BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg491515 Length=2899 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT4G32180.1 | Symbols: ATPANK2, PANK2 | pantothenate kinase 2 |... 4708 0.0 > AT4G32180.1 | Symbols: ATPANK2, PANK2 | pantothenate kinase 2 | chr4:15537559-15543779 REVERSE LENGTH=2935 Length=2935 Score = 4708 bits (2549), Expect = 0.0 Identities = 2770/2877 (96%), Gaps = 13/2877 (0%) Strand=Plus/Plus Query 31 AAAAATGGCGGGTCAAGAGGACGAGCATGATCCAATTCTTGACGATAAAAAAGAAGCTGA 90 ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct 61 AAAAATGGCGGGTCAAGAGGATGAGTATGATCCAATTCTTGACAATAAAAGAGAAGCTGA 120 Query 91 AGCAAAATCTGAGGTTTGTGTTGGTGGTGGTGAGAGAGATATGGCTCCTTCTACTTCTGG 150 |||||||||| |||||| ||||| || || | | | | |||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AGCAAAATCTCAGGTTTCTGTTGCTGCTGAT-A-A-AAATATGGCTCCTTCTACTTCTGG 177 Query 151 AACTTCGATCCACAGATCGGGCTCTAGACCTCAGCTTGATCTAAGCAAAGCTGAAATTCA 210 ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 178 TACTCCGATCCACAGATCAGGCTCTAGACCTCAGCTTGATCTAAGCAAAGCCGAAATTCA 237 Query 211 GGGGAATCTCGAGGAGAGAGATCCCACCATTTTGTTGCCTAATCAGTCTGATGATATCTC 270 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 238 GGGGAACCTCGAGGAGAGAGATCCCACCATTTTATTGCCTAATCAGTCTGATGATATCTC 297 Query 271 TCATTTAGCTCTTGATATCGGAGGTTCTTTGATAAAGTTGTTGTATTTTTCACGACATGA 330 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 298 TCATTTGGCTCTTGATATCGGAGGTTCTTTGATAAAGTTGTTGTATTTTTCACGACATGA 357 Query 331 GGACTACTCGAATGATGGTGATAAGCGGAAGAGGACGATCAAGGAGAGATTGGGTATAAC 390 ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 358 GGACTACTCTAATGATGATGATAAGCGGAAGAGGACGATCAAGGAGAGATTGGGTATTAC 417 Query 391 TAATGGCAACTTGAGAAGCTATCCTGTTCTTGGTGGCAGACTTCATTTTGTCAAGTTTGA 450 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 418 CAATGGCAACTTGAGAAGTTATCCTGTTCTTGGTGGTAGACTTCATTTTGTCAAGTTTGA 477 Query 451 GACTCACAAAATAAATGAGTGCTTGGATTTTATTCATTCCAAGCAGCTTCATCGCCGAGA 510 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 478 GACTCACAAAATTAATGAGTGCTTGGATTTTATTCATTCCAAGCAGCTTCATCGCCGAGA 537 Query 511 TCCTTATCCTTGGAGTTCAAAAACCTTGCCTTTGGGGACTGGTGTTATCAAGGTCACAGG 570 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 538 TCCTTATCCTTGGAGTTCAAAGACCTTGCCTTTGGGGACTGGTGTTATCAAGGTCACAGG 597 Query 571 TGGCGGGGCCTATAAATTTGCAGACTTGTTCAAGGAACGGCTGGGCGTTAGTATTGAGAA 630 ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 TGGCGGGGCATTTAAATTTGCAGACTTGTTCAAGGAACGGCTGGGCGTTAGTATTGAGAA 657 Query 631 AGAAGATGAAATGCATTGCCTTGTTTCTGGAGCAAATTTTTTGCTCAAAGCTATTCGACA 690 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 