BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg489332
Length=4518
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G24710.1 | Symbols: | Transducin/WD40 repeat-like superfami... 7022 0.0
> AT5G24710.1 | Symbols: | Transducin/WD40 repeat-like superfamily
protein | chr5:8458847-8468173 REVERSE LENGTH=4688
Length=4688
Score = 7022 bits (3802), Expect = 0.0
Identities = 4114/4265 (96%), Gaps = 19/4265 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 97 AATCGTCTTTGCGGATGCAATTGTGCTCAGA-TTTTGAGTTGTTTCATTGATCTTGGAGA 155
|||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||
Sbjct 166 AATCGTCTATGCGGATGCAGTTGTGCTCAGATTTTTGAGTTGTCTAATTGATCTTGAAGA 225
Query 156 ACTGATATagagagcgagagagagagaTCGAAATGTTGCGGGCGAGAGCATTTCGGCAGA 215
|||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 226 ACTG---T-GAGAGAGAGAGAGAGAGATCGAAATGTTGCGGGCGAGAGCATTTCGGCAGA 281
Query 216 CAAATGGTAAGATTGTGAAGATACAGGTGCATCCCACGCATCCATGGCTTGTCACAGCCG 275
| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |
Sbjct 282 CCAATGGTAAGATTGTGAAGATACAGGTACATCCTACGCATCCATGGCTTGTTACGGCTG 341
Query 276 ATGATTCAGATCACGTTTCCGTCTGGAATTGGGAGCATCGTCAGGTAATTTATGAATTGA 335
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 ATGATTCAGATCACGTCTCCGTCTGGAATTGGGAGCATCGTCAGGTAATTTATGAATTGA 401
Query 336 AAGCCGGCGGAGTTGACGAGCGCCGTTTAGTTGGTGCTAAGTTAGAGAAGCTCGCCGAAG 395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 402 AAGCCGGCGGAGTTGACGAGCGCCGTTTAGTTGGTGCCAAGTTAGAGAAGCTCGCCGAAG 461
Query 396 GAGAATCCGACTATAAAGCCAAGCCCACTGAAGCCATTAGAGGAGGAAGTGTTAAGCAGG 455
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 462 GAGAATCCGACTATAAAGCTAAGCCTACTGAAGCCATTCGAGGAGGAAGCGTTAAGCAGG 521
Query 456 TGAAGTTTTATGACGATGATGTGCGTTATTGGCAACTGTGGCGTAATCGCTCTGCAGCTG 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||
Sbjct 522 TGAAGTTTTATGACGATGATGTGCGTTATTGGCAACTGTGGCGCAACCGCTCCGCAGCTG 581
Query 516 CTGAATCTCCATCAGCTGTCAATCATCTCACATCTGCTTTCACTTCCCCTGCTCCATCGA 575
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 CTGAATCTCCATCAGCTGTCAATCATCTGACATCTGCTTTCACTTCCCCTGCTCCATCGA 641
Query 576 CTAAAGGCCGGCATTTTCTGGTCATCTGTTGTGAGAATAAAGCCATTTTCTTGGACTTGG 635
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 642 CTAAAGGCCGTCATTTTCTGGTCATTTGTTGTGAGAATAAAGCTATTTTCTTGGATTTGG 701
Query 636 TGACAATGCGTGGTCGTGATGTGCCAAAGCAAGAGCTTGATAACAAGTCACTTCTCTGCA 695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 TGACAATGCGTGGTCGTGATGTGCCAAAGCAAGAGCTTGATAACAAGTCACTTCTCTGCA 761
Query 696 TGGAGTTTCTTACCAGATCATCTGGTGGTGATGGCCCTTTAGTTGCATTTGGTTCAACTG 755
