BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg491390
Length=3427
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G33010.1 | Symbols: AtGLDP1, GLDP1 | glycine decarboxylase P... 5422 0.0
AT2G26080.1 | Symbols: AtGLDP2, GLDP2 | glycine decarboxylase P... 3145 0.0
> AT4G33010.1 | Symbols: AtGLDP1, GLDP1 | glycine decarboxylase
P-protein 1 | chr4:15926670-15931332 REVERSE LENGTH=3478
Length=3478
Score = 5422 bits (2936), Expect = 0.0
Identities = 3257/3409 (96%), Gaps = 33/3409 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 48 CTAGCTTCTACCTCCTCCTCTCATTCATGGCTaaaaactaaaaaaG-C-T--ATC-ATCT 102
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||
Sbjct 72 CTAGCTTCTACCTCCTCCTTTCATTCATGGCGAAAAACTAAAAAAGACATCCATCTTTCT 131
Query 103 -------T-TCTC-TACTCTCTTCCTTTTCTGACTGCAACC-CATTTCCCAATGGAGCGC 152
| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 132 CAAAACATCTCTCTTACTCTCTTCGTTTTCTGACTGCAACCTTTTTTCCCAATGGAGCGC 191
Query 153 GCAAGGAGACTTGCTTACAGAGGAATCGTCAGACGTCTCGTTAACGACACAAAACGACAC 212
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192 GCAAGGAGACTTGCTTACAGAGGAATCGTCAAACGTCTCGTTAACGACACAAAACGACAC 251
Query 213 CGTAACGCTGAAACACCTCACCTTGTTCCTCACGCTCCGGCGAGGTATGTCTCCTCTCTT 272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 252 CGTAACGCTGAAACACCTCACCTTGTTCCTCACGCTCCGGCGAGGTATGTCTCTTCCCTT 311
Query 273 TCCCCTTTTC-TCTCGACCCATCGATCCGTCAATCC-CGCGGCGGCTTTCGAGAGGCACC 330
||||| |||| |||| |||| |||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||
Sbjct 312 TCCCC-TTTCATCTCCACCCCTCGATCTGTCAA-CCACACGGCGGCTTTCGGGAGGCACC 369
Query 331 AGCAAACGCGTTCGATCTCCGTCGATGCTCTTAAACCCGGCGATACTTTCCCGCGTCGTC 390
|||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 370 AGCAGACGCGTTCCATCTCCGTCGATGCTGTTAAACCCAGCGATACTTTCCCTCGTCGTC 429
Query 391 ATAACTCTGCAACACCAGAAGAACAATCCCACATGGCTAAATTCTGTGGCTTTGACCATA 450
| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 ACAACTCTGCAACACCAGACGAACAAACCCACATGGCTAAATTCTGTGGCTTTGACCATA 489
Query 451 TCGATTCACTCATCGATGCTACGGTGCCCAAATCGATTCGATTAGATTCGATGAAGTTCT 510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 490 TCGATTCACTCATCGATGCTACGGTGCCCAAATCGATTCGATTAGATTCCATGAAGTTCT 549
Query 511 CCAAATTCGACGGAGGCTTAACCGAGAGCCAGATGATTGACCACATGGTTGATTTAGCTT 570
|||||||||||| || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 550 CCAAATTCGACGCTGGTTTAACCGAGAGCCAAATGATTCAACACATGGTTGATTTAGCTT 609
Query 571 CCAAGAACAAGGTTTTCAAATCCTTTATCGGGATGGGTTACTACAACACGCATGTCCCTA 630
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 610 CCAAGAACAAGGTTTTCAAATCCTTCATCGGGATGGGTTACTACAACACTCATGTCCCTA 669
Query 631 CTGTCATTCTCCGTAATATCATGGAGAATCCAGCTTGGTACACTCAATACACTCCTTATC 690
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 670 CTGTCATTCTCCGTAACATCATGGAGAATCCAGCTTGGTACACTCAATACACTCCTTATC 729
Query 691 AAGCTGAGATCTCTCAGGGTCGTCTCGAATCGCTGCTCAATTTCCAGACGGTGATCACCG 750
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 730 AAGCTGAGATCTCTCAAGGTCGTCTCGAATCGCTCCTCAATTTCCAGACCGTGATCACAG 789
Query 751 ATCTCACGGGGCTTCCTATGTCGAATGCGTCGCTTCTGGATGAAGGGACCGCTGCTGCGG 810
