BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg492801

Length=4326
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT4G20850.1 | Symbols: TPP2 | tripeptidyl peptidase ii | chr4:1...  7005    0.0  


> AT4G20850.1 | Symbols: TPP2 | tripeptidyl peptidase ii | chr4:11160721-11169889 
REVERSE LENGTH=4357
Length=4357

 Score = 7005 bits (3793),  Expect = 0.0
 Identities = 4143/4311 (96%), Gaps = 28/4311 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGGATCTGAGTCTGCAGCTGCAGGTCCACGGCGCGTTAAT---CAAAGGCCCGTCGTGT  57
             |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||||
Sbjct  1     ATGGATCTGAGTCTGCAGCTGCAGATTCACGGCGCGTTAATCAACAAAGGCCCGTCGTGT  60

Query  58    Ccttcttattgggcttcctcttcttcttcactctctcttcttcctcgtggtttcatttct  117
              ||||||||||||| |  |||||||||||||| | || ||||||||| | ||||||||||
Sbjct  61    ACTTCTTATTGGGC-T--TCTTCTTCTTCACT-T-TC-TCTTCCTCGCGATTTCATTTCT  114

Query  118   tcttctccgtttcttcttcATCGAAGACTC---AGAAGAAGCTGCTCTCGTTCTCGTGGA  174
             |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  115   TCTTCTACGTTTCTTCTTCATCGAAGACTCAGAAGAAGAAGCTGCTCTCGTTCTCGTGGA  174

Query  175   ATTCGATTAAGGCGGAGTCGTTTCTCGGCGATGCCTTGTTCTTCTTCTGATACTCTTACG  234
             || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  175   ATCCGATTAAGACGGAGTGGTTTCTCGGCGATGCCTTGTTCTTCTTCTGATACTCTTACG  234

Query  235   GCTTCTCGCGTCGGTTGTGGCGGAGGAggtggtggtggtg--g-tggcggtggAGCTGAT  291
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| 
Sbjct  235   GCTTCTCGCGTCGGTTGTGGCGGAGGAGGTGGTGGTGGAGCCGTTGGCGGTGGAGCTGAG  294

Query  292   AATGCTTCTGTCGCTAATTTCAAGCTCAACGAATCTA-CTTTCCTTGCTTCTCTCATGCC  350
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||
Sbjct  295   AATGCTTCTGTCGCTAATTTCAAGCTGAACGAATCTACCTTT-ATTGCTTCTCTCATGCC  353

Query  351   TAAGAAAGAAATCCGTGCGGATCGCTTCATCGAAGCTCATCCTGAGTACGACGGTCGTGG  410
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  354   TAAGAAAGAAATCCGTGCGGATTGCTTCATCGAAGCTCATCCTGAGTACGACGGTCGTGG  413

Query  411   CGTCGTCATCGCTATCTTTGATTCTGGTTTTGATCCTTCTGCTGCTGGCTTGCATGTAAC  470
             ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414   CGTTGTTATAGCTATCTTTGATTCTGGTTTTGATCCTTCTGCTGCTGGCTTGCATGTAAC  473

Query  471   TTCTGATGGAAAACCCAAGGTTTTGGACGTCATTGACTGCACTGGAAGTGGGGATATAGA  530
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  474   TTCTGATGGAAAACCCAAGGTTTTGGACGTCATTGACTGCACTGGAAGTGGAGATATAGA  533

Query  531   TACATCCACAGTGGTGAAAGCCAATGAAGATGGTCAAATTCGTGGAGCATCAGGAGCACC  590
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
Sbjct  534   TACATCCACAGTGGTGAAAGCCAATGAAGATGGTCATATTCGTGGAGCATCAGGGGCAAC  593

Query  591   TTTGGTTGTCAATTCTTCATGGAAAAATCCCACTGGAGAGTGGCGTGTAGGTTCCAAGTT  650
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  594   TTTGGTTGTCAATTCTTCATGGAAAAATCCCACTGGAGAGTGGCGTGTAGGTTCCAAGTT  653

