BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg482837
Length=2837
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G38280.1 | Symbols: FAC1, ATAMPD | AMP deaminase, putative /... 4451 0.0
> AT2G38280.1 | Symbols: FAC1, ATAMPD | AMP deaminase, putative
/ myoadenylate deaminase, putative | chr2:16033448-16038876
REVERSE LENGTH=2835
Length=2835
Score = 4451 bits (2410), Expect = 0.0
Identities = 2719/2860 (95%), Gaps = 54/2860 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCACTAAAACGAAATCGTGGTCTTA--CTCTC-TC----TTCTGACCTGAGCTCACACA 53
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 GCCACTAAAACGAAATCGTGGTCTTACTCTCTCTTCTGAGTTCTGACCTGAGCACACACA 60
Query 54 C--AGATTTTGATTGTGTCTGTCACTCATGGAACCCAATATTTACCAACTTGCCCTCGCG 111
| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CAGAGATTTTGA-T-TG--TGTCACTCATGGAACCCAATATTTACCAACTTGCCCTCGCG 116
Query 112 GCTCTCTTTGGAGCTTCCTTCGTTGCTGTTTCTGGGTTTTTCATGCATTTCAAGGCACTG 171
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 117 GCTCTATTCGGAGCTTCCTTCGTTGCTGTTTCTGGGTTTTTCATGCATTTCAAGGCACTG 176
Query 172 AATCTAGTCCTTGAGCGTGGTAAGGAGCGTAAAGAGAACCCTGAAGGAGACGAGCCTCAA 231
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 177 AATCTAGTCCTTGAGCGTGGTAAGGAGCGTAAAGAGAACCCTGATGGAGACGAGCCTCAA 236
Query 232 AATCCGACCTTGGTGAGACGGCGGAGCCAAGTTAGAAGGAAGGGTATTGACCAATACGGT 291
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||
Sbjct 237 AATCCGACCTTGGTGAGGCGGCGGAGCCAAGTTAGAAGGAAGGTTAATGACCAATATGGT 296
Query 292 CGCAGTCCTGCTTCTCTTCCAGATGCCACTCCTTTTACCGA---T------GGCGGCGGT 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 297 CGCAGTCCTGCTTCTCTTCCAGATGCCACTCCTTTTACCGATGGTGGCGGCGGCGGCGGC 356
Query 343 GGTGATACAGGTCGGAGCAACGGTCACGTTTATGTCGATGAAATCCCTCCTGGTCTCCCG 402
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 357 GGTGATACAGGACGGAGCAACGGTCACGTTTATGTCGATGAAATTCCTCCTGGTCTCCCT 416
Query 403 AGGCTTCATACGCCATCTGAGGGGAGAGCTTCAGTACATGGAGCTAGTAGTATCAGGAAA 462
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 AGGCTTCATACGCCATCTGAAGGGAGAGCTTCTGTACATGGAGCTAGTAGTATCAGGAAA 476
Query 463 ACTGGAAGCTTTGTTAGACCAATCTCTCCGAAATCCCCTGTTGCTAGTGCTAGTGCTTTT 522
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 ACTGGAAGCTTTGTTAGACCAATATCTCCGAAATCCCCTGTTGCTAGTGCTAGTGCTTTT 536
Query 523 GAGAGTGTGGAAGAATCAGATGATGATGATAATTTGACTAATAGTGAGGGTTTAGATGCT 582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 537 GAGAGTGTGGAAGAATCAGATGATGATGATAATTTGACTAATAGTGAGGGTTTAGATGCT 596
Query 583 TCCTACTTGCAAGCTAATGGTGACAATGAATTGGTGAAGCCTGTAGATGCCAATGAAGAG 642
|||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||
Sbjct 597 TCCTACTTGCAAGCTAATGGTGACAATG-A-----GATGCCTGCAGATGCTAATGAAGAA 650
Query 643 CAAATATCTATGGTTGCTTCAAGTATGATTCGATCACACAGTGTGTCTGGTGACTTACAT 702
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 651 CAAATATCTATGGCTGCTTCAAGTATGATTCGATCCCATAGTGTGTCTGGTGACTTACAT 710
Query 703 GGAGTTCAGCCTGATCCTATTGCCGCTGATATTCTTCGTAAGGAGCCAGAGCAAGAGACC 762
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 711 GGAGTTCAGCCTGATCCTATTGCTGCTGACATTCTTCGTAAGGAGCCAGAGCAAGAGACC 770
Query 763 TTTGTCCGTCTTAATGTTCCTCTTGAGGTGCCAACGTCCGATGAAGTTGAAGCCTATAAA 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 771 TTTGTCCGTCTTAATGTTCCTCTTGAGGTGCCAACGTCCGATGAAGTTGAAGCCTATAAA 830
Query 823 TGTCTGCAAGAATGTCTTGAACTGCGGAAGAGGTATGTCTTCCAAGAAACAGTTGCGCCA 882
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 831 TGTCTGCAAGAATGTCTTGAACTGCGGAAGAGGTATGTCTTCCAAGAAACAGTTGCACCA 890