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 790 ATCTCACGGGTCTTCCTATGTCCAATGCGTCGCTTCTGGATGAAGGCACTGCTGCTGCGG 849
Query 811 AGGCAATGGCCATGTGTAACAACATTCTTAAGGGTAAAAAGAAGACCTTTGTGATTGCTA 870
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 850 AGGCAATGGCCATGTGTAACAACATTCTTAAGGGTAAAAAGAAGACCTTTGTCATTGCTA 909
Query 871 GTAACTGTCACCCTCAGACTATTGATGTTTGTAAGACTAGAGCTGATGGGTTTGATTTGA 930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 910 GTAACTGTCACCCTCAGACTATTGATGTTTGTAAGACTAGAGCTGATGGGTTTGATTTGA 969
Query 931 AAGTTGTTACCGCTGATCTTAAGGATATAGATTACAGCTCTGGTGATGTTTGTGGGGTTC 990
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 970 AAGTTGTCACCTCTGATCTTAAGGATATAGATTACAGCTCTGGTGATGTTTGTGGGGTTC 1029
Query 991 TTGTTCAGTATCCTGGTACTGAAGGTGAAGTCTTGGATTATGCTGAGTTTGTCAAGAATG 1050
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1030 TTGTTCAGTATCCTGGTACTGAAGGTGAAGTCTTGGATTATGCTGAGTTTGTTAAGAATG 1089
Query 1051 CTCATGCTAATGGTGTTAAGGTTGTTATGGCTACGGATTTGCTGGCTTTGACCATGTTGA 1110
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1090 CTCATGCTAATGGTGTTAAGGTTGTGATGGCTACGGATTTGCTGGCTTTGACTGTGTTGA 1149
Query 1111 AACCCCCTGGGGAATTTGGGGCGGATATTGTTGTTGGTTCAGCTCAAAGGTTTGGTGTTC 1170
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 1150 AACCTCCTGGAGAATTTGGGGCGGATATTGTTGTTGGCTCTGCTCAAAGGTTTGGTGTTC 1209
Query 1171 CCATGGGTTATGGAGGCCCTCATGCTGCGTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAAGAGAA 1230
| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 CGATGGGTTATGGTGGTCCTCATGCTGCGTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAAGAGAA 1269
Query 1231 TGATGCCTGGGAGGATTATTGGTATTAGTGTTGATTCTTCAGGAAAGCAAGCTCTGCGTA 1290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270 TGATGCCTGGGAGGATTATTGGTATTAGTGTTGATTCTTCAGGAAAGCAAGCTCTGCGTA 1329
Query 1291 TGGCTATGCAGACTAGGGAGCAGCATATTAGGAGGGACAAAGCCACTAGCAACATCTGTA 1350
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 TGGCTATGCAGACTAGAGAACAGCATATTAGGAGGGACAAAGCCACTAGCAACATCTGTA 1389
Query 1351 CTGCTCAAGCGTTGCTTGCCAACATGGCTGCCATGTATGCTGTTTACCATGGACCTGCAG 1410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1390 CTGCTCAAGCGTTGCTTGCCAACATGGCTGCCATGTATGCTGTTTACCATGGACCTGCAG 1449
Query 1411 GTCTAAAATCTATTGCCCAGCGTGTTCATGGTCTTGCTGGCATATTTTCCTTAGGGTTAA 1470
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 1450 GTCTAAAATCTATTGCCCAGCGTGTCCATGGTCTCGCTGGTATATTTTCCTTAGGGTTGA 1509
Query 1471 AGAAGCTTGGGGTCGCAGAAGTCCAAGAACTTCCCTTCTTTGACACTGTAAAAATTAAGT 1530
| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1510 ACAAGCTTGGGGTTGCAGAAGTTCAAGAACTTCCTTTCTTTGACACTGTTAAAATTAAGT 1569
Query 1531 GTTCGGATGCACATGCAATTGCTGATGCAGCTTCCAAAAGTGAAATTAATCTGCGTGTTG 1590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1570 GTTCGGATGCACATGCAATTGCTGATGCAGCTTCCAAAAGTGAAATTAATCTGCGTGTTG 1629
Query 1591 TGGACTCAACCACTATTACTGCTTCCTTTGACGAAACAACCACCTTGGATGATGTCGACA 1650
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1630 TGGACTCAACCACTATTACTGCTTCCTTTGACGAAACAACCACCTTGGATGATGTCGATA 1689