Query  651   GGTTTATCAGTTATTTACAGATGACTTAACTTCTCGTGTGAAGAAAGAGAGAAGGAAATC  710
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654   GGTTTATCAGTTATTTACAGATGACTTGACTTCTCGTGTGAAGAAAGAGAGAAGGAAATC  713

Query  711   TTGGGATGAAAAGAATCAGGAAGAAATTGCAAAGGCTGTAAACAATCTATATGATTTCGA  770
              |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct  714   CTGGGATGAAAAGAATCAGGAGGAAATTGCCAAGGCTGTAAATAATCTGTATGATTTCGA  773

Query  771   TCAGAAGCACAGCAAGGTGGAAGATGCGAAATTGAAGAAAACCCGTGAAGACCTCCAAAG  830
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  774   TCAGAAGCACAGCAAGGTGGAAGATGCGAAATTGAAGAAAACTCGTGAAGACCTCCAAAG  833

Query  831   CAAAGTTGATTTTCTGAAAAAACAAGCTGATAAATATGAAGACAAAGGGCCTGTTATTGA  890
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  834   CAAAGTTGATTTTCTGAAAAAACAAGCTGATAAATATGAAGACAAAGGGCCTGTTATTGA  893

Query  891   TGCTGTTGTGTGGCATGATGGAGAAGTATGGAGGGTTGCACTTGATACACAGAGTCTGGA  950
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  894   TGCTGTTGTGTGGCATGATGGAGAAGTATGGAGGGTTGCACTTGATACACAGAGTCTGGA  953

Query  951   AGAGGATCCAGATAGCGGGAAACTAGCAGACTTCTCCCCCCTGACTAACTACCGAATTGA  1010
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  954   AGAGGATCCAGATAGCGGGAAACTAGCAGACTTCTCCCCACTGACTAACTACCGAATTGA  1013

Query  1011  GCGGAAGTATGGCGTGTTTAGCCGACTAGATGCATGCTCCTTTGTTGCTAACGTGTATGA  1070
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1014  ACGGAAGTATGGCGTGTTTAGCCGACTAGATGCATGCTCCTTTGTTGCTAACGTGTATGA  1073

Query  1071  TGAGGGGAAGGTTCTAAGCATTGTAACTGATAGTTCTCCTCATGGCACTCATGTTGCTGG  1130
             |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  1074  TGAGGGAAAGGTTCTAAGCATTGTAACTGATAGTTCTCCTCACGGCACTCATGTTGCTGG  1133

Query  1131  AATAGCTACTGCACACCACCCTGAGGAGCATTTGTTAAATGGTGTGGCACCTGGTGCACA  1190
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1134  AATAGCTACTGCACACCACCCTGAGGAGCATTTGTTAAATGGTGTGGCACCTGGTGCACA  1193

Query  1191  GATAATATCTTGCAAAATTGGAGACTCGCGATTAGGTTCAATGGAGACCGGAACTGGATT  1250
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1194  AATAATATCTTGCAAAATTGGAGACTCGCGATTAGGTTCAATGGAGACCGGAACTGGATT  1253

Query  1251  GAGTCGGGCATTGATAGCTGCCCTGGAGCATAACTGTGATCTTGTCAACATGAGCTATGG  1310
             || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1254  GACTCGGGCATTGATAGCTGCCCTAGAGCATAACTGTGATCTTGTCAACATGAGCTATGG  1313

Query  1311  AGAGCCAGCATTACTTCCAGACTATGGGCGCTTTGTTGATCTTGTTACTGAAGCTGTGAA  1370
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1314  AGAGCCAGCATTACTTCCAGACTATGGGCGCTTTGTTGATCTTGTTACTGAAGCTGTGAA  1373

