BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg492423 Length=2340 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT4G24280.1 | Symbols: cpHsc70-1 | chloroplast heat shock prote... 3742 0.0 AT5G49910.1 | Symbols: CPHSC70-2EAT SHOCK PROTEIN 70-2, HSC70-7... 2170 0.0 > AT4G24280.1 | Symbols: cpHsc70-1 | chloroplast heat shock protein 70-1 | chr4:12589988-12593630 FORWARD LENGTH=2456 Length=2456 Score = 3742 bits (2026), Expect = 0.0 Identities = 2251/2358 (95%), Gaps = 21/2358 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 GAAAAATGGCATCTTCCGCCGCCCAAATTCACGTCCTTGGCGGAATTGGATTCGCTTCTT 60 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 102 GAAAAATGGCATCTTCAGCCGCCCAAATCCACGTTCTCGGCGGAATTGGATTCGCTTCTT 161 Query 61 CTTCTTCTTCCAAGAGAAATCTTAATGGTAAAGGCGGTACCTTTATGCCGAGAAGTGCCT 120 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 162 CTTCTTCTTCCAAGAGAAATCTCAATGGTAAAGGCGGTACCTTTATGCCGAGAAGTGCCT 221 Query 121 TCTTCGGTACAAGAACCGGTCCTTTCTCAACACCCACTTCTGCTTTTCTCAGAATGGGCA 180 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 222 TCTTCGGTACAAGAACCGGTCCTTTCTCCACACCCACTTCTGCTTTTCTCAGAATGGGCA 281 Query 181 CCAGAAATGGCGGCGGCGCTTCTAGATACGCGGTTGGTCCGGTTCGTGTGGTTAACGAGA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 282 CCAGAAATGGCGGCGGCGCTTCTAGATACGCGGTTGGTCCGGTTCGTGTGGTTAACGAGA 341 Query 241 AGGTTGTTGGAATTGATTTGGGTACGACTAACTCCGCCGTTGCTGCTATGGAAGGAGGTA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| Sbjct 342 AGGTTGTTGGAATTGATTTGGGTACGACTAACTCTGCAGTAGCTGCTATGGAAGGAGGTA 401 Query 301 AGCCTACGATTGTTACTAACGCTGAAGGTCAGAGGACGACGCCGTCTGTGGTGGCTTACA 360 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| Sbjct 402 AGCCTACGATTGTGACTAACGCTGAAGGTCAGAGGACAACGCCTTCTGTTGTGGCTTACA 461 Query 361 CGAAGAGTGGTGATAGGCTTGTTGGGCAGATTGCGAAGAGGCAAGCTGTTGTTAATCCCG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 462 CGAAGAGTGGTGATAGGCTTGTTGGGCAGATTGCGAAGAGGCAAGCTGTTGTTAATCCCG 521 Query 421 AGAATACTTTCTTCTCCGTGAAGAGGTTTATTGGTAGGAAGATGAATGAGGTTGCTGAGG 480 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | Sbjct 522 AGAATACTTTCTTCTCAGTGAAGAGGTTTATTGGTAGGAAGATGAACGAGGTTGATGAAG 581 Query 481 AGTCTAAGCAGGTTTCTTATAGAGTTGTTAGAGATGAGAACGGGAATGTTAAGTTTGAGT 540 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct 582 AGTCTAAGCAGGTTTCTTACAGAGTTGTTAGAGATGAGAACAATAATGTTAAGCTTGAGT 641 Query 541 GTCCTGCCATTAACAAACAATTTGCTGCTGAGGAGATTTCAGCTCAGGTTTTGAGGAAAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct 642 GTCCTGCCATTAACAAACAATTTGCTGCTGAGGAGATTTCAGCTCAGGTTCTAAGGAAAC 701 Query 601 TTGTGGATGATGCCTCAAGATTCTTGAACGACAAAGTAACCAAGGCTGTCATTACTGTGC 660 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 702 TTGTGGATGATGCATCAAGATTCTTGAACGACAAAGTAACCAAGGCTGTCATCACTGTGC 761 