Query 883 TGGGAAAAAGAAGTCATATCTGATCCTAGTACTCCAAAGCCTAATACAGAGCCATTTGCA 942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 TGGGAAAAAGAAGTCATATCTGATCCTAGTACTCCAAAGCCTAATACAGAGCCATTTGCA 950
Query 943 CACTATCCTCAGGGAAAAACTGATCATTATTTTGAGATGCAAGATGGGGTAGTCCACGTG 1002
|||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 951 CACTATCCTCAGGGAAAATCTGATCATTGTTTTGAGATGCAAGATGGGGTTGTCCACGTG 1010
Query 1003 TTTGCAAATAAAGATGCAAAAGAAGAGCTCTTCCCGGTAGCTGATGCCACAGCGTTTTTC 1062
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 TTTGCAAATAAAGATGCAAAAGAAGATCTCTTCCCGGTAGCTGATGCCACAGCGTTTTTC 1070
Query 1063 ACTGACTTGCATCATGTACTCAAAGTCATAGCTGCAGGAAACATCCGGACTTTGTGCCAC 1122
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 ACTGACTTGCATCACGTACTCAAAGTCATAGCTGCAGGAAACATCCGGACTTTGTGCCAC 1130
Query 1123 CGTCGACTAGTGCTCCTAGAACAGAAATTCAATCTCCATTTGATGCTTAATGCGGATAAA 1182
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131 CGTCGACTAGTGCTCCTAGAACAGAAATTTAATCTCCATTTGATGCTTAATGCGGATAAA 1190
Query 1183 GAATTTCTTGCTCAAAAAAGTGCACCACATCGTGATTTTTATAACGTTAGGAAAGTCGAC 1242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 GAATTTCTTGCTCAAAAAAGTGCACCACATCGTGATTTTTATAACGTTAGGAAAGTCGAC 1250
Query 1243 ACTCATGTTCATCACTCAGCTTGCATGAACCAGAAACACCTTTTAAGGTTTATCAAGTCA 1302
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1251 ACTCATGTGCATCATTCAGCTTGCATGAACCAGAAACACCTTTTAAGGTTTATTAAGTCA 1310
Query 1303 AAGCTCCGGAAAGAACCCGATGAGGTTGTAATATTCCGAGATGGGACATATTTGACCTTG 1362
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1311 AAGCTCCGGAAAGAACCCGATGAGGTTGTAATATTCCGAGATGGAACATATTTGACCTTG 1370
Query 1363 AAAGAAGTTTTTGAGAGCCTGGATCTGACTGGATATGACCTGAACGTCGACCTTTTGGAT 1422
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 AGAGAAGTTTTTGAGAGCCTGGATCTGACTGGATATGACCTGAACGTCGACCTTTTGGAT 1430
Query 1423 GTTCATGCAGACAAAAGTACCTTTCATCGTTTTGATAAGTTTAACCTTAAGTATAATCCT 1482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||
Sbjct 1431 GTTCATGCAGACAAAAGTACCTTTCATCGTTTTGATAAGTTCAACCTAAAGTATAACCCT 1490
Query 1483 TGTGGTCAAAGTAGGCTTAGGGAGATTTTCCTTAAACAGGATAATCTCATCCAAGGTCGA 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1491 TGTGGTCAAAGTAGGCTTAGGGAGATTTTCCTTAAACAGGATAATCTCATCCAAGGTCGA 1550
Query 1543 TTTCTTGGTGAGATAACAAAGCAAGTCTTCTCTGACCTTGAAGCTAGTAAATATCAGATG 1602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 TTTCTTGGTGAGATAACAAAGCAAGTCTTCTCTGACCTTGAAGCTAGTAAATATCAGATG 1610
Query 1603 GCCGAATACAGAATATCTATATATGGCAGAAAAATGAGCGAGTGGGACCAACTGGCTAGT 1662
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1611 GCTGAATACAGAATATCTATATATGGCAGAAAAATGAGCGAGTGGGACCAACTCGCTAGT 1670
Query 1663 TGGATTGTGAACAATGATCTATACAGCGAGAATGTTGTCTGGTTAATTCAGCTCCCACGC 1722
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 TGGATTGTGAACAATGATCTATACAGTGAGAATGTTGTCTGGTTAATTCAGCTCCCACGC 1730
Query 1723 TTGTACAACATTTACAAGGACATGGGTATTGTGACATCTTTCCAGAATATCCTTGACAAT 1782
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1731 TTGTACAACATTTACAAGGACATGGGTATTGTGACATCGTTCCAGAATATCCTGGACAAT 1790
Query 1783 ATTTTCATTCCTCTGTTTGAAGCCACGATAGATCCCGATTCCCATCCCCAGCTCCATGtt 1842
|| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1791 ATATTCATTCCTCTGTTTGAAGCCACGGTAGATCCTGATTCCCATCCTCAGCTCCATGTT 1850
Query 1843 tttttGAAGCAGGTTGTTGGATTTGATTTGGTTGATGATGAAAGCAAACCTGAAAGACGG 1902
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TTTTTGAAGCAGGTTGTTGGATTTGATTTGGTTGATGATGAAAGCAAACCTGAAAGACGT 1910
