BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg495241
Length=2575
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G51750.1 | Symbols: ATSBT1.3, SBT1.3 | subtilase 1.3 | chr5:... 4017 0.0
> AT5G51750.1 | Symbols: ATSBT1.3, SBT1.3 | subtilase 1.3 | chr5:21020207-21022781
FORWARD LENGTH=2575
Length=2575
Score = 4017 bits (2175), Expect = 0.0
Identities = 2444/2576 (95%), Gaps = 10/2576 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCTCTTCTTCTCCATAGAGATAGAGAGAAGAATCATCTCCTATACTCTCTCCAAGACTC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||
Sbjct 1 ATCTCTTCTTCTCCATAGAGATAGAGAGAAGAATCATCTCCTATA--CTCT---AG-CTC 54
Query 61 CAACAATGGCTAACAAAAACCCACTTCGAAAATCCTTTCTTTTCATAATCTTATCAATCA 120
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 CAACAATGGCTAACAAAAACCCACTTCAAAAACCCTTTCTTTTCATAATCTTATCAATCA 114
Query 121 ATCTCATCTTTCTTCAAGGAGAAACAGCTACTCAAATCTCTAACAAGAAGACTTATGTTG 180
|||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 115 ATCTCATCTTTCTTCAAGCAGAAACAACTACTCAAATCTCTACCAAGAAGACTTATGTTA 174
Query 181 TCCATATGGATAAATCTGCTATGCCTTTACCTTACACTAATCACCTACAATGGTACTCTT 240
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 TCCACATGGATAAATCTGCCATGCCTTTACCTTACACTAATCACCTACAATGGTACTCTT 234
Query 241 CAAAGATAAACTCTGTAACACAAGGCAAATCTCAAGAAGAAGAAGGTAACAACAACAGGA 300
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 235 CAAAGATAAACTCTGTAACGCAACATAAATCTCAAGAAGAAGAAGGTAATAACAACAGGA 294
Query 301 TACTCTACACTTACCAGACTGCGTTT-CACGGTTTAGCTGCTCAGCTTACTGATGAAGAA 359
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||
Sbjct 295 TACTCTACACTTACCAGACTGC-TTTCCACGGTTTAGCAGCTCAGCTTACTCAAGAAGAA 353
Query 360 GCAGAGAGGCTTGAAGAAGAAGATGGTGTTGTAGCTGTGATTCCTGAGACAAGATATGAG 419
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 354 GCAGAGAGGCTTGAGGAAGAAGATGGTGTTGTAGCTGTGATACCTGAGACAAGATACGAG 413
Query 420 CTTCACACGACAAGAAGTCCAACGTTTCTTGGGTTAGAAAGACAAGAGAGTGAGAGAGTT 479
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 414 CTTCACACTACAAGAAGTCCAACGTTTCTTGGGTTAGAAAGACAAGAAAGTGAGAGAGTT 473
Query 480 TGGGCTGAGAGAGTCACCGATCATGATGTGGTAGTTGGTGTTTTAGACACTGGGATTTGG 539
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 474 TGGGCTGAGAGAGTCACCGACCATGATGTGGTAGTTGGTGTTTTAGACACTGGTATCTGG 533
Query 540 CCTGAGAGTGAGAGCTTCAACGATACAGGTATGTCCCCTGTTCCTTCTCCTTGGAGAGGA 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 534 CCTGAGAGTGAGAGCTTCAACGATACAGGTATGTCCCCTGTTCCTGCTACTTGGAGAGGA 593
Query 600 GCTTGTGAAACCGGAAAAAGATTCTTGAAACGTAACTGCAATAGAAAGATTGTTGGTGCT 659
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 594 GCTTGTGAAACTGGAAAAAGATTCTTGAAACGTAACTGCAATAGAAAGATCGTTGGTGCT 653
Query 660 AGAGTTTTCTATAGAGGCTATGAAGCTGCAACGGGAAAGATCGATGAAGAGCTCGAATAT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 654 AGAGTTTTCTATAGAGGCTATGAAGCTGCAACGGGAAAGATCGATGAAGAGCTTGAATAT 713
Query 720 AAATCACCGAGAGACCGAGATGGTCACGGGACACACACTGCAGCTACTGTTGCTGGTTCA 779
|| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 714 AAGTCACCGAGAGACAGAGATGGTCACGGGACACACACTGCAGCTACTGTAGCTGGCTCA 773
Query 780 CCTGTTAAAGGAGCAAATCTTTTTGGATTTGCTTATGGGACAGCTCGAGGGATGGCTCCA 839
