BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg491448 Length=3458 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT4G32640.1 | Symbols: | Sec23/Sec24 protein transport family ... 5515 0.0 AT3G44340.1 | Symbols: CEF | clone eighty-four | chr3:16011621-... 1711 0.0 > AT4G32640.1 | Symbols: | Sec23/Sec24 protein transport family protein | chr4:15742032-15750862 FORWARD LENGTH=3942 Length=3942 Score = 5515 bits (2986), Expect = 0.0 Identities = 3246/3371 (96%), Gaps = 19/3371 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 TGTGAATTTTCTGTC-T-TC-TACGGACAACAAATTTTTAGTTTTGATTGGTCGTCTGAA 57 ||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| Sbjct 1 TGTGAATTTTCTGTCTTCTCTTACGGACAACAAAATTTTAGTTTTTATCAGTCGTCTGAA 60 Query 58 TCCTGTGACACACACCGACGCCGTTAACCGTCGTCGCTGT-GTATCTCTCTCTCTTTCTC 116 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||| Sbjct 61 TCCTGTGACAGACACCGACGCCGTTAACCGTCGTCGCTGTCG-CTGTGTCTCTCTTTCTC 119 Query 117 ACTCTGTTCCATAGATCTGAGCTTCTACCAATATTTC-CCGATCGCTATCAGTCAAATCT 175 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| Sbjct 120 ACTCTGTTCCATAGATCTGAGCTTCTATCAATA-TTCTCGGATCGCTATCAGTCAAATCT 178 Query 176 TAAGAAGAATTTCCACGCTTTAGCTCAATT----C---AGATTGTTGAGCAAGGTTTT-G 227 | ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||| | Sbjct 179 T---AAGAATTTCGTCGCTTTAGCTCAATTCGGACTTTAGATTGTGGAGGAA-GTTTTAG 234 Query 228 GGTTTGATCTCCATCTCGTATCCAAGCATGGTTGCTCCTGTGCCTCCAGGGCCACCTAGA 287 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 235 GATTTGATCTCCATCTCGTATCCAAGCATGGTTGCTCCTGTGCCTCCAGGGGCACCTAGA 294 Query 288 CCCAACAGTCAGCAAAATTCCGGGCCACCAAATTTCTACCCGGGTTCACAAGGGAACTCA 347 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 295 CCCAACAGCCAGCAAAATTCCGGGCCACCTAATTTCTACCCGGGTTCACAAGGGAACTCA 354 Query 348 AATTCTTTAGCCGACAATATCCAGAATTTGAGCTTGAATCGACCACCTCCGATGATGCCT 407 ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 355 AATGCTTTAGCCGACAATATGCAGAACTTGAGCTTGAATCGACCACCTCCGATGATGCCT 414 Query 408 GGCTCAGGTCCTAGACCACCTCCTCCTTTTGGTCAGTCTCCACAGCCTTTCCCTCAGCAA 467 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 415 GGCTCAGGTCCTAGACCACCTCCTCCTTTTGGTCAGTCACCACAGCCTTTCCCTCAGCAA 474 Query 468 TCCCCTTCTTATGGAGCTCCTCAACGTGGGCCTTCACCCATGTCCCGGCCTGTACCTCCT 527 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 475 TCCCCTTCTTATGGAGCTCCGCAACGTGGGCCTTCACCCATGTCCCGGCCTGGACCTCCA 534 Query 528 GCTGGGATGGCGAGGCCAGGTGGTCCCCCTCCGGTATCACAACCAGCTGGATTTCAGTCA 587 ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 535 GCTGGCATGGCGAGACCAGGTGGTCCGCCTCCTGTATCACAACCAGCTGGGTTTCAGTCA 594 Query 588 AATGTACCCTTGAACAGACCCACTGGTCCACCTTCTAGTCAGCCACCATTTGGCTCTAGA 647 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| Sbjct 595 AATGTACCCTTGAACAGACCCACTGGTCCACCTTCTCGTCAGCCATCATTTGGGTCTAGA 654 Query 648 CCGTCAATGCCTGGAGGACCAGTGCCGCAGCCTGCCGCCTCATCTAGTGGTTTTCCAGCT 707 || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 655 CCTTCAATGCCTGGAGGACCAGTGGCGCAGCCTGCCGCCTCTTCTAGTGGTTTTCCAGCT 714 Query 708 