BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg484657
Length=4151
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G28860.1 | Symbols: ATMDR1, ATMDR11, PGP19, MDR11, MDR1, ATP... 6577 0.0
> AT3G28860.1 | Symbols: ATMDR1, ATMDR11, PGP19, MDR11, MDR1, ATPGP19,
ABCB19, ATABCB19 | ATP binding cassette subfamily B19
| chr3:10870038-10877506 REVERSE LENGTH=4228
Length=4228
Score = 6577 bits (3561), Expect = 0.0
Identities = 3982/4183 (95%), Gaps = 38/4183 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCTCATCACTTCAAAACAAGACACTCGTAGAAGAGTTCTTGAACTTCac--aa-aa---- 53
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 22 TCTCACCACTTCAAAACAAGACACTCGTAAAAGAGTTCTTGAACTTCACAAAACAATTGT 81
Query 54 ca-attttcaagaaaaacttt-ttaaac-aaaaa-a---ca-t-tttAT-tctctctctc 103
|| |||||||||||||||||| | |||| ||||| | || | ||| | ||||||||||
Sbjct 82 CAGATTTTCAAGAAAAACTTTATAAAACAAAAAACATTTCATTCTTTCTCTCTCTCTCTC 141
Query 104 t--ctGCTCAATGATCTCGTTTTCTCACTGAGCCAACTCGTTTCTTCTTTCTTTCTTTAA 161
| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 142 TCACTGCTCAATGATCTCGTTTTCTCACTAAACCAACTCGTTTCTTCTTACTTTCTTTAA 201
Query 162 CTCGGATCT--AAAAAACCATGTCGGAACCTAACACGACCGATGCCAAGACTGTTCCGGC 219
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 202 CTCGGATCTACAAAAAACCATGTCGGAAACTAACACAACCGATGCCAAGACTGTTCCAGC 261
Query 220 AGAAGCAGAGAAGAAGAAAGAACAGAGTTTACCATTCTTTAAACTCTTCTCTTTCGCTGA 279
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 262 AGAAGCAGAGAAGAAGAAAGAACAGAGTTTACCATTCTTTAAACTCTTTTCTTTCGCTGA 321
Query 280 TAAATTTGATTATCTCTTAATGTTCGTTGGTTCTCTTGGTGCCATTGTTCATGGCTCTTC 339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 322 TAAATTTGATTATCTCTTAATGTTCGTTGGTTCTCTTGGTGCCATTGTTCATGGCTCTTC 381
Query 340 CATGCCTGTCttttttttACTGTTTGGTCAAATGGTTAATGGATTTGGTAAAAACCAAAT 399
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 382 CATGCCTGTCTTCTTTTTACTCTTTGGTCAAATGGTTAATGGATTTGGTAAAAACCAAAT 441
Query 400 GGATTTACATCAAATGGTTCATGAAGTCTCAAAATATTCTCTGTATTTCGTCTACTTGGG 459
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 442 GGATTTACATCAAATGGTTCATGAAGTCTCTAGATATTCTCTATATTTCGTCTACTTGGG 501
Query 460 TTTGGTCGTTTGCTTCTCTTCATACGCAGAGATAGCATGTTGGATGTATTCTGGAGAAAG 519
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 502 TTTGGTCGTTTGCTTCTCTTCTTACGCAGAGATAGCATGTTGGATGTATTCTGGAGAAAG 561
Query 520 ACAAGTAGCAGCATTAAGGAAGAAATATCTTGAAGCAGTATTAAAACAAGACGTTGGGTT 579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 562 ACAAGTAGCAGCATTAAGGAAGAAATATCTTGAAGCAGTATTAAAACAAGACGTTGGGTT 621
Query 580 CTTTGATACTGATGCAAGAACTGGTGACATTGTCTTTAGTGTTTCTACTGATACTCTTCT 639
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622 CTTTGATACTGATGCTAGAACTGGTGACATTGTCTTTAGTGTTTCTACTGATACTCTTCT 681
Query 640 TGTTCAAGATGCCATTAGTGAAAAGGTTGGAAACTTTATACATTACCTATCAACATTTTT 699
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 682 TGTTCAAGATGCCATTAGTGAAAAGGTTGGAAACTTTATACATTACCTCTCAACATTTTT 741
Query 700 GGCGGGACTAGTCGTTGGATTTGTATCAGCATGGAAATTAGCTTTGTTAAGTGTTGCGGT 759