Query 1651 AACTTTTCAAAGTTTTTGCTTCTGGCAAGCCTGTTCCATTTACGGCTGAATCTCTAGCAC 1710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690 AACTTTTCAAAGTTTTTGCTTCTGGCAAGCCTGTTCCATTTACGGCTGAATCTCTAGCAC 1749
Query 1711 CCGAGGTTCAGAATTCCATTCCTTCTAGCCTAACAAGAGAGAGTCCTTATCTTACCCACC 1770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1750 CCGAGGTTCAGAATTCCATTCCTTCTAGCCTAACAAGAGAGAGTCCTTATCTTACCCACC 1809
Query 1771 CAATCTTCAACATGTACCACACAGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAAGTTACAGT 1830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1810 CAATCTTCAACATGTACCACACAGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAAGTTACAGT 1869
Query 1831 CTAAGGATCTATCACTGTGCCACAGCATGATTCCATTGGGATCTTGTACGATGAAACTAA 1890
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870 CAAAGGATCTATCACTGTGCCACAGCATGATTCCGTTGGGATCTTGTACGATGAAACTAA 1929
Query 1891 ATGCGACAACTGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCGACATTCACCCATTTG 1950
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 1930 ATGCAACAACTGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACTGACATTCACCCTTTTG 1989
Query 1951 CTCCTGTTGAACAAGCACAAGGTTATCAGGAAATGTTCGAAAATTTGGGTGACCTCTTGT 2010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990 CTCCTGTTGAACAAGCACAAGGTTATCAGGAAATGTTCGAAAATTTGGGTGACCTCTTGT 2049
Query 2011 GTACAATCACTGGGTTTGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCTGGTGCTGCTGGTGAGT 2070
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2050 GTACGATCACTGGGTTTGACTCTTTCTCGTTGCAACCTAATGCTGGTGCTGCTGGTGAGT 2109
Query 2071 ATGCTGGGCTTATGGTTATCCGCGCATATCACATGTCAAGAGGAGATCATCACCGAAATG 2130
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2110 ATGCCGGGCTTATGGTTATCCGCGCATATCACATGTCAAGAGGAGATCATCACCGTAATG 2169
Query 2131 TGTGTATCATACCTGTCTCTGCACATGGGACAAACCCTGCAAGTGCTGCTATGTGCGGTA 2190
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2170 TGTGTATCATACCTGTCTCTGCACACGGTACAAACCCTGCAAGTGCTGCTATGTGCGGGA 2229
Query 2191 TGAAAATTATTACGGTTGGAACTGATGCTAAGGGAAACATCAACATCGAGGAGGTGAGAA 2250
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 2230 TGAAAATTATTACAGTTGGAACTGATGCTAAGGGAAACATTAACATTGAGGAGGTGAGAA 2289
Query 2251 AAGCTGCAGAAGCCAACAAAGACAACTTAGCCGCTCTTATGGTTACATACCCTTCAACTC 2310
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2290 AAGCTGCAGAAGCCAACAAAGACAACTTAGCTGCTCTTATGGTTACATACCCTTCAACTC 2349
Query 2311 ATGGAGTCTATGAAGAGGGTATCGACGAGATTTGCAACATAATACATGAAAATGGAGGTC 2370
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2350 ATGGAGTCTATGAAGAGGGCATCGACGAGATTTGCAACATAATACACGAAAATGGAGGTC 2409
Query 2371 AAGTGTACATGGATGGTGCGAACATGAATGCACAGGTTGGCTTGACGAGCCCTGGTTTTA 2430
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2410 AAGTGTACATGGATGGTGCCAACATGAATGCACAGGTTGGTTTGACGAGCCCTGGTTTTA 2469
Query 2431 TTGGAGCGGATGTGTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATTCCTCATGGAGGTG 2490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2470 TTGGAGCGGATGTGTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATTCCTCATGGAGGTG 2529
Query 2491 GTGGTCCTGGTATGGGTCCCATTGGTGTGAAGAATCATTTGGCACCATTTCTTCCTTCTC 2550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2530 GTGGTCCTGGTATGGGTCCCATTGGTGTGAAGAATCATTTGGCACCATTTCTTCCTTCTC 2589
