BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg494223
Length=4368
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G47490.1 | Symbols: | RGPR-related | chr5:19264675-19270800... 6767 0.0
AT5G47480.1 | Symbols: | RGPR-related | chr5:19257420-19263424... 2558 0.0
> AT5G47490.1 | Symbols: | RGPR-related | chr5:19264675-19270800
FORWARD LENGTH=4399
Length=4399
Score = 6767 bits (3664), Expect = 0.0
Identities = 4181/4419 (95%), Gaps = 82/4419 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCTTCGGCTTCTCAATTCCTGCTGGAGGATCAAACGGATGAGGATTTCTTCGACAAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTCGGCTTCTCAATTCCTGCTGGAGGATCAGACGGATGAGGATTTCTTCGACAAG 60
Query 61 CTTGTTGATGATGCTTATTCTCCCGGCGAAGCTCAGGCTTCATCCTCTGTGACGGAGCTC 120
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTTGTTGATGATGCTTATTCTCCCACCGAAGCTCAGGCTTCATCCTCTGTGACGGAGCTG 120
Query 121 AAGTTTGACGACGAAAGTGACTCCGATGAT-TCCAGAGCTTTTTCCAATCTCTCCATTGT 179
||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 121 AAGTTCGACGATGAAAGTGACTCCGATGATAT-CAGAGCTTTTTCGAATCTCTCTATTGG 179
Query 180 TAAAGATCCTTTGGGTGAAGTAGATGGCACATTGAATGAAGCAGCTTTGGGGAACGATGT 239
||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 180 TAAAGATCCTTTGGGCGGAGGAGATGGCACACTGAATGAAGCAATTTTGGGGAACGATGT 239
Query 240 TGC--A--A--GT------GGTTCGGTGGGAAAAGACGAGCCTTCTTCTATTGCTCCGGA 287
||| | | || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 240 TGCAAACGAGGGTGCAAGCGGTTCGGTGGGGGAAGACGAGCCTTCATCTATTGCTCCGGA 299
Query 288 ACCTGTTCAATTTCTCCATAGTGATGCAAAGGAATTAAGAGATGATGAAATGAGATCAGA 347
| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 300 AGCTGTTCAATTTCCCCATAGTGATGCAAGGGAATTAAGAGATGATGAAATGAGATCGGA 359
Query 348 GGTAGCTGATATGCCACTATCTGAAACAGCAAAAGAATGCACCATGGTTAACGACCCCGG 407
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||
Sbjct 360 GGTAGCTGATATGCCACTATCTGAAACAGCAAAAGAATGCACGATAGTTAACGAGCCCGG 419
Query 408 GATTCCTGGGGTTAAGGAGCTAGATTGGGGTTCTTTTGATGCAGATTTATCTGTAAATGA 467
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 420 GATTCCTGGGGTTAAGGAGCTAGATTGGGGTTCATTTGATGCGGATTTATCTGTAAATGA 479
Query 468 CGGTCGTGGGTTTGGTTCATGCTCTGATTTCTTCACTGAGTTGGATGAAACTGCAGGAAA 527
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 480 CGGTCGTGGGTTTGGTTCATACTCTGATTTCTTCACTGAGCTGGATGCAACTGCAGGAAA 539
Query 528 TTTACAGGGAAAGGCGGATGTAGCTGTGGCCACTGGAGGAAACTTAGTAGCCAATCATAC 587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 540 TTTACAGGGAAAGGCGGATGTAGCTGTGGCCACTGGAGGAAACTTAGTAGCCAATGATAC 599
Query 588 AAATAACACAAGTGTTGGTTTTGATAATTCGGCAGGGTTTGAGCAACACCAGGGTCAAGT 647
||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 600 AAATAACACAA------G---TG----TT-----GGGTTTGAGCAACACCAGGGTCAATT 641
Query 648 GCACCACGATTCTGCAAGCGGGCAGTACGTGGATAACAGTCAGTCTTGGGAAAATCTCTA 707
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 642 GCACCACGATTCTGCAAGCGGGCAGTACGTGGATAACAGTCAATCTTGGGAAAATCTCTA 701
Query 708 TCCTGGATGGAAATATGATGCAAGTACTGGCCAGTGGTATCAAGTTGATGGTCATGATGC 767
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 702 TCCTGGATGGAAATATGATGCAAGTACTGGTCAGTGGTTTCAAGTTGATGGTCATGATGC 761
Query 768 AAGCATGAATTCACAGGAGAGCTATGAAAACTCAACGAGTAACTGGGAAAACGTTGCTGC 827
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 AAGCATGAATTCACAGGAGAGCTATGAAAACTCAACTAGTAACTGGGAAAACGTTGCTGC 821
Query 828 TAATAACTCGGATGTTGCTTATCAGAGACAGAGTACAGCATCTGCAGTGGCTGGCACAGT 887
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 GAACAACTCGGATGTTGCTTATCAGAGACAGAGTACAGCATCTGCAGTGGCTGGCACAGT 881
Query 888 TGAGAATGTGTCTACTTGGAACCAGGCTTCACAAGTGAGCAATGGGTATCCAGAACACAT 947
||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 TGAGAATGTTTCTACTTGGAACCAGGTTTCACAAGTGAGCAATGGGTATCCAGAACACAT 941
Query 948 GGTCTTTGACTCCCAGTATCCGGGATGGTACTATGACACAATTGCTCAAGAATGGCGCTC 1007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 942 GGTCTTTGACTCCCAGTATCCGGGATGGTACTATGACACAATTGCTCAAGAATGGCGCTC 1001
