BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg485406
Length=5011
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G50590.1 | Symbols: | Transducin/WD40 repeat-like superfami... 4676 0.0
> AT3G50590.1 | Symbols: | Transducin/WD40 repeat-like superfamily
protein | chr3:18771019-18779502 FORWARD LENGTH=5231
Length=5231
Score = 4676 bits (2532), Expect = 0.0
Identities = 2785/2905 (96%), Gaps = 25/2905 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2131 AAATAG-CTCTTCAGGTTCAATGGCAAGAAACACCCCGGGGATATGTCGCAGGGATATTA 2189
|||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2229 AAATTGACTCGTCATGTTCAATGGCAAGAAACACCCCGGGGATATGTCGCAGGGATATTA 2288
Query 2190 ACAACCCAAAGGGTGCTGATGGTATCTCTTCTATGGGTTGGGCCTGCCTTACTCTTTTCT 2249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2289 ACAACCCAAAGGGTGCTGATGGTATCTCTTCTATGGGTTGGGCCTGCCTTACTCTTTTCT 2348
Query 2250 ACAACAACTGCTGTATGTTTGCTTGGCTGGGATGGGAAAGTGAGGACCATTCTTTCTATA 2309
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 2349 ACAACAACTGCTGTATGTTTACTTGGCTGGGATGGGAAAGTGAGGACTATTCTTTCCATA 2408
Query 2310 AGTACACCATACGCAGCCTTAGTTGGTGCGTTGAATGACCGCCTATTACTCGCTAATCCC 2369
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||
Sbjct 2409 AGTACACCATACGCAGCCCTAGTTGGTGCCTTGAATGACCGCCTATTGCTTGCTCATCCC 2468
Query 2370 ACTGATATAAGTCCGAAGCAGAAAAAGGGGATTGAAATCAAGAGCTGTCTTGTTGGGCTA 2429
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2469 ACTGATATAAGTCCGAAGCAGAAAAAGGGGATCGAAATCAAGAGCTGCCTTGTTGGGCTA 2528
Query 2430 CTAGAACCGCTTTTAATTGGATTTTCTACAATGCAACAAACATTTGAACAGAAAGTGGAC 2489
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2529 CTTGAACCGCTTTTAATTGGATTTTCTACAATGCAACAAACATTTGAACAGAAAGTAGAC 2588
Query 2490 CTTTCTGAAATATTGTATCAAATAACAACAAGGTTTGATAGCTTGCGAATTACTCCAAGA 2549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589 CTTTCTGAAATATTGTATCAAATAACAACAAGGTTTGATAGCTTGCGAATTACTCCAAGA 2648
Query 2550 TCTCTTGATATTCTTGCTAGAAGCGCTCCAGTATGTGGAGATCTTGCTGTATCACTAGCT 2609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2649 TCTCTTGATATTCTTGCTAGAAGCGCTCCAGTATGTGGAGATCTTGCTGTATCACTAGCT 2708
Query 2610 CAAGCAGGCCCTCAATTCAACCAGGTATTACGTTGTGCATATGCAATAAAGGCTCTTCGG 2669
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2709 CAAGCAGGCCCTCAATTCAACCAGGTATTACGTTGTGCATATGCGATAAAGGCTCTTCGG 2768
Query 2670 TTCTCCACGGCATTGTCGGTTTTAAAGGACGAGTTCTTGCGTTCTAGAGACTATCCAAAA 2729
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2769 TTCTCCACGGCATTGTCAGTTTTAAAGGACGAGTTCTTGCGTTCTAGAGACTATCCAAAA 2828
Query 2730 TGTCCTCCAACTTCTCTTTTGTTCCAGAGGTTCCGTCAGCTTGGATATGCCTGTATCAAA 2789