Query 2551 ACCCCGTGATACCTACTGGTGGAATCCCGCAACCCGAGAAGACAGCACCGTTAGGTGCAA 2610
||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 2590 ACCCCGTGATACCGACTGGTGGTATCCCACAACCCGAGAAGACAGCACCTTTGGGTGCAA 2649
Query 2611 TATCCGCTGCACCATGGGGATCTGCGCTTATCTTACCAATATCTTATACTTACATTGCCA 2670
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2650 TATCCGCTGCACCATGGGGATCTGCGCTTATCTTGCCTATATCTTATACTTACATTGCCA 2709
Query 2671 TGATGGGATCTGGTGGACTCACTGATGCCTCTAAGATTGCAATTTTGAATGCCAATTACA 2730
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2710 TGATGGGATCTGGTGGGCTCACTGATGCCTCTAAGATTGCAATTTTGAATGCCAATTACA 2769
Query 2731 TGGCAAAGCGCCTAGAGAAACACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTTAATGGAACAGTAG 2790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2770 TGGCAAAGCGCCTAGAGAAACACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTTAACGGAACAGTAG 2829
Query 2791 CACACGAATTCATCATAGACTTAAGAGGCTTCAAGAGCACTGCTGGAATAGAACCAGAGG 2850
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2830 CACACGAATTCATCATAGACTTGAGAGGCTTCAAGAACACTGCTGGAATAGAACCAGAGG 2889
Query 2851 ATGTGGCGAAACGGCTAATGGACTATGGATTCCATGGACCCACAATGTCTTGGCCTGTCC 2910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2890 ATGTGGCGAAACGGCTAATGGACTATGGATTCCATGGACCCACAATGTCTTGGCCTGTCC 2949
Query 2911 CTGGAACTCTTATGATTGAGCCAACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGCTAGACAGGTTCT 2970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2950 CTGGAACTCTTATGATTGAGCCAACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGCTAGACAGGTTCT 3009
Query 2971 GCGATGCTCTCATTTCAATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAATGCAGATG 3030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3010 GCGATGCTCTCATTTCAATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAATGCAGATG 3069
Query 3031 TCCAGAACAACGTCCTTAAGGGAGCTCCACATCCTCCATCGTTGCTAATGGCAGACACAT 3090
||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3070 TCCAGAACAACGTTCTCAAGGGAGCTCCACATCCCCCATCGTTGCTAATGGCAGACACAT 3129
Query 3091 GGAAAAAGCCGTATTCTCGAGAGTACGCTGCTTTCCCTGCCCCGTGGCTCCG-TAACTCA 3149
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||
Sbjct 3130 GGAAAAAGCCGTATTCTCGAGAGTATGCTGCTTTCCCTGCGCCTTGGCTCCGCTC-CTCC 3188
Query 3150 AAGTTCTGGCCCACCACAGGGCGTGTGGACAATGTATATGGAGACAGGAAACTGGTGTGC 3209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3189 AAGTTCTGGCCCACCACAGGGCGTGTGGACAATGTATATGGAGACAGGAAACTGGTGTGC 3248
Query 3210 ACTCTCCTCCCAGAGGAAGAACAAGTTGCAGCTGCAGTATCTGCTTGATTACTGCTCTGT 3269
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3249 ACTCTCCTCCCAGAGGAAGAACAAGTCGCAGCTGCAGTGTCTGCTTGATTACTGCTCTGT 3308
Query 3270 CTCAATGTGTTGTGGCCCCTTCTCTCACCATGCTCTCTTCTCTTTCACATTCTGTCCATA 3329
| || ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3309 CCCATTGTGTTGTGTCCCTTTCTCTCACCACGCACTCTTCTCTTTCACATTCTGTCCATA 3368
Query 3330 GTGTTCTCATTATACGCTTTCTGTCTCTTACTCTGTTATTT--T-C-AAT-CAA-TTAC- 3382
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| || || |