Query 1008 TCTTGACAGCTACAACCAGGCTTTTCAAACAACTGGTCAAGCTAATGATCAGCAAGTTCA 1067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 TCTTGACAGCTACAACCAGGCTTTTCAAACAACTGGTCAAGCTAATGATCAGCAAGTTCA 1061
Query 1068 GAATGGCAATTCTCTTACAGCTATGTACCATAATAGAGAGAGTAATGTACATGATGTTTA 1127
||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1062 GAATGGCAATTCTTTTACAGCTGTGGACCATAGTAGAGAGAGTAACGTACATGATGTTTA 1121
Query 1128 CGATAAAAATCAGATACTCAGAACGCAATCATTTGATATCCAGAGCCAACATGGAAGTTG 1187
|||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122 CGATAAAAATCAGATACTCAGAACACAAAAATTTGATATCCAGAGCCAACATGGAAGTTG 1181
Query 1188 GGATCAATCGTACTATGACAACAATCAGCAGGCTACAAACATTTGGCAACCAGAAAATGC 1247
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1182 GGATCAATCGTACTATGACAAAAATCAGCAGGCTACAAACATGTGGCAACCAGAAAATGC 1241
Query 1248 AGGTAAGGCTGAGGCGGCTGTAACTCCTGCCTCATTATCAAACTTCGCAGGAAACCAGCA 1307
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 1242 AGGTGCGGCTGAGGCGGCTGTGACTCCTGCCTCATTATCAAACTCCGGAGGAAACCAGCA 1301
Query 1308 AGTAAATAATCTGTACAGTACAGGACATGTGGCTGAACAGTTTAAGCCATATGAGAGTGG 1367
|||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302 AGTAAATAATTTGTACAGTACAGGACCTGTGGCTGAACAGTTTAAGCCATATGAGAGTGG 1361
Query 1368 TGTTCAGAGCTTCATCCCTCAGCATATGAATGTGGCTAGTGTCACGCAGAATGGAGCTAT 1427
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||
Sbjct 1362 CGTTCAGAGCTTCATTCCTCAGCATATGAATGTGGCTAATGTCACGCAGAATGGACCCAT 1421
Query 1428 GAGTTTCTCGAACGATTTTTATAGTAGACAGGAATCTGTAGATGATGCTCCACAGTCATT 1487
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1422 GAGTTTCTCGAACGGTTTTTATAGTAGACAGGAATCTGTAGATGATGCTCCACAGTCATT 1481
Query 1488 TCAGAGCAATCAGCTTGTCTCCTCAAGTGCAGGAAGATCATCTGATGGGCGGCCACCACA 1547
|||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1482 TCAGAGCAGTCAGCTTTTCTCCCCAAGTGCAGGAAGATCATCTGATGGGCGTCCACCACA 1541
Query 1548 TGCACTTGTCAATTTTGGATTTGGGGGAAAGCTCATTCTTATGAAGGATGATAATGGTTC 1607
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 1542 TGCACTTGTCAATTTTGGATTTGGCGGAAAGCTCATTCTTATGAAGGACGATAGTGGTTC 1601
Query 1608 TCTCCAGAATTCATCATTTGGAAGTCAGAAGGGAACTGGGGGAAGCTCCATCTCTGTCTT 1667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602 TCTCCAGAATTCATCATTTGGAAGTCAGAAGGGAACTGGGGGAAGCTCCATCTCTGTCTT 1661
Query 1668 AAACTTGGCAGAAGTTATTTCTGGGAGTGCCTCTTATTCAAGTCTCGGGGAAAACTCTTT 1727
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1662 AAACTTGGCAGAAGTTATTTCTGGGAGTGCCTCTTATTCAAGTCTCGGAGAAAACTCTTT 1721
Query 1728 GAGTTACTTCAGTTGTCTGGATCAACAATCTCTTCCAGGACCCTTGGTTGGAGGAAATGT 1787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722 GAGTTACTTCAGTTGTCTGGATCAACAATCTCTTCCAGGACCCTTGGTTGGAGGAAATGT 1781
Query 1788 TGGAAGTAAAGACTTACATAAGTGGCTTGATGAGAAAATTTTGAATTGTGAATCTTCCTA 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1782 TGGAAGTAAAGACTTACATAAGTGGCTTGATGAGAGAATTTTGAATTGTGAATCTTCCTA 1841
Query 1848 TATGGAATTTTCAAGAGGGAAACTTTTAAAGATGCTTCTTTCTTTGCTCAGAATATCTTG 1907
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 CATGGACTTTTCAAGAGGGAAACTTTTAAAGATGCTTCTTTCTTTGCTCAGAATATCTTG 1901
Query 1908 TCAGTATTATGGGAAACTCCGTTCTCCTTTTGGTACTGATGCATCGCAAAAGGAAATGGA 1967
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1902 TCAGTATTATGGGAAACTCCGTTCTCCTTTTGGTTCCGATGCATTGCAAAAGGAAACGGA 1961
Query 1968 CTCTGCTGAAGCAGCAGTCGCTAAGCTTTTTGCATTTGCCAAGAAAGATGGCGTACAAAA 2027
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1962 CTCTGCTGAAGCAGCAGTCGCTAAGCTTTTTGCAATTGCCAAGGAAGATGGCGTACAAAA 2021
Query 2028 TGGTTATGCTCCTATTAGCCAATGTTTACAGCATTTACCACCGGAATCACAAATGCAAGT 2087
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2022 TGGTTATGCTCCTATTAGCCAATGCTTACAGCATTTACCACCGGAATCACAAATGCAAGT 2081