||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 742 GGCGGGATTAGTAGTTGGATTTGTATCAGCATGGAAATTAGCTTTGTTAAGTGTTGCTGT 801
Query 760 GATTCCCGGAATCGCTTTCGCCGGAGGTTTATACGCTTATACACTCACCGGAATTACTTC 819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 802 GATTCCCGGAATCGCTTTCGCCGGAGGTTTATACGCTTATACACTCACCGGAATTACTTC 861
Query 820 AAAGAGCCGTGAATCTTATGCTAACGCCGGCGTTATCGCCGAGCAGGCAATTGCTCAAGT 879
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 862 AAAGAGCCGTGAATCTTATGCTAACGCCGGTGTTATCGCCGAGCAGGCAATTGCTCAAGT 921
Query 880 TCGAACTGTTTACTCTTATGTTGGAGAGAGTAAGGCACTTAGTTCGTATTCGGATGCGAT 939
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 922 TCGAACTGTTTATTCTTATGTTGGAGAGAGTAAGGCACTTAATGCGTATTCGGATGCGAT 981
Query 940 TCAGTATACGCTTAAGCTCGGTTATAAAGCTGGGATGGCTAAAGGATTGGGTTTAGGATG 999
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 982 TCAGTATACGCTTAAGCTCGGTTATAAAGCGGGGATGGCTAAAGGGTTGGGTTTAGGATG 1041
Query 1000 TACTTATGGAATAGCTTGTATGTCATGGGCTTTGGTGTTTTGGTATGCCGGGGTTTTTAT 1059
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1042 TACTTATGGAATAGCTTGTATGTCATGGGCTTTGGTGTTTTGGTATGCTGGAGTTTTTAT 1101
Query 1060 TCGGAATGGGCAGACCGATGGAGGAAAGGCGTTTACGGCTATATTCTCTGCCATTGTTGG 1119
||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1102 TCGGAATGGACAAACCGATGGAGGAAAGGCGTTTACTGCTATATTCTCTGCTATTGTTGG 1161
Query 1120 TGGAATGAGTTTGGGACAATCTTTCTCCAATCTTGGGGCTTTTAGTAAAGGTAAAGCGGC 1179
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1162 TGGAATGAGTTTGGGGCAATCTTTCTCGAATCTTGGGGCGTTTAGTAAAGGTAAAGCGGC 1221
Query 1180 TGGTTACAAGCTGATGGAGATAATTAACCAGAGACCGACGATAATTCAAGACCCGTTAGA 1239
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1222 TGGTTATAAGTTGATGGAGATAATTAACCAGAGACCGACGATAATTCAAGACCCGTTGGA 1281
Query 1240 CGGAAAATGCTTGGATCAAGTTCATGGGAACATTGAGTTTAAAGATGTGACTTTTAGCTA 1299
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1282 TGGAAAATGTTTGGATCAAGTTCATGGGAACATTGAGTTTAAAGATGTGACTTTTAGCTA 1341
Query 1300 TCCTTCACGGCCTGATGTTATGATATTCAGAAACTTTAATATTTTCTTTCCTTCTGGGAA 1359
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1342 TCCTTCACGGCCTGATGTTATGATCTTCAGGAACTTTAATATTTTCTTCCCTTCTGGGAA 1401
Query 1360 AACTGTGGCGGTTGTTGGTGGGAGTGGCTCTGGAAAGAGTACTGTTGTTTCCCTCATTGA 1419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402 AACTGTGGCGGTTGTTGGTGGGAGTGGCTCTGGAAAGAGTACTGTTGTTTCCCTCATTGA 1461
Query 1420 GAGATTCTACGATCCAAACAGCGGGCAAATTCTGTTGGATGGTGTTGAAATAAAGACTCT 1479
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1462 GAGATTCTATGATCCAAACAGCGGGCAAATTCTGTTGGATGGTGTTGAGATAAAGACGCT 1521
Query 1480 TCAGTTGAAGTTTTTGCGCGAACAAATCGGGCTTGTGAATCAAGAACCAGCTCTGTTTGC 1539
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 1522 TCAGTTGAAGTTTTTGCGTGAACAAATCGGGCTTGTGAATCAAGAACCTGCGCTCTTTGC 1581
Query 1540 CACCACCATACTTGAGAACATACTCTACGGAAAGCCTGATGCAACAATGGTTGAAGTTGA 1599
||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1582 CACTACTATACTAGAGAACATACTCTATGGAAAGCCTGATGCAACAATGGTTGAAGTTGA 1641
