BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg486382
Length=4334
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G59140.1 | Symbols: ATMRP14, MRP14, ABCC10 | multidrug resis... 4604 0.0
> AT3G59140.1 | Symbols: ATMRP14, MRP14, ABCC10 | multidrug resistance-associated
protein 14 | chr3:21863420-21868701 REVERSE
LENGTH=4461
Length=4461
Score = 4604 bits (2493), Expect = 0.0
Identities = 2734/2854 (96%), Gaps = 2/2854 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1482 AAAGGCTTACAATGCGGTTCTGTTTTGGTCATCACCTGTGTTTGTCTCTGCTGCAACTTT 1541
||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1515 AAAGGCTTATAATGCGGTTCTGTTCTGGTCATCACCGGTGTTTGTCTCTGCTGCAACTTT 1574
Query 1542 TGCCACTTGTTATTTCCTAGGCATTCCATTGAGAGCAAGTAATGTTTTTACTTTTGTGGC 1601
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1575 TGCCACTTGTTATTTCCTAGACATTCCATTGAGAGCAAGTAACGTTTTCACTTTTGTGGC 1634
Query 1602 AACACTACGTCTGGTCCAAGATCCAGTAAGAATGATCCCTGATGTGATTGGAGTGACAAT 1661
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1635 AACCCTGCGTCTGGTCCAAGATCCAGTAAGAATGATCCCTGATGTTATTGGAGTGACAAT 1694
Query 1662 TCAGGCTAAAGTTGCCTTCAGTCGTATTTCAACATTTCTAGAAGCTCCTGAGCTTCAAGG 1721
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1695 TCAGGCTAAAGTTGCCTTCAGTCGTATTGCAACATTTCTAGAAGCTCCTGAGCTTCAAGG 1754
Query 1722 TGGGGAGAGGCGGAGAAAGCAGAGATCAGAAGGCGATCAGAACGCGATTGTTATTAAATC 1781
||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1755 TGGGGAGAGGCGGAGAAAGCAGAGATCCGAAGGCAATCAGAACGCGATTATTATTAAATC 1814
Query 1782 TGCGAGCTTTTCTTGGGAGGAGAAGGGTTCAACAAAACCAAACTTGAGAAATGTGAGTCT 1841
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 TGCTAGCTTTTCTTGGGAGGAGAAAGGTTCAACAAAACCAAACTTGAGAAATGTGAGTCT 1874
Query 1842 TGAGGTTAAGTTTGGTGAGAAAGTGGCTGTTTGTGGTGAAGTTGGCTCTGGCAAATCAAC 1901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1875 TGAGGTTAAGTTTGGTGAGAAAGTGGCTGTTTGTGGTGAGGTTGGCTCTGGCAAGTCAAC 1934
Query 1902 ACTATTAGCTGCCATTCTCGGTGAAACTCCATGTGTCTCAGGAACAATCGATTTTTATGG 1961
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1935 ACTTTTAGCTGCCATTCTCGGTGAAACTCCATGTGTCTCAGGAACAATCGATTTTTATGG 1994
Query 1962 TACCATCGCCTATGTATCCCAAACAGCCTGGATCCAAACAGGGACAATAAGAGATAACAT 2021
|||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 TACCATAGCCTATGTTTCTCAAACAGCATGGATCCAAACGGGGACAATAAGAGATAACAT 2054
Query 2022 ACTCTTTGGAGGTGTGATGGATGAACAACGTTACCGTGAGACAATTCAAAAGTCTAGCCT 2081
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2055 CCTCTTTGGAGGTGTGATGGATGAACACCGTTACCGTGAGACAATTCAAAAATCTAGCCT 2114
Query 2082 AGACAAAGATCTTGAGCTCTTGCCTGATGGAGACCAGACTGAGATTGGTGAAAGAGGTGT 2141
