BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg483746
Length=6561
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G46020.2 | Symbols: CHR2, ATBRM, BRM, CHA2 | transcription r... 1.092e+04 0.0
> AT2G46020.2 | Symbols: CHR2, ATBRM, BRM, CHA2 | transcription
regulatory protein SNF2, putative | chr2:18923304-18931934
FORWARD LENGTH=6747
Length=6747
Score = 1.092e+04 bits (5911), Expect = 0.0
Identities = 6369/6589 (97%), Gaps = 35/6589 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCAATCTGGAGGCAGTGGCGGAGGGCCCGCTCGGAATCCGCCCATGGGTCCGGCTGGT 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCAATCTGGAGGCAGTGGCGGAGGGCCCGCTCGGAATCCGGCCATGGGTCCGGCTGGT 60
Query 61 CGGACTGCGTCCACGTCATCCGCTGCTTCTCCTTCTTCTTCCTCTTC--C--T-C--C-G 112
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |
Sbjct 61 CGGACTGCTTCCACGTCATCCGCTGCTTCTCCTTCTTCTTCCTCTTCATCTGTGCAGCAG 120
Query 113 -Tg---cagc-a-a-c-a-a-cagcaacag---cagcagctggcgtctaggcagcaacag 159
| |||| | | | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 121 CAGCAACAGCAACAGCAACAGCAGCAACAGCAACAGCAGCTGGCGTCTAGGCAGCAGCAG 180
Query 160 cagcagcagAGAAACTCAGATGCAAACGAAAACATGTTTGCATATCATGCTGGTGGGGTT 219
|||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 181 CAGCAGCACAGAAACTCAGATACAAACGAAAATATGTTTGCATATCAACCTGGTGGGGTT 240
Query 220 CAGGGAATGATGGGAGGTGGCAACTTTGCTTCGTCTTCTGGCTCTATGCAAATGCCTCAG 279
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CAGGGAATGATGGGCGGTGGCAACTTTGCTTCGTCTCCGGGCTCTATGCAAATGCCTCAG 300
Query 280 CAGTCTAGGAAA-TTCTTTGAGTCTCCTcaacaacaacaacaacaGCAGCAACAGGGCTC 338
||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||
Sbjct 301 CAGTCTA-GAAATTTTTTTGAGTCTCCTCAGCAACAACAACAACAACAACAACAGGGTTC 359
Query 339 TTCTACCCAAGAGGGCCAGCAAAGTTTTAATCCAATGCAGCAAGCGTATATTCAGTTTGC 398
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 TTCTACCCAAGAGGGCCAGCAAAATTTTAATCCAATGCAGCAAGCGTATATTCAGTTTGC 419
Query 399 TATACAGGCTCAGCAACAAAAAGCACAGCAGCAAGCTAGAATGGGAATGATAGGTTCATC 458
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||
Sbjct 420 TATGCAGGCTCAGCATCAAAAAGCACAGCAGCAAGCTAGGATGGGAATGGTGGGTTCATC 479
Query 459 AAGTGTCGGAAAAGATCAAGATGCACGGATGGGAATGTTGAATATACAAGATTTGAATCC 518
|||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 480 AAGTGTGGGAAAGGATCAAGATGCACGAATGGGAATGTTGAATATGCAAGACTTGAATCC 539
Query 519 GTCTAGTCAGGCCCAGGCCTCATCGTCTAAGCCATCGGGAGATCAGTTTGGTCGCGGTGA 578
|||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 540 GTCTAGTCAGCCCCAGGCCTCATCATCGAAGCCATCGGGCGATCAGTTTGCTCGCGGTGA 599
Query 579 AAGGCAGA-TGGAATCAGGTTCTCAGCAAAGGAACGAAACAAATTCTCATCCTCAGCAGC 637
|||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 600 AAGGCAGACT-GAATCAAGTTCTCAGCAAAGGAACGAAACAAAATCTCATCCTCAGCAGC 658
Query 638 AGGTGGGTACCGGACAACTAATACCTGGAAATATGATAAGGCCAATGCAGGCACCACAGC 697
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 659 AGGTGGGTACCGGACAACTAATGCCTGGAAATATGATAAGGCCAATGCAAGCACCACAGG 718
