BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg486795 Length=4164 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G62900.1 | Symbols: | CW-type Zinc Finger | chr3:23248129-2... 6324 0.0 > AT3G62900.1 | Symbols: | CW-type Zinc Finger | chr3:23248129-23254810 REVERSE LENGTH=4939 Length=4939 Score = 6324 bits (3424), Expect = 0.0 Identities = 3733/3881 (96%), Gaps = 26/3881 (1%) Strand=Plus/Plus Query 100 GATGAGAAGCTTCAACACATCCTTGGACACTTCCAGAAAGACTTTGAGGGCGGTGTTTCA 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 130 GATGAGAAGCTTCAACACATCCTTGGACACTTCCAGAAAGACTTTGAGGGCGGTGTTTCA 189 Query 160 GCTGAGAATCTTGGGGCGAAATATGGTGGCTATGGCTCTTTCTTACCAACTTATCAACGA 219 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 190 GCTGAGAATCTTGGGGCGAAATATGGTGGCTATGGCTCTTTCTTGCCAACTTATCAACGT 249 Query 220 TCTCCTGTTTGGTCTCACCCGAAGACACCAGCAAAACCTCAGAGTTCTACAGGGACTAGA 279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 250 TCTCCTGTTTGGTCTCACCCGAAGACACCAGCAAAACCTCAGAGTTCTACAGGGACTAGA 309 Query 280 TCTCCCAACAACTTACTAGGGGAGAGTGGCAATGCAGCTTCGTCTAGTGTTCCTAAAAAG 339 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 310 TCTCCAAACAACTTACTAGGGGAGAGTGGCAATGCAGCTTCGTCTAGTGTTCCTAAAAAG 369 Query 340 GCAAAATCTGGGCTTGCTTCCTCTGGAAACCCCAAAAAATCAGTGAAATCCAAGAAACCC 399 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 370 GCAAAATCTGGTCTTGCTTCCTCTGGAAACCCCAAAAAATCAGTGAAATCTAAGAAACCT 429 Query 400 AGTTCCAGTGCCAGAATGGAATCTGCAACTAAGAAACCTGGTGTCTTTAGTAAACAGAAT 459 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| Sbjct 430 AGTTCCAGTGCCAGAATGGAATCTGCAACTAAGAAACCTTGTGTCTTCAGTAAGCAGAAT 489 Query 460 TCTCTGAAGCTTCGGATAAAGATGGTACCAGATGGTTTATCTACCGAAAAGAATGCTGCT 519 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 490 TCTCTGAAGCTTCGGATAAAGATGGTACCAGATGGTTTATCTACCGAAAAGAATGCTGCT 549 Query 520 GCGATATACAGTGGCCTTGGGCTTGATGTATCACCTTCTTTGTCCTTAGATAATAATAGT 579 || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 550 GCAATATACAGTGGCCTTGGACTTGATGTGTCACCTTCTTTGTCCTTAGATAACAATAGT 609 Query 580 CTTTCAGGTAGTGAAGGGATGAATGGGGAGCCTCAGGGTTATTCTCCAATGGAGTCTCCC 639 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 610 CTTTCAGGTAGTGAAGGGATGAATGAGGAGCCTCAGGGTTATTCTCCAACGGAGTCTCCC 669 Query 640 ACCAGTATTCTGAATGTAATGACTTCACTTCCTGTGGATCATCGTCAGTTGCTATCTCCT 699 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct 670 ACCAGTATTCTTAATGTAATGACTTCACTTCCTGTGGATCATTGTCAGTTCCTATCTCCT 729 Query 700 CTCTCTGATGATCTGATTCGATTCATT-ACAAGGGAAAAATCCGAAAAGGGATATAAGTA 758 |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 730 CTCTCTGAGGATCTGATTCGATTCATTGA-AAGGGAAAAATCCGAAAAGGGATATAAGTA 788 Query 759 TACATCTCCATCCAGGCTTTTCACTGAGAGTTCTTTTGCTATGGCGA-ACGATTTGGAAC 817 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||||||| Sbjct 789 TACATCTCCATCCAGGCTTTTCACTGCGAGTTCTTCTGCTATGGC-ATACGGTTTGGAAC 847 Query 818 CTCAGAAGGCTGGAGAAAAACCATCAGTAGAGAAGaaaaaaaaGATGGTGGAGAGGAGCA 877 |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 848 