BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg485989
Length=2543
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G55610.1 | Symbols: P5CS2 | delta 1-pyrroline-5-carboxylate ... 4246 0.0
AT2G39800.1 | Symbols: P5CS1, ATP5CS | delta1-pyrroline-5-carbo... 2383 0.0
> AT3G55610.1 | Symbols: P5CS2 | delta 1-pyrroline-5-carboxylate
synthase 2 | chr3:20624020-20629093 REVERSE LENGTH=2543
Length=2543
Score = 4246 bits (2299), Expect = 0.0
Identities = 2466/2547 (97%), Gaps = 10/2547 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCTCTCCTCACCGGATTATCCAATTTCCATATTTCTCACGTCCTCTTCTTCCTTCACCT 60
|||||||| ||||||||||||||| | || | || ||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 1 ATCTCTCCACACCGGATTATCCAA--T--AT-TCTC-CACGTCCGCTTCTTCCTTCAACT 54
Query 61 GAGTCCCACTAAGTTGACTCGTTCTCTCGTCTTTT-GAT--ACACAAACTATGACGGAGA 117
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 55 GAGTCCGACTAAGTTGACTCGTTCTCTCGTGTTTTCGATAGACACAAACTATGACGGAGA 114
Query 118 TCGATCGTTCACGCGCGTTCGCCAAAGACGTTAAGCGTATCGTCGTCAAGGTTGGGACTG 177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 115 TCGATCGTTCACGCGCGTTCGCCAAAGACGTTAAGCGTATCGTCGTCAAGGTTGGGACTG 174
Query 178 CAGTTGTTACTGGGAAAGGTGGAAGATTGGCTCTTGGACGTTTAGGAGCAATCTGTGAAC 237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 175 CAGTTGTTACTGGGAAAGGTGGAAGATTGGCTCTTGGACGTTTAGGAGCTATCTGTGAAC 234
Query 238 AGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGATTTGAGGTCATTTTGGTGTCATCTGGTGCCGTTG 297
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 AGCTTGCGGAGTTAAACTCAGATGGATTTGAGGTCATTTTGGTGTCATCTGGTGCCGTTG 294
Query 298 GTCTCGGTCGACAGAGGCTTCGATATAGACAACTAGTCAACAGCAGTTTTGCAGACCTAC 357
|||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 295 GTCTTGGTCGACAAAGGCTTCGATACAGACAATTAGTCAACAGCAGTTTTGCAGATTTAC 354
Query 358 AGAAGCCACAGATGGAACTTGATGGGAAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAAGTAGCCTCA 417
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||
Sbjct 355 AGAAGCCACAAATGGAACTTGATGGGAAGGCTTGTGCTGGTGTTGGGCAGAGCAGTCTCA 414
Query 418 TGGCTTACTATGAGACTATGTTTGACCAGTTGGATGTGACGGTTGCTCAAATGCTTGTGA 477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415 TGGCTTACTATGAGACTATGTTTGACCAGTTGGATGTGACGGTTGCTCAAATGCTTGTGA 474
Query 478 CTGATAGCAGTTTTAGAGATAAGGATTTCAGGAAGCAACTTAGTGAAACAGTCAAAGCGA 537
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 475 CCGATAGCAGTTTTAGAGATAAGGATTTCAGGAAGCAACTTAGTGAAACTGTCAAAGCGA 534
Query 538 TGCTGAGGATGAGGGTTATTCCTGTTTTCAATGAAAATGATGCTATAAGCACTCGCAGAG 597
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 TGCTGAGGATGAGGGTTATTCCAGTTTTCAATGAGAATGATGCTATAAGCACTCGCAGAG 594
Query 598 CCCCCTATAAGGATTCTACTGGTATATTTTGGGATAATGACAGCTTAGCTGCTCTTCTGT 657
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 595 CCCCCTACAAGGATTCTACTGGTATATTTTGGGATAATGACAGCTTAGCCGCTCTTCTGT 654
Query 658 CGCTAGAGCTGAAAGCTGATCTTTTGATTCTTCTAAGTGATGTTGAGGGTCTTTACACTG 717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 655 CGCTAGAGCTGAAAGCTGATCTTTTGATTCTTCTAAGTGATGTTGAGGGCCTTTACACTG 714