Query 698 CTCAACAGCTTATCAATAATATGGGAAATAACCAACTCGCATTTGCACAACAGTGGCAGG 757
|||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 CTCAGCAGCTTGTCAATAACATGGGAAACAACCAACTCGCATTTGCACAACAGTGGCAGG 778
Query 758 CAATGCAGGCATGGGCGCGTGAGAGGAATATCGATCTCTCACATCCTGCCAACGCCAGCC 817
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 CAATGCAGGCATGGGCGCGTGAGCGTAATATCGATCTCTCACATCCTGCCAACGCCAGCC 838
Query 818 AAATGGCACACATCCTTCAGGCAAGAATGGCTGCCCAACAGAAAGTTAGTGAAGGCAATG 877
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 839 AAATGGCACACATCCTTCAGGCAAGAATGGCTGCTCAACAGAAAGCTGGTGAAGGCAATG 898
Query 878 TGGCTTCACAGGCACCTTCTATTCCAATCTCTAGCCAGCCGGCTTCATCTTCGGTTGTTC 937
|||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 TGGCCTCACAGTCACCATCTATTCCAATCTCTAGCCAGCCGGCTTCATCTTCGGTTGTTC 958
Query 938 CAGGTGAGAATTCACCGCGTACCAACTCTGCTAGTGATATCTCTGGGCAGTCAGGATCAG 997
|||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 CAGGTGAGAATTCACCACATGCCAACTCTGCTAGTGATATCTCTGGGCAGTCAGGATCAG 1018
Query 998 CAAAGGCCAGGCATGCAATATCTACTGGCTCATTTGCTTCGACTTCCAGTCCCAGAATGG 1057
| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 CGAAGGCCAGACATGCATTATCTACTGGCTCATTTGCCTCGACTTCCAGTCCCAGAATGG 1078
Query 1058 TCAATCCTGCTATGAATCCCTTCTCCGTCCAAGGGAGAGATAATCCAATGTATCCTCGAC 1117
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1079 TCAATCCTGCTATGAATCCCTTCTCCGGCCAAGGGAGAGAGAATCCAATGTATCCTCGAC 1138
Query 1118 ATTTAGTTCAGCCTACAAATGGGATGCCCTCAGGAAATTCCCTGCAGACTTCTGCAAATG 1177
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 ATTTAGTTCAGCCTACAAATGGGATGCCCTCAGGAAATCCCCTGCAGACTTCTGCAAATG 1198
Query 1178 AGACTCTTGTTTTGGATCAGAATGTGTCTACaaaaaaaaGTTTAGGTCCTGCTGAACATT 1237
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 AGACTCCTGTTTTGGATCAGAATGCATCTACAAAAAAAAGTTTAGGTCCTGCTGAACATT 1258
Query 1238 TGCAAATGCAGCAGCCTAGGCAACTGAATGCACCGACTTCAAATTTACTAGCGCCATCTG 1297
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1259 TGCAAATGCAGCAGCCTAGGCAACTGAATACACCGACTCCAAATTTAGTAGCGCCATCTG 1318
Query 1298 ATACTGGTCCACTCAGTAATTCTTCCTTTCAGAGTGGACAGGGGACCCAACAAGCACAGC 1357
||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 ATACTGGTCCACTCAGTAACTCGTCCCTTCAGAGTGGACAGGGGACCCAACAAGCACAGC 1378
Query 1358 AGCGAGCAGGATTTACCAAACAGCAACTCCATGTTCTCAAAGCCCAGATACTGGCATTTA 1417
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 AGCGATCAGGATTTACCAAACAGCAACTCCATGTTCTCAAAGCCCAGATACTGGCATTTA 1438
Query 1418 GGCGTTTGAAGAAAGGGGAAGGTTCTTTGCCTCCAGAGCTTCTTCAAGCTATTGCTCCAC 1477
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1439 GGCGTTTGAAGAAAGGGGAAGGTTCTTTGCCTCCGGAGCTTCTTCAAGCTATTTCTCCAC 1498
Query 1478 CACCGCTTCAACTGCAGACACAGAGGCAAATAACTCCTG--TTGGAGGACAAGTTCAGGA 1535
|||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||
Sbjct 1499 CACCGCTTGAACTACAGACGCAGAGGCAAATATCTCCTGCCATAG-GGA-AAGTTCAGGA 1556