Query  1371  CAAGAGACGCCTAATATTTGTAAGTAGTGCTGGCAACAGTGGTCCAGCTTTGACAACGGT  1430
             ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  1374  CAAGAGACGTCTAATTTTTGTAAGTAGTGCTGGCAACAGTGGTCCAGCTTTGACAACAGT  1433

Query  1431  AGGAGCACCGGGTGGAACGACGTCCAGTATCATCGGGGTTGGTGCATATGTTTCTCCTGC  1490
              ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1434  CGGAGCACCGGGTGGAACAACGTCCAGTATCATTGGGGTTGGTGCGTATGTTTCTCCTGC  1493

Query  1491  AATGGCAGCCGGTGCCCATTCAGTGGTGGAACCTCCCAGTGAGGGGCTTGAATACACTTG  1550
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1494  AATGGCAGCAGGTGCCCATTCAGTGGTGGAACCTCCCAGTGAGGGGCTTGAATACACTTG  1553

Query  1551  GTCAAGCCGGGGGCCAACATCTGATGGGGATCTTGGTGTCTGCATAAGTGCACCTGGTGG  1610
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1554  GTCAAGCCGGGGGCCAACATCTGATGGAGATCTTGGTGTCTGCATAAGTGCACCTGGTGG  1613

Query  1611  GGCTGTTGCTCCTGTTCCTACATGGACGCTTCAAAGACGCATGCTCATGAATGGAACATC  1670
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1614  GGCTGTTGCTCCTGTTCCTACATGGACGCTTCAAAGACGCATGCTCATGAATGGAACATC  1673

Query  1671  AATGGCATCTCCTTCTGCCTGTGGAGCAATTGCGTTACTTCTAAGTGCTATGAAGGCTGA  1730
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1674  AATGGCATCTCCTTCTGCCTGTGGGGCAATTGCGTTACTTCTAAGTGCTATGAAGGCTGA  1733

Query  1731  GGGCATCCCAGTTAGCCCGTACAGTGTGAGAAGGGCCCTTGAGAATACATCTACACCTGT  1790
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct  1734  GGGCATCCCAGTTAGCCCGTACAGTGTGAGAAGGGCCCTTGAAAATACATCTACACCAGT  1793

Query  1791  AGGTGATCTACCTGAAGATAAACTAACTACTGGACAAGGGCTTATGCAAGTTGATAAGGC  1850
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1794  AGGTGATCTACCTGAAGATAAACTAACTACTGGACAAGGGCTTATGCAAGTTGATAAGGC  1853

Query  1851  ATATGAATACTTAAAAAAGTTTCAGGACTATCCATGCGTATTTTATCAGATAAAGGTCAA  1910
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1854  ATATGAATACTTAAAACAGTTTCAGGACTATCCATGCGTATTTTATCAGATAAAGGTCAA  1913

Query  1911  TCTCTCCGGGAAAACAATTCCAACATCACGGGGCATCTACCTGCGGGAGGGTACTTCTTG  1970
             ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1914  TCTCTCCGGTAAAACAATTCCAACATCACGAGGCATCTACCTGCGGGAGGGTACTGCTTG  1973

Query  1971  CAGACAGTCTACTGAGTGGACGGTACAAGTTGATCC-AAAGTTCCATGAAGGTGCAAGTA  2029
             |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct  1974  CAGACAGTCTACTGAGTGGACAATACAAGTTGATCCGAAA-TTCCATGAAGGTGCAAGTA  2032

Query  2030  ATTTAAAGGAACTTGTCCCTTTTGAGGAATGTCTTGAGTTGCACTCCACAGATGAAGGAG  2089
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2033  ATTTAAAGGAACTTGTCCCTTTCGAGGAATGTCTTGAGTTGCACTCCACAGATGAAGGAG  2092