658 AGAAGATGAAATGCATTGTCTTGTTTCTGGAGCAAATTTTTTGCTCAAGGCTATTCGACA 717 Query 691 TGAAGCCTTCACGCACATGGAGGGTGAGAAAGAATTTGTACAGATAGATCCCAATGACTT 750 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 718 TGAAGCCTTTACGCACATGGAGGGTGAGAAAGAATTTGTACAGATAGATCCCAATGACTT 777 Query 751 GTATCCCTATCTTCTTGTGAACGTTGGATCTGGTGTTAGCATAATCAAGGTTGATGGTGA 810 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 778 GTATCCTTATCTTCTTGTGAACGTTGGATCTGGTGTTAGCATAATCAAGGTTGATGGTGA 837 Query 811 GGGAAAGTTTGAACGTGTGAGTGGGACTAATGTTGGCGGTGGTACCTATTGGGGCTTAGG 870 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 838 AGGAAAGTTTGAACGTGTGAGTGGAACTAATGTTGGCGGTGGTACCTATTGGGGCTTAGG 897 Query 871 AAGACTTCTAACGAAGTGCAAGAGTTTTGATGAATTGCTAGAACTCAGCCAAAAGGGAGA 930 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 AAGACTTCTAACGAAGTGCAAGAGTTTTGATGAATTGCTAGAACTCAGCCAAAAGGGAGA 957 Query 931 TAATAGTGCCATTGACATGCTCGTTGGTGATATTTATGGTGGCATGGATTATTCCAAGAT 990 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 958 TAATAGTGCCATTGACATGCTCGTTGGTGATATTTATGGTGGCATGGATTACTCCAAGAT 1017 Query 991 TGGTCTCTCTGCTTCAACAATAGCTTCTAGTTTTGGCAAGGCCATATCTGAAAATAAGGA 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1018 TGGTCTCTCTGCTTCAACAATAGCTTCTAGTTTTGGCAAGGCGATATCTGAAAATAAGGA 1077 Query 1051 ACTGGATGATTACAGACCTGAAGATATTTCCTTGTCTCTGCTGCGGATGATTTCGTACAA 1110 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct 1078 ACTGGACGATTACAGACCTGAAGATATTTCCTTGTCTCTGTTGCGGATGATTTCATACAA 1137 Query 1111 TATTGGGCAGATATCATACTTGAATGCCCTTCGCTTTGGGTTGAAGCGAATATTTTTTGG 1170 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1138 TATTGGGCAGATATCGTACTTGAATGCCCTTCGCTTTGGGTTGAAGCGAATATTTTTTGG 1197 Query 1171 AGGATTTTTCATAAGGGGTCACGCATATACCATGGACACAATTTCCTTTGCTGTACATTT 1230 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 1198 AGGATTTTTCATAAGGGGTCATGCATATACCATGGATACAATTTCATTTGCTGTACATTT 1257 Query 1231 CTGGTCGAAAGGAGAGATGCAAGCTATGTTCTTGAGGCATGAAGGTTTTCTGGGTGCTCT 1290 |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1258 CTGGTCTAAGGGAGAGATGCAAGCTATGTTCTTGAGACATGAAGGTTTTCTGGGTGCTCT 1317 Query 1291 TGGTGCGTTCATGAGCTATGAGAAGCACGGATTGGATGATTTAATGTCCCATCAGTTGGT 1350 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1318 AGGTGCGTTCATGAGCTATGAGAAGCACGGATTGGATGATTTAATGTCCCATCAGTTGGT 1377 Query 1351 TGAGAGGTTCCCAATGGGTGCACCATATACTGGAGGAAATATTCACGGACCACCGCTCGG 1410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1378 TGAGAGGTTCCCAATGGGTGCACCATATACTGGAGGAAATATTCACGGACCACCACTCGG 1437 Query 1411 TGATTTGAACGAGAAGATTTCGTGGATGGAGAAGTTTGTGCGTAGAGGAACTGAAATAAC 1470 