BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg487455
Length=3447
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G06460.1 | Symbols: ATUBA2, UBA 2 | ubiquitin activating enz... 5653 0.0
AT5G06420.1 | Symbols: | Zinc finger (CCCH-type/C3HC4-type RIN... 209 1e-52
> AT5G06460.1 | Symbols: ATUBA2, UBA 2 | ubiquitin activating enzyme
2 | chr5:1970029-1974527 FORWARD LENGTH=3438
Length=3438
Score = 5653 bits (3061), Expect = 0.0
Identities = 3329/3456 (96%), Gaps = 28/3456 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TACTTTAACAACAAATTCGCCGCTTATCGCCTCCGATCTTCTCTCAAAGGTACGCTATAT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 2 TACTTTAACAACAAATTCGCCGCTTATCGCCTCCGATCTTCTCTCAAAGTTACTCTATAT 61
Query 61 GGAACCATTCGTTGCAAAGGAGAACATCATCGCATCTGCTTCTTCGCCGATGAAGAAGCG 120
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 62 GGAACCATTCGTTGTTAAGGAGAACATCATCGCATCTGCTTCTTCGCCGATGAAGAAGCG 121
Query 121 ACGGATCGATCACACTGAGTCTACTAAAGCTGATGGTTCGGCGATTAACGCCTCTAACTC 180
||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 122 ACGGATCGATCACACTGAG--T-C---AGCTGATGGTTCTGCGATTAACGCTTCTAACTC 175
Query 181 TGGTAGCATCGGTTTGAACAATAGCATCGGTGGTAACGATACGGTGATGAACATGGCGGA 240
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 176 CAGTAGCATCGGTTTGAACAACAGCATCGGTGGTAACGATACGGTGATGAGCATGGCGGA 235
Query 241 GTTTGGTAACGACAACTCCAACAATCAGGAGATCGATGAAGATCTTCATAGCAGACAGCT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 GTTTGGTAACGACAACTCCAACAATCAGGAGATCGATGAAGATCTTCATAGCAGACAGCT 295
Query 301 CGCCGTTTACGGCCGCGAGACTATGAGGAAGCTTTTCGCTTCCAACGTTCTCATCTCTGG 360
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 CGCCGTTTACGGCCGTGAGACTATGAGGAAGCTTTTCGCTTCCAACGTTCTCATCTCTGG 355
Query 361 GATGCAAGGACTTGGTGTCGAGATTGCCAAGAATATTATTCTAGCTGGTGTGAAGTCAGT 420
|||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 356 GATGCAGGGCCTTGGTGTTGAGATTGCCAAGAATATTATTCTAGCTGGTGTGAAGTCAGT 415
Query 421 GACCCTTCACGATGAAAATGTGGTTGAGTTATGGGACTTATCTAGTAACTTTGTTTTCAC 480
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 GACCCTTCACGATGAAAATGTGGTTGAGCTATGGGACCTATCTAGTAACTTTGTTTTCAC 475
Query 481 GGAGGAGGACATTGGTAAGAATAGGGCACTTGCTTCTGTTCACAAGTTGCAAGAACTCAA 540
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 476 GGAGGAGGACATTGGTAAGAATAGAGCACTTGCTTCTGTTCACAAGTTGCAAGAACTCAA 535
Query 541 CAATGCTGTGGCTGTCTCAACATTGACTGGGAAGTTAACCAAAGAGCAGCTTTCTGATTT 600
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 CAATGCTGTGGCTGTCTCAACTTTGACTGGGAAGTTAACCAAAGAGCAGCTTTCTGATTT 595
Query 601 CCAGGTTGTGGTATTTGTGGATATCTCTTTTGATAAAGCCACAGAGTTTGATGATTATTG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 596 CCAGGTTGTGGTATTTGTGGATATCTCTTTTGAGAAAGCGACAGAGATTGATGATTATTG 655