Query 2088 AACTGCTTCAGAGGTGCAGAATCTTCTGGCTTCTGGCAGGAAGATGGAGGCTCTCCAATG 2147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2082 AACTGCTTCAGAGGTGCAGAATCTTCTGGCTTCTGGCAGGAAGATGGAGGCTCTCCAATG 2141
Query 2148 TGCACAAGAAGGTCATTTATGGGGACCAGCGCTTGTTATCGCAGCACAACTTGGGCAGCA 2207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2142 TGCACAAGAAGGTCATTTATGGGGACCAGCGCTTGTTATCGCAGCACAACTTGGGCAACA 2201
Query 2208 GTTTTATATTGACACTGTGAAACAAATGGCCCTTCGCCAGCTGGTACCCGGGTCACCTTT 2267
||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202 GTTCTATGTTGACACTGTGAAACAAATGGCCCTTCGCCAGCTGGTACCCGGGTCACCTTT 2261
Query 2268 ACGGACACTGTGCCTGCTAGTTGCAGGGCAACCAGCTGAAGTGTTTTCCACTGGAAGTAC 2327
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2262 ACGAACACTGTGCCTGCTGGTTGCAGGGCAACCAGCTGAAGTGTTCTCCACTGGAAGTAC 2321
Query 2328 AAGCGATATCTCTTTTCCTGGTTCCATAAATGTGCCTCCACAGCAACCTCAGTTTGGAAG 2387
||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2322 AAGCGATATCTCTTTTCCTGGTTCCGTAAATTTACCTCCACAGCAACCTCAGTTTGGATG 2381
Query 2388 TAGTAGCATGCTTGACAGTTGGGAAGAGAATTTGGGTATAATAACTGCGAACAGAACCAC 2447
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2382 TAGTAGCATGCTTGACAGTTGGGAAGAGAATTTGGGTATAATTACTGCGAACAGAACCAC 2441
Query 2448 AGATGATGAGCTTGTAATTACTCATCTTGGAGATTGCATGTGGAAAGAAAGGGGCGAGAT 2507
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442 AGATGATGAGCTTGTGATTACTCATCTTGGAGATTGCATGTGGAAAGAAAGGGGCGAGAT 2501
Query 2508 AATTGCAGCTCATATTTGCTATTTAATTGCGGACAAGAACTTTGATCCATACTCAGATAC 2567
||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2502 TATTGCGGCCCATATTTGCTATTTAATTGCGGATAAGAACTTTGATACATACTCAGATAC 2561
Query 2568 TGCCAGACTCTGCCTTGTTGGAGCGGATCACTGGAAATATCCTCGAACATATGCAAGTCC 2627
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2562 TGCCAGACTGTGCCTTGTTGGAGCGGATCACTGGAAATATCCTCGAACATATGCAAGTCC 2621
Query 2628 AGAGGCTATACAGAGAACAGAGTTATATGAATACTCTAAGACTCTGGGAAACTCTCAGTT 2687
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2622 AGAGGCTATACAGAGAACAGAGTTATATGAATACTCTAAGACGCTGGGAAACTCTCAGTA 2681
Query 2688 TACCCTGCTACCGTTTCAACCATATAAAGTCATGTATGCCCATATGCTGGCTGAAGTTGG 2747
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2682 TACCCTGTTAACGTTTCAACCATATAAAGTCATGTATGCCCATATGCTGGCTGAAGTTGG 2741
Query 2748 TAAACTTTCGACTGCACTGAAGTACTGTCAAGCAGTATTAAAATGCCTCAAGACAGGCCG 2807
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2742 TAAACTTTCGACTGCACAAAAGTACTGTCAAGCAGTATTAAAATGCCTCAAGACAGGCCG 2801
Query 2808 ATCACCAGAAGTGGAAATGTGGAAACAGTTTGTTTCATCTCTTGAAGAGAGAATCCGCAT 2867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2802 ATCACCAGAAGTGGAAATGTGGAAACAGTTTGTTTCATCTCTTGAAGAGAGAATCCGTAT 2861
Query 2868 CCACCAACAGGGCGGGTATACAGCGAATTTACACACAGAAAAACTTGTTGGAGTACTGCT 2927
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2862 CCACCAACAGGGCGGGTATACAGCGAATTTACACCCAGAAAAACTTGTTGGAGTACTGCT 2921
Query 2928 AAACTTTTTTGGTAGTAA-AGCACATCGCCCTGTTGGGGGCATGCCACCACCTGCACCAC 2986
|||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2922 AAACTTTTTTGGTAGTAAGA-CACATCGTCCTGTTGGGGGCATGCCACCACCTGCACCAC 2980
Query 2987 ATTCAACCAAAGGAAACCTACAGGGAAATGAGTATCAACATCAACAGCAGGAAGCCACTA 3046
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2981 ATTCAACCAAAGGAAACCTACAGGGAAATGAGTATCAACATCAACAGCAGGAAGCTACTA 3040
Query 3047 AGTTAGCATATAGTCAATCGGTTAATACAATGTCATCATTGATGCCACCTGCTTCAATGG 3106
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3041 AGTTAGCATATAGTCAATCGGTTAATACAATGTCATCATTGATGCCACCTGCTTCAGTGG 3100
Query 3107 AACCCATACATGAGTCGGGTGGGAGTGGGAGGAGAATGGCAGTACATACTAGAAGTGTAT 3166
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3101 AACCCACACATGAGTCGGGTGGGAGTGGGAGGAGAATGGCAGTACATACTAGAAGTGTAT 3160
Query 3167 CAGAGCCAGATTTCGGTAGGACGCCAATACAGGATATGGCTGACTCCTCAAAAGAAAAGG 3226
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3161 CAGAGCCAGATTTCGGTAGGACGCCGATACAGGAAATGGCTGACTCCTCGAAAGAAAAGG 3220