TTTGGTCCATCAGGTAGTGTAGCTGCAGGTCCTCCTCCAGGAGCTCGCCCAATGGCATTT 767 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 715 TTTGGTCCATCAGGTAGTGTAGCTGCAGGTCCTCCTCCAGGATCTCGCCCAATGGCATTT 774 Query 768 GGTTCACCTCCACCTATCGGATCTGGCATGTCTATGCCTCCCTCAGGCATGCTTGGTGGT 827 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 775 GGTTCACCTCCACCTGTCGGATCTGGCATGTCTATGCCTCCCTCAGGCATGATTGGTGGT 834 Query 828 CCAGTCAGTAATGGGCATCAAATGGCTGCTTCAGGGGGATTTCCGAGGGGAACCCAGTTC 887 ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 835 CCAGTCAGTAATGGGCATCAAATGGTTGGTTCAGGGGGATTTCCGAGGGGAACCCAGTTC 894 Query 888 CCCGGTGCTGCTGTTACAACTCCACAGTCACCCTATATGCGGCCTCCCTCAGCACCTTTC 947 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | Sbjct 895 CCCGGTGCTGCTGTTACAACTCCACAGGCACCCTATGTGCGGCCTCCTTCAGCACCTTAC 954 Query 948 GCTCGGGCTCCTCCGCAGCCACTAGGTACACATTCTCTTTCTGGAAATCCACCATTAAAT 1007 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | Sbjct 955 GCTCGGACTCCTCCGCAGCCACTAGGTTCACATTCTCTTTCCGGAAATCCACCATTAACT 1014 Query 1008 CTGTCTACTGCTCCTTCAATGCCCCCACCGGCAACCTTTCCTGGAGCCCCTCATGGCAGG 1067 | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1015 CCGTTTACTGCTCCTTCAATGCCCCCACCAGCAACCTTTCCTGGAGCCCCTCATGGCAGG 1074 Query 1068 CCAGCGGTATCAAACTTGCCTTACGGTCCACCATCAGCGCAGGTCCCCCCTCCTCTAGGC 1127 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct 1075 CCAGCGGTATCAGGCTTGCCTTATGGTCCACCATCAGCGCAGGTTGCCCCACCTCTAGGC 1134 Query 1128 TTTCCTGGCCCAATGCAACCACCAAGATATGGCATGGGTCCTTTGCCAAATCAGTCGATG 1187 |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1135 TTTCCTGGTCAAATGCAACCACCAAGATATGGGATGGGTCCTTTGCCAAATCAGTCGATG 1194 Query 1188 ACCAACATACCCACTGCCATGGGCCAACCCGGTGCCTCTGTTCCTGGACCCTCAAGAATT 1247 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1195 ACCAACATACCCACTGCCATGGGCCAACCTGGTGCCACTGTTCCTGGACCCTCAAGAATT 1254 Query 1248 GATCCTAATCAAATCCCAAGGCCAGGTTCAAGCTCCAGCCCAACTGTGTTTGAAACTCGC 1307 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1255 GATCCTAATCAAATCCCAAGGCCAGGTTCAAGCTCCAGCCCAACTGTATTTGAAACTCGC 1314 Query 1308 CAGAATAATCAGGCTAATCCTCCCCCGCCTGCTACTAGTGATTATGTTGTTCGAGACACT 1367 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1315 CAGAGTAATCAGGCTAATCCTCCCCCGCCTGCTACTAGTGATTATGTTGTTCGAGACACC 1374 Query 1368 GGAAATTGTAGTCCCCGTTACATGAGGTGTACGATCAATCAGATCCCATGTACAGTTGAT 1427 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1375 GGAAATTGTAGTCCCCGTTACATGAGGTGTACCATCAATCAGATCCCATGTACAGTTGAT 1434 Query 1428 CTTCTATCTACATCTGGAATGCAACTGGCGTTGATGGTCCAACCTCTGGCGCTTTCTCAT 1487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1435 CTTCTATCTACATCTGGAATGCAACTGGCGTTGATGGTCCAACCGCTGGCGCTTTCTCAT 1494 Query 1488 CCATCTGAAGAGCCTATACAAGTTGTGGACTTTGGTGAGGGTGGGCCTGTTCGATGTTCA 1547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1495 CCATCTGAAGAGCCTATACAAGTTGTGGACTTTGGTGAGGGTGGGCCTGTTCGATGTTCA 1554 Query 1548 CGCTGTAAGGGTTACATAAATCCTTTCATGAAGTTCATTGACCAAGGAAGGAAGTTCATC 1607 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1555 CGCTGTAAGGGTTACATAAATCCTTTCATGAAGTTCATTGACCAAGGAAGGAAGTTCATC 1614 Query 1608 