Query 1536 TAGAGCTTCAGAAC-AAACTGGAGAAGACCAAGCAAGGTCGCTAGAGTGTGGCAAAGAGT 1594
|||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1557 TAGATCTTCAG-ACAAAACTGGAGAAGACCAAGCAAGGTCGCTAGAGTGTGGCAAGGAGT 1615
Query 1595 CTCAGGCTGCTGCTTCTTCAAATGGACCGATTTTTTCTAAAGAGGAAGATAATGTTGGAG 1654
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616 CTCAGGCTGCTGCTTCTTCAAATGGACCAATTTTTTCTAAAGAGGAAGATAATGTTGGAG 1675
Query 1655 ATACAGAAGTAGCTTTGACAACAGGCCACAGCCAATTATTTCAAAACCTGGGAAAAGAAG 1714
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676 ATACAGAAGTAGCTTTGACGACAGGCCACAGCCAATTATTTCAAAACCTGGGAAAAGAAG 1735
Query 1715 CTACTTCTACTGACGTGGCTACGAAAGAGGAGCAACAAACTGATGTATTCCCTGTTAAGT 1774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 CTACTTCTACTGACGTGGCTACGAAAGAGGAGCAACAGACTGATGTATTCCCTGTTAAGT 1795
Query 1775 CAGACCAAGGAGCAGATTCTAGTACTCAAAAGAATCCTAGAAGTGATTCTACAGCTGATA 1834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796 CAGACCAAGGAGCAGATTCTAGTACTCAAAAGAATCCTAGAAGTGATTCTACAGCTGATA 1855
Query 1835 AGGGAAAGGCTGTTGTATCTGATGGAAGCCAATCTAAGGTTCCTCCACAAGCAAACTCTC 1894
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1856 AGGGAAAGGCTGTTGCATCTGATGGAAGCCAATCTAAGGTTCCTCCACAAGCAAACTCTC 1915
Query 1895 CCCAGCAGCCCAAGGATACAGCCTCTGCCAGGAAATATTATGGACCGTTGTTTGATTTTC 1954
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 CCCAGCCGCCCAAGGATACAGCCTCTGCCAGGAAATATTATGGACCGTTGTTTGATTTTC 1975
Query 1955 CCTTTTTCACTCGAAAACTTGATTCTTATGGGTCTGCAACAGCCAATGCCAATAACAATC 2014
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1976 CCTTTTTCACTCGAAAACTTGACTCTTATGGGTCTGCAACAGCCAATGCCAATAACAATC 2035
Query 2015 TCACATTAGCATATGATATTAAAGATCTGATTTGTGATGAAGGTGCAGAGTTCCTTAGTA 2074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036 TCACATTAGCATATGATATTAAAGATCTGATTTGTGAAGAAGGTGCAGAGTTCCTTAGTA 2095
Query 2075 AGAAAAGAACAGACAGTTTGAAGAAGATAAATGGTCTGCTAGCAAAAAATTTAGAAAGGA 2134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2096 AGAAAAGAACAGACAGTTTGAAGAAGATAAATGGTCTGCTAGCAAAAAATTTAGAAAGGA 2155
Query 2135 AAAGGATTAGGCCTGATCTTGTTTTACGGCTTCAAATTGAAGAGAAAAAGCTTAGGCTAT 2194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2156 AAAGGATTAGGCCTGATCTTGTTTTACGGCTTCAAATTGAAGAGAAAAAGCTTAGGCTAT 2215
Query 2195 C-GAATCTTCAGTCTCGTGTTAGAGAGGAAGTGGATCGACAACAACAGGAGATAATGTCC 2253
| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 CTG-ATCTTCAGTCTCGTGTTAGAGAGGAAGTAGATCGACAACAACAGGAGATAATGTCC 2274
Query 2254 ATGCCCGATAGGCCATACCGCAAATTTGTGAGGTTGTGCGAACGGCAACGCCTTGAAATG 2313
||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2275 ATGCCGGATAGGCCGTACCGCAAATTTGTGAGGTTATGCGAACGGCAACGCCTAGAAATG 2334
Query 2314 AATAGACAAGTACTGGCCAACCAGAAAGCTGTTAGAGAGAAGCAGCTGAAAACCATTTTT 2373
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2335 AATAGACAAGTACTGGCCAATCAGAAAGCTGTCAGAGAGAAGCAGCTGAAAACCATTTTT 2394
