BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg494278
Length=4431
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G47020.1 | Symbols: | unknown protein; FUNCTIONS IN: molecu... 7251 0.0
> AT5G47020.1 | Symbols: | unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function
unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown;
LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 23 plant
structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis
thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G11700.2);
Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species:
Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants
- 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI
BLink). | chr5:19081458-19090023 FORWARD LENGTH=4894
Length=4894
Score = 7251 bits (3926), Expect = 0.0
Identities = 4277/4447 (96%), Gaps = 21/4447 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCTTGGACTTGTGTTCTTGTGTGTTCTTTTGGTGTCCACGCCATGTTTTAGCTTATCA 60
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 406 ATGCTTGGACTTGTGTTCTTGTGTGTCCTTTTGGTCTCTACGCCATGTTTTAGCTTATCA 465
Query 61 CAGTATGGGGGCACTGACTTTGAGAGCCCTCTGAGATTGTTTTCAGATGAAGATTCTGGG 120
|||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 466 CAGTATGGGGTCACTGAATTTGAGAGCTCTGTGAGATTGTTTTCAGATGAAGCTTCTGGA 525
Query 121 AATTCTACTAGTT-TACCGATTTCTGTGACTTGTCAAGACTTGGATGGTGTTGGATCTTT 179
||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 526 AATTCTACTAGTTCT-CCGATTTCTGTGACTTGTCAAGACCTGGATGGTGTTGGATCGTT 584
Query 180 GAATACCACTTGTACATTGAACTCGAATTTGCGGTTCGATTCTGATGTTTATGTATATGG 239
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 585 GAATACCACTTGTACATTGAACTCGAATTTGCGATTCGATTCCGATGTTTATGTATATGG 644
Query 240 AACGGGTAATCTGAACATACTTGCCCATGTCTTAGTTGATTGCCCTATTGAAGGATGTAT 299
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 645 AACTGGTAATCTGAACATACTTGCACATGTCTTAGTTGATTGCCCTGTTGAAGGATGTAT 704
Query 300 GATCATTTTCAATGTATCTGGAACTATTCATTTGGGTCAATCAGCAAGAATCGTTGCTGG 359
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 705 GATCACCTTCAATGTATCTGGAACTATTCATTTGGGTCAATCAGCAAGAATTGTTGCTGG 764
Query 360 TTCTGTGGTTTTTTCTGCTATCAATTTAACAATGGATAGCAATTCGTCTATCTACACGTC 419
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 765 TTCTGTGGTTTTTTCTGCTATCAACTTAACAATGGATAGCAATTCGTCTATCTACACGAC 824
Query 420 GGCATTGGCTGGACCACCACCTTCTCAGACTAGTGGAACACCATATGGTAGTGATGGTGC 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 825 AGCATTGGCTGGACCACCACCTTCTCAGACTAGTGGAACACCATATGGTATTGATGGTGC 884
Query 480 GGGTGGAGGCCATGGTGGGAGAGGTGCTTCCTGTGTGAAGAGTAATAAGACGACCTATTG 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 885 CGGTGGAGGCCATGGTGGGAGAGGTGCTTCCTGTGTGAAGAGTAATAAAACGACTTATTG 944
