BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg491819
Length=4611
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G29380.1 | Symbols: | protein kinase family protein / WD-40... 7795 0.0
> AT4G29380.1 | Symbols: | protein kinase family protein / WD-40
repeat family protein | chr4:14458822-14464859 FORWARD LENGTH=4652
Length=4652
Score = 7795 bits (4221), Expect = 0.0
Identities = 4501/4634 (97%), Gaps = 27/4634 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGAAACAAAATCGCTCGTACGACACAAGTCTCGGCGACGGAGTACTATCTCCACGAC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGAAACAAAATCGCTCGTACGACACAAGTCTCGGCGACGGAGTACTATCTCCACGAC 60
Query 61 TTGCCGTCTTCTTACAATCTGGTCTTAAAAGAGGTTTTAGGTCGAGGAAGATTCTTAAAG 120
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 61 TTGCCGTCTTCATACAATCTGGTCTTAAAAGAGGTTTTAGGTCGAGGAAGATTCCTAAAG 120
Query 121 TCGATCCAATGTAAGCACGACGAAGGATTGGTCGTTGTTAAGGTTTACTTCAAGCGTGGT 180
||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCGATTCAATGTAAGCACGATGAAGGATTGGTTGTTGTTAAGGTTTACTTCAAGCGTGGT 180
Query 181 GACTCGATCGATCTCAGAGAGCACGAGCGTCGTCTCGTGAAGATCAAGGATGTGTTTTTG 240
||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 181 GACTCGATCGATCTCAGAGAGTATGAGCGTCGTCTCGTTAAGATCAAAGATGTGTTTTTG 240
Query 241 TCTCTTGAACATCCTCACGTTTGGCCTTTCCAGTTTTGGCAAGAGACTGATAAAGCAGCA 300
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TCTCTAGAACATCCTCACGTTTGGCCTTTTCAGTTTTGGCAAGAGACTGATAAAGCAGCG 300
Query 301 TATCTAGTGAGGCAATACTTTTACAGTAATCTGCATGATCGGTTGAGTACTCGGCCTTTC 360
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 301 TATCTAGTGAGGCAATACTTTTACAGTAATCTACATGATCGCTTGAGTACGAGGCCTTTC 360
Query 361 CTCAGTCTTGTAGAGAAGAAGTGGTTGGCGTTTCAGTTGCTTCTTGCTGTGAAGCAATGC 420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTCAGTCTTGTAGAGAAGAAGTGGTTGGCGTTTCAGTTGCTTCTTGCTGTGAAGCAATGT 420
Query 421 CATGAGAAGGATATATGTCATGGTGATATCAAGTGCGAGAACGTATTGCTGACTTCCTGG 480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 421 CATGAGAAGGATATATGTCATGGTGATATCAAGTGCGAGAACGTATTGTTGACTTCCTGG 480
Query 481 AACTGGCTGTACCTTGCTGATTTTGCATCCTTCAAACCCACATACATTCCTTATGATGAT 540
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AACTGGCTTTACCTTGCTGATTTTGCATCCTTCAAACCTACATACATTCCTTATGATGAT 540
Query 541 CCTTCAGACTTTTCCTTCTTCTTTGACACAAGGGGACAAAGACTTTGTTATCTGGCTCCA 600
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CCTTCAGACTTCTCGTTCTTCTTTGACACAAGGGGACAAAGACTTTGTTATCTGGCTCCA 600
Query 601 GAGAGATTCTATGAGCATGGAGGTGAGACACAAGTAGCACAAGATGCTCCATTAAAGCCC 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GAGAGATTCTATGAGCATGGAGGTGAGACACAAGTAGCACAAGATGCTCCATTAAAGCCC 660