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 TGGAGTTTCTTTCGAGATCATCTGGTGGTGATGGCCCTTTAGTTGCATTTGGTTCAACTG 821
Query 756 ATGGTGTCATTCGGGTTTTATCAATGATAACTTGGAAGCTTGCACGTAGATATACAGGTG 815
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 822 ATGGTGTCATTCGGGTTTTATCAATGATAACATGGAAGCTTGCACGTCGATATACAGGTG 881
Query 816 GCCATAAAGGATCCATATATTGCTTGATGAATTTCATGGCATCGTCTGGCGAAGCACTCC 875
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 882 GCCATAAAGGATCCATTTATTGCTTGATGAATTTCATGGCATCATCTGGCGAAGCACTCC 941
Query 876 TTGTTTCAGGTGGCAGTGATGGCTTACTTGTACTGTGGAGTGCTGATAATGGCACTGACT 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||
Sbjct 942 TTGTTTCAGGTGGCAGTGATGGCTTACTTGTACTGTGGAGTGCCGATCATGGCGCTGACT 1001
Query 936 CAAGGGAACTTGTACCCAAGCTTAGCTTAAAGGCACATGATGGTGGGGTGGTGGCTGTTG 995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 CAAGGGAACTTGTACCCAAGCTTAGCTTAAAGGCACATGATGGTGGGGTGGTGGCTGTTG 1061
Query 996 AGTTGTCAAGGGTAAGTGGGAGTGCTCCACAATTGATTACAATTGGGGCTGACAAGACAT 1055
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 AGCTGTCAAGGGTAAGTGGGAGTGCTCCACAATTGATTACAATTGGGGCTGACAAGACAT 1121
Query 1056 TAGCCATATGGGACACAATGACATTTAAGGAGCTGCGTAGAATTAAACCTGTCCCGAAGC 1115
| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1122 TGGCCATATGGGATACAATGACATTTAAGGAGCTACGTAGAATTAAACCTGTCCCGAAAC 1181
Query 1116 TAGCTTGCCACAGTGTTGCATCTTGGTGTCACCCTCGAGCGCCAAACCTTGATATTTTGA 1175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 TAGCTTGCCACAGTGTTGCATCTTGGTGTCACCCTCGAGCGCCAAACCTTGATATTTTGA 1241
Query 1176 CTTGCGTTAAAGATTCGCACATATGGTCTATTGAGCATCCAACTTATTCGGCCCTAACAA 1235
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1242 CTTGCGTTAAAGATTCACACATATGGTCTATTGAGCATCCAACTTATTCGGCCCTGACAA 1301
Query 1236 GGCCATTATGTGAACTTTCTTCCTTGGTTCCGCCTCAAGTACTTGCAACCCACAGAAAAC 1295
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302 GGCCGTTATGTGAACTTTCTTCCTTGGTTCCGCCTCAAGTACTTGCAACCCACAGAAAAC 1361
Query 1296 TTAGGGTCTATTGTATGGTTGCACATCCTCTACAACCACATCTCGTCGCAACTGGTACCA 1355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362 TTAGGGTCTATTGTATGGTTGCACATCCTCTACAACCACATCTCGTCGCAACTGGTACCA 1421
Query 1356 ATGTTGGTATTATAGTTAGTGAATTTGATCCTCGTGCCATCCCGTCTGCAGCTCCTCTAC 1415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1422 ATGTTGGTATTATAGTTAGTGAATTTGATCCTCGTGCTATCCCGTCTGCAGCTCCTCTAC 1481
Query 1416 CAGCACTGCCTGGAAGTCGGGAGAATTCAGCTATATATATCCTTGGAAGAGAATTAAAGC 1475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482 CAGCACTGCCTGGAAGTCGGGAGAATTCAGCTATATATATCCTTGGAAGAGAATTAAAGC 1541
Query 1476 TCTTGAACTTTCAACTATCCAACTCAGCCAACCCATCCCTTGGAAATAATAGTGCCTTGT 1535