Query 540 GGGTGGTGATGTTTATGCTTGGTCGTCTTTGCATGACCCGTGGAGCTATGGGAGCGAGGG 599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 945 GGGTGGTGATGTTTATGCTTGGTCGTCTTTGCATGATCCGTGGAGCTATGGGAGTGAGGG 1004
Query 600 AGGGGTTAAGTTATCCACAAAGAATATCAGAGGCAAAGGTGGAGGTCGTGTCAGACTCCT 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |
Sbjct 1005 AGGGGTTAAGTTATCCACAAAGAATATCAGAGGCAAAGGTGGAGGTCGTGTTAAACTCAT 1064
Query 660 ATTGAAGGACACGGTACATGTGAATGGAACTGTTTACGCAGATGGTGGTGATGCTGGAGA 719
||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065 ATTGACGGACACAGTACATGTGAATGGAACTGTTTCCGCAGATGGTGGTGATGCTGGAGA 1124
Query 720 GGAAGGGGGTGGAGGATCTGGAGGAAGTATCTGTA-T--T-C-GT---GC----GGGTTA 767
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | || || ||||||
Sbjct 1125 GGAAGGGGGTGGAGGATCTGGAGGAAGTATCTGTATTCGTGCGGTAAAGCTGAAGGGTTA 1184
Query 768 CGGTAAAATATCTGCATCGGGTGGGAGGGGATGGGGTGGAGGTGGCGGAGGGAGGATCTC 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1185 CGGTAAAATATCTGCATCGGGTGGGAGGGGATGGGGTGGAGGTGGCGGAGGAAGGATCTC 1244
Query 828 CCTTGACTGTTACAGCATACAAGAAGATGTCAAAGTTTTTGTGCATGGTGGCGCAAGTAT 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1245 TCTTGACTGTTACAGCATACAAGAAGATGTCAAAGTTTTTGTTCATGGTGGCGCAAGTAT 1304
Query 888 CGGGTGTCCCAATAATGCTGGAGCAGCTGGAACATACTTTAATGCTGAATTAGTGAGTTT 947
|||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305 CGGGTGCCCCAAAAATGCAGGAGCAGCTGGAACATACTTTAATGCTGAATTAGTGAGTTT 1364
Query 948 AAGGGTTGGAAATGATAACATGACTACAGAGACAGAAACTCCTTTGCTCGATTTTCCTAC 1007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1365 AAGGGTTGGAAATGATAACATGACTACAGAGACAGAAACTCCTTTGCTCGATTTTCCTAC 1424
Query 1008 AAGGCCTCTGTGGTCAAACATCTATGTAGATAATAATGCAAAAGTTTTGGTCCCGCTGCT 1067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1425 AAGGCCTCTGTGGTCAAACATCTATGTAGATAATAATGCAAAAGTTTTGGTCCCGCTGCT 1484
Query 1068 GTGGACCAGAATGCAGGTCAGAGGTCAAATCAGTCTTTATCGGGGAAGCAGCATTGTTTT 1127
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485 GTGGACCAGAATGCAGGTCGGAGGTCAAATCAGTCTTTATCGGGGAAGCAGCATTGTTTT 1544
Query 1128 TGGGTTATCAAAATATCCAATTTCAGAATTTGAGCTTGTCGCTGAGGAACTTTTAATGAG 1187
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1545 CGGGTTATCAAAATATCCAATTTCAGAATTTGAGCTTGTTGCTGAAGAACTTTTAATGAG 1604
Query 1188 TAACTCCGTTATAAAGGTTTTTGGTGCGTTACGACTTGTTACGAAGATGCTGCTCATGTT 1247
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1605 TAACTCCGTTATAAAGGTTTTTGGTGCATTACGACTTGTTACGAAGATGCTGCTCATGTT 1664
Query 1248 GAATTCTGTGATTCAAATTGATGGTGAAGGAAACCCTGCGGTGCCTTCCTCTGTCCTCGA 1307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||
Sbjct 1665 GAATTCTGTGATTCAAATTGATGGTGAAGGAAACCCTGCAGTGCCTTCCTCTGTTCTTGA 1724