Query 3227 CAGTTGATGGGGTGACAAAGTTGAAATCATCTGGGACAGTGGCAAGTTCGCGGTTAAGTC 3286
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 3221 CAGTTGATGGGGTGACAAAGTTGAAATCATCTGGGTCAGTGGCAGGTTCGCGGTTTAGTC 3280
Query 3287 GCTTTGGTTTTAGCATGCTGAAGGACACTGTAGGGAGGGTCTTATATCGGTCATCCAAAG 3346
||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3281 GCTTTGGTTTTGGCATTTTTAAGGACACTGTAGGAAGGGTCTTAGCTCGGTCATCCAAAG 3340
Query 3347 AGGCAAAATTGGGCGCAGAAAATCAGTTCTACTATGATGACAAACTAAAGAGATGGGTGG 3406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3341 AGGCAAAATTGGGCGCAGAAAATCAGTTCTACTATGACGACAAACTAAAGAGATGGGTGG 3400
Query 3407 AAAGAGGTGTGGAACCCCCAGCTGAGGAAGCTGCACTGCCTCCTCCTCCAACAATAGGCG 3466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3401 AAAGAGGTGTGGAACCCCCAGCTGAGGAAGCTGCACTGCCTCCTCCTCCAACAATAGGCG 3460
Query 3467 CATTCCAAAGCAACTCACTGGGTTATGAAAACAA-TC----------C-ATCTAATGGGA 3514
||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||
Sbjct 3461 CATTCCAAAACAACTCATTGGGTTATGAAAACAAATCTGATATGATTCCATCTAATGGGA 3520
Query 3515 ACTCGAGTTCCGGCGGCCCAACTCCATCAGAGAATTCTTCAGGAATCCCACCAATCTCAC 3574
||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3521 ACTGGAGTTCTGGTGGCCCAACTCCGTCAGAGAATTCTTCAGGAATCCCACCAATCTCAC 3580
Query 3575 ACGGTTCGAATCAATTCTCAGCTCGTGGGCGTACGGGTGTGCGGGCAAGATACGTTGACA 3634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3581 ACGGTTCGAATCAATTCTCAGCTCGTGGGCGTACGGGTGTGAGGGCAAGATACGTTGACA 3640
Query 3635 CCTATAATT-T--AGGCCGTGGAAACTGTCAGACCATGTAT-CAGTCACCTTCCGTACAA 3690
|||||||| | |||||||||||||| ||| |||||| || | ||||||||||||||||
Sbjct 3641 CCTATAATCCTCCAGGCCGTGGAAACTCTCATACCATG-ATTCCGTCACCTTCCGTACAA 3699
Query 3691 ACTGCAAAACCACCAATCCCGGCAAAAGCAAAGTTCTTTGTTCCCGCAGCACCTGCATCG 3750
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3700 ACTGCAAAACCACCAATCCCCGCAAAAGCAAAGTTCTTTGTTCCCGCAGCACCTGCATCG 3759
Query 3751 TTTTCAAACGACCAGGCAATGGAACCGGCTGCTGCTGAAACCAGACAGGAGGAGATTTTG 3810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3760 TTTTCAAACGACCAGGCAATGGAACCGGCTGCTGCTGAAACCAGACAGGAGGAGATTTCA 3819
Query 3811 GCAGATGAAGTAGTAGCCTCTTCAGGGGCTCCACCACCAATGATGATGCAGAGATATCCA 3870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3820 GCAGATGAAGTAGTAGCCTCTTCAGGGGCTCCACCACCAATGATGATGCAGAGATATCCA 3879
Query 3871 AGTATGGATAACATCCAAAGAAATGGATTGGGGATTAGCGTCAATGGGGATCATCATCAG 3930
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3880 AGTATGGATAACATCCAAAGAAATGGATTGGGGATAAGCGTCAATGGGGATAATCATCAG 3939
Query 3931 CCTCCTGCTTCCAGAAGAACAGCTTCATGGAGCGGAAACTTCAACACCTCGTTTACGCCT 3990
|||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3940 CCTCCTACTTCCAGAAGAACAGCTTCATGGAGTGGAAACTTTAACACCTCGTTTACGCCT 3999
Query 3991 CCGACCAGTCCATCAACCTTCAAACCAATCCTACTCAACAGTAGCAGCAGCAGCTTAGGA 4050
|| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4000 CCTACCAGTCCATCAACCTTCAAACCAGTCCTACTCAACAGTAGCAGCAGCAGCTTAGGA 4059
Query 4051 GAGGAGCTTCAGGAAGTGGAACTCTAAGTCACCAGGAACTGAAAAAATATTTCACAAAGT 4110
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||
Sbjct 4060 GAGGAGCTTCAGGAAGTGGAACTCTAAGTGACCAGGAACTGAAAA--T-TT-CACAAAGT 4115
Query 4111 TTTTGGTTATTGATTGTCACAGGTAGGAAAGT---C-ACACAG---CGA-T----GGAGC 4158
|||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| | | | |||||
Sbjct 4116 TTTTGGTTATTG-TT---ACAGGTAGGAAAGTTTTCGACACAGAAACCAATCCATGGAGC 4171
Query 4159 TTGGATTTACGCCGTCTTCTTGAGTGATAGGGGCAGGCAA---TATATAATTGCAGTTTG 4215
||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4172 TTGGATTTACGTATTCTTCTTGAGTTATAGTGGCAGGCAACAATATATAATTGCAGTTTG 4231
Query 4216 TATAGATGATTCTTTGCTTCATTTGGGTTTTGAGAATGGAACCAAAAGTTGG-----GAG 4270
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4232 TATAGATGATTCTTTACTTCATTTGGGTTTTGAGAATGGAACCAAAAGTTGGTCTTCGAG 4291
Query 4271 AGAGTTGCAAAACTGTACCTTTCGCTAAAATATATAATAAGGTCAAATCTGACCAATTTT 4330
