BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg483787

Length=3665
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT2G46340.1 | Symbols: SPA1 | SPA (suppressor of phyA-105) prot...  5400    0.0  


> AT2G46340.1 | Symbols: SPA1 | SPA (suppressor of phyA-105) protein 
family | chr2:19022173-19027413 REVERSE LENGTH=3799
Length=3799

 Score = 5400 bits (2924),  Expect = 0.0
 Identities = 3464/3714 (93%), Gaps = 79/3714 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  6     AAAGAGAGATTCATAT-T-ATCATC-A-A-TATATGACAAATTTATAGCCTCACctttct  60
             ||||||| ||| |||| | || ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75    AAAGAGATATT-ATATGTAATTATCAATAGTATATGACAAATTTATAGCCTCACCTTTCT  133

Query  61    tcttcttctt-tt-tgaatt-tgctttcttcaagaggttt-cttcttcttGGAA-CCGTT  115
             |||||||||| || |   || || | | ||   ||  ||| | | |||||  ||   |||
Sbjct  134   TCTTCTTCTTCTTCT-TCTTCTG-TGTGTTTTTGA-ATTTGC-T-TTCTT-CAAGAGGTT  187

Query  116   TGGAT-T---CACCGCTTCGGTTTATGATCTGATTGTGATGAGAT-TCGAT-T-TGTTTT  168
             |   | |   |||||||||||| |||||||||||||||||    | ||||| | ||   |
Sbjct  188   T-CTTCTCCACACCGCTTCGGTGTATGATCTGATTGTGAT-CTCTCTCGATATCTGGGAT  245

Query  169   TTGTATAAGGTATGGAGGCTGTAG---ATTGTTATCATTCCATGT-G-GC-AATG-AAT-  220
              | |    ||||||||||||||||   ||| |||| ||| | ||| | ||  ||| ||| 
Sbjct  246   CT-T-CGGGGTATGGAGGCTGTAGATTATTATTATTATTACGTGTGGTGCTGATGCAATG  303

Query  221   -GTG--GATGCCTGCTATGGAAAGAGTAGCTGAAGAAACTGTGGCGAGTAACAACAACAT  277
              |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||
Sbjct  304   AGTGTTGATGCCTGTTATGGAAAGAGTAGCTGAAGAAACTGTGGCGACT---AACAACAT  360

Query  278   ACAATTGAAAGGACGAGTGGATGATGTTCCTTG---TACGCTTGATGCTCTTCATAGTAA  334
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||   |
Sbjct  361   ACAATTGAAAGCACGAGTGGATGATGTTCCTTGTAATAAGCTTGATGCTCGTCATAACGA  420

Query  335   TATGGTGATTGAATCAGAAACTAG-AAACAGTGACTGTCCTGGAAGCTCAGCTCACAGGA  393
             |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   TATGGTGATTCAATCAGAAACT-GCAAACAGTGATTGTCCTGGAAGCTCAGCTCACAGGA  479

Query  394   ATCTTGAGATGACTAAGCCGCCGCCTCCGGAGGAATCTGCTGGAGCTAAGCTTTCTGTTG  453
             || ||||  ||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||
Sbjct  480   ATGTTGATTTGACTAAGCCGCCGCCTCCTGAGGAAGCCGCAGGAGCTAAGCTTTCTGTTG  539

Query  454   AAGAGTTGACATTGGGGAACTATAGGATTGTTCAAGGGACTACTACTACTAATATGGATA  513
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||| ||||||
Sbjct  540   AAGAGTTGACATTGGGGAACTACAGGATTGTTCAAGGGAGTAATAATACTAATGTGGATA  599

Query  514   GTTCTAGGGCTGGGAAGTTTGAGCATCTTTATCGTCTT-GCTAGAGGGTCTTCTCTAAGG  572
             || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || | |||
Sbjct  600   GTCCTAGGGCTGGCAAGTTTGAGCATCTTTATCGT-TTGGCTAGAGGGTCTGCTTTTAGG  658