Query 2374 CAGTGGCGTAAGAAACTCCTTGAGGCTCACTGGGCTATACGTGATGCACGCACTGCTCGT 2433
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2395 CAGTGGCGTAAGAAACTCCTTGAGGCTCATTGGGCTATACGTGATGCACGCACTGCTCGT 2454
Query 2434 AACAGGGGAGTGGCCAAATACCATGAAAAGATGTTGAGAGAGTTTTCGAAGAGAAAAGAT 2493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2455 AACAGGGGAGTGGCCAAATACCATGAAAAGATGTTGAGAGAGTTTTCAAAGAGAAAAGAT 2514
Query 2494 GATGGCCGGAACAAAAGGATGGAGGCCTTGAAGAATAATGATGTAGAAAGGTACAGGGAG 2553
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2515 GATGGCCGCAACAAAAGGATGGAGGCCTTGAAGAATAATGATGTAGAAAGATACAGGGAG 2574
Query 2554 ATGTTGCTGGAACAGCAAACAAATATGCCTGGTGATGCTGCTGAAAGATATGCTGTTCTC 2613
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2575 ATGTTGCTGGAACAGCAAACTAATATGCCTGGTGATGCTGCTGAAAGATATGCTGTTCTC 2634
Query 2614 TCTTCATTTTTGACCCAAACCGAAGATTATCTTCATAAACTTGGAGGTAAGATTACTGCC 2673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2635 TCTTCATTTTTGACCCAAACCGAAGATTATCTTCATAAACTTGGAGGTAAGATTACTGCC 2694
Query 2674 ACAAAAAATCAACAGGAAGTGGAGGAGGCAGCGAATGCTGCAGCAGTAGCAGCCAGATTG 2733
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2695 ACAAAAAATCAACAGGAAGTGGAGGAGGCAGCAAATGCTGCAGCAGTAGCAGCGAGATTG 2754
Query 2734 CAGGGCTTGTCAGAAGAAGAGGTCAGGGCAGCAGCTACTTGTGCTCGAGAAGAAGTTGTG 2793
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755 CAGGGGTTGTCAGAAGAAGAGGTCAGGGCAGCAGCTACTTGTGCTCGAGAAGAAGTTGTG 2814
Query 2794 ATCAGAAATAGATTTACGGAAATGAATGCGCCAAAAGAAAATTCATCTGTCAACAAGTAT 2853
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2815 ATCAGAAATAGATTTACGGAAATGAATGCGCCAAAAGAAAATTCATCTGTCAACAAGTAC 2874
Query 2854 TATACTCTGGCTCATGCTGTAAATGAAGTGGTTATAAGACAACCTTCAATGCTTCAGGCT 2913
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2875 TATACTCTGGCTCATGCTGTAAATGAAGTGGTTGTAAGACAACCTTCAATGCTTCAGGCT 2934
Query 2914 GGAACTTTGCGTGATTACCAGCTGGTTGGATTACAATGGATGCTATCGCTGTATAATAAC 2973
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2935 GGAACTTTGCGTGATTACCAGCTGGTTGGATTACAATGGATGCTATCGTTGTATAATAAC 2994
Query 2974 AAATTAAATGGGATCTTGGCTGATGAGATGGGTCTTGGAAAAACTGTGCAGGTAATGGCA 3033
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2995 AAATTAAACGGGATCTTGGCTGATGAGATGGGTCTTGGAAAAACTGTTCAGGTAATGGCA 3054
Query 3034 CTGATTGCTTACCTTATGGAGTTTAAGGGGAATTATGGACCGCATCTCATCATCGTTCCC 3093
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3055 CTGATTGCTTACCTTATGGAGTTTAAAGGGAATTATGGACCGCATCTCATCATCGTTCCC 3114
Query 3094 AATGCTGTTCTGGTGAATTGGAAGAGTGAACTCCATACTTGGCTGCCATCTGTTTCATGC 3153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3115 AATGCTGTTCTGGTGAATTGGAAGAGTGAACTCCATACTTGGCTGCCATCTGTTTCATGC 3174
Query 3154 ATATATTATGTTGGTACAAAGGATCAACGTTCAAAATTGTTCTCTCAGGAGGTTTGCGCC 3213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3175 ATATATTATGTTGGTACAAAGGATCAACGTTCAAAATTGTTCTCTCAGGAGGTTTGCGCC 3234