Query 661 TCCATGGATATATTTGCTGTGGGGTGTGTGATAGCAGAACTTTTTCTTGAGGGTCAGCCA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TCCATGGATATATTTGCTGTGGGGTGTGTGATAGCCGAACTTTTTCTTGAGGGTCAGCCA 720
Query 721 CTATTTGAACTGGCGCAGCTTCTCGCTTATCGTAGAGGGCAACATGATCCTAGCCAACAC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CTATTTGAACTGGCGCAGCTTCTCGCTTATCGTAGAGGGCAACATGATCCTAGCCAACAC 780
Query 781 CTTGAAAAGATTCCTGATCCGGGAATTCGCAAGATGATTCTTCATATGATTCAGTTAGAA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CTTGAAAAGATTCCTGATCCGGGAATTCGCAAGATGATTCTTCATATGATTCAGTTAGAA 840
Query 841 CCCGAAGCACGCCTATCTGCTGAAGACTACCTGCAAAATTATGTCGGAGTTGTTTTCCCA 900
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 841 CCCGAAGCACGCCTATCTGCTGAAGACTACCTGCAAAATTATGTGGGAGTTGTTTTCCCA 900
Query 901 AACTACTTCTCACCATTTCTGCACACTTTATATTGTTGTTGGAATCCACTTCCTTCAGAC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AACTACTTCTCACCATTTCTGCACACTTTATATTGTTGTTGGAATCCACTTCCTTCAGAC 960
Query 961 ATGAGGGTAGCAACTTGCCAGGGGATATTTCAAGAAATTCTTAAAAAGATGATGGAAAAT 1020
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ATGAGGGTAGCAACTTGCCAGGGGATATTTCAAGAAATACTTAAAAAGATGATGGAAAAT 1020
Query 1021 AAGCCAGGTGATGAGATCGGCGTTGATCCTCCTGTAACTTCAGATCCAGTGAACGCAAGC 1080
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1021 AAGTCAGGTGATGAGATCGGCGTTGATTCTCCTGTAACTTCAAATCCAATGAACGCAAGC 1080
Query 1081 ACGGTACAGGAAACATTTGCAAATCACAAATTGAACTCATCGAAGGACTTGATAAGGAAT 1140
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1081 ACAGTACAGGAAACTTTTGCAAATCACAAATTGAACTCATCTAAGGATTTGATAAGGAAT 1140
Query 1141 ACTGTAAACTCTAAGGATGAGATCCTTTACTCTATTTCTGATGCACTCAAGAAAAATCGC 1200
||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 ACTGTGAACTCTAAGGATGAGATCTTTTACTCTATTTCTGATGCACTCAAGAAAAATCGC 1200
Query 1201 CATCCTTTCTTGAAAAAGATAACAATGGACGATTTGGGTACACTAATGTCTCTCTATGAT 1260
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1201 CATCCTTTCTTGAAAAAGATAACAATGGACGATTTGGGTACACTGATGTCTCTCTATGAT 1260
Query 1261 AGCCGTTCTGACACTTATGGTACGCCTTTTCTACCGGTAGAGGGTAACATGAGATGTGAG 1320
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 AGCCGTTCTGACACTTATGGCACGCCTTTTCTACCGGTAGAGGGTAACATGAGATGTGAG 1320
Query 1321 GGAATGGTTCTGATTGCATCTATGCTCTGTTCTTGTATCCGCAATATCAAGTTGCCTCAT 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GGAATGGTTCTGATTGCATCTATGCTCTGTTCTTGTATCCGCAATATCAAGTTGCCTCAT 1380
Query 1381 TTGAGGAGGGAAGCTATACTTCTATTGAGATCTTGCTCTTTGTATATTGATGATGATGAT 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 TTGAGGAGGGAAGCTATACTTCTATTGAGATCTTGCTCTTTGTATATTGATGATGATGAT 1440
Query 1441 CGCTTACAGCGTGTACTTCCATACGTCGTTGCCTTACTTTCTGATCCAACAGCAATCGTG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 CGCTTACAGCGTGTACTTCCATACGTCGTTGCCTTGCTTTCTGATCCAACAGCAATCGTG 1500