Query  573   GCAGGAGATGGGGATCTTGATTCTCAACCTCGTGACATGGATCAAATGTTGTCAAGAATT  632
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| 
Sbjct  659   GCAGGAGATGGGGATCTTGATTCTCAACCTCGTGATATGGATCAAATGTTGTCCAGAATC  718

Query  633   AGACAACAGCTTGCTGGAGCTCCTTCCGAAAGGCAAAACCTGAAACCTTTTATGACTAGG  692
             |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct  719   AGACAACAGCTTGCTGGAGCTCCTTCTGAGAGGCAAAACTTGAAACCTTTTATGTCTAGG  778

Query  693   AGGAGCGATCAGAATCTTGAATCTTTTTCTGAACGTCTAAGAGCAGCTGGTGAGAACAGT  752
             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  779   AGGAGCGATCAGAATCTTGAAGCTTTTTCTGAACGTCTAAGAGCAGCTGGTGAGAATAGT  838

Query  753   ATTATGAAAGCTCCTGCATTGATCAGTAGTGAAGGTGTCCAATTGAACACGCC--T--G-  807
             |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||  |  | 
Sbjct  839   ATTATGAATGCTCCTGCATTGATC---AGTGAAGGTGTCCAAATGAAAACGCCGGTGAGT  895

Query  808   ---TC-AATTTTTCTCAGTTGTTACTTAAAAGAGCTATGAAGGGGAAAGGGGTAGTAGGA  863
                || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  896   TCTTCGAATTTTTCTCAGTTGTTACTTAAAAGAGCTATGAAAGGGAAAGGGGTAGTAGGA  955

Query  864   AAGAACCAGGAGTCTCCTCCTGAATTTGTCTCTGACCAAGATTTAGGAAGCAAGGaaaaa  923
             |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956   AAGAACCAGGAAACTCCTCCTGAATTTGTCTCTGATCAAGATTTAGGAAGCAAGGAAAAA  1015

Query  924   aaGTTGGATAGTAGCAAGTCGCCTACTCCTCACCATGTGTTACCCCTAAAATCAAGTCCC  983
             |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1016  AAGTTGGATATTAGCAAGTCGCCTACTCCTCACGATGTGTTACCTCTAAAATCAAGTCCC  1075

Query  984   AAAGGAAATGGGATGGTATCACATGGTGATGGGAATCATACTAAATCTTCTTA-TGGAAT  1042
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||
Sbjct  1076  AAAGGAAATGGTATGGTATCACATGGTGATGGGAATCATAGTAAATCTTC-TATTGGAAT  1134

Query  1043  CAGTTTGAGGGAGTTTCTTAGATCAAGTTATGTTAAACGAGAGAAAAGACATGGCCTTTG  1102
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct  1135  CAGTTTGAGGGAGTTTCTTAGATCAAGTTATGCTAAAAGAGAAAAAAGACATGGCCTTTG  1194

Query  1103  TCTATTTAGGCAGCTGGTGGAGCTGGTTGACTCAGCCCATTCAAAAGGATTATTCTTGCT  1162
             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  1195  TCTATTTAGGCAGCTGGTGGAACTGGTTGACTCAGCCCATTCAAAAAGATTATTCTTGCT  1254

Query  1163  AGACTTGAGACCATCCCTTTTCACTTTAGTTCCATCGAAGAAACTTAGATATATTGGTAC  1222
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| 
Sbjct  1255  AGACTTGAGACCATCCCTTTTCACTTTAGTTCCATCAAAGAAACTTAGATATATTGGTAA  1314

Query  1223  TTTTGGAAAGAACGATCTAGACTCAGATGTTGACGAAGATTTGAATAGGAGGAGGCCTGT  1282
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1315  TTTTGGAAAGAACGATCTAGAATCAGATGTTGACGAAGATTTGAATAGGAGGAGGCCTGT  1374

Query  1283  TGTTCAGGAATCATCTATTGGAGGTAGGGATTCAAAGAAAAGAAAAATGGACTTGCATGT  1342
             |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  1375  TGTTGAGGAATCATCTAGTGGAGGTAGGGATTCGAAGAAAAGAAAAATGGACTTGCATTT  1434