Query  2090  TTGTACGGGCTCCTGACTATCTCCTTCTCACTCATAACGGACGTAGCTTCAACGTTGTTG  2149
             ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct  2093  TTGTACGGGTTCCTGACTATCTCCTTCTCACTAATAATGGACGTGGCTTCAACGTTGTTG  2152

Query  2150  TGGATCCCACAAATCTTGGTGATGGTGTGCATTACTTTGAAGTTTATGGGATTGATTGCA  2209
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2153  TGGATCCCACAAATCTTGGGGATGGTGTGCATTACTTTGAAGTTTATGGGATTGATTGCA  2212

Query  2210  AAGCACCAGAGCGTGGTCCTCTTTTCAGAATCCCAGTAACAATAATAATTCCCAAGACTG  2269
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2213  AAGCACCAGAGCGTGGTCCCCTTTTCAGAATCCCAGTAACAATAATAATTCCCAAGACTG  2272

Query  2270  TGGCAAATCGACCTCCTGTTATCTCATTTCAGCAAATGTCTTTCATCTCAGGCCACATTG  2329
             ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2273  TGGCAAATCAACCTCCAGTTATTTCATTTCAGCAAATGTCTTTCATCTCAGGCCACATTG  2332

Query  2330  AACGAAGATATATTGAGGTACCACAAGGAGCAACATGGGCTGAGGCTACAATGCGAACTT  2389
             ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2333  AACGAAGATATATCGAGGTACCACATGGAGCAACATGGGCTGAGGCTACAATGCGAACTT  2392

Query  2390  CAGGGTTTGATACTACACGACGATTTTATATTGATACACTTCAGCTTTGCCCATTGCGAA  2449
             | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  2393  CGGGGTTTGATACTACACGACGATTTTACATTGATACACTTCAGGTTTGCCCATTGCGAA  2452

Query  2450  GGCCTATCAAGTGGGAGAGCGCATCAACTTTCGCATCTCCGTCTGCGAAAAGCTTTGCGT  2509
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct  2453  GGCCTATCAAGTGGGAGAGCGCACCAACTTTCGCATCTCCGTCTGCTAAAAGCTTTGTGT  2512

Query  2510  TTCCTGTGGTTAGTGGTCAAACGATGGAACTAGCTATAGCTCAATTCTGGTCAAGTGGCC  2569
             | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  2513  TCCCTGTGGTTAGTGGTCAAACGATGGAACTAGCTATAGCTCAATTTTGGTCAAGTGGCC  2572

Query  2570  TTGGAAGTCGTGAACCAACTATCGTTGATTTTGAGATTGAATTCCATGGAGTTGGTGTCG  2629
             | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2573  TCGGAAGTCGTGAACCAACTATCGTTGACTTTGAGATTGAATTCCATGGAGTTGGTGTCG  2632

Query  2630  ATAAAGAAGAATTGTTACTTGATGGAAGTGAAGCACCAATAAAAGTTGAAGCTGAAGCAC  2689
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2633  ATAAAGAAGAATTGTTACTTGATGGAAGTGAAGCACCAATAAAAGTTGAAGCTGAAGCAC  2692

Query  2690  TATTGGCATCTGAAAAACTTGTTCCCATAGCTGTCCTGAACAAGATAAGAGTCCCGTATC  2749
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||
Sbjct  2693  TATTGGCATCTGAAAAACTTGTTCCCATAGCTGTCCTGAACAAGATACGAGTTCCATATC  2752

Query  2750  AACCTATTGATGCACAACTGAAGACTCTATCAACTGGCCGTGATAGACTACTGTCGGGCA  2809
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2753  AGCCTATTGATGCACAACTGAAGACTCTATCAACTGGCCGTGATAGACTACTGTCGGGCA  2812

Query  2810  AACAGATACTAGCATTGACCTTAACCTACAAGTTCAAATTAGAAGATTCAGCTGAAGTAA  2869
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  2813  AACAGATACTAGCATTGACCTTAACCTACAAGTTCAAATTAGAAGATTCAGCTGAAGTGA  2872