Query 661 TCATAGTCATCAGCCTCCTATTGCATTCATCAAGGCTGACGTTAGGGGGCTGTTTGGGTC 720
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 656 TCACAGTCATCAGCCTCCTATTGCATTCATCAAGGCTGATGTTAGGGGGCTGTTTGGGTC 715
Query 721 TTTGTTTTGTGATTTTGGACCTCATTTTACTGTTCTTGATGTTGATGGGGAGGAACCTCA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 716 TTTGTTTTGTGATTTTGGACCTCATTTTACTGTTCTTGATGTTGATGGGGAGGAACCTCA 775
Query 781 CTCTGGCATCATCGCTTCTGTTAGCAATGAAAATCCTGCATTTGTTTCGTGTGTCGATGA 840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 776 CTCTGGCATCATCGCTTCTGTTAGCAATGAAAATCCTGGATTTGTTTCGTGTGTCGATGA 835
Query 841 TGAGAGGCTCGAGTTTGAGGATGGAAATCTT-GTCATTTTCTCTGAAGTTGAGGGGATGA 899
|||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 836 TGAGAGGCTCGAGTTTGAAGATGGAAAT-TTGGTTGTTTTCTCTGAAGTTGAGGGAATGA 894
Query 900 CAGAGCTAAATGATGGAAAACCAAGGAAGATAAAAAATGTCAAGCCATTTTCATTTACCC 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 CAGAGCTAAATGATGGAAAACCAAGGAAGATAAAAAATGTCAAGCCATTTTCATTTACCC 954
Query 960 TCGAGGAAGACACCTCTAGCTATGGGCAATATATGAAGGGTGGCATTGTGACTCAGGTTA 1019
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 TGGAGGAAGACACCTCTAGCTATGGGCAATATATGAAGGGTGGCATTGTGACTCAGGTTA 1014
Query 1020 AACAACCAAAGGTGCTGAACTTTAAACCTCTTAGAGAAGCACTTAAAGATCCAGGCGACT 1079
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 AACAACCAAAGGTGTTGAACTTTAAACCTCTTAGAGAAGCACTTAAAGATCCAGGCGACT 1074
Query 1080 TTCTTCTAAGTGACTTTGCAAAGTTTGACCGACCACCTCTTCTCCACTTAGCATTCCAAG 1139
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 TTCTTCTAAGTGACTTTTCAAAGTTTGACCGACCACCTCTTCTCCACTTAGCATTCCAAG 1134
Query 1140 CACTTGATAGGTTTTCGTCTCAAGCAGGCCGATTTCCGGTTGCTGGTTCAGAAGAAGATG 1199
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 CACTTGATAGGTTTTCGTCTCAAGCAGGCCGATTTCCGTTTGCTGGTTCAGAAGAAGATG 1194
Query 1200 CTCAGAAACTAGTGGAAATTGCAGTTGACATTAATGAGAGTTTGGGTGATGCAAGGTTGG 1259
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 CTCAGAAACTAGTGGAAATTGCAGTTGACATTAATGAGGGTTTGGGTGATGCAAGGTTGG 1254
Query 1260 AAGATGTCAACTCTAAACTGTTGCGGCATTTGGCCTTTGGATCCAGGGCTGTTCTGAATC 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 AAGATGTCAACTCTAAACTGTTGCGGCATTTGGCCTTTGGATCCAGGGCTGTTCTGAATC 1314
Query 1320 CTATGGCTGCAATGTTTGGTGGCATTGTTGGGCAGGAGGTTGTCAAGGCATGCTCTGGGA 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 CTATGGCTGCAATGTTTGGTGGCATTGTTGGGCAGGAGGTTGTCAAGGCATGCTCTGGGA 1374
Query 1380 AATTCCATCCTATCTTTCAGTTCTTTTACTTTGATTCGGTGGAGTCACTTCCCAAGGAAC 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1375 AATTCCATCCTATCTTTCAGTTCTTTTACTTTGATTCGGTGGAGTCACTCCCCAAGGAAC 1434