Query 1308 AGTTCGCAACCTTGCAGTTCTAAGGGGAAAATCCGTCATTACTTCTAATGCAAACTTGGG 1367
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1725 AGTTCGCAACCTTGCAGTTCTAAAGGGAAAATCCGTCATTACTTCTAATACGAACTTGGG 1784
Query 1368 TGTATATGGTCAAGGAATGTTGACGCTCTCCGGTCCTGGGGATGCAATTAAAGGCCAGAG 1427
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1785 TGTATATGGTCAAGGAATGTTGACGCTATCTGGTCCTGGGGATGCAATTAAAGGCCAAAG 1844
Query 1428 ACTTTCCTTATCTCAATTTTACAACATAACTATTGGGCCAGGTTCTTTACTTCAAGCACC 1487
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 1845 ACTTTCCTTATCTCAATTTTACAACATAACTGTTGGACCAGGCTCTATACTTCAAGCACC 1904
Query 1488 ACTTGATGATTACGAAAGCAAAAACGCGGTTACTCAGACCCTTTGTGAGAGCAAAACATG 1547
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1905 ACTTGATGATTATGAAAGCAAAAACGCGGTTACTCAGACCCTTTGTGAGAGCAAAACATG 1964
Query 1548 CCCAATAGACTTGATCAGTCCGCCGGATGATTGTCATGTCAATTATACACTATCCTTTTC 1607
||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1965 CCCAATAGATTTAATCAGTCCGCCGGATGATTGCCATGTCAATTATACACTATCCTTTTC 2024
Query 1608 CCTTCAGATATGTCGAGTTGAAGACATTCTTGTGATTGGACATGTGAAAGGAAGCATAAT 1667
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2025 CCTTCAGATATGTCGAGTTGAGGACATTCTTGTGAGAGGACTTGTGAAAGGAAGCATAAT 2084
Query 1668 TCAAATCCACAGGGCGAGAACAGTGGTGGTTACTGATGATGGCTTGATTACTGCAACTGG 1727
||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 2085 TCAAATCCACAGGGCGAGAACGGTAGTAGTTACTGATGATGGCTTGATAACTGCATCTGG 2144
Query 1728 ATTTGGTTGCAGTGGTGGCTTGGGGAAGGGGCTTTATTCAAATGGGGCTGGTAGTGGTGC 1787
|||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2145 ATTTGGTTGCAGTGCTGGGTTGGGGAAGGGACTTTATTCAAATGGGGCTGGTAGTGGTGC 2204
Query 1788 TGGGCATGGAGGAAGAGGGGGATCAGGCATTTTCAATGGGAGAGTATGCAACGGAGGTCA 1847
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2205 TGGGCATGGAGGACGAGGGGGATCAGGCATTTTCAATGGGAGAGTATGCAACGGAGGACA 2264
Query 1848 TACCTATGGTGATCCTGATTTTCCCTGTGAGCTAGGAAGCGGAGCAGAAAGTCCAGATAA 1907
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2265 TACCTATGGTGATCCTGATTTTCCCTGTGAGTTAGGAAGCGGAGCAGAGAGTCCAGATAA 2324
Query 1908 ATCATATGGGAATGTGACTGGTGGAGGGATGATAGTAATTGGCTCCATCCAGTTTCCTCT 1967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2325 ATCATATGGGAATGTGACTGGTGGAGGGATGATAGTAATTGGCTCCATCCAGTTTCCTCT 2384
Query 1968 TTTGACACTTAATCTGCGTGGATCTCTGAGCTCTGATGGCCAAAGCCTTTGGAAGCCAAC 2027
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2385 TTTGACTCTTAATCTGCGGGGATCTCTGAGCTCTGATGGTCAAAGCCTTTGGAAGCCAAC 2444
Query 2028 AGCGAATGGTAACAGATCTTTGGTCGGCGGAGTTGGTGGGGGATCTGGTGGGACGATTCT 2087
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2445 AGCGAATGGTAACAGATCTTTGGTCGGTGGAGTTGGTGGGGGATCTGGTGGGACGATTCT 2504
Query 2088 TCTTTTCCTCCAGATGCTTGAGCTCTCAAAGAATTCATCTCTATCAGTTCGAgggggccg 2147