Sbjct 3369 GTGTTCTCATTATACGCTTTCTGTCTCTTACTCTATTATTTCATTCGAATACATCTT-CT 3427
Query 3383 ATG--TTCCACA--CCACAATTGACCGAAAACAAAACACAAACTTTGGT 3427
|| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3428 ATAAATTATATATTCCACAATTGACCGAAAACAAAACACAAACTTTGGT 3476
> AT2G26080.1 | Symbols: AtGLDP2, GLDP2 | glycine decarboxylase
P-protein 2 | chr2:11109003-11113828 REVERSE LENGTH=3504
Length=3504
Score = 3145 bits (1703), Expect = 0.0
Identities = 2695/3168 (85%), Gaps = 91/3168 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 144 ATGGAGCGCGCAAGGAGACTTGCTTACAGAGGAATCGTCAGACGTCTCGTTAACGACACA 203
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||
Sbjct 43 ATGGAGCGTGCAAGGAGACTTGCTTACAGAGGGATCGTGAAACGTCTCGTCAACGAGACA 102
Query 204 AAACGACACCGTAAC-GCTGAAACACCTCACCTTGTT-C--C-TC-AC-G---CTCCGGC 253
||||| ||||||||| || | || |||| ||| || | | | || | |||| |
Sbjct 103 AAACGCCACCGTAACGGC-G-AA-TCCTC-TCTTCTTCCGACGACGACTGTTACTCCCTC 158
Query 254 GAGGTATGTCTCCTCTC-TTTCC-CCTTTTCT-C-TCGACCCATC--GA--TC-CGTCAA 304
|||||||||||||| | | ||| || ||||| | ||| || || || || | | |
Sbjct 159 AAGGTATGTCTCCTC-CGTCTCCTCC-TTTCTCCATCG--CCGTCGTGATGTCTC-TGGA 213
Query 305 TCCCGC---GGCGGCTTTC-G-AG-AGGCACCAGCAAACGCGTTCGATCTCCGTCGATGC 358
| | || | | | | | || | || || || || || |||||||||||||||||
Sbjct 214 T-CGGCTTTTACCACCTCCGGTAGAAATCAACACCAGACACGATCGATCTCCGTCGATGC 272
Query 359 TCTT-AAACCCGGCGATACTTTCCCGCGTCGTCATAACTCTGCAACACCAGAAGAACAAT 417
|| || || |||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||
Sbjct 273 -GTTGAAGCCAAGCGACACTTTCCCGCGCCGGCACAACTCAGCAACACCGGATGAACAAG 331
Query 418 CCCACATGGCTAAATT-CTGTGGCTTTGACCATATCGATTCAC--TCATCGATGCTACGG 474
| || ||||| |||| ||| || || || || || | ||| | || ||| | || |
Sbjct 332 CTCAGATGGC-GAATTACTGCGGATTCGATAATCTC-A-ACACGTTGATTGATTCGACTG 388
Query 475 TGCCCAAATCGATTCGATTAGATTCGATGAAGTTCTCC---AAATTCGACGGAGGCTTAA 531
| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| || | ||| ||||
Sbjct 389 TTCCGAAATCGATTCGGTTAGATTCGATGAAGTTTTCCGGGATATTTGATGAAGGATTAA 448
Query 532 CCGAGAGCCAGATGATTGACCACATG-GTTGATTTAGCTTCCAAGAACAAGGTTTTCAAA 590
| ||||| || |||||||| || ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 449 CGGAGAGTCAAATGATTGAGCATATGAG-TGATTTAGCTTCGAAGAACAAAGTTTTCAAA 507
Query 591 TCCTTTATCGGGATGGGTTACTACAACACGCATGTCCCTACTGTCATTCTCCGTAATATC 650
|| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||| | ||||||||
Sbjct 508 TCGTTCATTGGTATGGGATACTATAACACTCATGTTCCTCCTGTGATTTTGCGTAATATA 567
Query 651 ATGGAGAATCCAGCTTGGTACACTCAATACACTCCTTATCAAGCTGAGATCTCTCAGGGT 710
||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 568 ATGGAGAATCCTGCTTGGTATACTCAATATACTCCTTATCAAGCTGAGATTTCTCAAGGA 627
Query 711 CGTCTCGAATCGCTGCTCAATTTCCAGACGGTGATCACCGATCTCACGGGGCTTCCTATG 770
| |||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||| || || || |||
Sbjct 628 AGACTCGAATCTCTGCTCAATTACCAGACGGTTATTACTGATCTCACCGGTCTACCGATG 687
Query 771 TCGAATGCGTCGCTT-CTGGATGAAGGGACCGCTGCTGCGGAGGCAATGGCCATGTGTAA 829
||||| || ||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 688 TCGAACGCTTCG-TTGCTCGATGAAGGTACGGCGGCGGCGGAAGCAATGGCGATGTGTAA 746