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2829 TGTCCTCCAACTTCTCTTTTGTTCCAGAGGTTCCGGCAGCTTGGATATGCCTGTATCAAA 2888
Query 2790 TATGGTCAATTTGATAGCGCAAAGGAAACTTTTGAAGTAATAGCCGACTATGAGAGCATG 2849
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2889 TATGGTCAATTCGATAGCGCAAAGGAAACTTTTGAAGTAATAGGCGACTATGAGAGCATG 2948
Query 2850 CTAGATCTTTTCATATGCCACCTCAACCCTAGTGCTATGCGTCGTCTTGCCCAGAAATTG 2909
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2949 CTAGATCTTTTTATATGCCACCTCAACCCTAGTGCTATGCGTCGTCTTGCCCAGAAATTG 3008
Query 2910 GAAGAAGAAAGCGGAGATCCTGAGTTGAGACGATATTGTGAAAGGATTTTAAGAGTACGG 2969
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3009 GAAGAAGAAAGTGGAGATCCCGAGTTGAGACGATATTGTGAAAGGATTTTACGAGTACGG 3068
Query 2970 TCTACAGGATGGACCCAGGGAATTTTTGCTAATTTTGCAGCTGAGAGTATGGTTCCAAAA 3029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3069 TCTACAGGATGGACCCAGGGAATTTTTGCTAATTTTGCAGCTGAGAGTATGGTTCCAAAA 3128
Query 3030 GGACCAGAATGGGGTGGTGGCAACTGGGAAATCAAGACTCCAACCGACATGAAAAGCATA 3089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3129 GGACCAGAATGGGGTGGTGGCAACTGGGAAATCAAGACTCCAACCGACATGAAGAGCATA 3188
Query 3090 CCTAAGTGGGAGCTTGCTGGGGAAGTAATGCCATACATGAAGAATGAAGATGGAACAATC 3149
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3189 CCTAAGTGGGAGCTTGCTGGGGAAGTAATGCCATACATGAAGAATGAAGATGGAACCATC 3248
Query 3150 CCCTCAATAGTAGCTGATCATATTGGTGTTTACTTGGGCTGTGTTAAAGGCAGAGTTAAT 3209
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3249 CCCTCAATAGTAGCTGATCATATTGGTGTTTACTTGGGCTGTGTCAAAGGCAGAGTTAAT 3308
Query 3210 GTGGTGGAGATTAAAGAAGACAGCTTAGTTTCTAAACCAGGAGTGCTTAGTTTGTTGGGT 3269
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct 3309 GTGGTGGAAATTAAAGAAGACAGCTTAGTTTCTAAACCTGGAGGGCTTAGTTTGTTGGGT 3368
Query 3270 AAACCTGTATCGGATAAACCTTTGGCACTTCCTGCTGGCGAATCCAGTTCGTTGATGGGT 3329
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||
Sbjct 3369 AAACCTGTATCGGATAAACCTCTGGCACTTCCTGCTGGTGAATCAAGTTCGATGATGGGT 3428
Query 3330 CTGGAATCCCTTGGAAAACAAAACGTAGCTGATGAACAGGCAAAGGCTGCTGAGGAATTC 3389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3429 CTGGAATCCCTTGGAAAACAAAACGTAGCTGATGAACAGGCAAAGGCTGCTGAGGAATTC 3488
Query 3390 AAGAAAACAATGTATGGTGCTGCTGGTGATGGCAGTAGCAGTGACGAGGAAGGTGTGACA 3449
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3489 AAGAAAACAATGTATGGTGCTACTGGTGATGGCAGCAGCAGTGACGAGGAAGGTGTAACA 3548
Query 3450 AAACCTAAGAAACTGCAGATTAGAATACGAGAAAAGCCAACATCTACCACCGTGGACGTC 3509
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3549 AAACCTAAGAAGCTGCAGATTAGAATACGAGAAAAGCCAACATCTACCACCGTGGACGTC 3608