Query  1343  GCATTCTCCAGGGAGTCAACTTCAGGCCACTTCAACCAGGAGACCTTTCAAAAGGAAAAG  1402
             | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct  1435  GAATTCTCCAGGGAATCAACTTCAGGCCACTTCAACCGGGCGACCTTTCAAAAGGAAAAG  1494

Query  1403  CCCTGTGATTGATTTAAATGTGGTTGATGCACGTAATCCAGACAGTTGCGAGCTTCAACA  1462
             ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1495  CCCTGTGATTGATTTAAACATGGTTGATGCACGTAATCCAGACAGTTGCGAGCTTCAACA  1554

Query  1463  GCAAGACTATATCAAAAATTTAAGTGTGTCTTCAATGACGAGAAAACAGTCTATGTCCAC  1522
             ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct  1555  GCAAGACTACATAAAAAATTTAAGCGTGTCTTCAGTGTCGAGAAAACAGTCTATGTCCAC  1614

Query  1523  ATGGCTAGAAGAGCAATGGTATACTTGTCCAGAGGAGATTAATGGAGAAGATATCGGAGA  1582
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct  1615  ATGGCTAGAAGAGCAATGGTATACTTGTCCAGAGGAGATAAATGGAGAAGATATTGGAGA  1674

Query  1583  TAAATCAAATATATATGCCCTTGGTGTTCTTCTGTTTGAGTTGCTATGCCATTGCGAGTC  1642
              ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1675  AAAATCAAATATTTATGCCCTTGGTGTTCTTCTGTTTGAGTTGCTATGCCATTGCGAGTC  1734

Query  1643  CGGTGAAATGCATGCTGCAATGATGGCAGATTTACGCCATCGGATTCTCCCACCAACATT  1702
              || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1735  AGGCGAGATGCATGCTGCAATGATGGCAGATTTACGCCATCGGATTCTCCCACCAACATT  1794

Query  1703  TCTCTCAAAATACCCGAAGGAAGCTGGATTTTGTCTTTGGCTTCTACATCCTGAACCCTC  1762
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1795  TCTCTCGAAATACCCGAAGGAAGCTGGATTTTGTCTTTGGCTTCTACATCCTGAACCCTC  1854

Query  1763  GTCCCGACCAACAGCTAGAGATATACTGAAGTCAGAGTTGATATGCGAGGATGATTCAGT  1822
              ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1855  CTCCCGACCATCAGCTAGAGATATACTAAAGTCAGAGTTGATATGCGAGGATGATTCAGT  1914

Query  1823  TAAATCGACTGCTGCTGCTGAGGAGATATCTGAGCTCTTACTTCATTTTTTGTCTTC-TC  1881
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | 
Sbjct  1915  TAAATCGACTGCTGCTGCTGAGGAGATATCTGAGCTGTTACTTCATTTTTTGTCTTCAT-  1973

Query  1882  TAGAAGTGCAGAAGCAGAAAAAAGCATCTAAGCTTTTGCAAGACATCCAGACCTTAGAGG  1941
             |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1974  TAGAAGTGCAGAAGAAGAAAAAAGCATCTAAACTTTTGCAAGATATCCAGACCTTAGAGG  2033

Query  1942  ATGATATCAAGGAGGCCGAGCGAAGATATTCTTCAAATGTATCTCTGGTGAGATCTCATG  2001
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2034  ATGATATTAAGGAGGCCGAGCGAAGATATTCTTCAAATGTATCTCTGGTGAGATCTCATG  2093

Query  2002  GAGCTATTGAAAGAAGGGTGCAATCATCTCCCCTAGACGAGCACTGTACAACTTCTGGCG  2061
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |
Sbjct  2094  GAGCTATTGAAAAAAGGGTGCAATCATCTCCCCTAGACGAGCACTGTACAACTTCCAGTG  2153

Query  2062  TCTTGCTTGTACCAAGTGCTAATACAGACAGGCTGATGAGTAATATCCGTCAACTTGAAG  2121
              |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2154  CCTTGTTTGTACCAACTGCTAATACAGACAGGCTGATGAGTAATATCCGTCAACTTGAAG  2213

