BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg495040 Length=3368 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G49810.1 | Symbols: MMT | methionine S-methyltransferase | c... 5557 0.0 > AT5G49810.1 | Symbols: MMT | methionine S-methyltransferase | chr5:20239343-20246380 FORWARD LENGTH=3625 Length=3625 Score = 5557 bits (3009), Expect = 0.0 Identities = 3254/3374 (96%), Gaps = 10/3374 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTTTCTTCTCTACTACTACAATCACTTGTTGACGATAAATGGCGGA-C-CT-CTCTGTCG 57 |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||| Sbjct 39 TTTTCTTCTCTATTACTGCAATCACTTGTTCACGAT-AATGGCGGACCTCTCCTCTGTCG 97 Query 58 ACGACTTCCTGAACCAGTGCAAACAATCCGGCGACGCAGCTTATGGCGCCTTGCGATCGG 117 | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 98 ATGAGTTCCTGAATCAGTGCAAACAATCCGGCGACGCAGCTTATGGCGCCTTGCGATCGG 157 Query 118 TCTTGGAACGGCTTGAGGATCCGAATACTCGATCTAAGGCTCGGATCTTCTTGTCTGACA 177 ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 158 TCTTGGAGCGGCTCGAGGATCCGAATACTCGATCTAAGGCTCGGATCTTCTTGTCTGACA 217 Query 178 TCTACAAACGCGTCGGATCCTCCGAGACGTCTCTCCAAACCTACCATTTCCATATCCAGG 237 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 218 TCTACAAACGCGTCGGATCTTCTGAGACGTCTCTCCAAACCTACCATTTTCATATCCAGG 277 Query 238 ACATTTATCTCGATCAATACGAAGGCTTTCAGTCAAGGAAAAAATTAACCATGATGGTCA 297 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 278 ACATCTATCTCGATCAATACGAAGGCTTTCAGTCCAGGAAAAAGTTAACCATGATGGTCA 337 Query 298 TTCCTAGTATTTTTATTCCAGAAGACTGGTCATTCACATTTTATGAAGGACTTAATAGAC 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 338 TTCCTAGTATTTTTATTCCAGAAGACTGGTCATTTACATTTTATGAAGGACTTAACAGAC 397 Query 358 ATCCTGACACCATCTTTAAGGATAAGACTGTTTCTGAACTTGGATGTGGGAATGGATGGA 417 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 398 ATCCTGACACCATCTTTAAGGATAAGACTGTTTCTGAACTTGGCTGTGGGAATGGATGGA 457 Query 418 TATCTATAGCCATAGCTGCTAAGTGGTTGCCTTCAAAGGTATATGGGCTTGATATTAATC 477 |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 458 TATCAATAGCCATTGCTGCTAAGTGGTTGCCTTCAAAGGTATATGGGCTTGATATTAATC 517 Query 478 CTAGAGCTGTGAAAATTTCTTGGATAAATTTGTACCTAAACGCGCTTGATGATAATGGGG 537 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 518 CTAGAGCTGTGAAAATTTCTTGGATAAATTTGTACCTAAACGCTCTTGATGATAATGGCG 577 Query 538 AACCAGTCTATGACGACGAGAAGAAAACTTTATTGGACAGAGTGGAATTCTATGAATCTG 597 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 578 AACCAGTCTATGACGAAGAGAAGAAAACTTTATTGGACAGAGTGGAATTCTATGAATCTG 637 Query 598 ATTTGCTTGGTTATTGTAGAGATAATAAAATTCAGCTAGAGAGAATTGTAGGATGCATAC 657 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct 638 ATTTGCTTGGTTATTGTAGAGATAATAAAATTCAGTTAGAAAGAATTGTAGGATGCATAC 697 Query 658 CTCAGATTCTTAATCCAAACCCAGAAGCAATGTCTAAGCTGATAACAGAAAATGCAAGTG 717 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 698 CTCAGATTCTTAATCCAAACCCAGAAGCTATGTCTAAGCTGATCACAGAAAATGCAAGTG 757 Query 718 AGGAATTTCTCCATTCGCTGAGTAACTATTGTGCCCTTCAGGGTTTTGTTGAAGATCAGT 777 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 758 