Query 718 GCCCTCCAAGTGATTCTACCTCAAAGTTAATCCACACATTCATTAAAGAAAAACACCAGG 777
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 GCCCTCCAAGTGATTCTACCTCAAAATTAATACACACATTCATTAAAGAAAAACACCAGG 774
Query 778 ACGAGATTACTTTTGGCGAAAAGTCCAAATTAGGACGAGGGGGTATGACTGCAAAAGTTA 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 ACGAGATTACTTTTGGCGAAAAGTCCAAATTAGGACGAGGGGGTATGACTGCAAAAGTTA 834
Query 838 AAGCTGCTGTTAATGCAGCTTATGGTGGCGTTCCTGTTATCATAACCAGTGGGTATGCAG 897
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 835 AAGCTGCTGTTAATGCAGCTTATGGTGGCGTTCCTGTTATCATAACCAGTGGATATGCAG 894
Query 898 CTGAGAATATAAGTAAAGTCCTTAGAGGACTGCGTGTTGGTACCCTGTTCCATCAAGATG 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 CTGAGAATATAAGTAAAGTCCTTAGAGGACTGCGTGTTGGTACCCTGTTCCATCAAGATG 954
Query 958 CTCATTTGTGGGCGCCGGTCGTAGATACTACTTCTCGTGACATGGCAGTTGCTGCAAGGG 1017
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 CTCATTTATGGGCTCCGGTCGTAGATACTACTTCTCGTGACATGGCAGTTGCTGCAAGGG 1014
Query 1018 AAAGCTCGAGAAAGCTTCAGGCCTTATCTTCAGAAGATAGGAAACAAATTCTACTCGACA 1077
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1015 AAAGCTCAAGAAAGCTTCAGGCCTTATCTTCAGAAGATAGGAAACAAATTCTACACGACA 1074
Query 1078 TTGCCAATGCCCTTGAAGCAAATGAGAAAACAATTAAAGCTGAGAATGATTTAGATGTCG 1137
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1075 TTGCCAATGCCCTTGAAGTAAATGAGAAAACAATTAAAGCTGAGAATGATTTAGATGTTG 1134
Query 1138 CTGCAGCACAAGAAGCTGGATATGAAGAGTCTTTGGTAGCTCGCTTAGTTATGAAGCCTG 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 CTGCAGCACAAGAAGCTGGATATGAAGAGTCTTTGGTAGCTCGCTTAGTTATGAAGCCTG 1194
Query 1198 GGAAGATCTCAAGCCTTGCGGCTTCCGTACGCCAGCTAGCTGAAATGGAAGATCCAATAG 1257
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1195 GGAAGATCTCAAGCCTTGCAGCTTCCGTTCGCCAGCTAGCCGAAATGGAAGATCCAATAG 1254
Query 1258 GCCGTGTATTAAAGAAAACCCAGGTTGCAGATGATCTGATTTTAGAGAAGACCTCATCAC 1317
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 GCCGTGTATTAAAGAAAACTCAGGTTGCAGATGATCTTATTTTAGAGAAGACCTCATCAC 1314
Query 1318 CAATAGGTGTTCTTCTGATTGTTTTTGAATCCCGGCCTGATGCACTTGTTCAAATAGCTT 1377
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1315 CAATAGGTGTTCTTCTGATTGTTTTTGAATCCCGGCCTGATGCACTTGTTCAGATAGCTT 1374
Query 1378 CGCTTGCAATCCGGAGTGGAAATGGTCTTCTCCTGAAGGGTGGAAAGGAGGCTCGTCGAT 1437
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 CGCTTGCAATCCGGAGTGGAAATGGTCTTCTGCTGAAGGGTGGAAAGGAGGCTCGTCGAT 1434
Query 1438 CAAATGCTATCTTACACAAGGTGATCACTGATGCAATTCCGAAGACTGTTGGAGGTAAAC 1497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1435 CAAATGCTATCTTACACAAGGTGATCACTGATGCAATTCCGGAGACTGTTGGAGGTAAAC 1494
Query 1498 TCATAGGACTTGTGACTTCGAGAGAGGAGATTCCTGATTTGCTCAAGCTTGATGACGTTA 1557
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 TCATAGGACTTGTGACCTCAAGAGAGGAGATTCCTGATTTGCTCAAGCTTGATGACGTTA 1554
Query 1558 TTGATCTTGTAATCCCAAGAGGCAGCAACAAGCTTGTTTCTCAGATAAAAAACTCGACGA 1617