Query 661 CTGCTTACTTCAACGACTCACAGAGGACAGCTACAAAAGATGCTGGTCGAATTGCTGGGT 720 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 762 CTGCTTACTTCAACGATTCACAGAGGACAGCTACAAAAGATGCTGGTCGAATTGCTGGGT 821 Query 721 TGGAAGTTCTTCGTATTATTAATGAGCCCACAGCTGCTTCGTTGGCTTATGGGTTTGACA 780 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 822 TGGAAGTTCTTCGTATTATCAATGAGCCCACAGCTGCTTCATTGGCTTATGGGTTTGACA 881 Query 781 GAAAAAG-CAATGAAACAATCCTAGTCTTTGATCTTGGTGGCGGTACCTTTGATGTCTCA 839 | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 882 G-AAAAGCCAATGAAACAATCCTAGTCTTCGATCTTGGTGGTGGTACCTTTGATGTCTCA 940 Query 840 GTGCTTGAGGTTGGTGATGGTGTGTTTGAAGTGCTTTCCACTTCTGGGGACACACATTTG 899 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 941 GTGCTTGAGGTTGGTGATGGTGTGTTTGAAGTGCTTTCCACTTCTGGCGACACACACTTG 1000 Query 900 GGTGGTGATGACTTCGACAAGAGAGTGGTTGATTGGCTTGCTGCAGAATTCAAGAAAGAT 959 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1001 GGTGGTGATGACTTTGACAAGAGAGTTGTTGATTGGCTTGCTGCAGAATTCAAGAAAGAC 1060 Query 960 GAAGGGATAGATCTTCTGAAAGACAAGCAAGCACTTCAGAGGTTAACAGAGGCAGCAGAA 1019 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1061 GAAGGGATAGATCTTCTGAAAGACAAGCAAGCTCTTCAGAGGTTAACAGAGGCAGCAGAA 1120 Query 1020 AAAGCTAAAATTGAGCTTTCCTCGCTGACTCAGACAAATATGAGCTTGCCATTTATCACC 1079 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct 1121 AAAGCTAAAATTGAGCTTTCTTCACTGACTCAGACAAATATGAGCTTACCTTTTATCACG 1180 Query 1080 GCCACAGCCGATGGACCTAAACACATAGAAACCACCCTCACACGTGCCAAGTTCGAAGAA 1139 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1181 GCCACAGCTGATGGACCTAAACACATAGAAACCACCCTCACACGTGCCAAGTTCGAAGAA 1240 Query 1140 TTGTGTTCAGATTTACTTGACAGGGTCAAGACTCCCGTCGAAAATTCCCTGAGGGATGCA 1199 |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||| Sbjct 1241 TTGTGTTCAGATTTACTTGACAGGGTCAGGACTCCTGTCGAGAATTCCCTGCGGGATGCA 1300 Query 1200 AAGCTCAGCTTCAAAGATATTGATGAAGTTATCCTTGTTGGTGGATCCACACGTATTCCT 1259 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1301 AAGCTCAGCTTCAAAGATATTGATGAAGTCATCCTTGTCGGTGGATCCACACGTATTCCT 1360 Query 1260 GCTGTTCAAGAACTCGTGAGGAAGGTGACTGGGAAAGAACCGAATGTCACAGTAAATCCT 1319 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1361 GCTGTTCAGGAACTCGTGAGGAAGGTGACTGGGAAAGAACCTAATGTTACAGTAAATCCT 1420 Query 1320 GATGAGGTTGTAGCTTTAGGTGCTGCAGTCCAGGCTGGTGTGCTTGCCGGAGATGTGAGT 1379 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1421 GACGAGGTTGTAGCGTTAGGTGCTGCAGTCCAGGCTGGTGTTCTTGCTGGAGATGTGAGT 1480 Query 1380 GACATTGTGCTTCTCGATGTGACACCGCTTTCCATTGGTTTGGAGACCCTTGGTGGTGTT 1439 |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1481 GACATTGTGCTTCTTGATGTGACACCGCTTTCGATTGGTTTGGAGACCCTAGGTGGTGTT 1540 Query 1440 ATGACTAAGATTATTCCAAGGAACACCACACTGCCTACTTCTAAATCAGAAGTCTTTTCA 