Query 3510 AATAAGCTTAAAGAAGCTGCTAAAACGTTTAAACTCGGAGATGGGCTAGGCTTAACAATG 3569
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3609 AATAAGCTTAAAGAAGCTGCTAAAACGTTTAAACTCGGAGATGGTCTAGGCTTAACAATG 3668
Query 3570 AGTAGAACAAAATCAATTAATGCTGGATCCCAGGATTTGGGTCAGATGTTAAACCAGCCT 3629
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3669 AGTAGAACAAAATCAATTAATGCTGGATCTCAGGATTTGGGTCAGATGTTAAGCCAGCCT 3728
Query 3630 TCTTCCTCAACAGCTGCAACTACAACTGCTCCCGGTTCTGCATCTGCTCCTGTTGATCCT 3689
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3729 TCTTCCTCAACAGTTGCAACTACAACTGCTCCAAGTTCTGCATCTGCTCCTGTTGATCCT 3788
Query 3690 TTTGCGATGGGCTCATGGACACAACAACCTCAACCAGTTTCTCAACCAGCTCCACCTGGT 3749
||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3789 TTTGCAATGAGCTCATGGACACAGCAACCTCAACCAGTTTCTCAACCAGCTCCACCTGGT 3848
Query 3750 GTAGCTGCGCCGATACCGGAAGACTTTTTCCAAAACACTATCCCATCTGTTGAGGTTGCC 3809
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 GTAGCCGCGCCGATACCGGAAGACTTTTTCCAAAACACAATCCCATCTGTTGAGGTTGCC 3908
Query 3810 AAGACATTGCCTCCTCCTGGCACTTATCTTTCGAAAATGGACCAAGCTGC---A-----A 3861
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 3909 AAGACATTGCCTCCTCCTGGCACTTATCTTTCGAAAATGGACCAAGCTGCTCGAGCTGCA 3968
Query 3862 -TAGCTGCACAGGGTGTTCCAAATCAAGCAAATAATACTACTCTTCCTGATATTGGTCTT 3920
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 3969 ATAGCTGCACAGGGTGGTCCAAATCAAGCAAATAATACTCCTCTGCCTGATATTGGTCTT 4028
Query 3921 CCCGATGGTGGCGTTCCTCAACAG-A-C---AA-------GTCAACAACCTGGTGCTCCA 3968
||||||||||| |||||||||||| | | || |||||||||||||||| |||
Sbjct 4029 CCCGATGGTGGTGTTCCTCAACAGTATCCTCAACAAACAAGTCAACAACCTGGTGCGCCA 4088
Query 3969 TTTCAGACTGTTGGACTTCCTGACGGCGGTGTTCCTCAACAGTATCCTGGTCAGACCCTG 4028
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
Sbjct 4089 TTTCAGACTGTTGGACTTCCTGACGGCGGTGTTCGTCAACAGTATCCTGGTCAGAACCAG 4148
Query 4029 GGGCCATCCCAGGTTCCCGTTTCTACACAGCCTCTTGATCTTAGCGTTCTTGGAGTTCCA 4088
| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4149 GTGCCATCTCAGGTTCCCGTTTCTACACAGCCTCTTGATCTTAGCGTTCTTGGAGTTCCA 4208
Query 4089 AATACTGGTGATTCTGGAAAGCCTCCCGGACAACCTCAATCGCCTCCTGCATCAGTTCGT 4148
||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4209 AATACCGGCGATTCTGGTAAGCCTCCTGGACAACCTCAATCGCCTCCTGCATCAGTTCGT 4268
Query 4149 CCTGGACAGGTTCCACGTGGAGCTGCAGCTCCTGTTTGTTTCAAGACTGGACTTGCACAT 4208
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4269 CCTGGACAGGTTCCACGTGGAGCTGCAGCTCCGGTTTGTTTCAAGACTGGACTTGCCCAT 4328
Query 4209 CTTGAACAAAACCAGCTTCCAGATGCACTGTCTTGCTTCGACGAAGCATTCTTGGCTCTG 4268