CTCAGAAGTCTGGAGAGAAACCATCAGTAGAGAAGAAAAAAAAGATGGTGGAGAGGAGCA 907 Query 878 GCTTTTCTGCAGAGACAAATGTCCGCAGTAAGAAGGGCCTATTTGATGCAACTGATGCCA 937 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| Sbjct 908 GCTTTTCTGCTGAGACAAATGTCCGCAGTAAGAAGGGCCTGTTTGATTCAACTGATGCCA 967 Query 938 CTGTCAAGGAGTCAATGGAAGCAAACACATCATATTCTAC-TGCTGCGGAGAAAGAAACA 996 | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| Sbjct 968 TTACCAAGGAGTCAATGGAAACAAACACATTATATCCTACAT-TTGCGGAGAAAGAAACA 1026 Query 997 GCCACTAGTAAATTATTTGATGCATCCAAGGAAAACTACAATGGCACTGTTAGGGGCGAA 1056 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1027 GCCAGTAGTAAATTATTTGATGCATCCAAGGAAAACTACAATGGCACTGTTAGGGGCGAA 1086 Query 1057 ATGGTGGGTGATGTCGACAGAAGGTTGTGGGGTCTAACTCGTCATAAAGATCTTGGGGTG 1116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1087 ATGGTGGGTGATGTCGACAGAAGGTTGTGGGGTCTAACTCGTCATAAAGATCTTGGGGCG 1146 Query 1117 CATCATGAGAATCCAAAGACTATTTCTGCTGGAAGTGTTCGGGAAGAGAAAAAGGCTAAA 1176 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1147 CATCATGAGAATCCAAAGACTATTTCTGCTGGAAGTGTTCGTGAAGATAAAAAGGCTAAA 1206 Query 1177 TTTGGTGATGATGAGGCTTCAGGATACCCAAGGAAAGTTGGCAAATACAAAGGAAGCAAA 1236 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1207 CTTGGTGATAATGAGGCTTCAGGATACCCAAGGAAAGTTGGCAAATACAAAGGCAGCAAA 1266 Query 1237 GCTTTTGATTCAGTCAAAAAAGAATCGAGTGCGTCAAAGGTGAAAAGTGGTCATAAAGTG 1296 |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1267 GCTTCTGATTCAGTCAAAAAGGAATCGAGTGCATCAAAGGCGAAAAGTGGTCATAAAGTG 1326 Query 1297 GAGCCAGAACATCCT-TTGAGAAAGCAGAAGTATGACCAGATAGAACAGGAGCCACCGTC 1355 |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1327 GAGCTAGAACATCCTCTT-AGAAAGCAGAAGTATGACCAGATAGAACAGGAGCCACCGTC 1385 Query 1356 TTTAACAAAGTTCAAGGAACAGCAAACCTCTGTTGTTTTTGAGACTAAGCTGAATGGTCA 1415 || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1386 TTCATCAAAGTTCAAGGAACAGCAAACCTCTGTTGTTTTTGAGACTAAGCTGAATGGTCA 1445 Query 1416 AGCTGAGAAGAAAGAAGTGGTAGCCTTGAAACCACAAAGTGATAGCAAAAAAGCTGAGGA 1475 |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1446 AGCTGAGAAGAAGGAAGTGGTAGCCGTGAAACCACAAAGTGATAGCAAAAAAGCCGAGGA 1505 Query 1476 CACTTACAAAGACTTTTTTGGAGACATAGGGGACTCTGAAGAAGAAGAGGAACAGAATTG 1535 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1506 CACTTACAAAGACTTTTTTGGAGACATAGGGGACTCTGAAGAAGAAGAGGAAC--AA--- 1560 Query 1536 TTCGTTGGACGTAAAAGATTTGCGGATTTCAGAAAAGGGACTTCCGCCCTTAGAAGATAT 1595 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 -------GACGTAAAAGATTTGCGGATTTCAGAAAAGGGACTTCCGCCCTTAGAAGATAT 1613 Query 1596 GCCTGAAAAATCGAGCTTCCCACTGGTAGAACCTCAGAACGTTGGTCCTGAACCCATGTT 1655 |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1614 GCCTGAAAAATCGAGCTTGCCGCTAGTAGAACCTCAGAACGTTGGTCCTGAACCCATGTT 1673 Query 1656 GAGAAAACTTGGTTCTGATGCTTCTCTTCCGAAAGCAAATCCCGTGATCATACAAGAACA 1715 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1674 GAGAAAACTTGGTTCTGATGCTTCTCTTCCGAAAGCAAATCCCGTGATCATACAAGAACA 1733 Query 1716 TTGGGTTGCTTGTGACAAGTGTGGAAAGTGGCGGCTTCTTCCTTTTGGCGTCGTCCCAGA 