1499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1541 ATGACTAAGATTATTCCAAGGAACACCACACTGCCTACTTCTAAATCAGAAGTCTTTTCA 1600 Query 1500 ACTGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGATTAATGTGTTGCAGGGTGAGAGGGAGTTT 1559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1601 ACTGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGATTAATGTGTTGCAGGGTGAGAGGGAGTTT 1660 Query 1560 GTTAGGGATAACAAGTCTCTTGGTAGCTTCCGTCTAGATGGTATTCCACCGGCACCACGT 1619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| Sbjct 1661 GTTAGGGATAACAAGTCTCTTGGTAGCTTCCGTCTAGATGGTATCCCCCCTGCACCACGT 1720 Query 1620 GGAGTTCCACAAATCGAAGTCAAATTTGACATTGATGCCAATGGAATTTTATCTGTCAGT 1679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1721 GGAGTTCCACAAATCGAAGTCAAATTTGACATTGATGCCAATGGAATTCTATCTGTCAGT 1780 Query 1680 GCTGTTGACAAGGGCACAGGAAAGAAGCAAGACATCACCATTACTGGCGCGAGTACATTG 1739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1781 GCTGTTGACAAGGGCACAGGAAAGAAGCAAGACATCACCATTACTGGCGCAAGTACATTG 1840 Query 1740 CCCAAGGATGAGGTAGACCAAATGGTCCAGGAAGCAGAAAGATTTGCAAAGGATGACAAG 1799 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1841 CCCAAGGATGAGGTAGACCAAATGGTCCAGGAGGCAGAAAGATTTGCAAAAGATGACAAA 1900 Query 1800 GAGAAGAGAGATGCAATCGACAC-AAAGAACCAGGCAGACTCAGTGGTGTATCAGACAGA 1858 ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 1901 GAGAAGAGAGACGCAATCGACACGAAA-AACCAAGCAGATTCAGTGGTGTACCAGACAGA 1959 Query 1859 GAAGCAACTGAAAGAACTTGGAGAGAAAATTCCAGGTGAAGTGAAAGAGAAGGTGGAGGC 1918 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1960 GAAGCAACTGAAAGAACTAGGAGAGAAAATTCCAGGTGAAGTGAAAGAGAAGGTGGAGGC 2019 Query 1919 TAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATAGGAAGCGAATCAACTCAGGAAATCAAAGACGC 1978 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| Sbjct 2020 TAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATAGGAAGTGGATCAACCCAAGAAATCAAAGACGC 2079 Query 1979 CATGGCTGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAGTCTCTATACAACCAGCCTGG 2038 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2080 CATGGCTGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAGTCTCTATACAACCAGCCTGG 2139 Query 2039 AGCTGGAGCACCAGGTGCAGGTCCTTCCCCGGGAGGTGAAGGTGCTTCTTCAGCAGATTC 2098 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| Sbjct 2140 AGCTGGAGGTCCAGGTGCAGGTCCTTCCCCGGGAGGCGAAGGTGCTTCATCAGGAGATTC 2199 Query 2099 ATCTTCAAGTAAAGGAGGAGATGGTGATGATGTGATCGATGCTGACTTCACAGACAGCAA 2158 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2200 ATCTTCAAGTAAAGGAGGAGATGGTGATGATGTGATCGATGCTGACTTCACAGACAGCCA 2259 Query 2159 ATGAGAAAGCAAACTAGGACGGCTTTGAAATTTATACATGGGATG---TG--A------- 2206 |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || | Sbjct 2260 ATGAGAAAACAAACTAGGAAGGCTTTGGAATTCATACATGGGATGCGATGGGAGAGACAA 2319 Query 