BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg491117 Length=2637 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT4G35300.1 | Symbols: TMT2 | tonoplast monosaccharide transpor... 4095 0.0 > AT4G35300.1 | Symbols: TMT2 | tonoplast monosaccharide transporter2 | chr4:16796256-16799553 REVERSE LENGTH=2590 Length=2590 Score = 4095 bits (2217), Expect = 0.0 Identities = 2413/2506 (96%), Gaps = 20/2506 (1%) Strand=Plus/Plus Query 136 GTGGGTTTTGTCTCACTCACTCATCGTCGTTGATCAGTGACTCTG-TTTTGCGAAATTCT 194 |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 99 GTGGATTTTGTTTCACTCACTCATCGTCGTTGATCAGTGACTCTGTTTTTGCGAAATTCT 158 Query 195 CTTCAGATTTCTTGATAAAAGATATAAGACGGAATCATGAGTGGAGCTGTGCTTGTTGCT 254 |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 159 CTTCAGATTTCTTGATAAAAGATAGAAGACGGAATTATGAGTGGAGCTGTGCTTGTTGCT 218 Query 255 ATCGCTGCTGCTGTTGGCAACTTGTTACAAGGATGGGATAACGCAACTATTGCAGGAGCT 314 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 219 ATTGCTGCTGCTGTTGGCAACTTGTTACAAGGATGGGATAACGCAACTATTGCAGGAGCT 278 Query 315 GTGTTGTACATAAAAAAGGAGTTTAATTTGGAGAGTAATCCATCAGTGGAAGGTCTAATT 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 279 GTGTTGTACATAAAAAAGGAGTTTAATTTGGAGAGTAATCCATCAGTGGAAGGTCTAATT 338 Query 375 GTGGCGATGTCACTTATTGGTGCTACTCTGATTACAACATGCTCTGGAGGGGTAGCTGAT 434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 339 GTGGCGATGTCACTTATTGGTGCTACTCTGATTACAACATGCTCTGGAGGGGTAGCTGAT 398 Query 435 TGGCTTGGTCGCCGTCCGATGCTAATATTGTCCTCAATTCTCTACTTTGTTGGTTCTCTA 494 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 399 TGGCTTGGTCGCCGTCCCATGCTAATATTGTCCTCAATTCTCTACTTTGTTGGTTCTCTA 458 Query 495 GTAATGCTATGGTCTCCAAACGTTTATGTGTTGCTCTTAGGAAGGTTGTTAGATGGATTT 554 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 459 GTAATGCTATGGTCTCCGAATGTTTATGTGTTGCTCTTAGGAAGGTTGTTAGATGGATTT 518 Query 555 GGGGTTGGTCTTGTGGTCACACTTGTTCCTATTTATATATCCGAGACTGCACCTCCTGAG 614 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct 519 GGGGTTGGTCTTGTGGTCACACTTGTTCCTATTTATATATCTGAGACTGCACCACCTGAG 578 Query 615 ATTAGGGGACTGTTGAATACGCTTCCGCAGTTCACTGGCTCTGGAGGGATGTTCTTATCG 674 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 579 ATTAGGGGACTGTTGAATACGCTACCGCAGTTCACTGGCTCTGGAGGGATGTTCTTATCT 638 Query 675 TACTGTATGGTTTTCGGAATGTCGTTGATGCCATCTCCTAGCTGGAGATTGATGCTTGGT 734 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 639 TACTGTATGGTTTTCGGAATGTCGTTGATGCCATCACCTAGCTGGAGATTGATGCTTGGT 698 Query 735 GTCCTTTTCATCCCTTCCCTTGTCTTTTTCTTCCTCACGGTCTTCTTCTTGCCCGAGTCC 794 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 699 GTCCTTTTCATCCCTTCCCTTGTCTTTTTCTTCCTCACGGTCTTCTTCTTGCCCGAGTCC 758 Query 795 CCAAGGTGGCTCGTGAGCAAAGGTCGAATGCTTGAAGCAAAGCGGGTTCTTCAGAGACTA 854 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 759 CCAAGGTGGCTCGTGAGCAAAGGTCGAATGCTTGAAGCAAAGCGGGTTCTTCAGAGACTG 818 Query 855 CGTGGTCGCGAAGATGTTTCTGGTGAGATGGCTCTGTTGGTTGAGGGTCTTGGAATTGGA 914 ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 819 CGTGGTCGCGAAGATGTGTCTGGTGAGATGGCTTTGTTGGTTGAGGGTCTTGGAATTGGA 878 Query 915 GGTGAAACAACAATAGAGGAATATATAATTGGTCCTGCGGATGAAGTTACTGATGATCAT 974 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 879 