BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg483012 Length=2802 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT2G39800.1 | Symbols: P5CS1, ATP5CS | delta1-pyrroline-5-carbo... 4510 0.0 AT3G55610.1 | Symbols: P5CS2 | delta 1-pyrroline-5-carboxylate ... 2322 0.0 > AT2G39800.1 | Symbols: P5CS1, ATP5CS | delta1-pyrroline-5-carboxylate synthase 1 | chr2:16598164-16603319 REVERSE LENGTH=2886 Length=2886 Score = 4510 bits (2442), Expect = 0.0 Identities = 2701/2823 (96%), Gaps = 29/2823 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 CTTCCACGGCGCTTCCTCAGCCGCCGATTTTATTTATTTCCCAAAATACCCATCACCCCT 60 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1 CTTCCACGGCGTTTCCTCAGCCGCCGATTTTATTTATTTCCCAAAATACCCATCACCTAT 60 Query 61 AGCGCCACAATCCCCTACAACACACCCTACTCTCCTTACCATACACCACCCAACGACCAC 120 ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 61 AGCGCCACAATCCTCTACATCACACCCTAATCTCATTACCATACACCACCCAACGAACAC 120 Query 121 GCGCCACTTCATCTGTCAGTGTCTAAAATACCAAATCTACCCTTA-TTCCAACACGTGGC 179 |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| Sbjct 121 GCGCCACTTCATTTGTTAGTATCTAAAATACCAAACCTACCCTTAGTTCC-ACACGTGGC 179 Query 180 GCTTCATGGTTTGGTAACAGAGCCTGAGTCTCTGGTGTTGTTGGTGTTTATAAACCCCTT 239 | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct 180 GTTTCCTGGTTTGATAACAGAGCCTGAGTCTCTGGTGTCGCTGGTGTTTATAAACCCCTT 239 Query 240 CATATCTTCCTTGGTGATCTCCACCTTTCCCTCACCTGATATTTA-TTT-TTA-C----- 291 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | Sbjct 240 CATATCTTCCTTGGTGATCTCCACCTTTCCCTCACCTGATATTTATTTTCTTACCTTAAA 299 Query 292 -ACG-C--TGCTTCACTGATTCCGACTCAGTTAACTCGTTCCTCTCTCTGTGTGGTGTGG 347 ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| Sbjct 300 TACGACGGTGCTTCACTGAGTCCGACTCAGTTAACTCGTTCCTCTCTC--TGT-GTGTGG 356 Query 348 TTTTGGT--A-GACGACGACGATAATGGAGGAGTTAGATCGTTCACGTGCTTTTGCTAGA 404 ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 357 TTTTGGTAGACGACGACGACGATAATGGAGGAGCTAGATCGTTCACGTGCTTTTGCCAGA 416 Query 405 GACGTTAAACGTATCGTCGTTAAGGTTGGGACCGCAGTTGTAACTGGAAAAGGTGGAAGA 464 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 417 GACGTCAAACGTATCGTCGTTAAGGTTGGGACAGCAGTTGTTACTGGAAAAGGTGGAAGA 476 Query 465 TTGGCTCTTGGTCGATTAGGAGCACTGTGTGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGA 524 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 477 TTGGCTCTTGGTCGTTTAGGAGCACTGTGTGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGA 536 Query 525 TTTGAGGTGATATTGGTGTCATCTGGTGCGGTTGGTCTTGGCCGGCAAAGGCTTCGATAT 584 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| Sbjct 537 TTTGAGGTGATATTGGTGTCATCTGGTGCGGTTGGTCTTGGCAGGCAAAGGCTTCGTTAT 596 Query 585 CGACAATTAGTCAATAGCAGCTTTGCGGATCTTCAGAAGCCTCAGACTGAACTTGATGGG 644 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 597 CGACAATTAGTCAATAGCAGCTTTGCGGATCTTCAGAAGCCTCAGACTGAACTTGATGGG 656 Query 645 AAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAAGCAGTCTTATGGCTTATTATGAGACTATGTTCGAC 704 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 657 AAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAAGCAGTCTTATGGCTTACTATGAGACTATGTTTGAC 716 Query 705 CAGCTGGATGTGACCGCGGCTCAACTTCTGGTGAATGACAGTAGCTTTAGAGACAAGGAT 764 ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 717 CAGCTTGATGTGACGGCAGCTCAACTTCTGGTGAATGACAGTAGTTTTAGAGACAAGGAT 776 Query 765 TTCAGGAAGCAACTTAATGAAACTGTCAAGTCCATGCTTGATTTGAGGGTTATTCCAATT 824 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 777 TTCAGGAAGCAACTTAATGAAACTGTCAAGTCTATGCTTGATTTGAGGGTTATTCCAATT 836 Query 825 TTCAATGAGAATGATGCTATTAGCACCCGAAGAGCCCCTTATCAGGATTCTTCTGGTATT 884 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 837 TTCAATGAGAATGATGCTATTAGCACCCGAAGAGCCCCATATCAGGATTCTTCTGGTATT 896 Query 885 TTCTGGGATAACGATAGCTTAGCTGCTCTACTGGCGCTCGAACTGAAAGCTGATCTTCTG 944 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 897 TTCTGGGATAACGATAGCTTAGCTGCTCTACTGGCGTTGGAACTGAAAGCTGATCTTCTG 956 Query 945 ATTCTCCTGAGTGATGTTGAAGGTCTTTACACAGGCCCTCCAAGTGATCCTAACTCAAAG 1004 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 957 ATTCTTCTGAGCGATGTTGAAGGTCTTTACACAGGCCCTCCAAGTGATCCTAACTCAAAG 1016 Query 1005 TTGATCCACACTTTTGTTAAAGAAAAACATCAAGACGAGATTACATTCGGCGACAAATCA 1064 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1017 TTGATCCACACTTTTGTTAAAGAAAAACATCAAGATGAGATTACATTCGGCGACAAATCA 1076 Query 1065 AGATTAGGGAGAGGGGGTATGACTGCAAAAGTCAAAGCTGCAGTGAATGCAGCTTATGCT 1124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1077 AGATTAGGGAGAGGGGGTATGACTGCAAAAGTCAAAGCTGCAGTCAATGCAGCTTATGCT 1136 Query 1125 GGGATTCCTGTCATCATAACCAGTGGCTATTCAGCTGAGAACATTGACAAAGTCCTCAGA 1184 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 1137 GGGATTCCTGTCATCATAACCAGTGGGTATTCAGCTGAGAACATAGATAAAGTCCTCAGA 1196 Query 1185 GGACTGCGTGTTGGAACCTTATTCCATCAAGATGCTCGTTTATGGGCTCCGATCACAGAT 1244 ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1197 GGACTACGTGTTGGAACCTTGTTTCATCAAGATGCTCGTTTATGGGCTCCGATCACAGAT 1256 Query 1245 TCTAATGCTCGTGACATGGCAGTTGCTGCGAGGGAAAGTTCCAGAAAGCTTCAGGCCTTA 1304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1257 TCTAATGCTCGTGACATGGCAGTTGCTGCGAGGGAAAGTTCCAGAAAGCTTCAGGCCTTA 1316 Query 1305 TCTTCAGAAGATAGGaaaaaaaTTCTGCTTGATATTGCCGATGCCCTTGAAGCAAATGAA 1364 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1317 TCTTCGGAAGACAGGAAAAAAATTCTGCTTGATATTGCCGATGCCCTTGAAGCAAATGTT 1376 Query 1365 ACAAGAATCAAAGCTGAGAATGAGTTAGATGTAGCTGCTGCACAAGAGGCTGGGTTGGAA 1424 || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1377 ACTACAATCAAAGCTGAGAATGAGTTAGATGTAGCTTCTGCACAAGAGGCTGGGTTGGAA 1436 Query 1425 GAGTCAATGGTGGCTCGCTTAGTTATGACACCTGGAAAGATCTCGAGCCTTGCAGCTTCA 1484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1437 GAGTCAATGGTGGCTCGCTTAGTTATGACACCTGGAAAGATCTCGAGCCTTGCAGCTTCA 1496 Query 1485 GTTCGTAAGCTAGCTGAAATGGAAGATCCAATCGGCCGTGTTTTAAAGAAAACAGAGGTG 1544 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1497 GTTCGTAAGCTAGCTGATATGGAAGATCCAATCGGCCGTGTTTTAAAGAAAACAGAGGTG 1556 Query 1545 GCAGATGGTCTTGTCTTAGAGAAGACCTCATCTCCATTAGGCGTACTCCTGATTGTTTTT 1604 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1557 GCAGATGGTCTTGTCTTAGAGAAGACCTCATCACCATTAGGCGTACTTCTGATTGTTTTT 1616 Query 1605 GAATCCCGACCTGATGCACTTGTACAGATAGCTTCACTTGCCATCCGTAGTGGAAATGGT 1664 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1617 GAATCCCGACCTGATGCACTTGTACAGATAGCTTCACTTGCCATCCGTAGTGGAAATGGT 1676 Query 1665 