Query  2870  AACCGTATATACCATTATTGAACAATCGCATATATGACACAAAATTTGAGTCCCAGTTTT  2929
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2873  AACCGTATATACCATTATTGAACAATCGCATATATGACACAAAATTTGAGTCCCAGTTTT  2932

Query  2930  ATATGATCTCTGATGCCAACAAGCGTGTATATGCCATGGGTGATGTTTATCCTGAGTCTT  2989
              ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  2933  TTATGATCTCTGATACTAACAAGCGTGTATATGCAATGGGTGACGTTTATCCTGAGTCTT  2992

Query  2990  CTAAACTTCCCAAGGGAGAATATAAACTTCAGCTGTATCTGAGGCATGAAAATGTGCAGC  3049
             | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  2993  CAAAACTTCCCAAGGGAGAGTATAAACTTCAGCTGTATCTGAGGCATGAAAATGTGGAGC  3052

Query  3050  TGCTGGAAAAGTTGAAGCAGCTCATTTTGTTTATTGAAAGAAATATGGGGGAGATTCGGC  3109
             |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3053  TGCTGGAAAAGTTGAAGCAGCTCACTGTGTTTATTGAAAGAAATATGGGGGAGATTCGGC  3112

Query  3110  TGAATTTACATTCTGAACCAGATGGTCCGTTCACAGGAAATGGTGCCTTTAAGTCCTCTA  3169
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  3113  TGAATTTACATTCTGAACCAGATGGTCCGTTCACTGGAAATGGTGCCTTTAAGTCCTCTG  3172

Query  3170  TTCTAATGCCAGGGGTGAAGGAAGCGTTTTATCTGGGCCCACCAACAAAAGACAAGTTAC  3229
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct  3173  TTCTAATGCCAGGGGTGAAGGAAGCATTTTATCTGGGCCCACCAACAAAGGACAAGCTAC  3232

Query  3230  CCAAGAATACTCCCCAAGGATCTGTGTTGGTGGGAGAAATCTCATATGGCAAATTGTCAT  3289
             |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  3233  CCAAGAATACCCCCCAAGGATCTATGTTGGTGGGAGAAATCTCATATGGGAAATTGTCAT  3292

Query  3290  TTGATGATAAAGAAGGGAAGAATCCAAAGGATAATCCTGTATCTTATCCGATATCATATG  3349
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  3293  TTGATGAAAAAGAAGGGAAGAATCCAAAGGATAATCCGGTATCTTATCCGATATCATATG  3352

Query  3350  TGGTTCCACCAAATAAGCCTGAGGAAGATAAAAAGGCAGCTTCTGCTCC-AGATTGCTCT  3408
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||
Sbjct  3353  TGGTTCCACCAAATAAGCCTGAGGAAGATAAGAAGGCAGCTTCTGCCCCTAC-TTGCTCT  3411

Query  3409  AAATCAGTATCAGAACGCTTGGAACAAGAGGTTCGTGATACAAAAATCAAATTTCTTGGG  3468
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||
Sbjct  3412  AAATCAGTATCAGAACGCTTGGAACAAGAGGTTCGCGACACAAAGATCAAATTTCTTGGG  3471

Query  3469  AACCTAAAACAAGAAACTGAGGAAGAGCGTTCAGAGTGGAAAAAGTTGTGTGCCTGTCTC  3528
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct  3472  AATCTAAAACAAGAAACTGAGGAAGAGCGTTCAGAGTGGAGAAAGTTGTGTACCTGTCTC  3531

Query  3529  AAGTCTGAATACCCAAACTACACTCCATTACTAGCTAAGATCCTGGAAGGTTTACTGTCT  3588
             ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3532  AAGTCTGAATACCCAGACTATACTCCATTACTAGCTAAGATCCTGGAAGGTTTACTGTCT  3591