GGTGAAACAACCATAGAGGAATATATAATTGGTCCCGCGGATGAAGTTACTGATGATCAT 938 Query 975 GATATAGCTGTGGATAAGGATCAAATTAAATTGTATGGTGCAGAAGAAGGGCTGAGTTGG 1034 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 939 GATATAGCTGTGGATAAGGATCAAATTAAGTTATATGGTGCAGAAGAAGGGCTGAGTTGG 998 Query 1035 GTTGCTAGGCCAGTCAAAGGAGGAAGCACTATGAGCGTTTTGTCTCGCCATGGAAGTACA 1094 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 999 GTTGCTAGGCCAGTCAAAGGAGGAAGCACTATGAGTGTTTTGTCTCGCCATGGAAGTACA 1058 Query 1095 ATGAGCAAGAGGCAAGGCTCATTGATTGATCCTCTTGTCACACTGTTTGGGAGCGTTCAC 1154 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1059 ATGAGCAGGAGGCAAGGCTCATTGATTGATCCTCTTGTCACACTGTTTGGGAGCGTTCAC 1118 Query 1155 GAGAAGATGCCAGACACTGGAAGCATGAGGAGTGCCTTGTTCCCACATTTTGGGAGTATG 1214 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1119 GAGAAGATGCCGGACACTGGAAGCATGAGGAGTGCCTTGTTCCCACATTTTGGGAGTATG 1178 Query 1215 TTCAGTGTGGGAGGGAATCAACCGAGAAATGAAGACTGGGATGAAGAGAATCTTGTTGGA 1274 |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1179 TTCAGTGTTGGAGGGAATCAACCAAGACATGAAGATTGGGATGAAGAGAATCTTGTTGGA 1238 Query 1275 GAAGGTGACGATTATCCATCCGACCATGGAGATGATTCTGATGATGATCTTCATTCTCCG 1334 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1239 GAAGGTGAGGATTATCCATCCGACCATGGAGATGATTCTGAAGATGATCTTCATTCTCCG 1298 Query 1335 TTGATCTCACGTCAAACGACAAGCATGGAGAAAGACATGCCTCACACTGCTCATGGAACT 1394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1299 TTGATCTCACGTCAAACGACAAGCATGGAGAAAGACATGCCTCACACTGCTCATGGAACT 1358 Query 1395 CTTTCTAACTTCAGACATGGAAGTCAAGTGCAGGGAGCTCAAGGGGAAGGAGCGGGTAGT 1454 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1359 CTTTCTACCTTCAGACATGGAAGTCAAGTGCAGGGAGCTCAAGGGGAAGGAGCGGGTAGT 1418 Query 1455 ATGGGGATTGGAGGTGGATGGCAAGTGGCATGGAAATGGACTGAAAGAGAAGATGAATCG 1514 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1419 ATGGGGATTGGAGGTGGATGGCAAGTGGCATGGAAATGGACGGAAAGAGAAGATGAATCG 1478 Query 1515 GGACAGAAAGAAGGTGGATTCAAGCGGATATACTTGCATCAAGAAGGTTTCCCGGGATCT 1574 ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1479 GGACAGAAAGAAGGTGGGTTTAAACGGATATACTTGCATCAAGAAGGTTTCCCAGGATCT 1538 Query 1575 CGACGTGGCTCAATTGTTTCATTGCCTGGAGGTGATGGAACCGGTGAGGCAGAGTTTGTA 1634 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1539 CGACGTGGCTCAATTGTTTCATTGCCTGGTGGTGATGGAACCGGTGAGGCAGATTTTGTA 1598 Query 1635 CAAGCGTCTGCTTTGGTTAGCCAACCAGCTCTTTATTCCAAAGACCTTCTCAAGGAACAT 1694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1599 CAAGCGTCTGCTTTGGTTAGCCAACCAGCTCTTTATTCCAAAGACCTTCTCAAAGAACAT 1658 Query 1695 TCAATTGGTCCTGCTATGATGCATCCATCCGAAACAGCTAAAGGGTCAATTTGGCATGAT 1754 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1659 ACAATTGGTCCTGCTATGGTACATCCATCCGAAACAACTAAAGGGTCAATTTGGCATGAT 1718 Query 1755 CTTCATGATCCTGGAGTCAAACGTGCATTAGTCGTAGGAGTCGGACTTCAAATACTTCAA 1814 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1719 CTTCATGATCCTGGAGTCAAGCGTGCATTAGTCGTAGGAGTTGGACTTCAAATACTTCAG 1778 Query 1815 CAGTTCTCAGGCATCAACGGAGTTCTTTACTACACACCGCAAATCCTTGAGCAGGCGGGT 1874 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1779 CAGTTCTCAGGCATCAACGGAGTTCTTTACTACACACCGCAAATCCTTGAGCAGGCGGGT 1838 Query 1875 GTCGGGATTCTACTATCGAACATGGGGATTAGTTCTTCCTCAGCATCCTTACTTATAAGT 