BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg487193 Length=5231 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G04140.2 | Symbols: GLU1, GLS1, GLUS, FD-GOGAT | glutamate s... 4420 0.0 > AT5G04140.2 | Symbols: GLU1, GLS1, GLUS, FD-GOGAT | glutamate synthase 1 | chr5:1130031-1138438 FORWARD LENGTH=5199 Length=5199 Score = 4420 bits (2393), Expect = 0.0 Identities = 2657/2784 (95%), Gaps = 19/2784 (1%) Strand=Plus/Plus Query 2438 CAA-TGCTGTATGCCCATACTTGGCACTGGAGACATGTAGGCAATGGCGCTTAAGTAACA 2496 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2390 CAAGTGCTGTATGCCCATACTTGGCACTGGAGACATGTAGGCAATGGCGCTTAAGTAACA 2449 Query 2497 AAACTGTCGCATTCATGCGTAACGGGAAAATTCCCACTGTAACCATTGAGCAGGCTCAGA 2556 ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2450 AAACTGTGGCCTTCATGCGTAACGGGAAAATTCCTACTGTAACCATTGAGCAAGCTCAGA 2509 Query 2557 AGAATTATACCAAGGCGGTTAATGCAGGGCTTCTTAAAATTCTTTCTAAGATGGGCATCT 2616 |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2510 AGAACTACACTAAGGCGGTTAATGCAGGGCTTCTTAAAATTCTTTCTAAGATGGGAATCT 2569 Query 2617 CATTGCTTTCAAGTTATTGTGGTGCTCAGATATTTGAGATATATGGTTTGGGGA-AAGAG 2675 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || Sbjct 2570 CATTGCTTTCAAGTTATTGTGGTGCTCAGATATTTGAGATATATGGTTT-GGGACAGGAT 2628 Query 2676 GTTGTTGATCTTGCATTCACTGGAAGTGTGTCAAAAATCAGTGGACTCACCTTTGATGAG 2735 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2629 GTTGTTGATCTTGCATTCACTGGAAGTGTGTCAAAAATCAGTGGACTCACCTTTGATGAG 2688 Query 2736 TTGGCAAGAGAGACATTGTCTTTCTGGGTGAAGGCCTTTTCTGAGGATACAACTAAACGA 2795 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2689 TTGGCAAGAGAGACATTGTCTTTCTGGGTGAAGGCCTTTTCTGAGGATACAACTAAGCGA 2748 Query 2796 TTAGAAAATTTCGGGTTTATTCAATTTAGGCCTGGAGGTGAGTATCATTCAAACAACCCA 2855 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2749 TTAGAAAATTTTGGGTTTATTCAATTCAGGCCTGGAGGTGAGTATCATTCAAACAACCCA 2808 Query 2856 GAGATGTCAAAGTTGCTCCACAAGGCTGTCCGTGAAAAGAGTGAAACTGCATATGCAGTC 2915 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2809 GAGATGTCAAAGTTGCTTCACAAGGCTGTCCGTGAAAAGAGTGAAACTGCATATGCAGTC 2868 Query 2916 TATCAACAACATCTCTCTAACAGACCTGTTAATGTCCTCCGTGATCTCCTTGAATTCAAG 2975 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| Sbjct 2869 TATCAACAGCATCTCTCTAACAGACCTGTTAATGTCCTCCGTGACCTGCTTGAGTTCAAG 2928 Query 2976 AGTGACCGTGCACCGATCCCAGTAGGGAAAGTTGAACCAGCCGTTTCTATTGTCCAGAGA 3035 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| Sbjct 2929 AGTGATCGTGCACCGATCCCAGTAGGGAAAGTAGAACCGGCCGTTGCTATTGTTCAGAGA 2988 Query 3036 TTTTGTACTGGTGGAATGTCACTTGGTGCTATTTCAAGAGAAACTCATGAAGCAATTGCT 