TGTAATTTCTGTGGATACACTGATGAGACTCCCCGTGACTATCACTGTAATCTGGGTCCA 1667 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1615 TGTAATTTCTGTGGATACACTGATGAGACTCCCCGTGACTATCACTGTAATCTGGGTCCA 1674 Query 1668 GATGGTAGACGCAGGGACGTTGATGAAAGACCTGAGCTGTGTAGGGGAACCGTTGAGTTT 1727 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1675 GATGGTAGACGTAGGGATGTTGATGAAAGACCTGAGCTGTGTAGGGGAACCGTTGAGTTT 1734 Query 1728 GTTGCTACAAAAGAATACATGGTACGGGATCCAATGCCAGCAGTGTATTTTTTCCTCATT 1787 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1735 GTTGCTACAAAAGAATACATGGTACGGGATCCAATGCCAGCAGTATATTTTTTCCTCATT 1794 Query 1788 GATGTCTCAATGAATGCGATACAAACAGGTGCTACTGCCGCTGCTTGCAATGCAATCCAG 1847 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1795 GATGTCTCAATGAATGCGATACAAACAGGTGCTACTGCCGCTGCTTGCAATGCAATCCAG 1854 Query 1848 CAAGTACTTTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGGACATTTGTTGGGATTGCTACGTTTGAC 1907 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1855 CAAGTACTTTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGGACATTTGTTGGGATTGCTACATTTGAC 1914 Query 1908 TCAACAATCCACTTCTATAATTTGAAACGTGCACTGCAGCAGCCATTGATGCTCATTGTC 1967 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1915 TCAACAATCCACTTCTATAATTTGAAACGTGCACTGCAGCAGCCATTGATGCTCATTGTC 1974 Query 1968 CCTGATGTACAAGATGTTTATACACCATTAGAAACAGATGTCATTGTTCAGCTATCTGAG 2027 ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct 1975 CCTGATGTACAAGATGTCTATACACCTTTAGAAACAGATGTTGTAGTTCAGCTATCTGAG 2034 Query 2028 TGCCGTCAACATCTGGAGCTTTTGCTGGATAGTATCCCAACGATGTTTCAGGAAAGTAAA 2087 ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2035 TGCCGTCAACACCTAGAGCTTTTGCTGGATAGTATCCCAACGATGTTTCAGGAAAGTAAA 2094 Query 2088 ACTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAGGCTGCTTTCTTGGCGATGAAGAGCAAA 2147 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2095 ATTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAGGCTGCTTTCTTGGCGATGAAGAGCAAA 2154 Query 2148 GGAGGGAAGCTTATGGTATTTCAATCAATTTTGTGTTCTGTTGGTGTTGGAGCACTTTCT 2207 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2155 GGAGGGAAGCTTATGGTATTTCAATCAATTTTGTGTTCTGTTGGTGTTGGAGCACTTTCT 2214 Query 2208 TCTAGAGAGGCTGAAGGGAGAGCTAATATGTCTGCTGGTGAAAAGGAGGCCCATAAATTA 2267 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2215 TCTAGAGAGGCCGAAGGGAGAGCTAATATGTCTGCTGGTGAAAAGGAGGCCCATAAATTA 2274 Query 2268 CTACAACCGGCAGACAAAACTCTAAAGACCATGGCTATTGAATTTGCTGAATACCAGGTC 2327 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2275 CTACAACCAGCAGACAAAACTCTAAAGACCATGGCTATTGAATTTGCTGAATACCAGGTC 2334 Query 2328 TGTGTTGATATATTTATCACAGCTCAGGCCTATGTTGACATGGCTTCAATTTCCGTCATT 2387 ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2335 TGTGTAGATATATTTATCACAACTCAGGCCTATGTTGACATGGCTTCAATTTCCGTTATT 2394 Query 2388 CCAAGAACTACTGGAGGACAGGTGTATTGTTATTACCCTTTCTCAGCTCTCTCAGATCCT 2447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2395 CCAAGAACTACTGGAGGACAGGTGTATTGTTATTACCCTTTCTCAGCTCTCTCAGATCCT 2454 Query 2448 CCCAAGCTTTACAATGATCTTAAATGGAATATTACTAGGCCACAGGGTTTTGAGGCTGTC 