||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4292 AGAGTTGCAAAACTGTACCTTTCGCTAAA-TATAAAATAAGGTCAAATCTGACCAATTTT 4350
Query 4331 TCATGTATTGT-TTTTTCTTATTCATTAATTCTTTCTAT 4368
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4351 -CATGTATTGTGTTTTTCTTATTCATTAATTTTTTCTAT 4388
> AT5G47480.1 | Symbols: | RGPR-related | chr5:19257420-19263424
FORWARD LENGTH=4345
Length=4345
Score = 2558 bits (1385), Expect = 0.0
Identities = 2057/2373 (87%), Gaps = 79/2373 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCTTCGGCTTCTCAATTCCTGCTGGAGGATCAAACGGATGAGGATTTCTTCGACAAG 60
||||||||| || || | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTCGACTGCTGATTTCCTCCTGGATGATCAAACGGACGAGGATTTCTTCGACAAA 60
Query 61 CTTGTTGATGATGCTTATTCTCCCGGCGAAGCTCAGGCTTCATCCTCTGTGACGGAGCTC 120
|||||||||||| | ||| || | | | | | ||||||||||||| | ||||||
Sbjct 61 CTTGTTGATGATTCCTATACT--C--C-TA-C-C--GCTTCATCCTCTGCCAAGGAGCTG 111
Query 121 AAGTTTGACGACGAAAGTGACTCCGATGATTCCAGAGCTTTTTCCAATCTCTCCATTGTT 180
|| || || |||| ||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||| | |||
Sbjct 112 AAATTCGATGACGGTAGTGATTCCGATGACGCCAAAGCTTTTGCTAATCTCTCCGTCGTT 171
Query 181 AAAGATCCTTTGGGTGAAGTAGATGGCACATTGAATGAAGCAGCTTTGGGGAACGATGTT 240
| ||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 172 GACGATGTTTTGGGTGATGGAGATGTCGCATTGAATGAAGCAGGTTTGGGGAACGATGTT 231
Query 241 ----------G--CAAGTGGTTCGGTGGGAAAAGACGAGCCTTC-T--TCTATTGCTCCG 285
| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||
Sbjct 232 GCAAACGAGGGTACAAGTGGTTCGGTGGGAAAAGAAGAGCCTTCTTCATCTATTGCTCCG 291
Query 286 GAACCTGTTCAATTTCTCCATAGTGATGC-AA-AGGAATTAA--GA-GATGATGAAATGA 340
||| ||||||||||| || | |||||||| || ||| |||| || | ||||| ||
Sbjct 292 GAAGCTGTTCAATTTGTCAACAGTGATGCAAATAGG--TTAAGGGATGTTGATGTGGTGC 349
Query 341 GATCAGAGGTAGCTGATATGCCACTATCTGAAACAGCAAAAGA-ATGCACCATGGT-TAA 398
|||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| | | | || || |
Sbjct 350 GATCGGAGGTGGATGATATGGCACTAACTGAAACAGGAAAAGAGA-GTAATATAGTCGAT 408
Query 399 CGACCCCGGGATTCCTGGGGTTAAGGAGCTAGATTGGGGTTC-TTTTGATGCAGATTTAT 457
|| | |||| |||||||||||||||| | || ||||| || |||| ||||||||| ||
Sbjct 409 GGA-TCTGGGAGTCCTGGGGTTAAGGAGGTTGACTGGGGCTCGTTTT-ATGCAGATTCAT 466
Query 458 CTGTAAATGACGGTCGTGGGTTTGGTTCATGCTCTGATTTCTTCACTGAGTTGGATGAAA 517
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 467 CTGTAAATGACGGTGGTGGGTTTGGTTCATACTCTGATTTCTTCACTGAGTTGGATGCAA 526
Query 518 CTGCAGGAAATTTACAGGGAAAGGCGGATGTAGCTGTGGCCACTGGAGGAAACTTAGTAG 577
||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 CTGCAGGAAATGTACAGGGACAGGCGGAGGTAGCTGTGGCCACTGGAGGAAACTTAGTAG 586
Query 578 CCAATCATACAAATAACACAAGTGTTGGTTTTGATAATTCGGCAGGGTTTGAGCAACACC 637
||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 587 CCAATGATACAATTAACACAAGTGTTGGTTTAGATAATTCGGCAGGCTTTGAGCAACACC 646
Query 638 AGGGTCAAGTGCACCACGATTCTGCAAGCGGGCAGTACGTGGATAACAGTCAGTCTTGGG 697
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 647 AGGGTCAAGTGCAACACGATTCTGGAAGCGGGCAGTATGTGGATAACAGTCAATCTTGGG 706
Query 698 AAAATCTCTATCCTGGATGGAAATATGATGCAAGTACTGGCCAGTGGTATCAAGTTGATG 757
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 707 AAAATCTCTATCCTGGATGGAAATATGATGCAAGTACTGGTCAATGGTATCAAGTTGATG 766
Query 758 GTCATGATGCAAGCATGAATTCACAGGAGAGCTATGA-AAACTCAACGA-GTAACTGGGA 815
|||| ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||
Sbjct 767 GTCAGGATGCAACCGTTAATTCACAGGAGAGCTAT-ATTAACTCAAC-AGGTAACTGGGA 824
Query 816 AAACGTTGCTGCTAATAACTCGGATGTTGCTTATCAGAGACAGAGTACAGCATCTGCAGT 875
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |
Sbjct 825 AAGCGTTGCTGCTGATAACTCGGATGTTGCTTATCTGAAACAGAGTACAACATCTGCAAT 884
Query 876 GGCTGGCACAGTTGAGAATGTGTCTACTTGGAACCAGGCTTCACAAGTGAGCAATGGGTA 935
||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||
Sbjct 885 GGCTGGCACAGCTGAGAGTGTGTCTACATGGAACCAGGTTTCACAAGTGGGCAATGGATA 944