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4329 CTTGAACAAAACCAGCTTCCAGATGCACTGTCTTGCTTTGACGAAGCATTCTTGGCTCTG 4388
Query 4269 GCTAAGGATCAATCACGTGGAGCAGATATCAAAGCTCAAGCCACAATCTGTGCTCAGTAC 4328
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4389 GCTAAGGATCAATCGCGTGGTGCAGATATCAAAGCTCAAGCCACAATCTGTGCTCAGTAC 4448
Query 4329 AAGATAGCTGTAACTCTCCTTCGGGAAATCTTGAGGCTACAAAGAGTCCAAGGTGCAAGT 4388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4449 AAGATAGCTGTAACTCTCCTTCGGGAAATCTTGAGGCTACAAAGAGTCCAAGGTGCAAGT 4508
Query 4389 GCATTAAGCGCAAAAGACGAAATGGCAAGACTTTCAAGGCATCTAGCTTCACTGCCACTA 4448
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4509 GCATTAAGCGCAAAGGACGAAATGGCAAGACTTTCAAGGCATCTAGCTTCACTGCCACTA 4568
Query 4449 CTAGCAAAGCACCGCATAAACTGCATACGCACTGCAATCAAAAGAAATATGGAAGTTCAA 4508
||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4569 CTAGCCAAGCACCGTATAAACTGCATACGTACTGCAATCAAAAGAAACATGGAAGTTCAA 4628
Query 4509 AACTATGGCTACTCAAAGCAGATGCTGGAACTTCTTTTATCAAAGGCACCAGCGAGCAGG 4568
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 4629 AACTATGGCTACTCAAAGCAGATGCTGGAACTTCTTTTATCAAAGGCACCAGCGAGTAAG 4688
Query 4569 CAAGAGGAATTAAGAGGACTAGTCGATCTCTGTGTCCAGAGAGGCACATCGAACAAATCC 4628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4689 CAAGAGGAATTAAGAGGACTAGTCGATCTCTGTGTCCAGAGAGGCACATCGAACAAATCC 4748
Query 4629 ATCGACCCACTTGAAGATCCTTCTCAGTTATGCTCAGCTACGCTCAGCAGATTATCGACT 4688
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4749 ATTGACCCGCTTGAAGATCCTTCTCAGTTATGCTCAGCTACGCTCAGCAGATTATCGACT 4808
Query 4689 ATTGGATACGATGTTTGTGATCTCTGTGGCGCAAAGTTTGCTGCTCTTTCATCGCCCGGT 4748
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4809 ATTGGATACGATGTTTGTGATCTCTGTGGTGCTAAGTTTGCTGCTCTTTCGTCGCCCGGT 4868
Query 4749 TGTATCATATGCGGTATGGGAAGCATCAAACGGTCTGATGCACTCGCTGGACCCGCACCT 4808
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4869 TGTATCATATGCGGTATGGGAAGCATCAAACGCTCTGATGCACTCGCTGGACCTGCACCT 4928
Query 4809 GTATCCACACCGTTCGGCTAAACGTTATAGACATTGTTACGGTTGGTGTTAATCAACATT 4868
|||||||||||||| ||||||| |||||||||| | | || ||||||||||||||||||
Sbjct 4929 GTATCCACACCGTTTGGCTAAAGGTTATAGACACTATCACCGTTGGTGTTAATCAACATC 4988
Query 4869 TAAGCAAATTTCAAACTGGTTACATGCAAGAAC--ATTCGATCGATTTTGTGGGGTTTGA 4926
|||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4989 TAAGCAAATTTCAAACTGGTTACATGTACGAACTCATTCGATCGATTTTGTGGG-TTTGA 5047
Query 4927 TTTTGGTTTATTCGTCTGTATATGATTTGATCATTTGTATCTGTTTATTTTCCGTACGTA 4986
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5048 TTTTGATTTATTCGTCTGTATATGATTTGATTATTTGTATCTGTTTATTTTCCGTACGTA 5107
Query 4987 GCTAATACAGTTTGTTGAGAGATTT 5011
