BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg487152 Length=2958 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G03730.2 | Symbols: CTR1, SIS1, AtCTR1 | Protein kinase supe... 4388 0.0 > AT5G03730.2 | Symbols: CTR1, SIS1, AtCTR1 | Protein kinase superfamily protein | chr5:974498-979849 REVERSE LENGTH=2974 Length=2974 Score = 4388 bits (2376), Expect = 0.0 Identities = 2540/2619 (97%), Gaps = 11/2619 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ACaaaaagaaaatgaaaaaCTAGAGAGAGAAACAAGTGGCTAGCTAGCTCGCCGAACTTC 60 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 48 ACAAAAAAAAAATGAAAAACTAGAGAGAGAAACAAGTGGCTAGCTAGCTCGCCAAACTTC 107 Query 61 TTCAACAATGGCGGTTTCCTAGGGTTTGATGCTTATAGTTATATGATCGGGAAACTCTCA 120 ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 108 TTCAACAATGGCGGTTTCCTAGGGTTTGATG----T--TTATATGATCGGGAAACTCTCT 161 Query 121 CATCTAGATCGCGAAAACTCTCTCTTCCATGGAAATGCCCGGTAGAAGATCTAATTACAC 180 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 162 CATCTAGATCGCGATAACTCTCTTTTCCATGGAAATGCCCGGTAGAAGATCTAATTACAC 221 Query 181 TTTGCTTAGTCAATTCTCTGACGATCAGGTGTCGGTTTCCGTCACCGGAGCTCCTCCGCC 240 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 222 TTTGCTTAGTCAATTTTCTGACGATCAGGTGTCAGTTTCCGTCACCGGAGCTCCTCCGCC 281 Query 241 GCACTATGATTCCTTGTCAAGCGAAAACAGGAGCAACAATAACAGCGGGAACAACGGGAA 300 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct 282 TCACTATGATTCCTTGTCGAGCGAAAACAGGAGCAACCATAACAGCGGGAACACCGGGAA 341 Query 301 AACTAAGGCGGAGAGAGGCGGATTTGATTGGGATCCTAGCGGTGGTGGTGGTGGTGATCA 360 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 342 AGCTAAGGCGGAGAGAGGCGGATTTGATTGGGATCCTAGCGGTGGTGGTGGTGGTGATCA 401 Query 361 TAGGTTGAGTAATCAACCGAATCGGGTTGGGAATAATATGTATGCTTCGTCTCTTGGCTT 420 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 402 TAGGTTGAATAATCAACCGAATCGGGTTGGGAATAATATGTATGCTTCGTCTCTAGGGTT 461 Query 421 GCAGAGGCAATCGAGTGGGAGTAGTTTCGGTGAGAGCTCTTTGTCTGGGGATTATTATAT 480 ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 462 GCAAAGGCAATCCAGTGGGAGTAGTTTCGGTGAGAGCTCTTTGTCTGGGGATTATTACAT 521 Query 481 GCCTACGCTTTCTGCGGCGGCTAACGAGATCGAATCTGTTGGATTTCCTCAAGACGATGG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 522 GCCTACGCTTTCTGCGGCGGCTAACGAGATCGAATCTGTTGGATTTCCTCAAGATGATGG 581 Query 541 GTTTAGGCTTGGATTTGGTGGTGGTGGAGGAGATTTGAGGATACAGATGGCGGGGGAATC 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct 582 GTTTAGGCTTGGATTTGGTGGTGGTGGAGGAGATTTGAGGATACAGATGGCGGCGGACTC 641 Query 601 GGCTGGAGGGTCTTCATCCGGGAAGAGCTGGGCGCAGCAGACGGAGGAGAGTTATCAGCT 660 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 642 CGCTGGAGGGTCTTCATCTGGGAAGAGCTGGGCGCAGCAGACGGAGGAGAGTTATCAGCT 