198
Query 1199 CATCATTGGGATTTAGTTGCCCTGAGAGAAAAAATGTTGCAGATTTCTTGCAAGAGGTCA 1258
| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 CTTCGTTGGGATTTACTTGCCCTGATAGAAAAAATGTTGCAGATTTCTTGCAAGAGGTCA 1258
Query 1259 CTTCAAAGAAGGATCAGCAGCAGTACTGGTCAGTCCCTTTCCGGCCTTATCGATATGTAC 1318
| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1259 CCTCAAAGAAAGATCAGCAGCAGTACTGGTCAGTCCCTTTCCGGCCTTATCGCTATGTAC 1318
Query 1319 CGCCTGGAAAGTTTGCTGAAGCTTTTCGTTCATATCCAACTGGTAAGAAGTTGGCAAAGA 1378
| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1319 CTCCTGGAAAATTTGCTGAAGCTTTCCGTTCATATCCAACTGGTAAGAAGTTGGCAAAAA 1378
Query 1379 AACTTGAGGTTCCATTTGATAAACGGTTCAATCATTCAGCTGCGTTATCGACATCTCAAT 1438
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1379 AACTTGAGGTTCCATTTGATAAACGGTTCAATCATTCAGCCGCGTTATCGACATCCCAAT 1438
Query 1439 ACGGTGTTAAGAAGAGTGAACTTCTCAAGATCAACTTTTCCTGGCAGAAGCAACTGATGA 1498
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 ATGGTGTTAAGAAGAGTGAACTTCTCAAGATCAACTTTGCCTGGCAGAAGCAACTGATGA 1498
Query 1499 AGCAAAATGCATTTATTTATGTGTTCAAGTTCGTTCAGCTTCTTTTAGTTGCCTTGATCA 1558
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1499 AGCAAAATGCATTTATTTATGTGTTCAAGTTTGTTCAGCTTCTTTTAGTTGCTTTGATCA 1558
Query 1559 CGATGACAGTCTTTTGCCGGACAACAATGCATCACAACACTATTGATGATGGCAACATAT 1618
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 CGATGACTGTCTTTTGCCGAACAACAATGCATCACAACACTATTGATGATGGCAACATAT 1618
Query 1619 ATCTTGGGTCACTTTACTTTTCCATGGTTATCATTCTCTTTAACGGATTCACCGAGGTTC 1678
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619 ATCTTGGGTCACTTTACTTTTCCATGGTCATCATTCTCTTTAACGGATTCACCGAGGTTC 1678
Query 1679 CAATGCTAGTAGCCAAGCTTCCCGTCCTTTATAAGCATAGAGACTTGCATTTTTACCCAA 1738
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 CAATGCTAGTAGCCAAACTTCCCGTTCTTTATAAGCACAGAGACTTGCATTTTTACCCAA 1738
Query 1739 GCTGGGCTTATACATTACCTTCCTGGCTTTTGAGTATCCCTACTTCAATAATTGAATCTG 1798
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1739 GCTGGGCTTATACATTACCTTCCTGGCTTTTGAGTATCCCTACTTCAATAATAGAATCTG 1798
Query 1799 CGACATGGGTGGCAGTAACATATTATACAATTGGATATGATCCTTTGTTCTCAAGGTTTC 1858
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 CCACATGGGTGGCAGTAACATATTATACAATTGGATATGATCCTTTGTTCTCAAGGTTTC 1858
Query 1859 TTCAGCAGTTCCTGCTGTATTTCTCTCTGCATCAGATGTCGTTGGGTCTTTTCCGTGTGA 1918
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 1859 TTCAGCAGTTCTTGCTGTATTTCTCTCTGCATCAGATGTCGTTGGGTCTTTTCCGCGTAA 1918
Query 1919 TGGGTTCTTTAGGCCGGCATATGATAGTTGCCAATACGTTTGGGTCCTTTGCAATGCTGG 1978
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1919 TGGGTTCTTTAGGCCGACATATGATAGTTGCCAATACGTTTGGGTCCTTTGCAATGCTTG 1978
Query 1979 TGGTCATGATTCTTGGAGGCTTTATAATTTCCAGAGAAAGCATACCAAGCTGGTGGATCT 2038
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 1979 TGGTCATGACTCTTGGAGGATTTATAATTTCCAGAGATAGCATACCAAGCTGGTGGATAT 2038
Query 2039 GGGGTTACTGGATTTCTCCTTTGATGTATGCTCAAAATGCAGCTTCTGTGAATGAGTTCC 2098