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2505 TCTTTTCCTTCAGATGCTTGAACTCTCAAAGAATTCATCTCTATCAGTTCGAGGGGGCCG 2564
Query 2148 gggtggccctcttgggggtggtgggggtggagg-gggAAGACTTCACTTTCACTGGGACA 2206
|||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2565 GGGTGGGCCTCTTGGGGGTGGTGGAGGTGGAGGAGGGA-GACTTCACTTTCACTGGGACA 2623
Query 2207 TGTTACACACTGGGGACGAGTATTCTCCTGTTGCAGTTGTCAAGGGGTCCATTAGTAATA 2266
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2624 TGTTACATACTGGGGACGAGTATTCTCCTGTTGCAATTGTCAAGGGGTCCATTAGTAATA 2683
Query 2267 GAGGAGGTGCAGGGGACAATGGAGGTCGATTCGGGGAAGAGGGAACAATGACTGGGAAAA 2326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2684 GAGGAGGTGCAGGGGACAATGGAGGTCGATTCGGGGAAGAGGGAACAATGACTGGGAAAA 2743
Query 2327 AGTGTCCGAAGGGACTCTATGGTACATTTTGCTTGGAATGCCCCATTGGCACTTACAAGA 2386
||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2744 AGTGTCCAAAGGGACTCTACGGTACATTCTGCTTGGAATGCCCCATTGGCACTTACAAGA 2803
Query 2387 ATGTTGAAGGCTCTGACAAACGTCTTTGTACTCCCTGCCCGCCTGAGCATCTTCCAAGTC 2446
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2804 ACGTCGAAGGCTCTGACAAACGTCTTTGTACTCCCTGCCCGCCTGAGCATCTTCCAAGTC 2863
Query 2447 GTGCAAAATTTGTATACGTACGAGGAGGAGTTAGTGAACCTGTTTGTCCCTATAAATGTG 2506
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2864 GTGCAAAATTTGTATACGTACGAGGAGGAGTTAGCGAACCTGTTTGTCCCTATAAATGTG 2923
Query 2507 TATCTGACAAATACAGATTGCCAAACTGCTATACACCTCTGGAAGAGCTTGTCTATACAT 2566
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2924 TATCAGAAAAATACAGATTGCCAAACTGCTATACACCTCTGGAAGAGCTTGTCTATACAT 2983
Query 2567 TTGGAGGGCCATTGCCCTTTACCCTTCTTCTATCTTGTGTGGTGGTAGTTTTGGGTCTGT 2626
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2984 TTGGAGGGCCATTGCCCTTTACTCTTCTTCTATCTTGTGTGGTGGTAGTTTTGGGTCTGT 3043
Query 2627 TGCTAAGCACATTAAGTATCAAATTGCTCAGATTGAGTTTCTATGGTGCCAATTCCATCG 2686
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 3044 TGCTAAGCACATTAAGTATCAAATTGCTCAGGTTGAGTTTCTATGGTGCTAATTCCATTG 3103
Query 2687 AACACCAGAGTGCTCATTGTTTACCCCATCTTCTGTCACTCTCTGAGGTTCGAGGCGCAA 2746
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3104 AACACCAGAGTGCACATTGTTTACCCCATCTTCTGTCACTCTCTGAGGTTCGAGGCGCAA 3163
Query 2747 AATCTGAGGACACGCAAACCCATGCTTACCGTATGTACTTCATGGGTCCAAACACTTTCA 2806
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3164 AATCTGAGGACACGCAAACCCATGCTTACCGTATGTACTTCATGGGTCCAAACAATTTCA 3223
Query 2807 GGGAACCTTGGCATCTGCCCTACTCTCCTCCTGATGCAATCATAGAGATAGTGTACGAAG 2866
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3224 GGGAACCTTGGCATCTGCCCTACTCTCCTCCTGGTGCAATCATAGAGATAGTGTACGAAG 3283
Query 2867 ATGCTTTTAACAGATTTATTGATGAAATAAACTCTACCGCAGCATATGATTGGTGGGAAG 2926