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1438 TGATTTGGACGAGAAGATTTCGTGGATGGAGAAGTTTGTGCGTAGAGGAACTGAAATAAC 1497 Query 1471 TGCTCCTGTACCGATGACTCCATCAAAAACGACTGGGCTTGGAGGGTTTGAAGTTCCCTC 1530 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1498 TGCTCCTGTACCAATGACTCCATCAAAAACGACTGGGCTTGGAGGGTTTGAAGTTCCATC 1557 Query 1531 ATCCAGAGGTAGTGCTCTAAGATCTGACGCCAGTGCTTTAAATGTTGGTGTTCTCCATTT 1590 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1558 ATCCAGAGGTAGTGCTTTAAGATCTGACGCCAGTGCTTTAAATGTTGGTGTTCTCCATCT 1617 Query 1591 TGTGCCCACACTGGAGGTGTTCCCATTACTGGCTGATCC-AAAGACGTATGAGCCTAACA 1649 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct 1618 TGTGCCCACATTGGAGGTGTTCCCATTACTAGCTGATCCGAAA-ACGTATGAGCCTAACA 1676 Query 1650 CGATTGATCTATCAGATCAAGGCGAACGAGAGTACTGGCTCAAAGTTTTGTCCGAGCATT 1709 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1677 CGATTGATCTATCAGATCAAGGCGAACGAGAGTACTGGCTCAAAGTTTTGTCCGAGCATT 1736 Query 1710 TGCCAGACCTCGTTGATACGGCTGTGGCAAGTGAAGGAGGAACTGAGGATGCGAAAAGGC 1769 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1737 TGCCAGACCTCGTTGATACGGCTGTAGCAAGTGAAGGAGGAACCGAGGATGCGAAAAGGC 1796 Query 1770 GGGGTGATGCTTTTGCTCGTGCCTTTTCTGCTCATTTGGCAAGATTAATGGAGGAGCCAG 1829 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1797 GGGGTGATGCTTTTGCTCGTGCTTTTTCTGCTCATTTGGCAAGATTAATGGAGGAGCCAG 1856 Query 1830 CTGCATATGGAAAGCTAGGGCTAGCAAATCTTTTGGAACTTAGGGAAGAATGCTTAAGGG 1889 |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1857 CTGCATATGGAAAGCTGGGGCTGGCAAATCTCTTGGAACTTAGGGAAGAATGCTTAAGAG 1916 Query 1890 AATTCCAGTTTGTTGATGCCTATAGAAGCATCAAGCAAAGAGAGAACGAGGCATCACTTG 1949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1917 AATTCCAGTTTGTTGATGCCTATAGAAGCATCAAGCAAAGGGAGAACGAGGCATCACTTG 1976 Query 1950 CTGTTTTACCTGATTTACTTGAAGAGCTTGATTCGATGAGCGAGGAGGCAAGGTTGCTTA 2009 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1977 CTGTTTTACCTGATTTACTTGAGGAGCTTGATTCGATGAGCGAGGAGGCAAGGTTGCTTA 2036 Query 2010 CACTTATAGAAGGTGTTCTTGCAGCAAACATATTCGACTGGGGATCTCGAGCATGTGTGG 2069 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2037 CACTTATAGAAGGTGTTCTTGCTGCAAACATATTTGACTGGGGATCTCGAGCATGTGTGG 2096 Query 2070 ATCTATATCACAAAGGAACCATTATTGAAATATACAGAATGAGCCGCAACAAGATGCAGA 2129 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2097 ATCTATATCACAAAGGAACCATTATTGAAATATACAGAATGAGTCGCAACAAGATGCAGA 2156 Query 2130 GACCGTGGAGGGTAGATGATTTTGATGCTTTTAAAGAAAGGATGCTTGGATCTGGAGGTA 2189 |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2157 GACCGTGGAGGGTAGACGATTTTGATGCTTTCAAAGAAAGGATGCTTGGATCTGGAGGTA 2216 Query 2190 