BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg483012

Length=2802
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT2G39800.1 | Symbols: P5CS1, ATP5CS | delta1-pyrroline-5-carbo...  4510    0.0  
  AT3G55610.1 | Symbols: P5CS2 | delta 1-pyrroline-5-carboxylate ...  2322    0.0  


> AT2G39800.1 | Symbols: P5CS1, ATP5CS | delta1-pyrroline-5-carboxylate 
synthase 1 | chr2:16598164-16603319 REVERSE LENGTH=2886
Length=2886

 Score = 4510 bits (2442),  Expect = 0.0
 Identities = 2701/2823 (96%), Gaps = 29/2823 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     CTTCCACGGCGCTTCCTCAGCCGCCGATTTTATTTATTTCCCAAAATACCCATCACCCCT  60
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
Sbjct  1     CTTCCACGGCGTTTCCTCAGCCGCCGATTTTATTTATTTCCCAAAATACCCATCACCTAT  60

Query  61    AGCGCCACAATCCCCTACAACACACCCTACTCTCCTTACCATACACCACCCAACGACCAC  120
             ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  61    AGCGCCACAATCCTCTACATCACACCCTAATCTCATTACCATACACCACCCAACGAACAC  120

Query  121   GCGCCACTTCATCTGTCAGTGTCTAAAATACCAAATCTACCCTTA-TTCCAACACGTGGC  179
             |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||
Sbjct  121   GCGCCACTTCATTTGTTAGTATCTAAAATACCAAACCTACCCTTAGTTCC-ACACGTGGC  179

Query  180   GCTTCATGGTTTGGTAACAGAGCCTGAGTCTCTGGTGTTGTTGGTGTTTATAAACCCCTT  239
             | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct  180   GTTTCCTGGTTTGATAACAGAGCCTGAGTCTCTGGTGTCGCTGGTGTTTATAAACCCCTT  239

Query  240   CATATCTTCCTTGGTGATCTCCACCTTTCCCTCACCTGATATTTA-TTT-TTA-C-----  291
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |     
Sbjct  240   CATATCTTCCTTGGTGATCTCCACCTTTCCCTCACCTGATATTTATTTTCTTACCTTAAA  299

Query  292   -ACG-C--TGCTTCACTGATTCCGACTCAGTTAACTCGTTCCTCTCTCTGTGTGGTGTGG  347
              ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||
Sbjct  300   TACGACGGTGCTTCACTGAGTCCGACTCAGTTAACTCGTTCCTCTCTC--TGT-GTGTGG  356

Query  348   TTTTGGT--A-GACGACGACGATAATGGAGGAGTTAGATCGTTCACGTGCTTTTGCTAGA  404
             |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  357   TTTTGGTAGACGACGACGACGATAATGGAGGAGCTAGATCGTTCACGTGCTTTTGCCAGA  416

Query  405   GACGTTAAACGTATCGTCGTTAAGGTTGGGACCGCAGTTGTAACTGGAAAAGGTGGAAGA  464
             ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  417   GACGTCAAACGTATCGTCGTTAAGGTTGGGACAGCAGTTGTTACTGGAAAAGGTGGAAGA  476

Query  465   TTGGCTCTTGGTCGATTAGGAGCACTGTGTGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGA  524
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  477   TTGGCTCTTGGTCGTTTAGGAGCACTGTGTGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGA  536

Query  525   TTTGAGGTGATATTGGTGTCATCTGGTGCGGTTGGTCTTGGCCGGCAAAGGCTTCGATAT  584
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct  537   TTTGAGGTGATATTGGTGTCATCTGGTGCGGTTGGTCTTGGCAGGCAAAGGCTTCGTTAT  596

Query  585   CGACAATTAGTCAATAGCAGCTTTGCGGATCTTCAGAAGCCTCAGACTGAACTTGATGGG  644
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597   CGACAATTAGTCAATAGCAGCTTTGCGGATCTTCAGAAGCCTCAGACTGAACTTGATGGG  656

Query  645   AAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAAGCAGTCTTATGGCTTATTATGAGACTATGTTCGAC  704
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct  657   AAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAAGCAGTCTTATGGCTTACTATGAGACTATGTTTGAC  716

Query  705   CAGCTGGATGTGACCGCGGCTCAACTTCTGGTGAATGACAGTAGCTTTAGAGACAAGGAT  764
             ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  717   CAGCTTGATGTGACGGCAGCTCAACTTCTGGTGAATGACAGTAGTTTTAGAGACAAGGAT  776