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTGATCTTGTGATCCCAAGAGGCAGCAACAAGCTTGTTTCTCAAATAAAAAACTCGACGA 1614
Query 1618 AAATCCCAGTGCTAGGCCATGCTGATGGAATCTGTCATGTATATGTTGATAAGTCTTGTA 1677
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1615 AAATCCCAGTGCTAGGCCATGCTGATGGAATCTGTCATGTATATGTTGATAAGTCTGGTA 1674
Query 1678 AACTGGACATGGCAAAGCGCATCGTTTCCGACGCAAAGTTAGACTATCCAGCAGCCTGTA 1737
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1675 AACTGGACATGGCAAAGCGCATTGTTTCCGATGCAAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTA 1734
Query 1738 ATGCGATGGAAACCCTTCTTGTACATAAAGATTTGGAGCAGAATGGTTTTCTCAATGATC 1797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1735 ATGCGATGGAAACCCTTCTTGTACATAAAGATTTGGAGCAGAATGGTTTTCTCGATGATC 1794
Query 1798 TTATTTATGTTCTGCAAACCAAAGGCGTCACTTTGTATGGTGGGCCAAGAGCAAGTGCAA 1857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 TTATTTATGTTCTGCAAACCAAAGGCGTCACTTTGTATGGTGGGCCAAGAGCAAGTGCAA 1854
Query 1858 AACTGAATATTCCGGAAACAAAATCATTTCACCACGAGTACAGTTCCAAGGCCTGCACCG 1917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 AACTGAATATTCCGGAAACAAAATCATTTCACCACGAGTACAGTTCCAAGGCCTGCACCG 1914
Query 1918 TTGAAATTGTAGAAGACGTATATGGTGCTATAGATCATATTCACCAACATGGAAGTGCAC 1977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 TTGAAATTGTAGAAGACGTATATGGTGCTATAGATCATATTCACCAACATGGAAGTGCAC 1974
Query 1978 ACACTGATTGCATAGTGACAGAAGATAGTGAAGTGGCAGAGATATTCCTCCGCCAAGTGG 2037
||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1975 ACACTGATTGCATAGTGACGGAAGATAGTGAAGTAGCAGAAATATTCCTCCGCCAAGTGG 2034
Query 2038 ACAGTGCTGCTGTTTTCCACAATGCAAGCACAAGATTCTCTGATGGTTTTCGGTTCGGAC 2097
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2035 ACAGTGCTGCTGTTTTCCACAATGCAAGCACAAGATTCTCTGATGGTTTTAGGTTCGGAC 2094
Query 2098 TTGGTGCTGAGGTGGGAATAAGCACAAGCAGGATTCATGCCCGTGGTCCAGTCGGAGTTG 2157
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2095 TTGGTGCTGAGGTGGGAATAAGCACAAGCAGGATTCATGCCCGTGGTCCAGTTGGAGTTG 2154
Query 2158 AAGGATTATTGACAACGAGATGGATAATGAGAGGAAAAGGACAAGTTGTGGATGGAGACA 2217
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 AAGGATTATTGACAACAAGATGGATAATGAGAGGAAAGGGACAAGTTGTGGATGGAGACA 2214
Query 2218 ATGGAATCGTTTACACCCATAAGGATCTTCCTGTCTTACAAAGGACAGAGGCTGTTGAGA 2277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 ATGGAATCGTTTACACCCATAAGGATCTTCCTGTCTTACAAAGGACAGAGGCTGTTGAGA 2274
Query 2278 ATGGAATTTAGTTCTCTCTTTCTCTGCTAATGTCATATTATGTTTTACCATTATGATTGA 2337
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2275 ATGGAATTTAGTTCTCTCTTTCTCTGCTGATGTCATATTATGTTTTACAATTATGATTGA 2334
Query 2338 AGtttttttCCC-TTTCACATAGGATTTAGTGTTCCTTGAGGTTTGTACCATCATAAGAA 2396
|||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2335 AGTTTTTTCCCCCTTTTACATAGGATATAGTGTTCCTTGAGGTTTGTACCATCATAAGAA 2394
Query 2397 GATCCCTTTACTTAAGTGGTCTTTGATAATAGTGAAATGTTTAACAGCTTCTCTTCATGT 2456
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2395 GATCTCATTACTTAAGTGGTCTTTGATAATAGTGAAATGTTTAGCAGCTTCTCTTCATGT 2454
