BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg486043 Length=2946 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G56040.1 | Symbols: UGP3 | UDP-glucose pyrophosphorylase 3 |... 4747 0.0 > AT3G56040.1 | Symbols: UGP3 | UDP-glucose pyrophosphorylase 3 | chr3:20792477-20797572 REVERSE LENGTH=2954 Length=2954 Score = 4747 bits (2570), Expect = 0.0 Identities = 2824/2949 (96%), Gaps = 8/2949 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATATGCTTGGAGTATCTCTCCTTATCCCTCCTTGGGGTTCTCTTCAAAACCCCTTCTTCC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3 ATATGCTTGGAGTATCTCTCCTTATCCCTCCTTGGGGTTCTCTTCAAAACCCCTTCTTCC 62 Query 61 TTCTCCTTCTCTAACCATCTTCTTCGCCATGGCTAATCCTCAAGCTTCTCCCATTCTCCA 120 |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 63 TTCTCCTTCTGTAACCATCTTCTTCACCATGGCTAATCCTCAAGCTTCTCCAATTCTCCA 122 Query 121 TCACCCCCAAAATCACCTCTCTCTCTTCCACTTTCGTACTACTACATCTCCTCGCTCCTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 123 TCACCCCCAAAATCACCTCTCTCTCTTCCACTTTCGCACTACAACATCTCCTCGCTCCTT 182 Query 181 CAGCTCTCTGCATTTCAGAAAACCTCTGCTCTTTCTCCCTTCTTCTTCTTCATTTTCCTC 240 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct 183 CAGCTCTCTGCATTTCAGAAAACCACTCCTCTTTCTCTCTTCTTCTTCGTCATTTTCCTC 242 Query 241 GAAATTACAGCAGAGCGAGCAGCAATGTGACAATCACCAGGTGAGACACGTGTCCACCGT 300 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 243 GAAATTACAGCAGAGCGAGCAGCAATGTAATAATCACCAGGTGAGACACGTGTCCACCGT 302 Query 301 ACCTGTCGAGTATTCCACTCCGACTCCTCCTGAATCCGACGATTTCTTATCGGAAATCGA 360 ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 303 ACCTGTCGAGTATTCTACACCGACTCCTCCGGAATCCGACGATTTCTTATCGGAAATCGA 362 Query 361 TCGGCTTAACTCTCTCCGT-GCGAAACTAGACGTTTCCAAGGATTTACGCCGGAAGGACG 419 ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 363 TCGGCTTAAGTCTCTCC-TATCGAAACTAGACGTTTCCAAGGATTTACGAAGGAAGGACG 421 Query 420 CGGTTATCGACGCTGATTCCAGAGTTCGTCGATTCTTCAGCGAGAATCGAGGCGGTTTAT 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 422 CGGTTATCGACGCTGATTCCAGAGTTCGTCGATTCTTCAGCGAGAATCGAGGCGGTTTAT 481 Query 480 CTCAGGTTTTAGGTTCA-CTTGGTTTGAATTCGAAAGAGATGTTTCTCGTTAAGTGTGTT 538 || ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 482 CTAAGGTTTTTGGTT-ATCTTGGTTTGAATTCGAATGAGATGTTTCTCGTTAAGTGTGTT 540 Query 539 ATCGCGGCGGGGCAAGAACATGCTCTATGTATGAATTACGAGGAAGCATTTGAACAAGAG 598 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| Sbjct 541 ATCGCGGCGGGGCAAGAACACGCTCTATGTATGAATTATGAGGAAGCATTTGGAGAAGAA 600 Query 599 GAGGAAGAGTATACAGTGAGAAGTTCGGTGAAGAACGCGCTCTACGCATTGGTGGAGATG 658 ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 601 GAGGAGGAGTATACAGTGAGAAGCTCAGTGAAGAACGCACTTTACGCATTGGTGGAGATG 