Query 936 TCCAGAACACATGGTCTTTGACTCCCAGTATCCGGGATGGTACTATGACACAATTGCTCA 995
||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 945 TCCAGAACACATGGTATTTGACGCCCAGTATCCTGGATGGTACTATGACACAATTGCTCA 1004
Query 996 AGAATGGCGCTCTCTTGACAGCTACAACCAGGCTTTTC--A-AAC---AACTGGTCAAGC 1049
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||
Sbjct 1005 AGAATGGCGCTCTCTGGACAGCTACAACCAGGCTTCCCAAACAACTGTAACTGGTCAAGC 1064
Query 1050 TAATGATCAGCAAGTTCAGAATGG-CAATTCTCTTACAGCTATGTA-C-C-ATAATAGAG 1105
| ||||||||||||||||||| || | || ||| |||| ||| ||| | | |||||||
Sbjct 1065 TCATGATCAGCAAGTTCAGAACGGTC-ATGCTCGTACAACTACGTATCACAATAATAGCC 1123
Query 1106 AGAGTAATGTACATGATGTTTACGATAAAAATCAGATACTCAGAA-CGCAATCA-TTTGA 1163
|||||| ||| |||||||| || | ||||| |||| | ||| || ||||| | ||||
Sbjct 1124 AGAGTAGTGTGTATGATGTTAACAACAAAAACCAGACATTCA-AAGCGCAA-GACTTTGC 1181
Query 1164 TATCCAGAGCCAACATGGAAGTTGGGATC-AATCGTACTATGACAACAATCAGCAGGCTA 1222
||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1182 TATTCAGGGCCAACACGGAAGTTGGGA-CGAATCTTACTATGCCAACAATCAGCAGGCTG 1240
Query 1223 CAAACATTTGGCAACCAGAAAATGCAGGTAAGGCTGAGGCGGCTGTAACTCCTGCCTCAT 1282
||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||||| ||| ||||
Sbjct 1241 GAAACACTTGGCAACCAGTAAATGTAGGTAAGGCTGAGCCTGCGGTAACTTCTGATTCAT 1300
Query 1283 TATCAAACTTCGCAGGAAACCAGCAAGTAAATAATCTGTACAGTACAGGA-CATGTGGCT 1341
||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||
Sbjct 1301 TATCACGCTTCGGAGGAAACCAGCAAGTAAATAATTTGTACAGTACAGAATC-TGTGGCT 1359
Query 1342 GAACAGTTTAAGCCATATGA-GAGTGGTGTTCAGAGCTTCATCCCTCAGCATATGAATGT 1400
||||||||||||||| || | || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1360 GAACAGTTTAAGCCAAAT-ACGATTGGAGCCCAGAGCTTTATCCCTCAGCATATGAATGT 1418
Query 1401 GGCTAGTGTCACGCAGAATGGAGCTA-TGAGTTTCTCGAACGATTTTTATAGTAGACAGG 1459
|||||||| ||| || |||||| | | |||||||||| |||||||| |||| |||||||
Sbjct 1419 GGCTAGTGCCACACAAAATGGA-CCATTGAGTTTCTCAAACGATTTGTATAATAGACAGC 1477
Query 1460 AATCTGTAGATGATGCTCCACAGTCATTTCAGAGCAATCAGCTTGTCTCCTCAAGTGCAG 1519
|||| |||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| |
Sbjct 1478 AATCGGTAGATCATGCTCAAAAGTCTTTTCAGAACAATCAGCTTTTCTCCCCAAGTGTGG 1537
Query 1520 GAAGATCATCTGATGGGCGGCCACCACATGCACTTGTCAATTTTGGATTTGG-GGGAAAG 1578
|||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| |||
Sbjct 1538 GAAGATCATCTGATAGGCGTCCACCACACGCACTAGTCAGTTTTGGATTTGGTGGG-AAG 1596
Query 1579 CTCATTCTTATGAAGGATGATAATGGTTCTCTCCAGAATTCATCATTTGGAAGTCAGAAG 1638
|||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |
Sbjct 1597 CTCATTGTTATGAAGGATAATAATGGTTCTCTGCAGAATACATCATTTGGGAGTCAG--G 1654
Query 1639 GGAACTGGGGGAAGCTCCATCTCTGTCTTAAACTTGGCAGAAGTTATTTCTGGGAGTGCC 1698
|| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655 GG-ATTGGGGGAAGCTCCATCACTGTCTTAAACTTGGCAGAAGTTATTTCTGGGAGTGCC 1713
Query 1699 TCTTATTCAAGTCTCGGGGAAAACTCTTTGAGTTAC-TTCAGTTGTCTGGATCAACAATC 1757
|||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 1714 TCTTATTCCAGTCCCGGGGAAGACTCTTTGAGCTACTTTC-GTTGTCTGCATCAACAATC 1772
Query 1758 TCTTCCAGGACCC-TTGGTTGGAGGAAATGTTGGAAGTAAAGACTTACATAAGTGGCTTG 1816
||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||
Sbjct 1773 TCTTCCAGG-CCCTTTGGTAGGGGGAAATGTTGGAAGTAAAGAGTTGCATAAGTGGATTG 1831
Query 1817 ATGAGAAAATTTTGAATTGTGAATCTTCCTATATGGAATTTTCAAGAGGGAAACTTTTAA 1876
|||||| | | ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1832 ATGAGAGACTCTTGCATTGTGAATCTTCCAACATGGATTTTTCAAGAGGGAAACTCTTAA 1891
Query 1877 AGATGCTTCTTTCTTTGCTCAGAATATCTTGTCAGTATTATGGGAAACTCCGTTCTCCTT 1936
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1892 AGATGCTTCTTTCTTTGCTCAGAATATCTTGTCAGTATTATGGGAAACTCCGATCTCCTT 1951
Query 1937 TTGG-TACTGATGCATCGCAAAAGGAAATGGACT-CTGCTGAAGCAGCAGTCGCTAAGCT 1994
|||| | ||||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1952 TTGGCT-CTGATGCATCGCAAAAGGAAACGGA-TACTCCAGAAGCAGCAGTTGCTAAACT 2009