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1542 TCTTGAACTTTCAACTATCCAACACAGCCAACCCATCCCTTGGCAATAATAGTGCCTTGT 1601
Query 1536 CCGAATCAGGGCTGTCTAAGGGAGACCCAAGTGAGCAGTTGACTGTAAAGCAGACCAAAA 1595
||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1602 CCGAATCAGGGCTTTCTAAGGGAGACCCAGGTGAACAGTTAACTGTAAAGCAAACCAAAA 1661
Query 1596 AGCAGATCGTGGCACCTGTTCCACATGATTCATACTCAGTTCTTTCTGTGAGCAGTTCAG 1655
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1662 AGCAGATCGTGGCACCAGTTCCACATGATTCATACTCAGTTCTTTCTGTGAGCAGTTCAG 1721
Query 1656 GGAAGTATGTGGCAGTTGTATGGCCTGATATTCTGTACTTCTCTATCTACAAGGTTAGTG 1715
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722 GGAAGTATGTGGCAGTTGTATGGCCGGATATTCTATACTTCTCTATCTACAAGGTTAGTG 1781
Query 1716 ACTGGTCGATTGTTGACTCTGGAAGTGCAAGACTGTTGGCTTGGGATACATGTCGAGACA 1775
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1782 ACTGGTCCATTGTTGACTCTGGAAGTGCAAGACTGTTGGCGTGGGATACATGTCGAGACA 1841
Query 1776 GATTTGCCATTCTAGAATCTGTGTTACCTCAAAGGATGCCTATAATCCCTAAGGGTGGTT 1835
||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 GATTTGCGATTCTAGAATCTGTGTTACCTCATAGAATGCCTATAATCCCTAAGGGTGGTT 1901
Query 1836 TATCGAGAAAGGCAAAAGAAGCCgctgcagctgcagctcaagctgctgctgctgccagtg 1895
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1902 CATCGAGAAAGGCAAAAGAAGCCGCTGCAGCTGCAGCTCAAGCTGCTGCTGCTGCCAGTG 1961
Query 1896 cagctTCATCGGCTAGTGTCCAAGTTCGTATTCTCTTGGATGATGGTACCTCAAACATAC 1955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1962 CAGCTTCATCGGCTAGTGTCCAAGTTCGTATTCTCTTGGATGATGGTACCTCAAACATAC 2021
Query 1956 TCATGAGATCTGTAGGAGGTCGCTCTGAACCGGTCATTGGTCTGCATGGTGGTGCTCTAC 2015
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2022 TCATGAGATCCGTAGGAGGTCGCTCTGAACCGGTCATTGGTCTGCATGGTGGTGCTCTAC 2081
Query 2016 TTGGTATAGGCTATCGCACATCCCGAAGGATTAGTCCTGTTGCTGCAACAGCTATTTCAA 2075
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2082 TTGGTATAGGTTATCGCACATCCCGAAGGATTAGTCCTGTTGCTGCAACAGCTATTTCAA 2141
Query 2076 CCATTCAGTCGATGCCACTCTCGGGATTTGGAAACAGCAATGTTTCTTCGTTTTCTAGCT 2135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2142 CCATTCAGTCGATGCCACTCTCGGGATTTGGAAACAGCAATGTTTCTTCGTTTTCTAGCT 2201
Query 2136 ATGATGATGGGTTTTCTTCGCAGAAGTCTGCTGAGTCTGCACCCCTAAACTACCAGCTCT 2195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202 ATGATGATGGGTTTTCTTCGCAGAAGTCTGCTGAGTCTGCACCCCTAAACTACCAGCTCT 2261
Query 2196 ACAGTTGGGAAAATTTTGAGCCAGTTGGTGGTATGCTACCTCAGCCAGAATGGACGGCGT 2255
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2262 ACAGTTGGGAAAATTTTGAGCCAGTAGGTGGTATGCTACCTCAGCCAGAATGGACGGCAT 2321