Query 2457 CaaaaaaaCTCCATATAAGTCCACAACCTTTGATTTACCACAACTATTTGTATCATTTCT 2516
||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2455 CAAAAAAGCTCCATACATGTCCACAACCTTTGATTTACCACAACTATTTGTATCATTTCT 2514
Query 2517 CCATGCAGAATAAGTTATATTTTTTCT 2543
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515 CCATGCAGAATAAGTTATATTTTTTCT 2541
> AT2G39800.1 | Symbols: P5CS1, ATP5CS | delta1-pyrroline-5-carboxylate
synthase 1 | chr2:16598164-16603319 REVERSE LENGTH=2886
Length=2886
Score = 2383 bits (1290), Expect = 0.0
Identities = 1872/2152 (87%), Gaps = 44/2152 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 113 GGAGATCGATCGTTCACGCGCGTTCGCCAAAGACGTTAAGCGTATCGTCGTCAAGGTTGG 172
|||| | ||||||||||| || || |||| |||||| || ||||||||||| ||||||||
Sbjct 386 GGAGCTAGATCGTTCACGTGCTTTTGCCAGAGACGTCAAACGTATCGTCGTTAAGGTTGG 445
Query 173 GACTGCAGTTGTTACTGGGAAAGGTGGAAGATTGGCTCTTGGACGTTTAGGAGCAATCTG 232
||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||
Sbjct 446 GACAGCAGTTGTTACTGGAAAAGGTGGAAGATTGGCTCTTGGTCGTTTAGGAGCACTGTG 505
Query 233 TGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGATTTGAGGTCATTTTGGTGTCATCTGGTGC 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 506 TGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGATTTGAGGTGATATTGGTGTCATCTGGTGC 565
Query 293 CGTTGGTCTCGGTC-GACAGAGGCTTCGATATAGACAACTAGTCAACAGCAGTTTTGCAG 351
|||||||| || | | || |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |
Sbjct 566 GGTTGGTCTTGG-CAGGCAAAGGCTTCGTTATCGACAATTAGTCAATAGCAGCTTTGCGG 624
Query 352 ACCTACAGAAGCCACAGA-TGGAACTTGATGGGAAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAAGT 410
| || |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 625 ATCTTCAGAAGCCTCAGACT-GAACTTGATGGGAAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAAGC 683
Query 411 AGCCTCATGGCTTACTATGAGACTATGTTTGACCAG-TTGGATGTGACGGTTGCTCAAAT 469
|| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |
Sbjct 684 AGTCTTATGGCTTACTATGAGACTATGTTTGACCAGCTT-GATGTGACGGCAGCTCAACT 742
Query 470 GCTTGTGACTGATAGCAGTTTTAGAGATAAGGATTTCAGGAAGCAACTTAGTGAAACAGT 529
|| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 743 TCTGGTGAATGACAGTAGTTTTAGAGACAAGGATTTCAGGAAGCAACTTAATGAAACTGT 802
Query 530 CAAAG-CGATGC-TGAGGATGAGGGTTATTCCTGTTTTCAATGAAAATGATGCTATAAGC 587
| ||| | |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 803 C-AAGTCTATGCTTGA-TTTGAGGGTTATTCCAATTTTCAATGAGAATGATGCTATTAGC 860
Query 588 ACTCGCAGAGCCCCCTATAAGGATTCTACTGGTATATTT-TGGGATAATGACAGCTTAGC 646
|| || |||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||
Sbjct 861 ACCCGAAGAGCCCCATATCAGGATTCTTCTGGTAT-TTTCTGGGATAACGATAGCTTAGC 919
Query 647 TGCTCTTCTGTCGCTAGAGCTGAAAGCTGATCTTTTGATTCTTCTAAGTGATGTTGAGGG 706
|||||| ||| || | || ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||
Sbjct 920 TGCTCTACTGGCGTTGGAACTGAAAGCTGATCTTCTGATTCTTCTGAGCGATGTTGAAGG 979
Query 707 TCTTTACACTGGCCCTCCAAGTGATTCTACCTCAAAGTTAATCCACACATTCATTAAAGA 766