Query  765   TTCAGGAAGCAACTTAATGAAACTGTCAAGTCCATGCTTGATTTGAGGGTTATTCCAATT  824
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777   TTCAGGAAGCAACTTAATGAAACTGTCAAGTCTATGCTTGATTTGAGGGTTATTCCAATT  836

Query  825   TTCAATGAGAATGATGCTATTAGCACCCGAAGAGCCCCTTATCAGGATTCTTCTGGTATT  884
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  837   TTCAATGAGAATGATGCTATTAGCACCCGAAGAGCCCCATATCAGGATTCTTCTGGTATT  896

Query  885   TTCTGGGATAACGATAGCTTAGCTGCTCTACTGGCGCTCGAACTGAAAGCTGATCTTCTG  944
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct  897   TTCTGGGATAACGATAGCTTAGCTGCTCTACTGGCGTTGGAACTGAAAGCTGATCTTCTG  956

Query  945   ATTCTCCTGAGTGATGTTGAAGGTCTTTACACAGGCCCTCCAAGTGATCCTAACTCAAAG  1004
             ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957   ATTCTTCTGAGCGATGTTGAAGGTCTTTACACAGGCCCTCCAAGTGATCCTAACTCAAAG  1016

Query  1005  TTGATCCACACTTTTGTTAAAGAAAAACATCAAGACGAGATTACATTCGGCGACAAATCA  1064
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1017  TTGATCCACACTTTTGTTAAAGAAAAACATCAAGATGAGATTACATTCGGCGACAAATCA  1076

Query  1065  AGATTAGGGAGAGGGGGTATGACTGCAAAAGTCAAAGCTGCAGTGAATGCAGCTTATGCT  1124
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1077  AGATTAGGGAGAGGGGGTATGACTGCAAAAGTCAAAGCTGCAGTCAATGCAGCTTATGCT  1136

Query  1125  GGGATTCCTGTCATCATAACCAGTGGCTATTCAGCTGAGAACATTGACAAAGTCCTCAGA  1184
             |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct  1137  GGGATTCCTGTCATCATAACCAGTGGGTATTCAGCTGAGAACATAGATAAAGTCCTCAGA  1196

Query  1185  GGACTGCGTGTTGGAACCTTATTCCATCAAGATGCTCGTTTATGGGCTCCGATCACAGAT  1244
             ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1197  GGACTACGTGTTGGAACCTTGTTTCATCAAGATGCTCGTTTATGGGCTCCGATCACAGAT  1256

Query  1245  TCTAATGCTCGTGACATGGCAGTTGCTGCGAGGGAAAGTTCCAGAAAGCTTCAGGCCTTA  1304
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1257  TCTAATGCTCGTGACATGGCAGTTGCTGCGAGGGAAAGTTCCAGAAAGCTTCAGGCCTTA  1316

Query  1305  TCTTCAGAAGATAGGaaaaaaaTTCTGCTTGATATTGCCGATGCCCTTGAAGCAAATGAA  1364
             ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  1317  TCTTCGGAAGACAGGAAAAAAATTCTGCTTGATATTGCCGATGCCCTTGAAGCAAATGTT  1376

Query  1365  ACAAGAATCAAAGCTGAGAATGAGTTAGATGTAGCTGCTGCACAAGAGGCTGGGTTGGAA  1424
             || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1377  ACTACAATCAAAGCTGAGAATGAGTTAGATGTAGCTTCTGCACAAGAGGCTGGGTTGGAA  1436

Query  1425  GAGTCAATGGTGGCTCGCTTAGTTATGACACCTGGAAAGATCTCGAGCCTTGCAGCTTCA  1484
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1437  GAGTCAATGGTGGCTCGCTTAGTTATGACACCTGGAAAGATCTCGAGCCTTGCAGCTTCA  1496

Query  1485  GTTCGTAAGCTAGCTGAAATGGAAGATCCAATCGGCCGTGTTTTAAAGAAAACAGAGGTG  1544
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1497  GTTCGTAAGCTAGCTGATATGGAAGATCCAATCGGCCGTGTTTTAAAGAAAACAGAGGTG  1556

Query  1545  GCAGATGGTCTTGTCTTAGAGAAGACCTCATCTCCATTAGGCGTACTCCTGATTGTTTTT  1604
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  1557  GCAGATGGTCTTGTCTTAGAGAAGACCTCATCACCATTAGGCGTACTTCTGATTGTTTTT  1616