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2115 AGACAAAGATCTTGAGCTCTTACCTGATGGAGACCAGACTGAGATTGGTGAAAGAGGTGT 2174
Query 2142 AAATCTTAGTGGAGGACAGAAACAGAGGATTCAACTCGCTCGTGCGCTATACCAAGATGC 2201
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2175 AAATCTAAGTGGAGGACAGAAACAGAGGATTCAACTCGCTCGTGCGCTATACCAAGATGC 2234
Query 2202 AGATATTTATCTCCTTGATGATCCATTCAGTGCTGTTGATGCACACACTGCTTCAAGTTT 2261
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2235 AGACATTTATCTCCTTGATGATCCATTTAGTGCTGTTGATGCACACACTGCTTCAAGTCT 2294
Query 2262 GTTCCAAGAATACGTTATGGGCGCTCTCGCAGGAAAAGCTGTGTTGTTGGTTACACATCA 2321
|||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GTTCCAAGAATATGTTATGGATGCTCTCGCGGGAAAAGCTGTGTTGTTGGTTACACATCA 2354
Query 2322 AGTGGATTTCTTGCCTGCTTTTGATTCTGTCTTGTTGATGTCAGATGGAGAAATCACTGA 2381
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2355 AGTGGATTTCTTGCCTGCTTTTGATTCTGTTTTGTTGATGTCAGATGGAGAAATCACTGA 2414
Query 2382 AGCCGATACATATCAAGAACTCCTAGCTAGAAGCAGAGACTTTCAAGATCTCGTGAACGC 2441
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2415 AGCTGATACATACCAAGAACTCCTAGCTAGAAGCAGAGACTTTCAAGATCTAGTGAACGC 2474
Query 2442 TCACAGAGAAACCGCTGGATCAGAAAGAGTGTTTGCGGTAGACCACCCCAGCAAACCGGT 2501
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 2475 TCACAGAGAAACCGCTGGTTCAGAAAGAGTGGTTGCGGTAGAAAACCCCACCAAACCGGT 2534
Query 2502 CAAGGAAATCAACAGAGTCCTTTCGTCCCAATCCAAGGTCTTGAAACCGAGTCGTTTGAT 2561
|||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2535 GAAGGAAATCAACAGAGTCATTTCATCTCAATCCAAGGTCTTGAAACCGAGTCGTTTGAT 2594
Query 2562 CAAACAGGAAGAGCGAGAGAAGGGAGACACGGGGTTGAGACCGTACATACAGTACATGAA 2621
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2595 CAAACAGGAAGAGCGAGAGAAGGGAGACACGGGATTGAGACCGTACATACAGTACATGAA 2654
Query 2622 TCAGAACAAAGGTTACATATTCTTCTTCATCGCGAGCCTAGCTCAGGTCATGTTTGCAAT 2681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
Sbjct 2655 TCAGAACAAAGGTTACATATTCTTCTTCATCGCGAGCTTAGCTCAGGTCACATTTGCAGT 2714
Query 2682 TGGACAGATTCTTCAGAACTCTTGGATGGCTGCAAACGTAGATAACCCTCAAGTTAGCAC 2741
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2715 TGGACAGATTCTTCAGAACTCTTGGATGGCTGCAAACGTAGATAACCCTCAAGTTAGCAC 2774
Query 2742 TTTGAAGTTGATATTGGTCTACTTGTTGATTGGGTTGTCCTCAGTTCTCTGCTTGATGGT 2801
|||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2775 TTTGAAGTTGATCTTGGTCTACTTACTGATTGGATTGTGCTCAGTTCTCTGCTTGATGGT 2834
Query 2802 TAGATCTGTCTGTGTCGTGATTATGTGCATGAAGTCATCAGCTTCATTGTTTTCTCAGCT 2861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2835 TAGATCTGTCTGTGTCGTGATTATGTGCATGAAGTCATCAGCTTCATTGTTTTCTCAGCT 2894