AGGAATTTCTCCATTCGCTGAGTAACTATTGTGCCCTTCAGGGTTTTGTTGAAGATCAGT 817 Query 778 TTGGCTTAGGTTTGATTGCCAGAGCGGTCGAAGAAGGAATATCTGTCATCAAACCTGCAG 837 ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 818 TTGGCTTAGGTTTGATTGCCAGAGCAGTTGAAGAAGGAATATCTGTCATCAAACCTGCAG 877 Query 838 GGATTATGATATTCAACATGGGTGGTCGTCCTGGACAAGGTGTCTGTAGACGCTTGTTTG 897 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 878 GGATTATGATATTTAACATGGGTGGTCGTCCTGGGCAAGGTGTCTGTAGACGCTTGTTTG 937 Query 898 AGCGGCGAGGAGTCCGTGTTACACAGATGTGGCAGACTAAAATACTTCAGGCTGCAGATA 957 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 938 AGCGGCGAGGAGTCCGTGTTACACAGATGTGGCAGACTAAAATACTTCAGGCTGCAGATA 997 Query 958 CCGATATCTCGGCATTAGTTGAAATTGAGAGGAGCAGCCCTCATCGTTTTGAGTTTTTTA 1017 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 998 CTGATATCTCAGCATTAGTTGAAATTGAGAGGAGCAGCCCTCATCGTTTTGAGTTCTTTA 1057 Query 1018 TGGGACTTTCTGGAGACCAACCAATTTGTGCTCGAACAGCATGGGCCTATGGGAAGGCTG 1077 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1058 TGGGACTTTCTGGAGACCAACCAATTTGTGCTCGAACAGCATGGGCCTATGGGAAGGCTG 1117 Query 1078 GTGGACGAATCTCCCATGCTTTATCGGTTTATAGTTGTCAGATTCGCCAACCAAATCAGG 1137 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1118 GTGGCCGAATCTCCCATGCTTTATCGGTTTATAGTTGTCAGATTCGCCAACCAAATCTGG 1177 Query 1138 TTAAGATAATCTTTGACTTCTTGAAAAATGGATTCCAAGAAATCAGTAATTCACTGGATT 1197 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1178 TTAAGATAATCTTTGACTTCTTGAAAAATGGATTCCAAGAAATCAGTAATTCACTGGATT 1237 Query 1198 TATCTTTCGAAGATGAAACTGTTGCTGATGAGAAAATTCCATTCCTAGCCTATCTTGCTA 1257 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1238 TATCTTTTGAAGATGAAACTGTTGCTGATGAGAAGATTCCATTCCTAGCCTATCTTGCTA 1297 Query 1258 GTGTCTTGAAAAATAGCTCCTATTTCCCGTTTGAACCTCCAGCTGGCAGCAAAAGATTCT 1317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1298 GTGTCTTGAAAAATAGCTCCTATTTCCCGTTTGAACCTCCAGCTGGCAGCAAAAGATTCT 1357 Query 1318 GCAGTCTAATTGCAGGCTTTATGAGGACATACCACCGTATTCCAATTAATCAGGATAACA 1377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1358 GCAGTCTAATTGCAGGCTTTATGAGGACATACCACCGTATACCAATTAATCAGGATAACA 1417 Query 1378 TTGTCGTGTTTCCATCAAGGGCTGTGGCAATCGAGAGTGCATTTCGGTTATTCTCACCTC 1437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct 1418 TTGTCGTGTTTCCATCAAGGGCTGTGGCAATCGAGAGTGCATTTCGTTTATTCTCTCCTC 1477 Query 1438 GACTTGCAATTGTTGATGAGCATTTAACTCGACAACTTCCGAGGAGCTGGCTAACCTCTT 1497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1478 GACTTGCAATTGTTGATGAGCATTTAACTCGACAACTTCCGAGGAGCTGGCTAACCTCTT 1537 Query 1498 TAGCCATTGAGAACACTAGCATGGAGAAATCAGATGATCAAATCACAGTCATTGAATCCC 1557 ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1538 TAGCCATTGAGGACACTAGCATGGATAAATCAGATGATCAAATCACAGTCATCGAATCCC 1597 Query 1558 CACACCAATCTGATCTGATGATAGAACTCATTAAGAAACTAAAGCCACAGGTGGTGATTA 1617 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1598 CGCACCAATCTGATCTGATGATAGAACTCATTAAGAAACTAAAGCCACAGGTGGTGGTTA 1657 Query 1618 CTGGAATGGCTCCATTTGAGGTCATTACCAGTTCATCGTTTTTGCACCTGTTGGAAGTGA 1677 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1658 