660 Query 659 ATTGAGCGATTCGATGTGAATAGTAGCGGCTATAAAGGTAGAAGAGAGATTGGTACAGTT 718 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 661 ATTGAGAGATTCGATGTGAATAGTAGCGGCTATAAAGGTAGAAGAGAGATGGGTACAGTT 720 Query 719 TTAGATGCAGAGGAGATTTCTCACTTTAGAAAATTCTTGACATTTCTGGAAGAAATTGAA 778 |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 721 TTAGATTCAGAGGAGATTGCTCATTTTAGAAAATTCTTGACGTTTCTGGAAGAAATTGAA 780 Query 779 CAGTTCTACGACTGCATTGGAGGAATCATCGGATATCAGGTTATGGTTCTTGAGCTTCTT 838 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 CAGTTCTACGACTGCATTGGAGGAATCATTGGATATCAGGTTATGGTTCTTGAGCTTCTT 840 Query 839 CATCAATCATCTAAGAGACGTAATACTAACCGGTCACATCTTGTTGAAGAATCCTTGGGT 898 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct 841 CATCAGTCATCTAAGAGACGTAATACTAACCGGTCACAACTTGTTGAAGAATCATTGGGT 900 Query 899 TGCCAGTACTTAGAAATGCATACTCCTAGTGTTCTTGACCTCACTCAGAAGGCAGATTAT 958 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| Sbjct 901 TGCCAGTATTTAGAAATGCATACTCCTAGTGTTCTTGATCTCACTCAGGAGGAAGATTAT 960 Query 959 GCCTCGCAGGCGGCAATATGGGGAATTGAGGGATTGCCAGACCTAGGTGAAATATATCCC 1018 || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 GCTTCACAGGCGGCTCTGTGGGGAATTGAGGGATTGCCAGACCTAGGTGAAATATATCCC 1020 Query 1019 CTAGGAGGTGCAGCAGACAGACTAGGTTTGGTTGATTCAGAAACAGGAGAATGCCTTCCT 1078 ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1021 CTAGGAGGTGCTGCAGACAGACTAGGTTTGATTGATTCAGAAACTGGAGAATGCCTTCCT 1080 Query 1079 GCAGCAATGCTTGCTCATTGTGGACGAACTTTGTTGGAAGGACTTATTAGAGATCTTCAG 1138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 GCAGCAATGCTTGCTCATTGTGGACGAACTTTGTTGGAGGGACTTATTAGAGATCTTCAG 1140 Query 1139 GCTAGAGAGTTTCTTTACTTCAAACTTTATGGAAAGCAATGTGTCACACCTGTTGCCATT 1198 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 GCTAGAGAGTTCCTTTACTTCAAACTTTATGGAAAGCAATGTGTCACACCTGTTGCCATT 1200 Query 1199 ATGACAAGTGCTGCAAAGAACAACCATGAGCATGTAAGTTCCCTTTGTGAAAGGCTCAAA 1258 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 1201 ATGACAAGTGCTGCAAAGAACAACCATGAGCATGTAAGTTCGCTTTGTGAAAGGCTTAAA 1260 Query 1259 TGGTTTGGAAGAGGTCAATCAAATTTCAGACTCTTTGAACAGCCTCTCGTCCCAGCTGTC 1318 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 TGGTTTGGCAGAGGTCAATCAAATTTCCGACTCTTTGAACAGCCTCTCGTCCCAGCTGTC 1320 Query 1319 AGTGCTGAAGATGGTCAATGGATAGTATCAAAGCCCTATGTGCCAGTTAGTAAACCTGGT 1378 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| Sbjct 1321 AGTGCTGAAGATGGTCAATGGATAGTATCAAAGCCCTTTGTTCCAGTTAGTAAACCTGGT 1380 Query 1379 GGTCATGGTGTGATTTGGAAATTGGCTTATGACAAAGGTGTCTTTAACTGGTTTTACGAT 1438 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 GGTCATGGTGTAATTTGGAAATTGGCTTATGACAAAGGTGTCTTTAACTGGTTTTACGAT 1440 Query 1439 