Query 3214 ATGAAGTTCAATGTCCTCGTTACGACTTATGAGTTCATTATGTATGATCGATCAAAACTC 3273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3235 ATGAAGTTCAATGTCCTCGTTACGACTTATGAGTTCATTATGTATGATCGATCAAAACTC 3294
Query 3274 TCAAAAGTTGACTGGAAATATATTATAATTGATGAAGCACAACGGATGAAGGACAGAGAA 3333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3295 TCAAAAGTTGACTGGAAATATATTATAATTGATGAAGCACAACGGATGAAGGACAGAGAA 3354
Query 3334 TCTGTTTTGGCCCGAGATCTTGACCGGTATCGCTGCCAGAGGAGATTACTTCTCACTGGA 3393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3355 TCTGTTTTGGCCCGAGATCTTGACCGGTATCGCTGCCAGAGGAGATTACTTCTCACTGGA 3414
Query 3394 ACACCTTTGCAGAACGATCTGAAAGAGCTTTGGTCACTATTGAACCTTCTCCTTCCTGAT 3453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3415 ACACCTTTGCAGAACGATCTGAAAGAGCTTTGGTCACTATTGAACCTTCTCCTTCCTGAT 3474
Query 3454 GTCTTTGACAATCGAAAAGCATTTCATGATTGGTTTGCGCAACCCTTTCAAAAAGAAGGT 3513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3475 GTCTTTGACAATCGAAAAGCATTTCATGATTGGTTTGCGCAACCCTTTCAAAAAGAAGGT 3534
Query 3514 CCTGCGCATAATATAGAGGATGACTGGCTGGAGACTGaaaaaaaGGTTATAGTCATTCAC 3573
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3535 CCTGCGCATAATATAGAAGATGACTGGCTGGAGACTGAAAAAAAGGTCATAGTCATTCAC 3594
Query 3574 AGACTTCATCAAATTTTAGAGCCATTCATGCTCAGACGCCGTGTTGAGGATGTGGAAGGG 3633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3595 AGACTTCATCAAATTTTAGAGCCATTCATGCTCAGACGCCGTGTTGAGGATGTGGAAGGG 3654
Query 3634 TCACTTCCTGCTAAGGTTTCTGTAGTTTTAAGGTGTAGAATGTCTGCTATTCAGAGTGCC 3693
|||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3655 TCACTTCCTGCTAAGGTTTCTGTAGTCTTACGATGTAGAATGTCTGCTATTCAGAGTGCC 3714
Query 3694 GTTTATGATTGGATTAAAGCGACTGGAACTCTTAGAGTTGATCCAGACGATGAAAAACTT 3753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3715 GTTTATGATTGGATTAAAGCGACTGGAACTCTTAGAGTTGATCCAGACGATGAAAAACTT 3774
Query 3754 AGGGCCCAGAAGAATCCAATATACCAAGCCAAGATATATAGAACTTTAAATAATAGGTGC 3813
||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 AGGGCTCAAAAGAATCCGATATACCAAGCCAAGATATATAGAACTTTAAATAATAGGTGC 3834
Query 3814 ATGGAGTTGAGGAAAGCCTGCAATCATCCTTTACTCAACTATCCATATTTCAACGACTTT 3873
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 3835 ATGGAGTTGAGGAAAGCCTGCAATCATCCTTTGCTCAATTATCCATATTTCAATGACTTT 3894
Query 3874 TCCAAAGATTTCCTCGTAAGGTCATGTGGAAAATTGTGGATTCTGGATAGGATCCTTATA 3933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3895 TCCAAAGATTTCCTCGTAAGGTCATGTGGAAAATTGTGGATTCTGGACAGGATCCTTATA 3954
Query 3934 AAGCTACAGAGGACAGGCCATCGTGTATTGCTCTTCAGTACAATGACTAAACTTCTTGAT 3993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3955 AAGCTACAGAGGACAGGCCATCGTGTATTGCTCTTCAGTACAATGACTAAACTTCTTGAT 4014
Query 3994 ATCTTGGAAGAGTATCTACAATGGAGAAGGCTTGTATACAGAAGAATAGATGGGACTACC 4053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4015 ATCTTGGAAGAGTATCTACAATGGAGAAGGCTTGTATACAGAAGAATTGATGGGACTACC 4074