Query 1501 CGGTGCGCTGCCATGGAAACTTTGTGTGATATTCTGCCGCTTGTCCGAGATTTTCCTCCT 1560
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 CGGTGCGCTGCCATGGAAACTTTGTGTGACATTCTGCCGCTTGTCCGAGATTTTCCTCCT 1560
Query 1561 AGTGATGCGAAGATTTTCCCAGAGTACATATTTCCGATGCTCTCCATGCTTCCTGAAGAT 1620
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 AGTGATGCAAAGATTTTCCCAGAGTACATATTTCCGATGCTCTCCATGCTTCCTGAAGAT 1620
Query 1621 ACGGAAGAGAGTGTGAGGATATGCTATGCCAGCAATATTGCAAAACTCGCTCTTACTGCT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 ACGGAAGAGAGTGTGAGGATATGCTATGCCAGCAATATTGCAAAACTCGCTCTTACTGCT 1680
Query 1681 TATGGATTCTTGATACATTCTTTCCAGTTGAGCGATGTAGGGGTTCTTAATGAATTGAAT 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 TATGGATTCTTGATACATTCTTTCCAGTTGAGCGATGTAGGGGTTCTTAATGAATTGAAT 1740
Query 1741 TCCCAGCAGATCTC-ACCTACACCTGCTAGTGAGACCCCTAGTCATTTGCAAAAGGCAAA 1799
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 TCCCAGCAGATCTCCAC-TACACCTGCTAGTGAGACCCCTAGTCATTTGCAAAAGGCAAA 1799
Query 1800 TGGCAATGCGCAGCTTGCA-CAGCTTAGAAAAACTATAGCTGAAGTTGTTCAAGAGCTTG 1858
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 TGGCAATGCGCAGCTT-CAACAGCTTAGAAAAACTATAGCTGAAGTTGTTCAAGAGCTTG 1858
Query 1859 TTATGGGTCCAAAACAAACTCCAAATGTTAGAAGAGCACTCCTTCAGGACATAGGGGAGC 1918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 TTATGGGTCCAAAACAAACTCCAAATGTTAGAAGAGCACTCCTTCAGGACATAGGGGAGC 1918
Query 1919 TCTGCTTTTTCTTTGGTCAGAGGCAGAGTAATGACTTTCTACTACCGATCCTCCCTGCCT 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 TCTGCTTTTTCTTTGGTCAGAGGCAGAGTAATGACTTTCTACTACCGATCCTCCCTGCCT 1978
Query 1979 TTCTAAACGACAGAGATGAACAGCTAAGATCTGTATTCTTTGAGAAGATTGTTTATGTAT 2038
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 TTCTAAACGACAGAGATGAGCAGCTAAGATCTGTATTCTTTGAGAAGATTGTTTATGTAT 2038
Query 2039 GCTTTTTTGTTGGTCAGAGAAGTGTGGAGGAGTATCTATTGCCTTATATCGATCAAGCTT 2098
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 GCTTTTTTGTTGGCCAGAGAAGTGTGGAGGAGTATCTATTGCCTTATATCGATCAAGCTT 2098
Query 2099 TGAGTGATCAGACAGAGGCTGTCATTGTCAATGCATTGGAGTGCTTATCCACATTATGCA 2158
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099 TGAGTGATCAGACGGAGGCTGTTATTGTCAATGCATTGGAGTGCTTATCCACATTATGCA 2158
Query 2159 AGAGTAGTTTCTTGCGGAAGAGAGCTCTCCTCCAAATGATAGAGTGTGTTTATCCTTTGT 2218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 AGAGTAGTTTCTTGCGGAAGAGAGCTCTCCTCCAAATGATAGAGTGTGTTTATCCTTTGT 2218
Query 2219 TGTGCTATCCATCTCAATGGGTAAGGAGGGCAGTTGTCACTTTCATTGCCGCAAGTAGTG 2278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 TGTGCTATCCATCTCAATGGGTAAGGAGGGCAGTTGTCACTTTCATTGCCGCAAGTAGTG 2278
Query 2279 AATACTTAGGTGCAGTCGACTCTTATGCTTTTATTGCCCCAGTAATACGCTCTTATCTTA 2338