Query 1995 TTTTGCATTTGCCAAGAAAGATGGCGTACAAAATGGTTATGCTCCTATTAGCCAATGTTT 2054
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2010 TTTTGCATTTGCCAAGAAAGATGGCATCCAAAATGGTTATGCTCCTATTAGCCAATGCTT 2069
Query 2055 ACAGCATTTACCACCGGAATCACAAATGCAAGTAACTGCTTCAGAGGTGCAGAATCTTCT 2114
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2070 GCAGCATTTACCACCTGAATCGCAAATGCAAGTAACTGCTTCAGAGGTTCAGAATCTTCT 2129
Query 2115 GGCTTCTGGCAGGAAGATGGAGGCTCTCCAATGTGCACAAGAAGGTCATTTATGGGGACC 2174
||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2130 GGCTTCTGGTAGAAAAATGGAGGCTCTACAATGTGCGCAAGAAGGCCATTTATGGGGACC 2189
Query 2175 AGCGCTTGTTATCGCAGCACAACTTGGGCAGCAGTTTTATATTGACACTGTGAAACAAAT 2234
|| ||||| ||||| || ||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||
Sbjct 2190 GGCACTTGTCATCGCGGCTCAACTTGGGGATCAGTTCTATGTAGACACTGTGAAACAAAT 2249
Query 2235 GGCCCTTCGCCAGCTGGTACCCGGGTCACCTTTACGGACACTGTGCCTGCTAGTTGCAGG 2294
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||
Sbjct 2250 GGCCCTTCGCCAGCTGATACCCGGGTCACCTTTACGGACATTGTGCCTACTCGTTGC-GG 2308
Query 2295 G-CAACCAGCTGAAGTGTTTTCCACTGGAAGTA 2326
| |||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 2309 GACAACCAGCTGAAGTGTGTCCCACTGGAAGTA 2341
Score = 773 bits (418), Expect = 0.0
Identities = 768/928 (83%), Gaps = 59/928 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 2961 TGGGGGCATGCCACCACCTGCACCACATTCAACCAA-AGGAAACCTACAGGGAAATGAGT 3019
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||
Sbjct 2884 TGGGGG-ATGCCACCACCTGCACCACATTCAA-CAACTGGAAACCCGCAGGTAAATGAGT 2941
Query 3020 ATCAACATCAACAGCAGGAAGCCACTAAGTTAGCATATAGTCAATCGGTTAATACAATGT 3079
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 2942 ATCAACATCAACAGCAGGAAGCGGCTAAGTTATCATATAGTCAATCCGCTAATACAATGT 3001
Query 3080 CATCATTGATGCCACCTGCTTCAATGGAACCCATACATGAGTCGGGTGGGAGTGGGAGGA 3139
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 3002 CATCATTGATGCCACCTGCTTCAATTGAACCCGTACATGAGTGGGGTGGGAACGGGAGGA 3061
Query 3140 GAATGGCAGTACATACTAGAAGTGTATCAGAGCCAGATTTCGGTAGGACGCCAATACAGG 3199
|||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3062 CAATGGCAGCACATTCTAGAAGTGTATCAGAGCCAGATTTCAGTAGGACGCCAATACAGG 3121
Query 3200 AT-ATGGCTGACTCCTCAAAAGA-AAAGGCAGTTGATGGGGTGACAAAGTTGAAATCATC 3257
|| | | |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||| |
Sbjct 3122 ATCA-GACTGACTCCTCAAAAGACAAA-GCTCCTGATGGGGTGACACAGGTGAAATCAAC 3179
Query 3258 TGGGACA-GTGGCAAGTTCGCGGTTAAGTCGCTTTGGTTTTAGCATGCTGAAGGACACTG 3316
| ||| | ||| ||||||| ||||| || ||||||||| || |||| ||||| ||||||
Sbjct 3180 TCGGA-AGGTGCCAAGTTCTCGGTTTAGCCGCTTTGGTATTGGCATATTGAAGAACACTG 3238
Query 3317 TAGGGAGGGTCTT---ATATCGGTCATCCAAAGAGGCAAAATTGGGCGCA-GAAAATCAG 3372
|||||| |||||| || ||| ||||| || ||||||||| |||| | || |||||
Sbjct 3239 TAGGGAAGGTCTTCCCATCTCGATCATCTAATGAGGCAAAACTGGG-TAATGAGAATCAA 3297
Query 3373 TTCTACTATGATGACAAACTAAAGAGATGGGTGGAAAGAGGTGTGGAACCCCCAGCTGAG 3432
||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3298 TTCTACTATGACGATAACCTAAAGAGATGGGTGGAAAGAGGTGTGGAACCCCCAGCTGAG 3357
Query 3433 GAAGCTGCACTGCCTCCTCCTCCAACAAT-AGGCGCATTCCAAAGCAACTCACTGGGTTA 3491
||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||| |||||||||| ||||| |
Sbjct 3358 GAAGCTGCACTACCTCCTCCTCCAACG-TCAGTCCCATTCCGAAGCAACTCATTGGGTCA 3416
Query 3492 TGAAAACAA-TC------------C-A--T--CT--A---A-TGGGAACTCGAGTTCCGG 3527
||||||||| || | | | || | | ||||| || |||| ||
Sbjct 3417 TGAAAACAAGTCTGAGATAAAGAACGAGATGTCTCCATCTAGTGGGAGCTGGAGTAGTGG 3476
Query 3528 CGGCCCAACTCCATCAGAGAATTCTTCAGGAATCCCACCAATCTCACACGGTTCGAATCA 3587
| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || || || ||
Sbjct 3477 CAGCCCAACTCCGTCAGAGAATTCTCCGGGAATCCCACCAGTCTCACAGGGCTCAAACCA 3536
Query 3588 ATTCTCAGCTCGTGGGCGTACGGGTGTGCGGGCAAGATACGTTGACACCTATAATTTAGG 3647