Query 1600 AGCTGCTGCTTCCGCTGCGAATGCGCATAGTTTCATTACATTGCTTCCTAAAGGTTATGA 1659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||
Sbjct 1642 AGCTGCTGCTTCCGCTGCGAATGCGCATAGTTTCATTACATTACTTCCTAAAGGCTACGA 1701
Query 1660 CACACAGGTTGGAGAACGTGGAGTTCAACTATCAGGTGGACAGAAACAGAGAATTGCAAT 1719
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1702 CACACAGGTTGGAGAACGTGGTGTTCAACTCTCAGGTGGACAGAAGCAGAGAATTGCAAT 1761
Query 1720 TGCTAGGGCAATGTTGAAAGACCCAAAGATTCTGTTACTAGATGAAGCTACAAGTGCTCT 1779
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1762 TGCTAGGGCGATGTTGAAAGACCCAAAGATTCTGTTACTAGATGAAGCTACAAGCGCTCT 1821
Query 1780 TGATGCTAGCTCTGAGAGCATTGTTCAGGAAGCTTTAGACAGAGTCATGGTAGGCAGGAC 1839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 1822 TGATGCTAGCTCTGAGAGCATTGTTCAGGAAGCTTTAGACAGAGTCATGGTGGGGAGGAC 1881
Query 1840 CACTGTGGTTGTTGCTCATCGTCTCTGCACCATCAGAAATGTTGATTCCATTGCCGTGAT 1899
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1882 CACTGTTGTTGTTGCTCATCGTCTCTGCACCATCAGAAATGTTGATTCCATTGCCGTGAT 1941
Query 1900 ACAACAAGGCCAAGTTGTTGAAACCGGAACACATGAAGAACTCATTGCCAAATCCGGTGC 1959
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1942 ACAGCAAGGCCAAGTTGTTGAAACCGGAACACATGAAGAACTCATTGCCAAATCCGGTGC 2001
Query 1960 TTACGCATCCCTCATCAGGTTTCAAGAAATGGTTGGTACTCGAGATTTCTCAAATCCGTC 2019
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2002 TTACGCATCCCTCATCAGGTTTCAGGAAATGGTTGGTACTCGAGATTTCTCAAACCCGTC 2061
Query 2020 AACTCGTCGCACTCGTTCAACCCGTTTGAGCCATTCTCTGTCAACAAAATCACTCAGTTT 2079
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2062 AACTCGTCGCACTCGTTCAACCCGTTTGAGCCATTCACTGTCAACGAAATCACTCAGTTT 2121
Query 2080 AAGATCAGGAAGTTTGAGGAATCTGAGCTATTCGTACAGCACTGGAGCTGATGGTCGGAT 2139
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2122 AAGATCAGGAAGTTTGAGGAATCTGAGCTATTCTTACAGCACTGGAGCTGATGGTCGGAT 2181
Query 2140 AGAGATGATTTCAAATGCAGAGACGGACCGAAAGACTCGCGCCCCTGAAAATTACTTCTA 2199
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2182 AGAGATGATTTCAAATGCAGAGACTGACCGAAAGACTCGTGCCCCTGAAAATTACTTCTA 2241
Query 2200 CAGGCTTCTCAAGCTTAATTCACCTGAATGGCCTTACTCCATCATGGGAGCCA-TTGGCT 2258
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || | ||||
Sbjct 2242 CAGGCTTCTCAAGCTTAATTCACCGGAATGGCCTTACTCAATCATGGGAG-CAGTAGGCT 2300
Query 2259 CGATTCTTTCTGGTTTCATCGGACCTACATTTGCTATTGTGATGAGTAATATGATCGAAG 2318
| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 2301 CAATTCTTTCTGGTTTCATTGGTCCTACATTTGCTATTGTGATGAGCAACATGATCGAAG 2360
Query 2319 TCTTCTACTACACAGACTACAATTCAATGGAGAGAAAAACAAAGGAATACGTTTTCATCT 2378
||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| || || || |||||||
Sbjct 2361 TCTTCTACTACACAGACTATGATTCAATGGAAAGGAAAACAAAAGAGTATGTCTTCATCT 2420
Query 2379 ACATCGGTGCTGGTCTCTACGCTGTGGGTGCTTATTTGATCCAACATTACTTCTTTAGCA 2438
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2421 ACATTGGTGCTGGTCTCTATGCTGTGGGTGCTTATTTGATCCAACATTACTTCTTTAGCA 2480