Query 1440 CTCTTGATGCATCAGAGTTTAGACCACAAAATAGCCGTTATGATGCACAGATCTCTGTAT 1499
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1435 CTCTTGATGCATCAGAGTTTAGACCACAAAATAGCCGTTACGATGCACAGATCTCTGTAT 1494
Query 1500 TTGGGTCTACTCTTCAGAAGAAACTCGAGGATGCCAGAGTTTTTGTTGTAGGGGCTGGTG 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 TTGGGTCTACTCTTCAGAAGAAACTCGAGGATGCCAGAGTTTTTGTTGTAGGGGCTGGTG 1554
Query 1560 CTCTTGGATGCGAGTTCTTAAAGAACTTGGCTTTGATGGGTGTGTCATGTGGCACTCAAG 1619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1555 CTCTTGGATGCGAGTTCTTAAAGAACTTGGCTTTGATGGGTGTGTCATGTGGCACCCAAG 1614
Query 1620 GGAAGCTAACTGTCACCGATGATGATGTAATTGAGAAGAGCAACCTGAGTCGTCAGTTTC 1679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 GGAAGCTAACTGTCACCGATGATGATGTAATTGAGAAGAGCAACCTGAGTCGTCAGTTTC 1674
Query 1680 TTTTTCGAGATTGGAACATAGGACAGGCTAAATCCACAGTTGCCGCAACAGCAGCAGCTG 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 TTTTTCGAGATTGGAACATAGGACAGGCTAAATCCACAGTTGCCGCAACAGCAGCAGCTG 1734
Query 1740 GAATAAATTCGCGCCTCAACATTGATGCTCTGCAAAATCGTGTTGGACCTGAGACCGAGA 1799
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1735 GAATAAATTCTCGCCTCAACATTGATGCTCTGCAAAATCGTGTTGGACCTGAGACCGAGA 1794
Query 1800 ATGTCTTTGATGACAGCTTCTGGGAGAATTTGACAGTTGTGGTCAACGCTTTGGACAATG 1859
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1795 ATGTCTTTGACGACAGCTTCTGGGAGAATTTGACAGTTGTGGTGAACGCTTTGGACAATG 1854
Query 1860 TCACTGCAAGGCTTTATGTCGATTCGAGGTGTGTGTATTTCCAGAAGCCTCTCCTCGAGT 1919
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 TCACTGCAAGGCTTTATGTTGATTCAAGGTGTGTGTATTTCCAGAAGCCTCTCCTCGAGT 1914
Query 1920 CAGGAACCCTAGGTGCAAAGTGCAACACACAGATGGTTATCCCTCATCTCACTGAGAACT 1979
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1915 CAGGAACCCTAGGTGCAAAGTGCAACACACAGATGGTTATCCCTCACCTCACTGAGAACT 1974
Query 1980 ATGGTGCCTCGAGGGACCCACCAGAGAAACAGGCTCCGATGTGTACAGTGCACTCATTTC 2039
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||
Sbjct 1975 ATGGTGCCTCGAGAGACCCACCAGAGAAACAGGCTCCAATGTGCACCGTGCACTCATTTC 2034
Query 2040 CTCACAACATTGACCATTGTTTGACATGGGCTCGCTCTGAATTTGAGGGTCTGCTTGAGA 2099
||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2035 CTCACAACATTGATCATTGCTTAACATGGGCTCGCTCTGAATTTGAGGGTTTGCTTGAGA 2094
Query 2100 AAACACCAGCTGAAGTTAATGCATACCTCTCAGATCCTGTTGAATACATGAAAGCGATGA 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2095 AAACACCAGCTGAAGTTAATGCATACCTCTCAGATCCTGTTGAATACATGAAAGCGATGA 2154
Query 2160 GTACTGCTGGTGATGCTCAAGCCAGGGATACTTTGGGGCGTGTTGTTGAGTGCCTTGAGA 2219
| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2155 GAACTGCTGGTGATGCCCAAGCAAGGGATACTTTGGGACGTGTTGTTGAGTGCCTCGAGA 2214