Query 2862 TCTTAACTCTCTTTTTAGAGCGCCTATGTCATTTTATGACTCGACACCTCTTGGAAGGAT 2921
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 2895 TCTTAACTCTCTTTTTAGAGCACCTATGTCATTTTATGACTCCACACCTCTTGGACGGAT 2954
Query 2922 TCTTAGCAGGGTCTCATCTGACTTGAGCATTGTAGATCTTGACGTTCCTTTCGGTCTGAT 2981
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2955 TCTTAGCAGGGTCTCATCTGACTTGAGCATTGTAGACCTTGACGTTCCTTTTGGTCTGAT 3014
Query 2982 CTTTGTGGTGGCGTCTACGGTAAACACAGGTTGCAGTCTTGGAGTGTTAGCTATTGTTAC 3041
||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3015 CTTTGTGGTTGCGTCTTCGGTAAACACAGGTTGTAGTCTTGGAGTGTTAGCTATTGTTAC 3074
Query 3042 TTGGCAAGTCTTGTTTGTATCTGTTCCCATGGTTTATCTAGCTTTTCGTTTACAGAAGTA 3101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3075 TTGGCAAGTCTTGTTTGTATCTGTTCCCATGGTTTATCTAGCTTTTCGTTTACAGAAGTA 3134
Query 3102 CTACTTCCAAACAGCGAAAGAGTTGATGCGGATCAATGGCACAACAAGATCTTATGTGGC 3161
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3135 CTACTTCCAAACAGCTAAAGAGTTGATGCGGATCAATGGCACGACAAGATCTTATGTGGC 3194
Query 3162 GAATCATTTAGCAGAATCAGTAGCAGGAGCAATAACAATAAGGGCATTTGATGAAGAAGA 3221
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3195 GAATCATTTAGCAGAATCAGTAGCAGGAGCAATAACAATAAGAGCATTTGATGAAGAAGA 3254
Query 3222 GAGGTTTTTTAAGAAAAGTCTTACACTCATTGATACAAACGCCAGTCCTTTCTTCCATAG 3281
||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3255 GAGGTTTTTCAAGAAAAGTCTCACACTCATTGATACAAACGCCAGTCCTTTCTTTCATAG 3314
Query 3282 CTTTGCAGCTAATGAATGGCTGATCCAGCGGCTTGAAACCGTCAGCGCCATTGTTCTTGC 3341
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 3315 CTTTGCAGCGAACGAATGGCTGATCCAGCGGCTTGAAACCGTTAGCGCCATTGTTCTCGC 3374
Query 3342 CTCCACTGCTTTCTGCATGGTTTTGC-TCCCTACAGGAACATTTAGCTCTGGGTTCATCG 3400
||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3375 CTCCACTGCTTTCTGCATGATTTTGCTTCCC-ACAGGAACATTTAGCTCTGGGTTCATCG 3433
Query 3401 GTATGGCGCTATCTTACGGTTTATCATTAAACCTGGGACTTGTTTACTCTGTACAGAACC 3460
|||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3434 GTATGGCGCTATCTTATGGTTTATCTTTGAATATGGGACTTGTTTACTCTGTTCAGAACC 3493
Query 3461 AATGCTACTTAGCTAACTGGATCATTTCGGTTGAAAGACTTAATCAGTACACACATTTAA 3520
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3494 AATGTTACTTAGCTAACTGGATCATTTCGGTTGAGAGACTTAATCAGTACACACATTTAA 3553
Query 3521 CACCTGAGGCTCCTGAAGTAATAGAAGAGACCCGACCACCGGTTAATTGGCCGGTTACAG 3580
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3554 CACCTGAGGCTCCTGAAGTAATAGAAGAGACTCGACCACCGGTTAATTGGCCGGTCACAG 3613
Query 3581 GCCGTGTCGAAATCTCTGATTTGCAGATAAGATACAGAAGAGAATCCCCATTGGTTCTAA 3640
| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3614 GTCGAGTCGAAATCTCGGATTTGCAGATAAGATACAGAAGAGAATCCCCACTGGTTCTAA 3673