3095 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct 2989 TTTTGTACTGGTGGAATGTCACTTGGTGCTATTTCAAGAGAGACTCATGAAGCTATTGCT 3048 Query 3096 ATTGCTATGAATAGGATTGGTGGTAAATCAAACTCTGGAGAAGGTGGAGAGGATCCTATC 3155 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3049 ATTGCAATGAATAGGATTGGTGGGAAATCAAACTCTGGAGAAGGTGGAGAGGATCCTATC 3108 Query 3156 CGTTGGAAGCCACTTACAGATGTGGTTGATGGATATTCATCAACATTACCACATCTCAAA 3215 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 3109 CGTTGGAAGCCACTTACAGATGTGGTTGATGGATATTCACCAACACTACCACATCTCAAA 3168 Query 3216 GGACTTCAAAACGGCGATATCGCAACAAGTGCTATCAAGCAGGTTGCTTCAGGACGTTTT 3275 || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3169 GGTCTTCAAAACGGCGATATTGCAACAAGTGCTATCAAGCAGGTTGCTTCAGGGCGTTTT 3228 Query 3276 GGAGTCACACCAACATTCTTGGTGAATGCAGACCAATTGGAAATCAAAGTTGCACAAGGT 3335 |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3229 GGAGTCACACCAACGTTCTTGGTCAATGCAGATCAATTGGAAATCAAAGTTGCACAAGGT 3288 Query 3336 GCCAAGCCTGGGGAAGGTGGTCAGCTTCCTGGAAAGAAAGTTAGTGCATATATCGCAAGG 3395 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 3289 GCCAAGCCTGGGGAAGGTGGTCAGCTTCCTGGAAAGAAAGTTAGTGCGTATATCGCTAGG 3348 Query 3396 CTAAGAAGCTCTAAACCTGGTGTTCCGCTTATATCTCCGCCTCCTCACCACGACATTTAC 3455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3349 CTAAGAAGCTCTAAACCTGGTGTTCCGCTTATATCTCCGCCTCCTCACCACGACATTTAC 3408 Query 3456 TCTATTGAGGATCTTGCTCAGTTGATCTTTGATCTACATCAGATTAATCCGAATGCAAAA 3515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3409 TCTATTGAGGATCTTGCTCAGTTGATCTTTGATCTACATCAGATTAATCCAAATGCAAAA 3468 Query 3516 GTATCAGTCAAGCTGGTCGCAGAAGCTGGAATCGGAACAGTTGCTTCTGGAGTTGCAAAG 3575 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct 3469 GTATCAGTCAAGCTAGTTGCAGAAGCTGGAATCGGAACTGTTGCTTCAGGAGTTGCAAAG 3528 Query 3576 GGTAACGCTGATATCATTCAGATATCAGGGCATGATGGTGGAACTGGTGCTAGTCCAATA 3635 ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 3529 GGTAACGCTGATATCATCCAGATATCAGGCCATGATGGTGGAACCGGGGCTAGTCCAATA 3588 Query 3636 AGCTCCATAAAACATGCTGGTGGACCATGGGAGCTTGGACTAACAGAAACTCACCAAACT 3695 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3589 AGCTCCATAAAACATGCTGGTGGACCATGGGAACTTGGACTAACAGAAACTCACCAAACA 3648 Query 3696 CTTATCGAAAATGGACTCAGAGAACGAGTCATTTTAAGAGTCGATGGAGGCTTAAAGAGT 3755 ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3649 CTTATCGCAAATGGACTAAGAGAAAGAGTCATTTTAAGAGTCGATGGAGGCTTAAAGAGT 3708 Query 3756 GGTGTTGATGTTCTAATGGCTGCAGCTATGGGTGCTGATGAATACGGATTTGGTTCCTTG 3815 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3709 GGTGTTGATGTTCTAATGGCTGCAGCTATGGGTGCTGATGAATACGGATTCGGTTCCTTG 