BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg485071
Length=3507
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G46920.1 | Symbols: | Protein kinase superfamily protein wi... 2483 0.0
> AT3G46920.1 | Symbols: | Protein kinase superfamily protein
with octicosapeptide/Phox/Bem1p domain | chr3:17280430-17284857
REVERSE LENGTH=3516
Length=3516
Score = 2483 bits (1344), Expect = 0.0
Identities = 1753/1942 (90%), Gaps = 61/1942 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCACATGAACCCAGTAGCCCAAGTTCGAATCTTG-TTCATAATCCGGCGAATCTTTC 59
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 1 ATGGCACATGAACCCAGTAGCCCAAGTTCGAATCTTGTTTC-TAATCCGGCCAATCTTTC 59
Query 60 AGATTATGGGTTAAATTATGGCTCTGATTTGAGCAATAAGCGTGTCTCTGATGGAATCAT 119
|| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 60 AGCTTCTGGGTTAGATTATAGCTCTGATTTGAGTAATAAGCGTGTCTCTGATGGAATTAT 119
Query 120 TACTGGGTTTGGGAGTGAGCAGGTAAGTATTGATGCTACGAATAGTAACAATCCAAATTT 179
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 120 TTCTGGGTTTGGGAGTGAGCAGGTAAGTATTGATGCTACGAATAGAAACAATCCAAATTT 179
Query 180 -----AT-CAAGTAGTGATATGGATGGTGAAGAAGGGGAAAAGGTGAAGTTTTTATGTAG 233
|| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 AGGCAATAAAAGAAGTGATATGGATGATGAAGAATTGGAAAAGGTGAAGTTTTTATGTAG 239
Query 234 CTACAATGGAAAGATAATGCCTAGACCAAGTGATGGCATGTTACGATACGTTGGTGGTCA 293
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 240 CTACAATGGAAAGATAATCCCTAGACCAAGTGATGGCATGTTACGTTACGTTGGTGGTCA 299
Query 294 AACAAGGATCATTAGTGTTAAAAGGAATGTGAGATTTGATGAGTTTGAGCAAAAGATGAT 353
|||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 300 AACAAGGATCGTTAGTGTTAAAAAGAATGTGAGATTTGATGAATTTGAGCAAAAGATGAT 359
Query 354 TCAGGTTTATGGTCAGCCTGTTGTTGTTATTAAGTATCAGCTTCCTGATGAGGATCTTGA 413
||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 TCAGGTTTATGGTCACCCTGTTGTTG---TTAAGTATCAGCTTCCTGATGAGGATCTTGA 416
Query 414 TGCTTTGGTTTCTGTCTCATCTAGTGAAGATATTGATAATATGATGGATGAGTTTGACAA 473
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 417 TGCTTTGGTTTCTGTTTCATCTAGTGAAGATATTGATAATATGATGGAGGAGTTTGAGAA 476
Query 474 GTTGGTTGAGAGATCTTCTGATGGGTCAGGGAAGTTGAGAGtttttttGTTTGATGCTGC 533
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 477 GTTGGTAGAGAGATCTTCTGATGGGTCAGGGAAGTTGAGAGTTTTTTTGTTTGATGCTTC 536
Query 534 TTCATCCGAGGTTGATGATTCTTTCGGAATATCGCAGTATGG--A-G---TTGATATTGG 587
||| || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||
Sbjct 537 TTCGTCTGAGGTGGATGATTCTTTCGGAATATTGGAGTATGGTGATGGAGTTGATATTGG 596
Query 588 GCAGAGGTATGTAGAGGCGGTGAATGGTGTTGTTTTGAGTAAGGAAAGTGTGGCTAGTGG 647
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 597 GCAGAGATATGTAGAGGCTGTGAATGGTGTTGTTGTGAGTAAGGAAAGTGTAGCTAGTGG 656
Query 648 TAGTAGTTCTAATCCGAATTCTGATTTTAGTGGCGTGGATGTTGTTGATAGCTTGG-CTG 706
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 657 TAGT--T-CTAATCCGAATTCTGATTTTAGTGGCGTGGATGTTGTTGATAGCTTGGGC-G 712
Query 707 TAGGTCAGAGTGATTTTGTTGCAACTACCTGGACCTCGAGTACTTTCTCACCTCACACTT 766
| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||
Sbjct 713 TTGGTCAGAGTGATTTTGTCGCAACTACTTGGACCTCGAGTAATTTTTCACCTCAGACTT 772
Query 767 ATCATAGTAATGCACCAAGACTTGTTCCTCCTGATCCTCGCTCCTCTGCTTATGTTTTGC 826