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2279 AATGCTTAGGTGCAGTCGACTCTTATGCTTTTATTGCCCCAGTAATACGCTCTTATCTTA 2338
Query 2339 GTAGACTGCCTGCGTCAATTGCTTCTGAGGAAGGTCTACTTTCATGTTTGAAGCCCCCAG 2398
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2339 GTAGACTGCCTGCGTCAATTGCTTCTGAGGAAGGTCTACTTTCATGTTTGAAGCCCCCTG 2398
Query 2399 TCACAAGGGAGGTAGTTTACCGTATCTTTGAAAAAGCCAGGAACCCAGAATTCATGGCGA 2458
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399 TCACAAGGGAGGTAGTTTATCGTATCTTTGAAAAAACCAGGAACCCAGAATTCATGGCGA 2458
Query 2459 AACAGCGAAAGATGTGGTATAGTTCTTCACCTCAATCCAAAGATTGGGAAACTGTTGATT 2518
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2459 AACAGCGAAAGATGTGGTATAGTTCTTCACCTCAGTCCAAAGATTGGGAATCTGTTGATT 2518
Query 2519 TGTTTGACAAAGATGCTGGGGAGTTGAATTCAATAGAATGCAGGGCCGAACAGAAGCAAA 2578
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 TGTTTGACAAAGATGCTGGGGAGTTGAATTCAGTAGAATGCAGGGCCGAACAGAAGCAAA 2578
Query 2579 GTGTGGAAGGACAGAAACAGATTAAGAGTGCATCGAAGCAACAAGAAGTTCAAGGAAAGT 2638
||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2579 GTGTGGAAGGAAAAAAACAGATTAAGAGTGCATCAAAGCAACCAGAAGTTCAAGGAAAGT 2638
Query 2639 ATGCAGAAAAGGATGCTAAATTAAGAATCCCGAGAAACCCAAGACCTAATGCTTCTAACA 2698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639 ATGCAGAAAAGGATGCTAAATTAAGAATCCCGAGAAACCCAAGACCTAATGCTTCTAACA 2698
Query 2699 CTGTTGAGCTACGTGATCCCGTGTATCCAGAGAAGTTACAGTTCTCTGGGTTTATGGCAC 2758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2699 CTGTTGAGCTACGTGATCCCGTGTATCCAGAGAAGTTACAGTTCTCTGGGTTTATGGCAC 2758
Query 2759 CATATGTATCTGGTATGAATAGCTTTATTGAACCAGAGAACATACCTCTCTATTCGTTTA 2818
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2759 CATATGTATCTGGTGCGAATAGCTTTATTGAACCAGAGAACATACCTCTCTATTCGTTTA 2818
Query 2819 GCATGGACAAACGAGCAGCTACAAATCCTCCTGTGGCTTCTGAGTCTTCATTGCAGATGA 2878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2819 GCATGGACAAACGAGCAGCTACAAATCCTCCTGTGGCTTCTGAGTCTTCATTGCAGATGA 2878
Query 2879 ACTCTCTGGGAATGGGTTCATTGTCTGTGCCATGGATGGATTCCATGAGTAAATCATTTA 2938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2879 ACTCTCTGGGAATGGGTTCATTGTCTGTGCCATGGATGGATTCCATGAGTAAATCATTTA 2938
Query 2939 ACTTGGCTAGTTCGGTCCCTGTGCCTAAGCTGATTTCTGGGTCATTCCATGTCGGTACCA 2998
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2939 ACTTGGCTAGTTCGGTCCCAGTGCCTAAGCTGATTTCTGGGTCATTCCATGTCGGTACCA 2998
Query 2999 ATCCTAAACAATTTTACAGAGTGGTACATGAGCCAGAAAGCAGAGAAAATGACCAAATCT 3058
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2999 ATCCTAAACAATTTTACAGAGTGGTACATGAGCCAGAAAGCAGAGAAAATGATCAAATCT 3058
Query 3059 CCTCAGCTATCAGTAAATTTCAAGACCTCGGAGTATCAAGCTCCTCAAAAAGTGCTTCTG 3118
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3059 CCTCAGCCATCAGTAAATTTCAAGACCTCGGAGTATCAAGCTCCTCAAAAAGTGCTTCTG 3118