CTTCTGTTGAAGGGTGGAAAAGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTAATT 1724 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1677 CTTCTGCTGAAGGGTGGAAAGGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTGATC 1736 Query 1725 ACTGATGCAATTCCAGAGACTGTTGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTGACTTCAAGAGAA 1784 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1737 ACTGATGCAATTCCAGAGACTGTTGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTGACTTCAAGAGAA 1796 Query 1785 GAGATTCCTGATTTGCTTAAGC-TGATGGACGTTATTGATCTGGTGATCCCAAGAGGCAG 1843 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || Sbjct 1797 GAGATTCCTGATTTGCTTAAGCTTGAT-GACGTTATCGATCTTGTGATCCCAAGAGGAAG 1855 Query 1844 CAACAAGCTTGTTACTCAGATTGAAAATACTACGGAAATGCGTGTACT-GGTTCATGCTG 1902 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || || |||||||| Sbjct 1856 CAACAAGCTTGTTACTCAGATAAAAAATACTACAAAAATCCCTGTGCTAGG-TCATGCTG 1914 Query 1903 ATGGAATCTGTCATGTGTATGTCGACAAGTCTTGTGATACGGATATGGCAAAGCGCATAG 1962 |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1915 ATGGAATCTGTCATGTATATGTCGACAAGGCTTGTGATACGGATATGGCAAAGCGCATAG 1974 Query 1963 TTTCTGATGCAAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACTCTCCTTGTGC 2022 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 1975 TTTCTGATGCAAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACCCTTCTTGTGC 2034 Query 2023 ATAAGGATCTAGAGCAGAATGCTGTGCTCAATGAGCTTATTTTTGCTCTTCAGAGCAATG 2082 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2035 ATAAGGATCTAGAGCAGAATGCTGTGCTTAATGAGCTTATTTTTGCTCTGCAGAGCAATG 2094 Query 2083 GAGTCACTTTGTATGGTGGACCAAGGGCAAGTGCA-ATACTGAACATACCAGAAGCACGG 2141 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2095 GAGTCACTTTGTATGGTGGACCAAGGGCAAGT-AAGATACTGAACATACCAGAAGCACGG 2153 Query 2142 TCATTTAACCATGAGTACTGTGCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTAGAAGACGTTTAT 2201 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2154 TCATTCAACCATGAGTACTGTGCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTAGAAGACGTTTAT 2213 Query 2202 GGTGCTATAGATCACATTCACCGACATGGGAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAG 2261 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2214 GGTGCTATAGATCACATTCACCGACATGGGAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAG 2273 Query 2262 GATCACGAAGTTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTGGACAGCGCTGCTGTTTTCCACAAC 2321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 2274 GATCACGAAGTTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTGGATAGCGCTGCTGTGTTCCACAAC 2333 Query 2322 GCAAGCACAAGATTCTCAGATGGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAGTAAGC 2381 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 2334 GCCAGCACAAGATTCTCAGATGGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCAGAGGTGGGGGTAAGC 2393 Query 2382 ACGGGCAGGATCCATGCTCGTGGTCCAGTCGGGGTTGAAGGATTACTTACAACGAGATGG 2441 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2394 ACGGGCAGGATCCATGCTCGTGGTCCAGTCGGGGTCGAAGGATTACTTACAACGAGATGG 2453 Query 2442 ATAATGAGAGGAAAAGGTCAAGTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAG 2501 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2454 ATAATGAGAGGAAAAGGACAAGTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAG 2513 Query 2502 GACATTCCCATCCAAGCTTAAAACCAGACTTC-GAGTGTGTCTTTTTGTGTTTGGTTGAG 2560 |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| Sbjct 2514 GACATTCCCATCCAAGCTTAAA-CAAGACTTCCGAGTGTGTGTTTGTGTATTTGGTTGAG 2572 Query 2561 ACTTGAGGAGAGACACAGAGGAGGATGGGCTTTTT-GTTTCCTCTCTGCTTAGTACTCAT 2619 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2573 ACTTGAGGAGAGACACAGAGGAGGATGGGCTTTTTTGTTTCCTCTCTGCTTAGTACTCAT 2632 Query 2620 ATCCTATCATTATTATTATTACTACTACTTATTATTGAAACCCTCGCTTATGTAGTGGTT 2679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2633 ATCCTATCATTATTATTATTACTACTACTTATTATTGAAACCCTCGCTTATGTAGTGGTT 2692 Query 2680 TTGATTTAGGGTTAGGATTGCACCAAAAATAAGATCCACTTTACCACTTGGTCTTGCTCA 2739 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2693 TTGATTTAGGGTTAGGATTGCACCAAAAATAAGATCCACTTTACCACTTAGTCTTGCTCA 2752 Query 2740 TAAGTAAGATGAAGAACATTTTATTAGCTTCTCTTCTTGTCATTGTAAGCTACCTACACC 2799 |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2753 TAAGTACGATGAAGAACATTTAATTAGCTTCTCTTCTTGTCATTGTAAGCTACCTACACA 2812 Query 2800 TTT 2802 ||| Sbjct 2813 TTT 2815 > AT3G55610.1 | Symbols: P5CS2 | delta 1-pyrroline-5-carboxylate synthase 2 | chr3:20624020-20629093 REVERSE LENGTH=2543 Length=2543 Score = 2322 bits (1257), Expect = 0.0 Identities = 1862/2153 (86%), Gaps = 46/2153 (2%) Strand=Plus/Plus Query 374 GGAGTTAGATCGTTCACGTGCTTTTGCTAGAGACGTTAAACGTATCGTCGTTAAGGTTGG 433 |||| | ||||||||||| || || || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 110 GGAGATCGATCGTTCACGCGCGTTCGCCAAAGACGTTAAGCGTATCGTCGTCAAGGTTGG 169 Query 434 GACCGCAGTTGTAACTGGAAAAGGTGGAAGATTGGCTCTTGGTCGATTAGGAGC-ACTGT 492 ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | | Sbjct 170 GACTGCAGTTGTTACTGGGAAAGGTGGAAGATTGGCTCTTGGACGTTTAGGAGCTA-TCT 228 Query 493 GTGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGATTTGAGGTGATATTGGTGTCATCTGGTG 552 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 229 GTGAACAGCTTGCGGAGTTAAACTCAGATGGATTTGAGGTCATTTTGGTGTCATCTGGTG 288 Query 553 CGGTTGGTCTTGGCCGGCAAAGGCTTCGATATC-GACAATTAGTCAATAGCAGCTTTGCG 611 | ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 289 CCGTTGGTCTTGGTCGACAAAGGCTTCGATA-CAGACAATTAGTCAACAGCAGTTTTGCA 347 Query 612 GATCTT-CAGAAGCCTCAGACT-GAACTTGATGGGAAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAA 669 ||| || |||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct 348 GAT-TTACAGAAGCCACA-AATGGAACTTGATGGGAAGGCTTGTGCTGGTGTTGGGCAGA 405 Query 670 GCAGTCTTATGGCTTATTATGAGACTATGTTCGACCAGCTGGATGTGACCGCGGCTCAAC 729 ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||| Sbjct 406 GCAGTCTCATGGCTTACTATGAGACTATGTTTGACCAGTTGGATGTGACGGTTGCTCAAA 465 Query 730 TTCTGGTGAATGACAGTAGCTTTAGAGACAAGGATTTCAGGAAGCAACTTAATGAAACTG 789 | || |||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 466 TGCTTGTGACCGATAGCAGTTTTAGAGATAAGGATTTCAGGAAGCAACTTAGTGAAACTG 525 Query 790 TC-AAGTCCATGCTTGA-TTTGAGGGTTATTCCAATTTTCAATGAGAATGATGCTATTAG 847 || ||| | |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct 526 TCAAAG-CGATGC-TGAGGATGAGGGTTATTCCAGTTTTCAATGAGAATGATGCTATAAG 583 Query 848 CACCCGAAGAGCCCCTTATC-AGGATTCTTCTGGTAT-TTTCTGGGATAACGATAGCTTA 