Query 2220 AAGAAAAGTGCAATTCATTCCAGGATTGCATAACCTGGGCTCGTCTGAGGTTTGAGGACT 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 AAGAAAAGTGCAATTCATTCCAGGATTGCATAACCTGGGCTCGTCTGAGGTTTGAGGACT 2274
Query 2280 ACTTCGCCAACCGTGTGAAGCAGTTATGTTACACATTTCCTGAGGATGCTGCTACTAGTA 2339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2275 ACTTCGCCAACCGTGTGAAGCAGTTATGTTACACATTTCCTGAGGATGCTGCTACTAGTA 2334
Query 2340 CGGGAGCTCCATTCTGGTCTGCCCCAAAGAGATTTCCTCGCCCACTCCAATTCTCCTCAA 2399
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2335 CAGGAGCTCCGTTCTGGTCTGCCCCAAAGAGATTTCCTCGCCCACTCCAATTCTCCTCAA 2394
Query 2400 CCGACCTGGGCCATATCAACTTTGTCATGGCTGCATCTATCTTGCGTGCAGAGACATTCG 2459
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2395 CCGACCTGAGCCATATCAACTTTGTCATGGCTGCATCTATCTTGCGAGCAGAGACATTCG 2454
Query 2460 GAATCCCTACTCCTGAGTGGGCTAAAAACCCAA-CAGGACTAGCCGAGGCTGTGGAAAGA 2518
||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2455 GAATCCCTACTCCTGAGTGGGCTAAAA-CCCGAGCAGGACTAGCCGAGGCTGTGGAAAGA 2513
Query 2519 GTAATTGTCCCCGACTTTGAGCCGAGGAAAGATGCAAATATTGTGACAGATGAGAAAGCT 2578
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct 2514 GTAATTGTCCCCGACTTTGAGCCGAAGAAAGATGCAACTATTGTGACAGATGAGAAGGCT 2573
Query 2579 ACAACTTTGTCTACAGCTTCAGTCGATGATGCTGCAATAATCGATGAACTAAACACAAAG 2638
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2574 ACAACTTTGTCTACAGCTTCAGTCGATGATGCAGCAGTAATCGATGAACTAAACGCAAAA 2633
Query 2639 CTAGAGTGGTGCAGGAGGAGCTTGCAGCCAGAGTTCAGGATGAAGCCAATCCAGTTTGAA 2698
|||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2634 CTAGTGCGGTGCAGGATGAGCTTGCAGCCAGAGTTCAGGATGAAGGCAATCCAGTTTGAA 2693
Query 2699 AAGGACGACGATACCAACTACCACATGGATATGATCGCTGGGCTAGCCAACATGAGAGCA 2758
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2694 AAGGACGATGATACCAACTACCACATGGATATGATCGCTGGGCTAGCCAACATGAGAGCA 2753
Query 2759 AGGAACTACAGCGTTCCTGAGGTGGACAAGCTTAAAGCCAAGTTCATAGCCGGAAGAATC 2818
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2754 AGGAACTACAGTGTTCCCGAGGTGGACAAGCTTAAAGCCAAGTTCATAGCCGGAAGAATC 2813
Query 2819 ATTCCAGCAATCGCAACATCAACTGCAATGGCAACAGGTTTAGTCTGCCTCGAGCTGTAC 2878
|| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||
Sbjct 2814 ATACCCGCGATTGCGACATCAACTGCAATGGCAACAGGTTTTGTTTGCCTTGAGATGTAC 2873
Query 2879 AAGGTCTTAGACGGGTCACACAAAGTAGAAGACTACAGAAACACATTTGCTAACTTAGCA 2938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2874 AAGGTCTTAGACGGGTCACACAAAGTAGAAGACTACAGAAACACATTTGCTAACTTAGCA 2933
Query 2939 CTTCCGCTCTTCTCCATGGCTGAGCCGGTTCCACCTAAAGTGGTGAAGCACCAAGACCAA 2998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2934 CTTCCGCTCTTCTCCATGGCTGAGCCGGTTCCACCTAAAGTGGTGAAGCACCAAGACCAA 2993
Query 2999 AGCTGGACTGTTTGGGACCGGTGGGTGATCAGGGGAAACCCGACCCTAAGGGAGTTGCTA 3058