Query 3119 TAACTTCAGAAGATGCTTCTTCTCCAGCGGATCTTGTAGGAGAACCATCTCTGTCAAGGA 3178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3119 TAACTTCAGAAGATGCTTCTTCTCCAGCGGATCTTGTAGGAGAGCCATCTCTGTCAAGGA 3178
Query 3179 CATCGGTTCCGGATTCAGGGTGGAAGCCTCGTGGAGTATTAGTTGCTCATCTACAGGAGC 3238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3179 CATCGGTTCCGGATTCAGGGTGGAAGCCTCGTGGAGTATTAGTTGCTCATCTACAAGAGC 3238
Query 3239 ATCGCTCTGCGGTCAACGACATCGCCACTTCAAGCGACCATAGCTTTTTTGTTAGTGCAT 3298
|||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3239 ATCGCTCTGCGGTCAATGACATTGCCACTTCAAGCGATCATAGCTTTTTTGTTAGTGCAT 3298
Query 3299 CAGATGATTCCACAGTGAAGGTGTGGGACTCTAGAAAACTGGAAAAGGACATCTCTTTTA 3358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3299 CAGATGATTCCACAGTGAAGGTGTGGGACTCTAGAAAACTGGAAAAGGACATCTCTTTTA 3358
Query 3359 GGTCAAGGCTAACATATCATCTCGAGGGAAGCAGAGGGATGTGCACAACAATGCTTCGGA 3418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3359 GGTCAAGGCTAACATATCATCTCGAGGGAAGCAGAGGGATGTGCACAACAATGCTTCGGA 3418
Query 3419 ATTCAACACAAGTTGTAGTTGGAGCCTCTGATGGTGTGATACATATGTTTTCAATCGACC 3478
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3419 ATTCAACGCAAGTTGTAGTTGGAGCCTCTGATGGTGTGATACATATGTTTTCAATTGACC 3478
Query 3479 ATATCTCCAGAGGCTTGGGGAACGTAGTGGAGAAGTATTCAGGCATTGTTGATATTAAAA 3538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 ATATCTCCAGAGGCTTGGGGAACGTAGTGGAGAAGTATTCAGGCATTGTTGATATTAAAA 3538
Query 3539 AGAAGGATGTTAAAGAAGGCGCTCTAGTTTCTCTCTTGAATTATACCGCTGATAGCCTTT 3598
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3539 AGAAAGATGTTAAAGAAGGCGCTCTAGTTTCTCTCTTGAATTATACTGCTGATAGCCTTT 3598
Query 3599 CTGGTCCGATGGTAATGTATAGTACCCAAAACTGCGGAATCCACCTTTGGGATACAAGAT 3658
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3599 CTGGTCCGATGGTAATGTATAGTACCCAAAACTGCGGAATCCACCTTTGGGATACAAGGT 3658
Query 3659 CAGATTTAGATGCATGGACACTGAAAGCAAACCCCGAAGAAGGATATGTGTCTTCATTGG 3718
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3659 CAGATTTAGATGCATGGACACTGAAAGCAAATCCTGAAGAAGGATATGTGTCTTCATTGG 3718
Query 3719 TTACAAGCCCTTGCGGGAATTGGTTTGTCTCTGGGTCTTCAAGGGGATTGCTTACTCTTT 3778
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3719 TTACAAGTCCTTGTGGGAATTGGTTTGTCTCTGGGTCTTCAAGGGGAGTGCTTACTCTTT 3778
Query 3779 GGGATTTGAGATTTCGTGTTCCTGTAAATTCGTGGCGATACCCTATCATATGCCCCATAG 3838
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||
Sbjct 3779 GGGATTTGAGATTTCGTGTTCCTGTAAATTCGTGGCAATACCCCATCATATGTCCCATAG 3838
Query 3839 AGAAGATGTGCCTCTGCTTTCTTCCTCCAAGCGTCTCAGTGTCCACCACTATGAAACCTT 3898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3839 AGAAGATGTGCCTCTGCTTTCTTCCTCCAAGCGTCTCAGTGTCCACCACTATGAAACCTT 3898