Query 830 CAACATTCTTAAGGGTAAAAAGAAGACCTTTGTGATTGCTAGTAACTGTCACCCTCAGAC 889
|| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 747 TAATATTCTAAAGGGGAAGAAGAAGACGTTTGTTATTGCTAGTAATTGTCATCCTCAGAC 806
Query 890 TATTGATGTTTGTAAGACTAGAGCTGATGGGTTT-GATTTGAAAGTTGTTACCGCTGATC 948
|||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||| || | ||||
Sbjct 807 TATTGATGTTTGCAAGACGAGAGCGGAT-GGTTTCGATTTGAAAGTTGTGACGGTTGATA 865
Query 949 TTAAGGATATAGATTACAGCTCTGGTGATGTTTGTGGGGTTCTT-GTTCAGTATCCTGGT 1007
|||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| | | || ||||||||||| ||
Sbjct 866 TTAAGGATGTGGATTATAGCTCTGGTGATGTGTGTGGAG-TGTTGGTTCAGTATCCGGGG 924
Query 1008 ACTGAAGGTGAAGTCTTGGATTATGCTGAGTTTGTCAAGAATGCTCATGCTAATGGTGTT 1067
|||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 925 ACTGAAGGGGAGGTGTTGGATTATGGTGAGTTTGTTAAGAATGCTCATGCTAATGGTGTT 984
Query 1068 AAGGTTGTTATGGCTACGGATTTGCTGGCTTTGACCATGTTGAAACCCCCTGGG-GAATT 1126
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || ||
Sbjct 985 AAGGTTGTTATGGCTACGGATTTGTTGGCTTTGACGATGTTGAAACCGCC-GGGTGAGTT 1043
Query 1127 TGGGGCGGATATTGTTGTTGGTTCAGCTCAAAGGTTTGGTGTTCCCATGGGTTATGGAGG 1186
||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1044 TGGGGCGGATATTGTTGTTGGGTCGGGTCAGAGGTTTGGTGTTCCGATGGGTTATGGTGG 1103
Query 1187 CCCTCATGCTGCGTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAAGAGAATGATGCCTGGGAGGAT 1246
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 TCCTCATGCTGCTTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAAGAGAATGATGCCTGGGAGGAT 1163
Query 1247 TATTGGTATTAGTGTTGATTCTTCAGGAAAGCAAGCTCTGCGTATGGCTATGCAGACTAG 1306
||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164 TATTGGTGTTAGTGTTGATTCTTCCGGGAAGCAAGCTTTGCGTATGGCTATGCAGACTAG 1223
Query 1307 GGAGCAGCATATTAGGAGGGACAAAGCCACTAGCAACATCTGTACTGCTCAAGCGTTGCT 1366
||| |||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||
Sbjct 1224 GGAACAGCATATCCGCAGGGATAAAGCTACCAGCAACATCTGTACCGCTCAGGCCTTGCT 1283
Query 1367 TGCCAACATGGCTGCCATGTATGCTGTTTACCATGGACCTGCAGGTCT-AAAATCTATTG 1425
||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||
Sbjct 1284 TGCAAATATGACTGCTATGTATGCTGTTTACCATGGACCAGAAGG-CTTAAAATCTATTG 1342
Query 1426 CCCAGCGTGTTCATGGTCTTGCTGGCATATTTTCCTTAGGGTTAAAGAAGCTTGGGGTC- 1484
| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| || ||||| || ||| |
Sbjct 1343 CACAACGGGTTCATGGTCTCGCTGGTGTATTTGCCTTAGGATTGAAGAAACT-GGGAACT 1401
Query 1485 GCAGAAGTCCAAGAACTTCCCTTCTTTGACACTGTAAAAATTA-AGTGTTCGGATGCA-C 1542
||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||| |
Sbjct 1402 GCACAAGTCCAAGATCTTCCCTTCTTTGACACTGTCAAAGTTACA-TGTTCAGATGCAAC 1460
Query 1543 ATGCAATTGCTGATGCAGCTTCCAA-AAGTGAAATTAATCTGCGTGTTGTGGACTC-AAC 1600
||||||| ||||| || |||| ||| || || ||| ||||| |||||||||| |||
Sbjct 1461 -TGCAATTTTTGATGTGGCAGCCAAGAAG-GAGATCAATTTGCGTCTTGTGGACTCCAAC 1518
Query 1601 CACTATTACTGCTTCCTTT-GACGAAACAACCACCTTGGATGATGTCGACAAACTTTTCA 1659
|||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1519 -ACTATTACTG-TTGCTTTCGATGAAACAACCACCTTGGATGATGTCGATAAACTTTTTG 1576