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3284 ATGCTTTTAACAGCTTTATTAATGAAATAAACTCTACCGCAGCATATGATTGGTGGGAAG 3343
Query 2927 GGTCTGTGCACAGCATTCTATCAGTTCTTGCAAATCCTTGTGCCTGGTCGTGGAAACAAT 2986
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3344 GGTCTGTGCACAGCATTCTTTCAGTTCTTGCAAATCCTTGTGCCTGGTCGTGGAAACAAT 3403
Query 2987 GGCGTCGCAGGAGAAAAATTCACCGCCTTCAAGAATATGTCAAATCTCAATATGACCACT 3046
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3404 GGCGTCGCAGGAGAAAAATTCATCGCCTTCAAGAATATGTCAAATCTCAATATGACCATT 3463
Query 3047 CTTGCCTCCGCTCATGCAGATCTAGAGCTCTCTACAAAGGGATGAAGGTTGGAGCCACTC 3106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3464 CTTGCCTCCGCTCATGCAGATCTAGAGCTCTCTACAAAGGGATGAAGGTTGGAGCCACTC 3523
Query 3107 CGGATCTGATGATTGCATACATAGATTTCTTTCTTGGCGGTGACGAGAAGCGTGTAGATA 3166
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3524 CGGATCTGATGGTTGCATACATAGATTTCTTCCTTGGCGGTGACGAGAAGCGTGTAGATA 3583
Query 3167 TGGTCTCCATTATACAGAAAAGATTCCCAATGTGCATACTTTTTGGTGGAGATGGAAGTT 3226
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3584 TGGTCTCTATTATACAGAAAAGATTCCCAATGTGCATACTTTTTGGAGGAGATGGAAGTT 3643
Query 3227 ATATGTCACCTTATAGTCTCCATAGTGATACACTATTAACAAATCTTCTTGGCCAGCACA 3286
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3644 ATATGTCACCCTATAGTCTCCATAGTGATACACTGTTAACAAATCTTCTTGGCCAGCACA 3703
Query 3287 TCCCACCAAGTGTTTGGCACCGGTTTGTTGCTGGTTTAAATGCTCAGCTTAGGACTGTGA 3346
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3704 TCCCACCGAGTGTTTGGCACCGGTTTGTTGCTGGTTTAAATGCTCAGCTTAGGACTGTGA 3763
Query 3347 GGCACGGATCAATTCGTTCAGCATTACTTCCTGTCATTAGGTGGATAAACAGTCATGGAA 3406
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3764 GGCACGGATCAATTCGGTCAGCATTACTTCCTGTCATTAGGTGGATAAACAGCCATGGAA 3823
Query 3407 ATCCTCAGCTAGAATTCCATGGAGTAAGAATTGAACTTGGATGGTTTCAAGCTACAGCTT 3466
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3824 ATCCTCAACTCGAATTCCATGGAGTAAGAATTGAACTTGGATGGTTTCAAGCTACAGCTT 3883
Query 3467 CTGGATATTACCAACTTGGTATCTTGGTTTTTGTTGGCGATTTTCCTCTGAGCACTGTAA 3526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3884 CTGGATATTACCAACTTGGTATCTTGGTTTTTGTTGGCGATTTTCCTCTGAACACTGTAA 3943
Query 3527 CCCGATCACTTTCGTTCAGCAGAAGTGACGACGAGTCACCTCGGAACAGCTCTGCATGTC 3586
| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||
Sbjct 3944 ACAGATCACTGTCGTTCAGCAGAAGTGACGACGAGTCCCCTGGGAACAACTCTGCATGTC 4003
Query 3587 CCAGCAAATCTCTTATCGAGTTGCAGCAAAACTTGATCCAACCAGGACATGGATTATCTC 3646
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4004 CAAGCAAATCTCTTATCGAGTTGCAGCAAAACTTGATCCAACCAGGACATGGATTATCTC 4063
Query 3647 GGAAGAGGATCAATGGTGGAATCAATGGAGGCCTCATCAATGAGATTTCACTAGAATCTT 3706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4064 GGAAGAGGATCAATGGTGGAATCAATGGAGGCCTCATCAATGAGATTTCACTAGAATCTT 4123