Query 2256 GGGACCAAACAGTTGAGTACTGTGCTTTTGCTTATCAACAATACATGGTCATATCGTCCT 2315
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2322 GGGACCAAACAGTTGAATACTGTGCTTTTGCTTATCAACAATACATGGTCATATCGTCCT 2381
Query 2316 TGCGCCCTCAGTATAGATATCTTGGTGATGTTGCCATTGCACATGCTACTGGAGCTGTTT 2375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2382 TGCGCCCTCAGTATAGATATCTTGGTGATGTTGCCATTGCACATGCTACTGGAGCTGTTT 2441
Query 2376 GGCATCGCAGACAGCTGTTTGTGGCTACACCAACCACGATTGAATGTGTTTTTGTGGACG 2435
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2442 GGCATCGCAGACAGCTGTTTGTGGCTACACCAACCACGATTGAATGTGTTTTTGTGGATG 2501
Query 2436 CGGGAGTTTCTGAAATTGATATAGAGACTAGGAAGATGAAGGAAGAAATGAAACTTAAGG 2495
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2502 CGGGAGTTTCCGAAATTGATATAGAGACTAGGAAGATGAAGGAAGAAATGAAACTTAAGG 2561
Query 2496 AGGCGCAGGCTAGAGCAGTTGCAGAGCATGGAGAGTTAGCCTTAATCACAGTAGAAGGTT 2555
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2562 AGGCGCAGGCTAGAGCAGTTGCAGAGCATGGAGAGTTGGCCTTAATCACAGTAGAAGGTT 2621
Query 2556 CCCAGGCTGCAAAGCAAGAAAGGATATCTTTAAGGCCCCCCATGCTGCAGGTTGTGCGTT 2615
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2622 CCCAGGCTGCAAAGCAAGAAAGGATATCTTTAAGGCCCCCCATGCTGCAGGTGGTGCGTT 2681
Query 2616 TAGCTTCTTTCCAAAATGCTCCATCTGTTCCACCATTCTTATCATTGCCAAGACAATCTA 2675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2682 TAGCTTCTTTCCAAAATGCTCCATCTGTTCCACCATTCTTATCATTGCCAAGACAATCTA 2741
Query 2676 GAGGTGATAGCGATGACATAATGGATGAAAGAAGGGTCAATGAGGTAGCTGTGGGTGGTG 2735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2742 GAGGTGATAGCGATGACATAATGGATGAAAGAAGGGTCAATGAGGTAGCTGTGGGTGGTG 2801
Query 2736 GAGGAGTCTCAGTTGCTGTTACTCGTTTCCCAGTGGAGCAAAAACGACCAGTGGGGCCTC 2795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2802 GAGGAGTCTCAGTTGCTGTTACTCGTTTCCCAGTGGAGCAAAAACGACCAGTGGGGCCTC 2861
Query 2796 TTGTTGTTGCCGGTGTACGTGATGGAGTTCTTTGGCTCATTGACAGGTACATGTGTGCCC 2855
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2862 TTGTTGTTGCCGGTGTGCGGGATGGAGTTCTTTGGCTCATTGACAGGTACATGTGTGCCC 2921
Query 2856 ATGCCATTTCACTGAATCATCCTGGTATCCGTTGCCGCTGTCTTGCTGCTTACGGGGATG 2915
||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2922 ATGCCATATCCCTTAATCATCCTGGTATCCGCTGTCGCTGTCTTGCTGCTTACGGGGATG 2981
Query 2916 CTGTTAGTGCAGTCAAATGGGCAAGTAGGCTTGGCAGGGAACATCATGACGATCTGGCAC 2975
||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2982 CTGTTAGTGCAGTTAAATGGGCAAGTAGGCTTGGGAGAGAACATCATGACGATCTGGCAC 3041
Query 2976 AGTTTATGCTAGGGATGGGATACGCAACAGAAGCTCTTCATTTGCCTGGAATATCTAAGA 3035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3042 AGTTTATGCTAGGGATGGGATACGCAACAGAAGCTCTTCATTTGCCTGGAATATCTAAGA 3101