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 GGGGTTACTGGATTTCTCCATTGATGTATGCTCAAAACGCAGCTTCTGTGAATGAGTTCC 2098
Query 2099 TTGGCCATAATTGGCAAAAGAGTGCTGGGAATCACACAAGCGACTCTATTGGTTTGGCAT 2158
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2099 TTGGTCATAATTGGCAAAAGACTGCTGGGAATCACACTAGCGACTCTCTTGGTTTGGCAT 2158
Query 2159 TGCTGAAAGAAAGAAGTTTGTTCTCTGGGAACTACTGGTATTGGATCGGTGTCGCTGCCT 2218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 TGCTGAAAGAAAGAAGTTTGTTCTCTGGGAACTACTGGTATTGGATCGGTGTCGCTGCCT 2218
Query 2219 TGCTTGGATACACAGTTCTTTTCAATTTGCTCTTTACGCTGTTTTTAGCTCACCTCAACC 2278
|||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 TGCTTGGATACACAGTTCTTTTTAATATACTATTTACGCTGTTTTTAGCTCACCTCAACC 2278
Query 2279 CTTGGGGTAAGTTTCAAGCTGTTGTATCCAGAGAAGAGTTGGACGAGAGAGAAAAGAAAA 2338
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2279 CATGGGGTAAGTTTCAAGCCGTTGTATCCAGAGAAGAGTTAGACGAGAGAGAAAAGAAAA 2338
Query 2339 GAAAAGGCGATGAGTTTGTTGTGGAACTAAGAGAGTACTTGCAGCATTCAGGCTCAATAC 2398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2339 GAAAAGGCGATGAGTTTGTTGTGGAACTAAGAGAGTACTTGCAGCATTCAGGCTCAATAC 2398
Query 2399 ATGGAAAATATTTCAAGAATCGAGGCATGGTTCTTCCGTTTCAACCACTATCTCTGTCTT 2458
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399 ATGGAAAATATTTCAAGAATCGAGGCATGGTTCTCCCATTTCAACCACTATCTCTGTCTT 2458
Query 2459 TCTGCAATATCAACTACTATGTGGATGTTCCATTGGGACTAAAAGAACAAGGGATACTAG 2518
|| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459 TCAGCAATATCAACTACTATGTGGATGTTCCTTTGGGACTAAAAGAACAAGGGATACTAG 2518
Query 2519 AAGATAGGTTGCAGCTACTTGTGAATATTACTGGAGCTTTTAGACCAGGTGTGCTTACAG 2578
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2519 AAGATAGGTTGCAGCTACTTGTGAATATTACTGGAGCTTTTAGACCTGGTGTGCTTACAG 2578
Query 2579 CATTAGTAGGAGTAAGTGGTGCCGGTAAAACAACGCTCATGGATGTTTTAGCTGGAAGAA 2638
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 CATTAGTGGGAGTAAGTGGTGCCGGTAAAACAACGCTCATGGATGTTTTAGCTGGAAGAA 2638
Query 2639 AAACCGGAGGAACTATAGAAGGCGATGTGTACATATCTGGTTTTCCCAAAAGGCAGGAAA 2698
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 2639 AAACCGGAGGAACTATAGAAGGCGATGTGTACATATCTGGTTTTCCTAAAAGACAGGAAA 2698
Query 2699 CGTTTGCTAGAATTTCAGGTTATTGTGAGCAGAACGATGTTCATTCTCCATGCCTAACTG 2758
||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2699 CGTTTGCAAGAATTTCTGGTTATTGTGAGCAGAATGATGTTCACTCTCCATGCCTAACTG 2758
Query 2759 TTGTTGAATCTCTACTTTTCTCGGCGTGCCTTCGTTTACCAGCAGACATTGACTCAGAGA 2818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2759 TTGTTGAATCTCTACTTTTCTCGGCGTGCCTTCGTTTACCAGCAGACATTGACTCAGAGA 2818
Query 2819 CACAAAGGGCATTTGTCCATGAGGTGATGGAGCTAGTGGAGCTGACCTCATTGAGCGGGG 2878
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 2819 CACAAAGGGCGTTTGTTCATGAGGTGATGGAGCTAGTGGAGCTGACCTCTTTAAGCGGGG 2878
Query 2879 CATTGGTCGGTCTTCCTGGAGTTGATGGCTTATCAACTGAACAGAGGAAAAGATTAACAA 2938
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 2879 CATTAGTCGGTCTTCCTGGAGTTGATGGCTTATCAACTGAACAGAGGAAACGGTTAACAA 2938