701 Query 661 CCAGCTTGCATTGGCGTTACGGCTTTCGTCCGAGGCTACTTGTGCCGACGATCCGAACTT 720 |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 702 GCAGCTTGCATTGGCGTTAAGGCTTTCGTCGGAGGCTACTTGTGCCGACGATCCGAACTT 761 Query 721 TCTGGATCCTGTACCGGACGAGTCTGCTTTGCGGACTTCGCCAAGTTCAGCCGAAACCGT 780 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 762 TCTGGATCCTGTACCGGACGAGTCTGCTTTACGGACTTCGCCAAGTTCAGCCGAAACCGT 821 Query 781 TTCACATCGTTTCTGGGTTAATGGCTGCTTATCGTATTATGATAAAGTTCCTGATGGGTT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 822 TTCACATCGTTTCTGGGTTAATGGCTGCTTATCGTACTATGATAAAGTTCCTGATGGGTT 881 Query 841 TTATATGATGAATGGTCTGGATCCATATATTTGGACCTTATGCATCGATCTGCATGAAAG 900 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 882 TTATATGATGAATGGTCTGGATCCCTATATTTGGACCTTATGCATCGACCTGCATGAAAG 941 Query 901 TGGCCGCATCCCTTCAATTGAATCATTAAGAGCTGTTGATTCTGGTGTTGATTCTTCGCT 960 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 942 TGGTCGCATCCCTTCAATTGAATCATTAAGAGCTGTTGATTCTGGTGTTGATTCTTCGCT 1001 Query 961 TGAAGCGATCATAGTTGATAGGCGTAGTGATCCAGCCTTCAAGGAACTTCACAATAGAGT 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1002 TGAAGCGATCATAGTTGATAGGCGTAGTGATCCAGCCTTCAAGGAACTTCACAATAGAGT 1061 Query 1021 CCACGACATATCTTGTAGCTGCATTACCACAAAAGAGGTTGTTGATCAGCTGGCAAAGCT 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1062 CCACGACATATCTTGTAGCTGCATTACCACAAAAGAGGTTGTTGATCAGCTGGCAAAGCT 1121 Query 1081 TATCTGCAATCGTATGGGGGGTCCAGTTATCATGGGGGAAGATGAGTTGGTTCCCATGTG 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1122 TATCTGCAATCGTATGGGGGGTCCAGTTATCATGGGGGAAGATGAGTTGGTTCCCATGTG 1181 Query 1141 GAAGGAGTGTATTGATGGTCTAAAAGAAATCTTCAAAGTGGTGGTTCCCATAGGTAGCCT 1200 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1182 GAAGGAGTGCATTGATGGTCTAAAAGAAATCTTTAAAGTGGTGGTTCCCATAGGTAGCCT 1241 Query 1201 CTCTGTTGGACTCTGCAGACATCGAGCTTTACTCTTCAAAGTACTGGCTGACATAATTGA 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1242 CTCTGTTGGACTCTGCAGACATCGAGCTTTACTCTTCAAAGTACTGGCTGACATAATTGA 1301 Query 1261 TTTACCGTGTCGAATTGC-AAAGGGATGCAAATATTGTAATAGAGACGATGCCGCATCGT 1319 |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1302 TTTACCCTGTCGAATTGCCAAAGG-ATGTAAATATTGTAATAGAGACGATGCCGCTTCGT 1360 Query 1320 GCCTTGTCAGGTTTGGGCTTGATAGGGAGTACCTGGTTGATTTAGTAGGGAAGCCAGGTC 1379 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1361 GCCTTGTCAGGTTTGGGCTTGATAGGGAGTACCTGGTTGATTTAGTAGGAAAGCCAGGTC 1420 Query 1380 ACTTATGGGAGCCTGATTCCTTGCTAAATGGTCCTTCATCTATCTCAATTTCTTCACCTT 1439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1421 ACTTATGGGAGCCTGATTCCTTGCTAAATGGTCCTTCATCTATCTCAATTTCTTCTCCTC 