||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 5108 GCTAATACAATTTGTTGAGATATTT 5132
Score = 1810 bits (980), Expect = 0.0
Identities = 1059/1098 (96%), Gaps = 2/1098 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAACCTTCGTGTATCTTCATATCCTCAGCATCGGATTTGAAGCAAATTGATGAACTCGT 60
|||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 16 AAAACCTTCGTGTACCTTCGTATTCTCTGCATTGGATTTGAAGCAAATTGATGAACTAGT 75
Query 61 AATCTCACAGGGATCTAAGAGCAGGAGTTATGGAGTGGGCAACGGTGCAGCATCTGGATC 120
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 AATCTCACACGGATCTAAGAGCAGAAGTTATGGAGTGGGCAACGGTGCAGCATCTGGATC 135
Query 121 TGCGTCATGTAGGTCGCGGTGTGAGCAAGCCGCTGCAACCACATACGGCGGCGTTTCATC 180
||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 136 TGCGTCATGTAGGTCGCGGTGTGAGCAAGCCACTACAACCTCATACGGCGGCGTTTCATC 195
Query 181 CTTCTCAAGCCGTTATCGCTGTTGCCGTTGGCTCTCACATCATGGAATTTGATGCATTAA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 196 CTTCTCAAGCCGTTATCGCTGTTGCCGTTGGCTCTCACATCATGGAATTTGATGCATTAA 255
Query 241 CGGGGTGTAAGATCGCGTCGATTGACATTGGATCTCCAGCTGTTAGAATGTTGTATAGTC 300
|||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 256 CGGGATGTAAGATCGCGTCTATTGATATTGGATCTCCAGCTGTTAGAATGTTGTATAGTC 315
Query 301 CTACTAGCAGCAATGCTGTTGTTGCAATTCTTGAGGATTGTACAATTAGGTCTTGTGATT 360
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 316 CTACTAGCAGCAATGCTGTTGTTGCCATTCTTGAGGATTGTACAATTAGGTCTTGTGATT 375
Query 361 TTGAAACGGAGCAGACTTGTGTATTGCACTCACCGGAGAAGAGGAGTGAGCACATTTCCT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 TTGAAACGGAGCAGACTTGTGTATTGCACTCACCGGAGAAGAGGAGTGAGCACATTTCCT 435
Query 421 CAGATACTGAAGTTCATCTTGCTGTGACGCCACTCCAACCTGTTGTGTT-TTTCGGATTC 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 436 CAGATACTGAAGTTCATCTTGCTGTGACGCCACTTCAACCTGTTGTGTTCTTT-GGATTC 494
Query 480 CCAAAAAGAATGAGTGTGACAGTTGTTGGAACTGTTGAAGGTGGAAGAGCTCCGACAAAA 539
|||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 495 CCAAAACGAATGAGTGTCACAGTTGTTGGAACTGTTGAAGGTGGAAGAGCTCCAACCAAA 554
Query 540 ATTAAGACAGACCTGAAGAAACCGATTGTGAACATTGCTTGCCATCCCCGACTCCCTGTC 599
||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 555 ATTAAGACAGATTTGAAGAAACCAATTGTGAACATTGCTTGCCATCCTCGACTACCTGTC 614
Query 600 CTGTATGTAGCATATGCAGAGGGGTTGATAAGAGCTTATAACATTCATACTTATGCTGTT 659
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 615 CTGTATGTAGCATATGCAGAGGGGTTGATACGAGCTTATAACATTCATACTTATGCTGTT 674
Query 660 CATTATACACTACAGCTTGATAATACTATTAAACTTATCGGCGCAAGTTCGTTTGCTTTT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 CATTATACACTACAGCTTGATAATACTATTAAACTTATCGGCGCAAGTTCGTTTGCTTTT 734