3768 Query 3816 GCAATGATTGCTACTGGTTGTGTTATGGCTCGTATTTGCCACACTAATAACTGCCCAGTG 3875 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3769 GCAATGATTGCTACTGGTTGTGTTATGGCTCGTATTTGCCACACTAATAATTGCCCAGTG 3828 Query 3876 GGTGTAGCAAGTCAGAGAGAAGAATTACGTGCAAGATTCCCCGGTGTGCCTGGTGATCTT 3935 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 3829 GGTGTAGCAAGTCAGAGAGAAGAATTACGTGCAAGATTCCCTGGTGTACCTGGTGATCTT 3888 Query 3936 GTCAATTACTTCTTATACGTAGCAGAAGAGGTGAGAGGTATCTTAGCACAGTTGGGATAC 3995 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3889 GTCAACTACTTCTTATACGTAGCAGAAGAGGTGAGAGGTATCTTAGCACAGTTGGGATAC 3948 Query 3996 AGCAAG-TTAGATGACATCATTGGACGAACAGAGTTACTGAAACCACGAGACATTTCGTT 4054 | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | Sbjct 3949 AAC-AGTTTAGATGACATCATTGGACGAACAGAGTTACTGAGACCACGAGACATTTCGCT 4007 Query 4055 AGTGAAAACTCAGCATCTCGATCTGAGTTATCTTCTTTCGTCTGTTGGAACACCTTCATT 4114 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4008 AGTTAAAACTCAACATCTCGATCTGAGTTATCTTCTTTCGTCTGTTGGAACACCTTCATT 4067 Query 4115 GAGCAGTACTGAAATCAGAAAGCAGGAAGTTCATACAAATGGACCTGTTCTCGACGACGA 4174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4068 GAGCAGTACTGAAATCAGAAAGCAGGAAGTTCATACAAATGGACCTGTTCTCGACGACGA 4127 Query 4175 TATTCTTGCAGATCCATTGGTGATTGATGCAATAGAGAACGAAAAGGTGGTCGATAAAAC 4234 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct 4128 TATTCTTGCAGATCCATTGGTGATTGATGCAATAGAGAACGAAAAAGTGGTTGAGAAAAC 4187 Query 4235 CGTCAAAATATGCAACGTAGACCGTGCGGTCT-GTGGTCGCGTTGCTGGTGTTATCGCAA 4293 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 4188 CGTCAAAATATGCAACGTAGACCGTGCGG-CTTGTGGTCGTGTTGCTGGTGTTATTGCAA 4246 Query 4294 AGAAGTATGGAGACACTGGTTTTGCTGGACAAGTGAATCTAACTTTCCTT-GGGAGCGCG 4352 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| Sbjct 4247 AGAAGTATGGAGACACTGGTTTTGCAGGACAAGTGAACCTAACTTTC-TTAGGGAGCGCG 4305 Query 4353 GGACAGTCTTTTGGGTGCTTTTTGATTCCCGGTATGAACATCCGGCTAATAGGAGAGTCA 4412 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4306 GGACAGTCGTTTGGGTGCTTTTTGATTCCCGGTATGAACATCCGGCTCATAGGAGAGTCA 4365 Query 4413 AATGACTACGTTGGAAAGGGAATGGCTGGTGGGGAAATAGTAGTAACTCCTGTGGACACA 4472 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | Sbjct 4366 AATGACTACGTTGGAAAGGGAATGGCTGGTGGTGAAATAGTAGTAACTCCTGTGGAAAAA 4425 Query 4473 ATCGGGTTTGTGCCCGAGGAAGCAACGATAGTCGGGAACACTTGCTTGTATGGTGCCACA 4532 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4426 ATCGGGTTTGTGCCTGAGGAAGCAACGATAGTCGGGAACACTTGCTTGTATGGTGCAACA 4485 Query 4533 GGCGGTCAGATATTTGCTAGAGGCAAAGCTGGAGAGAGATTTGCAGTGAGAAACTCACTA 