1480 Query 1440 TGCGGTTTCCACGACCCAAGCCAGTTGAACCCGCAGTCGATTTTAGGTTACTAGCCAAAC 1499 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1481 TGCGGTTTCCACGACCAAAGCCAGTTGAACCCGCAGTCGATTTTAGGTTACTAGCCAAAC 1540 Query 1500 AATATTTCTCCGACAGCCAGTCTCTTAATCTTGTTTTCGATCCTGCATCAGATGATATGG 1559 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1541 AATATTTCTCCGATAGCCAGTCTCTTAATCTTGTTTTCGATCCTGCATCAGATGATATGG 1600 Query 1560 GATTCTCAATGTTTCATAGGCAATATGATAATCCGGGTGGAAAGAATGACGCATTGGCAG 1619 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1601 GATTCTCAATGTTTCATAGGCAATATGATAATCCGGGTGGAGAGAATGACGCATTGGCAG 1660 Query 1620 AAAATGGTGG-G--TCTTTGCCACCCAGTGCTAATATGCCTCCACAGAACATGATGCGTG 1676 |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1661 AAAATGGTGGTGGGTCTTTGCCACCCAGTGCTAATATGCCTCCACAGAACATGATGCGTG 1720 Query 1677 CGTCAAATCAAGTAGAAGCAGTACCTATGAATGCCCCACCAATCACTCAGCCAGTTCCGA 1736 ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | Sbjct 1721 CGTCAAATCAAATTGAAGCAGCACCTATGAATGCCCCACCAATCAGTCAGCCAGTTCCAA 1780 Query 1737 ACAGGGCAAATAGGGAGCTTGGACTTGATGGTGATGATATGGACATCCCGTGGTGTCATC 1796 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1781 ACAGGGCAAATAGGGAACTTGGACTTGATGGTGATGATATGGACATCCCGTGGTGTGATC 1840 Query 1797 TTAATATAAAAGAGAAGATTGGAGCAGGCTCCTTTGGCACTGTCCACCGTGCTGAGTGGC 1856 ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1841 TTAATATAAAAGAAAAGATTGGAGCAGGTTCCTTTGGCACTGTCCACCGTGCTGAGTGGC 1900 Query 1857 ATGGCTCGGATGTTGCTGTGAAAATTCTCATGGAGCAAGACTTCCATGCTGAGCGCGTAA 1916 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct 1901 ATGGCTCGGATGTTGCTGTGAAAATTCTCATGGAGCAAGACTTCCATGCTGAGCGTGTTA 1960 Query 1917 ATGAGTTCTTAAGAGAGGTTGCAATAATGAAACGCATTCGCCATCCTAACATTGTTCTCT 1976 |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1961 ATGAGTTCTTAAGAGAGGTTGCGATAATGAAACGCCTTCGCCACCCTAACATTGTTCTCT 2020 Query 1977 TCATGGGTGCGGTCACTCAACCTCCAAATTTGTCAATAGTGACAGAATATTTGTCAAGAG 2036 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2021 TCATGGGTGCGGTCACTCAACCTCCAAATTTGTCAATAGTGACAGAATATTTGTCAAGAG 2080 Query 2037 GTAGTTTATACAGACTTTTGCATAAAAGTGGAGCAAGGGAGCAATTAGATGAGAGACGTC 2096 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2081 GTAGTTTATACAGACTTTTGCATAAAAGTGGAGCAAGGGAGCAATTAGATGAGAGACGTC 2140 Query 2097 GTCTGAGTATGGCTTATGATGTGGCTAAGGGAATGAATTATCTTCACAATCGCAATCCTC 2156 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2141 GCCTGAGTATGGCTTATGATGTGGCTAAGGGAATGAATTATCTTCACAATCGCAATCCTC 2200 Query 2157 CAATTGTGCATAGAGATCTAAAATCTCCAAACTTGTTGGTTGACAAAAAATATACAGTCA 2216 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2201 CAATTGTGCATAGAGATCTAAAATCTCCAAACTTATTGGTTGACAAAAAATATACAGTCA 