Query  1605  GAATCCCGACCTGATGCACTTGTACAGATAGCTTCACTTGCCATCCGTAGTGGAAATGGT  1664
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1617  GAATCCCGACCTGATGCACTTGTACAGATAGCTTCACTTGCCATCCGTAGTGGAAATGGT  1676

Query  1665  CTTCTGTTGAAGGGTGGAAAAGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTAATT  1724
             |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || 
Sbjct  1677  CTTCTGCTGAAGGGTGGAAAGGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTGATC  1736

Query  1725  ACTGATGCAATTCCAGAGACTGTTGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTGACTTCAAGAGAA  1784
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1737  ACTGATGCAATTCCAGAGACTGTTGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTGACTTCAAGAGAA  1796

Query  1785  GAGATTCCTGATTTGCTTAAGC-TGATGGACGTTATTGATCTGGTGATCCCAAGAGGCAG  1843
             |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||
Sbjct  1797  GAGATTCCTGATTTGCTTAAGCTTGAT-GACGTTATCGATCTTGTGATCCCAAGAGGAAG  1855

Query  1844  CAACAAGCTTGTTACTCAGATTGAAAATACTACGGAAATGCGTGTACT-GGTTCATGCTG  1902
             |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| | ||| || || ||||||||
Sbjct  1856  CAACAAGCTTGTTACTCAGATAAAAAATACTACAAAAATCCCTGTGCTAGG-TCATGCTG  1914

Query  1903  ATGGAATCTGTCATGTGTATGTCGACAAGTCTTGTGATACGGATATGGCAAAGCGCATAG  1962
             |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1915  ATGGAATCTGTCATGTATATGTCGACAAGGCTTGTGATACGGATATGGCAAAGCGCATAG  1974

Query  1963  TTTCTGATGCAAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACTCTCCTTGTGC  2022
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct  1975  TTTCTGATGCAAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACCCTTCTTGTGC  2034

Query  2023  ATAAGGATCTAGAGCAGAATGCTGTGCTCAATGAGCTTATTTTTGCTCTTCAGAGCAATG  2082
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  2035  ATAAGGATCTAGAGCAGAATGCTGTGCTTAATGAGCTTATTTTTGCTCTGCAGAGCAATG  2094

Query  2083  GAGTCACTTTGTATGGTGGACCAAGGGCAAGTGCA-ATACTGAACATACCAGAAGCACGG  2141
             ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2095  GAGTCACTTTGTATGGTGGACCAAGGGCAAGT-AAGATACTGAACATACCAGAAGCACGG  2153

Query  2142  TCATTTAACCATGAGTACTGTGCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTAGAAGACGTTTAT  2201
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2154  TCATTCAACCATGAGTACTGTGCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTAGAAGACGTTTAT  2213

Query  2202  GGTGCTATAGATCACATTCACCGACATGGGAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAG  2261
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2214  GGTGCTATAGATCACATTCACCGACATGGGAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAG  2273

Query  2262  GATCACGAAGTTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTGGACAGCGCTGCTGTTTTCCACAAC  2321
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct  2274  GATCACGAAGTTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTGGATAGCGCTGCTGTGTTCCACAAC  2333

Query  2322  GCAAGCACAAGATTCTCAGATGGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAGTAAGC  2381
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct  2334  GCCAGCACAAGATTCTCAGATGGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCAGAGGTGGGGGTAAGC  2393

Query  2382  ACGGGCAGGATCCATGCTCGTGGTCCAGTCGGGGTTGAAGGATTACTTACAACGAGATGG  2441
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2394  ACGGGCAGGATCCATGCTCGTGGTCCAGTCGGGGTCGAAGGATTACTTACAACGAGATGG  2453

Query  2442  ATAATGAGAGGAAAAGGTCAAGTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAG  2501
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2454  ATAATGAGAGGAAAAGGACAAGTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAG  2513

Query  2502  GACATTCCCATCCAAGCTTAAAACCAGACTTC-GAGTGTGTCTTTTTGTGTTTGGTTGAG  2560
             |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||
Sbjct  2514  GACATTCCCATCCAAGCTTAAA-CAAGACTTCCGAGTGTGTGTTTGTGTATTTGGTTGAG  2572