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 774 CCTGTTAAAGGAGCTAATCTTTTTGGATTTGCTTATGGGACAGCTCGAGGGATGGCTCAA 833
Query 840 AAGGCTAGAGTAGCTGCTTATAAAGTCTGTTGGGTCGGTGGATGTTTCAGCTCAGACATT 899
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||
Sbjct 834 AAGGCTAGAGTTGCTGCTTATAAAGTCTGTTGGGTCGGAGGGTGTTTCAGTTCAGACATT 893
Query 900 TTGTCGGCGGTTGATCAAGCTGTTGCTGATGGAGTTCAAGTACTCTCTATATCATTAGGT 959
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 894 TTGTCGGCTGTTGATCAAGCTGTTGCTGATGGAGTTCAAGTACTCTCTATATCATTAGGT 953
Query 960 GGTGGGATCTCTACTTATTCTCGAGACAGTTTGTCCATAGCAACATTTGGAGCAATGGAG 1019
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 GGTGGGGTCTCTACTTATTCTAGAGACAGTTTGTCTATAGCAACATTTGGAGCAATGGAG 1013
Query 1020 ATGGGTGTTTTCGTTTCGTGTTCTGCCGGTAATGGAGGTCCTGATCCGATTAGTCTCACT 1079
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014 ATGGGAGTTTTCGTTTCGTGTTCTGCCGGTAATGGAGGTCCTGATCCGATTAGTCTCACT 1073
Query 1080 AATGTTTCTCCATGGATCACAACAGTTGGTGCAAGTACTATGGATAGAGATTTTCCAGCA 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074 AATGTTTCTCCATGGATCACAACAGTTGGTGCAAGTACTATGGATAGAGATTTTCCAGCA 1133
Query 1140 ACAGTGAAGATAGGAACTATGAAAACATTTAGAGGAGTTTCACTTTACAAAGGCAGAACA 1199
|||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1134 ACAGTGAAGATAGGAACTATGAGAACATTCAAAGGAGTGTCACTTTACAAAGGCAGAACA 1193
Query 1200 GTTTTGTCTAAAAACAAACAGTATCCTCTGGTTTACTTAGGAAGGAATGCAAGTAGTCCT 1259
|||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194 GTTTTGCCTAAGAATAAACAGTATCCTCTGGTTTACTTAGGAAGGAATGCAAGTAGTCCT 1253
Query 1260 GATCCAACCTCGTTCTGTCTAGATGGGGCTTTGGATCGTCGCCATGTAGCGGGCAAGATC 1319
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1254 GATCCAACCTCGTTCTGTCTAGATGGAGCTTTGGATCGGCGCCATGTAGCGGGAAAGATC 1313
Query 1320 GTGATATGCGACCGTGGTGTTACTCCACGTGTGCAAAAGGGTCAGGTTGTGAAAAGAGCA 1379
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314 GTGATATGCGACCGCGGTGTTACTCCACGTGTGCAAAAGGGTCAGGTTGTGAAAAGAGCT 1373
Query 1380 GGAGGAATTGGGATGATTTTAACTAATACTGCAACAAATGGTGAAGAGCTTGTTGCAGAC 1439
|| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374 GGTGGAATTGGGATGGTTTTAACTAACACTGCAACAAATGGTGAAGAGCTTGTTGCAGAT 1433
Query 1440 TCTCATTTGCTTCCAGCAGTTGCAGTGGGAGAGAAAGAAGGTAAACTGATCAAACAGTAC 1499
|||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1434 TCTCATATGCTTCCAGCTGTTGCAGTTGGAGAGAAAGAAGGTAAACTAATCAAACAGTAC 1493
Query 1500 GCGATGACGAGTAAAAAAGCTACAGCGAGTTTAGAGATTCTTGGAACAAGAATTGGTATC 1559
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 GCGATGACGAGTAAAAAAGCGACAGCGAGTTTAGAGATTCTTGGAACAAGAATTGGTATC 1553
Query 1560 AAACCATCTCCTGTTGTAGCAGCATTCTCTTCAAGAGGACCAAATTTTCTGTCTTTGGAG 1619
||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 AAACCTTCACCAGTTGTAGCAGCGTTCTCTTCAAGAGGACCAAATTTTCTGTCTTTGGAG 1613
Query 1620 ATCTTGAAACCTGACTTGTTGGCTCCAGGAGTGAACATTCTTGCAGCTTGGACTGGAGAC 1679
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 ATCTTGAAACCAGACTTGTTGGCTCCAGGAGTGAATATTCTTGCAGCTTGGACTGGAGAC 1673
Query 1680 ATGGCGCCATCGAGTTTATCATCTGATCCAAGGAGGGTTAAGTTCAATATACTGTCTGGA 1739