Query 4054 AGCCTAGAAGATCGGGAATCAGCTATTGTGGACTTCAATGATCCTGATACGGATTGCTTT 4113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4075 AGCCTAGAAGATCGGGAATCAGCTATTGTGGACTTCAATGATCCTGATACGGATTGCTTT 4134
Query 4114 ATCTTCTTGCTTAGTATACGTGCAGCTGGACGGGGTCTCAACCTTCAGACTGCTGACACA 4173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4135 ATCTTCTTGCTTAGTATACGTGCAGCTGGACGGGGTCTCAACCTTCAGACTGCTGACACA 4194
Query 4174 GTTGTGATATATGATCCGGATCCAAATCCCAAGAATGAGGAACAAGCAGTTGCCAGAGCC 4233
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4195 GTTGTTATATATGATCCTGATCCAAATCCCAAGAATGAGGAACAAGCAGTTGCCAGAGCC 4254
Query 4234 CATCGTATAGGGCAGACAAGGGAAGTAAAAGTGATTTATATGGAGGCAGTTGTTGAAAAA 4293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4255 CATCGTATAGGGCAGACAAGGGAAGTAAAAGTGATTTATATGGAGGCAGTTGTTGAAAAA 4314
Query 4294 ATCTCCAGCCATCAAAAGGAGGACGAGCTTAGAAGTGGTGGTTCAATAGACCTAGAGGAT 4353
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4315 CTCTCCAGCCATCAAAAGGAGGACGAGCTTAGAAGTGGTGGTTCAGTAGACCTAGAGGAT 4374
Query 4354 GACATGGCTGGGAAGGACCGATATATAGGATCTATAGAGGGTCTCATAAGGAATAATATT 4413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4375 GACATGGCTGGGAAGGACCGATATATAGGATCTATAGAGGGTCTCATAAGGAATAATATT 4434
Query 4414 CAACAGTATAAGATTGACATGGCTGATGAGGTCATTAATGCTGGGCGTTTTGACCAAAGG 4473
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4435 CAACAGTATAAGATTGACATGGCTGATGAGGTCATTAATGCTGGTCGTTTTGACCAAAGG 4494
Query 4474 ACAACTCATGAAGAGCGACGAATGACATTGGAGACTCTATTGCATGACGAAGAGAGATAT 4533
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4495 ACAACTCATGAAGAGCGACGAATGACATTGGAGACTTTATTGCATGACGAAGAGAGATAT 4554
Query 4534 CAAGAAACTGTCCATGATGTACCTTCTCTGCATGAGGTGAACAGGATGATTGCCAGAAGC 4593
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4555 CAAGAAACTGTCCATGATGTACCTTCTCTGCATGAGGTGAACAGAATGATTGCCAGAAGC 4614
Query 4594 GAAGAGGAAGTTGAGTTATTTGATCAGATGGATGAAGAATTTGACTGGACGGAGGAGATG 4653
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4615 GAGGAGGAAGTTGAGTTATTTGATCAGATGGATGAAGAATTTGACTGGACGGAGGAGATG 4674
Query 4654 ACTAATCATGAGCAGGTGCCTAAGTGGCTTCGAGCTAGTACCAGAGAGGTGAATGCTACT 4713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4675 ACTAATCATGAGCAGGTGCCTAAGTGGCTTCGAGCTAGTACCAGAGAGGTGAATGCTACT 4734
Query 4714 GTTGCTGATTTGTCTAAGAAACCTTCAAAGAACATGTTGTCTAGCAGTAATCTGATTGTG 4773
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4735 GTTGCTGATTTGTCTAAGAAACCGTCAAAGAACATGTTGTCTAGCAGTAACCTGATTGTA 4794
Query 4774 CAACCTGGTGGACCGGGAGGTGAGAGAAAAAGGGGGCGGCCCAAGAGCAAAAAGATTAAC 4833
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4795 CAACCTGGTGGACCTGGAGGTGAGAGAAAAAGGGGCCGGCCCAAGAGCAAAAAGATTAAC 4854
Query 4834 TACAAGGAAATTGAAGATGACATTGCAGGTTACTCTGAGGAAAGCTCTGAGGAAAGGAAC 4893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4855 TACAAGGAAATTGAAGATGACATTGCAGGTTACTCTGAGGAAAGCTCTGAGGAAAGGAAC 4914
Query 4894 ATTGATTCTGGGAATGAAGAAGAGGGAGATATTCGACAATTTGATGATGATGAACTTAC- 4952