1775 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1734 TTGGGTTGCTTGTGACAAATGTGGAAAGTGGCGGCTTCTTCCTTTTGGCGTCTTCCCAGA 1793 Query 1776 AGACCTTCCTGAGAAATGGATGTGCACAATGCTTAATTGGCTGCCTGGAGTCAACTATTG 1835 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1794 AGACCTTCCTGAGAAATGGATGTGCACAATGCTTAATTGGCTGCCTGGAGTGAACTATTG 1853 Query 1836 CAATGTTCCTGAAGATGAAACAACGAAAGCACTGTATGCAATGTATCAGATCCCTGTCCC 1895 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1854 CAATGTTCCTGAAGATGAAACAACGAAAGCACTGTATGCAATGTATCAGATCCCTGTCCC 1913 Query 1896 TGAGAGCCAGGCTTCAATGCAGAGTAATCCCAGTGGCCCTAAGCCTCAGTTTAACCAGGG 1955 ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1914 TGAGAACCAGGCTTCGATGCAGAGTAATCCCAGTGGCCCTAAGCCTCAGTTTACCCAGGG 1973 Query 1956 AGATGACAACACAAAGAAGAAGAAAAAGGGTTTTAAAAAGATAGACAATGGTATGTATAA 2015 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct 1974 AGATGACAACACAAAGAAGAAGAAAAAGGGTTTCAAAAAGATAGACAATGGAATGGATAA 2033 Query 2016 AGAAGGTTCTCGAACTGCCGAAACTAACAAGACCATCCAAACATCGTCAAGAAATGGTAT 2075 ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2034 AGAAGGTGCTCGAACTGCAGAAACTAACAAGACCATCCAAACATCGTCAAGAAATGGTAT 2093 Query 2076 TCAAAATTCGCATGGACTTGGCAACTTGGCCGAGGATGAGAGGCAAATACATAAACAGAA 2135 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2094 TCAAAATTCGCAGGGACTTGGCGACTTGGCCGAGGATGAGAGGCAAATACATAAACAGAA 2153 Query 2136 AGAGAAAGGAAAATCAGTGGATCACCTCTCTGATGAGTCGAAGAGCTTGAAGGCGAATAA 2195 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2154 AGAGAAAGGAAAAGCAGTGGATCACCTCTCTGATGAGTCGAAGAGCTTGAAGGCGAATAA 2213 Query 2196 CAAAAGAAAATCAGATCTAGAGAGTTCTATGCTGGCCaaaaaaaTGAAGATTGAAAGTTT 2255 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2214 CAAAAGAAAAACAGATCTAGAGAGTTCTATGCTGGCCAAAAAAATGAAGATCGAAAGTTT 2273 Query 2256 TCTGTTTCCTGATGAATCCGAACATGGAAATGGACGTCCTACCTCGAGTAGTGGTGTCCC 2315 |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2274 TCTGTTTCCTGATGAATCTGAATATGGAAATGGACGTCCTACCTCGAGTAGTGGTGTCCC 2333 Query 2316 TATCACGTCAGCAGATATAAAGCCTAAGCCTCGAGTGTCCTCCAAAATGCCAAAAGAGGA 2375 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2334 TATCACGTCAGCAGATATAAAGCCAAAGCCCCGAGTCTCCTCCAAAATGCCAAAAGAGGA 2393 Query 2376 AGGAGGAGCTTCAGACACTGGAAATAGCAATAGCACAGGGGGGATTAAAAAGAGGAAAAT 2435 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | Sbjct 2394 AGGAGGAGCTTCAGACACTGGAAATAGCAATAGCACTGGGGGGATTAAAAAGAGGAAACT 2453 Query 2436 GAGAGAAAGCCATGGTTCTAGGATTTACAGTGAGAACGAAAATCATGAACGTAAGAAAGC 2495 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2454 GAGAGAAAGCCATGGTTCTAGGATTTACAGTGAGAACGAAAATCATGAACGAAAGAAAGC 2513 Query 2496 TCGAGTTCGTAAAGAAGAGAAGGAGCCTAGTTATTCTCAAGGCAATGGGAAGTTGGAAAA 2555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2514 TCGAGTTCGTAAAGAAGAGAAGGAGCCTAGTTATTCACAAGGCAATGGGAAGTTGGAAAA 2573 Query 2556 GAAAAATAGAAGTCATTCGAAAAGAGAGTATGCACATGTTCAGAACTCAATCGCGGCCAC 2615 ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct 2574 GAAAAATAGAAGTCATTCGAAAATAGAGTATGCAAATGTTCAGAACTCAATCGCGGCAAC 