2507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2455 CCCAAGCTTTACAATGATCTTAAATGGAATATTACTAGGCCACAGGGTTTTGAGGCTGTC 2514 Query 2508 ATGCGAGTCAGATGCAGCCAGGGTATTCAAGTGCAAGAATACTCGGGGAATTTCTGCAAA 2567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2515 ATGCGAGTCAGATGCAGCCAGGGTATTCAAGTGCAAGAATACTCTGGGAATTTCTGCAAA 2574 Query 2568 CGCATTCCAACTGACATTGATCTACCAGCGCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCTGAA 2627 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2575 CGCATTCCAACTGACATTGATCTACCAGCGCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCGGAA 2634 Query 2628 TGTGCTTTCCAGTGCGCCCTTCTGTATACTACAATATATGGAGAAAGAAGAATTAGGGTT 2687 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2635 TGTGCTTTCCAGTGCGCCCTTCTGTATACTACAATATATGGAGAAAGAAGAATTAGGGTT 2694 Query 2688 ACCACATTATCACTCTCCTGTACGAACATGCTCAGTAATTTGTTTCGCGCAGCTGACTTA 2747 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2695 ACCACATTATCACTCTCCTGTACAAACATGCTCAGTAATTTGTTTCGCGCAGCTGACTTA 2754 Query 2748 GATTCTCAATTTGCTTGTATGCTGAAACAAGCGGCGAATGAAATTCCTTCGAAGGCACTT 2807 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2755 GATTCTCAATTTGCTTGTATGCTGAAACAAGCGGCTAATGAAATTCCTTCGAAGGCACTT 2814 Query 2808 CCACTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAATAGTTGCATAAATGCACTCTATGCCTACCGTAAA 2867 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2815 CCACTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAATAGTTGCATAAATGCACTCTATGCCTACCGTAAA 2874 Query 2868 TTTTGTGCTACAGTGACATCATCTGGACAACTTATTCTTCCCGAGGCGCTCAAGCTATTT 2927 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2875 TTTTGTGCTACAGTGACATCATCTGGACAACTTATTCTTCCCGAGGCGCTCAAGCTATTT 2934 Query 2928 CCATTATATACTCTCGCATTGACCAAAAGTGTGGGTTTAAGGACGGATGGGAGAATTGAT 2987 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2935 CCATTATACACTCTCGCATTGACCAAAAGTGTGGGTTTAAGGACGGATGGAAGAATTGAT 2994 Query 2988 GATCGATCATTCTGGATTAACTATGTATCTTCCCTTTCTACTCCTTTGGCAATCCCATTG 3047 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2995 GATCGATCATTCTGGATCAACTATGTGTCTTCCCTTTCTACTCCTTTGGCAATCCCATTG 3054 Query 3048 GTTTATCCCAGGATGATTTCTGTTCACGACCTTGATGCGAAGGACAATGAGGGATCGGTT 3107 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct 3055 GTTTATCCGAGAATGATTTCTGTTCACGACCTTGATGTGAAGGACACTGAGGGATCGGTC 3114 Query 3108 CTTCCTCCTCCAATCCCATTGTCAAGTGAACACATTAGCAATGAGGGAGTTTATTTTCTT 3167 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3115 CTTCCTCCTCCAATCCCATTGTCAGGTGAACACATTAGCAATGAGGGAGTTTATTTTCTT 3174 Query 3168 GAGAATGGTGAAGACGGTCTACTATATGTTGGCGAATCAGTAGACTCTGATATTCTGCAG 3227 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3175 GAGAATGGTGAAGACGGTCTACTATTTGTTGGCGAATCAGTAGACTCTGATATTCTGCAG 3234 Query 3228 AAACTTTTTGGTGTTCCTTCAGCTGCTGAAATTCCTAGCCAGTATGTGCTGCAGCAGTAT 3287 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 3235 AAACTTTTTGCTGTTTCTTCAGCTGCTGAAATTCCTAACCAGTTTGTGCTGCAGCAGTAT 3294 Query 3288 GATAATCAGTTATCAAAGAAGTTCAATGATGCTGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGATGT 3347 