2207 -T--TTT-GTAGGTTGGATTTGAGAACACAAATGAATTTAAGCAATGCTTGTGGACAACA 2262 | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2320 ATGATTTTGTAGGTTGGATTTGAGAACACAAATGAATTTAAGCAATGCTTGTGGACAACA 2379 Query 2263 TTTATTTGTCGTTAGAAGGAAGCAGTGTGGTTACAAGAGGATGATGTTTAATACATAATA 2322 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2380 TTTATTTGTCGTTAGAAGGAAGCAGTGTGGTTACA-GAGGATGATGTTTAATACATAATA 2438 Query 2323 ATATGCAAGCCTTCTCTT 2340 |||||||||||||||||| Sbjct 2439 ATATGCAAGCCTTCTCTT 2456 > AT5G49910.1 | Symbols: CPHSC70-2EAT SHOCK PROTEIN 70-2, HSC70-7, cpHsc70-2 | chloroplast heat shock protein 70-2 | chr5:20303414-20306469 FORWARD LENGTH=2387 Length=2387 Score = 2170 bits (1175), Expect = 0.0 Identities = 1761/2045 (86%), Gaps = 36/2045 (2%) Strand=Plus/Plus Query 6 ATGGCATCTTCCGCCGCCCAAATTCACGTCCTTGGCGGAATTGGATT--C-GCTTCTTCT 62 ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||| ||| Sbjct 57 ATGGCTTCCTCCGCCGCCCAAATTCACATCCTCGGCGGAATCGGATTCCCTACTTCGTCT 116 Query 63 TCTT-CT--TCCAAGAGAAATCTTAATGGTAAAGGCGGTACCTTTATGCCGA-GAAGTGC 118 |||| || |||| | ||| || | ||| | | || || || | |||| | Sbjct 117 TCTTCCTCCTCCACCAAAAACCTCGACAACAAAACCAATTCC---ATTCC-ACGAAGCGT 172 Query 119 CTTCTTCGG-TACAAGAACCGGTCCTTTCTCAACACCCACTTCTGCTTTTC-TCAGAATG 176 ||||||||| || ||||| |||||||| | || || || || || || | || | ||| Sbjct 173 CTTCTTCGGCAAC-AGAACAAGTCCTTTCACTACTCCAACCTCCGCCTTCCTTC-GTATG 230 Query 177 GGCAC-CAGAAATGGCGGCGGCGCTTCTAGATACGCGGTTGGTCCGGTTCGTGTGGTTAA 235 || || ||||| | | |||||| ||||| | |||||||| || ||||||||||| Sbjct 231 GG-ACGAAGAAA---CAACAACGCTTCCCGATACACCGTTGGTCCAGTCCGTGTGGTTAA 286 Query 236 CGAGAAGGTTGTTGGAATTGATTTGGGTACGACTAACTCCGCCGTTGCTGCTATGGAAGG 295 |||||| || || ||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| Sbjct 287 CGAGAAAGTCGTCGGAATCGATTTAGGCACGACGAATTCAGCTGTTGCTGCTATGGAAGG 346 Query 296 AGGTAAGCCTACGATTGTTACTAACGCTGAAGGTCAGAGGACGACGCCGTCTGTGGTGGC 355 |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| ||||| Sbjct 347 AGGTAAACCAACGATTGTGACTAACGCTGAAGGTCAAAGAACTACACCTTCTGTTGTGGC 406 Query 356 TTACACGAAGAGTGGTGATAGGCTTGTTGGGCAGATTGCGAAGA-GGCAAGCTGTTGTTA 414 ||| || |||||| ||||| |||||||| |||||||| || | | ||||||||||||| Sbjct 407 TTATACTAAGAGTAAAGATAGACTTGTTGGTCAGATTGCTAA-ACGTCAAGCTGTTGTTA 465 Query 415 ATCCCGAGAATACTTTCTTCTCCGTGAAGAGGTTTATTGGTAGGAAG-ATGAATGAGGTT 473 |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| Sbjct 466 ATCCGGAGAATACTTTCTTCTCTGTTAAGAGGTTTATTGGTA-GAAGAATGAATGAAGTT 524 Query 474 GCTGAGGAGTCTAAGCAGGTTTCTTATAGAGTTGTTAGAGATGAGAACGGGAATGTTAAG 533 ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| Sbjct 525 GCTGAAGAGTCTAAGCAGGTTTCTTATAGAGTTATTAAAGATGAGAATGGTAATGTTAAG 584 Query 534 TTTGAGTGTCCTGCCATTAACAAACAATTTGCTGCTGAGGAGATTTCAGCTCAGGTTTTG 593 |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 585 CTTGATTGTCCTGCTATTGGTAAACAATTTGCTGCTGAGGAGATTTCTGCTCAGGTTTTG 644 Query 594 AGGAAACTTGTGGATGATGCCTCAAGATTCTTGAACGACAAAGTAACCAAGGCTGTCATT 653 ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| Sbjct 645 AGGAAGCTTGTGGATGATGCTTCGAGATTTTTGAATGATAAAGTAACGAAAGCTGTCATC 704 Query 654 ACTGTGCCTGCTTACTTCAACGACTCACAGAGGACAGCTACAAAAGATGCTGGTCGAATT 713 |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 705 ACTGTGCCTGCTTACTTCAATGATTCACAAAGGACGGCTACTAAAGATGCTGGTCGTATT 764 Query 714 GCTGGGTTGGAAGTTCTTCGTATTATTAATGAGCCCACAGCTGCTTCGTTGGCTTATGGG 773 ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| Sbjct 765 GCTGGATTGGAAGTTCTTAGGATTATTAATGAGCCTACTGCTGCTTCTTTGGCTTATGGG 824 Query 774 TTTGACAGAAAAAGCAATGAAACAATCCTAGTCTTTGATCTTGGTGGCGGTACCTTTGAT 833 ||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct 825 TTTGAGAGGAAAAGCAATGAAACTATTCTTGTTTTTGATCTTGGTGGTGGTACTTTTGAT 884 Query 834 GTCTCAGTGCTTGAGGTTGGTGATGGTGTGTTTGAAGTGCTTTCCACTTCTGGGGACACA 893 |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| Sbjct 885 GTCTCAGTCCTTGAGGTTGGTGACGGTGTTTTTGAAGTGCTTTCGACTTCTGGTGATACA 944 Query 894 CATTTGGGTGGTGATGACTTCGACAAGAGAGTGGTTGATTGGCTTGCTGCAGA-ATTCAA 952 |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| Sbjct 945 CATTTGGGAGGTGATGACTTTGACAAGAGAGTCGTTGATTGGCTTGCTTCA-ACCTTCAA 1003 Query 953 GAAAGATGAAGGGATAGATCTTCTGAAAGACAAGCAAGCACTTCAGAGGTTAACAGAGGC 1012 ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| Sbjct 1004 GAAGGATGAAGGTATAGATCTTCTCAAAGACAAGCAAGCGCTTCAGAGGTTGACGGAGGC 1063 Query 1013 AGCAGAAAAAGCTAAAATTGAGCTTTCCTCGCTGACTCAGACAAATATGAGCTTGCCATT 1072 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || Sbjct 1064 AGCTGAAAAAGCTAAAATTGAGCTTTCCTCACTGACTCAGACAAACATGAGTTTGCCTTT 1123 Query 1073 TATCACCGCCACAGCCGATGGACCTAAACACATAGAAACCACCCTCA-CACGTGCCAAGT 1131 |||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||| || | | ||||| Sbjct 1124 TATCACTGCAACGGCTGATGGGCCTAAGCACATTGAAACCACTCTCACCA-GGGGCAAGT 1182 Query 1132 TCGAAGAATTGTGTTCAGATTTACTTGACAGGGTCAAGACTCCCGTCGAAAATTCCCTGA 1191 | ||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| || || || |||||||||| Sbjct 1183 TTGAAGAATTGTGCTCTGACTTACTCGACAGGGTCAGGACACCTGTGGAGAATTCCCTGA 1242 Query 1192 GGGATGCAAAGCTCAGCTTCAAAGATATTGATGAAGTTATCCTTGTTGGTGGATCCACAC 1251 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 1243 GGGATGCAAAACTCAGCTTCAAAGATATTGATGAGGTGATCCTTGTTGGTGGATCCACAC 1302 Query 1252 GTATTCCTGCTGTTCAAGAACTCGTGAGGAAGGTGACTGGGAAAGAACCGAATGTCACAG 1311 |||| ||||||||||| || || || |||||| |||| || |||||||| |||||| ||| Sbjct 1303 GTATCCCTGCTGTTCAGGATCTTGTAAGGAAGCTGACAGGAAAAGAACCCAATGTCTCAG 1362 Query 1312 TAAATCCTGATGAGGTTGTAGCTTTAGGTGCTGCAGTCCAGGCTGGTGTGCT-TGCCGGA 