Query 3036 GGCTGGAGTTTGATCTAGCAATGCAGAGCAATGATCTTAAGAGGGCTCTTCATTGTCTTC 3095
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3102 GGCTGGAGTTTGACCTAGCAATGCAGAGCAATGATCTTAAGAGGGCACTTCATTGTCTTC 3161
Query 3096 TCACAATGAGTAATAGTAAGGACATTGGACAGGACGGTGTAGGCCTTGATTTGAGTGACA 3155
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3162 TCACAATGAGTAATAGCAAGGACATTGGACAGGACGGTGTAGGCCTTGATTTGAGTGACA 3221
Query 3156 TTCTCTCTTTGACAGCTACTAAAAAAGAAGATGTTGTTGAAGCTGTGGAGGGAATAGTGA 3215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3222 TTCTCTCTTTGACAGCTACTAAAAAAGAAGATGTTGTTGAAGCTGTGGAAGGAATAGTGA 3281
Query 3216 AATTTGCAAAGGAGTTTCTTGACCTTATAGATGCTGCTGATGCCACAGGGCACGCTGACA 3275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3282 AATTTGCAAAGGAGTTTCTTGACCTTATAGATGCTGCAGATGCCACAGGGCACGCCGACA 3341
Query 3276 TTGCTCGCGAAGCTCTCAAAAGACTGGCAACTGCAGGTTCAGTCAAAGGCGCCTTACAGG 3335
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 3342 TTGCTCGCGAAGCTCTCAAAAGACTGGCAACTGCAGGTTCGGTCAAAGGCGCTTTACAGG 3401
Query 3336 GTCATGAGTTGCGAGGCCTTTCATTACGCCTAGCAAACCATGGAGAATTGACACGCCTAA 3395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3402 GTCATGAGTTGCGAGGCCTTTCATTACGCCTAGCAAACCATGGAGAATTGACACGCCTAA 3461
Query 3396 GCGGACTTATAAACAATCTGATCTCCATAGGCCTCGGGCGAGAATCAGCATTTTCTGCTG 3455
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3462 GTGGACTTGTAAACAATCTGATCTCCATAGGCCTTGGACGAGAATCAGCATTTTCTGCTG 3521
Query 3456 CAGTTCTGGGAGACAATGCGCTCATGGAGAAGGCATGGCAAGACACGGGAATGCTTGCAG 3515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3522 CAGTTCTGGGAGACAATGCGCTCATGGAGAAGGCATGGCAAGACACGGGAATGCTCGCAG 3581
Query 3516 AAGCCGTGCTTCATGCCCATGCACATGGTCGTCCAACTCTAAAGAACTTGGTCCAGGCTT 3575
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3582 AAGCCGTGCTTCATGCCCATGCACATGGTCGCCCAACTCTAAAGAACTTGGTCCAGGCTT 3641
Query 3576 GGAATAAAACGCTGCAGAAGGAAGTTGAGCAAGCTCCATCTTCTAAAACTGATGCTGCAA 3635
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3642 GGAATAAAACGCTGCAGAAGGAAGTTGAGAAAGCTCCGTCTTCTAAAACCGATGCTGCAA 3701
Query 3636 GTGCGTTTCTGGCTTCTCTCGAGGATCCAAAGCTCACGAGTTTATCTGATGCATCCAGAA 3695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3702 GTGCGTTTCTGGCTTCTCTCGAGGATCCAAAGCTCACTAGTTTATCTGATGCATCTAGAA 3761
Query 3696 AACCTCCTATCGAGATTCTACCTCCTGGAATGTCTTCAATCTTTGCTTCCATTACTGCTC 3755
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3762 AACCTCCTATCGAGATTCTACCTCCTGGAATGTCTTCAATCTTTGCTTCCATTACGGCTC 3821
Query 3756 CCAAAAAACCTTTACTCACACAGAAGACTGCACAGCCAGAAGTAGCTAAGCCATTGGCGC 3815