CATGGAAGAAAGGGAGCAACTGTTAGGCAAGTTAGTAACGTTGTGGCTGCCACAGATGTT 1498 ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1441 CATGGAAGAAAAGGAGCAACCGTTCGGCAAGTTAGTAACGTTGTGGCTGCTACAGATGTT 1500 Query 1499 ACCCTCTTGGCCCTTGCTGGGATTGGCTTACGGTACAATAAGAAACTTGGGTTTGCATCC 1558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 ACCCTCTTGGCCCTTGCTGGGATTGGCTTACGGTATAATAAGAAACTTGGGTTTGCATCC 1560 Query 1559 TGTAAAAGGAATGCTGGAGCAACTGAAGGGATTAATGTATTGATGGAGAAGAAGAATTTC 1618 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 TGTAAAAGGAATGCTGGAGCAACCGAAGGGATTAATGTTTTGATGGAGAAGAAGAATTTC 1620 Query 1619 GATGGGAAGTGGGAATATGGTATATCGTGCATTGAGTACACAGAATTTGATAAATTCGGA 1678 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1621 GATGGGAAGTGGGAATATGGTATATCGTGCATTGAGTACACAGAATTTGATAAATTC-GA 1679 Query 1679 -ATCTCCAACAGATCACCTTCTTCAAATGGTTTGCAGGCTGATTTCCCGGCCAATACAAA 1737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 1680 TATCTCCAACAGATCACCTTCTTCAAATGGTTTGCAGGCTGATTTTCCTGCCAATACAAA 1739 Query 1738 CATTCTATATGTAGACTTACATTCTGCCGAGTTAATTGGGTCGAGCAGTAATGCAAAAAG 1797 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1740 CATTCTATATGTAGACTTACATTCGGCCGAGTTAATTGGGTCAAGCAGTAATGCAAAAAG 1799 Query 1798 TTTGCCAAATATGGTTCTCAATACAAAGAAGCGAATTGAGTACATTGATCAGTATGGAGA 1857 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1800 TTTGCCAAATATGGTTCTCAATACAAAGAAGCGAATTGAGTACCTTGATCAGTATGGAGA 1859 Query 1858 CTATCACAGCGTTTTGGGTGGTAGATTGGAATGCACGATGCAAAACATAGCAGACAAttt 1917 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1860 CTATCACAGCGTTATGGGTGGTAGATTGGAATGCACGATGCAAAACATAGCAGACAACTT 1919 Query 1918 ttttAATAAGTTTCCATCTAGATGCCAGGGCAGTCTAGAAGACAAACTGGATACATATAT 1977 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1920 TTTTAATAAGTTTCCATCTAGATGCCACGGCAGTCTAGAAGACAAACTGGATACATATAT 1979 Query 1978 TGTATACAACGAACGAAGAAGGGTCACTTCATCAGCTAAGAAGAAGAAACCACATGCAAG 2037 ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1980 TGTGTACAACGAACGAAGAAAGGTCACTTCATCAGCTAAGAAGAAGAAACCACACGCAAG 2039 Query 2038 TGCTGCATTACACCAGACTCCAGATGGTGCATTGTTAGATATACTCCGGAATGCATATGA 2097 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| Sbjct 2040 TGCTGCATTACACCAGACTCCAGATGGTGCATTGTTGGATATACTCCGGAATGGATATGA 2099 Query 2098 CCTCCTTACGGAGTGTGATATTAAACTCCCCATGATTGAAGCTAATGATAAATATGTTGA 2157 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2100 CCTCCTTACGGAGTGTGATATCAAACTCCCCATGATTGAAGCTAATGATAAATATGTTGA 2159 Query 2158 TTCCCCACCTCCGTATCTCATTCTTCTGCATCCTGCCCTCGGCCCTCTTTGGGAAGTTTC 2217 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2160 TTCCCCACCTCCGTATCTCATTCTTCTGCATCCTGCCCTCGGCCCTCTTTGGGAAGTTTC 2219 Query 2218 