1934 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1839 GTCGGGATCCTACTATCGAACATGGGGATTAGTTCTTCCTCAGCATCCTTACTTATAAGT 1898 Query 1935 GCATTGACAACCTTTGTGATGTTACCTGCAATCGCCGTTGCAATGAGGCTCATGGATCTC 1994 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1899 GCATTGACAACCTTTGTGATGTTACCTGCAATAGCTGTTGCAATGAGGCTCATGGATCTT 1958 Query 1995 TCAGGTCGAAGGACTTTGCTTCTCACCACGATACCAATCCTGATAGCATCTCTATTGGTC 2054 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1959 TCTGGTCGAAGGACCTTGCTTCTCACCACGATACCAATCCTGATAGCATCTCTATTGGTT 2018 Query 2055 TTAGTAATCTCGAATCTCGTTCACATGAACAGCATTGTGCACGCAGTCTTATCAACCGTA 2114 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2019 TTAGTAATCTCAAATCTTGTTCACATGAACAGCATTGTGCACGCGGTCTTATCAACCGTA 2078 Query 2115 AGTGTTGTGCTCTACTTCTGTTTCTTCGTGATGGGTTTCGGTCCTGCTCCAAACATCCTC 2174 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2079 AGCGTTGTGCTCTACTTCTGCTTCTTCGTGATGGGTTTCGGTCCTGCTCCAAACATCCTC 2138 Query 2175 TGTTCAGAGATCTTTCCAACTCGAGTCCGCGGAATCTGCATCGCCATCTGCGCACTCACC 2234 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2139 TGTTCAGAGATTTTTCCAACTCGAGTCCGCGGAATCTGCATCGCCATCTGCGCACTCACC 2198 Query 2235 TTCTGGATCTGTGACATTATCGTCACTTACAGTCTCCCTGTGCTGCTCAAATCCATTGGA 2294 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2199 TTCTGGATCTGTGACATAATCGTCACTTACAGTCTCCCCGTGCTGCTCAAATCCATTGGA 2258 Query 2295 CTTGCTGGTGTGTTTGGAATGTACACAATCGTCTGTTGCATCTCATGGGTCTTTGTGTTC 2354 || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2259 CTAGCTGGTGTGTTTGGAATGTACGCAATCGTATGTTGCATTTCATGGGTCTTTGTGTTC 2318 Query 2355 ATTAAAGTCCCCGAAACTAAAGGCATGCCACTTGAAGTCATCACAGAGTTCTTCTCCGTT 2414 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 2319 ATTAAAGTCCCGGAAACTAAAGGCATGCCACTTGAAGTCATCACAGAGTTCTTTTCTGTT 2378 Query 2415 GGAGCTAGACAAGCTGAAGCTGCCAAAAACGAGTGAGAAACTAAAAGACTTG---AGATC 2471 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct 2379 GGAGCTAGACAAGCTGAAGCTGCTAAAAACGAGTGAGAAACTGAAAGACTTGTTGAGATA 2438 Query 2472 AAAAGTTTGTGTAATGTTTCCATGTTCATGTGGATTTGTTGTTGTCTTTTTACTTTGTGC 2531 ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2439 AAAAGTTTGTGTAAT------AT-T-CATGTGGATTTGTTGTTGTCTTTTTACTTTGTGC 2490 Query 2532 AGTAATAATCAtctctctctctctctctGTTTCTTCTTCCTCATGTGGGGAGaaaaaaaa 2591 |||||||||||||||||||| | | || || ||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2491 AGTAATAATCATCTCTCTCTGT-T-TC-GT--CTTCTTC---ATGTGGGGAGAAAAAAAA 2542 Query 2592 GTTTCAAACTTTCAATTACGAATCTCTTTATTATCATTTACCATTT 2637 |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2543 GTTTCAAACTTTCAGTTACGAATCTCTTTATTACCATTTACCATTT 2588 Score = 141 bits (76), Expect = 3e-32 Identities = 97/106 (92%), Gaps = 6/106 (6%) Strand=Plus/Plus Query 1 GATTTAAACCAAAAGGGTAAACAAAAGAAATGCTTTTTGTTTGCTTAGTGACGCCATTGA 60 |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct 1 GATTTAAACCAAAAGGGTAAAC------AATGCTTTATGATTGCTTAGTGACGCCATTGA 54 Query 61 AGCAGCGGCTCACAGATAGTGGCTTCTTCTGCCTCCAATTCCAAGT 106 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 55 AGCAGCGGCTCACTGATAGTGGCTTCTTCTGCCTCCAATTCCAAGT 100 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 130935721230 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5