CTGGAATGGCTCCATTTGAGGTCATTACCAGTTCATCGTTTTTGCACCTTTTGGAAGTGA 1717 Query 1678 CGAGAGAAATCGGATGTCGACTTTTCTTGGATATATCTGATCACTTTGAGTTGTCTAGCC 1737 | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1718 CAAAAGAAATTGGATGTCGACTTTTCTTGGATATATCTGATCACTTTGAGTTGTCTAGCC 1777 Query 1738 TCCCTGCATCCAATGGGGTACTAAAATATCTCGCTGAAAATCAACTACCTGCTCATGTAG 1797 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || Sbjct 1778 TTCCTGCATCCAATGGGGTACTAAAATATCTCGCTGAAAATCAACTACCTTCTCATGCAG 1837 Query 1798 CAATTATCTGCGGTCTGGTAAAGAATAAGGTCTATTCAGATTTAGAAGTAGCCTTTGTCA 1857 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1838 CAATTATCTGCGGTCTGGTAAAGAATAAGGTCTATTCGGATTTAGAAGTAGCCTTTGTCA 1897 Query 1858 TTACAGAAGTGGATGCCATTGCTAAGGCCCTGTCCAAAACTGTGGAAGTCTTAGAAGGTC 1917 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1898 TTACAGAAGTGGATGCCATTGCTAAAGCCCTGTCCAAAACTGTGGAAGTCTTAGAAGGTC 1957 Query 1918 ATACTGCTATTATCAGTCAATACTACTATGGTTGCCTTTTCCATGAGCTTTTGGCTTTCC 1977 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1958 ATACTGCTATTATCAGTCAATACTACTATGGTTGCCTTTTCCATGAGCTTTTGGCTTTCC 2017 Query 1978 AGCTTGCTGATCGCCATGCCCCGGCTGAGAGGGAAAGTGAGAAGGCAAAGTCTGAAGAGA 2037 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2018 AGCTTGCTGATCGCCATGCCCCGGCTGAGAGGGAAAGTGAGAAAGCAAAGTCTGAAGAGA 2077 Query 2038 TCATTGGATTTTCAAGCTCAGCCGTCTCTATTCTAAAAGATGCTGAGCTTTCAGTCACTG 2097 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2078 TCATTGGATTTTCAAGCTCAGCAGTCTCTATTCTAAAAGATGCTGAGCTTTCAGTCACTG 2137 Query 2098 AGATTGACGAAACTTCTCTAATACACATGGATGTGGATCAAAGTTTCTTGCCAATTCCAC 2157 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2138 AGATTGACGAAACTTCTCTAATCCACATGGATGTTGATCAAAGTTTCTTGCAAATTCCAC 2197 Query 2158 AATCTGTTAAGGCTGCAATCTTTGAAAGTTTTGTGAGGCAGAACATATCTGAAGCGGAAG 2217 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2198 AATCTGTTAAGGCTGCAATCTTTGAAAGTTTTGTGAGGCAGAACATATCTGAAGCGGAAG 2257 Query 2218 TTGATATCAACCCAAGTATTAAGCAGTTTGTGTGGAGTAATTATGGGTTTCCAACCAAAA 2277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2258 TTGATATCAACCCAAGTATTAAGCAGTTTGTGTGGAGTAATTATGGGTTTCCAACCAAAA 2317 Query 2278 GCAGCACAGGCTTTGTATATGCTGATGGCTCACTAGCACTATTCAATAAGCTGGTCATTT 2337 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct 2318 GCAGCACAGGCTTTGTATATGCTGATGGCTCACTAGCACTATTCAATAAACTGGTAATTT 2377 Query 2338 GCTGTGCTCAAGAAGGTGGAACACTCTGTTTACCTGCTGGCACAAATGGGAATTATGTTG 2397 | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct 2378 GTTGTGCTCAAGAAGGTGGAACGCTTTGTTTACCTGCTGGTACAAATGGAAATTATGTTG 2437 Query 2398 CTGCTGCCAAATTTTTAAAAGCTAATGTTGTGAATATCCCTACTGAGTCTAGTGATGGCT 2457 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2438 CTGCTGCCAAATTTTTAAAAGCTAATGTCGTGAATATCCCTACCGAGTCTAGTGATGGCT 2497 Query 2458 TTAAGCTGACGGAAAAGACTTTAACGAATGCACTCGAGACTGTGAAGAAGCCATGGGTTT 2517 |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| Sbjct 2498 TTAAGCTGACAGAAAAGACTCTAACGAAAGCACTCGAGTCTGTGAAGAAGCCGTGGGTTT 2557 Query 2518 GTATATCTGGACCAACAGTTAGCCCTACGGGCTTGGTGTACAGCAATGAGGAGATGGATA 