4592 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4486 GGTGGTCAGATATTCGCTAGAGGCAAAGCTGGAGAGAGATTTGCAGTGAGAAACTCACTC 4545 Query 4593 GCTGAAGCGGTAGTTGAAGGCACTGGAGACCATTGCTGTGAGTACATGACTGGTGGTTGT 4652 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4546 GCTGAAGCAGTAGTTGAAGGCACTGGAGACCATTGCTGTGAGTACATGACTGGTGGCTGT 4605 Query 4653 GTCGTCGTGCTTGGAAAGGTGGGAAGGAACGTTGCTGCGGGTATGACTGGAGGCTTAGCT 4712 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| Sbjct 4606 GTAGTCGTGCTTGGAAAGGTGGGAAGAAACGTTGCTGCTGGTATGACAGGAGGGTTAGCT 4665 Query 4713 TACCTTCTTGATGAAGACGACACTCTTCTCCCTAAGATTAACAGAGAGATAGTGAAGATG 4772 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4666 TACCTTCTTGATGAAGACGACACTCTTCTTCCTAAGATTAACAGAGAGATAGTGAAGATC 4725 Query 4773 CAAAGAGTAGCTGCGCCTGCAGGGGAATTGCAGCTGAAGAGCTTAATTGAAGCACATGTC 4832 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4726 CAAAGAGTAACTGCGCCTGCAGGGGAATTGCAGCTGAAGAGCTTAATTGAAGCACATGTG 4785 Query 4833 GAAAAAACCGGAAGCAGCAAAGGCGCAACGATTCTGAATGAATGGGACAAGTATCTACCA 4892 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 4786 GAAAAAACCGGAAGCAGCAAAGGCGCAACGATTCTGAATGAGTGGGAAAAGTATCTACCT 4845 Query 4893 CTCTTCTGGCAACTGGTTCCACCGAGTGAAGAAGACACTCCTGAAGCTTCAGCTGCTTAT 4952 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 4846 CTCTTCTGGCAACTGGTTCCACCGAGTGAGGAAGACACTCCTGAAGCTTCTGCTGCTTAC 4905 Query 4953 GTAAGAACAGCCACCGGCGAAGTCACATTTCAATCGGCATAAAGATCATTCAAGAGAAGG 5012 ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| Sbjct 4906 GTAAGAACATCCACCGGGGAAGTCACATTTCAATCGGCTTAGAGATCATTCAAGAGCAGG 4965 Query 5013 TTGTTGCAGTTGAAACACAAGGATTGATATACATACA-TCAATGGTGGACTATGGAG-G- 5069 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| | Sbjct 4966 TTGTGGCAGTTGAAACACAAGGATTGATATACAT-CAATGG-TGGAGGACTATGGAGAGC 5023 Query 5070 ACA--AATAGAAAATCATTATCATTT-CAT--AGATCAAATGTGTGAGACAATATTCTTA 5124 | | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 5024 AGATTAATGGAAAATCATTATCATTCACATGTAGATCAAATGTGTGGGACAATATTCTTA 5083 Query 5125 TTGTCTTGTGATCTTTACAACAATACCATGGTTGCTATAACTGTACAGTAAATTCAGTAA 5184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5084 TTGTCTTGTGATCTTTACAACAATACCATGGTTGCTATAACTGTACAGTAAATTCAGTAA 5143 Query 5185 AATAACTGCTTTCAACTGTCATAA 5208 |||||||||||||||||||||||| Sbjct 5144 AATAACTGCTTTCAACTGTCATAA 5167 Score = 3249 bits (1759), Expect = 0.0 Identities = 1891/1956 (97%), Gaps = 4/1956 (0%) Strand=Plus/Plus Query 444 CAGGTTGCTAATTTGGAGGATATATTGTCTGAAAGAGGAGCTTGTGGAGTTGGGTTTATA 503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 352 