Query 2439 TCATGGGAGAAAACCTCACAACAAGAGTAAGAAGAATGATGCTCTCAGCTATCTTGAGAA 2498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2481 TCATGGGAGAAAACCTCACAACAAGAGTAAGAAGAATGATGCTCTCAGCTATCTTGAGAA 2540
Query 2499 ACGAAGTTGGTTGGTTCGATGAGGATGAACACAACTCAAGCCTGATCGCTGCACGGTTAG 2558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2541 ACGAAGTTGGTTGGTTCGATGAGGATGAACACAACTCAAGCCTGATCGCTGCACGTTTAG 2600
Query 2559 CTACTGATGCAGCCGATGTTAAATCCGCTATAGCCGAGAGAATCTCAGTAATTCTACAAA 2618
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2601 CTACTGATGCAGCAGATGTTAAATCCGCTATAGCCGAGAGAATCTCAGTAATTCTACAAA 2660
Query 2619 ACATGACTTCACTTCTCACATCCTTCATAGTTGCCTTCATAGTAGAATGGAGAGTCTCAC 2678
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2661 ACATGACTTCACTTCTCACATCCTTCATAGTCGCCTTCATAGTAGAATGGAGAGTCTCAC 2720
Query 2679 TTCTCATCTTAGGCACATTCCCACTTCTAGTCCTCGCCAACTTTGCTCAGCAACTATCTT 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2721 TTCTCATCTTAGGCACATTCCCACTTCTAGTCCTCGCTAACTTTGCTCAGCAACTATCTC 2780
Query 2739 TGAAGGGTTTTGCTGGAGATACAGCCAAGGCGCATGCAAAGACTTCAATGATTGCTGGTG 2798
||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2781 TGAAGGGTTTTGCTGGAGACACAGCTAAGGCTCATGCAAAGACTTCAATGATTGCTGGTG 2840
Query 2799 AAGGAGTTAGCAACATTAGAACTGTAGCAGCGTTCAATGCACAGAGCAAAATTCTCTCTT 2858
||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2841 AAGGAGTCAGTAACATTAGAACCGTAGCAGCTTTCAATGCACAGAGCAAGATTCTCTCTT 2900
Query 2859 TGTTCTGTCACGAGCTTCGTGTTCCTCAGAAAAGAAGTTTATACCGGAGTCAAACCTCGG 2918
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 2901 TGTTCTGTCATGAGCTTCGTGTACCTCAGAAAAGAAGCTTATACCGAAGTCAAACCTCGG 2960
Query 2919 GTTTCCTATTTGGCCTCTCGCAGCTTGCTCTATATGGTTCTGAGGCTTTGATTCTCTGGT 2978
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2961 GTTTCCTATTTGGCCTCTCGCAGCTTGCTCTCTATGGTTCTGAGGCTTTAATTCTCTGGT 3020
Query 2979 ATGGCGCCCACCTTGTGAGCAAAGGCGTGTCAACCTTTTCCAAAGTGATCAAAGTGTTTG 3038
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3021 ATGGTGCCCACCTTGTGAGTAAAGGCGTGTCAACCTTTTCCAAAGTGATCAAAGTGTTTG 3080
Query 3039 TGGTTTTGGTCATTACTGCAAACTCTGTTGCTGAAACTGTCAGCCTTGCTCCTGAAATTA 3098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3081 TGGTTTTGGTCATTACTGCAAACTCTGTTGCTGAAACTGTCAGTCTTGCTCCTGAAATTA 3140
Query 3099 TCCGGGGAGGTGAAGCGGTTGGTTCGGTTTTCTCGGTATTGGATAGGCAAACTC-GGATT 3157
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||
Sbjct 3141 TTCGGGGAGGTGAAGCTGTTGGTTCGGTTTTCTCGGTCTTGGACAGGCAGAC-CAGGATT 3199
Query 3158 GACCCGGATGATGCTGATGCTGATCCCGTTGAAACAATCCGTGGAGACATAGAGTTTAGG 3217
||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3200 GACCCGGATGATGCTGATGCTGATCCCGTGGAGACGATCCGTGGAGACATTGAGTTTAGG 3259
Query 3218 CATGTGGATTTCGCTTACCCTTCAAGACCAGATGTCATGGTTTTCAGGGACTTTAACCTC 3277
||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3260 CATGTTGATTTCGCTTACCCTTCAAGACCCGACGTCATGGTTTTCAGGGACTTTAACCTC 3319
Query 3278 AGAATCCGAGCTGGACATAGCCAAGCTCTAGTGGGCGCAAGTGGGTCAGGGAAGAGTTCT 3337
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3320 AGAATTCGAGCTGGACATAGCCAAGCTCTTGTGGGCGCGAGTGGGTCAGGGAAGAGTTCT 3379