Query 1660 AAGTTTTTGCTTCTGGCAAGCCTGTTCCATTTACGGCTGAATCTCTAGCACCCGAGGTTC 1719
||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||
Sbjct 1577 AAGTTTTTGCTTCGGGCAAGCCCGTTCAATTCACGGCTGAGTCTCTTGCACCGGAGTTTA 1636
Query 1720 AGAATTCCATTCCTTCTAGCCTAACAAGAGAGAGTCCTTATCTTACCCACCCAATCTTCA 1779
| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1637 ACAATGCTATTCCCTCTAGCCTAACAAGAGAGAGCCCTTATCTGACCCATCCAATCTTCA 1696
Query 1780 ACATGTACCACACAGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAAGTTACAGTCTAAGGATC 1839
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 1697 ACATGTACCACACGGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAAGTTACAAAATAAAGATC 1756
Query 1840 TATCACTGTGCCACAGCATGATTCCA-TTGGGATCTTGTACGATGAAACTAAATGCGACA 1898
||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| ||
Sbjct 1757 TATCATTGTGCCACAGCATGATTCCACTTGG-ATCTTGTACGATGAAATTGAATGCCACC 1815
Query 1899 ACTGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCGACATTCACCCATTTGCTCCTGTT 1958
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1816 ACTGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCAACATGCACCCTTTTGCTCCTGTT 1875
Query 1959 GAACAAGCACAAGGTTATCAGGAAATGTT--CGAAAATTTGGGTGACCTCTTGTGTACAA 2016
|||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |
Sbjct 1876 GAACAAGCCCAAGGTTATCAGGAAATGTTTACGAA--TTTGGGTGAGCTCTTATGTACGA 1933
Query 2017 TCACTGGGTTTGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCTGGTGCTGCTGGTGAGTATGCTG 2076
||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |
Sbjct 1934 TCACTGGATTCGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCCGGTGCTGCTGGCGAGTACGCCG 1993
Query 2077 GGCTTATGGTTATCCGCGCATATCACATGTCAAGAGGAGATCATCACCGAAATGTGTGTA 2136
|||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
Sbjct 1994 GGCTCATGGTTATCCGTGCATATCATATGTCAAGAGGCGATCATCACAGAAATGTGTGCA 2053
Query 2137 TCATACCTGTCTCTGCACATGGGACAAACCCTGCAAGTGCTGCTATGTGCGGTATGAAAA 2196
|||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2054 TCATACCTGTTTCTGCACACGGGACAAACCCTGCTAGTGCTGCCATGTGCGGAATGAAAA 2113
Query 2197 TTATTACGGTTGGAACTGATGCTAAGGGAAACATCAACATCGAGGAGGTGAGAAAAGCTG 2256
|| || | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||| || || |
Sbjct 2114 TTGTTGCCGTTGGAACTGATGCCAAAGGAAACATTAACATCGAAGAGTTGAGGAACGCCG 2173
Query 2257 CAGAAGCCAACAAAGACAACTTAGCCGCTCTTATGGTTACATACCCTTCAACTCATGGAG 2316
| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 2174 CCGAAGCCAACAAGGACAACTTGGCTGCTCTTATGGTTACATACCCTTCCACCCATGGAG 2233
Query 2317 TCTATGAAGAGGGTATCGACGAGATTTGCAACATAATACATGAAAATGGAGGTCAAGTGT 2376
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2234 TCTACGAAGAGGGTATCGACGAGATCTGCAACATAATTCATGAAAATGGAGGCCAAGTTT 2293
Query 2377 ACATGGATGGTGCGAACATGAATGCACAGGTTGGCTTGACGAGCCCTGGTTTTATTGGAG 2436
| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2294 ATATGGATGGTGCTAATATGAATGCACAGGTGGGTTTGACAAGCCCTGGTTTTATTGGAG 2353
Query 2437 CGGATGTGTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATTCCTCATGGAGGTGGTGGTC 2496
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||
Sbjct 2354 CGGATGTTTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATCCCTCACGGAGGTGGAGGTC 2413