Query 3641 AAGGAATCAGCTGCACATTTGAAGGAGGACACAAGATTGGAATTGTTGGCCGGACCGGTA 3700
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3674 AAGGAATCAGCTGCACATTTGAAGGAGGACACAAGATTGGAATTGTTGGCCGAACCGGTA 3733
Query 3701 GTGGAAAGACAACTCTGATCAGTGCTTTGTTCAGACTTGTAGAGCCTGTTGGAGGAAAGA 3760
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3734 GTGGGAAGACAACTCTGATCAGTGCTCTGTTCAGACTTGTTGAGCCTGTTGGAGGAAAGA 3793
Query 3761 TTGTCGTTGACGGTGTTGACATCTCCAAGATTGGAGTTCATGATCTGAGATCAAGATTTG 3820
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3794 TTGTCGTTGACGGTGTTGACATCTCCAAAATTGGAGTTCATGATCTGAGATCAAGGTTTG 3853
Query 3821 GGATTATACCACAGGATCCAACTCTGTTCAATGGAACAGTGAGATTTAATCTGGATCCTT 3880
|||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3854 GGATTATACCTCAAGATCCAACTCTCTTCAATGGAACAGTGAGATTTAATCTGGATCCTT 3913
Query 3881 TGTGTCAGCATTCAGATGCTGAGATTTGGGAGGTTCTTGGCAAGTGTCAACTAAAAGAAG 3940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3914 TGTGTCAGCATTCAGATGCTGAGATTTGGGAGGTTCTTGGCAAGTGTCAACTAAAAGAAG 3973
Query 3941 TGGTTCAAGAAAAAGAGAACGGCTTAGACTCATTAGTTGTGGAGGATGGATCAAATTGGA 4000
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3974 TGGTTCAAGAAAAAGAGAACGGCTTAGATTCATTAGTTGTGGAGGATGGATCAAATTGGA 4033
Query 4001 GCATGGGACAGAGACAGTTGTTCTGTTTAGGCAGGGCAGTTTTGAGAAGAAGCAGAGTAT 4060
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4034 GCATGGGACAGAGACAGTTGTTCTGTTTAGGCAGAGCAGTTTTGAGAAGAAGCAGAGTAT 4093
Query 4061 TAGTCCTCGACGAAGCCACGGCATCGATAGATAATGCAACAGATTTGATACTTCAGAAAA 4120
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4094 TAGTCCTGGACGAAGCCACGGCATCGATAGATAATGCAACAGATTTGATACTTCAGAAAA 4153
Query 4121 CAATCAGGCGAGAATTTGCCGATTGCACCGTCATAACCGTGGCTCACCGTATCCCCACCG 4180
||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||
Sbjct 4154 CAATCAGGCGAGAATTTGCAGATTGCACTGTCATTACAGTTGCTCACCGTATCCCTACCG 4213
Query 4181 TTATGGATTGTACAATGGTTCTCTCCATCAGTGAAGGACGAATTGTGGAGTATGATGAGC 4240
||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4214 TTATGGATTGTACAATGGTTCTCTCCATCAGCGACGGACGGATTGTGGAGTATGATGAGC 4273
Query 4241 CGATGAAGTTGATGAAGGATGAAAACTCTTTGTTCGGAAAGCTTGTGAAAGAGTATTGGT 4300
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4274 CAATGAAGTTGATGAAGGATGAGAACTCTTTGTTCGGAAAGCTTGTGAAAGAGTATTGGT 4333
Query 4301 CTCACTACCACTCAGCTGACTCACGTTGCTGATG 4334
|||| ||| |||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 4334 CTCATTACAACTCGGCTGACTCACGTTGATGATG 4367
Score = 2228 bits (1206), Expect = 0.0
Identities = 1392/1483 (94%), Gaps = 7/1483 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATAGAAAATTTTTGGACTTGGTTCTGCGGGAATCA-C-CACA-CGTCAAACTGCACT 57