Query 720 CACCCAACACTAGAATGGATTTTTGTTGGAGATAGGAGGGGTACACTTTTAGCGTGGGAT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 CACCCAACACTAGAATGGATTTTTGTTGGAGATAGGAGGGGTACACTTTTAGCGTGGGAT 794
Query 780 GTTTCAACTGAAAGACCTAATATGATTGGAATAACGCAAGTGGGTTCGCAACCCATCACT 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 GTTTCAACTGAAAGACCTAATATGATTGGAATAACGCAAGTGGGTTCGCAACCCATCACT 854
Query 840 TCAATTTCTTGGCTTTCTATGTTGCGTGTACTTGTCACTGTGTCCAAGGATGGATCTCTT 899
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 TCAATTTCTTGGCTTCCTATGTTGCGTGTACTTGTCACTGTGTCCAAGGATGGATCTCTT 914
Query 900 CAAGTGTGGAAGACACGGGTAATAATCAATCCCAACAGGCCTTCGACACAAACAAACTTT 959
||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 CAAGTGTGGAAGACACGAGTAATAATTAATCCCAATAGGCCTTCGACACAAACAAACTTC 974
Query 960 TTTGAGCCTGCTGCTATGGAATCAATAGACGTTCCTAGAATTCTCTCTCAACAGGGTGGG 1019
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 975 TTTGAGCCTGCTGCTATGGAATCAATAGACATTCCTAAAATTCTCTCCCAACAGGGTGGC 1034
Query 1020 GAAGCTGTTTACCCCTTACCGCGAATCAAAACTTTAGAAGTTCACCCAAAGCTGAACTTA 1079
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 GAAGCTGTTTACCCTTTACCACGAATCAAAACTTTAGAAGTTCACCCAAAGCTGAACTTA 1094
Query 1080 GCAGCTTTGATTTTTGCA 1097
||||||||||||||||||
Sbjct 1095 GCAGCTTTGATTTTTGCA 1112
Score = 1507 bits (816), Expect = 0.0
Identities = 979/1049 (93%), Gaps = 45/1049 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1133 AACATGGCGGGTAATGAGAACACTCAAAATCGAGCAGCTCAGACTAGGGAAGGAAGGAAG 1192
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1113 AACATGGTGGGTAATGAGAACACTCAAAATCGAGCAGCTCAGACTAGAGAAGGAAGGAAG 1172
Query 1193 CAGCTCTTTGCAGTTCTGCAAAGTGCTAGGGG------A---TC--TTC---AGGAAAAG 1238
||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||||
Sbjct 1173 CAGCTCTTTGCAGTTTTGCAAAGTGCTAGGGGATCTTCAGCTTCTGTTCTAAAGGAAAAG 1232
Query 1239 CTTTCATCGATGGGTTCCTCTGGAATTTTAGCCGAGCATCAACTCCAAGCTCTGCTACAG 1298
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1233 CTTTCGTCTATGGGTTCCTCTGGAATTTTAGCCGAGCATCAACTTCAAGCTCTGCTACAG 1292
Query 1299 GAGCATCATCACAAGGGCCAGAGTCAGCTAACAATTTCAGATATTGCACGGAAGGCGTTC 1358
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1293 GAG------CACAAGGGCCAGAGTCAGCTAACAATTTCAGATATCGCACGGAAGGCGTTC 1346
Query 1359 CTGTATAG--------T----GGCCATGCCAAAACTGCTCCAATATCAAGGTTACCCCTT 1406
||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1347 TTGTATAGTCATTTTATGGAGGGTCATGCCAAAACTGCTCCAATATCAAGGTTACCCCTT 1406
Query 1407 ATTACCGTCGTGGATACAAAGGATCAACTTAAAGACATTCC----T-----CCATTTCAT 1457
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 1407 ATTACGGTCGTGGATACAAAGGATCAACTTAAAGACATTCCTGTTTGCCAGCCATTTCAT 1466