Query 2939 TTGCCGTTGAGCTAGTTGCAAACCCTTCTATAGTATTCATGGATGAGCCAACTTCAGGAT 2998
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2939 TTGCTGTCGAGCTAGTTGCAAACCCTTCTATAGTATTCATGGATGAGCCAACTTCAGGAT 2998
Query 2999 TGGATGCACGTGCTGCCGCCATTGTGATGAGGACTGTAAGAAATATTGTTAACACCGGGC 3058
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2999 TGGATGCACGGGCGGCCGCCATTGTGATGAGGACTGTAAGAAATATTGTTAACACAGGGC 3058
Query 3059 GAACCATCGTCTGCACGATTCATCAGCCTAGCATTGATATTTTTGAGTCATTTGACGAGC 3118
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3059 GAACCATTGTCTGCACGATTCATCAGCCTAGCATTGATATTTTTGAGTCATTTGACGAGC 3118
Query 3119 TTTTGTTCATGAAACGTGGTGGAGAACTCATATATGCCGGTCCACTCGGTCAGAAATCAT 3178
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |
Sbjct 3119 TTTTGTTCATGAAACGTGGTGGAGAACTCATATATGCCGGTCCACTTGGCCAGAAGTCTT 3178
Query 3179 GTGAGCTTATCAAGTATTTCGAGTCAATTGAAGGGGTGCAAAAGATCAGACCTGGCCATA 3238
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3179 GTGAGCTTATCAAGTATTTCGAGTCAATTGAAGGGGTGCAAAAGATCAAACCTGGCCATA 3238
Query 3239 ATCCGGCAGCATGGATGCTTGACGTCACTTCTTCGACCGAGGAACACCGGCTTGGTGTTG 3298
|||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3239 ATCCGGCAGCATGGATGCTTGATGTCACTGCTTCTACCGAGGAACACCGGCTTGGAGTTG 3298
Query 3299 ATTTTGCTGAAATTTACAGGAACTCAAATCTGTGTCAACGCAACAAGGAGCTGATCGAAC 3358
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3299 ATTTTGCTGAAATTTACAGGAACTCAAATCTTTGTCAACGCAACAAGGAGCTGATCGAAG 3358
Query 3359 TCCTCAGTAAGCCAAGTAGTATTGCAAAAGAAATCGAGTTTCCGACCAGATACTCTCAGT 3418
| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3359 TACTCAGCAAGCCAAGTAACATTGCAAAAGAAATCGAGTTTCCAACCAGATACTCTCAGT 3418
Query 3419 CACTGTATAGTCAGTTTGTTGCTTGCCTGTGGAAACAAAACCTATCATATTGGCGAAACC 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3419 CACTGTATAGTCAGTTTGTTGCTTGCCTGTGGAAACAAAACCTATCATATTGGCGAAACC 3478
Query 3479 CGCAATACACTGCAGTTCGCTTCTTCTACACCGTGGTTATCTCGCTGATGCTTGGAACAA 3538
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 CACAATACACTGCAGTTCGATTCTTCTACACCGTGGTTATCTCGCTGATGCTTGGAACAA 3538
Query 3539 TATGTTGGAAATTTGGCTCTAAAAGGGACACCCAACAACAGTTATTTAATGCAATGGGAT 3598
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3539 TATGTTGGAAATTTGGCTCCAAAAGGGACACTCAACAACAGTTATTTAATGCAATGGGAT 3598
Query 3599 CGATGTATGCTGCGGTTCTCTTCATTGGAATCACCAATGCAACCGCTGCGCAGCCCGTTG 3658
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3599 CGATGTACGCTGCGGTTCTCTTCATTGGAATCACCAATGCAACCGCTGCACAGCCCGTTG 3658
Query 3659 TTTCCATAGAAAGATTTGTTTCATATCGCGAAAGAGCAGCGGGAATGTACTCAGCACTTC 3718
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3659 TTTCCATAGAAAGATTTGTTTCATACCGCGAGAGAGCAGCGGGAATGTACTCGGCACTTC 3718
Query 3719 CTTTTGCATTTGCACAGGTGTTTATAGAGTTTCCATACGTGCTAGCACAATCCACAATAT 3778
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3719 CCTTTGCATTTGCACAGGTGTTTATAGAATTTCCATACGTGTTAGCACAATCCACAATAT 3778