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||
Sbjct 773 ATCATAGTAATGTATCAAGACTTGTTCCTCCTGATCCACGCTCTTCTGCTTATGTTGTGC 832
Query 827 CAATGACTGTTCAAGCCGATCCGTTTCATTCTTCTCAGCTTGAGTCTGTTTCAGGGAAAC 886
|||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 833 CAATGACTGTCCACGCCGATCCGCCTCATTCTTTTCAGCTTGAGACTGTTTCAGAGAAAC 892
Query 887 AAATACTTGGTAAGATCCAGCAGCATCAACAGGTGCATGACTTGCAGCAATCAATGACTA 946
|||| |||||||||| |||||||| ||||||| | | | | | | | | | |
Sbjct 893 CAATAGTTGGTAAGATGCAGCAGCAACAACAGGGG--T-A-T---A-C--T-A----C-A 936
Query 947 CGCCATCTGAGCATCATTCACCGACTTATGTTGAATCTCGCCAAGAAGCTTTAAAACAAC 1006
| | |||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 937 C-C-ATCTGAACATCATCCACCGGCCTATGTTGAATCTCGCCAAGAAGCTTTAAGACAAC 994
Query 1007 CAGATGTTGTTCATTCACCTATCCAGCTTTTGCCAAGTAGTACTTCTTTGTTCTCCCAAC 1066
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 995 CAGATATTGTTCATTCACCTATCCAGCTTTTGCCAAGTAGTACTTCTTTGTTCTCCCAAC 1054
Query 1067 AACCTTTTCAAGGTAGTACTGTAGGTGTCTCATCCCACCAGTTCCTTCCTGCTTCTCACA 1126
|||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1055 AACCTTTTCAAGATAGTCCTTTAAGTGTCTCATCCCACCAGTTCCTTCCTGCTGCTCACA 1114
Query 1127 TGTCAATGGCTCCTTTGAACGCTCAGGTTGGTGCTACACCAGTTTTGATTAACCCTATAC 1186
||||||||||||| ||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1115 TGTCAATGGCTCCCTTGAATTCTCAGATTAGTTCCACACCAGTTTTGATTAACCCGGTAA 1174
Query 1187 TACAAACCCAAGAAAATCTGTTGGGGAACTATCCTGCTGAAAGAAATGTCGGGATTCAAA 1246
| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||
Sbjct 1175 TGCAAACCCAAGAAAATCTGTTGGGGAACTATCATGCTG----------C----T-CAAA 1219
Query 1247 AGGTAGCCCCGCTTCCTACAGAGCCGAGATACACTGCATATCAAGGTACGATTGCTCCTG 1306
|| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1220 AGTTAGTACCGCTTCCTACAGAGCCAAGAAACACTGCATATCAAGGTACGATTTCTCCTG 1279
Query 1307 GTCTACCAATTGGTGGTTGTGGCGGGTCTCAGGTTCCACCATCTAACTATGTTGTTCTCC 1366
|| ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1280 GTATACCATTTGATGGTTATGGCGGGTCTCAAGTTCCACCATCTAACCATGTTGTTCTCC 1339
Query 1367 CCGATGGTGGTTTGC-ATCAACAAGTAATTATGCCTGAAAGTTTTCAAAGGGTAGATGAT 1425
||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1340 CCGATGGAAGTTT-CTATCAACAAGTAACTATGGCTGAAAGTTTTCAAAGGGTAAATGAT 1398
Query 1426 TGTCATATGTGTCAGACATCTTTTCCTCATATGCATTCTGATCCCATTATACGGGAGAGG 1485
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||
Sbjct 1399 TGTCATATGTGCCAGACATCTTTTCCTCATATGCATTCTGATCCGATTATGCGGGAG-GG 1457
Query 1486 AA-TGATGGCTCTACAATGTCGGTACCATATGTGAGATCAGCTTTCCATGCTTCTCATCC 1544
|| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 1458 AAATGATGGTTCTACAATGTATGTGCCATATGTGAGCTCAGCTTTCTATGCTTCTCGTCC 1517
Query 1545 AGATGATATCATGAGAGTCCAACAGACGGATAAGTTAACGGGTCAACAAAGCTTCCTCAA 1604
|||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1518 AGATGATATCATGAGAATCCAACAAACGGATAAGTTTACGGGTCAACAAAGCTTCCTCAA 1577
Query 1605 TCATTCAAATCATCAAGAAAGAGATACTTTACATAACGCCAATGTTGTGACTGCTCAGCT 1664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
Sbjct 1578 TCATTCAAATCATCAAGAAAGAGATACTTTACATAACGCCAATCTTGCCACTGCTCAGGT 1637
Query 1665 CGAGACTACTGAACCTTTCCTCAATGAGATCGTGAGAGATGTTCCGATAAAAGTTCAAGT 1724
|||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1638 CGAGACTACTGAACCTTTTGTCAATGAGATAGTAAGAGATGTTCCGATAAAAGTTCAAGT 1697