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3822 CCAAAAAACCTCTACTCACGCAGAAGACTGCACAGCCAGAAGTAGCTAAGCCATTGGCGC 3881
Query 3816 TCGAAGAACCTGCAAAACCATTGGCTATTGAAGCTCCTCCATCTTCTGAGGCACCTCAGA 3875
||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 3882 TCGAAGAACCTACGAAACCATTGGCTATTGAAGCTCCTCCATCTTCCGAGGCACCACAGA 3941
Query 3876 CTGAATCAGCGCCTGAAACTGCAGCTACTGCTGAGTCACCAGCACCTGAAACCGTAGCCG 3935
| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3942 CCGAATCAGCGCCTGAAACCGCAGCCGCTGCTGAGTCACCAGCACCTGAAACCGCAGCCG 4001
Query 3936 TTGCTGAGTCACCAGCACCTGAAACCGTAGCCGTTGCTGAGTCACCAGCATCTGAAACTG 3995
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 4002 TTGCTGAGTCACCAGCACCTGGAACCGCAGCCGTTGCTGAGGCACCAGCATCTGAGACTG 4061
Query 3996 CAGCAGCACCTGTGGATGGACCCGTGACGGAGACAGTGTCTGAGCCTCCTCCCGTAGAG- 4054
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4062 CAGCAGCACCTGTGGATGGACCAGTGACGGAGACTGTGTCTGAGCCTCCTCCCGTAGAGA 4121
Query 4055 -G-AGGAAACTTCTTTGGAATACAAAAGTGATCCGTCTTCAACTCCAAACACAGAAACAG 4112
| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4122 AGGAGGAAACTTCTTTGGAAGAAAAAAGCGATCCGTCTTCAACTCCAAACACAGAAACAG 4181
Query 4113 CT--GTAGCCACAGAAGATACTAGCCAAACAACAACGACGCCTGAAACTGTTACAAGAGC 4170
|| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||
Sbjct 4182 CTACGT--CCACAGAAAATACTAGCCAAACAACAACAACGCCTGAAAGTGTTACAACAGC 4239
Query 4171 GCCACCAGAAACTGTTACAACAGCCCCTCCGCCTGAAACTGCTACGACAACAG---TGAA 4227
|||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 4240 GCCACCTGAACCTATTACAACAGCGCC---GCCTGAAACTGTTACGACAACAGCAGTGAA 4296
Query 4228 ACCAACAGAGAATGCAGCAACCGAGAGACGAGTAACCAATTATCCTCCAATAAGAAGCCA 4287
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4297 ACCAACAGAGAATGCAGCAACCGAGAGACGAGTAACCAATTACCCTCCAATAAGAAGCCA 4356
Query 4288 GCCAATTGATTTTGACTTCTTGAATGGCTAAAACCAAGTTTGCACAGAAGATCCCAAAAC 4347
|||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4357 GCCAATAGATTTTGATTTCTTGAATGGCTAAA-CCAAGTTTTCACAGAAGATCCCAAAAC 4415
Query 4348 GAAGA 4352
|||||
Sbjct 4416 GAAGA 4420
Score = 145 bits (78), Expect = 5e-33
Identities = 92/98 (94%), Gaps = 3/98 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACACTACCGGAGTTTTTGTTCGGCGATTGTAG-TGGTGGTGGTGGATCCGGCCATTTTC- 58
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||
Sbjct 3 ACACTACCGGAGTTTTTGTTCGGCGATTGTAGTTAGTGGTGGTGGATCCGGGCA-TTTCA 61
Query 59 TTTGATAACCGCGGTGGATCTAATCGATCTGGATCTGA 96
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 62 TTTGATAACCGCGGTGGATCTAATTGATCTGGATCTGA 99
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 225299741013
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5