Query  2561  ACTTGAGGAGAGACACAGAGGAGGATGGGCTTTTT-GTTTCCTCTCTGCTTAGTACTCAT  2619
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2573  ACTTGAGGAGAGACACAGAGGAGGATGGGCTTTTTTGTTTCCTCTCTGCTTAGTACTCAT  2632

Query  2620  ATCCTATCATTATTATTATTACTACTACTTATTATTGAAACCCTCGCTTATGTAGTGGTT  2679
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2633  ATCCTATCATTATTATTATTACTACTACTTATTATTGAAACCCTCGCTTATGTAGTGGTT  2692

Query  2680  TTGATTTAGGGTTAGGATTGCACCAAAAATAAGATCCACTTTACCACTTGGTCTTGCTCA  2739
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  2693  TTGATTTAGGGTTAGGATTGCACCAAAAATAAGATCCACTTTACCACTTAGTCTTGCTCA  2752

Query  2740  TAAGTAAGATGAAGAACATTTTATTAGCTTCTCTTCTTGTCATTGTAAGCTACCTACACC  2799
             |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2753  TAAGTACGATGAAGAACATTTAATTAGCTTCTCTTCTTGTCATTGTAAGCTACCTACACA  2812

Query  2800  TTT  2802
             |||
Sbjct  2813  TTT  2815


> AT3G55610.1 | Symbols: P5CS2 | delta 1-pyrroline-5-carboxylate 
synthase 2 | chr3:20624020-20629093 REVERSE LENGTH=2543
Length=2543

 Score = 2322 bits (1257),  Expect = 0.0
 Identities = 1862/2153 (86%), Gaps = 46/2153 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  374   GGAGTTAGATCGTTCACGTGCTTTTGCTAGAGACGTTAAACGTATCGTCGTTAAGGTTGG  433
             |||| | ||||||||||| || || || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct  110   GGAGATCGATCGTTCACGCGCGTTCGCCAAAGACGTTAAGCGTATCGTCGTCAAGGTTGG  169

Query  434   GACCGCAGTTGTAACTGGAAAAGGTGGAAGATTGGCTCTTGGTCGATTAGGAGC-ACTGT  492
             ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | |
Sbjct  170   GACTGCAGTTGTTACTGGGAAAGGTGGAAGATTGGCTCTTGGACGTTTAGGAGCTA-TCT  228

Query  493   GTGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGATTTGAGGTGATATTGGTGTCATCTGGTG  552
             |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct  229   GTGAACAGCTTGCGGAGTTAAACTCAGATGGATTTGAGGTCATTTTGGTGTCATCTGGTG  288

Query  553   CGGTTGGTCTTGGCCGGCAAAGGCTTCGATATC-GACAATTAGTCAATAGCAGCTTTGCG  611
             | ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| 
Sbjct  289   CCGTTGGTCTTGGTCGACAAAGGCTTCGATA-CAGACAATTAGTCAACAGCAGTTTTGCA  347

Query  612   GATCTT-CAGAAGCCTCAGACT-GAACTTGATGGGAAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAA  669
             ||| || |||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct  348   GAT-TTACAGAAGCCACA-AATGGAACTTGATGGGAAGGCTTGTGCTGGTGTTGGGCAGA  405

Query  670   GCAGTCTTATGGCTTATTATGAGACTATGTTCGACCAGCTGGATGTGACCGCGGCTCAAC  729
             ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| 
Sbjct  406   GCAGTCTCATGGCTTACTATGAGACTATGTTTGACCAGTTGGATGTGACGGTTGCTCAAA  465

Query  730   TTCTGGTGAATGACAGTAGCTTTAGAGACAAGGATTTCAGGAAGCAACTTAATGAAACTG  789
             | || ||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  466   TGCTTGTGACCGATAGCAGTTTTAGAGATAAGGATTTCAGGAAGCAACTTAGTGAAACTG  525

Query  790   TC-AAGTCCATGCTTGA-TTTGAGGGTTATTCCAATTTTCAATGAGAATGATGCTATTAG  847
             || ||| | |||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  526   TCAAAG-CGATGC-TGAGGATGAGGGTTATTCCAGTTTTCAATGAGAATGATGCTATAAG  583

Query  848   CACCCGAAGAGCCCCTTATC-AGGATTCTTCTGGTAT-TTTCTGGGATAACGATAGCTTA  905
             ||| || |||||||| || | |||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||
Sbjct  584   CACTCGCAGAGCCCCCTA-CAAGGATTCTACTGGTATATTT-TGGGATAATGACAGCTTA  641