Query 3338 GTAATCGCGATGATTGAGCGGTTTTATGACCCGCTTGCTGGAAAAGTCATGATTGATGGC 3397
||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3380 GTAATTGCGATGATCGAGCGGTTTTACGACCCTCTTGCTGGAAAAGTCATGATTGATGGC 3439
Query 3398 AAAGATATCCGCCGGCTAAACCTGAAATCTCTAAGGCTCAAAATCGGTCTTGTTCAACAA 3457
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3440 AAAGACATCCGCCGGCTAAACCTGAAATCTCTAAGGCTCAAAATCGGTCTTGTTCAACAA 3499
Query 3458 GAACCAGCTCTTTTCGCAGCAACCATCTTCGACAACATCGCATATGGGAAAGATGGTGCA 3517
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 3500 GAACCAGCTCTCTTCGCAGCAACGATCTTCGACAACATCGCCTATGGTAAAGATGGTGCA 3559
Query 3518 ACTGAATCCGAGGTAATTGAGGCAGCGCGGGCCGCAAATGCTCATGGTTTCATCAGTGGT 3577
|||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3560 ACTGAATCCGAGGTAATTGATGCAGCTCGAGCCGCAAATGCTCACGGTTTCATCAGTGGT 3619
Query 3578 TTGCCTGAAGGTTACAAAACTCCAGTGGGCGAAAGAGGAGTGCAGTTATCAGGTGGACAG 3637
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3620 TTACCTGAAGGTTACAAAACTCCAGTAGGCGAAAGAGGAGTGCAGTTATCAGGTGGACAG 3679
Query 3638 AAACAGAGGATCGCGATAGCAAGAGCTGTGCTCAAGAACCCTACAGTGTTGCTTCTAGAC 3697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3680 AAACAGAGGATCGCGATAGCAAGAGCTGTGCTCAAGAACCCTACAGTGTTGCTTCTAGAC 3739
Query 3698 GAAGCAACTAGCGCACTAGATGCAGAATCAGAATGCGTGCTGCAAGAGGCATTAGAGAGG 3757
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3740 GAAGCAACTAGCGCACTAGATGCAGAATCAGAATGCGTGCTGCAAGAGGCGTTAGAGAGG 3799
Query 3758 CTCATGAGAGGTCGGACAACCGTGGTAGTTGCTCACCGCTTGTCCACCATAAGAGGTGTT 3817
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3800 CTCATGAGAGGTCGGACCACCGTGGTAGTTGCTCACCGCTTGTCCACCATAAGAGGTGTT 3859
Query 3818 GATTGCATTGGTGTGATTCAAGACGGGCGGATTGTGGAGCAAGGCAGCCATTCCGAGCTC 3877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3860 GATTGCATTGGTGTGATTCAAGACGGGCGGATTGTGGAGCAAGGCAGCCATTCAGAGCTC 3919
Query 3878 GTAAGCCGACCAGAGGGAGCGTATTCAAGGCTTTTACAGCTTCAAACGCATAGGATTTGA 3937
|| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3920 GTTAGCCGACCAGAGGGAGCTTATTCAAGGCTGTTACAGCTTCAAACACATAGGATTTGA 3979
Query 3938 AGCTTGATCATGGTTTaaaaacaaaaaaaaaTCGGTTTCTGTAAttttttttAAATCAAA 3997
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||
Sbjct 3980 AGCTTGATCATGGATTAAAAACAAAAAA---TCGGTTTGTGTAATTTTTTTTATATTAAA 4036
Query 3998 ACTTTAATTTGGAAGATTTCGATGGACTATAACGATAATATGGATAGGTGTAGATAATGA 4057
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4037 ACTTTAATTTGGAAGATTTCTATGGACTATAACGATAATATGAATAGGTGTAGATAATGA 4096
Query 4058 AGCTTTTGC--T-T--ATGAAGGTTCTTTAAG---GGGTTTTCTTTTTTCGCATTT-GCT 4108
|||||||| | | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||
Sbjct 4097 AGCTTTTGGAGTGTTTATGAAGGTTCTTTAATTAAGGGTTAT-TTTTTTCGCATTTTGCT 4155
Query 4109 TATGTGCCCGTTTTGGAACATGAGACTAAACTATGTTTTCGTT 4151
||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 4156 TATGTGCCCGTTTTGGAACATAAGACTGAACTATGTTTTCGTT 4198
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 206888472932
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5