Query 3779 ACAGCAGCATATTCTATGCGATGGCCGCGTTCGAATGGTCCGCGGTGAAGTTCTTGTGGT 3838
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3779 ACAGCACCATATTCTATGCAATGGCCGCGTTCGAATGGTCCGCGGTGAAGTTCTTGTGGT 3838
Query 3839 ACCTATTCTTCATGTACTTTTCGATAATGTACTTCACCTTCTACGGAATGATGACAACAG 3898
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 3839 ACTTATTCTTCATGTACTTTTCGATAATGTACTTCACCTTCTACGGGATGATGACGACAG 3898
Query 3899 CAATTACCCCAAACCACAACGTCGCCTCAATCATAGCAGCCCCTTTCTACATGCTCTGGA 3958
|||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3899 CAATCACCCCAAACCACAATGTCGCCTCGATTATAGCAGCACCTTTCTACATGCTCTGGA 3958
Query 3959 ACCTCTTT-AGTGGCTTCATGATCCCATACAAGAGGATTCCGCTGTGGTGGAGATGGTAC 4017
| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3959 ATCT-TTTCAGTGGCTTCATGATCCCATACAAGAGGATTCCTCTGTGGTGGAGATGGTAC 4017
Query 4018 TACTGGGCAAACCCGGTGGCATGGACATTGTACGGTCTATTGGTGTCTCAGTACGGTGAT 4077
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4018 TACTGGGCAAACCCGGTGGCTTGGACACTGTACGGTCTATTGGTGTCTCAGTACGGTGAT 4077
Query 4078 GATGAGAGATCAGTGAAGCTATCGGACGGTATCCATCAGGTGATGGTGAAACAACTACTT 4137
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4078 GATGAAAGATCGGTGAAGCTATCGGACGGTATCCATCAGGTGATGGTGAAACAACTGCTT 4137
Query 4138 GAGGATGTGATGGGATACAAACATGACTTCTTGGGTGTCTCAGCTATTATGGTCGTCGCC 4197
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4138 GAGGATGTGATGGGATATAAACATGACTTCTTAGGTGTCTCAGCTATTATGGTTGTCGCC 4197
Query 4198 TTTTGCGTTTTCTTCTCCCTTGTCTTTGCTTTCGCCATTAAAGCCTTCAATTTCCAGAGA 4257
|||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4198 TTTTGCGTCTTCTTCTCCCTTGTGTTTGCATTCGCCATTAAAGCTTTCAATTTCCAGAGA 4257
Query 4258 AGATGAT---T-GATTA----T--C-A--T---AT-TT-ATATATACACGTATACAAACA 4299
||||||| | ||||| | | | | || || |||||||||||||||||| ||
Sbjct 4258 AGATGATGGATTGATTACCACTTACCAACTCTCATATTCATATATACACGTATACAA-CA 4316
Query 4300 C-CATCTATTGTTTTATTTGTATATTGGGGCTTTTATAACCAAAAAGGCAGGGGACTGCC 4358
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct 4317 ATCATCTATTGTTT-ATTTGTATATTGGGGCTTTTATACCCAAGAAGGCAGGGGACTGCC 4375
Query 4359 TATTCTTCCTCTGCCATTACATGTATGGGATCAATAAAAGCTTGTGTTGTGTTTTATGTT 4418
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4376 TATTCTTCCTCTGTCATTACATGTATGGGATCAATAAAAGCTTGTGTTGTGTTTTATGTT 4435
Query 4419 CCTTAATCATTTTCTC--ATAAATGTGTATGAGTCAATGTCATCTATAACAATCACTGAT 4476
|||| ||||||| || | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4436 CCTTG-TCATTTTTTCTGAGAAATGTGTATT-G-----GTCATCTATAACAATCACTGAT 4488
Query 4477 CATGAACCGGTACTGTAATAGAGAGATGTATCTCTAGTTTACTGTTTGAATTACACATCT 4536
|||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||
Sbjct 4489 CATGAACCAGTACTGTAATAGAGATAT--ATCTCTAGTTTACTGGTTG--T-ACACATCT 4543
Query 4537 TTGCTAGTAACTATATTTGGCCACGTGCATA 4567
||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 4544 TTGCTAGTA--TATATTTGGCCAAGTGCATA 4572
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 227757921220
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5