Query 1725 ATCTAGACAGCAGCAACATCCCGTAGACCCTTCAGTAGCATATGCTCAATACCGAGAACT 1784
| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 1698 AACTAGGCAGCAGCAACATCCCGTAGACCCTTCAGTAGCATATGCACAATGCCGAGAACT 1757
Query 1785 AAGTGGATTGGTGGATGATGTTAACATACATGCTCCCGGAATATATAGCAATTGTCAGAA 1844
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 1758 AAGTGGATTGGTGGATAATGTTAACATACATGCTCCTGAAATATATAGCAATTGTCAGAA 1817
Query 1845 TTTCATCTCACCGGTTGACAAAATTGG-AACAGAAGATATTATGGGTACAAGTTCTCACC 1903
|||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1818 TTTCATCTCACCAGTTGACAAAATTGGGAA-AGAAGATATTATGGGTACCAGTTCTCAAC 1876
Query 1904 AAATGGCAAGGAAGAATATGTT 1925
||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877 AAATGGCAAGGAAGAATATGTT 1898
Score = 2405 bits (1302), Expect = 0.0
Identities = 1473/1554 (95%), Gaps = 17/1554 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1958 TAGTTCTTCCAGGCCATGAATCTCAGCCTAAGGCATCAT-TGCCGCCAACACAGTCGCCC 2016
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||
Sbjct 1976 TAGTTCTTCCAGGCCATGAATCTCAGCCTAAGGAATCATGTG-TGCCAACACAGTCTCCC 2034
Query 2017 TTATTAGGAAATCCTGGTTTGTATCTACAATCATTGGTTGGAGGTCAGCAGTGCGATTCA 2076
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2035 TTATTAGGCAATCCTGGTTTGTATCTACAATCATTGGTTGGAGGTCAGCAGTTCGATTCA 2094
Query 2077 GTGGAAGCGCAGTCCAGCAACCCCGCTTATGACGTTGTTGAATCTACCTTTGATGCTGCT 2136
| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2095 GCGGAAGCGCAGTCCAGCAATCCCGCTTATGACGTTGTTGAATCTACATTTGATGCTGCA 2154
Query 2137 AACTTACCCTCATCTTTATCATCAAATCCTGATGCTGCTAATTTACCATCATCCTTGTCA 2196
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 AACTTACCATCATCCTTATCATCAAATCCTGATGCTGCTAATTTACCATCATCCTTGTCA 2214
Query 2197 TCTAGTGTTGGTGGTGCAGACCATAAAGATTCATCAAAATCACTTTTTAGCAACCAGGAC 2256
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2215 TCTAGTGTTGGTGGTGCAGACCACAAAGAATCATCAAAATCACTTTTTAGTAACCAGGAC 2274
Query 2257 CCGTGGAATTTGCAAACTAACTCAAAGGAGGATGTCAAACCTGATCTACTTAGTTCTTCG 2316
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2275 CCATGGAATTTGCAAACTAACTCAAACGAGGATGTCAAACCTGATCTACTTAATTCTTCG 2334
Query 2317 AAAGGTGAGAATGACTTTCATG-ATTATCTGTTGATTGGTCTTTTGTTCTCTCTGAAAGG 2375
||| || || | || | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2335 AAA-GT---TAT--CCTTGA-GAATGATCTGTTGATTGGTCTTTGGTTCTCTCTGAAAGG 2387
Query 2376 CTCAGCGGAGGAGCACATCAAACAAGAACTTCGGAATGTTGCTGAAGGAGTCGCTGCTTC 2435
||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2388 CTCCGAGGAGGAGCACATCAAACAAGAACTTCAGAATGTTGCTGAAGGAGTCGCCGCTTC 2447
Query 2436 TGTGTTACAGTCAAGCACATCTTCATATCTTGAACCTACAA-TCAGCGTGGATGAGTATC 2494
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||
Sbjct 2448 TGTGTTACAGTCAAGCACACCTTCATATCATGAACCTCCAATTAAG-GTGGATGAGTATG 2506
Query 2495 CTTCTAATTCGAAAGGAGAAGTTTCACGTAATGATGAAATGAAACAGCAGTCTACTACAC 2554
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2507 CTTTTAATTCGAAAGGAGAAGTTTCACGTAATGATGAAATGAAACAGCAGTCTAC-ACAC 2565
Query 2555 AGTTCAAGAATATCAGGAACCAACTTCTAGAAAGACTGAATTTCGGATATTCTGGTTCTG 2614
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2566 --TTCAAGGATATCAGGAACCAACTTCTAGAAAGACTGAATTTCGGATATTCTGGTTCTG 2623