||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||
Sbjct 980 TCTTTACACAGGCCCTCCAAGTGATCCTAACTCAAAGTTGATCCACACTTTTGTTAAAGA 1039
Query 767 AAAACACCAGGACGAGATTACTTTTGGCGA-AAAGTCCAA-ATTA-GGACGAGGGGGTAT 823
|||||| || || |||||||| || ||||| ||| | ||| |||| ||| ||||||||||
Sbjct 1040 AAAACATCAAGATGAGATTACATTCGGCGACAAA-T-CAAGATTAGGGA-GAGGGGGTAT 1096
Query 824 GACTGCAAAAGTTAAAGCTGCTGTTAATGCAGCTTATGGTGGCG-TTCCTGTTATCATAA 882
|||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||
Sbjct 1097 GACTGCAAAAGTCAAAGCTGCAGTCAATGCAGCTTATGCTGG-GATTCCTGTCATCATAA 1155
Query 883 CCAGTGGGTATGCAGCTGAGAATATAAG-TAAAGTCCTTAGAGGACTGCGTGTTGGTACC 941
||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||||||| |||
Sbjct 1156 CCAGTGGGTATTCAGCTGAGAACAT-AGATAAAGTCCTCAGAGGACTACGTGTTGGAACC 1214
Query 942 CTGTTCCATCAAGATGCTCATTTGTGGGCGCCGGTCGTAGATACTACTTCTCGTGACATG 1001
|||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||| ||| | |||||||||||
Sbjct 1215 TTGTTTCATCAAGATGCTCGTTTATGGGCTCCGATCACAGATTCTAATGCTCGTGACATG 1274
Query 1002 GCAGTTGCTGCAAGGGAAAGCTCGAGAAAGCTTCAGGCCTTATCTTCAGAAGATAGGAAA 1061
||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1275 GCAGTTGCTGCGAGGGAAAGTTCCAGAAAGCTTCAGGCCTTATCTTCGGAAGACAGGAAA 1334
Query 1062 CAAATTCTACTCGACATTGCCAATGCCCTTGAAGCAAATGAGAAAACAATTAAAGCTGAG 1121
||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||
Sbjct 1335 AAAATTCTGCTTGATATTGCCGATGCCCTTGAAGCAAATGTTACTACAATCAAAGCTGAG 1394
Query 1122 AATGATTTAGATGTCGCTGCAGCACAAGAAGCTGGATAT-GAAGAGTCTTTGGTAGCTCG 1180
||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| | | |||||||| |||| |||||
Sbjct 1395 AATGAGTTAGATGTAGCTTCTGCACAAGAGGCTGGGT-TGGAAGAGTCAATGGTGGCTCG 1453
Query 1181 CTTAGTTATGA-AGCCTGGGAAGATCTCAAGCCTTGCGGCTTCCGTACGCCAGCTAGCTG 1239
||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||
Sbjct 1454 CTTAGTTATGACA-CCTGGAAAGATCTCGAGCCTTGCAGCTTCAGTTCGTAAGCTAGCTG 1512
Query 1240 AAATGGAAGATCCAATAGGCCGTGTATTAAAGAAAACCCAGGTTGCAGATGATC-TGATT 1298
| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || || |
Sbjct 1513 ATATGGAAGATCCAATCGGCCGTGTTTTAAAGAAAACAGAGGTGGCAGATGGTCTTG-TC 1571
Query 1299 TTAGAGAAGACCTCATCACCAATAGGTGTTCTTCTGATTGTTTTTGAATCCCGGCCTGAT 1358
||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1572 TTAGAGAAGACCTCATCACCATTAGGCGTACTTCTGATTGTTTTTGAATCCCGACCTGAT 1631
Query 1359 GCACTTGTTCAAATAGCTTCGCTTGCAATCCGGAGTGGAAATGGTCTTCTCCTGAAGGGT 1418
|||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1632 GCACTTGTACAGATAGCTTCACTTGCCATCCGTAGTGGAAATGGTCTTCTGCTGAAGGGT 1691
Query 1419 GGAAAGGAGGCTCGTCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTGATCACTGATGCAATTCC- 1477
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1692 GGAAAGGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTGATCACTGATGCAATTCCA 1751
Query 1478 GAAGACTGTTGGAGGTAAACTCATAGGACTTGTGACTTCGAGAGAGGAGATTCCTGATTT 1537
|| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1752 GA-GACTGTTGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTGACTTCAAGAGAAGAGATTCCTGATTT 1810