2633 Query 2616 CTCGAGTTCTTCTAAGATTTCTGATTCTCATAAACCCAGAAACAGCTCCCACGAAGCTAA 2675 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2634 CTCAAGTTCTTCTAAGATTTCTGATTCTCATAAACCCAGAAACAGCTCCCGCGAAGCTAA 2693 Query 2676 ATGTTCGCCTGTTGAGTCGGTGTCTTCCTCACCTATGAGGCTTTCCAACATGGAGAAAAG 2735 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | Sbjct 2694 ATGTTCTCCTGTTGAGTCGGTGTCTTCCTCACCTATGAGGCTTTCCAACCCGGAGAAACG 2753 Query 2736 TACATCTGCGAGAAAAAAGAAAGAAGAATCTTATGATGCTAATGTCTTTGCAGCAGGTAG 2795 || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2754 TATATCTGTGAGTAAAAAGAAAGAAGAATCTTATGATGCTAACGTCTTTGCAGCAGGTAG 2813 Query 2796 TTTGAGAAAATTCTCAGATGGTGAAGGTGAAGATGGTGGTGGGAGTGATAGATCGCAGTC 2855 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2814 TTTGAAAAAATTCTCAGATGGTGAAGGTGAAGATGATGGTGGGAGTGATAGATCGCAG-A 2872 Query 2856 G-CGGATGAAGGACAAACATGGATCCCATGAGTCTTCTGTGCTTGATATTTGGGATAATA 2914 | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2873 GTCAGATGAAGGATAAACATGGATCCCATGAGTCTTCTGTGCTTGATATTTGGGATAATA 2932 Query 2915 AAGGATCTTTGAAAGCCAAAGAGCGCGCTGATCCTTCTCTCGATGCCAGTTTTGAGAAA- 2973 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| Sbjct 2933 AAGGATCTTTGAAAGCGAAAGAGCGCGCTGATCCTTCTCTCGATGCCAATTTTGA-AAAT 2991 Query 2974 GGTGGCCACAAGGA-TTTACCGCGGAAACTGGATCATATTCTCGGTGAAGGAAAACAGTC 3032 ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2992 GGTGGCCACAA-GACTTTACCGCGGAAACTGGATCATATTCTCGGTGAAGGAAAACAGTC 3050 Query 3033 TAGCGATCATCATCGACGTAGCAATGATTACCTGGCAAAGAAGTCAGGAAAAGGTTCATC 3092 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3051 TAGCGATCATCATCGACGTAGCAATGATTCCCTGGCAAAGAAGTCAGGAAAAGGTTCATC 3110 Query 3093 TTCTCGGTCCAAAGAAAAGAGCCAAAGCATTAGGTCTGATTCACGGGATGGCCCGAGACA 3152 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3111 TTCTCGGTCCAAAGAAAAGAGCCAAAGCATTAGGTCTGATTCACGGGATGGTCCGAGACA 3170 Query 3153 TATTGAAAAGAAGATATACGATGGTAGTCCTGACAGTAGAGCGGATATGATCGCGAGACC 3212 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3171 TATTGAAAAGAAGATATATGATGGTAGTCCTGACAGTAGAGCGGATATGATCGTGAGACC 3230 Query 3213 AAACATTCCAAAACCTTACGACTCCGAAAGAATATCAGAGAGGAGTAATAGAGCAGATTT 3272 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3231 AAACATTCCAAAACCGCACGACTCCGAAAGAATACCAGAGAGGAGTAATATAGCAGATTT 3290 Query 3273 AGCTTCTCCATCACGGCCACCATCTAGAGGTATCCAAGGGGATTCTTCTATGCTTTCTGT 3332 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3291 AGCTTCTCCATCACGGCCACCATCTAGAGGTGTCCAAGGGGATTCCTCTATGCTTTCTGT 3350 Query 3333 CCGTAAGAAAGTCGATAAATGTAGCACATCAGCTGGAAACAATAATATTCAAGCTGATGA 3392 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 3351 CCGTAAGAAAGTCGATAAATGCAGCACATCAGCTGGAAATAATAATATCCAAGCTGATGA 3410 Query 3393 TGTGACAAAGGCAACAGCCCAAATAAGAAGGAAAAGCGAGCCTTCTCCAAGCCCCTTGCG 3452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3411 TGTGACAAAGGCAACAGCCCAAATAAGAAGGAAAAGCGAGCCTTCTCCAAGCCCCTTGCG 3470 Query 3453 AAAGGAAGTAACATCTGCGCAGGCCGCCCATAATACTTTAAAAGAAGCTAAAGACTTGAA 3512 