AGCAGCCTCATCGACATAAAAGAGCATTACTTTTTGTTGATAACTCGGGCGCAGACGTCA 2249 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct 2217 AGCAGCCTCATCGACATAAAAGAGCATTACTTTTTGTTGATAACTCGGGAGCAGATGTCA 2276 Query 2250 TTCTTGGGATGCTTCCTCTTGCCCGAGAGTTTCTCCGCCGTGGGACTGAAGTTGTTCTAG 2309 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 2277 TTCTTGGGATGCTTCCTCTTGCTCGAGAGTTTCTCCGTCGAGGGACTGAAGTTGTTCTAG 2336 Query 2310 TGGCGAACTCTCTTCCTGCTCTTAACGACGTGACCGCTATGGAACTCCCTGATATAGTCG 2369 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2337 TGGCAAACTCTCTTCCTGCTCTTAACGACGTGACCGCTATGGAACTGCCTGATATAGTCG 2396 Query 2370 CTGGGGCTGCTAAGCACTGTGACATCTTGAGGAGAGCGGCAGAAATGGGAGGCTTACTTG 2429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2397 CTGGGGCTGCTAAGCACTGTGACATCTTGAGGAGAGCGGCAGAAATGGGAGGCTTACTTG 2456 Query 2430 TGGATGCGATGGTAAATCCGGGGGATGGATCAAAGAAGGATTCAACGTCAGCACCATTGA 2489 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2457 TGGATGCGATGGTAAATCCAGGGGATGGATCAAAGAAGGATTCAACGTCAGCACCATTGA 2516 Query 2490 TGGTTGTTGAAAATGGATGTGGAAGTCCTTGCATTGACCTGAGACAAGTCAGCTCTGAGC 2549 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2517 TGGTTGTTGAAAATGGATGTGGAAGTCCTTGTATCGACCTCAGACAAGTCAGCTCTGAGC 2576 Query 2550 TTGCAGCCGCTGCCAAAGACGCTGATCTTGTTGTCTTGGAAGGTATGGGTAGAGCACTTC 2609 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2577 TTGCAGCCGCTGCCAAAGACGCTGATCTTGTTGTCTTGGAAGGTATGGGAAGAGCACTTC 2636 Query 2610 ACACCAACTTCAACGCTCAATTCAAATGCGAGGCTCTCAAGCTAGCAATGGTGAAAAATC 2669 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2637 ACACCAACTTCAACGCTCAATTCCAATGCGAGGCTCTCAAGCTAGCAATGGTTAAAAATC 2696 Query 2670 AGAGATTGGCTGAGAAGTTGATAAAAGGAAACATTTATGATTGCGTATGCAGATACGAGC 2729 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2697 AGAGATTGGCTGAGAAGTTGATAAAAGGAAACATATATGATTGTGTATGCAGATACGAGC 2756 Query 2730 CTCCCTCTCTTTAACAATGTAATGT-TAAGTTTCTTCAACCTTTAGACTACTGTTGTATA 2788 ||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2757 CTCCCTCGCTTTAACAATGTTATGTATCA-TTTCTTCAACCTTTAGACTACTGTTGTATA 2815 Query 2789 CAGATTAAGCATTCGGCATATGT-At-t-t-tttttATTTAGACTAAACTTTTACTGTAT 2844 ||||||||||||||| ||| || || | | ||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2816 CAGATTAAGCATTCGTCATGTGGCATATGTATTTTTATTTAGACTACACTTTTACTGTAT 2875 Query 2845 AAAATTGTATTTGAATAAATCAAAATCGCTTGCTA-AA-GAGCATCATCAGGGTTCA 2899 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| Sbjct 2876 AAAATTGTATTTGAATGAATCAAAATCACTTGCTATAAAGAGCATCATGAGGGTTCA 2932 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 144079460296 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5