Query 3899 TTATTTATGTTGCTGCAGGTTGCAACGAAGTTTCACTCTGGAATGCAGAGGGAGGTAGCT 3958
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3899 TAATTTATGTTGCTGCCGGTTGCAACGAAGTTTCACTCTGGAATGCAGAGGGAGGTAGCT 3958
Query 3959 GTCACCAGGTATTGAGAGTAGCCAACTATGAAAATGAGACGGATGTTTCCGAGTTTCAAT 4018
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3959 GTCACCAGGTATTGAGAGTAGCCAATTATGAAAATGAGACGGATGTTTCCGAGTTTCAAT 4018
Query 4019 GGAAGTTACCAAGCAATAAGGTAAATCCCAAGCCGAATCTTCGCCAGAACATGAGCTCCA 4078
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 4019 GGAAGTTACCAAGCAATAAGGTAAATCCGAAGCCGAATCATCGTCAGAACATGAGCTCCA 4078
Query 4079 AGTACAGAATCGAAGAGTTGAACGAGCCTCCTCCTCGTCTTCCTGGTATCCGCTCTTTGC 4138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4079 AGTACAGAATCGAAGAGTTGAACGAGCCTCCTCCTCGTCTTCCTGGTATCCGCTCTTTGC 4138
Query 4139 TTCCTTTACCTGGAGGTGACTTGTTAACAGGTGGTACTGACTTGAAGATTCGGCGTTGGG 4198
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4139 TCCCTTTACCTGGAGGTGACTTGTTAACAGGTGGTACTGACTTGAAGATTCGGCGTTGGG 4198
Query 4199 ATTACTCCAGCCCTGAGAGAAGTTATTGTATATGCGGTCCGAGTTTGAAAGGAGTCGGAA 4258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4199 ATTACTCCAGCCCTGAGAGAAGTTATTGTATATGCGGTCCGAGTTTGAAAGGAGTCGGAA 4258
Query 4259 ATGATGATTTTTATGAAGTAAAAACCAACTCCGGCGTGCAATTTGTTCAGGAGACAAAGA 4318
|||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4259 ATGATGATTTCTATGAACTAAAAACCAACACGGGCGTGCAATTTGTTCAGGAGACAAAGA 4318
Query 4319 GACGGCCTCTGGCAACCAAACTGACAGCAAAGGCAGTACTTGCGGCTGCTGCCACAGACA 4378
||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4319 GACGGCCTCTGGCTACTAAACTGACGGCAAAGGCGGTACTTGCGGCTGCTGCGACAGACA 4378
Query 4379 CAGCAGGTTGTCACCGTGACTCAGTTCAGTCTCTGGCATCTGTGAAACTGAACCAGAGAC 4438
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4379 CAGCGGGTTGTCATCGTGACTCAGTTCAGTCTCTGGCATCTGTGAAGCTGAACCAGAGAC 4438
Query 4439 TGTTGATATCAAGCAGCAGAGATGGAGCCATTAAGATCTGGAAGTAA-G------TG--- 4488
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||
Sbjct 4439 TGTTGATATCAAGCAGCAGAGATGGAGCCATAAAGGTCTGGAAGTAAAGAAACCCTGACG 4498
Query 4489 -T---------ACAGTGTTATAGTGTTTATTTTTTAGTTTACCTTTTCATTGTAACATCA 4538
| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||
Sbjct 4499 GTCTTTCGTGTACAGTGTTATAGTGTTTATTTTAT--TTTACCTTGTCATTGTACCATCA 4556
Query 4539 AATGCTAAAAGAAATTTTTTAGCCTTGTATCCTTTT-ACTCGATAAACTTTCTTGTGCAG 4597
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 4557 AATGCTAAAAGAAATTTTTTAGCCTTGTATCCTTTTTACTCGATAAACTTCCTTGTACAG 4616
Query 4598 ATTTCTCCTTTGTA 4611
|||| ||| |||||
Sbjct 4617 ATTTTTCCATTGTA 4630
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 229965266712
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5