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3471 AAAGGAAATAACATCTGCGCAGGCCGCCCATAATACTTTAAAAGAAGCTAAAGACTTGAA 3530 Query 3513 ACATACAGCTGACCGTCTCAAGAGTTCTGTATCAAACCTCGAGCACATTGAGCTCTACTT 3572 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3531 ACATACAGCTGACCGTCTCAAGAATTCTGTATCAAACCTTGAGCACATTGAGCTCTACTT 3590 Query 3573 CCAGGCTTGCCTTAAGTTTCTTCATGGTGCTTTTCTCTTGGAGATGAGTAGCAACGAGAG 3632 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3591 CCAAGCTTGCCTTAAGTTTCTTCACGGTGCTTTTCTTTTGGAGATGAGTAGCAACGAGAG 3650 Query 3633 TGTTAGACAAGGAGAAACAATGGTCCAATCTATGAAGATTTATAGTAGCACAGCGAATCT 3692 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3651 TGCTAGACAAGGAGAAACAATGGTCCAATCTATGAAGATTTATAGTAGCACTGCGAATCT 3710 Query 3693 TTGCGGATTTTGTGCCCATGAGTATGAGAAGTCTAAAGATATGGGAGCTGCTGCCCTGGC 3752 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3711 TTGCGGATTTTGTGCCCATGAGTATGAGAAGTCTAAAGATATGGGAGCTGCTGCCCTGGC 3770 Query 3753 TTACAAATGCATGGAGGTCGCGTATATGAGAGTGGTTAATTCCTCCTACACCAGTGCTAA 3812 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3771 TTACAAATGCATGGAGGTCGCGTATATGAGAGTGGTTAATTCCTCCTACACCAGTGCTAA 3830 Query 3813 TAGATATCGAAATGAATTGCAGACTTCTCTGCAAATGATTCCGCCAGGTGAATCTCCTTC 3872 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3831 TAGATATCGAAATGAATTGCAGACTTCTCTACAAATGGTTCCGCCAGGTGAATCTCCTTC 3890 Query 3873 TTCATCTGCCTCGGATGTTGATAACGTGAACCATCCAGCAGCAGTAGACAGAGTTGGTAC 3932 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3891 TTCATCTGCCTCGGATGTTGATAACGTGAACCATCCAGCAGCAGTAGACAGAGTTGGTAC 3950 Query 3933 CTCAAGGGGCATCAGTTCTCCTTTAGTTGCTGGGAACCACG 3973 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3951 CTCAAGGGGCATCAGTTCTCCTTTAGTTGCTGGGAACCACG 3991 Score = 263 bits (142), Expect = 1e-68 Identities = 150/154 (97%), Gaps = 0/154 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3973 GACGTAAATCTGTCAATGGATGCCTCGAGGAAATCACGTGTGGCATTAGCAGCTTGTATT 4032 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4045 GACGTAAATCTGTCAATGGATGCCTCGAGGAAATCACGTGTGGCATTAACAGCTTGTATT 4104 Query 4033 GAAAACTTGGGGGAGGCCCAACAACAAGGAGAGGGTATTATATCTATTAAAAGCGCCCTT 4092 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 4105 GAAAACTCAGGGGAGGCCCAACAACAAGGAGAGGGTATAATATCTATTAAAAGCGCCCTT 4164 Query 4093 GATTATAACTTCCAAGACATGGAGGGATTGCTAC 4126 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4165 GATTATAACTTCCAAGACATGGAGGGATTGCTAC 4198 Score = 182 bits (98), Expect = 3e-44 Identities = 103/105 (98%), Gaps = 1/105 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGAGGAGTCTGAACTTGAAGAAGGAGAGGCTTGCTCTTACAATATTACTAACGAATAC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGAGGAGTCTGAACTTGAAGAAGGAGAGGCTTGCTCTTACAATATTACTAACGAATAC 60 Query 61 TCTGGAAGCATAGACCCTGATAACGATCTCTCTTACATTGATGAG 105 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 61 GCTGGAAGCATAGACCCTGATAACGATCTCTCTTACATTG-TGAG 104 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 207540643191 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5