CAGGTTGCTAATTTGGAGGATATATTGTCTGAAAGAGGAGCTTGTGGAGTTGGGTTTATA 411 Query 504 GCAAACTTAGATAACATACCTTCACATGGAGTTGTCAAAGATGCTCTTATTGCTCTTGGT 563 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 412 GCAAACTTAGATAACATACCTTCACATGGAGTTGTCAAAGATGCTCTTATTGCTCTTGGG 471 Query 564 TGTATGGAACATCGTGGAGGTTGTGGAGCTGACAATGATTCTGGTGATGGCTCTGGTCTT 623 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 472 TGTATGGAACATCGTGGAGGTTGTGGAGCAGACAATGATTCTGGTGATGGCTCTGGTCTT 531 Query 624 ATGTCTTCCATTCCTTGGGATTTCTTTAACGTCTGGGCCAAGGAACAAGGTCTTTCTCCT 683 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 532 ATGTCTTCCATTCCTTGGGATTTCTTTAACGTCTGGGCCAAGGAACAAAGTCTTGCTCCT 591 Query 684 TTTGATAAGTTGCATACTGGTGTTGGCATGATCTTTCTTCCACAAGAGGATACCTTTATG 743 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 592 TTTGATAAGTTGCATACTGGTGTTGGCATGATCTTTCTTCCACAAGATGATACCTTTATG 651 Query 744 CAAGAAGCCAAACAAGTTATTGAAAACATATTTGAGAAAGAAGGATTACAAGTTCTTGGG 803 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 652 CAAGAAGCCAAGCAAGTTATTGAAAACATATTTGAGAAAGAAGGATTACAAGTTCTTGGG 711 Query 804 TGGAGGGAAGTTCCTGTGAATGTTCCTATAGTTGGTCAAAATGCTAGGGAAACAATGCCT 863 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct 712 TGGAGGGAAGTTCCTGTTAATGTTCCTATAGTTGGTAAAAATGCTAGGGAGACAATGCCT 771 Query 864 AACATTCAACAAGTGTTTGTCAAAATCGCAAAGGAAGATAGTACGGATGATATTGAAAGG 923 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 772 AACATTCAACAAGTGTTTGTGAAAATCGCAAAGGAAGATAGTACTGATGATATTGAAAGG 831 Query 924 GAACTTTACATATGCCGGAAACTAATCGAAAGGGCGGTGGCTACTGAGAGTTGGGGAACA 983 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 832 GAACTTTACATCTGCCGGAAACTAATCGAAAGGGCCGTAGCTACTGAGAGTTGGGGAACA 891 Query 984 GAGCTATACTTCTGTTCACTGTCCAATCAAACCATAGTGTACAAGGGCATGCTTCGGTCC 1043 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 892 GAGCTTTACTTCTGTTCACTGTCCAATCAAACCATAGTGTACAAGGGCATGCTTCGATCT 951 Query 1044 GAAGCTCTTGGATTGTTTTATCTAGATCTTCAGAATGAGCTTTATGAGTCTCCTTTTGCT 1103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 952 GAAGCTCTTGGATTGTTTTATCTAGATCTTCAGAATGAGCTTTATGAGTCTCCTTTTGCT 1011 Query 1104 ATTTATCATCGAAGGTACAGTACAAACACTAGTCCTAGGTGGCCTCTTGCTCAACCAATG 1163 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1012 ATTTATCATCGAAGGTACAGTACAAACACTAGTCCTAGGTGGCCTCTTGCTCAACCAATG 1071 Query 1164 AGGTTTCTTGGACATAACGGAGAGATCAATACCATACAGGGGAACTTAAATTGGATGCAG 1223 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1072 AGGTTTCTTGGACATAACGGGGAGATCAATACCATTCAGGGGAACTTAAATTGGATGCAG 1131 Query 1224 TCTCGAGAAGCTTCTTTGAAGTCCT-CTGTTTGGAATGGCCGTGAAAATGAAATCCGTCC 1282 |||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1132 TCTCGAGAAGCTTCATTGAAGGC-TGCTGTTTGGAATGGCCGTGAAAATGAAATTCGTCC 1190 Query 1283 GTTTGGTAATCCCAGGGGTTCAGACTCTGCTAATCTTGATAGTGCTGCAGAAATCTTGAT 1342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1191 ATTTGGTAATCCCAGGGGTTCAGACTCTGCTAATCTTGATAGTGCTGCAGAAATCATGAT 1250 Query 1343 TAGAAGTGGCCGTACTCCAGAGGAAGCTCTAATGATTCTTGTCCCTGAGGCATACAAAAA 1402 ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1251 TAGAAGTGGAAGAACACCAGAGGAAGCTCTAATGATTCTTGTCCCTGAGGCATACAAGAA 1310 Query 1403 TCATCCAACCTTATCTGTCAAATATCCTGAGGTTATAGATTTCTATGACTACTACAAAGG 1462 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1311 TCATCCAACCTTATCTGTCAAATATCCTGAGGTTGTAGATTTCTATGACTACTACAAAGG 1370 Query 1463 ACAAATGGAGGCTTGGGATGGTCCTGCCTTACTTTTGTTCAGTGATGGAAAAACAGTTGG 1522 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1371 ACAAATGGAGGCTTGGGATGGTCCTGCCTTACTTTTGTTCAGTGATGGAAAAACAGTTGG 1430 Query 1523 GGCTTGTCTTGACCGTAACGGCCTTCGTCCTGCTCGATATTGGCGGACTAGTGACAATGT 1582 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1431 GGCTTGTCTTGACCGTAATGGCCTTCGTCCTGCTCGATATTGGCGGACTAGTGACAATTT 1490 Query 1583 CGTCTATGTAGCATCTGAGGTCGGAGTTGTACCAGTTGATGAAGCGAAAGTCACAATGAA 1642 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct 1491 CGTCTATGTTGCATCTGAGGTCGGAGTTGTACCAGTTGATGAGGCAAAAGTCACAATGAA 1550 Query 1643 AGGCCGTCTAGGACCTGGAATGATGATTGCTGTTGACCTAGTGAATGGCCAGGTATATGA 1702 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1551 AGGCCGTCTAGGACCTGGAATGATGATTGCTGTTGACCTTGTGAATGGCCAGGTATATGA 1610 Query 1703 GAACACAGAGGTCAAGAAGAGGATATCTTCATTTAATCCATATGGAAAATGGATTAAAGA 1762 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1611 GAATACAGAGGTCAAGAAGAGAATATCTTCATTTAATCCATATGGAAAATGGATTAAAGA 1670 Query 1763 AAACCCCCGGTTCTTGAAGCCTGTGAATTTCAAATCCTCAACTGTCATGGAAAATGAAGA 1822 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1671 AAACTCCCGGTTCTTGAAGCCTGTGAATTTCAAATCCTCAACTGTCATGGAAAATGAAGA 1730 Query 1823 AATCTTAAGAAGCCAACAGGCATTTGGTTATTCAAGTGAGGATGTGCAAATGGTTATTGA 1882 |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1731 AATCCTAAGAAGCCAACAAGCATTTGGTTATTCAAGTGAGGATGTGCAAATGGTTATTGA 1790 Query 1883 GTCTATGGCTTCTCAAGGAAAGGAACCAACCTTCTGCATGGGCGATGATATTCCGCTGGC 1942 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1791 GTCTATGGCTTCTCAAGGAAAGGAACCAACCTTCTGCATGGGCGACGATATTCCGCTGGC 1850 Query 1943 AGGATTGTCTCAAAGACCACACATGCTTTACGATTATTTCAAACAAAGATTTGCGCAGGT 2002 |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1851 AGGATTGTCTCAAAGACCGCATATGCTTTATGATTATTTCAAACAAAGATTTGCACAGGT 1910 Query 2003 