Query  2122  ATGCATATTTCTTCATGCGATCACAAATCAACTTGTCGAGTTCTGCTGCTAGTACCCGTT  2181
             |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||
Sbjct  2214  ATGCATATTTTTTCATGCGATCACAAATCAACTTATCGAGTTCTGCTGCTACTGCCCGTT  2273

Query  2182  CTGAAAAAATTGTACTAAAGGACAGGGACAGATGCTCTGAAAACCAAAATGAAAATCAGT  2241
             |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2274  CTGACAAAA---CACTAAAGGACAGGGACAGATGCTCTGAAAACCAAAATGAAAATCAGG  2330

Query  2242  TTATGAGTACCAAAGGAAAATCTTCAGATCAACTGGAAGTGTTTTTCGAGGGGTTGTGCA  2301
              ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2331  ATATGAGTACCAAAGGAAAATCTTCAGATCAACTCGAAGTGTTTTTCGAGGGGTTGTGCA  2390

Query  2302  AATTTGCTCGGTATAGCAAGTTCGAAACCTGTGGGACAATAAGAAGTGGGGACCTTTTAA  2361
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2391  AATTTGCTCGGTATAGCAAGTTCGAAACCTGTGGGACAATAAGAAGTGGGGACCTTTTAA  2450

Query  2362  ACTCTGCAAGTGTGGTCTGCTCATTGAGTTTTGACCCTGATGAGGAACACATAGCAGCAG  2421
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  2451  ACTCTGCAAGTGTGGTCTGCTCGTTGAGTTTTGACCCTGATGAAGAACACATAGCAGCAG  2510

Query  2422  CTGGGATATCAAAGAAGATCAAGATTTTTGACTTCAATGCATTTATGAATGAATCTGTCG  2481
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2511  CTGGGATATCAAAGAAGATCAAGATTTTTGACTTCAATGCATTTATGAATGAATCTGTCG  2570

Query  2482  GTGTTCATTATCCACTAGTAGAGATGGTCAACAAATCTAAATTAAGCTGTGTTTGCTGGA  2541
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2571  GTGTTCATTATCCACTAGTAGAGATGGTCAACAAATCTAAATTAAGCTGTGTTTGCTGGA  2630

Query  2542  ATAGCTACATCAAAAACTACTTGGCCTCGACTGACTACGATGGTGTAGTTCAGATTTGGG  2601
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  2631  ATAGCTACATCAAAAACTACTTGGCCTCGACTGACTACGATGGTGTAGTTCAGATATGGG  2690

Query  2602  ATGCCGGGACTGGACAAGGATTTTCGCAGTACACCGAACACCAAAAGAGAGCATGGTCAG  2661
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||
Sbjct  2691  ATGCCGGCACTGGACAAGGATTTTCGCAGTACACAGAACACCAGAAGAGAGCCTGGTCAG  2750

Query  2662  TTGATTTTTCTCCATCTGACCCGACAAAATTTGTCAGTGGAAGTGATGACTGCACGGTGA  2721
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  2751  TTGATTTTTCTCCATCTGACCCGACAAAATTTGTTAGTGGAAGTGATGACTGCTCGGTGA  2810

Query  2722  AACTTTGGAGCATCAATGAGAAACGTTCATTAGGCACAATCTGGAGTCCAGCAAATGTGT  2781
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2811  AGCTTTGGAGCATCAATGAGAAACGTTCATTAGGCACAATCTGGAGTCCAGCAAATGTGT  2870

Query  2782  GTTGCGTGCAATTCTCTTCTTATTCCAATCACTTATTGGCATTTGGGTCAGCTGATTACA  2841
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2871  GTTGCGTGCAATTCTCTTCTTATTCCAATCACTTATTGGCATTTGGGTCAGCTGATTACA  2930

Query  2842  AGGTCTATTGCTATGATCTTCGGTATGTCAAAACACCTTGGTGCACATTGGCTGGTCATG  2901
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2931  AGGTCTATTGCTATGACCTTCGGTATGTCAAAACACCTTGGTGCACATTGGCTGGTCATG  2990