Query 2497 CTGGTATGGGTCCC-ATTGGTGTGAAG-AATCATTTGGCACCATTTCTTCCTTCTCACCC 2554
| || ||||| ||| || ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||
Sbjct 2414 CCGGAATGGG-CCCTATCGGTGTGAAGCAA-CATTTGGCTCCATTCCTACCTTCTCACCC 2471
Query 2555 CGTGATACCTACTGGTGGAATCCC-GCAACCCGAGAAGACAGCACCGTTAGGTGCAATAT 2613
||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||| | || | || |
Sbjct 2472 AGTGATACCTACCGGTGGTATCCCTG-AACCCGAGCAGACATCACCGCTGGGAACCATTT 2530
Query 2614 CCGCTGCACCATGGGGATCTGCGCTTATCTTACCAATATCTTATACTTACATTGCCATGA 2673
| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 2531 CTGCAGCACCATGGGGGTCTGCGCTTATCTTGCCAATCTCGTATACTTACATTGCCATGA 2590
Query 2674 TGGGATCTGGTGGACTCACTGATGCCTCTAAGATTGCAATTTTGAATGCCAATTACATGG 2733
|||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||
Sbjct 2591 TGGGATCTGGAGGACTCACCGATGCCTCAAAGATTGCAATTTTGAACGCTAACTACATGG 2650
Query 2734 CAAAGCGCCTAGAGAAACACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTTAATGGAACAGTAGCAC 2793
||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
Sbjct 2651 CAAAGCGTCTGGAGAGCCACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTCAATGGAACAGTCGCTC 2710
Query 2794 ACGAATTCATCATAGACTTAAGAGGCTTCAAGAGCACTGCTGGAATAGAACCAGAGGATG 2853
||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2711 ACGAATTCATCATTGACTTGAGAGGATTCAAGAACACTGCTGGAATTGAACCAGAGGATG 2770
Query 2854 TGGCGAAACGGCTAATGGACTATGGATTCCATGGACCCACAATGTCTTGGCCTGTCCCTG 2913
|||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2771 TGGCCAAACGATTGATGGATTATGGTTTCCATGGACCGACAATGTCTTGGCCTGTCCCTG 2830
Query 2914 GAACTCTTATGATTGAGCCAACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGCTAGACAGGTTCTGCG 2973
|||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||| |
Sbjct 2831 GAACGCTTATGATCGAGCCAACCGAAAGCGAAAGCAAGGCTGAGTTAGATAGGTTCTGTG 2890
Query 2974 ATGCTCTCATTTCAATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAATGCAGATGTCC 3033
|||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| ||
Sbjct 2891 ATGCTCTCATCTCGATCAGGGAAGAGATTTCACAGATTGAGAAAGGAAACGCAGAT--CC 2948
Query 3034 AGA-A-CAACGTCCTTAAGGGAGCTCCACATCCTCCATCGTTGCTAATGGCAGACACATG 3091
| | | |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||
Sbjct 2949 AAACAACAACGTTCTGAAGGGTGCTCCACATCCTCCGTCATTGCTAATGGCAGATACATG 3008
Query 3092 GAAAAAGCCGTATTCTCGAGAGTACGCTGCTTTCCCTGCCCCGTGGCTCCG-TAACTCAA 3150
||||||||||||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| | ||| |
Sbjct 3009 GAAAAAGCCGTATTCACGGGAATACGCAGCCTTCCCCGCTCCATGGCTCCGCTC-CTCCA 3067
Query 3151 AGTTCTGGCCCACCACAGGGCGTGTGGACAATGTATATGGAGACAGGAAACTGGTGTGCA 3210
||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| | || ||||||||||
Sbjct 3068 AGTTCTGGCCCACTACAGGGCGAGTGGACAACGTGTATGGAGACCGTAATCTGGTGTGCA 3127
Query 3211 CTCTCCTCCCAGAG---GAAGAACAAGTTGCAGCTGCAGTATCTGCTT 3255
|||||| || | | |||||||| | |||||||||||| |||||||
Sbjct 3128 CTCTCCAACCGGCGAACGAAGAACAGGCTGCAGCTGCAGTGTCTGCTT 3175
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 170567606200
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5