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4915 ATTGATTCTGGGAATGAAGAAGAGGGAGATATTCGACAATTTGATGATGATGAACTTACT 4974
Query 4953 GGTCGCTCTTGGAGATCACCAAACCAACAAGGGAGAATCTGATGGAGAGAACCCTGTCTG 5012
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 4975 GG-CGCTCTTGGAGATCATCAAACCAACAAGGGAGAATTTGATGGAGAGAACCCCGTCTG 5033
Query 5013 TGGTTATGATTATCCTCCGGGTTCTGGTAGTTATaaaaaaaTTCCTCCTCGTGATGATGC 5072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5034 TGGTTATGATTATCCTCCGGGTTCTGGTAGTTATAAAAAAAATCCTCCTCGTGATGATGC 5093
Query 5073 CGGTTCTTCAGGATCTTCTCCAGAGAGCCATAGATCGAAAGAGATGGCATCTCCTGTTTC 5132
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5094 TGGTTCGTCAGGATCTTCTCCAGAGAGCCATAGATCGAAAGAAATGGCATCTCCTGTTTC 5153
Query 5133 TTCACAAAAGTTTGGCTCTTTGTCTGCATTGGACACTAGGCCAGGTTCTGTCTCAAAAAG 5192
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5154 TTCACAAAAGTTTGGCTCTTTGTCTGCATTGGACACTAGGCCAGGTTCTGTCTCTAAAAG 5213
Query 5193 ACTGCTGGATGACCTAGAAGAGGGGGAAATAGCAGCATCAGGGGATTCTCACGTAGATCT 5252
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5214 ACTGCTGGATGACCTAGAAGAGGGGGAAATAGCAGCATCAGGGGATTCTCACATAGATCT 5273
Query 5253 CCAACGATCAGGAAGTTGGGCCCATGACCGTGATGAAGGGGATGAAGAACAGGTTTTGCA 5312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5274 CCAACGATCAGGAAGTTGGGCCCATGACCGTGATGAAGGGGATGAAGAACAGGTTCTGCA 5333
Query 5313 ACCTACGATAAAACGAAAACGGAGTATTCGTCTACGACCCCGTCAAACGGTAGACAGAGT 5372
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||
Sbjct 5334 ACCTACGATAAAACGGAAACGGAGTATTCGTCTAAGACCCCGTCAGACGGCAGAAAGAGT 5393
Query 5373 TGACGGTAGTGAGATGCCTGCAGCTCAGCCATTACAAGTTGATCGTAGCTACCGATCAAA 5432
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5394 TGACGGTAGTGAGATGCCTGCAGCTCAGCCATTGCAAGTGGATCGTAGCTACCGATCAAA 5453
Query 5433 GTTAAGGACAGTTGTTGACTCGCATGGTTCAAGACAAGATCAGAGTGATTCGTCCTCTAG 5492
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5454 GTTAAGGACAGTTGTTGACTCGCATAGTTCAAGACAAGATCAGAGTGATTCGTCCTCGAG 5513
Query 5493 ACTTAGGAGTTTACCTGCAAAGAAGGTAGCTAGTACTTCCAAACTCCATGTATCATCACC 5552
||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5514 ACTAAGGAGTGTACCTGCAAAGAAGGTAGCTAGTACTTCCAAACTCCATGTCTCATCACC 5573
Query 5553 AAAATCTGGTAGATTGAATGCCACACAGCTTACCGTGGAGGATAACGCTGAAGCTTCCAG 5612
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5574 AAAATCTGGTAGATTGAATGCTACACAGCTTACCGTGGAGGATAACGCTGAAGCTTCCAG 5633
Query 5613 AGAAACATGGGATGGAACTAGTCCTATTGGCTCTTCAAATACTGGTGCAAGAATGTCCCA 5672
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5634 AGAAACATGGGATGGAACTAGTCCTATTAGCTCTTCAAATGCTGGTGCAAGAATGTCCCA 5693
Query 5673 CATCATACAGAAACGGTGCAAAAACGTGATTAGCAAGCTCCAAAGGAGAATCGACAAGGA 5732
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5694 CATCATACAGAAACGGTGCAAAATCGTGATTAGCAAGCTCCAGAGGAGAATCGACAAGGA 5753