Query 1903 CCCACAAAACATATGCCCACTCCAGCTCAATGGACTAACGCGTTCAATCCTGCATTTTCA 1962
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1911 CCCACAAAACACATGCCCACTCCAGCTCAATGGACTAACGCATTCAATCCTGCATTTTCG 1970
Query 1963 TACTATGTCTACTATTGTTATGCTAACCTCTATGTGCTAAATAAGCTTCGGGAGTCAAAG 2022
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1971 TATTATGTCTACTATTGTTATGCTAACCTCTATGTGTTAAATAAGCTTCGAGAGTCAAAG 2030
Query 2023 GGCATGACTACCATCACGCTACGGCCACATTCTGGAGAGGCTGGTGACATTGACCACTTG 2082
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2031 GGCATGACTACTATCACGCTACGACCACATTCTGGAGAGGCTGGTGACATTGACCACTTG 2090
Query 2083 GCTGCTACGTTTCTCACATGCCATAGCATCGCACATGGAATCAATCTGCGGAAGTCTCCT 2142
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2091 GCTGCTACGTTTCTAACATGCCATAGCATCGCACATGGAATCAATCTGCGAAAGTCTCCT 2150
Query 2143 GTGCTTCAGTATCTCTACTACCTCGCCCAGATTGGTCTGGCCATGTCTCCACTGAGCAAC 2202
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2151 GTGCTTCAGTATCTGTACTACCTCGCCCAGATTGGTCTGGCCATGTCACCACTGAGCAAC 2210
Query 2203 AACTCTTTGTTTCTAGATTACCACCGAAACCCGTTTCCTGTGTTTTTCTTGAGAGGTCTC 2262
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2211 AACTCTTTGTTTCTAGATTACCACCGGAACCCGTTTCCTGTGTTTTTCTTAAGAGGTCTC 2270
Query 2263 AATGTTTCCCTGTCTACGGATGATCCCCTTCAGATTCACTTAACTAAAGAACCTCTCGTG 2322
|||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2271 AATGTTTCTCTGTCTACTGATGACCCCCTTCAGATTCACTTAACTAAAGAACCTCTCGTG 2330
Query 2323 GAAGAGTATAGCATAGCTGCCTCAGTTTGGAAGCTGAGTGCGTGTGACCTGTGCGAGATA 2382
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2331 GAAGAGTATAGCATAGCTGCATCAGTTTGGAAGCTGAGTGCGTGTGACCTGTGCGAGATA 2390
Query 2383 GCTCGTAACTCAGTGTACCAGTCAGGTTTCTCACATGCCCTGAAGTCGCACTGGATTGGA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2391 GCTCGTAACTCAGTGTACCAGTCAGGTTTCTCACACGCCCTGAAGTCGCACTGGATTGGA 2450
Query 2443 AAAGACTACTACAAAAGAGGACCTGATGGAAACGATATTCACAAAACAAATGTGCCTCAC 2502
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 2451 AAAGATTACTACAAAAGAGGACCTGATGGAAACGACATTCACAAAACAAACGTGCCACAC 2510
Query 2503 ATAAGGGTGGAGTTCCGGGACACGATTTGGAAAGAGGAGATGCAACAGGTTTATCTGGGC 2562
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2511 ATAAGGGTGGAGTTCCGTGACACGATCTGGAAAGAGGAGATGCAACAGGTTTATCTGGGC 2570
Query 2563 AAGGCTGTTATCTCAGATGAAGTTGTTCCGTAAAAACCGCAATCAGAAATGGCAACGTTT 2622
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 2571 AAGGCTGTTATCTCTGATGAAGTTGTTCCATAAAAACCACAATCAGAAATGGCAA-G--- 2626
Query 2623 AAGAATCCAACATATTTCAGGAGAACAAAGAGAGCAAGCAGCTAGAGAAGTATACGAA-G 2681
| | | | | |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |
Sbjct 2627 A-----C-A---T-TG-CAGGGGAACAAAGAGAGCATTT---T-GAGAAGTATACGAAAG 2671
Query 2682 CAGGAACCTAGTAGATAGGGTAATAATATGAGTGGCTCTGTGCCCTGAGAAAGCGATTTG 2741
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2672 CAGGAACCTAGTAGATAGGGTAATAATATGAGTGGCTCTGTGCCCTGAGAAAGCGATTAG 2731
Query 2742 GCTGT-C-AA--TCATATTGTCTTATAAAGCTTTTTAGATAAAGAGAGATACAAAGAGAC 2797
||||| | || || |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 2732 GCTGTGCCAAAATCTTATTGTTTTATAAAGCTTTTTAGATAATGAGA--TACAAAGAGAC 2789
Query 2798 TAGTTGAGAACCGGTTTTAATATAATGGATTTCAGTTTTT 2837
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2790 CAGTTGAGAACCGGTTTTAATATAATGGATTTCAGTTTTT 2829
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 140969109830
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5