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3295 GATAATCAGTTATCAAAGAAATTCAATGATGCGGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGATGT 3354 Query 3348 TCTTACCTAAG 3358 ||||||||||| Sbjct 3355 TCTTACCTAAG 3365 Score = 139 bits (75), Expect = 2e-31 Identities = 98/108 (91%), Gaps = 6/108 (6%) Strand=Plus/Plus Query 3357 AGGAGTCCTTACAGAAGTTTCGT--C--C--CATCTGTGTCATGTACGGAATTTGTGGTA 3410 ||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct 3518 AGGAGTCCTTACAGAAGTTTCCTCCCATCTGCATCTGTGTCATGTTCGGAATTTGCGGTA 3577 Query 3411 GAAAAGCATAGCAGAAGGGGAAAGGGCATTGGTCTTATGGCTGCTTGA 3458 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3578 GAAAAGCATAGCAGAAGGGGAAAGGGCATCGGTCTTATGGCTGCTTGA 3625 > AT3G44340.1 | Symbols: CEF | clone eighty-four | chr3:16011621-16020254 REVERSE LENGTH=3723 Length=3723 Score = 1711 bits (926), Expect = 0.0 Identities = 1232/1382 (89%), Gaps = 12/1382 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1222 CCTCTGTTCCTGGACCCTC-AAGAATTGATCCTAATCAAATCCCAAGGCCAGGTTCAAGC 1280 |||||||| || | ||||| ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 1107 CCTCTGTTTCTAGCCCCTCAAAG-ATTGATCTTAATCAGATACCAAGGCCAGGTTCAAGC 1165 Query 1281 TCCAGCCCAACTGTGTTTGAAACTCG-CCAGAATAATCAGGCTAATCCTCCCCCGCCTGC 1339 ||||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||| | Sbjct 1166 TCCAGTCCAATTGTGTATGAAACTCGTGTGGAA-AATAAGGCTAATCCTCCACCACCTAC 1224 Query 1340 TACTAG-TGATTATGTTGTTCGAGACACTGGAAATTGTAGTCCC-CGTTACATGAGGTGT 1397 |||| | ||||||| | | ||||||||||||||| || ||| ||||||||| | || Sbjct 1225 TACT-GTTGATTATATAACTAGAGACACTGGAAATTCCAG-CCCGCGTTACATGCGATGC 1282 Query 1398 ACGATCAATCAGATCCCATGTACAGTTGATCTTCTATCTACATCTGGAATGCAACTGGCG 1457 || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1283 ACAATCAATCAGATCCCATGCACTGTTGATCTTCTATCTACATCTGGTATGCAACTGGCA 1342 Query 1458 TTGATGGTCCAACCTCTGGCGCTTTCTCATCCATCTGAAGAGCCTATACAAGTTGTGGAC 1517 | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1343 CTAATAGTCCAACCAATGGCGCTTTCTCATCCATCTGAAGAGCCTATCCAAGTTGTGGAC 1402 Query 1518 TTTGGTGAGGGTGGGCCTGTTCGATGTTCACGCTGTAAGGGTTACATAAATCCTTTCATG 1577 ||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| Sbjct 1403 TTTGGTGAGAGTGGCCCTGTTAGATGTTCACGTTGTAAGGGCTACGTGAATCCTTTCATG 1462 Query 1578 AAGTTCATTGACCAAGGAAGGAAGTTCATCTGTAATTTCTGTGGATACACTGATGAGACT 1637 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 1463 AAGTTCATTGACCAAGGAAGGAAGTTCATATGTAACTTGTGTGGATACACTGATGAGACT 1522 Query 1638 CCCCGTGACTATCACTGTAATCTGGGTCCAGATGGTAGACGCAGGGACGTTGATGAAAGA 1697 || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| Sbjct 1523 CCTCGTGACTACCAGTGTAATCTCGGTCCAGATGGTAGACGTAGGGATGCTGATGAAAGG 1582 Query 1698 CCTGAGCTGTGTAGGGGAACCGTTGAGTTTGTTGCTACAAAAGAATACATGGTACGGGAT 1757 |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 1583 CCTGAGCTGTGTAGGGGAACTGTTGACTTTGTTGCTACAAAAGAATATATGGTACGAGAT 1642 Query 1758 CCAATGCCAGCAGTGTATTTTTTCCTCATTGATGTCTCAATGAATGCGATACAAACAGGT 1817 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 1643 CCAATGCCAGCAGTATATTTCTTCCTCATTGATGTCTCAATGAACGCGATTCAAACAGGT 