Query  2902  AGAAAGCAGTGAGTTATGTTAAATTTATGGATTCAGAAACCATTGTTTCTGCTTCCACTG  2961
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2991  AGAAAGCGGTGAGTTATGTTAAATTTATGGATTCAGAAACCATTGTTTCTGCTTCCACTG  3050

Query  2962  ATAACTCTCTCAAGCTTTGGAATCTTAACAAGACAAATTCCTCTGGTTTATCTCCTGGTG  3021
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3051  ATAACTCTCTCAAGCTTTGGAATCTTAACAAGACAAATTCCTCTGGTTTATCTCCTGGTG  3110

Query  3022  CTTGTTCATTGACATATAAAGGACATACAAATCAGAAGAATTTTGTCGGATTGTCGGTTT  3081
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct  3111  CTTGTTCATTGACATATAAAGGACATACAAATCAGAAGAATTTCGTTGGATTGTCGGTTT  3170

Query  3082  TGGACGGGTACATAGCTTGTGGTTCAGAGACCAATGAGGTATATAGTTACTATAAATCCT  3141
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  3171  TGGACGGATACATAGCTTGTGGTTCAGAGACCAATGAGGTATATAGTTACTATAAATCTT  3230

Query  3142  TACCGATGCCAATGACTTCATACAAGTTTGGATCCGTCGATCCCATTTCTGGAAACGAAT  3201
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3231  TACCGATGCCAATGACTTCATACAAGTTTGGATCCGTCGATCCCATTTCTGGAAACGAAT  3290

Query  3202  ACTTTGATGACAATGGACAGTTTGTGTCGAGCGTCTGTTGGAGGAAAAAATCGAATATGC  3261
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3291  ACTTTGATGACAATGGACAGTTTGTGTCGAGCGTCTGTTGGAGGAAAAAATCGAATATGC  3350

Query  3262  TTGTAGCTGCAAACTCTACTGGAAACATGAAGCTGCTAAAACTTGTTTGACAACTTGGCG  3321
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  3351  TTGTAGCTGCAAACTCTACTGGAAACATGAAGCTACTAAAACTTGTTTGACAACTTGGCC  3410

Query  3322  TCTTCACTACTAC-G-GG-CATTGGACTCTTTGAGTCTGAAACTAGGACAAACCAGTT-T  3377
             | ||| ||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |
Sbjct  3411  TTTTCGCTACTACTGCGGGCATTGGACTTTTTGAGTCTGAAACTAGGACAAAGCAGGTCT  3470

Query  3378  GACTTTGAAG-AAACGTTTTTGTCCTGGAAATTA-GATCCTATATGACCAGAACAGaaaa  3435
             |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct  3471  GACTTTGAAGCAAACGTTTTTGTCCTGGAAACTATGATCCCATATGACCAGAAGAGAAAA  3530

Query  3436  aaaaaTT-GAAATCTTAGAGAAGTTGAAGAAGCAAAACTGTCTGTGGTAATAT-T-ATTT  3492
             |||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||
Sbjct  3531  AAAG-TTCGAAATCTTGGAGAAGTTGAAGAAGCAAAACTGTCTGTGATAATATATTATTT  3589

Query  3493  GATTCTTCTTCCTGTAATCCTATACATATGAGATATAATTTGAGATAA-CTTCTCAGATT  3551
             |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  3590  GATTCTTCTTCCTGTAATTCTATATATATGAGATATAATTTGAGATAAACTTCTCAGATT  3649

Query  3552  CTTCAGAAGTGATTCAGATTTGGTCGGCATAATGTGTAATGATGAGAGGTATATAACTTG  3611
             |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3650  CTTCAGAAATGATTCATATTTGGTCGGCATAACGTGTAATGATGAGAGGTATATAACTTG  3709

Query  3612  TACAAGTGTGTTATATCATTAGCTCAATTATGTAATTGTTGTTGGAGATTCTCT  3665
             ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3710  TACAAGTGTGTTATATCGTTAGCTCGGTTATGTAATTGTTGTTGGAGATTCTCT  3763



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 182507338634


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5