Query 3707 TGGAGTACCGAAGGGATTTACTTTTTCCATTTTCTCTCTTATTGAACAACACTCGACCTG 3766
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4124 TGGAGTATCGAAGGGATTTACTTTTTCCATTTTCTCTCTTATTGAACAACACTCGACCTG 4183
Query 3767 TTGGGCGTCAGGATACTCTTCTCCGTTTGATCTCCATCCTTCTCCTTGCTGATCTTTCAG 3826
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4184 TTGGGCGTCAGGATACTCTTCTCCGTTTTATTTCCATCCTTCTCCTTGCTGATCTTTCAG 4243
Query 3827 TTACGCTACTTGCATTACTTCAGTTCTATTGGCTTGCCATTGCAGCCTTTCTCGCTATCC 3886
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 4244 TTACGCTACTTGCATTACTTCAGTTCTATTGGCTTGCCCTTGCAGCCTTTCTTGCTATCC 4303
Query 3887 TCCTGATTCTCCCTCTCTCCCTGCTTTGCCCATTCCCTGCCGGCCTTAACGCTTTATTAA 3946
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4304 TCCTGATTCTCCCTCTCTCCCTTCTTTGCCCATTCCCTGCCGGCCTTAACGCTTTATTAA 4363
Query 3947 GTAAAGAAATGAGAAGAGCCTCACTTACTCGTATCTATGGCCTTTGGAATGCTACATCTC 4006
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4364 GTAAAGAAATGAGAAGAGCCTCACTTACTCGTATCTACGGCCTGTGGAATGCTACATCTC 4423
Query 4007 TAACAAACGTCATTGTGGCTTTCATTTGCGGTGTCATTCATTCCGGGTTTTTCACTGACG 4066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4424 TAACAAACGTCATTGTGGCTTTCATTTGCGGTGTCATTCATTCCGGGTTTTTCACTGACG 4483
Query 4067 AGCTACCAAACATCTGGAACGCCATAAGGGATGATGATAGATGGTGGGTGTTACCAACAG 4126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 4484 AGCTACCAAACATCTGGAACGCCATAAGGGATGATGATAAATGGTGGGTATTACCAACA- 4542
Query 4127 TTC-TCCTGTTACTCAAGTCAATACAAGCCCGGTTCCTTGATTGGCACGTCGCAAATCTA 4185
||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4543 TTCCTCTTGTTACTCAAGTCAATACAAGCTCGGTTCCTTGATTGGCACGTCGCAAATCTA 4602
Query 4186 GAAGTACCGGACTTTTCTCTTCTTTGTCCAGATCCAGATACCTTCTGGGCTTATGAATCT 4245
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4603 GAAGTACCAGACTTTTCTCTTCTTTGTCCAGATCCAGATACCTTCTGGGCATATGAATCT 4662
Query 4246 GGAGCTTGACCATCAACATGATTATAAAGAAAGACAAGCAAAAGGTATATCATATTTTTC 4305
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 4663 GGAGCTTGACCATCAACATGATTATAAAGAAAGACCAGCAAAAGATATATCTTATTTTTC 4722
Query 4306 ATGTAAATCTTTTAAAAAGTACAAAGCTCTTCTCAGTGATAGTTGTTAAAAACAGTTCTC 4365
||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4723 ATGTAAATCTTTTAAAA-GTACAAAGTTCTTCTCGGTGATAGTTGTTAAAAACAGTTCTC 4781
Query 4366 TAGAACATCTGGTTATATTTCTGGTGCCGAATTAGG-GTTTTGCCAGATCAATGGTAGTT 4424
|||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4782 TAGAACATCTGGTTATATATCTGGTGCTGAATTAGGAGTTC-GCCAGATCAATGGTAGTT 4840
Query 4425 GTAGAAA 4431
|||||||
Sbjct 4841 GTAGAAA 4847
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 220935216972
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5