Query 1538 GCTCAAGCTTGATGACGTTATTGATCTTGTAATCCCAAGAGGCAGCAACAAGCTTGTTTC 1597
||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1811 GCTTAAGCTTGATGACGTTATCGATCTTGTGATCCCAAGAGGAAGCAACAAGCTTGTTAC 1870
Query 1598 TCAGATAAAAAACT-CGACGAAAATCCCAGTGCTAGGCCATGCTGATGGAATCTGTCATG 1656
|||||||||||| | | || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1871 TCAGATAAAAAA-TACTACAAAAATCCCTGTGCTAGGTCATGCTGATGGAATCTGTCATG 1929
Query 1657 TATATGTTGATAAGTCTTGTAA-ACTGGACATGGCAAAGCGCATCGTTTCCGACGCAAAG 1715
||||||| || ||| ||||| | || ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||
Sbjct 1930 TATATGTCGACAAGGCTTGTGATAC-GGATATGGCAAAGCGCATAGTTTCTGATGCAAAG 1988
Query 1716 TTAGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACCCTTCTTGTACATAAAGATTTGGAG 1775
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||
Sbjct 1989 TTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACCCTTCTTGTGCATAAGGATCTAGAG 2048
Query 1776 CAGAATGGTTTTCTCAATGATCTTATTTATGTTCTGCAAACCAAAGGCGTCACTTTGTAT 1835
||||||| | | || ||||| ||||||| || |||||| | ||| || ||||||||||||
Sbjct 2049 CAGAATGCTGTGCTTAATGAGCTTATTTTTGCTCTGCAGAGCAATGGAGTCACTTTGTAT 2108
Query 1836 GGTGGGCCAAGAGCAAGTGCAA-A-ACTGAATATTCCGGAAACAAAATCATTTCA-CCAC 1892
||||| ||||| |||||| || | |||||| || || ||| || ||||| || |||
Sbjct 2109 GGTGGACCAAGGGCAAGT--AAGATACTGAACATACCAGAAGCACGGTCATT-CAACCAT 2165
Query 1893 GAGTACAGTTCCAAGGCCTGCACCGTTGAAATTGTAGAAGACGTATATGGTGCTATAGAT 1952
|||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2166 GAGTACTGTGCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTAGAAGACGTTTATGGTGCTATAGAT 2225
Query 1953 CATATTCACCAACATGGAAGTGCACACACTGATTGCATAGTGACAGAAGAT-AGTGAAGT 2011
|| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||| | |||||
Sbjct 2226 CACATTCACCGACATGGGAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAGGATCAC-GAAGT 2284
Query 2012 GGCAGAGATATTCCTCCGCCAAGTGGACAGTGCTGCTGTTTTCCACAATGCAAGCACAAG 2071
|||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||
Sbjct 2285 TGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTGGATAGCGCTGCTGTGTTCCACAACGCCAGCACAAG 2344
Query 2072 ATTCTCTGATGGTTTTCGGTTCGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAATAAGCACAAGCAGGAT 2131
|||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 2345 ATTCTCAGATGGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCAGAGGTGGGGGTAAGCACGGGCAGGAT 2404
Query 2132 TCATGCCCGTGGTCCAGTCGGAGTTGAAGGATTA-TTGACAACGAGATGGATAATGAGAG 2190
||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2405 CCATGCTCGTGGTCCAGTCGGGGTCGAAGGATTACTT-ACAACGAGATGGATAATGAGAG 2463
Query 2191 GAAAAGGACAAGTTGTGGATGGAGACAATGGAATCGTTTACACCCATAAGGA 2242
|||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 2464 GAAAAGGACAAGTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAGGA 2515
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 126220028588
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5