2577 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2558 GTATATCTGGACCAACGGTTAGCCCTACAGGCTTGGTGTACAGCAATGAGGAGATGGATA 2617 Query 2578 TACTATTGTCTAGTTGTGCTAAGTTTGGAGCAAAGGTCATCATCGATACTTCATTCTCGG 2637 |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2618 TACTGTTGTCTACTTGTGCTAAGTTTGGAGCAAAGGTCATCATCGATACTTCATTCTCGG 2677 Query 2638 GATTAGAATACAGTCCAACTAGCTGGGATTTGAAGAGCGCTTTGTC-AAGATTGGGTTCA 2696 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || ||| Sbjct 2678 GATTAGAATACAGTGCAACTAGCTGGGATTTGAAGAACGCTTTGTCGAAAAT-GGATTCT 2736 Query 2697 TCCTTGTCAGTTTCGCTGCTTGGATGTCTCTCTTTGAATTTGCTCAGTGGAGCTATTAAA 2756 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2737 TCCTTATCAGTTTCGCTGCTTGGATGTCTCTCTTTGAATTTGCTCAGTGGAGCTATTAAA 2796 Query 2757 CTTGGGTTTCTAGTTTTGGATCAGTCTCTCATCGATGCCTTCCATACCCTCCCAGGCCTG 2816 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2797 CTCGGGTTTCTAGTTTTGGATCAGTCTCTCATCGATGCCTTCCATACCCTCCCAGGCCTG 2856 Query 2817 AGCAAACCGCACAGCACTGTGAAATATGCCGCTAAGAAAATGTTGGCTCTGAAAGAAGAG 2876 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| Sbjct 2857 AGCAAACCGCACAGCACTGTGAAATATGCCGCTAAGAAAATGTTGGCTTTGAAGGAAGAG 2916 Query 2877 AAAGCAAGTGACTTTCTGGATGCCGTTTCTGAAACCATTAAAACGTTGGAGGGCAGATCT 2936 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 2917 AAAGCAAGTGACTTTCTGGATGCCGTTTCTGAAACCATTAAAACCTTGGAAGGCAGATCC 2976 Query 2937 A-AGCGCTTAAAAGAGGTACTAGAGAACTCTGGTTGGGAGGTTATCCAACCTTCAGCTGG 2995 | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2977 AGA-CGCTTAAAAGAGGTACTACAGAACTCTGGTTGGGAGGTTATCCAACCCTCAGCTGG 3035 Query 2996 AATCTCAATGGTGGCAAAGCCAAAAGCTTATCTCAACAAAACAGTAAAGCTGAAAGCAGG 3055 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3036 AATCTCAATGGTGGCAAAGCCAAAAGCTTATCTCAACAAAAAAGTAAAGCTGAAAGCAGG 3095 Query 3056 AAAAGGACAGGAAGTCGTTGAGCTTACGGATTCAAATATGAGGGACGTGTTCCTCAGCCA 3115 | | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3096 AGATGGACAGGAAATCGTCGAGCTTACGGATTCAAATATGAGGGATGTGTTCCTCAGCCA 3155 Query 3116 TACCGGTGTTTGCTTAAACAGCGGTTCCTGGACCGGAATTCCTGGTTACTGCCGCTTTTC 3175 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 3156 TACCGGTGTTTGCTTAAACAGCGGTTCCTGGACTGGAATCCCTGGTTACTGCCGGTTTTC 3215 Query 3176 ATTTGCATTGGAGGATAGTGAGTTCGACAAGGCTATTGAATCAATAGCACAGTTTAAAAG 3235 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 3216 ATTTGCATTGGAAGATAGTGAGTTTGACAAGGCTATTGAATCGATAGCTCAGTTTAAAAG 3275 Query 3236 CGTCCTTGCTAATTGAAACGTGCCACTTTCATTTACGGTGTCATCAACTTGAACTAAAGT 3295 |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3276 CGTCCTTGCTAACTGAAACGTGCCAGTTTCATTTACGATGTCATCAACTTGAACTAAAGG 3335 Query 3296 GCATTGTGCATTGCTGGTTCTGAGACTTAACACTTCGCTCTACTTCTGCGTTTCCTT-GT 3354 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || Sbjct 3336 GCATTGTGCATTGCTGGTTCTGAGACTTAACACGTCGCTCTTCTTCTGCGTT-CCTTTGT 3394 Query 3355 TCTGTTGTTTCTAA 3368 |||||||||||||| Sbjct 3395 TCTGTTGTTTCTAA 3408 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 167607756563 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5