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| | ||||||||||||
Sbjct 1 ATGATAGAAAATTATTGGACTTCCTTCTGCGGGAATCACCACACATCATCAAACTGCACT 60
Query 58 CTTGGATTTCTGCAGATATGTTTCGGTATCACACTCTCATTCCTAACTCTCTGTATTTGC 117
|| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 61 GTTCGATTTCTACAGATATGTTTCGGTATCACACTCTCATTCCTAACCCTCTGTATTTGC 120
Query 118 TTGTTTCACAAGGAATCTCCCAAAAGGATTCATCGATTCTTTTGTCTGCGAATAGTGTCT 177
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 121 TTGTTTCACAAGGAACCTCCCAAAAGGATTCATCAATTCTTTTGTCTGCGACTAGTGTCT 180
Query 178 GCTGTGTTCAACGGAATCATCGGATCTCTAGATTTGGTTTTAGGGATTTGGGTTTTACGA 237
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GCTCTATTCAACGGAATCATCGGATCTCTAGATTTGGTTTTAGGGATTTGGGTTTTACGA 240
Query 238 GAGAACTC-CAATAAGCCCTTAATCCTCTGGCTTGTGATTCTGATTCAAGGGTTTACATG 296
||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GAGAA-TCACAGTAAGCCCTTAATCCTCTGGCTGGTCATTCTGATTCAAGGGTTTACATG 299
Query 297 GCTCTTGATTAACTTAGTTATTTGCATTAGAGGAGCAAGAATTCGAAAATCTTCGTTGAG 356
| | || ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| || || |||||||||||
Sbjct 300 GTTATTCATTAACTTAATCATTTGCGTTAGAGGAACAAGAATCCGCAAGTCTTCGTTGAG 359
Query 357 ATTGTTATCTATCTTCTCCTTCTTTTATGGTCTGGTCTCAAGTTGTTTATCTGTGAACAA 416
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 ATTGTTATCTATCTTCTCCTTCTTTTATGGTTTGGTCTCAAGTTGTTTATCTGTGAACAA 419
Query 417 TGCTGTTTTTGGAGAAGAATTAGCTGTTAGGACGATTCTTGATGTTTTGTTACTGCCTGG 476
|||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 420 TGCTGTGTTTGGAGATGAATTAGCAGTTAGGACAATTCTTGATGTTTTGTTACTTCCTGG 479
Query 477 GTCTGTTTTATTACTCTTAAGTGCTTATAAAGGCTATAGATTTGATGAATCTGGTGAGAG 536
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 GTCAGTTTTGTTACTCTTAAGTGCTTATAAAGGCTATAGATTTGATGAATCTGGTGAGAG 539
Query 537 TGGTTTGA-ATGAGCCTCTTAATGTTGGTGATTCAAGTGGGAACAACGAAAAAGCCGATT 595
| |||| | | ||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||
Sbjct 540 TAGTTT-ATACGAGCCTCTTAATGCTGGTGATTCAAATGGGTTTAGCGAAAAAGCCGATT 598
Query 596 CTGATAATCGGGTTAGCCAGTTTGCTGTAGCTGGGTTGTTCAGTAAGTTATCATTCTGGT 655
|||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 599 TTGATAACCGGGTTAGCCAGTTTGCTAAAGCAGGATTGTTCAGTACGTTATCATTCTGGT 658
Query 656 GGTTGAATTCTTTGATAAAGAGAGGAAATGTGAAAGACTTGGAGGAAGAAGATATACCCG 715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 GGTTGAATTCTTTGATAAAGAGAGGAAATGTGAAAGACTTGGAGGAAGAAGATATACCCG 718
Query 716 AGCTTCGCGAGGAAGAGCGTGCAGAGACGTGTTATTCCTTGTTCAAGGAGAATCTCAATG 775
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||