Query 2615 ATTCTCTGGATCAGTTGCAGATTATAAAGGACAGCGACCTTGAACAATTGCGAGAACTAG 2674
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2624 ATTCGCTGGATCAGTTGCAGATTATAAAGGACAGCGACCTTGAGGAATTGCGAGAACTAG 2683
Query 2675 GATCTGGCACATTTGGCACAGTTTATCATGGGAAATGGCGAGGCACTGATGTTGCAATCA 2734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2684 GATCTGGCACATTTGGCACAGTTTATCATGGGAAATGGCGAGGCACTGATGTTGCAATCA 2743
Query 2735 AAAGGATCAATGATCGATGTTTTGCTGGCAAACCATCTGAGCAAGAACGAATGATTGATG 2794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2744 AAAGGATCAATGATCGATGTTTTGCTGGCAAACCATCTGAGCAAGAACGAATGATCGATG 2803
Query 2795 ACTTTTGGAATGAGGCACAAAACCTAGCTGGCGTGCATCATCCTAACGTCGTTGCTTTTT 2854
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2804 ACTTTTGGAATGAGGCACAGAACCTAGCTGGCTTGCACCATCCTAACGTCGTTGCTTTTT 2863
Query 2855 ATGGGGTTGTGCTGGATTCACCTGGAGGTTCTGTGGCAACGGTTACAGAGTATATGGTCA 2914
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2864 ATGGGGTTGTGCTGGATTCACCTGGAGGTTCTGTGGCAACAGTTACAGAGTATATGGTCA 2923
Query 2915 ATGGTTCTTTACGAAATGCGTTGCAGAAGAATGTGAGGAAATTTGATAGGCGCAAGCGTC 2974
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 2924 ATGGTTCTTTACGAAATGCGTTGCAGAAGAATGTTAGGAATTTTGATAGGTGCAAGCGTC 2983
Query 2975 TGTTGATCGCGATGGACATAGCTTTTGGGATGGAGTATTTGCATGGAAAGAAGATAGTAC 3034
||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2984 AACTGATCGCTATGGACATTGCTTTTGGGATGGAGTATTTGCATGGAAAGAAGATAGTAC 3043
Query 3035 ACTTTGATCTTAAAAGTGACAACCTACTCGTTAATCTCAGAGATCCTCATCGCCCAATTT 3094
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3044 ACTTTGATCTTAAAAGTGACAACCTGCTCGTCAATCTCAGGGATCCTCATCGCCCAATTT 3103
Query 3095 GCAAGGTTGGGGATTTGGGTCTCTCAAAGGTGAAATGTCAGACATTAATATCAGGTGGTG 3154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3104 GCAAGGTTGGGGATTTGGGTCTCTCAAAGGTGAAATGTCAGACATTAATATCAGGTGGTG 3163
Query 3155 TTCGGGGAACACTTCCATGGATGGCACCCGAGCTTCTAAATGGAATCAGTAGCCTTGTTT 3214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3164 TTCGGGGAACACTTCCATGGATGGCACCCGAGCTTCTAAATGGAACCAGTAGCCTTGTTT 3223
Query 3215 CTGAGAAGGTCGATGTGTTTTCATTTGGAATTGTCCTCTGGGAACTTTTCACCGGTGAAG 3274
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3224 CTGAGAAGGTCGATGTGTTTTCATTCGGAATTGTCCTCTGGGAACTTTTCACCGGTGAAG 3283
Query 3275 AACCTTACGCCGACTTGCACTACGGGGCGATCATAGGTGGTATCGTTAGTAATACGCTAC 3334
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3284 AACCTTACGCCGACTTGCACTATGGAGCGATCATAGGTGGTATAGTTAGTAATACGCTAC 3343
Query 3335 GGCCGCCA-ATTCCCAACTTCTGTGACATGGACTGGAAATTGTTGATGGAGAGATGTTGG 3393
|||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3344 GGCCGC-AGATTCCCGACTTTTGTGACATGGACTGGAAATTGCTGATGGAGAGATGTTGG 3402
Query 3394 TCTGCAGAACCATCAGAGAGGCCAAGCTTCACTGAGATCGTGAACGAACTACGGACCATG 3453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3403 TCTGCAGAACCATCAGAGAGGCCAAGCTTCACTGAGATCGTGAACGAACTACGGACCATG 3462
Query 3454 GCTACAAAGCTTCCTTCCAAAGAGCAAGGATCAACACAAGGAGCACAATCTTAA 3507
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 3463 GCTACAAAGCTTCCTTCCAAAGAACAAGGCTCAACACAGGGACCACAATCTTAA 3516
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 174580961640
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5