Query 1458 TTGGAGCTGAATTTCTTCAATAAGCCAAATAGAGTTCTTCATTATCCTGTGAGGGCCTTT 1517
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1467 TTGGAGCTGAATTTCTTCAATAAGCCAAATAGAGTTCTTCATTATCCTGTGAGGTCCTTT 1526
Query 1518 TATATCGAGGGCCTTAACCTCATGGCACACAATCTCTGTTCTGGAACGGACAACATCTAC 1577
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1527 TATATCGAGGGCCTTAACCTCATGGCTCACAATCTCTGTTCTGGAACAGACAACATCTAC 1586
Query 1578 AAGAAGCTGTACACATCGATTCCCGGAAATGTAGAATATCATTCGAAACACATTGTTTAC 1637
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1587 AAGAAGCTGTACACATCGATCCCCGGAAATGTTGAATATCATTCGAAACACATTGTTTAC 1646
Query 1638 AGTCGTAAAAGGCACCTCTTTCTGGTTGTCTTTGAGTTTAGTGGTGCTACGAATGAAGTT 1697
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1647 AGTCGTAAAAGGCACCTCTTTCTGGTTGTCTTTGAGTTCAGTGGTGCTACAAATGAAGTT 1706
Query 1698 GTGCTTTACTGGGAAAATACAGGTTCTCAGCTGCCTAATAGCAAAGGAAGCACTGCTAAA 1757
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1707 GTGCTTTACTGGGAAAATACAGGTTCCCAGCTGCCTAATAGCAAAGGAAGCACTGCTAAA 1766
Query 1758 GGTTGTGATGCTGCCTTTATTGGCCCAAATGACGATCAATTTGCAATTCTTGACGAGGAT 1817
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1767 GGTTGTGATGCTGCCTTTATCGGCCCAAATGACGATCAATTTGCAATTCTTGACGAGGAT 1826
Query 1818 AAGACAGGACTTTCTATGTATATCCTCCCAAAA-TATACCACAATGGAAGAGAATGAGAA 1876
||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1827 AAGACAGGACTGTCTATGTATATCCTCCCAAAACT-TACCACAATGGAAGAGAATGAGAA 1885
Query 1877 GAATTTATTATCTGAAGAGAACCAAAACAAAGAGGCAGATGCC-TCGGGAATTCAGGGTC 1935
|||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || || |||||||||||||
Sbjct 1886 GAATTTGTTATCTGAAGAAAACCAAAAGAAAGAGGCGGAT-CCTTCTGGAATTCAGGGTC 1944
Query 1936 CACAACAATTCATGTTTGAGACAGAAGTCGATCGTGTTTTTTCCACACCGATAGAGTCCA 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1945 CACAACAATTCATGTTTGAGACAGAAGTCGATCGTGTTTTTTCCACACCGATAGAGTCCA 2004
Query 1996 CTCTGATGTTTGCTTGTAATGGAACCCAAATTGGGCTGGCAAAGTTGTTTCAAGGCTACC 2055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2005 CTCTGATGTTTGCTTGTAATGGAACCCAAATTGGGCTGGCAAAGTTGTTTCAAGGCTACC 2064
Query 2056 GTCTCTCAGCTTCAGATGGTCATTATATTTCAACACAAGGTGAGGGACGAAAGTCAATCA 2115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2065 GTCTCTCAGCTTCAGATGGTCATTATATTTCAACACAAGGTGAGGGACGAAAGTCAATCA 2124
Query 2116 AGTTGAAGAAACATGAAATAGCTCTTCAG 2144
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2125 AGTTGAAGAAACATGAAATAGCTCTTCAG 2153
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 250032043912
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5