Sbjct 719 AGCTTCGAAAGGAAGAGCGTGCAGAGACGTGTTATTCCTTGTTTGAGGAAAATCTCATTG 778
Query 776 AGCAGAAGAGAAGATTAGGGAGTTCTTGTCAGCCTTCGATCTTGAAAGTTACCGTTCTTT 835
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 779 AGCAGAAGAGAAGATTAGGGAGTTCTTGTCAACCTTCGATCTTGAAAGTTACTGTTCTTT 838
Query 836 GTGTGTGGAGAGATCTTTTGACCTCTGGTTGCTTTGCTTTTATGAAGATTGTTGCTGTTT 895
|||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 GTGTCTGGAGAGAGCTTTTGACCTCTGGTTTCTTTGCTTTTATGAAGATTGTTGCTGTTT 898
Query 896 CAGCTGGTCCTTTGCTTCTGAATGCTTTCATTTTGGTTGCTGAAGGCAATGAAAGCTTTA 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 899 CAGCTGGTCCTTTGCTTCTGAATGCTTTCATTTTGGTTGCTGAAGGCAATGCAAGCTTTA 958
Query 956 GATATGAAGGATTTGTGTTGGCTGTGTTGCTGTTCTTCTCAAAGATGATAGAGTCTTTGT 1015
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 GATATGAAGGGCTTGTGTTGGCTGTGTTGCTGTTCTTCTCAAAGATGATAGAGTCTTTGT 1018
Query 1016 CTCAGAGACAATGGTACTTCAGATGTAGAATTGTCGGTTTACGCGTGAGGTCTCTACTAA 1075
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1019 CACAGAGACAATGGTATTTCAGATGTAGAATTGTCGGTTTACGCGTGAGGTCTCTTCTAA 1078
Query 1076 CTGCAGCTATAAACAAGAAGCAGCTGAGATTGAATAACTCTTCAAGATTGATTCATTCAG 1135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 1079 CTGCAGCTATAAACAAGAAGCAGCTGAGATTGAATAACTCTTCAAGACTGATTCATTCTG 1138
Query 1136 GCAGCGAGATTATGAACTACGCGACTGTCGACGCCTACAGAATTGGGGAGTTTCCATATT 1195
|||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1139 GCAGCGAGATTATGAACTACGCTACTGTTGATGCTTACAGAATTGGGGAGTTTCCGTATT 1198
Query 1196 GGTTTCACCAGCTTTGGACAACAAGCTTTCAGCTACTAATTGCGCTTGGGATTCTCTTTC 1255
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1199 GGTTTCACCAGCTTTGGACAACAAGCTTTCAGCTACTAATCGCGCTTGGGATTCTCTTTC 1258
Query 1256 ATTCTGTGGGAGTTGCTACATTTTCAGCTCTAGCTGTGATAATACTTACTGTTCTATGCA 1315
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1259 ATTCTGTGGGAGTTGCTACGTTTTCAGCTCTAGCTGTGATAATACTTACTGTTTTATGCA 1318
Query 1316 ATGCTCCTATCGCGAAACTTCAGAACAAGTTTCAAAGCGAACTCATGACCTCTCAGGACG 1375
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 ACGCTCCTATCGCAAAACTTCAGAACAAGTTTCAAAGCGAACTCATGACCTCTCAGGACG 1378
Query 1376 AGCGGCTTAAGGCCTGCAATGAGTCTCTTGTCAACATGAAGGTCTTGAAGCTCTACGCGT 1435
|| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1379 AGAGGCTGAAGGCCTGCAATGAGTCTCTTGTCAACATGAAGGTCTTGAAGCTCTATGCGT 1438
Query 1436 GGGAATCACATTTCAAGAAGGTTATCGAGAAGCTAAGGAACAT 1478
||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||
Sbjct 1439 GGGAATCACATTTCAAGAAGGTTATTGAAAAGCTTAGGAACAT 1481
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 216069023501
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5