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1674 ATGGCACCATCGAGTTTATCATCTGATCCAAGGAGGGTTAAGTTCAATATACTGTCTGGA 1733
Query 1740 ACTTCAATGTCATGTCCTCATGTGAGTGGTGTGGCTGCTTTGATCAGATCAAGGCATCCA 1799
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1734 ACTTCAATGTCATGTCCTCATGTAAGTGGTGTAGCTGCTTTGATCAAATCAAGGCATCCA 1793
Query 1800 GATTGGAGCCCTGCGGCAATCAAATCAGCTCTCATGACAACAGCTTATGTTCACGACAAC 1859
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 1794 GATTGGAGTCCTGCAGCAATCAAATCAGCTCTCATGACAACTGCTTATGTTCATGACAAC 1853
Query 1860 ACGCTTAAGCCTCTTACGGATGCATCAGGAGCAGCTCCTTCATCGCCTTATGATCACGGT 1919
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1854 ATGTTTAAGCCTCTTACGGATGCATCAGGAGCAGCTCCTTCATCGCCTTATGATCACGGT 1913
Query 1920 GCAGGACATATAGATCCTTTAAAAGCTATAGATCCGGGTTTGGTCTACGACATTGGACCT 1979
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1914 GCAGGACATATAGATCCTTTAAGAGCTACAGATCCTGGTTTGGTCTACGACATTGGACCT 1973
Query 1980 CAAGATTACTTTGAATTCCTCTGCACTCAGGATTTAAGTCCTTCACAGCTCAAGGTATTC 2039
||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1974 CAAGAGTATTTTGAATTCCTCTGCACTCAAGATTTAAGTCCATCACAGCTTAAGGTATTC 2033
Query 2040 ACAAAACATTCAAACAGAACATGCAAACACACTCTTGCCAAGAATCCGGGAAACTTGAAC 2099
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034 ACAAAACATTCAAACAGAACCTGCAAACACACTCTTGCCAAGAATCCGGGAAACTTGAAC 2093
Query 2100 TACCCGGCGATATCAGCTTTGTTCCCAGAGAACACACATGTTAAAGCCATGACTCTTAGA 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 2094 TACCCGGCGATATCAGCTTTGTTCCCAGAGAACACACATGTTAAAGCTATGACACTTAGA 2153
Query 2160 AGAACTGTGACCAATGTTGGTCCTCACATTTCAAGCTACAAGGTTTCTGTCTCGCCGTTC 2219
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2154 AGAACAGTGACCAATGTTGGTCCTCACATTTCAAGCTACAAGGTTTCTGTCTCGCCATTC 2213
Query 2220 AAAGGCGCATCGGTCACTGTCCAGCCCAAAACACTCAACTTCACTTCAAAACACCAGAAG 2279
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 2214 AAAGGCGCATCCGTAACTGTCCAGCCCAAAACACTCAACTTCACTTCGAAGCACCAGAAG 2273
Query 2280 CTTTCCTACACGGTTACTTTCCGGACAAGAATGCGGTTGAAGAGGCCTGAGTTTGGTGGT 2339
||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2274 CTTTCCTACACGGTTACTTTCAGGACAAGGTTCCGGATGAAGAGGCCTGAGTTTGGTGGT 2333
Query 2340 CTTGTGTGGAAGAGCTCAACACATAAAGTTCGTAGTCCGGTTATCATCACTTGGCTGCCT 2399
|| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 2334 CTAGTGTGGAAGAGCACTACACATAAAGTTCGTAGCCCGGTTATCATCACATGGTTGCCT 2393
Query 2400 CCTCTGTAGAACAACAACCAATGTTTGGGCAATTTTAATGTTTTTAGTTCCACAAATaaa 2459
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2394 CCTCTGTAGAACAACAACCAATGTTTGAGCAATCCTAATGTTTTTAGTTCCACAAATAAA 2453
Query 2460 aaaaTTCCTCATGTAATGAGAGCTATTCTCTAGATCAATGCTTTGTCATTTATAAAACAA 2519
|| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2454 AA--TTCCTTATGTAATGGGAGCTATTCTCTAGATCAATGCTTTGGCATTTATAAAACAA 2511
Query 2520 CCATATGTTCTTCTTTCGTCACAATGAGAACACTTGAGACAAGTCAATTGAATTTG 2575
|||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | | ||| ||||||||||||
Sbjct 2512 CCATATGTTCTTCTTTTGTCACAATGATAACGCTTAACAGAAGACAATTGAATTTG 2567
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 127825370764
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5