2260 Query 2217 AGGTTTGTGATTTTGGTCTCTCGCGATTGAAGGCCAGCACGTTTCTTTCATCGAAGTCAG 2276 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2261 AGGTTTGTGATTTTGGTCTCTCGCGATTGAAGGCCAGCACGTTTCTTTCCTCGAAGTCAG 2320 Query 2277 CAGCTGGAACCCCCGAGTGGATGGCACCAGAAGTCCTGCGAGATGAGCCATCTAATGAAA 2336 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2321 CAGCTGGAACCCCCGAGTGGATGGCACCAGAAGTCCTGCGAGATGAGCCGTCTAATGAAA 2380 Query 2337 AGTCAGATGTGTACAGCTTCGGGGTCATCTTGTGGGAGCTTGCTACATTGCAACAACCAT 2396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2381 AGTCAGATGTGTACAGCTTCGGGGTCATCTTGTGGGAGCTTGCTACATTGCAACAACCAT 2440 Query 2397 GGGGTAACTTAAATCCGGCTCAGGTTGTAGCTGCGGTTGGTTTCAAGTGTAAACGGCTTG 2456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2441 GGGGTAACTTAAATCCGGCTCAGGTTGTAGCTGCGGTTGGTTTCAAGTGTAAACGGCTGG 2500 Query 2457 AGATCCCGCGGAATCTGAATCCTCAGGTTGCAGCCATAATCGAGAGTTGTTGGACCAATG 2516 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2501 AGATCCCGCGTAATCTGAATCCTCAGGTTGCAGCCATAATCGAGGGTTGTTGGACCAATG 2560 Query 2517 AGCCATGGAAGCGTCCATCATTTGCAACTATAATGGACTTGTTAATACCATTGATCAAAT 2576 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct 2561 AGCCATGGAAGCGTCCATCATTTGCAACTATAATGGACTTGCTAAGACCATTGATCAAAT 2620 Query 2577 CGGCAGTTCCTCCACCCAACCGCTCGGATTTGTAAAATA 2615 | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2621 CAGCGGTTCCTCCGCCCAACCGCTCGGATTTGTAAAATA 2659 Score = 145 bits (78), Expect = 3e-33 Identities = 91/97 (94%), Gaps = 2/97 (2%) Strand=Plus/Plus Query 2820 AGGAAGGaaaaaaaaaTGTAGTAATGGAAACAGTGTG-GG-AGATAATCTATCTATCTAG 2877 ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||| Sbjct 2762 AGGGAGGAAAAAAAAATGTAGTAATGGAAACAATGTGAGGGATATAATCTATCTATCTAG 2821 Query 2878 TCCCAAAGGGTAAGCAATATTTTGTTGTTATATCTTT 2914 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2822 TCCCAAAGGGTAAGCAATATTTTGTTGTTATGTCTTT 2858 Score = 111 bits (60), Expect = 3e-23 Identities = 60/60 (100%), Gaps = 0/60 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2613 ATATGCACATATACTCTCAGCATTCTTTTGCTGCCCAGGAGGGAGACACTAGTTAAGATA 2672 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2693 ATATGCACATATACTCTCAGCATTCTTTTGCTGCCCAGGAGGGAGACACTAGTTAAGATA 2752 Score = 69.4 bits (37), Expect = 2e-10 Identities = 43/46 (93%), Gaps = 0/46 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2913 TTACCTTGTTGTACATTTATACCGCTAAATTAGTTACTAAGCAAAG 2958 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2887 TTACATTGCTGTACATTTATACCGCTAAATTAGTTACTAAGCGAAG 2932 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 147039309933 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5