TACAAACCCTGCCATTGATCCCCTTAGGGAAGGTTTGGTTATGTCTCTTGAAGTAAATAT 2062 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1911 TACAAACCCTGCCATTGACCCCCTTAGGGAAGGTTTGGTTATGTCTCTTGAAGTAAATAT 1970 Query 2063 TGGAAAACGTGGAAATATATTGGAGCTTGGACCTGAGAATGCCTCACAGGTTATCCTGTC 2122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 1971 TGGAAAACGTGGAAATATATTGGAGCTTGGACCTGAGAATGCCTCGCAGGTTATTCTGTC 2030 Query 2123 TAACCCTGTGTTAAACGAAGGAGCGTTGGAGGAGTTAAAGAAGGATACA-TACTTAAAAC 2181 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| Sbjct 2031 TAACCCTGTGTTAAATGAAGGAGCGTTAGAGGAGTTAATGAAGGAT-CAATACTTAAAAC 2089 Query 2182 CCAAGGTTCTGTCCACATATTTCGATATACGAAAAGGAGTTGAAGGTTCCTTGCAAAAGG 2241 | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2090 CAAAGGTTCTGTCCACATATTTCGATATAAGAAAAGGCGTTGAAGGTTCCTTGCAAAAGG 2149 Query 2242 CTCTATATTATCTTTGTGAAGCAGCTGATGATGCTGTCCGAAGTGGCTCTCAGCTTCTCG 2301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2150 CTCTATATTATCTTTGTGAAGCAGCTGATGATGCTGTCCGAAGTGGCTCTCAGCTTCTCG 2209 Query 2302 TTCTTTCAGACCGATCCGAAAGCCTGGAACCGACCAGGCCTGCAATTCCGATAATGTTAG 2361 ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| Sbjct 2210 TTCTTTCAGACCGATCCGATAGACTGGAACCAACCAGGCCTTCAATTCCAATAATGTTAG 2269 Query 2362 CTGTTGGCGCTGTACATCAACATCTTATTCAGAACG 2397 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2270 CTGTTGGCGCTGTCCATCAACATCTTATTCAGAACG 2305 Score = 396 bits (214), Expect = 1e-108 Identities = 260/281 (93%), Gaps = 7/281 (2%) Strand=Plus/Plus Query 174 ATGGCGATGAAATCTCTTTCCCCTGTTCCTAAGCTTCTCTCCACAACACCAAGCTCTGTT 233 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGCGATGCAATCTCTTTCCCCTGTTCCTAAGCTTCTCTCCACAACACCAAGCTCTGTT 60 Query 234 CTTTCTTCTGACAAGAACTTCTTCTTCGTCGATTTCGTTGGATTATACTGTAAGTCCAAG 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CTTTCTTCTGACAAGAACTTCTTCTTCGTCGATTTCGTTGGATTATACTGTAAGTCCAAG 120 Query 294 AGAACCAGACGCAGACTTCGTGGCGAttcttcctcaggctct---tcttcttcttctctc 350 || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct 121 AGGACCAGACGCAGACTTCGTGGAGACTCTTCCTCTTCCTCACGCTCTTCTTCTTCTCTC 180 Query 351 tctcgtctttcctctGTTCGTGCTGTTATCGACCTTGAACGTGTTAATGGCTTCTCTCAC 410 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | Sbjct 181 TCTCGTCTTTCCTCTGTTCGTGCCGTTATCGACCTTGAACGTGTTCATGGCGTCTCTGA- 239 Query 411 AAAG-ATCTCTCTTCTCCTTCA-CTTTTAAAACCTCAGGTT 449 |||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||||||| Sbjct 240 AAAGGATCTCTCCTCTCCTTCAGCTTT-AAGACCTCAGGTT 279 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 261068771372 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5