Query 5733 AGGTCAGCAGATTGTACCTATGCTGACAAATTTGTGGAAGAGAATTCAGAATGGTTATGC 5792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5754 AGGTCAGCAGATTGTACCTATGCTGACAAATTTGTGGAAGAGAATTCAGAATGGTTATGC 5813
Query 5793 AGCTGGAGGTGTAAATAACCTTTTGGAACTACGAGAGATAGACCAGCGAGTAGAAAGACT 5852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 5814 AGCTGGAGGTGTAAATAACCTTTTGGAACTACGAGAGATAGACCACCGGGTAGAAAGACT 5873
Query 5853 AGAGTACGCAGGAGTTATGGAACTCGCATCTGACGTGCAGTTAATGCTAAGGGGAGCAAT 5912
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5874 AGAGTATGCAGGAGTTATGGAACTCGCATCTGACGTGCAGTTAATGCTAAGGGGAGCAAT 5933
Query 5913 GCAATTCTATGGATTTTCACATGAGGTGAGATCTGAAGCAAGGAAGGTTCACAATCTGTT 5972
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5934 GCAATTCTATGGGTTTTCACATGAGGTGAGATCTGAAGCAAAGAAGGTTCACAATCTGTT 5993
Query 5973 CTTTGATCTATTAAAGATGTCTTTCCCAGACACAGATTTCCGGGAAGCAAGGAATGCTCT 6032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5994 CTTTGATCTATTAAAGATGTCTTTCCCAGACACAGATTTCCGGGAAGCAAGGAATGCTCT 6053
Query 6033 TTCCTTTTCTGGCCCAATCCCAAATTTGGTGTCTACACCATCCCCAAGAGGAGCAGGCAT 6092
||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 6054 TTCCTTTTCTGGCTCAGCCCCAACTTTGGTGTCTACACCAACCCCAAGAGGAGCAGGAAT 6113
Query 6093 TAGCCAAGGCAAGAGGCAAAAGTTGGTAAACGAGGCGGAACCCGAGCCAAGCTCTCCTCA 6152
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 6114 TAGCCAAGGCAAGAGGCAAAAGTTAGTAAACGAGCCGGAAACCGAGCCAAGCTCTCCTCA 6173
Query 6153 GAGATCTCAACAACGTGAGAACTCAAGGATCAGAGTACAGATACCGCAGAAAGAAACAAA 6212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6174 GAGATCTCAACAACGTGAGAACTCAAGGATCAGAGTACAGATACCGCAGAAAGAAACAAA 6233
Query 6213 TCTTGGGGGCACAACAAGCCACACTGATGAATCCCCAATTTTAGCTCATCCAGGGGAATT 6272
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6234 GCTTGGGGGGACAACAAGCCACACTGATGAATCCCCAATATTAGCTCATCCAGGGGAATT 6293
Query 6273 AGTTATCTGCAAGAAGAAGAGGAAAGACCGAGAGAAGTCTGCTCCGAAAACCCGAACTGG 6332
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 6294 AGTAATCTGCAAGAAAAAGAGGAAAGACCGAGAGAAGTCTGGTCCGAAAACCCGAACTGG 6353
Query 6333 TGGCTCCAGCAGCCCAGTTTCACCACCTCCAGCTATGATTGGTCGTGGTCTTAGAAGTCC 6392
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6354 TGGCTCCAGCAGCCCAGTTTCACCACCTCCAGCAATGATTGGTCGTGGTCTTAGAAGTCC 6413
Query 6393 TGTGTCTGGTGGAGTTCCAAGGGAAACAAGGCTAGCACAGCAGCAGCGCTGGCCAAACCA 6452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 6414 TGTGTCTGGTGGAGTTCCAAGGGAAACAAGGCTAGCACAACAGCAGCGGTGGCCAAACCA 6473
Query 6453 ACCCACTCATCCAAACAACAGCGGTGCGGCCGGTGATTCCGTGGGATGGGCAAATCCGGT 6512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6474 ACCCACTCATCCAAACAACAGCGGTGCGGCCGGTGATTCTGTGGGATGGGCAAATCCGGT 6533
Query 6513 GAAGAGGTTAAGGACAGATTCTGGTAAAAGACGGCCTAGCCATTTATAG 6561
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6534 GAAGAGGTTAAGGACAGATTCTGGTAAAAGACGGCCTAGCCATTTATAG 6582
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 327521116753
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5