||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct 3537 ATTCTCAGCTCGTGGACGTATGGGTGTGCGTGCAAGGTACGTTGACACCTATAATCAAGG 3596
Query 3648 CCGTGGAAACTGTCAGACCATGTATCAGTCACCTTCCGTACAAACTGCAAAACCACCAAT 3707
| | || | || |||||||||||||||| |||| ||| || | |||||||| ||
Sbjct 3597 C--TC----CT--C-GAGCATGTATCAGTCACCTCCCGTGCAATCTTCTAAACCACCGAT 3647
Query 3708 CCCGGCAAAAGCAAAGTTCTTTGTTCCC-GCAGCACCTGCATCGTTTTCAAACGACCAGG 3766
|| || |||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3648 TCCTGCGAAAGCAAAATTCTTTGT-CCCAGCAGCACCGGCATCGTTTGCAAACGACCAGG 3706
Query 3767 CAATGGAACCGGCT-GCTGCTGAAACCAGACAGGAGGAGATTTTGGCAGATGAAG---TA 3822
||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||| | | | || |||||||| ||
Sbjct 3707 TAATGGAATCGGTTAG-TGCTGAAACCAGACAAGAG-A-ACTCAGG-AGATGAAGCAGTA 3762
Query 3823 GTAGCCTCTTCAGGGGCTCCACCACCAA 3850
|||| |||| |||| |||||| |||||
Sbjct 3763 GTAGGCTCTGCAGGCGCTCCAGGACCAA 3790
Score = 665 bits (360), Expect = 0.0
Identities = 455/501 (91%), Gaps = 6/501 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2386 AGTAGTAGCATGCTTGACAGTTGGGAAGAGAATTTGGGTATAATAACTGCGAACAGAACC 2445
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2341 AGTAGTAGCATGCTTGACAATTGGGAAGAGAATTTGGGTATAATAACTGCTAACAGAACC 2400
Query 2446 ACAGATGATGAGCTTGTAATTACTCATCTTGGAGATTGCATGTGGAAAGAAAG-GGGCGA 2504
|||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 2401 ACAGATGACGACCTTGTGATTATTCATCTTGGAGATAGCATGTGGAAAGAAAGAGGG-GA 2459
Query 2505 GATAATTGCAGCTCATATTTGCTATTTAATTGCGGACAAGAACTTTGATCCATACTCAGA 2564
||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 GATAATTGCGGCGCATATTTGCTATTTAATCGCAGACAAGAACTTTGATCCATACTCAGA 2519
Query 2565 TA-CTGCCAGACTCTGCCTTGTTGGAGCGGATCACTGGAAATATCCTCGAACATATGCAA 2623
| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 2520 AAGC-GCCAGACTCTGCCTTGTCGGAGCGGACCATTGGAAATGTCCTCGAACATACGCAA 2578
Query 2624 GTCCAGAGGCTATACAGAGAACAGAGTTATATGAATACTCTAAGACTCTGGGAAACTCTC 2683
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2579 GTCCAGATGCTATACAGAGAACAGAGTTATATGAATACTCTAAGACGCTGGGAAACTCTC 2638
Query 2684 AGTTTACCCTGCTACCGTTTCAACCATATAAAGTCATGTATGCCCATATGCTGGCTGAAG 2743
||| || |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2639 AGTATATCCTGTTACCGTTTCAACCATATAAAATCATATATGCTCATATGCTGGCTGAAG 2698
Query 2744 TTGGTAAACTTTCGACTGCACTGAAGTACTGTCAAGCAGTATTAAAATGCCTCAAGAC-A 2802
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
Sbjct 2699 TTGGTAAACTTTCTACTGCACAAAAGTACTGTCAAGCAGTAATAAGATGCCTCAAGACTA 2758
Query 2803 GGCCGATCACCAGAAGTGGAAATGTGGAAACAGTTTGTTTCATCTCTTGAAGAGAGAATC 2862
| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2759 G-CCGATCATCTGAAGTAGAAATGTGGAAGCAGTTTGCTTCATCTCTTGAAGAGAGAATC 2817
Query 2863 CGCATCCACCAACAGGGCGGG 2883
|| | ||| ||| |||| |||
Sbjct 2818 CGTAGCCATCAAGAGGGTGGG 2838
Score = 182 bits (98), Expect = 3e-44
Identities = 187/229 (82%), Gaps = 10/229 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 3856 ATGCAGAGATATCCAAGTATGGATAACATCCA-AAGAAATGGATTGGGGATTAGCGTCAA 3914
|||||||||| ||||||| | || ||||| || ||||| ||||| || | ||| | ||
Sbjct 3832 ATGCAGAGATTTCCAAGTGTAGACAACAT-CAGAAGAAGTGGATCAGGAACAAGCCTTAA 3890
Query 3915 TGGGGATCATCATCAGCCTCCTGCT-TCCAGAAGAACAGCTTCATGGAGCGGAAACTTCA 3973
||| |||| || |||| | | | | || ||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 3891 TGGTGATCTTCCTCAG--T-CAG-TATCAAGAAGAACAGCTTCATGGAGCGGAAGCGTCA 3946
Query 3974 ACA-C-C-TCGTTTACGCCTCCGACCAGTCCATCAACCTTCAAACCAATCCTACTCAACA 4030
||| | | ||||||| | |||| || ||| ||||||| |||| ||||| || ||| ||||
Sbjct 3947 ACAGCTCGTCGTTTATGTCTCCAACGAGTGCATCAACATTCAGACCAAGCCCACTGAACA 4006
Query 4031 GTAGCAGCAGCAGCTTAGGAGAGGAGCTTCAGGAAGTGGAACTCTAAGT 4079
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 4007 GTAGCAGTAGCAGCTTAGGAGAGGAGCTTCAGGAAGTTGAACTGTAAGT 4055
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 217774699563
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5