Query  3589  CGATCTGATGCTGGGGACAAAATCAGCCATCACGAAGAGATTATAGAAGCTGCAAACGAA  3648
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3592  CGGTCTGATGCTGGGGACAAAATCAGCCATCACGAAGAGATTATAGAAGCTGCAAACGAA  3651

Query  3649  GTAGTACGCAGTGTTGACGTAGATGAGTTAGCAAGATTCTTGCTAGACAAAACTGAACCA  3708
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3652  GTAGTACGCAGTGTTGACGTAGATGAGCTAGCAAGATTCTTGCTAGACAAAACTGAACCA  3711

Query  3709  GAAGATGCTGAAGCAGAGAAATTGAAGaaaaaaaTGGAGATGACACGTGATCAACTGGCA  3768
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| 
Sbjct  3712  GAAGATGATGAAGCAGAGAAATTGAAGAAAAAAATGGAGGTGACACGTGATCAACTGGCG  3771

Query  3769  GATGCACTATACCAGAAAGGATTAGCCATGGCGAGAATCGAGAATCTGAAAGGTGAGAAG  3828
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  3772  GATGCACTATACCAGAAAGGGTTAGCCATGGCGAGAATCGAGAATCTGAAGGGTGAGAAG  3831

Query  3829  GGAGATGAAGGAGAAGAAGAAAGTAGTCAGAGGGATAAATTCGAAGAGAACTTCAAAGAA  3888
             | || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  3832  GAAGGTGAAGGAGAAGAAGAAAGTAGCCAGAAGGATAAATTCGAAGAGAATTTCAAAGAA  3891

Query  3889  CTGACAAAATGGGTAGACGTGAAATCATCTAAATATGGTACTCTCACTGTTCTAAGAGAG  3948
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3892  CTGACAAAATGGGTAGACGTGAAATCATCTAAATACGGTACTCTCACTGTTCTAAGAGAG  3951

Query  3949  AAACGGCTCTCACGACTCGGGACCGCATTGAAGGTACTTGATGACTTGATCCAAAACGAG  4008
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3952  AAACGGCTATCACGACTCGGGACCGCATTGAAGGTACTTGATGACTTGATCCAAAACGAG  4011

Query  4009  AACGAGACTGCGAATAAGAAACTCTACGAACTGAAACTGGGTTTGCTGGAGGAACTAGGT  4068
             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct  4012  AACGAGACTGCGAATAAGAAACTCTACGAACTTAAACTGGATTTGCTGGAGGAAATAGGT  4071

Query  4069  TGGAGCCATTTGGTTACGTATGAGAAGCAATGGATGCAGGTTAGTTTCCCTACAAGCTTA  4128
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||
Sbjct  4072  TGGAGCCATTTGGTTACGTATGAGAAGCAATGGATGCAGGTTCGTTTCCCTAAAAGCCTA  4131

Query  4129  CCCCTCTTTTAGTAGTTGTTTCTACCTTCTTGTCCAATAAAAGCTTGTCCAGAACATATA  4188
             |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  4132  CCCCTCTTTTAGTAGTTGTTGCTACCTTCTTGTTCAATAAAAGCTTATCCAGAACATATA  4191

Query  4189  GT-GCTAAGTTCTTGTTCAATAAAAGCTTGTCCAGAACATTTAGTTCGTTGTTTTTCTAA  4247
             || || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||
Sbjct  4192  GTTGC-AAGTTCTTGTTCAATAAAAGCTTGTCCAGAACAAATAGTTCGTTGTTTTTCGAA  4250

Query  4248  AACCCAAACTACTGT-TTGATTTTCTCTGTCTTTAGAAACTGTATGTTCTT  4297
             | ||||||||||||| || |||||||  |||  || |||||||||||||||
Sbjct  4251  A-CCCAAACTACTGTCTT-ATTTTCT--GTCCGTATAAACTGTATGTTCTT  4297



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 215667687957


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5