Query  906   GCTGCTCTACTGGCGCTCGAACTGAAAGCTGATCTTCTGATTCTCCTGAGTGATGTTGAA  965
             || ||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| 
Sbjct  642   GCCGCTCTTCTGTCGCTAGAGCTGAAAGCTGATCTTTTGATTCTTCTAAGTGATGTTGAG  701

Query  966   GGTCTTTACACAGGCCCTCCAAGTGATCCTAACTCAAAGTTGATCCACACTTTTGTTAAA  1025
             || |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||| ||  |||||
Sbjct  702   GGCCTTTACACTGGCCCTCCAAGTGATTCTACCTCAAAATTAATACACACATTCATTAAA  761

Query  1026  GAAAAACATCAAGACGAGATTACATTCGGCGACAAA-T-CAAGATTAGGGA-GAGGGGGT  1082
             |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| ||| ||||||||
Sbjct  762   GAAAAACACCAGGACGAGATTACTTTTGGCGA-AAAGTCCAA-ATTA-GGACGAGGGGGT  818

Query  1083  ATGACTGCAAAAGTCAAAGCTGCAGTGAATGCAGCTTATGCTGG-GATTCCTGTCATCAT  1141
             |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||
Sbjct  819   ATGACTGCAAAAGTTAAAGCTGCTGTTAATGCAGCTTATGGTGGCG-TTCCTGTTATCAT  877

Query  1142  AACCAGTGGCTATTCAGCTGAGAACATTGA-CAAAGTCCTCAGAGGACTGCGTGTTGGAA  1200
             ||||||||| ||| |||||||||| | | |  |||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct  878   AACCAGTGGATATGCAGCTGAGAATA-TAAGTAAAGTCCTTAGAGGACTGCGTGTTGGTA  936

Query  1201  CCTTATTCCATCAAGATGCTCGTTTATGGGCTCCGATCACAGATTCTAATGCTCGTGACA  1260
             || | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||| | |||||||||
Sbjct  937   CCCTGTTCCATCAAGATGCTCATTTATGGGCTCCGGTCGTAGATACTACTTCTCGTGACA  996

Query  1261  TGGCAGTTGCTGCGAGGGAAAGTTCCAGAAAGCTTCAGGCCTTATCTTCAGAAGATAGGa  1320
             ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  997   TGGCAGTTGCTGCAAGGGAAAGCTCAAGAAAGCTTCAGGCCTTATCTTCAGAAGATAGGA  1056

Query  1321  aaaaaaTTCTGCTTGATATTGCCGATGCCCTTGAAGCAAATGA-AACAAGAATCAAAGCT  1379
             || ||||||| |  || |||||| |||||||||||| |||||| || || ||| ||||||
Sbjct  1057  AACAAATTCTACACGACATTGCCAATGCCCTTGAAGTAAATGAGAA-AACAATTAAAGCT  1115

Query  1380  GAGAATGAGTTAGATGTAGCTGCTGCACAAGAGGCTGGGT-TGGAAGAGTCAATGGTGGC  1438
             |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | | ||||||||  |||| ||
Sbjct  1116  GAGAATGATTTAGATGTTGCTGCAGCACAAGAAGCTGGATAT-GAAGAGTCTTTGGTAGC  1174

Query  1439  TCGCTTAGTTATGACA-CCTGGAAAGATCTCGAGCCTTGCAGCTTCAGTTCGTAAGCTAG  1497
             |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||
Sbjct  1175  TCGCTTAGTTATGA-AGCCTGGGAAGATCTCAAGCCTTGCAGCTTCCGTTCGCCAGCTAG  1233

Query  1498  CTGAAATGGAAGATCCAATCGGCCGTGTTTTAAAGAAAACAGAGGTGGCAGATGGTCTTG  1557
             | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||| 
Sbjct  1234  CCGAAATGGAAGATCCAATAGGCCGTGTATTAAAGAAAACTCAGGTTGCAGATGATCTTA  1293

Query  1558  TCTTAGAGAAGACCTCATCTCCATTAGGCGTACTCCTGATTGTTTTTGAATCCCGACCTG  1617
             | ||||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1294  TTTTAGAGAAGACCTCATCACCAATAGGTGTTCTTCTGATTGTTTTTGAATCCCGGCCTG  1353