905 ||| || |||||||| || | |||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||| Sbjct 584 CACTCGCAGAGCCCCCTA-CAAGGATTCTACTGGTATATTT-TGGGATAATGACAGCTTA 641 Query 906 GCTGCTCTACTGGCGCTCGAACTGAAAGCTGATCTTCTGATTCTCCTGAGTGATGTTGAA 965 || ||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| Sbjct 642 GCCGCTCTTCTGTCGCTAGAGCTGAAAGCTGATCTTTTGATTCTTCTAAGTGATGTTGAG 701 Query 966 GGTCTTTACACAGGCCCTCCAAGTGATCCTAACTCAAAGTTGATCCACACTTTTGTTAAA 1025 || |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||| || ||||| Sbjct 702 GGCCTTTACACTGGCCCTCCAAGTGATTCTACCTCAAAATTAATACACACATTCATTAAA 761 Query 1026 GAAAAACATCAAGACGAGATTACATTCGGCGACAAA-T-CAAGATTAGGGA-GAGGGGGT 1082 |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| ||| |||||||| Sbjct 762 GAAAAACACCAGGACGAGATTACTTTTGGCGA-AAAGTCCAA-ATTA-GGACGAGGGGGT 818 Query 1083 ATGACTGCAAAAGTCAAAGCTGCAGTGAATGCAGCTTATGCTGG-GATTCCTGTCATCAT 1141 |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| Sbjct 819 ATGACTGCAAAAGTTAAAGCTGCTGTTAATGCAGCTTATGGTGGCG-TTCCTGTTATCAT 877 Query 1142 AACCAGTGGCTATTCAGCTGAGAACATTGA-CAAAGTCCTCAGAGGACTGCGTGTTGGAA 1200 ||||||||| ||| |||||||||| | | | |||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct 878 AACCAGTGGATATGCAGCTGAGAATA-TAAGTAAAGTCCTTAGAGGACTGCGTGTTGGTA 936 Query 1201 CCTTATTCCATCAAGATGCTCGTTTATGGGCTCCGATCACAGATTCTAATGCTCGTGACA 1260 || | |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| | ||||||||| Sbjct 937 CCCTGTTCCATCAAGATGCTCATTTATGGGCTCCGGTCGTAGATACTACTTCTCGTGACA 996 Query 1261 TGGCAGTTGCTGCGAGGGAAAGTTCCAGAAAGCTTCAGGCCTTATCTTCAGAAGATAGGa 1320 ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 997 TGGCAGTTGCTGCAAGGGAAAGCTCAAGAAAGCTTCAGGCCTTATCTTCAGAAGATAGGA 1056 Query 1321 aaaaaaTTCTGCTTGATATTGCCGATGCCCTTGAAGCAAATGA-AACAAGAATCAAAGCT 1379 || ||||||| | || |||||| |||||||||||| |||||| || || ||| |||||| Sbjct 1057 AACAAATTCTACACGACATTGCCAATGCCCTTGAAGTAAATGAGAA-AACAATTAAAGCT 1115 Query 1380 GAGAATGAGTTAGATGTAGCTGCTGCACAAGAGGCTGGGT-TGGAAGAGTCAATGGTGGC 1438 |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | | |||||||| |||| || Sbjct 1116 GAGAATGATTTAGATGTTGCTGCAGCACAAGAAGCTGGATAT-GAAGAGTCTTTGGTAGC 1174 Query 1439 TCGCTTAGTTATGACA-CCTGGAAAGATCTCGAGCCTTGCAGCTTCAGTTCGTAAGCTAG 1497 |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct 1175 TCGCTTAGTTATGA-AGCCTGGGAAGATCTCAAGCCTTGCAGCTTCCGTTCGCCAGCTAG 1233 Query 1498 CTGAAATGGAAGATCCAATCGGCCGTGTTTTAAAGAAAACAGAGGTGGCAGATGGTCTTG 1557 | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| Sbjct 1234 CCGAAATGGAAGATCCAATAGGCCGTGTATTAAAGAAAACTCAGGTTGCAGATGATCTTA 1293 Query 1558 TCTTAGAGAAGACCTCATCTCCATTAGGCGTACTCCTGATTGTTTTTGAATCCCGACCTG 1617 | ||||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1294 TTTTAGAGAAGACCTCATCACCAATAGGTGTTCTTCTGATTGTTTTTGAATCCCGGCCTG 1353 Query 1618 ATGCACTTGTACAGATAGCTTCACTTGCCATCCGTAGTGGAAATGGTCTTCTGTTGAAGG 1677 |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1354 ATGCACTTGTTCAGATAGCTTCGCTTGCAATCCGGAGTGGAAATGGTCTTCTGCTGAAGG 1413 Query 1678 GTGGAAAAGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTAATTACTGATGCAATTC 1737 ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct 1414 GTGGAAAGGAGGCTCGTCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTGATCACTGATGCAATTC 1473 Query 1738 CAGAGACTGTTGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTGACTTCAAGAGAAGAGATTCCTGATT 1797 | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 1474 CGGAGACTGTTGGAGGTAAACTCATAGGACTTGTGACCTCAAGAGAGGAGATTCCTGATT 1533 Query 1798 TGCTTAAGC-TGATGGACGTTATTGATCTGGTGATCCCAAGAGGCAGCAACAAGCTTGTT 1856 |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1534 TGCTCAAGCTTGAT-GACGTTATTGATCTTGTGATCCCAAGAGGCAGCAACAAGCTTGTT 1592 Query 1857 ACTCAGATTGAAAATACT--ACGGAAATGCGTGTACT-GGTTCATGCTGATGGAATCTGT 1913 |||| | | |||| ||| ||| |||| | || || || |||||||||||||||||| Sbjct 1593 TCTCA-AAT-AAAAAACTCGACGAAAATCCCAGTGCTAGG-CCATGCTGATGGAATCTGT 1649 Query 1914 CATGTGTATGTCGACAAGTCTTGTGATAC-GGATATGGCAAAGCGCATAGTTTCTGATGC 1972 ||||| ||||| || |||||| || | || ||| |||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 1650 CATGTATATGTTGATAAGTCTGGT-AAACTGGACATGGCAAAGCGCATTGTTTCCGATGC 1708 Query 1973 AAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACTCTCCTTGTGCATAAGGATCT 2032 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | Sbjct 1709 AAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACCCTTCTTGTACATAAAGATTT 1768 Query 2033 AGAGCAGAATGCTGTGCTCAATGAGCTTATTTTTGCTCTTCAGAGCAATGGAGTCACTTT 2092 |||||||||| | | ||| |||| ||||||| || ||| || | ||| || |||||||| Sbjct 1769 GGAGCAGAATGGTTTTCTCGATGATCTTATTTATGTTCTGCAAACCAAAGGCGTCACTTT 1828 Query 2093 GTATGGTGGACCAAGGGCAAGTGCAATACTGAACATACCAGAAGCACGGTCATTTAACCA 2152 ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||| || |||||| |||| Sbjct 1829 GTATGGTGGGCCAAGAGCAAGTGCAAAACTGAATATTCCGGAAACAAAATCATTTCACCA 1888 Query 2153 TGAGTACTGTGCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTAGAAGACGTTTATGGTGCTATAGA 2212 |||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1889 CGAGTACAGTTCCAAGGCCTGCACCGTTGAAATTGTAGAAGACGTATATGGTGCTATAGA 1948 Query 2213 TCACATTCACCGACATGGGAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAGGATCAC-GAAG 2271 ||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | |||| Sbjct 1949 TCATATTCACCAACATGGAAGTGCACACACTGATTGCATAGTGACGGAAGAT-AGTGAAG 2007 Query 2272 TTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTGGACAGCGCTGCTGTTTTCCACAACGCAAGCACAA 2331 | ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2008 TAGCAGAAATATTCCTCCGCCAAGTGGACAGTGCTGCTGTTTTCCACAATGCAAGCACAA 2067 Query 2332 GATTCTCAGATGGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAGTAAGCACGGGCAGGA 2391 ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct 2068 GATTCTCTGATGGTTTTAGGTTCGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAATAAGCACAAGCAGGA 2127 Query 2392 TCCATGCTCGTGGTCCAGTCGGGGTTGAAGGATTACTT-ACAACGAGATGGATAATGAGA 2450 | ||||| ||||||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| Sbjct 2128 TTCATGCCCGTGGTCCAGTTGGAGTTGAAGGATTA-TTGACAACAAGATGGATAATGAGA 2186 Query 2451 GGAAAAGGTCAAGTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAGGA 2503 ||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||| Sbjct 2187 GGAAAGGGACAAGTTGTGGATGGAGACAATGGAATCGTTTACACCCATAAGGA 2239 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 139213266825 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5