1370 | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | | ||| Sbjct 1363 TCAATCCTGATGAAGTTGTAGCTTTAGGTGCTGCAGTTCAGGCCGGTGTTCTAT-CAGGA 1421 Query 1371 GATGTGAGTGACATTGTGCTTCTCGATGTGACACCGCTTTC-CATTGGTTTGGAGACCCT 1429 ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || | |||||||||| || || Sbjct 1422 GATGTGAGTGACATTGTTCTTCTTGATGTGACGCCGCTATCGC-TTGGTTTGGAAACTCT 1480 Query 1430 TGGTGGTGTTATGACTAAGATTATTCCAAGGAACACCACACTGCCTACTTCTAAATCAGA 1489 ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| Sbjct 1481 TGGTGGTGTCATGACCAAGATCATTCCAAGAAACACCACACTTCCAACTTCTAAGTCAGA 1540 Query 1490 AGTCTTTTCAACTGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGATTAATGTGTTGCAGGGTGA 1549 |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1541 AGTCTTCTCAACTGCTGCAGATGGACAGACAAGCGTTGAGATTAATGTGTTACAGGGTGA 1600 Query 1550 GAGGGAGTTTGTTAGGGATAACAAGTCTCTTGGTAGCTTCCGTCTAGATGGTATTCCACC 1609 ||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1601 GAGAGAGTTCGTAAGAGATAACAAGTCTATTGGTAGCTTCCGTCTTGATGGTATTCCACC 1660 Query 1610 GGCACCACGTGGAGTTCCACAAATCGAAGTCAAATTTGACATTGATGCCAATGGAATTTT 1669 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | Sbjct 1661 TGCACCACGTGGAGTTCCACAAATCGAGGTCAAATTCGACATTGATGCCAATGGAATTCT 1720 Query 1670 ATCTGTCAGTGCTGT-TGACAAGGGCACAGGAAAGAAGCAAGACATCACCATTACTGGCG 1728 ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct 1721 ATCTGTCAGTGCT-TCGGACAAAGGTACAGGAAAGAAGCAGGACATCACCATTACTGGTG 1779 Query 1729 CGAGTACATTGCCCAAGGATGAGGTAGACCA-AATGGTCCAGGAAGCAGAAAGATTTGCA 1787 | ||||| || || |||||||||||||| || |||||| || |||||||| || |||||| Sbjct 1780 CTAGTACCTTACCAAAGGATGAGGTAGA-CACAATGGTGCAAGAAGCAGAGAGGTTTGCA 1838 Query 1788 AAGGATGACAAGGAGAAGAGAGATGCAATCGACACAAAGAACCAGGCAGACTCAGTGGTG 1847 ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct 1839 AAGGAAGACAAAGAAAAGAGAGATGCGATTGACACAAAGAACCAGGCTGACTCCGTCGTT 1898 Query 1848 TATCAGACAGAGAAGCAACTGAAAGAACTTGGAGAGAAAATTCCAGGTGAAGTGAAAGAG 1907 || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1899 TACCAGACAGAGAAGCAGCTTAAAGAACTTGGAGAGAAAATTCCAGGTCCAGTGAAAGAA 1958 Query 1908 AAGGTGGAGGCTAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATAGGAAGCGAATCAACTCAGGAA 1967 ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| ||| Sbjct 1959 AAGGTTGAGGCTAAGCTCCAAGAGCTGAAGGAGAAGATAGCAAGCGGATCAACTCAAGAA 2018 Query 1968 ATCAAAGACGCCATGGCTGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAGTCTCTATAC 2027 ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 2019 ATCAAAGACACCATGGCAGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGCCAGTCTCTGTAC 2078 Query 2028 AACCA 2032 ||||| Sbjct 2079 AACCA 2083 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 116164061130 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5