GAGACAGAAATTCAAGGGAGGGTCTATTTCCAGTTGCTCAGAACTGCAACTAGAGATTGC 2277 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2220 GAGACAGAAATTCAAGGGAGGGTCCATTTCCAGTTGCTCAGAACTGCAACTAGAGATTGC 2279 Query 2278 AGAGTTCTCATGGAACAATGTTCAGGTTGATGGTAGCTTGATCATCACTGCTGAAAATGC 2337 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| Sbjct 2280 AGAGTTCTCATGGAACAATGTTCAGGTTGATGGTAGCTTGATCGTTACTGCTGAAAATGC 2339 Query 2338 CATGGGTTCAACAACACCTAACGATAATGGTGAACCAATATTACAATACGGATTAAGGTG 2397 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct 2340 CATGGGTTCAACAACACCTAATGATAATGGTGAACCAATATTGCAATACGGGTTAAGGTG 2399 Query 2398 TGGTAAGTGTAAACTGCATAATGTCAAGGTAGTGAACCGAGGAATCGATTGGAACAGTAA 2457 ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2400 TGGTAAGTGTAAACTGCATAACGTGAACGTAGTGAACCGAGGAATCGATTGGAACAGTAA 2459 Query 2458 ATCAAATGTTTACTGGAGAAACGATGTGAACCGGCTTGAGACTTGTAAAATCATACTCCA 2517 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 2460 ATCAAATGTTTACTGGAGAAACGATGTGAACAGGCTTGAGACCTGTAAAATCATACTGCA 2519 Query 2518 CGGAAATGCAGAATTCGAAGCCAGCAATGTAACTATAGAGGAAAACCATGTTTTTGAAGT 2577 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct 2520 CGGAAATGCAGAATTCGAAGCCAGCAATGTAACTATAGAGGGACACCATGTTTTTGAAGT 2579 Query 2578 ACCCGACGGTCACAAACTTAAGATCACACCAGGAAATGCAGGTTTAAGCATCAACTTGGA 2637 |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2580 ACCCGACGGTCACAAACTGAAGATCACATCAGGAAATGCAGGTTTAAGCATCAACTTGGA 2639 Query 2638 AGCAATGAAAGAAGAGGTAAAGGAAACAGGAAGCTGGTATTGGAACTACCAACTCAATGG 2697 |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2640 AGCACTGAAAGAAGAGGTAATGGAAACAGGAAGCTGGTATTGGAACTACCAACTCAATGG 2699 Query 2698 ATCCCACATTCATCTTCAACAAGTAGAGGTTTCACAAAACTAACCCCACCCAAATAATTG 2757 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| Sbjct 2700 ATCCCATATTCATCTTCAACAAGTAGAGGTTTCACAAAGCTAACCCAACCCGAATAATTT 2759 Query 2758 GGAGCTAAGCCTCCCAAAGTAGAAAAAAGTTAATAACCTCTCCTTGTCTTTGAAAATAAA 2817 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2760 GGAGCTAAGCCTCCCAAAGTAGAAAAAAGTTTATTACCTCTCCTTGTCCATGAAAATAAA 2819 Query 2818 AATAGAAAGTCTACTTTGCTGTAAATGTTTGCTCCTCTGTAAATTAAACAAAACAGTTCA 2877 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2820 AATAGAAAGTGTAATTTGCTGTAAATGTTTGCTCCTCTGTAAATTAAACAAAACAGTTCA 2879 Query 2878 CCATCTCTATATGATGTGTTCTCTTTCATGTAAAAAGCCCGAGAATTGTACAATTCATAG 2937 |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct 2880 CCATCT--ATCTGATGTGTTCTCTTTCATGAAAAAAGCTCGACAATTGTACAATTCATAA 2937 Query 2938 ATTCATACT 2946 ||||||||| Sbjct 2938 ATTCATACT 2946 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 146437306617 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5