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2994 AGCTGGACTGTTTGGGACCGGTGGGTGATGAGGGGAAACCCGACCCTAAGGGAGTTGCTA 3053
Query 3059 GGA-TGGCTAAAAGGGAAAGGGCTAAACGCTTACAGCATATCGTGCGGAAGCAGTTTACT 3117
| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3054 G-ACTGGCTAAAAGAGAAAGGGCTAAACGCATACAGCATATCTTGCGGAAGCAGTTTACT 3112
Query 3118 GTACAACAGTATGTTCTCAAGGCATAAAGATAGGATGGACACGA-GAGTGGTGGATCTTG 3176
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||
Sbjct 3113 GTACAACAGTATGTTCTCAAGGCATAAAGAGAGGATGAACA-GAAGAGTGGTGGATCTTG 3171
Query 3177 CAAGAGATGTGGCTGGGGTTGAATTACCTGCTTATAGACGTCACGTGGATGTTGTGGTTG 3236
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 3172 CAAGAGACGTGGCTGGGGTTGAATTGCCTGCTTATAGACGTCACGTGGATGTTGTAGTCG 3231
Query 3237 CTTGTGAAGATGATAATGGTGAC-GACGTTGATATCCCTCTCGTATCAGTCTACTACGCC 3295
|||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3232 CTTGTGAAGATGATAATGATG-CTGACGTTGATATCCCTCTCGTATCAGTCTACTTCGCC 3290
Query 3296 TGATTAGAGAATCTTAA----CGTCCCCAACGAGAGAAGCTTTTAATAATTACTGTATTC 3351
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3291 TGATTAGAGAATTTTAATTAACGTCCCCAACGAGAGAAGCTTTTAATAATTACTGTATTC 3350
Query 3352 TTGGGATATGAAGCTGAGTTTCAGAGATAGAGAGAGTTTTGATGTATGAGAAATTGAGAA 3411
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 3351 TTGGGATATGAAGTTGAGTTTCAGAGATAGAGAGAGTTTTGATGTATGAGAA-T--AGA- 3406
Query 3412 TAGAGTTAACTTCTTAAAATTTAGAATTGAATTTTC 3447
| ||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 3407 --G--TTAACTTCTTAAAATTTAGAACTAAATTTTC 3438
> AT5G06420.1 | Symbols: | Zinc finger (CCCH-type/C3HC4-type RING
finger) family protein | chr5:1961411-1963038 FORWARD LENGTH=1415
Length=1415
Score = 209 bits (113), Expect = 1e-52
Identities = 189/221 (86%), Gaps = 24/221 (11%)
Strand=Plus/Plus
Query 51 TACGCTATATGGAACCATTCGTTGCAAAGGAGAACATCATCGCATCTGCTTCTTCGCCGA 110
||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 103 TACTCTACATGGAACCATTCGTTGTTAAGGAGAACATCGTCGCATCCGCTTCTTCGCCGA 162
Query 111 TGAAGAAGCGACGGATCGATCACACTGAGTCTACTAAAGCTGATGGTTCGGCGATTAACG 170
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 163 TGAAGAAGCGACGGATCGATCACACTGAGTC-A-----GCTGATGGTTCTGCGATTAACG 216
Query 171 CCTCTAACTCTGGTAGCATCGGTTTGAACAATAGCATCGGTGGTAACGATACGGTGATGA 230
| ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 CTTCTAACTCT---AG--T-------A------GCATCGGTGGTAACGATACGGTGATGA 258
Query 231 ACATGGCGGAGTTTGGTAACGACAACTCCAACAATCAGGAG 271
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 259 ACATGGCGGAGTTTGGTAACGACAACTCCAACAATCAGGAG 299
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 171570945060
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5