1702 Query 1818 GCTACTGCCGCTGCTTGCAATGCAATCCAGCAAGTACTTTCAGACCTTCCTGAAGGTCCT 1877 || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 1703 GCAACTGCAGCTGCTTGCAGTGCAATCCAGCAAGTCCTCTCAGACCTTCCTGAAGGTCCT 1762 Query 1878 AGGACATTTGTTGGGATTGCTACGTTTGACTCAACAATCCACTTCTATAATTTGAAACGT 1937 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| Sbjct 1763 AGGACATTTGTTGGAATTGCCACGTTTGACTCAACAATTCACTTTTATAATTTGAAGCGT 1822 Query 1938 GCACTGCAGCAGCCATTGATGCTCATTGTCCCTGATGTACAAGATGTTTATACACCATTA 1997 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||| Sbjct 1823 GCACTGCAGCAGCCATTGATGCTCATTGTTCCGGATGTTCAAGATGTGTATACACCTTTA 1882 Query 1998 GAAACAGATGTCATTGTTCAGCTATCTGAGTGCCGTCAACATCTGGAGCTTTTGCTGGAT 2057 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| Sbjct 1883 GAAACAGATGTCATTGTTCAGCTATCTGAGTGCCGTCAACACCTAGAGATTTTGCTGGAA 1942 Query 2058 AGTATCCCAACGATGTTTCAGGAAAGTAAAACTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTT 2117 ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1943 AGTATCCCAACAATGTTTCAGGAAAGTAAGAGTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTT 2002 Query 2118 AAGGCTGCTTTCTTGGCGATGAAGAGCAAAGGAGGGAAGCTTATGGTATTTCAATCAATT 2177 ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| || Sbjct 2003 AAGGCCGCATTCTTAGCGATGAAGAGCACTGGAGGAAAGCTCATGGTGTTCCAATCAGTT 2062 Query 2178 TTGTGTTCTGTTGGTGTTGGAGCACTTTCTTCTAGAGAGGCTGAAGGGAGAGCTAATATG 2237 ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| Sbjct 2063 TTGCCTTCTGTTGGCATTGGAGCACTTTCTTCTAGAGAAGCCGATGGGAGAGCTAATGCC 2122 Query 2238 TCTGCTGGTGAAAAGGAGGCCCATAAATTACTACAACCGGCAGACAAAACTCTAAAGACC 2297 ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| Sbjct 2123 TCTGCGGGTGAAAAAGAGGCCCATAAATTACTACAACCCGCAGACAAAACTTTAAGGACC 2182 Query 2298 ATGGCTATTGAATTTGCTGAATACCAGGTCTGTGTTGATATATTTATCACAGCTCAGGCC 2357 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| || Sbjct 2183 ATGGCTATTGAATTTGCTGAATACCAGGTCTGTGTAGATTTGTTTATCACAACTCAAGCG 2242 Query 2358 TATGTTGACATGGCTTCAATTTCCGTCATTCCAAGAACTACTGGAGGACAGGTGTATTGT 2417 ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct 2243 TATGTTGACATGGCTTCAATTTCTGAGATCCCAAGAACAACTGGAGGACAGGTTTATTGT 2302 Query 2418 TATTACCCTTTCTCAGCTCTCTCAGATCCTCCCAA-GCTT-TACAATGATCTTAAATGGA 2475 |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | || ||||| ||||||| ||||| Sbjct 2303 TATTACCCTTTCTCAGCTCTTTCAGACCC-CCCAAAG-TTATACAACGATCTTAGATGGA 2360 Query 2476 ATATTACTAGGCCACAGGGTTTTGAGGCTGTCATGCGAGTCAGATGCAGCCAGGGTATTC 2535 |||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2361 ATATCACGAGGCCCCAAGGTTTTGAGGCTGTCATGCGAGTCAGATGCAGTCAGGGTATTC 2420 Query 2536 AAGTGCAAGAATACTCGGGGAATTTCTGCAAACGCATTCCAACTGACATTGATCTACCAG 2595 |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| | Sbjct 2421 AAGTGCAAGAATACTCAGGGAACTTCTGTAAGCGCATACCAACTGACATCGATCTACCTG 2480 Query 2596 CG 2597 || Sbjct 2481 CG 2482 Score = 739 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 653/773 (84%), Gaps = 26/773 (3%) Strand=Plus/Plus Query 2597 GCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCTGAATGTGCTTTCCAGTGCGCCCTTCTGTATAC 2656 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 2518 GCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCTGAATGCGGTTTTCAGTGTGCCCTTCTGTATAC 2577 Query 2657 TACAATATATGGAGAAAGAAGAATTAGGGTTACC-A-CATTATCACTCTCCT-GTACGAA 2713 || |||| ||||||||| |||||||||||| | | | |||||| || ||| |||| || Sbjct 2578 CACCATATCTGGAGAAAGGAGAATTAGGGTT-CTTAAC-TTATCAATC-CCTTGTACAAA 2634 Query 2714 CATGCTCAGTAATTTGTTTCGCGCAGCTGACTTAGATTCTCAATTTGCTTGTATGCTGAA 2773 |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2635 CATGCTCAGTAACTTGTTCCGCTCAGCTGACCTAGATTCCCAATTTGCTTGTATGCTGAA 2694 Query 2774 ACAAGCGGCGAATGAAATTCCTTCGAAGGCACTTCCACTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAA 2833 ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2695 ACAAGCGGCTAATGAGATCCCTTCGAAGGCACTTCCGTTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAA 2754 Query 2834 T-AGTTGCATAA--ATGCACT-CTATGCCTACCGTAAATTTTGTGCTACAGTGACATCAT 2889 | | |||||| | || ||| | || |||| |||||||| || |||||||| |||||| Sbjct 2755 TGA-TTGCATCACCAT--ACTAC-ATTCCTATCGTAAATTCTGCGCTACAGTTACATCAA 2810 Query 2890 CTGGACAACTTATTCTTCCCGAGGCGCTCAAGCTATTT-CCATTATATACTCTCGCATTG 2948 |||||||||||||||| || || || |||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct 2811 CTGGACAACTTATTCTACCTGAAGCACTCAAGCT-TTTGCCATTATATACTCTCGCCTTA 2869 Query 2949 ACCAAAAGTGTGGGTTTAAGGACGGATGGGAGAATTGATGATCGATCATTCTGGATTAAC 3008 |||||| ||||||| ||| | | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| Sbjct 2870 ACCAAAGGTGTGGGGTTACGAATGGACGGGAGAATTGATGACCGATCATTTTGGATAAAC 2929 Query 3009 TATGTATCTTCCCTT-TCTACTCCTTTGGCAATCCCATTGGTTTATCCCAGGATGATTTC 3067 |||| ||||| || || ||||||||||| || || | |||||||| ||||||||| | Sbjct 2930 CATGTGTCTTCA-TTGTCCACTCCTTTGGCTATTCCGCTAGTTTATCCAAGGATGATTGC 2988 Query 3068 TGTTCACGACCTTGATGCGAAGGACAATGAGGGATCGGTTCTTCCTCCTCCAATCCCATT 3127 ||| || ||||||||||| || || ||||| | | || ||||| |||||||||||| Sbjct 2989 TGTCCATGACCTTGATGCAAATGATAATGAAGAAAATGTGGTTCCTTGTCCAATCCCATT 3048 Query 3128 GTCAA-GTGAACACATTAGCAATGAGGGAGTTTATTTTCTTGAGAATGGTGAAGACGGTC 3186 ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 3049 A-CAAAGTGAACACCTTAGCGATGAGGGAGTCTATTTTCTTGAGAACGGTGAAGATGGTT 3107 Query 3187 T-ACTATATGTTGGCGAATCAGTAGACTCTGATATTCTGCAGAAACTTTTTGGTGTTC-C 3244 | | ||||| |||| ||||||||| | || ||||| || ||||| || ||| ||||| | Sbjct 3108 TGA-TATATATTGGAGAATCAGTAAATTCAGATATCCTACAGAAGCTCTTTAATGTTCGC 3166 Query 3245 TTCAGCTGCTGAAATTCCTAGCCAGTATGTGCTGCAGCAGTATGATAATCAGTTATCAAA 3304 | ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct 3167 T-CAGCTGCTGAACTTCCAAGTCAGTATGTGCTGCAAAAGTATGATAATCAGCTATCAAA 3225 Query 3305 GAAGTTCAATGATGCTG-TGAATGAAATAAGGAGGCAAAGATGTTCTTACCTA 3356 |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3226 GAAGTTCAATGACG-TGGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGAAGTTCTTACCTA 3277 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 172122781433 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5