Query  1618  ATGCACTTGTACAGATAGCTTCACTTGCCATCCGTAGTGGAAATGGTCTTCTGTTGAAGG  1677
             |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1354  ATGCACTTGTTCAGATAGCTTCGCTTGCAATCCGGAGTGGAAATGGTCTTCTGCTGAAGG  1413

Query  1678  GTGGAAAAGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTAATTACTGATGCAATTC  1737
             ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct  1414  GTGGAAAGGAGGCTCGTCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTGATCACTGATGCAATTC  1473

Query  1738  CAGAGACTGTTGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTGACTTCAAGAGAAGAGATTCCTGATT  1797
             | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct  1474  CGGAGACTGTTGGAGGTAAACTCATAGGACTTGTGACCTCAAGAGAGGAGATTCCTGATT  1533

Query  1798  TGCTTAAGC-TGATGGACGTTATTGATCTGGTGATCCCAAGAGGCAGCAACAAGCTTGTT  1856
             |||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1534  TGCTCAAGCTTGAT-GACGTTATTGATCTTGTGATCCCAAGAGGCAGCAACAAGCTTGTT  1592

Query  1857  ACTCAGATTGAAAATACT--ACGGAAATGCGTGTACT-GGTTCATGCTGATGGAATCTGT  1913
              |||| | | |||| |||  ||| |||| |  || || ||  ||||||||||||||||||
Sbjct  1593  TCTCA-AAT-AAAAAACTCGACGAAAATCCCAGTGCTAGG-CCATGCTGATGGAATCTGT  1649

Query  1914  CATGTGTATGTCGACAAGTCTTGTGATAC-GGATATGGCAAAGCGCATAGTTTCTGATGC  1972
             ||||| ||||| || |||||| || | || ||| |||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct  1650  CATGTATATGTTGATAAGTCTGGT-AAACTGGACATGGCAAAGCGCATTGTTTCCGATGC  1708

Query  1973  AAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACTCTCCTTGTGCATAAGGATCT  2032
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |
Sbjct  1709  AAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACCCTTCTTGTACATAAAGATTT  1768

Query  2033  AGAGCAGAATGCTGTGCTCAATGAGCTTATTTTTGCTCTTCAGAGCAATGGAGTCACTTT  2092
              |||||||||| | | ||| |||| ||||||| || ||| || | ||| || ||||||||
Sbjct  1769  GGAGCAGAATGGTTTTCTCGATGATCTTATTTATGTTCTGCAAACCAAAGGCGTCACTTT  1828

Query  2093  GTATGGTGGACCAAGGGCAAGTGCAATACTGAACATACCAGAAGCACGGTCATTTAACCA  2152
             ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||| ||   |||||| ||||
Sbjct  1829  GTATGGTGGGCCAAGAGCAAGTGCAAAACTGAATATTCCGGAAACAAAATCATTTCACCA  1888

Query  2153  TGAGTACTGTGCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTAGAAGACGTTTATGGTGCTATAGA  2212
              |||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1889  CGAGTACAGTTCCAAGGCCTGCACCGTTGAAATTGTAGAAGACGTATATGGTGCTATAGA  1948

Query  2213  TCACATTCACCGACATGGGAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAGGATCAC-GAAG  2271
             ||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||| |  ||||
Sbjct  1949  TCATATTCACCAACATGGAAGTGCACACACTGATTGCATAGTGACGGAAGAT-AGTGAAG  2007

Query  2272  TTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTGGACAGCGCTGCTGTTTTCCACAACGCAAGCACAA  2331
             | |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  2008  TAGCAGAAATATTCCTCCGCCAAGTGGACAGTGCTGCTGTTTTCCACAATGCAAGCACAA  2067

Query  2332  GATTCTCAGATGGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAGTAAGCACGGGCAGGA  2391
             ||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||
Sbjct  2068  GATTCTCTGATGGTTTTAGGTTCGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAATAAGCACAAGCAGGA  2127

Query  2392  TCCATGCTCGTGGTCCAGTCGGGGTTGAAGGATTACTT-ACAACGAGATGGATAATGAGA  2450
             | ||||| ||||||||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||
Sbjct  2128  TTCATGCCCGTGGTCCAGTTGGAGTTGAAGGATTA-TTGACAACAAGATGGATAATGAGA  2186

Query  2451  GGAAAAGGTCAAGTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAGGA  2503
             ||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct  2187  GGAAAGGGACAAGTTGTGGATGGAGACAATGGAATCGTTTACACCCATAAGGA  2239



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 139213266825


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5